BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G22970.1 Length=6809 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg492569 jgi|Araly1|492569|fgenesh2_kg.7__2002__AT4G22970.1 1.070e+04 0.0 Ahg945887 jgi|Araly1|945887|scaffold_702116.1 171 9e-41 > Ahg492569 jgi|Araly1|492569|fgenesh2_kg.7__2002__AT4G22970.1 Length=6795 Score = 1.070e+04 bits (5794), Expect = 0.0 Identities = 6478/6809 (95%), Gaps = 44/6809 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCGTCCTCTGGCGACGACCTCCGTCTTCTCTCTCTCATCG-A-CGT-CG--G-C--- 51 ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | | | || | | Sbjct 1 ATGGCGTCCACT---GACGACCTCCGTCTTCTCTCTCTCATCGAATCTTCCGACGCCGGT 57 Query 52 GATAATGTCTTCTCTTCCTTCTCCGATTACCTTAAACCTTTCTCTACTCTATCCACTTCC 111 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 58 GATGATATCTTCTCTTCCTTCTCCGATTACCTTAAACCTTTCTCTACTCTATCCACTTCC 117 Query 112 CGGAAAAAACAAGACCGAGCAACCACGATTCGAGCCCTAGCTAAGCAATTCCTTCCTTTC 171 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 118 CGGAAAAAACAAGACCGAGCAACCACCATTCGAGCCCTAGCTAAGCAATTTCTTCCTTTC 177 Query 172 CTCAACAAATCGATCTCTCTCCTACCGAAACGTCTCTCCGTCGCGAATTCTGATAAGGAA 231 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| Sbjct 178 CTCAACAAATCGATCTCGCTCCTACCGAAACGCCTCTCCGTCGCCAAGTCTGACAAGGAA 237 Query 232 GCTCGTGAATCAGCATTAGATCTGTTCCGTGCTTATGAACTTTGTTTGGACTGTTTAGAA 291 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 238 GCTCGTGAATCAGCCTTAGATCTGTTCCGTGCTTATGAACTTTGCTTGGATTGTTTAGAA 297 Query 292 TTGGTCTCTGCTCAATTAGCTTGTAAGCCTCACACTGTTCAATCTCAGAGGCTAAGGATG 351 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| Sbjct 298 TTGGTCTCTGCTCAATTAGCTTGTAAGCCTCATACCGTTCAATCTCAGAGGCTACGGATG 357 Query 352 ATTCATTGTCTCGATGTTTGGGGTTTGTATGAGAATGTGTATACTGAAGCGTTTAAGGTT 411 || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 358 GTTTATTGTCTCGATGTTTGGGGTTTGTATGAGAATATGTATTCTGAAGCGTTTAAGGTT 417 Query 412 CTGGAGAAGCTAAGAGGCTCTGATAGCAAATCCCGGAAGTCCCGGTTGTTGCCGGAGGTT 471 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 418 TTGGAGAAGCTAAGAGGCTCTGATAGCAAATCCCGGAATTGCCGGTTGTTGCCGGAGGTT 477 Query 472 CAGGATGGAGATGCGGAGATGGCTTTAGTTGTTGTTGATGCTGTGGCGGCCATCTTTAGG 531 ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 478 CAGGACGGAGAGGCGGATATGGCTTTGGTTGTTGTTGATGCTGTGGCGGCCATTTTTAGG 537 Query 532 GCTGTGGCAATGAGTCAGCAGTTAGATGATAAGCGGTATCGGAAAGTTCTTCTTTTGCTT 591 |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 GCTGTGGCAATGGGCCAGCAATTAGATGATAAGCGGTATCGGAAAGTTCTTCTTTTGCTG 597 Query 592 GAGGAAGTCGGAGGCTGGTTAAGGGTCTTAGATGCTAAGGTGTATGAAAAGTTGCACAGA 651 | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| Sbjct 598 GGGGAGGTCGGAGGCTGGTTTAGGGTCTTAGATGCTAAGGCGTATGAGAAGTTTCACAGA 657 Query 652 GCGATGGTGACAAGTATGGGTAAATGTGCTGTTTCTCTCGTTAGAGAAGCTGAGCGTTTC 711 ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 GCGATGGTGACAAATTTGGGTAAATGTTCTGTTTCTCTCGTTAGAGAAGCTGAGCGTTTT 717 Query 712 AATGGGGATTTAGTGATTTCTTTCTGCGACTTAACTGTGAAGGAACATTATAAATCTGCA 771 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 718 GATGGGGATTTAGTGATATCTTTCTGCGACTTAACTGTGAAGGAACACTATAAATCTGCA 777 Query 772 TTATCAAAAGATCGAGTTTATAAGTTTGCTCGCGAGGTGCTTTCTGTTCTGTTTGGATTT 831 || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 778 TTCTCAAAAGATCGAATTTATAAGTTTGCTCGCGAGGTGCTTTCTGTTCTGTTCAGATTT 837 Query 832 AAGGATAGAAAAATGTCAGTGACCATTGACATTTCAATGTCTGTGTTGCGCAGCTTATCT 891 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 838 AAGGATAAAAAAATGTCAGTGACCATTGACATTTCAATGTCTTTGTTGCGCAGCTTAACT 897 Query 892 TGCCAATTTGAGGATGAAAGTAATGAGAATTTAATGGAGTTTTTTGACCTAGTCGATTAT 951 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct 898 TGCCAATTTGAGGATGAAAGTAATGAGAATTTAATGGAGTTTGTTGACCTAGTCGCTTAT 957 Query 952 TGCGCTCACAAGTTTCGAGCAGCAGGAGACATGTACTGTGCAAAAGTTTCaaaaaaaTTG 1011 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 958 TGCGCTCACAAGTTTCGAGCAGCAGGAGACATTTACTGTGCAAAAGTTTCAAAAAAGTTG 1017 Query 1012 AATGAGATGGCAGCTATTTTCGTAGAGGCAATACCCCAACTTAATTTGGTTCTTAGACTG 1071 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1018 AATGAGATGGCAGCTATTTTCTTAGAGGCAATACCCCAACTTAATCTGGTTCTTAGACTG 1077 Query 1072 TATTCGACCGGGCTGTCCATCACGGTTTGCAATTCCAAGCTCGGAGAAATTAA-GCTAGA 1130 ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || | Sbjct 1078 TATTCAACCGGGCTGTCCATCACGGTTTGCGATTCCAAGCTCGGAGAAAGTAAGGTTA-A 1136 Query 1131 AGATTCAACAGATGATTGGAAGATTCAAGCTATGTTTGATGATGATGCTAGATGGCAAAG 1190 |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 AGATTCCACAGATGATTGGAAGATTCAAGCAATGTTTGATGATGATGCTAGATGGCAAAG 1196 Query 1191 CTTAGTTTCTTTACTCGGCATGGTTGATAGTTACTCAGGTGATGAGGGCAATCAGACTGG 1250 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1197 CTTAGTTTCTTTACTCGGCTTGGTTGATAGTTACTCAGGTGATGTGGGCAATCAGACTGG 1256 Query 1251 TTCATCATCGATTGGTGGGCATAGGAACTACAACAATAAAACACATGATAGCTGTAAAGA 1310 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 1257 TTCATCATTGATTGGTGGGCATAAAAACTACAACAATAAAACACATGGTAGCTGTACAGA 1316 Query 1311 CAGGAACAAGATTACTTGTTGGCCACAATACGTAGATGCCTTGAAATTCTTGTGCCAACC 1370 || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 1317 CATGAACAAGAAGACTTGTTGGCCACAATACTTAGATGCCTTGCAGTTCTTGTGCCAACC 1376 Query 1371 GCTTGCAGACTTTATATATTCTGTGAAAAGAAAGATTGTGCTGGAGACAGAAATGTCATG 1430 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1377 ACTTGCAGACTTGATATATTCTGTGAAAAGAAAGATTGTGCTGGAGACAGAAATGTCCTG 1436 Query 1431 CGCCTCTGCTCATCTAATTACTATTCACGATGCCTTTCTCCAGTTTTGTGATGGCTGTCT 1490 ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1437 CGCTTCTGCTCATCTAACTACTATTCACGATGCCTTTCTCCAATTTTGTGATGGCTGTCT 1496 Query 1491 CTTCCTTCAGAGGTGCACGTCTGACAAGGGAGATAGAGAAATTGCCAATAACAAAGCTTT 1550 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| Sbjct 1497 CTTCCTTCAGAGATGCACGTCTGACAAGGGAGATAGCGAAACTGACAATAACAAAGCTTT 1556 Query 1551 CTTAAACGCGGCTATGGGTGCTTTCATTGTCTCATTGAGAACCCAACTTAAATTGGAGAT 1610 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| Sbjct 1557 GTTAAACGTGGCTATGGGTGCTTTCATTGTCTCATTGAAAACCCAGCTTAAATTGCAGAT 1616 Query 1611 AAGTGCCCATCTAGTTGAGGATGTAATTGGAAGCCCATGGATCCAATCTCAAGAACTCAA 1670 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1617 CAGTGCCCATCTAGTTGAGGATGTAATTGCCAGTCCATGGATCCGATCTCAAGAACTCAA 1676 Query 1671 GTATCTAATTGCGACGCTGTACAATATTGGTATCGTTTTGTACAGAAATAAGGAGCTAAA 1730 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1677 GTATCTAATTGCGACGCTTTACAATATTGGTATCGTTTTGTACAGAAATAAGGAGCTAAA 1736 Query 1731 CAAGGCTTGTGAGGCGCTTAAGCTGTGCTCCAAGGTATCATGGAGATGTGTTGAACTACA 1790 ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1737 CAAGGCTTGTGAGGCACTCAAGCTGTGCTCTAAGGCATCATGGAGATGTGTTGAGCTACA 1796 Query 1791 TTGTCATATGTTTGTAAATCAGTCTAGTTCATCTGATAATGACTTGTCAGAAGATGCCAT 1850 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1797 TTGTCAGATGTTTGTAAATCAGTCTAGTTCATCTGATAATGACATGTCAGAAGATGCCAT 1856 Query 1851 TATGGATTTTGTGGGCGAAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGATATACTCCAGAA 1910 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1857 TATGGATTTTGTGGGCGAAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGATATACTCCAGAA 1916 Query 1911 ATGTAGCAGACGTAAGATTAGACAGAATATTGTTCATATTCTAGAAAATTGGTTGTCAGC 1970 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1917 ATGTAGCAGACATAAGATTAGACAGAATATTGTTCATATTCTACAAAATTGGTTGTCAGC 1976 Query 1971 TGAACATCTGATTAGACGGTTACCAGGCCCTGAGGCAATTGTAAAGCAATGGGTTAAGAT 2030 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1977 TGAACATCTGATTAGAAGGTTACCAGGCCCTGAGGCAATTGTAAAGCAATGGGTTAAGAT 2036 Query 2031 AGAGCGGGAATGTCACACGGATCTGGATGCGGCAGGTTCTTGTACAACTTTGTACTCATT 2090 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2037 AGAACGGGAATGTCACACGGATCTGGATGCGGCAGATTCTTGTACAACTTTGTACTCATT 2096 Query 2091 GTTATCATCTTCTCaaaaaaaGTCAAAGCGGGGTATCGGAAAAATCCTTGAGCAGGAGCT 2150 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2097 GTTATCATCTTCTCAAAAAAAGTCAAAGCGTGGTATCGGAAAAATCCTAGAGCAGGAGCT 2156 Query 2151 TCTTGCCTATGACAGAGTG-TTACCTTTAAGGTCAAATCTAGGTCAACAAACGCGAATCA 2209 |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2157 TCTTGCCTATGATAGAGTGCTT-CCTTTAAGGTCAAATCTAGGTCAACAAACTCGAATCA 2215 Query 2210 AGATAGCAGATATCCTCTTGAAGGATGTTTATGTCACTGAGGATATGCATATAGAGAGAG 2269 ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2216 AGATAACAGATATCCTTTTGAAGGATGTTTATGTCACTGAGGATATGCATATAGAGAGAG 2275 Query 2270 CAAGAATTTTGATATGGAAAGCACGAATGACAAGGACATCTGGAACTGAACATATAACCG 2329 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2276 CAAGAATCTTGATATGGAAAGCACAAATGACAAGGACATCTGGAACTGAACATATAACCG 2335 Query 2330 AGTGCATTTGTTTTCTGTCTGAAGCAATCTCTATATTGGGTGAGTTACATCATGGGCCAA 2389 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2336 AGTGCATTTGTTTTCTGTCCGAAGCAATCTCTATATTGGGTGTGTTACATCATGGGCCAA 2395 Query 2390 ATGAAGAGGGTTCTCCATCTTCTCACATGTTACCTATTGCGTATTGCTTGAGAGCTTTTT 2449 || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2396 ATAAAGAGGGTTCTCCATCTTCTCCCATGTTACCTATTGCGTATTGCTTGAGAGCTTTTT 2455 Query 2450 GTACCCAGGAAGCTGACCCAAACTCGAAGAAAGTCTTTCAAGATATTAGCACTTCACTAA 2509 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2456 GTACCCAGGAAGCTGAGCCAAACTCGAAGAAAGTCTTTCAAGATATTAGCACTTCACTAA 2515 Query 2510 ATCTCTGGCT-AAGGATTCTTAGCCTAGATGATAGTGGAGACAGTCTACCAACAGAGAAT 2568 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 2516 ATCTCTGGCTGAA-GATTCTTAGCCTAGATGATAGTGGGGACAGTCTACCAACAGAAAAC 2574 Query 2569 ATAATTCCGTTACTGTATAATATGATTGATTTGATGTCAGTGAAGGGATGTACAGAGCTC 2628 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2575 ATAATTCCGTTACTGTATAATATGATTGATTTGATGTCAGTGAAGGGATGTACAGAGCTC 2634 Query 2629 CATCATCATATATACCAACTGATTTTCAGATTGTTTAAATGGAAGAATGTCAAATTGGAG 2688 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2635 CATCATCATATATACCAACTGATTTTCAGATTGTTTAAATGGAAGAAAGTCAAATTGGAG 2694 Query 2689 GTCTGCCTTGCAATGCTGTGGGAATGTAGAAGGCTTAGTCATGCCTTATGCCCTTCCCCC 2748 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2695 GTCTGCCTTGCAATGCTGTGGGAATGTAGAAGGCTTAGTCATGCCTTATGCCCTTCCCCC 2754 Query 2749 ATAAGTGATGCCTTTATCCAGACCTTATCAGAGAATTGTGCTGACAAATCCACATGCATT 2808 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2755 ATAAGTGATGCCTTTATCCAGACCTTATCAGAGAATTGTGGTGACAAATCCACATGCATT 2814 Query 2809 GATTTCTGGATGGATTGCCTGAAAGATTCAAAAGCAAAGTTAATTGGGTTCCAGCAGAAC 2868 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2815 GATTTCTGGATGGATTGCCTGAAAGATTCAAAAGCAAAGCTAATTGGGTTCCAGCAGAAC 2874 Query 2869 TTCCATGATTTACATAATAAGGATGAAGGTCCCTTTCAATCAGACATCACAATTGACGAT 2928 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| Sbjct 2875 TTCCATGATTTACATAATAAGGATGAAGGTCCCTTTCAATCAGACTTCACAATAGGCGAT 2934 Query 2929 ATTAAAGATGCAGCATCAGAACTCATCTCCAGTGCATCACTCTCTGGTAATTCATCTTTT 2988 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2935 ATTAAAGATGCAGCTTCAGAACTCATTTCCAGTGCGTCACTCTCTGGTAATTCATCTTTT 2994 Query 2989 GCAGCTGCATATCTCTATTATGATCTCTGTGAAAGGCTCATATCATTTGGAAAACTTTCT 3048 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2995 GTAGCTGCATATCTCTATTATGATCTCTGTGAAAGGCTCATATCATTTGGAAAACTTTCT 3054 Query 3049 GAGGCTCTTTCATATGCAAAAGAAGCCTATAGGATAAGGACTCTTATATTTCAAGATAAA 3108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3055 GAGGCTCTTTCATATGCAAAAGAAGCCTATAGGATACGGACTCTTATATTTCAAGAGAAA 3114 Query 3109 TTTAAGTATACAGCTGAGAAGCA-TATCGAAAAACACAATGAAGATGGGAAAATATCAGA 3167 ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| Sbjct 3115 TTTAAGTATACAGCTGAGAAGAAGT-TCGTAAAACACAATGACGCTGGAAAAATATCAGA 3173 Query 3168 AATACGGACTTTTAGCATAAAAAATTTCCAAGTCTACAGATTGTTAGCAACTGATTTTTG 3227 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3174 GATACGGACTTTTGGCATAAAAAATTTCCAAGTCTACAGATTGTTCGCAACTGATTTTTG 3233 Query 3228 GCCATGTGGAAATTTTCTCTGGGACATCAATCGCTGCTACCTAAGTCCTTGGAGTGTACT 3287 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3234 GCCATGTGGAAATTTTCTCTGGGACATCAATTGCTGCTACCTAAGTCCTTGGAGTGTACT 3293 Query 3288 CCAATGTTATTTGGAAAGCACCCTTCAGGTTGGAATTCTGAATGAGCTCATAGGGAATGG 3347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3294 CCAATGTTATTTGGAAAGCACCCTTCAGGTTGGAATTCTGAATGAGCTAATAGGGAATGG 3353 Query 3348 ACTGGAGGCAGAAACCATTCTATCATGGGGGAAAGCCTTTTCATGCTCGCAAAGTCTATT 3407 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3354 ACTGGAGGCAGAAACCATTCTATCATGGGGAAAAGCCTTTTCATGCTCGCAAAGTCTATT 3413 Query 3408 CCCTTTTGTAGTTGCATTTTCTTCTGCCTTAGGAAATCTATACCACAAAAAGCAGTGTCT 3467 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3414 CCCTTTCATAGTTGCATTTTCTTCTGCCTTAGGAAATCTTTACCACAAAAAGCAGTGTCT 3473 Query 3468 GGATCTGGCAGAAAAGGAACTCCAAAATGCAAAAGAGATATTAATTGCTAATCAGCGAGA 3527 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3474 GGATCTGGCAGAAATTGAACTCCAAAATGCAAAAGAGATATTAATTGCTAATCAGCGAGA 3533 Query 3528 TTTTTCTTGCGTAAAGTGCAAACTGAAGTTGGAAGTTACATTGGATAAACAACTTGGAGA 3587 ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3534 TTTTTCTTGTTTTAAGTGCAAACTGAAGTTGGAAGTTACATTGGATAAACAACTTGGAGA 3593 Query 3588 CATATCTCGGAAACAAATTGATAGAGTTTCACAGACAGATGGATTCTTGCATGCTGAAAG 3647 ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3594 CATATCTCGGAAAAAAATTGATAGAGTTTCCCAGACAGATGGATTTTTGCATGCTGAAAG 3653 Query 3648 CTTGTTTAGTGCTGCCCTGGGAAAATTCTGTTGCTCAGCATGGAAAAGCTGCATTAGATC 3707 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3654 CTTGTTTAGTGCTGCCCTGGGAAAAGTCTGTTGCTCAGCATGGAAAAGCTGCATTAGATC 3713 Query 3708 ACATGGGGAAGAAATTGCTGAGGAGATAGTGATTGATAGAAATGGAGGGGAAGGTTTAGG 3767 |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3714 ACATGGGGAAGAAATTGCTGAGGAAATAGTGGTTAATAGAAATGGAGGGGACGGTTTAGG 3773 Query 3768 ACATAATTCAAGTAAAACAAAGCTCAGTATAAAGGAGCCACCAGGAAACAGAGGCTCCAG 3827 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3774 ACATAAATCAAGTAAAACGAAGCTCAGTATAAAGGAGCCACCAGGAAACAGAGGCTCCAG 3833 Query 3828 GAGGGGTGGAAGAGCTAACAAAACTTGTTTGTCAAAGGATCAGGATTTGATATCTGAGCC 3887 ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3834 GAGGGGTCTAAGAGCTAACCAAACTTGTTTGTCAAAGGACCAGGATTTGATATCTGAGCC 3893 Query 3888 AACATCAAGGTTGACTCGATCTATGCGTCACTCACTTAGAGAGCAATGCCAAAACCGTTC 3947 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3894 AACGTCAAGGTTGACTCGATCTATGCGTCACTCACTTAAAGAGCAATGCCAAAACCGTTC 3953 Query 3948 TAATGTGCCTGAAGTTGTTTCAAAGAAGCCTAATTTATGTGATAGATCTGTTGGTTCTAG 4007 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3954 TAATGTGCCTGAAGTTGTTTCAAAGAAGCCTAATTTCTGTGATAGATCTGTTGGTTCTAG 4013 Query 4008 GGGTGAAAGGGTTTTGTTGGACACGAGTAATGCACTCCCTGGCTTTTGTATTTGCTACAA 4067 |||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 4014 GGGTGAAAGGGTGTTGTTGGACACAAAAAATGCAGTCCCTGGATTTTGCATTTGCTACAA 4073 Query 4068 AGAAAAACGTCAGCAGTGCCTCTCGGAAGAAGTAACAGAATCTGGGTCTCTCAACAATTT 4127 ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4074 AGAAAAATGTCAGCAGTGCTTCTCCGAAGGAGTAACAGAATCTGGGTCTCTCAACAATCT 4133 Query 4128 AGTAAGTTTGAAATGGGAACTCTGCCATAGGAAGCTTGCGTCCTCAATACTTGTTAGCCT 4187 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4134 AGTAAGTTTGAAATGGAAACTCTGCCATAGGAAGCTTGCGTCCTCAATACTTGTTAGCCT 4193 Query 4188 TGGAAAATGTTTGGGAGACTCTGGTAGAATTCATCTAGCTCATGAGGCTTTACTGCATAG 4247 ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4194 GGGAAAATGTTTGGCAGACTCTGGTAGAGTTCATCTAGCTCATGAGGCTTTACTGCATAG 4253 Query 4248 TATCTCTGTTTTATTCAAAAGCACCTGGTCCAGCCACAACCAGCCTTCTGTC-AGTCAGT 4306 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 4254 TATCTCTGTTTTATTTAAAAGCAACTGGTCCAGCCACAACCAGCCTTCTGTCTA-TCAGT 4312 Query 4307 TGCTGGAATTTATCGGGAAAGAAGTTACAAGAGATGTATTTGCCGTTGATCGTGCAATAA 4366 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 4313 TGCTGGAGTTTATCGGGAAAGAAGTTACAAGAGATGTATTTGCTGTTGACCGTGCAATAA 4372 Query 4367 TATTATACAACTTGTGCTGGTTGAATTTGCGGAATTACCACTGCAGGAAGAGTAGGTCTA 4426 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 4373 TACTATACAACTTGTGCTGGTTGAATTTGCGGAATTACCACTGCAGGGATAGTAGGTCTA 4432 Query 4427 TCTGCTGTGATCTGTTTCATATCCCTTTCACAAAACTAGTGTCATGGTTAATGTTAGCAT 4486 | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4433 TTTGCTGTGATCTGTTTCATATTCCTTTCACAAAACTGGTGTCATGGTTAATGTTAGCAT 4492 Query 4487 TTGTACTCAGCGGAGAGGTTCCAATATTATTTCAAAAGGTTTCAAGATTGCTTGCCTCTT 4546 ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4493 TTGTACTCAGCAGAGCGGTTCCAATATTATTTCAAAAGGTTTCAAGATTGCTTGCCTCTT 4552 Query 4547 TATATCTGCTTTCTTCCTCAAATTCTGAATTCACATTCGAATCTGATGGAAATGAGCTGT 4606 ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 4553 TATATCTACTTTCTTCCTCAAGTGCTGAATTCTCATTCGAATATGATGGAAGTGAGCTGT 4612 Query 4607 CAGCAAGTCATTGGGTCTCATTTTTCCATCAAGCCTCGCTTGGTACCCATCTCAGTTACC 4666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct 4613 CAGCAAGTCATTGGGTCTCATTTTTCCATCAAGCCTCGCTTGGTACCCATATCAGTTATC 4672 Query 4667 ATTTCATTTCAAATTTGAGCCAAAAACACAAATCACAGTGCCTCTCAGATAAAGAGTGCA 4726 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4673 ATTTCATTTCAAAGTTGAGTCAAAAACACAAATCACGGTGCCTCTCAGATAAAGAGTGCA 4732 Query 4727 CAGAGGCTACTTGCTCGAGTTGCATGGTTCCTGAGGATTTGGACTTACCCAGGCTTGCTC 4786 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4733 CAGAGGCTACTTGCTCGAGTTGCATGGTTCCTGAGGATTTGGACTTACCCAGGCTTGCTC 4792 Query 4787 CTGACCGTACTCAAGATCTTGTACAATTCGCTAAAGAATTTTTCATCAATCTTCCAAGCT 4846 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4793 CTGAGCGTACTCAAGATCTTGTACAATTCGCTAAAGAATTTTTCATCAATCTTCCAAGCT 4852 Query 4847 CAACAATCATCTGCATTAGTTTGCTTGGAGGTGCTTTAAACCAATTGTTACAGGAGCTAA 4906 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4853 CAACAATCATCTGCATTAGTTTGCTTGGAGGTGCTTTAAACCAATTGTTACAGGAGCTAA 4912 Query 4907 TGCATATTCGTTCACCTGTTTGTGCCTGGGTGCTCATATCACGCCTAAACCCAGAAAGTC 4966 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4913 TGCATATTCGTTCACCTGTTTGTGCCTGGGTGCTCATATCGCGCCTAAACCCAGAAAGTC 4972 Query 4967 AACCGGTTGCCACACTTTTACCTGTAGATTCGATTGTAGAAGACATGTCAGATGACAGTG 5026 ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4973 AACCGGTTGCCACACTTCTATCTGTAGATTCGATTCTAGAAGACATGTCAGATAACAGTG 5032 Query 5027 CAAATCTTAGCTCTACCGAAGCGACTCAAGTCAAGAGTTTAAAGGGGCCCTGGCTTTGTC 5086 |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 5033 CAAACCTTAGCTCTACGGAAGCGACTCAAGTTAAGAGTTTAAAGGGGCCTTGGCTTTGTC 5092 Query 5087 CATGGGGTACCACCGTGGTTGATGAGGTAGCTCCAGCATTTAAATCAATATTGGAGGAAA 5146 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 5093 CATGGGGTGCCACCGTGGTTGATGAGGTAGCTCCAGCATTTAGATCAATATTGGAGGAAA 5152 Query 5147 GCCACTCATCTTCTTCTACTACTGAAGAAGACACAATAGAGAGTAGGGGCCTGTGGTGGA 5206 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5153 GCTACTCATCTTCTTCTACTCCTGAAGAAGACACAATAGAGAGTAGGGGCCTGTGGTGGA 5212 Query 5207 AAAAGAGAAAGAAACTTAATCATCGTCTGGGAATATTCCTAAGGAATCTAGAAGCTTCCT 5266 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 5213 AAAAGAGGAAGAAACTTGATCATCGTCTGGGAATATTCCTAAGGAATCTAGAAGCTTCAT 5272 Query 5267 GGCTGGGTCCCTGGAGGTGTCTGCTTCTCGGAGAATGGTCGAACTACAAATTGCCTGACT 5326 ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 5273 GGCTGGGCCCCTGGAGGTGTCTGCTTCTTGGAGAATGGTCGAACTACAAATTGCCTGCCT 5332 Query 5327 CAGCGCAGAAAAAGCTGGTAAATGATCTCAAGTCCAAGTGCAAAATGGAAGTAAATGAGA 5386 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5333 CAGTGCAGAAAAAGCTGGTAAATGATCTCAAGTCCAAGTGCAAAATGGAAGTAAATGAGA 5392 Query 5387 TGCTTTTGAAGGTTATTCTTGGAGGTGGGACGGATAACTTTAAAGGAGAAGCATGCGTTG 5446 ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | Sbjct 5393 TGCTTTTGAAGGTTATTCTTGGAGGTGGGACAGACAACTTTAAAGGAGAAGCATGTGTCG 5452 Query 5447 CTCAGCTTTCTTTAAGAAATGGTTGCTATGTAGGTAGAGGGGGATATCTTTATGAAGAAG 5506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5453 CTCAGCTTTCTTTAAGAAATGGTTGCTATGTAGGTAGAGGGGGATATCTTTATGAAGAAG 5512 Query 5507 ATAGCTGTAAAACTCCTACTGCTGCGTCTAATATATCTGAAAGTAGGCATGAATTGGCCT 5566 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 5513 ATAGCTGTAAAACTCCTACTGCTGCGTCTAATATATCTGAAAGTAGGCATGAATTAGCCT 5572 Query 5567 TAAAACTGATACATGACGCAGCAAGCAAACTAGGGCAACAAGATGGACATGAAAATAGAG 5626 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 5573 TAAAACTGATACATGACGCAGCAAGCAAACTAGGGCAACAAGATGGAGATGAAAATAGAG 5632 Query 5627 AACCTATCATTCTTGTGTTAGATCCCGAGGTTCAGATGCTTCCTTGGGAGAATATTCCAA 5686 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5633 AACCTATCATTCTTGTGTTAGATCCTGAGGTTCAGATGCTTCCTTGGGAGAATATTCCAA 5692 Query 5687 TACTAAGGAAACAGGAGGTGTACCGCATGCCTTCCGTAGGTTGCATATCTGCCGTGCTAA 5746 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 5693 TACTAAGGAAACAGGAGGTGTACCGCATGCCTTCCGTAGGTTGCATATCTGCTGTGCTAA 5752 Query 5747 AGAAGCGCAGTCTTCAAGGAGAGCCAGCAAAATCTCATGTTGCTTCCTTCCCTCTTATTG 5806 ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5753 AGAAGCGCAGTG---AAGGAGAGCCAGCAAGATCTCATGTTGCTTCCTTCCCTCTTATTG 5809 Query 5807 ATCCGCTAGATTCATTTTACTTGTTGAATCCTGGTGGTGATCTCACCGATACACAAGTCA 5866 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct 5810 ATCCGCTAGATTCATTTTACTTGTTGAATCCTGGTGGTGATCTCACCGATACCCAAGACA 5869 Query 5867 CGTTTGAGAGTTGGTTCAGAGATCAAAACTTTGAGGGTAAAGCTGGGTCAGAACCAAGTG 5926 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| Sbjct 5870 AGTTTGAGAGTTGGTTCAGAGATCAAAACTTTGAGGGGAAAGCTGGATTAGAACCAAGTG 5929 Query 5927 CTATAGAGTTGACAGAAGCATTAGAAACTCATGATCTCTTTCTATACTTTGGTCATGGAA 5986 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5930 CTATAGAGTTGACAGAAGCATTAAAAACTCATGATCTCTTTCTATACTTTGGTCATGGAA 5989 Query 5987 GCGGAGCACAGTATATACCTAGGCGTGAAATAGAGAAGCTAGATAACTGTTCTGCAACTT 6046 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5990 GCGGAGCACAGTATATACCTAGGCGCGAAATAGAGAAGCTAGATAACTGTTCTGCAACTT 6049 Query 6047 TCTTAATGGGATGCAGTAGTGGTTCACTATGGCTAAAAGGCTGCTACATCCCACAAGGTG 6106 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 6050 TCTTAATGGGATGCAGTAGTGGTTCACTATGGCTAAAAGGCTGCTACATCCCAGAAGGCA 6109 Query 6107 TACCACTTTCTTATCTCCTAGGTGGATCTCCAGCCATTGTGGCGACTCTATGGGACGTAA 6166 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6110 TACCACTTTCTTATCTCCTAGGTGGATCTCCAGCCATTGTGGCGACTCTATGGGACGTAA 6169 Query 6167 CAGACCGAGACATTGATCGGTTTGGGAAAGCGTTGTTGGAAGCATGGTTGCAAGAGAGGT 6226 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6170 CAGACCGAGACATTGATCGGTTTGGGAAAGCGTTGTTGGAAGCATGGTTGCAAGAGAGGT 6229 Query 6227 CAGATTCTTCTTCAGAGGGTGGCTGCAGCCAATGTGAGTCATTAGCTAATGACCTTGCAG 6286 ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| Sbjct 6230 CAGATTCTTGTTCAGAGGGTGGTTGCAGCCAGTGTGAGTCGTTAGCAAATGAACTTGCAG 6289 Query 6287 CAATGACTCTAAAAGGCACCAA---------GAGGTCAAGGAAACCATCATCGCGTAACA 6337 | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 6290 CCATGAATCTAAAAGGCACCAACAACACCAAGAGGTCAAGGAAACCGTCATCGCGTAACA 6349 Query 6338 AGCCAGCTCAATCAGATGTGGATGGGTCAGGGAAGATTGAGTGCAACCACAAGCATAGAC 6397 |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6350 AGCCAGCTAAATCAAATGTCGATGGGTCAGGGAAGATTGAGTGCAACCACAAGCATAGAC 6409 Query 6398 GTAAAATCGGTTCATTCATAGCCGCGGCTCGAGATGCGTGCAACTTGCAATACTTGATTG 6457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 6410 GTAAAATCGGTTCATTCATAGCCGCGGCTCGAGATGCGTGCACCTTGCAATACTTGATTG 6469 Query 6458 GGGCTGCGCCTGTCTGTTATGGTGTGCCAACTGGTATCACTAGGAAAAAAGGAATTGATG 6517 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 6470 GGGCTGCGCCTGTCTGTTATGGTGTACCAACTGGTATCACAAGGAAAAAAGGAATTGATG 6529 Query 6518 CTCTTCTTCCTTCT--T-CATC-TC--GTTAGTAGGTTAGAGCATCTCTTAAAATCCTCA 6571 |||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 6530 CTCTTCTTCCTTCTACTTCTTCATCTTGTTAGTAGGTTAGAGCATCTCTAAAAATCCTCA 6589 Query 6572 TTGTTTGGTCGTATAACAATTTTGAGGGAGCAAATAAATTTAGGAGTTAGGACTTCAGAT 6631 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || Sbjct 6590 TTGTTTGGTCGTATAACAATTGTGAGGTAGCAAAAAAATTTAGGAGTTAGGACGTCAAAT 6649 Query 6632 CAGAGATTTTATGACAACAACGCAAGAGAAGAGAAAAAA-GGAGACTCTAGTCTAGAGAT 6690 ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct 6650 CAGAGATCTTATGACAGCAACACAAGAGAAGAGAAAAAAAGGAGACTCTGGTCTAGAGAT 6709 Query 6691 ATATATTCATCCCTGtttttttATATAACAAAATTGTaaaaaaaaaTATCACATGATGTA 6750 |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 6710 ATATATTCATCCCTGTTTTT--ATATAACAAA-TTGTAAAAAGGAATATCACATGATGTA 6766 Query 6751 TTGTCCTCGAATTCTATGTTATAAAAGTG 6779 |||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 6767 TTGTCCTCAAATTCTATATTATAAAAGTG 6795 > Ahg945887 jgi|Araly1|945887|scaffold_702116.1 Length=469 Score = 171 bits (92), Expect = 9e-41 Identities = 140/163 (86%), Gaps = 4/163 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1868 AAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGATATACTCCAGAAATGTAGCAGAC-GTAAG 1926 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| Sbjct 46 AAGCATGTAATAGGTGTGCATTCTACCTGGCTATACTCCACCAATGTAGC-GATTGTAAG 104 Query 1927 ATTAGACAGAATATTGTTCATATTCTAGAAAATTGGTTGTCAGCTGAACATCTGATTAGA 1986 |||||||||| ||| || || |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct 105 ATTAGACAGACTATCGTGCAGATTCAAGAGAATTGGTTTTCAGCAGAGCATCTGATTAGA 164 Query 1987 CGGTTACCAGGCCCTG-AGGCAATTGTAAAGCAATGGGTTAAG 2028 |||||| |||||||| || ||||||||| || ||| ||||| Sbjct 165 AGGTTACTAGGCCCTGCAGA-AATTGTAAAACAGTGGATTAAG 206 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 258106460086 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5