BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G17330.1 Length=6499 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg329795 jgi|Araly1|329795|fgenesh1_pm.C_scaffold_7002022 3923 0.0 Ahg337636 jgi|Araly1|337636|fgenesh1_pg.C_scaffold_1004201 52.8 3e-05 > Ahg329795 jgi|Araly1|329795|fgenesh1_pm.C_scaffold_7002022 Length=5235 Score = 3923 bits (2124), Expect = 0.0 Identities = 2660/2909 (91%), Gaps = 75/2909 (3%) Strand=Plus/Plus Query 2106 ACTCTGTCAGTTCTGGACAAGGATAACAAAAATGAAATGCCTATTACTAGCTCCTTGCCT 2165 |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || Sbjct 2098 ACTCAGTTAGTTCTGGGCAAGGATAACAAAAATGAAAAGCCTAGTACTAGCTCCTTGGCT 2157 Query 2166 ATTCTTGGGAGTGAAGCTGGAAAAGATGGCCAGGAAGAGGATAATACTGCTGCTTCTGGT 2225 | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || || Sbjct 2158 AATCTTGGGAGTGAAGCTGGAAAAGATCACCGGGAAGAGGATAATTCTGCTGCGTCCGGA 2217 Query 2226 GGGATTATGGCAGCTGGGACTCCTGTTACACACCCCAAAGGTGATGCAATCGTACTAGGA 2285 ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2218 GGGATTATGTCAGCTGGGACTCCTGTTTCAAACCCCAAAGGTGATGCAATCGTACTAGGA 2277 Query 2286 GACTCCCGTGCTTCTACATG-TTCTGAGTCTTCTGTAAAGTCTTATGTAACTGCAATAGA 2344 |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | | Sbjct 2278 GACTCCTGTGCTTCTACA-GTTTCTGAGCCTTCTGGAAAGTCTCATGTAACTGCAACAAA 2336 Query 2345 AGATGCTGCTACTAATTTAAAGACTCCTCTTGATTCTTTCCCCACTGTTAAGACTTCCGA 2404 ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2337 AGACGCTGCTACTAATTTGAAGACTCCTCTTAATTCTTTCCCCACTGTTAAGACTTCCGA 2396 Query 2405 ACTTCAATTTAATAACACAGAGACAAACAGTGTCAAAAAGCCAGAAGATCAGAATATTTC 2464 ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2397 ACTTCAACTTAATAAGACTGAGACAAACAGTGTCAAAAAGCCAGAAGATCAGAATATTTC 2456 Query 2465 GGGTTTTATGTCTGCTGGATCTCCGGTCTTGAATAGAAATGAGACCTCCAGCAGTGAAAT 2524 | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || Sbjct 2457 GAGTTTTATGTCTGCTGGATCTTCGGTCTTGAAT---AATGAGACCTTCAGCAGTGAGAT 2513 Query 2525 GAACTTAACTCCTGATCAGCTGAAAGCAGGGAAAATTTCCAAAGCTGTT-ATATTTTCAC 2583 |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 2514 GAACATAACTCCCGATCAGCTGAAAGCAGGGGAAATTTCCAAAGCTGTTAAT-TTTTCAC 2572 Query 2584 AAGCTACCCTTGTCTCCCCGATTGTGGTGGGATCTCCTTCAACATCTAGCTTAGATAAAA 2643 ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2573 AAGCTACACTGGTCTCTCCGATTGTGGTGGGATCTCCTTCAACATCTAGCTTAGAGAAAA 2632 Query 2644 CAGCTGCAAAGTCTTCCAAAGCAAAATCTGAGCGGAAACCCAGGCGAACATCTAAATCTG 2703 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2633 CAGCTGCAAAGTCTTCCAAAACAAAATCTGAGCGGAAACCCAGGCGAACATCTAAATCTG 2692 Query 2704 TAGGAAAAGAGACTTCTAGAAAAGGAACTAGTGTAAAAGGGGCTACACCTATTGAACAGT 2763 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 2693 TAGGAAAAGAGACTTCTAGAAAAGGAACTAGTGTAAAAGGGGCTACACCTTTTCAACAGT 2752 Query 2764 TTCAAAGTGGAGGCAAAACAAATGCTGTTAATCAAAGTTTGGCTTCTCATATTCAGATCA 2823 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| Sbjct 2753 TTCAAAGTGGAGGCAAAACAAATGCTGTTAATCAAAGTTCGGCTTGTCCTATTCAGATCA 2812 Query 2824 CACAATCTACTGAGAAACAGCGAAGTCTTCAGAGCCCTGCTCTAAAAGCTTTTGGGTCCC 2883 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2813 CACAATCTACTGAGAAACAGCAAAGTCTTCAGAGCCCTGCTCTAAAAGCTTTTGGGACCC 2872 Query 2884 TTTCAACCCCTACGGCAAGTCTACCGGATTTGAACTCTTCTGCTCTCTCAAGTATTCTGC 2943 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2873 TTTCAACCCCCACGGCAAGTCTACCGGATTTGAACTCTGCTGCTCTCTCAAGTATTCTGC 2932 Query 2944 GTCGACCTTTCACGGACTTGCAACAAGTGCAACTACGTGCACAGATTTTTGTATACGGGG 3003 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| Sbjct 2933 GTCGACCTTTCACAGACTTGCAACAAGTGCAACTACGTGCACAAATTTTCGTATATGGGG 2992 Query 3004 CTCTGATCCAAGGAACAGCACCGGATGAAGCTTATATGATATCTGCA-TT--T-G----G 3055 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | | | Sbjct 2993 CTCTGATCCAAGGAACAGCACCCGATGAAGCTTATATGATTTCTGCATTTGGTGGTCCAG 3052 Query 3056 TG-G-------TG-----C---AGATGGTGGGAAGGGCAGCTGGGAGAAATCATGGCGTA 3099 || | || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3053 TGTGTTCACTCTGCATTTCTTTAGATGGTGGGAAGGGCAGCTGGGAGAAAGCATGGCGTT 3112 Query 3100 CTTGTGTTGTAAGGGCTCAGAAATCGCTTGTTGCTACTCCTGAAACGCCACTGCAATCAC 3159 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3113 CTTGTGTTGTAAGGGCTCAGAAATCGTTTGTTGCTACTCCTGAAACGCCATTGCAATCAC 3172 Query 3160 GTCCAGGGAAGACAGAGACCCCTTCAGCAGGTCACACCAATAGCAAAGAGAGTTCAGGGA 3219 || |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 3173 GTGCAGGGAAGACAGAGACTCCATCAGCTGGTCACACCAATAGCAAAGAGACTTCAGCGA 3232 Query 3220 CAAACCCCATGATTCCACTCTCATCACCTTTATGGAGTTTATCAACTTCCGTAGATACTT 3279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 3233 CAAACCCCATGATTCCACTCTCATCACCTTTATGGAGTTTATCAACTTCCCTTGATACTT 3292 Query 3280 TACAATCAAGTAGCGTTCAGAGAGGTTCAGCTGCTACTCACCAGCCATTGCTTTCTGCAT 3339 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct 3293 TACAATCAAGTAGCATTCAGAGAGGTTCAACTGCTACTCACCAGCCATTACTTTCTTCAT 3352 Query 3340 CGCATGCTCACCAAACTCCACCAACT-CAGAATATTGTTGGACATAATACCCCTTGGATG 3398 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3353 CGCATGCTCACCAAACTCCACCAACTGC-GAATATTGTTGGACATAATACCCCTTGGATG 3411 Query 3399 TCGCCTCTCCCTTTCCGTAACGCTTGGCTTGCTTCTCAGCAAACCAGTGGATTTGATGTT 3458 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 3412 TCGCCTCTCCCTTTCCGTAATTCTTGGCTTGCTTCTCAGCAAAGCAGTGGATATGATGTT 3471 Query 3459 GGTTCCCGTTTCCCCGTCTATCCAATCACTGACCCTGTAAAATTGACTCCCATGAAAGAA 3518 ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3472 GGTTCTCGTTTCCCCGTCTATCCGATGACCGAACCTGTAAAATTGACTCCCATGAAAGAA 3531 Query 3519 TCATCCATGACTCTT-TCTGGCGCAAAACATGTTCAGAGTGGAACTTCTAGCAATGTTTC 3577 || ||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3532 TCGTCCTTGAGT-TTCCCTGGCGCAAAGCATGTTCAGAGTGGAACTTCTGGCAATGTTTT 3590 Query 3578 CAAAGTGACACCAACACTTGAGCCTACTAGTACAGTTGTAGCACCTGCTCAACATTCTAC 3637 |||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3591 CAAAATGACATCATCACTTGAGCCAACGAGTACAGTTGTAGCACCTGCTCAACATTCCAC 3650 Query 3638 AAGGG-TAAAATCAAGGAAACGGAAGAAGATGCCAGTCTCTGTGGAGTCTGGTCCAAACA 3696 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3651 -CGGGACAAAATCAAGGAAACGGAAGAAGATGCCAGTCTCTGTGGAGTCTGGTCCAAACA 3709 Query 3697 TTTTGAATTCGTTAAAGCAGACAGAATTAGCTGCCTCACCTCTTG--------T-G-C-- 3744 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | Sbjct 3710 TTTTGAATTCGTTAAAGCAGACAGAGTTAGCTGCCTCACCTCTTGTTTCTATATCGACGG 3769 Query 3745 C--T---T-TTACACCTACTCCGGCTAATCTGGGTTATAATGCTGGCACCCTGCCCAGTG 3798 | | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || Sbjct 3770 CAGTGCCTATTACACCTACTCCGGCTAATCTGGGTTCTAATGCTGGCACCCTGCCTAATG 3829 Query 3799 TTGTTTCTATGACTGCAGTCCCTATGGACCTGGTATCTACGTTCCCCGGGAAGAAAATAA 3858 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3830 TTGTTTCTATCACTGCAGTCCCTATGGACCTGGTATCTACGTTCCCCGGGAAGAAAATCA 3889 Query 3859 AATCATCTTTCCCATCTCCAATTTTTGGTGGTAACCTTGTACGTGAAGTAAAGCAGAGAT 3918 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3890 AATCATCGTTGCCATCTCCAATTTTTGGTGGTAACCTTGTACCTGAAGTAAAGCAGAGAT 3949 Query 3919 CTGTCTTGTCAGAGGATACTATTGAAAAACTTAAGGAGGCTAAGATGCATGCAGAGGATG 3978 ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3950 CTGTCTTGTCAGAGGATACTAACGATAAACTTAAGGAGGCTAAGATGCATGCAGAGGATG 4009 Query 3979 CATCTGCTCTTGCTACTGCAGCTGTTAGTCATAGCGAATATGTATGGAAGCAGATAGAGC 4038 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4010 CATCTGCTCTTGCTACTGCAGCTGTTAGTCACAGCGAATATGTATGGAAGCGGATAGAGC 4069 Query 4039 AACAAAGTCATGCTGGCCTCCAGCCAGAAACTCAAGACAGATTAGCTTCGGCTGCTGTTG 4098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4070 AACAAAGTCATGCTGGCCTCCAGCCAGAAACTCAAGACAGATTAGCTTCGGCTGCTGTTG 4129 Query 4099 CCATAGCTGCTGCAGCTGCGGTGGCAAAAGCTGCAGCTGCTGCCGCCAATGTTGCAGCTA 4158 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4130 CTATAGCTGCTGCTGCTGCGGTGGCAAAAGCTGCAGCTGCTGCCGCCAATATTGCAGCTA 4189 Query 4159 ATGCTGCATTGCAGGCCAAGTTAATGGCTGAAGAAGCATCCCTTCCAAATGCTTCTGATC 4218 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| Sbjct 4190 ATGCTGCATTGCAGGCCAAATTAATGGCTGAAGAAGCATCCCTTCTAAATACTTTTGATC 4249 Query 4219 AGGGACTCCCAAAGTCATATGATAGCATATTAC--CC-GGTCAGGGTACCCCTGCTTCTA 4275 ||||||||||||||||| |||||| |||||| || || || |||||||||||||||| Sbjct 4250 AGGGACTCCCAAAGTCAAATGATAATATATTATTACCAGGCCACGGTACCCCTGCTTCTA 4309 Query 4276 TCTTGAAGGGTGAAGGTGCAGTGGTGAACTCCAGTTCGGTTCTTATTGCTGCGAGAGAGG 4335 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4310 TCTTGAAGGGTGAAGGTGCAGTGGGGAGCTCCAGTTCGGTTCTTATTGCTGCGAGAGAGG 4369 Query 4336 CATCTAAGAAGAGGGTTGAAGCTGCTACAGCGGCCACCAAGCGTGCTGAAAATATGGACT 4395 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4370 CATCTAAGAAGAGGGTTGAAGCTGCCACAGCGGCCACCAAGCGTGCTGAAAATATGGACT 4429 Query 4396 CCATTGTAAAAGCAGCAGAATTGGCATCAGAGGCTGTTTCTCAAGCTGGAATACTTGTTT 4455 |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 4430 CCATTGTAAAAGCAGCTGAATTGGCATCCGACGCGGTTTCACAAGCTGGAATACTTGTGT 4489 Query 4456 CAATGGGTCATCCTCCGT-TGCTCAATAAGCTGGTGGAGGCGGGTCCAAGTAATTACTGG 4514 |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 4490 CAATGGGTCATCCTCCGTCT-CTCAATAAGCTGGTGGAGGCGGGTCCAAGTAAGTATTGG 4548 Query 4515 AGGCAGGCTCAAGAATCTCAGGAAGTACAGCCCTGTAAAACGGTTGTCTTAGAAAAAGAA 4574 || |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 4549 AGACAGGCTCAAGGATCTCATGAAGTGCAGCCTTGTA---CGGTTGTTTTAGAAAAAGAA 4605 Query 4575 ACTGTGTCTACTAGTGAGGGAACTTTTGCTGGTCCCAAAATTGTGCAGACTGAGTTTGGT 4634 ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| Sbjct 4606 CCTGTGGCTACTAGTGAGGGAACTATTGCTAGTCCCAGAACTGTGCAGACTGAGTTGGGT 4665 Query 4635 GGCTCTGTGAATACGGCAGATGGTGTGTCCGGTCCAGTTCCTGCCACTGGAAAGTTAAAG 4694 |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 4666 GGCTCTCTGAAAAAGGCAGATGGTGTGTCTGGTCCAGTTTCTGCCACTGGAAAGAAAAAG 4725 Query 4695 GGACAGGAGGGTGATAAATATGCAGACTTGGCTAAAAACAATGATGTGGTTTTTGAACCA 4754 ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4726 GGACAAAAGGGTGATACAGGTGCAGACTTGGCTGTTAACAATGATGTGGTTTTGGAACCA 4785 Query 4755 GAAGTTGGGTCAAAATTTTCAATTGACGCCCAA-C--A--G--A-C----TATCAAAGCA 4802 ||||||||||||||| |||| |||||| | ||| | | | | | ||| |||||| Sbjct 4786 GAAGTTGGGTCAAAAATTTCGATTGACACACAAACTGAAAGTCAACAGAGTATGAAAGCA 4845 Query 4803 ACAAAGAATGAGGACATCAAGGAGGGTTCTAATGTAGAGGTTTTCAAAGAAGAACCTGGA 4862 || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4846 ACGAATAATGCGGACATCAAGGAGGGTTCTAATGTAGAGGTTTTCAAGGAAGAACCTGGA 4905 Query 4863 TTAAGAACCGCATGGTACTCTGCCAATGTATTGAGCTTAGAGGATGATAAAGCTTACGTG 4922 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4906 TTAAGAACCGCATGGTACTCTGCCAATGTATTGAGCTTAGAGGATGATAAAGCTTACGTG 4965 Query 4923 TTGTTCAGTGACCTATCTGTAGAACAAGG 4951 ||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct 4966 TTGTTCAATGACCTTTCTGTAGAACAAGG 4994 Score = 2758 bits (1493), Expect = 0.0 Identities = 1856/2028 (92%), Gaps = 37/2028 (2%) Strand=Plus/Plus Query 102 ATGGATTATGATGACAGTGACTTTCAAAACCAGAATCTCCATTTAGCTGGTGAAGCCAAC 161 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGATTATGATGACAATGACTTTCAAAACCAGAATCTCCATTTAGCTGGTGAAGCCAAC 60 Query 162 AACAAATTTCCACCAGTTTTACAGCCTTATGCTCTTCCAAAGTTTGATTTTGATGATACA 221 || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AATAAATTTCCACCAGTTTTACAGCCTTATGCTCTACCAAAGTTTGATTTTGATGATACA 120 Query 222 CTCAACACGCATCTGAGGTTTGATAGTTTAGGTGAATCTGAAGCTTTTCTTGGTATTGAG 281 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct 121 CTCAACACGCATCTAAGGTTTGACAGTTTAGGTGAAAGTGAGGCTTTTCTTGGTATTGAG 180 Query 282 GGTAACGAAGATAATAACTGGATTGAGGATTTCTCTCGTGGAAGTAGTGGTATAGTGTTT 341 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GGTAACGAAGATAATAACTGGATTGAGGATTTTTCTCGTGGAAGTAGTGGTATAGTGTTT 240 Query 342 AGTTCAGGTGCAACGGAGTCCTGTGCCATTTCTAGGCACAATAATGTTTGGTCTGAGGCT 401 |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AGTTCAGGTGCAACGGAGTCTTGTGCCATTCCAAGGCACAATAATGTTTGGTCTGAGGCT 300 Query 402 ACTTCGTCGGAATCTGTTGCAATGCTTTTGAATTCAGTTGGACAGGACGAAGTTATTGTA 461 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ACTTCGTCGGAATCTGTTGAAATGCTTTTGAATTCAGTTGGACAGGACGAAGTTATTGTA 360 Query 462 AGAGAGGATACTATCAAGAAATCTGACACTTCTCATGAACTAGGCTGCACAATGGAAACA 521 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || Sbjct 361 AGAGAGGATACTATCAAGAAATCTGACACTTCTGATGAACTAGGTTGCACAATGGAACCA 420 Query 522 GTAGAGCCTGGTCAGACATCCCATGAAAGAAGTCTTTCCAAAGAGGAAACGGTGAACTTA 581 | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATGGAGCCTGGTCAGACATCCCATGAAAAAAGTCCTTCCAAAGAGGAAACGGTGAACTTA 480 Query 582 CAACCCAACCCCTCTGTGGATGATACTCCAGGAGAGTCCTCTGTGGTAAAGACAGATGAT 641 ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| Sbjct 481 CAACCCAACCCATCTGTGGATGATACTTCAGGAGAGTTCTCTGTAGTCAAGACAGATGAT 540 Query 642 GGACAGGAGCAGGTTCTGGTTAAAGATGACTCACCAACGGCTGTAGAAGAGGCATCTGTG 701 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 541 GGACAGGAGCAGGTTCTGGTAAAAGATGACTCACCAACCGCTGTAGAAGAAGCATCTGTG 600 Query 702 GAGGAAAAGAATTCCATCTTGACTTCTAATACCGCGACGGTAGAGGCTATAGATACTACT 761 |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || Sbjct 601 GAGGAAAAGAATGCCATCTTGACTTCAAATACCGCGACGGTAGAGGCTGTCGATACTGCT 660 Query 762 GATCTTGGTAAAATAGGAACTGAGACGACGGATAATCTTCTTGACCAAACAGAAGAGAAA 821 | ||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct 661 GGTCTTGATAAAATAGGACCTGAGTCGACTGATGATCTTCTTCACCAAACGGAAGAGAAA 720 Query 822 GCCAATGTAGAATCAAGGATGGAAGATGATTGTAGCGATGGGAA-TGTACAGACTATTAT 880 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| | || Sbjct 721 GCCAATATAGAATCAAGGATGGAAGATGATTGTAGCGATAG-AACTGTACCGACTGTGAT 779 Query 881 TACTTGTAGCGGTGAGTTGAATAATCAGAGCACTTTACTTCCAGAGACTTCCAATGATGA 940 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TACTTGTAGTGGTGAGTTGACTAATCAGAGCACTTTGCTTCCAGAGACTTCCAATGATGA 839 Query 941 AAATGTTATCAGCGACCACATTCAAAGTAGTTATAACCGCAATGATCTAACTGCAGATGC 1000 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| Sbjct 840 AAATGTTATCAGTGACCACATTCAAAGTAGTTATAACCGCAGTGATATAACTATAGGTGC 899 Query 1001 ACGGTCAATTTTGGTTGAAGG-TCATTCTGATAGCCATATAGACTCAGCTTCCGAAGTTG 1059 || |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || Sbjct 900 ACAGTCAGTTTTGGTTGA-GGCTCATTCTGATAGCCGTATAGAATCAGCTTCCAAAGCTG 958 Query 1060 AAAAAGTGGAAGCTGAAAATATTGGCAAAACTGCAAAGCCTGATTTGAAGGAGATAGAGC 1119 |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 AAAATGTGGAAGCTGAAAATATTTGCGAAACTGCAGAGCCTGATTTGAAGGAGATAGAGC 1018 Query 1120 TATCTGATGTCACAGTACTAGAAAGAGGGGACCAAGCTC-CCTCTACTCTTGAGGTAGGT 1178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 1019 TATCTGATGTCACAGTACTAGAAAGAGGGGACCAAGCTCTCC-CTACTCTTGAGGTAGGT 1077 Query 1179 GGACAAGATGTTTCTGGGAC-CGAATGCCAAGATCTCCTTGTCAGCACTGTTCATACTAG 1237 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 GGACAAGATGTTTCTGGGACTC-AATGCCAAGATCTCCTTGTCAGCACTGTTCATACTAG 1136 Query 1238 CGTAGCTGTTGAAGCGTCTTTGGAACTTGCTGGGGAATTGACAACTATAACAAACAGTGT 1297 | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 GGGAGCTGTTGAAGCATCTTTGGAACTTGTTGGGGAATTGACAACTATAACAAACAGTGT 1196 Query 1298 TTCCATTGAGAAGCCCGAGTTGCTTAGTCATCAACATATGGAAGTTATTACAAGTGAACA 1357 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1197 TTCCATTGAGAAGCCTGAGTCGCTTAGTCATCAACATATGGAAGTTATTACAAGTGTACA 1256 Query 1358 TGAGTCTACTTTTCAGATAGAGACTGAGACATATCCGCAGATACACGTATTTGAAACTTC 1417 |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 1257 TGAGTCTACTTTTCAGATGGAGACTGAGACACATACGCAGATACATGTAGTTGAAACTTC 1316 Query 1418 AGAGAGTGTTTATATTTCAACGATGGACTCAATGGTTGAAGCTAGAGAAGGTGGTGTGTC 1477 ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 1317 AGAAAGTGTTTATATTTCACCTATGGACTCGATGGTTGAAGCTACAAAAGGTGGTGTGTC 1376 Query 1478 TAAGAAGAGTGACAATGAAGGTAGTGCTCGCACTTCTAATCTCGAGCAAAGCATGGAACT 1537 |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct 1377 TAAGAAGAGTGACAGTGAAGGTAGTGATCCCACTTCTAATCTCGAGGAAAGAATGGAACT 1436 Query 1538 GCCTGTCAATGCCAATGATAGAGATCAAGATGTCAAGAACTCTC-AGATCCTATCTGAAA 1596 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||| Sbjct 1437 GCCTGTCAATGCCAACGATAGAGATCAGGATGTCAAGAACTCTCCA-ATTTTGTCTGAAA 1495 Query 1597 GCGTTGTGTCTG-GTTCTGTTGGCTATGTTTCAGGAGGCTCTACTTC-AGAGTTGGCGGA 1654 | |||||||| | || |||||| |||||||||||||||| || |||| | || ||||||| Sbjct 1496 GTGTTGTGTCCGAGT-CTGTTGACTATGTTTCAGGAGGCCCTGCTTCCA-AGCTGGCGGA 1553 Query 1655 GTCAGAATCTCAATCTGACAGCATTCCAACAGACAAGTCAGAGACTATGATTGAC-AGTT 1713 | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || Sbjct 1554 GCCAAAATCTCAATCTGACAACATCCCAACAGACAAGTCAGGGACTATGATTGACTA-TT 1612 Query 1714 CTCTCAATC-TCGAAGAATTACAACCTCTAAGTCAAGATGGAGCACCTGCTGTCAGTCTC 1772 |||| || | | ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||| Sbjct 1613 CTCTTAACCGT-GAAGAATTACAACCTTTAAATCCATATGGAGCACCTGCTGTCAGTCTT 1671 Query 1773 ACATCTTCAATAGATTTACATATGGTAAAGACATCCTCTGATGACA-GTGACCAAGGCAG 1831 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| Sbjct 1672 ACATCTTCAATAGATTTACATATGGTAAAGACATCCTCTGAT-ACAAGTGACCAAGGCAG 1730 Query 1832 TTACTCTGAAACCAAGAAGGTTT-AT--GGTGAACCTGAAAATGGTCAAACCGTTCCACC 1888 || || | ||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1731 TTTCTATAAAACCGAGAAGATATCATCTGGTGAACCTGAAAATGGTCAAACCGTTCCACC 1790 Query 1889 TGTGGATGCAAGTTGTTCAGGGAGTCAGATGGACCAAGAAGCTAGGAAGCGTGCTGAAGG 1948 ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| Sbjct 1791 TGTGGATGCAAGTAGTTCGGGGAGTCAGATGGACAAACAAGCTAGGAAGATTGCTGAAGA 1850 Query 1949 TACTAAGCAAAGTACATACTCTGTTGAAGGCTGTCCTCGCTCTGAAGGGTCAAAGGATGC 2008 |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1851 TACTCAGCAAAGTACACACTTTGTTGAAGGCTGTCCTGGCTCTGAAGGGTCAAAGGATGC 1910 Query 2009 AGTAGATGCTGATG--G-TG-T--TG-----G-ACAAGTTTTGCAGCAGCAGTCTGAGGA 2056 |||||||||||||| | || | || | ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1911 AGTAGATGCTGATGCTGATGCTGGTGCTACTGGACAAGTTTTGCTGCAGCAGTCTGAGGA 1970 Query 2057 ATTAATTTTTGAAGAGAA-TGTAGTAACAGAAGCTGTAAAAGCTCCTG 2103 | |||||| ||||| || | |||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct 1971 AACAATTTTAGAAGA-AACTCTAGTAACAGAAGTTGTAAATGCTCCTG 2017 Score = 315 bits (170), Expect = 4e-84 Identities = 180/185 (97%), Gaps = 0/185 (0%) Strand=Plus/Plus Query 5132 TTGGTTGGAGGGTGTTATCACAGAGAAGAACAAGAAAGATGAAAACACAGTGACTGTGCA 5191 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 4998 TTGGTTGGAGGGTGTTATCACAGAGAAGAACAAGAAAGATGAAAATACAGTGACTGTGCA 5057 Query 5192 TTTTCCTGCGGAAGAAGAAACTTTGACGATCAAAGCTTGGAATCTTCGTCCTTCTCTTGT 5251 |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5058 TTTTCCTGCGCAAGGAGACACTTTGACGATCAAAGCTTGGAATCTTCGTCCTTCTCTTGT 5117 Query 5252 GTGGAAAGATGGAAAGTGGATTGAATGTTCTAGTTCAGGAGAAACTATCAGCTCGTCACA 5311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 5118 GTGGAAAGATGGAAAGTGGATTGAATGTTCTAGTTCAGGAGAAAATATCAGCTCGTCACA 5177 Query 5312 TGAGG 5316 ||||| Sbjct 5178 TGAGG 5182 > Ahg337636 jgi|Araly1|337636|fgenesh1_pg.C_scaffold_1004201 Length=489 Score = 52.8 bits (28), Expect = 3e-05 Identities = 28/28 (100%), Gaps = 0/28 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2190 GATGGCCAGGAAGAGGATAATACTGCTG 2217 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 34 GATGGCCAGGAAGAGGATAATACTGCTG 61 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 246308612456 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5