BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G21710.1
Length=3794
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg492703 jgi|Araly1|492703|fgenesh2_kg.7__2136__AT4G21710.1 6189 0.0
Ahg902613 jgi|Araly1|902613|Al_scaffold_0004_3263 300 6e-80
> Ahg492703 jgi|Araly1|492703|fgenesh2_kg.7__2136__AT4G21710.1
Length=3609
Score = 6189 bits (3351), Expect = 0.0
Identities = 3523/3609 (98%), Gaps = 0/3609 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 34 TTTGCTGTGCTCTAATCTTCAGAGAGTGAGAATAAATGGAGTACAACGAATACGAACCTG 93
|||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTGCTCTGCTCCGATCTTAAGTGAGTGAGAAAAAATGGAGTACAACGAATACGAACCTG 60
Query 94 AACCTCAATATGTAGAAGACGATGACGATGAGGAGATTACCCAGGAGGACGCGTGGGCTG 153
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AACCTCAATATGTAGAAGACGATGATGATGAGGAGATTACCCAGGAGGACGCGTGGGCTG 120
Query 154 TTATATCTGCTTATTTCGAAGAGAAAGGTCTCGTTCGTCAACAGCTGGATTCGTTTGATG 213
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 121 TTATATCTGCTTATTTCGAAGAGAAAGGTCTCGTTCGTCAGCAGCTCGATTCGTTTGATG 180
Query 214 AGTTTATTCAAAATACTATGCAAGAAATCGTTGATGAGTCTGCTGATATCGAGATCCGAC 273
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AGTTTATTCAGAATACTATGCAAGAAATTGTTGATGAGTCTGCTGATATCGAGATCCGAC 240
Query 274 CTGAATCTCAGCATAATCCTGGCCATCAGTCCGATTTTGCGGAGACAATCTACAAGATTA 333
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTGAATCTCAGCACAATCCTGGCCACCAGTCCGATTTTGCGGAGACAATCTACAAGATTA 300
Query 334 GCTTTGGACAGATTTATCTGAGTAAACCTATGATGACAGAGTCTGATGGAGAGACTGCCA 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCTTTGGACAGATTTATCTGAGTAAACCTATGATGACAGAGTCTGATGGAGAGACTGCCA 360
Query 394 CCCTGTTCCCTAAGGCTGCAAGGTTGAGAAATCTCACATACTCTGCGCCTTTGTATGTCG 453
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 361 CCCTGTTCCCTAAGGCTGCGAGGTTGAGAAACCTCACATATTCTGCTCCTTTGTATGTCG 420
Query 454 ATGTTACTAAGAGAGTTATTAAGAAAGGGCATGATGGTGAAGAAGTTACGGAGACACAGG 513
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 421 ATGTTACTAAGAGAGTTATAAAGAAAGGGCATGATGGTGAAGAAGTTACAGAGACCCAGG 480
Query 514 ATTTTACTAAAGTTTTCATTGGAAAGGTTCCCATCATGCTCCGGTCTAGTTACTGTACCT 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ATTTTACTAAAGTTTTCATTGGAAAGGTTCCCATCATGCTCCGGTCTAGTTACTGTACCT 540
Query 574 TGTTTCAGAACTCGGAGAAAGACCTGACAGAGCTTGGAGAATGTCCTTATGATCAGGGTG 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TGTTTCAGAACTCGGAGAAAGACCTGACAGAGCTTGGAGAATGTCCTTATGATCAGGGTG 600
Query 634 GATACTTCATTATTAATGGCAGTGAAAAGGTTCTGATTGCTCAGGAGAAGATGAGTACGA 693
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GATACTTCATTATTAATGGCAGTGAAAAGGTTCTTATTGCTCAGGAGAAGATGAGTACGA 660
Query 694 ATCATGTTTATGTGTTCAAGAAAAGGCAGCCAAATAAGTATGCTTATGTTGGTGAAGTCC 753
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATCATGTTTATGTGTTCAAGAAGAGACAGCCAAATAAGTATGCTTATGTTGGTGAAGTCC 720
Query 754 GTTCTATGGCTGAAAACCAAAATAGGCCTCCAAGCACAATGTTTGTGCGTATGCTTGCTC 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTTCTATGGCTGAAAACCAAAATAGGCCTCCAAGCACAATGTTTGTGCGTATGCTTGCTC 780
Query 814 GTGCTAGTGCAAAAGGGGGTTCATCTGGACAGTATATTCGATGTACTCTTCCATACATCA 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GTGCTAGTGCAAAAGGGGGTTCATCTGGACAGTATATTCGATGTACTCTTCCATACATCA 840
Query 874 GAACAGAAATTCCTATTATCATAGTATTTCGTGCACTGGGATTTGTTGCCGATAAGGACA 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GAACAGAAATTCCTATTATCATAGTATTTCGTGCACTGGGATTTGTTGCCGATAAGGACA 900
Query 934 TATTGGAACACATCTGCTATGATTTTGCCGATACCCAGATGATGGAGTTGCTCAGGCCTT 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TATTGGAACACATCTGCTATGATTTTGCCGATACCCAGATGATGGAGTTGCTCAGGCCTT 960
Query 994 CCTTGGAAGAAGCTTTCGTTATTCAAAATCAGCTGGTTGCACTTGACTATATTGGAAAAC 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCTTGGAAGAAGCTTTCGTTATTCAAAATCAGCTGGTTGCACTTGACTATATTGGAAAAC 1020
Query 1054 GTGGTGCAACTGTTGGTGTAACCAAGGAAAAAAGGATAAAGTATGCTAGAGATATCCTTC 1113
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1021 GTGGTGCAACTGTTGGTGTAACCAAGGAGAAAAGGATAAAGTATGCGAAAGATATCCTTC 1080
Query 1114 AGAAAGAAATGCTTCCTCATGTAGGAATTGGGGAGCATTGCGAGACAAAGAAAGCTTACT 1173
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1081 AGAAAGAAATGCTTCCTCATGTAGGAATTGGGGAATATTGCGAGACGAAGAAAGCTTATT 1140
Query 1174 ATTTTGGGTATATCATACACCGGCTGCTGCTTTGTGCACTTGGCCGAAGGCCAGAAGATG 1233
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1141 ATTTTGGGTATATCATACACCGGCTGCTGCTTTGTGCACTGGGCCGAAGGCCAGAAGATG 1200
Query 1234 ATAGGGATCATTATGGTAACAAAAGGCTGGATCTTGCTGGTCCTTTACTTGGAGGGCTAT 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1201 ATAGGGATCATTATGGTAACAAAAGGCTGGATCTTGCTGGTCCATTACTTGGAGGGCTGT 1260
Query 1294 TTAGAATGCTTTTCCGAAAGTTAACAAGGGATGTGAGATCTTATGTTCAAAAGTGCGTTG 1353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TTAGAATGCTTTTCCGAAAGTTAACAAGGGATGTGAGATCTTATGTTCAAAAGTGCGTTG 1320
Query 1354 ACAATGGCAAAGAAGTCAATCTTCAATTTGCCATTAAGGCTAAAACAATTACCTCTGGCC 1413
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 ACAATGGCAAAGAAGTCAATCTTCAATTTGCCATCAAGGCTAAAACAATTACCTCTGGCC 1380
Query 1414 TGAAATATTCTCTTGCTACTGGGAACTGGGGCCAGGCAAACGCTGCTGGCACAAGAGCTG 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 TGAAATATTCTCTTGCTACTGGGAACTGGGGCCAGGCAAACGCTGCTGGCACAAGAGCTG 1440
Query 1474 GAGTCTCTCAGGTTCTTAACCGGTTGACATATGCTTCGACTTTGTCACATCTGAGGCGTC 1533
|||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GAGTTTCTCAGGTTCTTAATCGGTTGACGTATGCTTCGACTTTGTCACATCTGAGGCGTC 1500
Query 1534 TCAATTCTCCAATAGGACGTGAAGGAAAATTGGCAAAACCAAGACAACTGCACAACTCAC 1593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 TCAATTCTCCAATAGGACGTGAAGGAAAATTGGCAAAGCCAAGACAACTGCACAACTCAC 1560
Query 1594 AGTGGGGAATGATGTGCCCTGCTGAAACACCTGAAGGACAGGCTTGTGGTCTAGTGAAAA 1653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 AGTGGGGAATGATGTGCCCTGCTGAAACACCTGAAGGACAGGCTTGTGGTCTAGTGAAAA 1620
Query 1654 ACTTGGCTCTCATGGTCTACATAACAGTTGGGTCAGCTGCTTATCCTATATTGGAATTTT 1713
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 ACTTGGCTCTCATGGTCTACATAACAGTTGGGTCCGCTGCTTATCCTATATTGGAATTTT 1680
Query 1714 TGGAAGAATGGGGTACTGAGAATTTTGAGGAAATATCTCCATCTGTTATACCCCAAGCCA 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TGGAAGAATGGGGTACTGAGAATTTTGAGGAAATATCTCCATCTGTTATACCCCAAGCCA 1740
Query 1774 CAAAAATCTTTGTCAATGGAATGTGGGTTGGAGTTCATAGAGATCCTGACATGTTGGTGA 1833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 CAAAAATCTTTGTCAATGGAATGTGGGTTGGAGTTCATAGAGATCCTGACATGTTGGTGA 1800
Query 1834 AAACGTTGAGACGTTTGAGACGAAGGGTTGATGTCAACACTGAAGTTGGTGTAGTTAGAG 1893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1801 AAACGTTGAGACGTTTGAGACGAAGGGTTGATGTCAACACTGAAGTTGGCGTAGTTAGAG 1860
Query 1894 ATATCCGTCTTAAAGAGCTCCGGATATACACTGATTATGGACGTTGTAGCCGTCCGTTGT 1953
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1861 ATATACGTCTTAAAGAGCTCCGAATATACACTGATTATGGCCGTTGTAGCCGTCCGTTGT 1920
Query 1954 TTATTGTAGATAATCAGAAGCTCTTAATAAAGAAGAGAGATATCTATGCTCTGCAACAAA 2013
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1921 TTATTGTAGATAATCAGAGGCTCTTAATAAAGAAGAGAGATATTTATGCTCTGCAACAAA 1980
Query 2014 GGGAAAGTGCAGAAGAAGATGGTTGGCATCATCTGGTTGCTAAGGGCTTTATAGAATACA 2073
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 GGGAAAGTGCGGAAGAAGATGGTTGGCATCATCTGGTTGCTAAGGGCTTTATAGAATACA 2040
Query 2074 TAGACACAGAAGAAGAGGAAACGACCATGATTTCCATGACTATCAGTGATCTGGTTCAAG 2133
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 TAGACACAGAGGAAGAGGAAACGACCATGATTTCCATGACTATCAGTGATCTGGTTCAAG 2100
Query 2134 CTAGACTCCGCCCAGAAGAGGCTTATACTGAAAACTACACACATTGTGAGATTCACCCAT 2193
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 CTAGACTCCGCCCAGAGGAGGCTTATACTGAAAACTACACACATTGTGAGATTCACCCAT 2160
Query 2194 CTCTGATATTGGGGGTCTGTGCTTCAATCATACCATTTCCTGACCATAATCAGTCACCTC 2253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 CTCTGATATTGGGGGTCTGTGCTTCAATCATACCATTTCCTGACCATAATCAGTCACCTC 2220
Query 2254 GTAATACATATCAATCTGCCATGGGGAAGCAAGCAATGGGAATTTATGTCACCAACTACC 2313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTAATACATATCAATCTGCCATGGGGAAGCAAGCAATGGGAATTTATGTCACCAACTACC 2280
Query 2314 AATTTCGCATGGATACGTTAGCTTATGTTCTCTATTATCCACAAAAGCCTTTGGTTACTA 2373
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||
Sbjct 2281 AATTTCGCATGGATACCTTAGCCTATGTTCTCTATTACCCGCAAAAGCCTCTGGTTACTA 2340
Query 2374 CAAGAGCTATGGAGCATCTTCACTTTAGACAACTTCCAGCAGGAATTAATGCTATTGTTG 2433
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 CAAGAGCTATGGAGCATCTTCACTTTAGGCAACTTCCAGCAGGAATTAATGCTATTGTTG 2400
Query 2434 CCATTTCTTGCTATTCTGGATATAATCAAGAAGATTCTGTCATCATGAATCAGTCTTCAA 2493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 CCATTTCTTGCTATTCTGGATATAATCAAGAAGATTCTGTCATCATGAATCAGTCTTCAA 2460
Query 2494 TAGATCGTGGTTTCTTTCGATCCTTGTTCTTTCGGTCTTACAGAGATGAGGAGaaaaaaa 2553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 TAGATCGTGGTTTCTTTCGATCCTTGTTCTTTCGGTCTTACAGAGATGAGGAGAAAAAAA 2520
Query 2554 TGGGGACGCTTGTCAAAGAAGACTTTGGGCGCCCAGACAGAGGAAGTACAATGGGTATGC 2613
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2521 TGGGGACTCTTGTCAAAGAAGACTTTGGGCGCCCAGACAGAGGAAGCACAATGGGTATGC 2580
Query 2614 GACATGGTTCTTATGATAAACTGGATGATGATGGTCTTGCGCCTCCTGGTACTAGAGTTT 2673
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2581 GACATGGTTCTTATGATAAATTGGATGATGATGGTCTTGCACCTCCTGGTACTAGAGTTT 2640
Query 2674 CAGGTGAAGATGTTATCATTGGGAAAACCACTCCAATATCTCAAGATGAGGCTCAAGGAC 2733
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 CAGGTGAAGATGTTATCATTGGAAAAACCACTCCAATATCTCAAGATGAGGCTCAAGGAC 2700
Query 2734 AATCATCCCGATACACTAGACGTGATCATAGTATAAGCTTGCGACATAGTGAAACTGGAA 2793
||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 AATCATCACGATACACTAGACGCGACCATAGTATAAGCTTGCGACATAGTGAAACTGGAA 2760
Query 2794 TGGTGGATCAGGTGTTATTGACTACAAATGCAGATGGTTTGAGGTTTGTGAAAGTGAGGG 2853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 TGGTGGATCAGGTGTTATTGACTACAAATGCAGATGGTTTGAGGTTTGTGAAAGTGAGGG 2820
Query 2854 TCAGATCCGTGCGGATTCCTCAAATTGGAGACAAATTTAGTAGTAGACACGGTCAGAAGG 2913
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2821 TCAGATCTGTTCGGATTCCTCAAATTGGAGACAAATTTAGTAGTAGACATGGTCAGAAGG 2880
Query 2914 GAACTGTTGGCATGACCTACACGCAGGAGGATATGCCATGGACGATTGAAGGGGTCACTC 2973
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2881 GAACTGTTGGGATGACCTACACGCAGGAGGACATGCCATGGACGATTGAAGGCGTCACTC 2940
Query 2974 CGGACATTATTGTGAATCCACATGCTATTCCGTCTCGAATGACAATTGGACAGCTAATTG 3033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2941 CGGACATTATTGTGAATCCACATGCTATTCCGTCTCGAATGACAATTGGACAGCTAATTG 3000
Query 3034 AGTGCATCATGGGAAAAGTGGCAGCTCACATGGGAAAAGAAGGAGATGCTACTCCCTTTA 3093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 3001 AGTGCATCATGGGAAAAGTGGCAGCTCACATGGGAAAAGAAGGAGATGCGACTCCTTTTA 3060
Query 3094 CAGATGTCACGGTGGATAATATAAGCAAAGCCCTTCATAAGTGTGGGTACCAAATGCGTG 3153
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3061 CAGATGTCACGGTGGATAATATAAGCAAAGCTCTTCATAAGTGTGGGTACCAAATGCGTG 3120
Query 3154 GATTTGAGAGAATGTACAATGGTCACACGGGCAGACCACTCACAGCTATGATATTCCTTG 3213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3121 GATTTGAGAGAATGTACAATGGTCACACGGGCAGACCACTCACAGCTATGATATTCCTTG 3180
Query 3214 GACCAACATATTACCAAAGATTGAAGCATATGGTTGATGACAAGATTCACTCGCGTGGAC 3273
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3181 GGCCAACGTATTACCAAAGATTGAAGCATATGGTTGATGACAAGATTCACTCCCGTGGAC 3240
Query 3274 GAGGTCCGGTGCAAATCTTAACAAGACAACCAGCTGAAGGGCGATCACGTGATGGTGGTC 3333
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3241 GAGGTCCTGTGCAAATCTTAACAAGACAACCAGCTGAAGGGCGATCCCGTGATGGTGGTC 3300
Query 3334 TCCGTTTTGGAGAAATGGAGCGCGATTGCATGATTGCACATGGTGCTGCTCACTTTTTGA 3393
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3301 TCCGTTTTGGAGAAATGGAACGCGATTGCATGATTGCTCATGGTGCTGCACACTTTTTGA 3360
Query 3394 AAGAGAGGCTGTTTGATCAGAGTGATGCGTATAGGGTACATGTGTGTGAAGTCTGCGGGC 3453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3361 AAGAGAGGCTGTTTGATCAGAGTGATGCGTATAGGGTACATGTGTGTGAAGTCTGTGGGC 3420
Query 3454 TCATTGCCATTGCAAATCTGAAGAAGAATTCTTTTGAATGCAGAGGTTGCAAGAACAAAA 3513
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3421 TCATCGCCATTGCAAATCTGAAGAAGAATTCTTTTGAATGCAGAGGTTGCAAGAACAAAA 3480
Query 3514 CAGATATTGTTCAGGTATACATTCCATATGCTTGCAAATTACTCTTTCAAGAGCTTATGT 3573
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3481 CAGATATTGTTCAGGTATACATTCCATATGCATGCAAATTGCTCTTTCAAGAGCTTATGT 3540
Query 3574 CAATGGCTATTGCACCAAGGATGCTCACTAAACACCTGAAATCGGCTAAAGGCAGACAGT 3633
||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3541 CAATGGCTATTGCGCCAAGGATGCTTACCAAACACCTGAAATCGGCTAAAGGCAGACAGT 3600
Query 3634 GAGGAGCTT 3642
|||||||||
Sbjct 3601 GAGGAGCTT 3609
> Ahg902613 jgi|Araly1|902613|Al_scaffold_0004_3263
Length=258
Score = 300 bits (162), Expect = 6e-80
Identities = 223/251 (89%), Gaps = 9/251 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 3360 TGCATGATTGCACATGGTGCTGCTCACTTTTTGAAAGAGAGGCTGTTTGATCAGAGTGAT 3419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 10 TGCATGATTGCACATGGTGCTGCTCACTTTTTGAAAGGGAGGCTGTTTGATCAGGGTGAT 69
Query 3420 GCGTATAGGGTACATGTGTGTGAAGTCTGCGGGCTCATTGCCATTGCAAATCTGAAGAAG 3479
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 70 GCGTATACGGTACATGTGTGTGAAGTCTGCGGGCTCATCACCATTGCAAATATGAAGAAG 129
Query 3480 AATTCTTTTGAATGCAGAGGTTGCAAGAACAAAACAGATATTGTTCAG-GT-ATACATTC 3537
||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | | || | |||||
Sbjct 130 AATTCTTTTGAATGCAGAGGTGGCAAGAACAGAATAGATATAAAT-ATTGTCAG-CATTC 187
Query 3538 CATATGCTTGCAAATTACTCTTTCAAGAGCTTATGT-----CAATGGCTATTGCACCAAG 3592
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |
Sbjct 188 CATATGCTTGCAAATTGCTCTTTCAAGAGCTTATCTTATGGCAATGGCAATTGCACCACG 247
Query 3593 GATGCTCACTA 3603
|||||| ||||
Sbjct 248 GATGCTTACTA 258
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 143362877491
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5