BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G22970.1
Length=6809
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg492569 jgi|Araly1|492569|fgenesh2_kg.7__2002__AT4G22970.1 1.070e+04 0.0
Ahg945887 jgi|Araly1|945887|scaffold_702116.1 171 9e-41
> Ahg492569 jgi|Araly1|492569|fgenesh2_kg.7__2002__AT4G22970.1
Length=6795
Score = 1.070e+04 bits (5794), Expect = 0.0
Identities = 6478/6809 (95%), Gaps = 44/6809 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGTCCTCTGGCGACGACCTCCGTCTTCTCTCTCTCATCG-A-CGT-CG--G-C--- 51
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | | | || | |
Sbjct 1 ATGGCGTCCACT---GACGACCTCCGTCTTCTCTCTCTCATCGAATCTTCCGACGCCGGT 57
Query 52 GATAATGTCTTCTCTTCCTTCTCCGATTACCTTAAACCTTTCTCTACTCTATCCACTTCC 111
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 GATGATATCTTCTCTTCCTTCTCCGATTACCTTAAACCTTTCTCTACTCTATCCACTTCC 117
Query 112 CGGAAAAAACAAGACCGAGCAACCACGATTCGAGCCCTAGCTAAGCAATTCCTTCCTTTC 171
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 118 CGGAAAAAACAAGACCGAGCAACCACCATTCGAGCCCTAGCTAAGCAATTTCTTCCTTTC 177
Query 172 CTCAACAAATCGATCTCTCTCCTACCGAAACGTCTCTCCGTCGCGAATTCTGATAAGGAA 231
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct 178 CTCAACAAATCGATCTCGCTCCTACCGAAACGCCTCTCCGTCGCCAAGTCTGACAAGGAA 237
Query 232 GCTCGTGAATCAGCATTAGATCTGTTCCGTGCTTATGAACTTTGTTTGGACTGTTTAGAA 291
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 238 GCTCGTGAATCAGCCTTAGATCTGTTCCGTGCTTATGAACTTTGCTTGGATTGTTTAGAA 297
Query 292 TTGGTCTCTGCTCAATTAGCTTGTAAGCCTCACACTGTTCAATCTCAGAGGCTAAGGATG 351
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 298 TTGGTCTCTGCTCAATTAGCTTGTAAGCCTCATACCGTTCAATCTCAGAGGCTACGGATG 357
Query 352 ATTCATTGTCTCGATGTTTGGGGTTTGTATGAGAATGTGTATACTGAAGCGTTTAAGGTT 411
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 358 GTTTATTGTCTCGATGTTTGGGGTTTGTATGAGAATATGTATTCTGAAGCGTTTAAGGTT 417
Query 412 CTGGAGAAGCTAAGAGGCTCTGATAGCAAATCCCGGAAGTCCCGGTTGTTGCCGGAGGTT 471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 418 TTGGAGAAGCTAAGAGGCTCTGATAGCAAATCCCGGAATTGCCGGTTGTTGCCGGAGGTT 477
Query 472 CAGGATGGAGATGCGGAGATGGCTTTAGTTGTTGTTGATGCTGTGGCGGCCATCTTTAGG 531
||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 478 CAGGACGGAGAGGCGGATATGGCTTTGGTTGTTGTTGATGCTGTGGCGGCCATTTTTAGG 537
Query 532 GCTGTGGCAATGAGTCAGCAGTTAGATGATAAGCGGTATCGGAAAGTTCTTCTTTTGCTT 591
|||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 GCTGTGGCAATGGGCCAGCAATTAGATGATAAGCGGTATCGGAAAGTTCTTCTTTTGCTG 597
Query 592 GAGGAAGTCGGAGGCTGGTTAAGGGTCTTAGATGCTAAGGTGTATGAAAAGTTGCACAGA 651
| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||
Sbjct 598 GGGGAGGTCGGAGGCTGGTTTAGGGTCTTAGATGCTAAGGCGTATGAGAAGTTTCACAGA 657
Query 652 GCGATGGTGACAAGTATGGGTAAATGTGCTGTTTCTCTCGTTAGAGAAGCTGAGCGTTTC 711
||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 GCGATGGTGACAAATTTGGGTAAATGTTCTGTTTCTCTCGTTAGAGAAGCTGAGCGTTTT 717
Query 712 AATGGGGATTTAGTGATTTCTTTCTGCGACTTAACTGTGAAGGAACATTATAAATCTGCA 771
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 718 GATGGGGATTTAGTGATATCTTTCTGCGACTTAACTGTGAAGGAACACTATAAATCTGCA 777
Query 772 TTATCAAAAGATCGAGTTTATAAGTTTGCTCGCGAGGTGCTTTCTGTTCTGTTTGGATTT 831
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 778 TTCTCAAAAGATCGAATTTATAAGTTTGCTCGCGAGGTGCTTTCTGTTCTGTTCAGATTT 837
Query 832 AAGGATAGAAAAATGTCAGTGACCATTGACATTTCAATGTCTGTGTTGCGCAGCTTATCT 891
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 838 AAGGATAAAAAAATGTCAGTGACCATTGACATTTCAATGTCTTTGTTGCGCAGCTTAACT 897
Query 892 TGCCAATTTGAGGATGAAAGTAATGAGAATTTAATGGAGTTTTTTGACCTAGTCGATTAT 951
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 898 TGCCAATTTGAGGATGAAAGTAATGAGAATTTAATGGAGTTTGTTGACCTAGTCGCTTAT 957
Query 952 TGCGCTCACAAGTTTCGAGCAGCAGGAGACATGTACTGTGCAAAAGTTTCaaaaaaaTTG 1011
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 958 TGCGCTCACAAGTTTCGAGCAGCAGGAGACATTTACTGTGCAAAAGTTTCAAAAAAGTTG 1017
Query 1012 AATGAGATGGCAGCTATTTTCGTAGAGGCAATACCCCAACTTAATTTGGTTCTTAGACTG 1071
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1018 AATGAGATGGCAGCTATTTTCTTAGAGGCAATACCCCAACTTAATCTGGTTCTTAGACTG 1077
Query 1072 TATTCGACCGGGCTGTCCATCACGGTTTGCAATTCCAAGCTCGGAGAAATTAA-GCTAGA 1130
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |
Sbjct 1078 TATTCAACCGGGCTGTCCATCACGGTTTGCGATTCCAAGCTCGGAGAAAGTAAGGTTA-A 1136
Query 1131 AGATTCAACAGATGATTGGAAGATTCAAGCTATGTTTGATGATGATGCTAGATGGCAAAG 1190
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 AGATTCCACAGATGATTGGAAGATTCAAGCAATGTTTGATGATGATGCTAGATGGCAAAG 1196
Query 1191 CTTAGTTTCTTTACTCGGCATGGTTGATAGTTACTCAGGTGATGAGGGCAATCAGACTGG 1250
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1197 CTTAGTTTCTTTACTCGGCTTGGTTGATAGTTACTCAGGTGATGTGGGCAATCAGACTGG 1256
Query 1251 TTCATCATCGATTGGTGGGCATAGGAACTACAACAATAAAACACATGATAGCTGTAAAGA 1310
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1257 TTCATCATTGATTGGTGGGCATAAAAACTACAACAATAAAACACATGGTAGCTGTACAGA 1316
Query 1311 CAGGAACAAGATTACTTGTTGGCCACAATACGTAGATGCCTTGAAATTCTTGTGCCAACC 1370
|| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1317 CATGAACAAGAAGACTTGTTGGCCACAATACTTAGATGCCTTGCAGTTCTTGTGCCAACC 1376
Query 1371 GCTTGCAGACTTTATATATTCTGTGAAAAGAAAGATTGTGCTGGAGACAGAAATGTCATG 1430
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1377 ACTTGCAGACTTGATATATTCTGTGAAAAGAAAGATTGTGCTGGAGACAGAAATGTCCTG 1436
Query 1431 CGCCTCTGCTCATCTAATTACTATTCACGATGCCTTTCTCCAGTTTTGTGATGGCTGTCT 1490
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1437 CGCTTCTGCTCATCTAACTACTATTCACGATGCCTTTCTCCAATTTTGTGATGGCTGTCT 1496
Query 1491 CTTCCTTCAGAGGTGCACGTCTGACAAGGGAGATAGAGAAATTGCCAATAACAAAGCTTT 1550
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||
Sbjct 1497 CTTCCTTCAGAGATGCACGTCTGACAAGGGAGATAGCGAAACTGACAATAACAAAGCTTT 1556
Query 1551 CTTAAACGCGGCTATGGGTGCTTTCATTGTCTCATTGAGAACCCAACTTAAATTGGAGAT 1610
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1557 GTTAAACGTGGCTATGGGTGCTTTCATTGTCTCATTGAAAACCCAGCTTAAATTGCAGAT 1616
Query 1611 AAGTGCCCATCTAGTTGAGGATGTAATTGGAAGCCCATGGATCCAATCTCAAGAACTCAA 1670
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1617 CAGTGCCCATCTAGTTGAGGATGTAATTGCCAGTCCATGGATCCGATCTCAAGAACTCAA 1676
Query 1671 GTATCTAATTGCGACGCTGTACAATATTGGTATCGTTTTGTACAGAAATAAGGAGCTAAA 1730
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 GTATCTAATTGCGACGCTTTACAATATTGGTATCGTTTTGTACAGAAATAAGGAGCTAAA 1736
Query 1731 CAAGGCTTGTGAGGCGCTTAAGCTGTGCTCCAAGGTATCATGGAGATGTGTTGAACTACA 1790
||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1737 CAAGGCTTGTGAGGCACTCAAGCTGTGCTCTAAGGCATCATGGAGATGTGTTGAGCTACA 1796
Query 1791 TTGTCATATGTTTGTAAATCAGTCTAGTTCATCTGATAATGACTTGTCAGAAGATGCCAT 1850
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1797 TTGTCAGATGTTTGTAAATCAGTCTAGTTCATCTGATAATGACATGTCAGAAGATGCCAT 1856
Query 1851 TATGGATTTTGTGGGCGAAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGATATACTCCAGAA 1910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 TATGGATTTTGTGGGCGAAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGATATACTCCAGAA 1916
Query 1911 ATGTAGCAGACGTAAGATTAGACAGAATATTGTTCATATTCTAGAAAATTGGTTGTCAGC 1970
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1917 ATGTAGCAGACATAAGATTAGACAGAATATTGTTCATATTCTACAAAATTGGTTGTCAGC 1976
Query 1971 TGAACATCTGATTAGACGGTTACCAGGCCCTGAGGCAATTGTAAAGCAATGGGTTAAGAT 2030
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 TGAACATCTGATTAGAAGGTTACCAGGCCCTGAGGCAATTGTAAAGCAATGGGTTAAGAT 2036
Query 2031 AGAGCGGGAATGTCACACGGATCTGGATGCGGCAGGTTCTTGTACAACTTTGTACTCATT 2090
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 AGAACGGGAATGTCACACGGATCTGGATGCGGCAGATTCTTGTACAACTTTGTACTCATT 2096
Query 2091 GTTATCATCTTCTCaaaaaaaGTCAAAGCGGGGTATCGGAAAAATCCTTGAGCAGGAGCT 2150
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2097 GTTATCATCTTCTCAAAAAAAGTCAAAGCGTGGTATCGGAAAAATCCTAGAGCAGGAGCT 2156
Query 2151 TCTTGCCTATGACAGAGTG-TTACCTTTAAGGTCAAATCTAGGTCAACAAACGCGAATCA 2209
|||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2157 TCTTGCCTATGATAGAGTGCTT-CCTTTAAGGTCAAATCTAGGTCAACAAACTCGAATCA 2215
Query 2210 AGATAGCAGATATCCTCTTGAAGGATGTTTATGTCACTGAGGATATGCATATAGAGAGAG 2269
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 AGATAACAGATATCCTTTTGAAGGATGTTTATGTCACTGAGGATATGCATATAGAGAGAG 2275
Query 2270 CAAGAATTTTGATATGGAAAGCACGAATGACAAGGACATCTGGAACTGAACATATAACCG 2329
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 CAAGAATCTTGATATGGAAAGCACAAATGACAAGGACATCTGGAACTGAACATATAACCG 2335
Query 2330 AGTGCATTTGTTTTCTGTCTGAAGCAATCTCTATATTGGGTGAGTTACATCATGGGCCAA 2389
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2336 AGTGCATTTGTTTTCTGTCCGAAGCAATCTCTATATTGGGTGTGTTACATCATGGGCCAA 2395
Query 2390 ATGAAGAGGGTTCTCCATCTTCTCACATGTTACCTATTGCGTATTGCTTGAGAGCTTTTT 2449
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 ATAAAGAGGGTTCTCCATCTTCTCCCATGTTACCTATTGCGTATTGCTTGAGAGCTTTTT 2455
Query 2450 GTACCCAGGAAGCTGACCCAAACTCGAAGAAAGTCTTTCAAGATATTAGCACTTCACTAA 2509
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 GTACCCAGGAAGCTGAGCCAAACTCGAAGAAAGTCTTTCAAGATATTAGCACTTCACTAA 2515
Query 2510 ATCTCTGGCT-AAGGATTCTTAGCCTAGATGATAGTGGAGACAGTCTACCAACAGAGAAT 2568
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2516 ATCTCTGGCTGAA-GATTCTTAGCCTAGATGATAGTGGGGACAGTCTACCAACAGAAAAC 2574
Query 2569 ATAATTCCGTTACTGTATAATATGATTGATTTGATGTCAGTGAAGGGATGTACAGAGCTC 2628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 ATAATTCCGTTACTGTATAATATGATTGATTTGATGTCAGTGAAGGGATGTACAGAGCTC 2634
Query 2629 CATCATCATATATACCAACTGATTTTCAGATTGTTTAAATGGAAGAATGTCAAATTGGAG 2688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2635 CATCATCATATATACCAACTGATTTTCAGATTGTTTAAATGGAAGAAAGTCAAATTGGAG 2694
Query 2689 GTCTGCCTTGCAATGCTGTGGGAATGTAGAAGGCTTAGTCATGCCTTATGCCCTTCCCCC 2748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 GTCTGCCTTGCAATGCTGTGGGAATGTAGAAGGCTTAGTCATGCCTTATGCCCTTCCCCC 2754
Query 2749 ATAAGTGATGCCTTTATCCAGACCTTATCAGAGAATTGTGCTGACAAATCCACATGCATT 2808
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2755 ATAAGTGATGCCTTTATCCAGACCTTATCAGAGAATTGTGGTGACAAATCCACATGCATT 2814
Query 2809 GATTTCTGGATGGATTGCCTGAAAGATTCAAAAGCAAAGTTAATTGGGTTCCAGCAGAAC 2868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2815 GATTTCTGGATGGATTGCCTGAAAGATTCAAAAGCAAAGCTAATTGGGTTCCAGCAGAAC 2874
Query 2869 TTCCATGATTTACATAATAAGGATGAAGGTCCCTTTCAATCAGACATCACAATTGACGAT 2928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||
Sbjct 2875 TTCCATGATTTACATAATAAGGATGAAGGTCCCTTTCAATCAGACTTCACAATAGGCGAT 2934
Query 2929 ATTAAAGATGCAGCATCAGAACTCATCTCCAGTGCATCACTCTCTGGTAATTCATCTTTT 2988
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 ATTAAAGATGCAGCTTCAGAACTCATTTCCAGTGCGTCACTCTCTGGTAATTCATCTTTT 2994
Query 2989 GCAGCTGCATATCTCTATTATGATCTCTGTGAAAGGCTCATATCATTTGGAAAACTTTCT 3048
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 GTAGCTGCATATCTCTATTATGATCTCTGTGAAAGGCTCATATCATTTGGAAAACTTTCT 3054
Query 3049 GAGGCTCTTTCATATGCAAAAGAAGCCTATAGGATAAGGACTCTTATATTTCAAGATAAA 3108
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3055 GAGGCTCTTTCATATGCAAAAGAAGCCTATAGGATACGGACTCTTATATTTCAAGAGAAA 3114
Query 3109 TTTAAGTATACAGCTGAGAAGCA-TATCGAAAAACACAATGAAGATGGGAAAATATCAGA 3167
||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||
Sbjct 3115 TTTAAGTATACAGCTGAGAAGAAGT-TCGTAAAACACAATGACGCTGGAAAAATATCAGA 3173
Query 3168 AATACGGACTTTTAGCATAAAAAATTTCCAAGTCTACAGATTGTTAGCAACTGATTTTTG 3227
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3174 GATACGGACTTTTGGCATAAAAAATTTCCAAGTCTACAGATTGTTCGCAACTGATTTTTG 3233
Query 3228 GCCATGTGGAAATTTTCTCTGGGACATCAATCGCTGCTACCTAAGTCCTTGGAGTGTACT 3287
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3234 GCCATGTGGAAATTTTCTCTGGGACATCAATTGCTGCTACCTAAGTCCTTGGAGTGTACT 3293
Query 3288 CCAATGTTATTTGGAAAGCACCCTTCAGGTTGGAATTCTGAATGAGCTCATAGGGAATGG 3347
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3294 CCAATGTTATTTGGAAAGCACCCTTCAGGTTGGAATTCTGAATGAGCTAATAGGGAATGG 3353
Query 3348 ACTGGAGGCAGAAACCATTCTATCATGGGGGAAAGCCTTTTCATGCTCGCAAAGTCTATT 3407
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3354 ACTGGAGGCAGAAACCATTCTATCATGGGGAAAAGCCTTTTCATGCTCGCAAAGTCTATT 3413
Query 3408 CCCTTTTGTAGTTGCATTTTCTTCTGCCTTAGGAAATCTATACCACAAAAAGCAGTGTCT 3467
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3414 CCCTTTCATAGTTGCATTTTCTTCTGCCTTAGGAAATCTTTACCACAAAAAGCAGTGTCT 3473
Query 3468 GGATCTGGCAGAAAAGGAACTCCAAAATGCAAAAGAGATATTAATTGCTAATCAGCGAGA 3527
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3474 GGATCTGGCAGAAATTGAACTCCAAAATGCAAAAGAGATATTAATTGCTAATCAGCGAGA 3533
Query 3528 TTTTTCTTGCGTAAAGTGCAAACTGAAGTTGGAAGTTACATTGGATAAACAACTTGGAGA 3587
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3534 TTTTTCTTGTTTTAAGTGCAAACTGAAGTTGGAAGTTACATTGGATAAACAACTTGGAGA 3593
Query 3588 CATATCTCGGAAACAAATTGATAGAGTTTCACAGACAGATGGATTCTTGCATGCTGAAAG 3647
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3594 CATATCTCGGAAAAAAATTGATAGAGTTTCCCAGACAGATGGATTTTTGCATGCTGAAAG 3653
Query 3648 CTTGTTTAGTGCTGCCCTGGGAAAATTCTGTTGCTCAGCATGGAAAAGCTGCATTAGATC 3707
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3654 CTTGTTTAGTGCTGCCCTGGGAAAAGTCTGTTGCTCAGCATGGAAAAGCTGCATTAGATC 3713
Query 3708 ACATGGGGAAGAAATTGCTGAGGAGATAGTGATTGATAGAAATGGAGGGGAAGGTTTAGG 3767
|||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3714 ACATGGGGAAGAAATTGCTGAGGAAATAGTGGTTAATAGAAATGGAGGGGACGGTTTAGG 3773
Query 3768 ACATAATTCAAGTAAAACAAAGCTCAGTATAAAGGAGCCACCAGGAAACAGAGGCTCCAG 3827
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3774 ACATAAATCAAGTAAAACGAAGCTCAGTATAAAGGAGCCACCAGGAAACAGAGGCTCCAG 3833
Query 3828 GAGGGGTGGAAGAGCTAACAAAACTTGTTTGTCAAAGGATCAGGATTTGATATCTGAGCC 3887
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3834 GAGGGGTCTAAGAGCTAACCAAACTTGTTTGTCAAAGGACCAGGATTTGATATCTGAGCC 3893
Query 3888 AACATCAAGGTTGACTCGATCTATGCGTCACTCACTTAGAGAGCAATGCCAAAACCGTTC 3947
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3894 AACGTCAAGGTTGACTCGATCTATGCGTCACTCACTTAAAGAGCAATGCCAAAACCGTTC 3953
Query 3948 TAATGTGCCTGAAGTTGTTTCAAAGAAGCCTAATTTATGTGATAGATCTGTTGGTTCTAG 4007
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3954 TAATGTGCCTGAAGTTGTTTCAAAGAAGCCTAATTTCTGTGATAGATCTGTTGGTTCTAG 4013
Query 4008 GGGTGAAAGGGTTTTGTTGGACACGAGTAATGCACTCCCTGGCTTTTGTATTTGCTACAA 4067
|||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 4014 GGGTGAAAGGGTGTTGTTGGACACAAAAAATGCAGTCCCTGGATTTTGCATTTGCTACAA 4073
Query 4068 AGAAAAACGTCAGCAGTGCCTCTCGGAAGAAGTAACAGAATCTGGGTCTCTCAACAATTT 4127
||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4074 AGAAAAATGTCAGCAGTGCTTCTCCGAAGGAGTAACAGAATCTGGGTCTCTCAACAATCT 4133
Query 4128 AGTAAGTTTGAAATGGGAACTCTGCCATAGGAAGCTTGCGTCCTCAATACTTGTTAGCCT 4187
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4134 AGTAAGTTTGAAATGGAAACTCTGCCATAGGAAGCTTGCGTCCTCAATACTTGTTAGCCT 4193
Query 4188 TGGAAAATGTTTGGGAGACTCTGGTAGAATTCATCTAGCTCATGAGGCTTTACTGCATAG 4247
||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4194 GGGAAAATGTTTGGCAGACTCTGGTAGAGTTCATCTAGCTCATGAGGCTTTACTGCATAG 4253
Query 4248 TATCTCTGTTTTATTCAAAAGCACCTGGTCCAGCCACAACCAGCCTTCTGTC-AGTCAGT 4306
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 4254 TATCTCTGTTTTATTTAAAAGCAACTGGTCCAGCCACAACCAGCCTTCTGTCTA-TCAGT 4312
Query 4307 TGCTGGAATTTATCGGGAAAGAAGTTACAAGAGATGTATTTGCCGTTGATCGTGCAATAA 4366
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 4313 TGCTGGAGTTTATCGGGAAAGAAGTTACAAGAGATGTATTTGCTGTTGACCGTGCAATAA 4372
Query 4367 TATTATACAACTTGTGCTGGTTGAATTTGCGGAATTACCACTGCAGGAAGAGTAGGTCTA 4426
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 4373 TACTATACAACTTGTGCTGGTTGAATTTGCGGAATTACCACTGCAGGGATAGTAGGTCTA 4432
Query 4427 TCTGCTGTGATCTGTTTCATATCCCTTTCACAAAACTAGTGTCATGGTTAATGTTAGCAT 4486
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4433 TTTGCTGTGATCTGTTTCATATTCCTTTCACAAAACTGGTGTCATGGTTAATGTTAGCAT 4492
Query 4487 TTGTACTCAGCGGAGAGGTTCCAATATTATTTCAAAAGGTTTCAAGATTGCTTGCCTCTT 4546
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4493 TTGTACTCAGCAGAGCGGTTCCAATATTATTTCAAAAGGTTTCAAGATTGCTTGCCTCTT 4552
Query 4547 TATATCTGCTTTCTTCCTCAAATTCTGAATTCACATTCGAATCTGATGGAAATGAGCTGT 4606
||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 4553 TATATCTACTTTCTTCCTCAAGTGCTGAATTCTCATTCGAATATGATGGAAGTGAGCTGT 4612
Query 4607 CAGCAAGTCATTGGGTCTCATTTTTCCATCAAGCCTCGCTTGGTACCCATCTCAGTTACC 4666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 4613 CAGCAAGTCATTGGGTCTCATTTTTCCATCAAGCCTCGCTTGGTACCCATATCAGTTATC 4672
Query 4667 ATTTCATTTCAAATTTGAGCCAAAAACACAAATCACAGTGCCTCTCAGATAAAGAGTGCA 4726
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4673 ATTTCATTTCAAAGTTGAGTCAAAAACACAAATCACGGTGCCTCTCAGATAAAGAGTGCA 4732
Query 4727 CAGAGGCTACTTGCTCGAGTTGCATGGTTCCTGAGGATTTGGACTTACCCAGGCTTGCTC 4786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4733 CAGAGGCTACTTGCTCGAGTTGCATGGTTCCTGAGGATTTGGACTTACCCAGGCTTGCTC 4792
Query 4787 CTGACCGTACTCAAGATCTTGTACAATTCGCTAAAGAATTTTTCATCAATCTTCCAAGCT 4846
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4793 CTGAGCGTACTCAAGATCTTGTACAATTCGCTAAAGAATTTTTCATCAATCTTCCAAGCT 4852
Query 4847 CAACAATCATCTGCATTAGTTTGCTTGGAGGTGCTTTAAACCAATTGTTACAGGAGCTAA 4906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4853 CAACAATCATCTGCATTAGTTTGCTTGGAGGTGCTTTAAACCAATTGTTACAGGAGCTAA 4912
Query 4907 TGCATATTCGTTCACCTGTTTGTGCCTGGGTGCTCATATCACGCCTAAACCCAGAAAGTC 4966
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4913 TGCATATTCGTTCACCTGTTTGTGCCTGGGTGCTCATATCGCGCCTAAACCCAGAAAGTC 4972
Query 4967 AACCGGTTGCCACACTTTTACCTGTAGATTCGATTGTAGAAGACATGTCAGATGACAGTG 5026
||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4973 AACCGGTTGCCACACTTCTATCTGTAGATTCGATTCTAGAAGACATGTCAGATAACAGTG 5032
Query 5027 CAAATCTTAGCTCTACCGAAGCGACTCAAGTCAAGAGTTTAAAGGGGCCCTGGCTTTGTC 5086
|||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5033 CAAACCTTAGCTCTACGGAAGCGACTCAAGTTAAGAGTTTAAAGGGGCCTTGGCTTTGTC 5092
Query 5087 CATGGGGTACCACCGTGGTTGATGAGGTAGCTCCAGCATTTAAATCAATATTGGAGGAAA 5146
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5093 CATGGGGTGCCACCGTGGTTGATGAGGTAGCTCCAGCATTTAGATCAATATTGGAGGAAA 5152
Query 5147 GCCACTCATCTTCTTCTACTACTGAAGAAGACACAATAGAGAGTAGGGGCCTGTGGTGGA 5206
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5153 GCTACTCATCTTCTTCTACTCCTGAAGAAGACACAATAGAGAGTAGGGGCCTGTGGTGGA 5212
Query 5207 AAAAGAGAAAGAAACTTAATCATCGTCTGGGAATATTCCTAAGGAATCTAGAAGCTTCCT 5266
||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5213 AAAAGAGGAAGAAACTTGATCATCGTCTGGGAATATTCCTAAGGAATCTAGAAGCTTCAT 5272
Query 5267 GGCTGGGTCCCTGGAGGTGTCTGCTTCTCGGAGAATGGTCGAACTACAAATTGCCTGACT 5326
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5273 GGCTGGGCCCCTGGAGGTGTCTGCTTCTTGGAGAATGGTCGAACTACAAATTGCCTGCCT 5332
Query 5327 CAGCGCAGAAAAAGCTGGTAAATGATCTCAAGTCCAAGTGCAAAATGGAAGTAAATGAGA 5386
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5333 CAGTGCAGAAAAAGCTGGTAAATGATCTCAAGTCCAAGTGCAAAATGGAAGTAAATGAGA 5392
Query 5387 TGCTTTTGAAGGTTATTCTTGGAGGTGGGACGGATAACTTTAAAGGAGAAGCATGCGTTG 5446
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |
Sbjct 5393 TGCTTTTGAAGGTTATTCTTGGAGGTGGGACAGACAACTTTAAAGGAGAAGCATGTGTCG 5452
Query 5447 CTCAGCTTTCTTTAAGAAATGGTTGCTATGTAGGTAGAGGGGGATATCTTTATGAAGAAG 5506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5453 CTCAGCTTTCTTTAAGAAATGGTTGCTATGTAGGTAGAGGGGGATATCTTTATGAAGAAG 5512
Query 5507 ATAGCTGTAAAACTCCTACTGCTGCGTCTAATATATCTGAAAGTAGGCATGAATTGGCCT 5566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5513 ATAGCTGTAAAACTCCTACTGCTGCGTCTAATATATCTGAAAGTAGGCATGAATTAGCCT 5572
Query 5567 TAAAACTGATACATGACGCAGCAAGCAAACTAGGGCAACAAGATGGACATGAAAATAGAG 5626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5573 TAAAACTGATACATGACGCAGCAAGCAAACTAGGGCAACAAGATGGAGATGAAAATAGAG 5632
Query 5627 AACCTATCATTCTTGTGTTAGATCCCGAGGTTCAGATGCTTCCTTGGGAGAATATTCCAA 5686
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5633 AACCTATCATTCTTGTGTTAGATCCTGAGGTTCAGATGCTTCCTTGGGAGAATATTCCAA 5692
Query 5687 TACTAAGGAAACAGGAGGTGTACCGCATGCCTTCCGTAGGTTGCATATCTGCCGTGCTAA 5746
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5693 TACTAAGGAAACAGGAGGTGTACCGCATGCCTTCCGTAGGTTGCATATCTGCTGTGCTAA 5752
Query 5747 AGAAGCGCAGTCTTCAAGGAGAGCCAGCAAAATCTCATGTTGCTTCCTTCCCTCTTATTG 5806
||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5753 AGAAGCGCAGTG---AAGGAGAGCCAGCAAGATCTCATGTTGCTTCCTTCCCTCTTATTG 5809
Query 5807 ATCCGCTAGATTCATTTTACTTGTTGAATCCTGGTGGTGATCTCACCGATACACAAGTCA 5866
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 5810 ATCCGCTAGATTCATTTTACTTGTTGAATCCTGGTGGTGATCTCACCGATACCCAAGACA 5869
Query 5867 CGTTTGAGAGTTGGTTCAGAGATCAAAACTTTGAGGGTAAAGCTGGGTCAGAACCAAGTG 5926
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||
Sbjct 5870 AGTTTGAGAGTTGGTTCAGAGATCAAAACTTTGAGGGGAAAGCTGGATTAGAACCAAGTG 5929
Query 5927 CTATAGAGTTGACAGAAGCATTAGAAACTCATGATCTCTTTCTATACTTTGGTCATGGAA 5986
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5930 CTATAGAGTTGACAGAAGCATTAAAAACTCATGATCTCTTTCTATACTTTGGTCATGGAA 5989
Query 5987 GCGGAGCACAGTATATACCTAGGCGTGAAATAGAGAAGCTAGATAACTGTTCTGCAACTT 6046
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5990 GCGGAGCACAGTATATACCTAGGCGCGAAATAGAGAAGCTAGATAACTGTTCTGCAACTT 6049
Query 6047 TCTTAATGGGATGCAGTAGTGGTTCACTATGGCTAAAAGGCTGCTACATCCCACAAGGTG 6106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6050 TCTTAATGGGATGCAGTAGTGGTTCACTATGGCTAAAAGGCTGCTACATCCCAGAAGGCA 6109
Query 6107 TACCACTTTCTTATCTCCTAGGTGGATCTCCAGCCATTGTGGCGACTCTATGGGACGTAA 6166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6110 TACCACTTTCTTATCTCCTAGGTGGATCTCCAGCCATTGTGGCGACTCTATGGGACGTAA 6169
Query 6167 CAGACCGAGACATTGATCGGTTTGGGAAAGCGTTGTTGGAAGCATGGTTGCAAGAGAGGT 6226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6170 CAGACCGAGACATTGATCGGTTTGGGAAAGCGTTGTTGGAAGCATGGTTGCAAGAGAGGT 6229
Query 6227 CAGATTCTTCTTCAGAGGGTGGCTGCAGCCAATGTGAGTCATTAGCTAATGACCTTGCAG 6286
||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 6230 CAGATTCTTGTTCAGAGGGTGGTTGCAGCCAGTGTGAGTCGTTAGCAAATGAACTTGCAG 6289
Query 6287 CAATGACTCTAAAAGGCACCAA---------GAGGTCAAGGAAACCATCATCGCGTAACA 6337
| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 6290 CCATGAATCTAAAAGGCACCAACAACACCAAGAGGTCAAGGAAACCGTCATCGCGTAACA 6349
Query 6338 AGCCAGCTCAATCAGATGTGGATGGGTCAGGGAAGATTGAGTGCAACCACAAGCATAGAC 6397
|||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6350 AGCCAGCTAAATCAAATGTCGATGGGTCAGGGAAGATTGAGTGCAACCACAAGCATAGAC 6409
Query 6398 GTAAAATCGGTTCATTCATAGCCGCGGCTCGAGATGCGTGCAACTTGCAATACTTGATTG 6457
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 6410 GTAAAATCGGTTCATTCATAGCCGCGGCTCGAGATGCGTGCACCTTGCAATACTTGATTG 6469
Query 6458 GGGCTGCGCCTGTCTGTTATGGTGTGCCAACTGGTATCACTAGGAAAAAAGGAATTGATG 6517
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6470 GGGCTGCGCCTGTCTGTTATGGTGTACCAACTGGTATCACAAGGAAAAAAGGAATTGATG 6529
Query 6518 CTCTTCTTCCTTCT--T-CATC-TC--GTTAGTAGGTTAGAGCATCTCTTAAAATCCTCA 6571
|||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 6530 CTCTTCTTCCTTCTACTTCTTCATCTTGTTAGTAGGTTAGAGCATCTCTAAAAATCCTCA 6589
Query 6572 TTGTTTGGTCGTATAACAATTTTGAGGGAGCAAATAAATTTAGGAGTTAGGACTTCAGAT 6631
||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 6590 TTGTTTGGTCGTATAACAATTGTGAGGTAGCAAAAAAATTTAGGAGTTAGGACGTCAAAT 6649
Query 6632 CAGAGATTTTATGACAACAACGCAAGAGAAGAGAAAAAA-GGAGACTCTAGTCTAGAGAT 6690
||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 6650 CAGAGATCTTATGACAGCAACACAAGAGAAGAGAAAAAAAGGAGACTCTGGTCTAGAGAT 6709
Query 6691 ATATATTCATCCCTGtttttttATATAACAAAATTGTaaaaaaaaaTATCACATGATGTA 6750
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6710 ATATATTCATCCCTGTTTTT--ATATAACAAA-TTGTAAAAAGGAATATCACATGATGTA 6766
Query 6751 TTGTCCTCGAATTCTATGTTATAAAAGTG 6779
|||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 6767 TTGTCCTCAAATTCTATATTATAAAAGTG 6795
> Ahg945887 jgi|Araly1|945887|scaffold_702116.1
Length=469
Score = 171 bits (92), Expect = 9e-41
Identities = 140/163 (86%), Gaps = 4/163 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1868 AAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGATATACTCCAGAAATGTAGCAGAC-GTAAG 1926
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||
Sbjct 46 AAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGCTATACTCCACCAATGTAGC-GATTGTAAG 104
Query 1927 ATTAGACAGAATATTGTTCATATTCTAGAAAATTGGTTGTCAGCTGAACATCTGATTAGA 1986
|||||||||| ||| || || |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 105 ATTAGACAGACTATCGTGCAGATTCAAGAGAATTGGTTTTCAGCAGAGCATCTGATTAGA 164
Query 1987 CGGTTACCAGGCCCTG-AGGCAATTGTAAAGCAATGGGTTAAG 2028
|||||| |||||||| || ||||||||| || ||| |||||
Sbjct 165 AGGTTACTAGGCCCTGCAGA-AATTGTAAAACAGTGGATTAAG 206
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 258106460086
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5