BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G21100.1
Length=3576
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg492777 jgi|Araly1|492777|fgenesh2_kg.7__2210__AT4G21100.1 5489 0.0
Ahg943318 jgi|Araly1|943318|scaffold_603862.1 3845 0.0
> Ahg492777 jgi|Araly1|492777|fgenesh2_kg.7__2210__AT4G21100.1
Length=3357
Score = 5489 bits (2972), Expect = 0.0
Identities = 3250/3382 (96%), Gaps = 28/3382 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 43 CGTTTAAATCTCAAAGAGAACCCAGAAGCTTGGTATAAAAGAGGCGGGAAATTTCTCACG 102
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGTTTAAATCTCAAAGAGAACCCAGAAGCTTCTTATAAAAGAGGCGGGAAATTTCTCACG 60
Query 103 TGTGTTGCAATAGAAAGCAAAACCCCTAGtttttttCTGGGCGAAGAAGAAGATGAGCGT 162
||| | | | | | ||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 61 CGTG-T----T-----G--------C-A---TTTTTCTGGGCCAAGAAGAAAATGAGCGT 98
Query 163 ATGGAACTACGCCGTTACGGCTCAGAAACCGACCTGTGTCACTCACTCTTGCGTCGGGAA 222
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 99 ATGGAACTACGCCGTTACGGCTCAAAAACCGACCTGTGTCACTCACTCTTGCGTCGGAAA 158
Query 223 CTTCACAAGTCCTCAAGAACTCAATCTCATTGTTGCGAAATCCACTCGAATCGAGATCCA 282
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 159 CTTCACCAGTCCTCAAGAACTCAATCTCATTGTTGCGAAATCCACTCGAATCGAGATCCA 218
Query 283 TCTGCTTTCTCCACAGGGACTTCAGACTATACTGGATGTTCCTCTATATGGGAGAATCGC 342
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 219 TCTGCTTTCTCCACAGGGACTTCAGACTATACTGGATGTTCCTCTATATGGGAGGATCGC 278
Query 343 AACTATGGAATTGTTCCGTCCCCATGGTGAAGCACAAGACTTTTTGTTTGTTGCAACTGA 402
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 279 CACTTTGGAATTGTTCCGTCCCCATGGTGAAGCACAAGATTTTTTGTTTGTTGCAACTGA 338
Query 403 AAGATATAAATTCTGTGTTCTTCAATGGGATTATGAGTCCTCTGAGCTTATTACAAGGGC 462
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 339 GAGATATAAATTCTGCGTTCTTCAATGGGATTATGAGTCCTCTGAGCTTATAACAAGGGC 398
Query 463 AATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCGACAGACAATGGTCAGATTGGTATAAT 522
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 AATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCGACGGACAATGGTCAGATTGGTATAAT 458
Query 523 TGATCCTGATTGCAGAGTAATTGGTCTGCATCTGTATGACGGCTTGTTTAAGGTCATTCC 582
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459 TGATCCTGATTGCAGATTAATTGGTCTGCATCTGTATGACGGCTTGTTTAAGGTCATTCC 518
Query 583 ATTTGACAATAAAGGACAGCTCAAGGAAGCCTTTAACATAAGGCTGGAGGAGTTGCAGGT 642
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATTTGACAATAAAGGACAGCTCAAGGAAGCTTTTAACATAAGGCTGGAGGAGTTGCAGGT 578
Query 643 CCTAGATATCAAGTTTCTGTATGGATGCACGAAACCAACAATTGCAGTACTTTATCAGGA 702
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 579 CCTAGATATCAAGTTTCTGTATGGATGCACGAAGCCAACAATTGCAGTACTTTATCAGGA 638
Query 703 CAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTTTCTCTAAAGGATAAGAACTTTGT 762
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 639 CAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTTTCTCTAAAGGAGAAGGACTTTGT 698
Query 763 CGAAGGTCCATGGTCACAGAACAATCTCGACAATGGTGCTGACTTATTGATCCCTGTACC 822
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 699 CGAAGGTCCATGGTCACAGAACAATCTCGATAATGGTGCTGACTTATTGATCCCTGTACC 758
Query 823 TTCACCTCTATGTGGCGTCCTCATCATTGGGGAAGAAACAATTGTCTATTGTAGTGCCAA 882
||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 759 TTCTCCTCTGTGTGGCGTCCTCATCATTGGAGAAGAAACAATTGTCTATTGTAGTGCCAA 818
Query 883 TGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTTCCATCACAAAAGCATATGGAAGAGTTGATCT 942
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 TGCATTCAAAGCAATCCCAATAAGACCTTCCATCACAAAAGCATATGGAAGAGTTGATCT 878
Query 943 TGATGGTTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATGCCGGACTGATTCACCTGCTTGTTATAAC 1002
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 TGATGGTTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATACCGGACTGATTCACCTGCTTGTTATAAC 938
Query 1003 CCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTCAAAATTGAGCTTTTGGGTGAAACCTCTATTGC 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 939 CCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTCAAAATTGAGCTTTTGGGTGAAACCTCTATTGC 998
Query 1063 ATCTTCCATCTCGTATCTGGACAATGCTGTCGTCTTTGTCGGTTCAAGCTATGGAGATTC 1122
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 999 ATCTTCCATCTCGTATCTTGACAATGCTGTCGTCTTTGTCGGTTCAAGCTATGGAGATTC 1058
Query 1123 ACAGCTTATTAAGCTAAACCTGCAACCGGATGCAAAAGGGTCATATGTAGAAATTTTAGA 1182
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1059 ACAGCTTATTAAGCTAAACTTGCAACCGGATGCAAAAGGTTCATACGTAGAAATTTTAGA 1118
Query 1183 AAAGTATGTCAACTTGGGGCCTATTGTCGATTTTTGTGTAGTTGACCTTGAGAGACAGGG 1242
||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 AAAGTATGTCAACCTGGGGCCTATTGTTGACTTCTGTGTAGTTGACCTTGAGAGACAGGG 1178
Query 1243 GCAAGGTCAGGTTGTAACTTGCTCTGGAGCATACAAGGATGGTTCTCTTCGCATAGTTCG 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 GCAAGGTCAGGTTGTAACTTGCTCTGGAGCATACAAGGATGGTTCTCTTCGCATAGTTCG 1238
Query 1303 CAATGGGATAGGAATAAATGAACAGGCGTCCGTGGAACTTCAAGGCATCAAAGGAATGTG 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239 CAATGGGATAGGAATAAATGAACAGGCGTCCGTGGAACTTCAAGGCATCAAAGGAATGTG 1298
Query 1363 GTCGTTGAAATCGTCAATTGATGAAGCCTTTGATACATTCCTTGTAGTTAGTTTTATCAG 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299 GTCGTTGAAATCGTCAATTGATGAAGCCTTTGATACATTCCTTGTAGTTAGTTTTATCAG 1358
Query 1423 TGAAACTCGTATACTAGCCATGAATATAGAGGATGAACTGGAAGAAACAGAGATTGAGGG 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1359 TGAAACTCGTATACTAGCCATGAATATAGAGGATGAACTGGAAGAAACAGAGATTGAAGG 1418
Query 1483 TTTTTTGTCTGAAGTTCAGACTTTATTTTGCCATGATGCTGTCTACAACCAACTTGTACA 1542
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1419 TTTCTTGTCTGAAGTGCAGACTTTATTTTGCCATGATGCTGTCTACAACCAACTTGTACA 1478
Query 1543 GGTTACCTCAAATTCTGTTAGATTAGTTAGTTCTACAACTAGAGAGTTGCGGAATAAATG 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1479 GGTTACCTCAAATTCTGTTAGATTAGTTAGTTCTACAACTAGAGAATTGCGGAATAAGTG 1538
Query 1603 GGATGCCCCAGCTGGATTCTCTGTTAATGTTGCAACTGCAAATGCGAGCCAGGTTCTTTT 1662
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1539 GGATGCCCCAGCTGGATTCGCTGTTAATGTTGCAACTGCAAATGCTAGCCAGGTGCTTTT 1598
Query 1663 GGCCACTGGAGGTGGGCATTTGGTCTATCTAGAAATTGGGGATGGGACATTGACGGAAGT 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599 GGCCACTGGAGGTGGGCATTTGGTCTATCTAGAAATTGGGGATGGGACATTGACGGAAGT 1658
Query 1723 GAAACATGTCCTGTTGGAGTACGAGGTTTCTTGTCTTGACATAAACCCCATTGGTGATAA 1782
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1659 CAAACATGTCCTGTTGGAGTACGAGGTTTCCTGTCTTGACATAAACCCCATTGGCGATAA 1718
Query 1783 TCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCCGTCGGGATGTGGACTGATATAAGTGTGAGGATTTT 1842
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1719 TCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCAGTCGGGATGTGGACTGATATAAGTGTGAGGATTTT 1778
Query 1843 TGTGCTACCAGACTTGACTCTTATTACTAAGGAGGAACTAGGAGGAGAGATCATTCCCCG 1902
|||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1779 TGTGCTGCCGGACTTGACTCTTATTACTAAGGAGCAACTAGGAGGAGAGATAATTCCCCG 1838
Query 1903 ATCTGTTCTTCTTTGTGCATTTGAAGGGATATCTTACTTGCTCTGTGCTCTTGGAGACGG 1962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1839 ATCTGTTCTTCTTTGTGCATTTGAAGGGATATCTTACTTGCTCTGTGCTCTTGGAGATGG 1898
Query 1963 TCATCTCTTAAACTTCCAGTTGGATACAAGTTGCGGGAAATTAAGAGATCGGAAAAAAGT 2022
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1899 TCATCTCTTAAACTTCCAGTTGGATACAAGTAGCGGGAAATTAAGAGACCGGAAAAAAGT 1958
Query 2023 ATCACTGGGGACTC-GACCTATAACTCTGCGTACTTTTTCATCTAAAAGTGCAACGCATG 2081
|||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1959 ATCACTTGGGACTCAG-CCTATAACTCTGCGTACTTTTTCATCTAAAAGTGCAACGCATG 2017
Query 2082 TCTTCGCTGCATCAGATAGACCAGCTGTTATATATAGCAACAACAAGAAGCTATTATACA 2141
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2018 TCTTTGCTGCATCAGATAGACCAGCTGTTATATATAGCAACAACAAGAAGCTGTTATACA 2077
Query 2142 GCAACGTGAATCTGAAAGAAGTTAGTCATATGTGTCCCTTCAACTCTGCTGCTTTTCCAG 2201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2078 GCAACGTGAATCTGAAAGAAGTTAGTCATATGTGTCCCTTCAACTCTGCTGCTTTTCCAG 2137
Query 2202 ACAGTCTAGCAATTGCAAGGGAGGGCGAACTTACAATTGGTACCATCGATGACATTCAGA 2261
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2138 ACAGTCTAGCAATTGCAAGGGAAGGCGAACTTACAATTGGCACCATCGATGACATTCAGA 2197
Query 2262 AGCTTCACATACGCACCATTCCCATTGGAGAGCATGCTCGTCGGATATGTCATCAGGAAC 2321
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2198 AGCTTCACATACGTACCATTCCTATTGGAGAGCATGCTCGTCGCATATGCCATCAGGAAC 2257
Query 2322 AAACACGAACATTTGCTATCTCCTGTTTGAGAAACGAACCAAGTGCAGAAGAATCTGAA- 2380
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2258 AAACACGGACATTTGCTATCTGCTGTTTGAGAAACCAACCAAGTGCAGAAGAATCTGAAA 2317
Query 2381 TCGCATTTTGTCCGTCTGCTGGATGCCCAAAGTTTCGAGTTCTTGTCAAGTTACCCTTTG 2440
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2318 T-GCATTTTGTCCGTCTGCTGGATGCCCAAAGTTTCGAGTTCTTGTCAACTTACCCTTTG 2376
Query 2441 GATGCCTTTGAATGTGGTTGCTCCATATTGAGCTGCTCGTTTACAGACGACAAAAATGTC 2500
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2377 GATGCCTTTGAATACGGTTGCTCCATATTGAGCTGCTCGTTTACAGACGACAAAAATGTC 2436
Query 2501 TATTATTGTGTTGGTACAGCATATGTTTTGCCCGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGG 2560
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2437 TATTATTGTGTTGGTACGGCATATGTTTTGCCCGAGGAAAATGAACCCACTAAGGGAAGG 2496
Query 2561 ATACTTGTGTTTATAGTTGAAGAAGGAAGATTGCAGCTTATCACAGAGAAGGAAACCAAG 2620
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2497 ATACTGGTGTTTATAGTTGAAGAAGGGAGATTGCAGCTTATTACAGAGAAGGAAACCAAG 2556
Query 2621 GGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTCAATGGCAAACTTCTTGCTTCTATTAATCAAAAG 2680
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2557 GGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTCAACGGCAAACTTCTTGCTGCTATTAATCAAAAA 2616
Query 2681 ATTCAGTTGTATAAGTGGATGCTGCGGGATGATGGCACTCGCGAGCTGCAATCTGAATGT 2740
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2617 ATTCAGTTGTATAAGTGGATGCTACGGGATGATGGCACTCGCGAGCTGCAGTCTGAATGT 2676
Query 2741 GGACATCACGGTCACATACTAGCTCTCTACGTGCAGACCCGTGGAGACTTCATCG-CTGT 2799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 2677 GGACATCACGGTCACATACTAGCTCTCTACGTGCAGACCCGTGGAGACTTCATCGTC-GT 2735
Query 2800 TGGTGATCTCATGAAATCAATCTCTTTATTGATCTACAAGCACGAGGAAGGTGCGATCGA 2859
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 TGGTGACCTCATGAAATCAATCTCTTTATTGATCTACAAGCACGAGGAAGGTGCGATCGA 2795
Query 2860 GGAGAGAGCTCGGGACTATAATGCAAACTGGATGACGGCAGTTGAGATACTCAATGATGA 2919
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2796 GGAAAGAGCTCGGGACTATAATGCAAACTGGATGGCGGCAGTTGAGATACTCGATGATGA 2855
Query 2920 CATCTACCTCGGTACTGATAATTGCTTCAACATATTCACCGTAAAGAAGAACAACGAAGG 2979
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2856 CATCTACCTCGGTGCTGATAATTGCTTCAACCTATTCACAGTAAAGAAGAACAATGAAGG 2915
Query 2980 TGCTACAGATGAAGAACGTGCTCGTATGGAGGTGGTTGGTGAGTATCACATAGGGGAATT 3039
||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2916 TGCCACAGATGAAGAACGGGCTCGTATGGAGGTCGTTGGTGAGTATCACATAGGGGAATT 2975
Query 3040 TGTGAACCGATTCCGCCATGGCTCTCTTGTCATGAAGCTGCCTGATTCAGATATTGGTCA 3099
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2976 TGTGAACCGATTCCGCCATGGCTCTCTTGTTATGAGGCTTCCTGATTCAGAGATTGGTCA 3035
Query 3100 GATACCGACAGTCATATTTGGCACTGTCAGTGGGATGATTGGAGTGATAGCGTCTCTGCC 3159
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3036 GATACCGACCGTCATATTTGGCACTGTCAGTGGGATGATTGGAGTGATAGCTTCTCTGCC 3095
Query 3160 TCAAGAACAGTATGCGTTTCTAGAGAAACTGCAGACGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGG 3219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3096 TCAAGAACAGTATGCGTTTCTAGAGAAACTGCAGACGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGG 3155
Query 3220 AGTTGGTGGTCTAAGCCACGAGCAGTGGAGATCGTTCAACAACGAGAAAAGAACTGCGGA 3279
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3156 AGTTGGTGGTCTAAGCCACGAGCAATGGAGATCATTCAACAACGAGAAAAGAACTGCGGA 3215
Query 3280 AGCAAAGGGTTACTTGGATGGAGACCTTATTGAATCGTTCTTGGATTTGAGCAGAGGTAA 3339
||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3216 AGCAAAGAGTTACTTGGATGGAGATCTAATTGAATCGTTCTTGGATTTGAGCAGAGGTAA 3275
Query 3340 GATGGAGGAGATCTCCAAAGGTATGGATGTTCAAGTGGAAGAGTTGTGCAAGAGAGTTGA 3399
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3276 GATGGAGGAGATCTCTAAAGGTATGGATGTCCAAGTGGAAGAGTTGTGCAAGAGAGTTGA 3335
Query 3400 AGAACTCACTAGGCTTCACTGA 3421
|||||| |||||||||||||||
Sbjct 3336 AGAACTAACTAGGCTTCACTGA 3357
> Ahg943318 jgi|Araly1|943318|scaffold_603862.1
Length=3313
Score = 3845 bits (2082), Expect = 0.0
Identities = 2908/3309 (88%), Gaps = 48/3309 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 145 GAAGAAGAAGATGAGCGT-ATGGAACTACGCCGTTACGGCTCAGAAACCGACCTGTGTCA 203
||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 16 GAAGAGGAAGATGAGC-TCATGGAACTACGTTGTTACGGCTCACAAACCGACCAGTGTCA 74
Query 204 CTCACTCTTGCGTCGGGAACTTCACAAGTCCTCAAGAACTCAATCTCATTGTTGCGAAAT 263
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCACTCGTGCGTTGGCAACTTCACAAGTCCTCAAGAGCTCAATCTCATTGTTGCGAAAT 134
Query 264 CCACTCGAATCGAGATCCATCTGCTTTCTCCACAGGGACTTCAGACTATACTGGATGTTC 323
|| ||||| ||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 135 GTACCCGAATTGAGATCCATTTGCTTACCCCGCAGGGACTTCAGCCTATGCTGGATGTTC 194
Query 324 CTCTATATGGGAGAATCGCAACTATGGAATTGTTCCGTCCCCATGGTGAAGCACAAGACT 383
|| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 195 CTATATATGGAAGAATCGCTACTCTGGAGTTGTTCCGGCCCCATGGCGAAGCACAAGACT 254
Query 384 TTTTGTTTGTTGCAACTGAAAGATATAAATTCTGTGTTCTTCAATGGGATTATGAGTCCT 443
||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 255 TTTTGTTCATTGCAACTGAGAGATACAAATTCTGTGTTCTTCAGTGGGATCCTGAGTCCT 314
Query 444 CTGAGCTTATTACAAGGGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCGACAGACA 503
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 315 CTGAGCTTATTACAAGAGCAATGGGGGATGTTTCTGATCGTATAGGCCGACCAACAGACA 374
Query 504 ATGGTCAGATTGGTATAATTGATCCTGATTGCAGAGTAATTGGTCTGCATCTGTATGACG 563
||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||
Sbjct 375 ATGGTCAGATTGGCATAATTGATCCAGATTGTAGATTAATTGGACTCCATCTGTATGACG 434
Query 564 GCTTGTTTAAGGTCATTCCATTTGACAATAAAGGACAGCTCAAGGAAGCCTTTAACATAA 623
||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |
Sbjct 435 GCTTGTTCAAGGTTATTCCATTTGATAATAAGGGACAGCTCAAAGAAGCTTTTAATATCA 494
Query 624 GGCTGGAGGAGTTGCAGGTCCTAGATATCAAGTTTCTGTATGGATGCACGAAA-CCAACA 682
|||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||| || ||
Sbjct 495 GGCTTGAGGAATTGCAGGTTCTGGATATCAAGTTTCTGTTTGGATGTGC-AAAGCCCACT 553
Query 683 ATTGCAGTACTTTATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTTTCT 742
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 554 ATTGCAGTACTATATCAGGACAACAAAGATGCTCGTCATGTCAAAACATATGAAGTCTCT 613
Query 743 CTAAAGGATAAGAACTTTGTCGAAGGTCCATGGTCACAGAACAATCTCGACAATGGTGCT 802
||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 614 CTAAAAGATAAGGATTTTGTCGAGGGTCCATGGTCACAGAATAATCTCGACAATGGTGCT 673
Query 803 GACTTATTGATCCCTGTACCTTCACCTCTATGTGGCGTCCTCATCATTGGGGAAGAAACA 862
||||| |||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 674 GACTTGCTGATTCCTGTACCACCACCGCTCTGTGGTGTCCTTATTATTGGTGAAGAAACA 733
Query 863 ATTGTCTATTGTAGTGCCAATGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTTCCATCACAAAA 922
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 734 ATTGTCTATTGCAGTGCTAATGCATTCAAAGCAATACCAATAAGACCTTCCATCACTAAA 793
Query 923 GCATATGGAAGAGTTGATCTTGATGGTTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATGCCGGACTG 982
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 794 GCATATGGAAGAGTTGATGTTGATGGCTCTAGGTATCTTCTTGGTGACCATGCTGGACTG 853
Query 983 ATTCACCTGCTTGTTATAACCCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTCAAAATTGAGCTT 1042
||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 854 ATTCATCTTCTTGTTATAACGCATGAGAAAGAAAAGGTCACTGGCCTAAAAATTGAGCTT 913
Query 1043 TTGGGTGAAACCTCTATTGCATCTTCCATCTCGTATCTGGACAATGCTGTCGTCTTTGTC 1102
||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || |||||||| || |||||||||
Sbjct 914 TTGGGTGAAACATCTATTGCATCGACTATATCGTACCTTGACAATGCCGTTGTCTTTGTC 973
Query 1103 GGTTCAAGCTATGGAGATTCACAGCTTATTAA-GCTAAACCTGCAACCGGATGCAAAAGG 1161
|| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || || || || |||||||||||
Sbjct 974 GGCTCAAGCTATGGCGATTCACAGCT-AGTAAAGCTGAATCTACACCCTGATGCAAAAGG 1032
Query 1162 GTCATATGTAGAAATTTTAGAAAAGTATGTCAACTTGGGGCCTATTGTCGATTTTTGTGT 1221
|||||||||||| | || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1033 CTCATATGTAGAAGTCTTGGAAAGGTATATCAACTTGGGGCCTATTGTCGACTTTTGTGT 1092
Query 1222 AGTTGACCTTGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGCTCTGGAGCATACAAGGA 1281
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 1093 AGTTGACCTCGAGAGACAGGGGCAAGGTCAGGTTGTAACTTGTTCTGGAGCATTTAAGGA 1152
Query 1282 TGGTTCTCTTCGCATAGTTCGCAATGGGATAGGAATAAATGAACAGGCGTCCGTGGAACT 1341
|||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1153 TGGTTCCCTCCGCGTAGTTCGCAATGGAATAGGAATCAATGAACAGGCGTCTGTGGAACT 1212
Query 1342 TCAAGGCATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCGTCAATTGATGAAGCCTTTGATACATT 1401
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1213 TCAAGGTATCAAAGGAATGTGGTCGTTGAAATCTTCAATTGATGAAGCCTTCGATACATT 1272
Query 1402 CCTTGTAGTTAGTTTTATCAGTGAAACTCGTATACTAGCCATGAATATAGAGGATGAACT 1461
||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1273 CCTCGTTGTTAGCTTTATCAGTGAAACTCGTATATTAGCCATGAATCTTGAGGATGAACT 1332
Query 1462 GGAAGAAACAGAGATTGAGGGTTTTTTGTCTGAAGTTCAGACTTTATTTTGCCATGATGC 1521
||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGAAGAAACAGAGATTGAGGGCTTCTTGTCTCAAGTGCAGACGTTATTTTGCCATGATGC 1392
Query 1522 TGTCTACAACCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGATTAGTTAGTTCTACAAC 1581
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1393 TGTGTACAATCAACTTGTACAGGTTACCTCAAATTCTGTTAGACTAGTCAGTTCTACAAC 1452
Query 1582 TAGAGAGTTGCGGAATAAATGGGATGCCCCAGCTGGATTCTCTGTTAATGTTGCAACTGC 1641
|||||| |||||| | | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1453 TAGAGAATTGCGGGACGAGTGGCATGCCCCGGCTGGATTCACTGTTAATGTTGCAACTGC 1512
Query 1642 AAATGCGAGCCAGGTTCTTTTGGCCACTGGAGGTGGGCATTTGGTCTATCTAGAAATTGG 1701
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1513 AAATGCCAGCCAGGTTCTTTTGGCGACTGGAGGTGGGCATTTGGTGTATCTAGAAATTGG 1572
Query 1702 GGATGGGACATTGACGGAAGTGAAACATGTCCTGTTGGAGTACGAGGTTTCTTGTCTTGA 1761
||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1573 AGATGGGAAATTGACGGAAGTGCAACATGCCCTTTTGGAGTACGAGGTTTCTTGTCTTGA 1632
Query 1762 CATAAACCCCATTGGTGATAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTGCCGTCGGGATGTGGAC 1821
|||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||
Sbjct 1633 TATAAACCCTATCGGTGACAATCCTAATTACAGTCAGCTAGCTTCGGTTGGGATGTGGAC 1692
Query 1822 TGATATAAGTGTGAGGAT-TTTTGTGCTACCAGACTTGACTCTTATTACTAAGGAGGAAC 1880
||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||
Sbjct 1693 AGATATAAGTGTGAGGATCTTTTC-GCTGCCAGAATTGACTCTTATTACAAAAGAGCAAC 1751
Query 1881 TAGGAGGAGAGATCATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTTGAAGGGATATCTTACT 1940
| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1752 TCGGAGGGGAAATAATTCCCCGATCTGTTCTTCTTTGTGCATTCGAAGGGATATCTTACT 1811
Query 1941 TGCTCTGTGCTCTTGGAGACGGTCATCTCTTAAACTTCCAGTTGGATACAAGTTGCGGGA 2000
||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1812 TGCTCTGTGCTCTTGGAGATGGCCATCTTTTGAACTTCCAGTTGGATACAACTACCGGGC 1871
Query 2001 AATT-AAGAGATC-GGAAAAAAGTATCACTGGGGACTC-GACCTATAACTCTGCGTACTT 2057
| || || ||| | |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 1872 AGTTGAA-AGA-CAGGAAAAAAGTATCACTAGGGACTCAG-CCTATAACTCTGCGTACTT 1928
Query 2058 TTTCATCTAAAAGTGCAACGCATGTCTTCGCTGCATCAGATAGACCAGCTGTTATATATA 2117
||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||
Sbjct 1929 TTTCATCAAAAAGCGCCACACATGTCTTTGCTGCATCAGATAGACCAACCGTGATCTATA 1988
Query 2118 GCAACAACAAGAAGCTATTATACAGCAACGTGAATCTGAAAGAAGTTAGTCATATGTGTC 2177
||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1989 GCAGCAACAAGAAACTGTTATACAGCAATGTCAATCTTAAAGAAGTTAGTCATATGTG-C 2047
Query 2178 CCTT-CAACTCTGCTGCTTTTCCAGACAGTCTAGCAATTGCAAGGGAGGGCGAACTTACA 2236
|||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||
Sbjct 2048 CCTTTCAACTCTGCTGCTTTTCCCGACAGTTTAGCAATTGCCAGGGAAGGTGAACTTACG 2107
Query 2237 ATTGGTACCATCGATGACATTCAGAAGCTTCACATACGCACCATTCC-CATTGGAGAGCA 2295
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||
Sbjct 2108 ATTGGTACCATTGATGATATTCAGAAGCTTCACATACGCACTATTCCTC-TTGGAGAGCA 2166
Query 2296 TGCTCGTCGGATATGTCATCAGGAACAAACACGAACATTTGCTATCTCCTGTTTGAGAAA 2355
||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||
Sbjct 2167 TGCTCGTCGAATTTGCCATCAGGAGCAGACACGTACATTTGGTATCTGCAGTTTGGGAAA 2226
Query 2356 CGAACCAAGTGCAGAAGAATCTGAA-TCGCATTTTGTCCGTCTGCTGGATGCCCAAAGTT 2414
| | ||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| | || | ||| | ||
Sbjct 2227 CCAGTCAAATGCCGAAGAATCTGAAAT-GCACTTTGTCCGTCTTTTAGACGACCAGACTT 2285
Query 2415 TCGAGTTCT-TGTCAAGTTACCCTTTGGATGCCTTTGAATGTGGTTGCTCCATAT-TGAG 2472
||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||
Sbjct 2286 TCGAGTT-TATGTCAACTTACCCCTTGGATTCCTTTGAATACGGTTGCTCCAT-TCTGAG 2343
Query 2473 CTGCTCGTTTACAGACGACAAAAATGTCTATTATTGTGTTGGTACAGCATATGTTTTGCC 2532
|||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||
Sbjct 2344 CTGCTCATTCACCGACGATAAAAATGTCTATTACTGCGTTGGAACCGCATATGTTTTACC 2403
Query 2533 CGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATACTT-GTGTTTATAGTTGAAGAAGGAAGAT 2591
|||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || |
Sbjct 2404 GGAGGAAAATGAACCAACTAAGGGAAGGATA-TTAGTATTTATAGTTGAAGATGGGAGGT 2462
Query 2592 TGCAGCTTA-TCACAGAGAAGGAAACCAAGGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTCAAT 2650
||||| ||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2463 TGCAG-TTAATCGCCGAGAAAGAAACCAAAGGAGCTGTTTATTCTCTCAATGCCTTTAAT 2521
Query 2651 GGCAAACTTCTTGCTTCTATTAATCAAAAGATTCAGTTGTATAAGTGGATGCTGCGGGAT 2710
|| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2522 GGAAAACTTCTTGCTGCTATTAATCAGAAGATTCAGTTGTACAAGTGGATGCTGCGGGAT 2581
Query 2711 GATGGCACTCGCGAGCTGCAATCTGAATGTGGACATCACGGTCACATACTAGCTCTCTAC 2770
||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 2582 GATGGCACTCGTGAACTGCAGTCTGAATGCGGACATCACGGACACATTCTAGCTCTCTAT 2641
Query 2771 GTGCAGACCCGTGGAGACTTCATCGCTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCTTTATTG 2830
|| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2642 GTACAGACCCGTGGAGACTTTATCGTTGTTGGTGATCTCATGAAATCAATCTCCTTATTG 2701
Query 2831 ATCTACAAGCACGAGGAAGGTGCGATCGAGGAGAGAGCTCGGGACTATAATGCAAACTGG 2890
| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| || ||||| || |||
Sbjct 2702 TTATACAAGCACGAGGAAGGTGCAATTGAGGAGCGGGCTCGGGATTACAATGCGAATTGG 2761
Query 2891 ATGACGGCAGTTGAGATACTCA-ATGATGACATCTACCTCGGTACTGATAATTGCTTCAA 2949
||| | || ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||| || |||||
Sbjct 2762 ATGTCAGCGGTTGAGATACT-AGATGATGATATTTACCTCGGTGCTGAGAACAATTTCAA 2820
Query 2950 -CATATTCACCGT-AAAGAAGAACAACGAAGGTGCTACAGATGAAGAACGTGCTCG-TAT 3006
| | || || || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || | |
Sbjct 2821 TC-TGTTAACAGTGAAA-AAGAACAGTGAAGGTGCTACTGATGAAGAACGAGGACGGT-T 2877
Query 3007 GGAGGTGGTTGGTGAGTATCACATAGGGGAATTTGTGAACCGATTCCGCCATGGCTCTCT 3066
|||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 2878 GGAGGTAGTTGGAGAGTATCACCTTGGGGAATTTGTGAACAGATTCCGCCATGGATCTCT 2937
Query 3067 TGTCATGAAGCTGCCTGATTCAGATATTGGTCAGATACCGACAGTCATATTTGGCACTGT 3126
|| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||
Sbjct 2938 AGTAATGAGGCTACCTGATTCAGAGATTGGTCAGATCCCAACTGTCATCTTTGGTACCGT 2997
Query 3127 CAGTGG-GATGATTGGAGTGATAGCGTCTCTGCCTCAAGAACAGTATGCGTTTCTAG-AG 3184
|| ||| | |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||||| | ||
Sbjct 2998 CAATGGAG-TGATAGGAGTAATAGCTTCACTTCCTCAAGAACAGTATAC-TTTCTTGGAG 3055
Query 3185 AAACTGCAGACGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGGAGTTGGTGG-TCTAAGCCACGAGCA 3243
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||
Sbjct 3056 AAGTTGCAGTCGAGTCTGAGGAAAGTGATTAAAGGAGTTGGCGGAT-TAAGCCACGAGCA 3114
Query 3244 GTGGAGATCGTTCAACAACGAGAAAAGAACTGCGGAAGCAAAGGG-TTACTTGGATGGAG 3302
||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| | || || ||||||||| |
Sbjct 3115 ATGGAGGTCGTTTAATAACGAGAAAAGAACCGCAGAAGCGA-GGAATTTCTTGGATGGTG 3173
Query 3303 ACCTTATT-GAATCGTT-CTTGGATTTGAGCAGAGGTAAGATGGAGGAGATCTCCAAAGG 3360
|| ||| | |||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||| || || |||
Sbjct 3174 AC-TTAATCGAATCGTTTCT-GGATCTGAGTAGAAACAAGATGGAGGATATATCGAAATC 3231
Query 3361 TATGGATGTTCAAGTGGAAGAGTTGTGCAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTG 3420
||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3232 CATGAATGTTCAAGTGGAAGAGTTGTGTAAGAGAGTTGAAGAACTCACTAGGCTTCACTG 3291
Query 3421 AAGCAAATC 3429
|| ||||||
Sbjct 3292 AATCAAATC 3300
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 135066326577
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5