BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT4G24200.1

Length=3663
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg492440 jgi|Araly1|492440|fgenesh2_kg.7__1873__AT4G24200.1        5485    0.0  


> Ahg492440 jgi|Araly1|492440|fgenesh2_kg.7__1873__AT4G24200.1
Length=3622

 Score = 5485 bits (2970),  Expect = 0.0
 Identities = 3453/3676 (94%), Gaps = 73/3676 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     AGTTATTAAATATTTATTGCCAAAAAGAATAAACGAAGAAAAAGCCTTTTCTTCTCTCTC  60
             ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||
Sbjct  1     AGTTATTGAATATTTATTACCAAAAAGAATAAACGAAG--AAAGCCTTTTCTTCTCTCTC  58

Query  61    GTTTTCGCGACAACCTTTTCCTCGAAGAAGAAGAAGAACGAGGTTTTCTC-TCAGAGCTG  119
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct  59    GTTTTCGCGACAACCTTTTCCTCGAAGAAGAAGAAGAACGAGGTTTTCTCAT-AGAGCTG  117

Query  120   CCAACCATCGTTGCCCGGAGATTTAAAAAACCTGTGATAAATCGTAACTGAGTGAGAGAT  179
             |||||||    |   |   |  ||      ||      |||||||||| |||||||| ||
Sbjct  118   CCAACCA----T---C---G--TT-----GCC------AAATCGTAACAGAGTGAGAAAT  154

Query  180   ATATACACATATATATACACAGAGGGACAAGGAAAGAGATTGGGATATGCGAGTGCGCAT  239
             ||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct  155   ATATACACACATATAT--ACAGAGGGACAAGG-AAGGGATTGGGATATGCGAGTGGGCAT  211

Query  240   CGGTTCTGTCGGAACGGCTAACTCGCTTGACCTAGGGTTTCGTCTTCCTTGTGCTTCGTG  299
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  212   CGGTTCTGTCGGAACGGCTAACTCGCTTGACCTAGGGTTTCGTCTTCCTTGTGCTTCATG  271

Query  300   GAGTTTTTCGAATGGGAGAAAGAACCTTTTTGCTTTC-TAACCGTGTTCTATATTTTTGG  358
             || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct  272   GACTTTTTCGAATGGGAGAAAGAACCTTTTTGC-TTCATAACAGTGTTCTATATTTTTGG  330

Query  359   AGTTGTCATAAGTAAAGCAGTATGACGCTTGAAGATTTCTTTACCCTAACAGAAATAAAA  418
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331   AGTTGTCATAAGTAAAGCAGTATGACGCTTGAAGATTTCTTTACCCTAACAGAAATAAAA  390

Query  419   GATGGACTCACGGTCACTTCTCGTGTTGAAGAGCTTGTGTCTGTTATGCAGAGTAATAAG  478
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| 
Sbjct  391   GATGGACTCACGGTCACTTCTCGTGTTGAAGAGCTCGTGTCTGTTATGCAAAGTAATAAA  450

Query  479   GATTCAGTTTTGAAGAATAGTGGTGATGCTTTTAGACAATGGACTGCTGTTGCAAGCACA  538
             ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  451   GATTCAGTTTTGAAGAATAATGGTGATGCTTCTAGACAATGGACTGCTGTTGCAAGCACA  510

Query  539   ATTGCGGCTACAAAGAACAGAGATTGTCTTGATGTTTTTGTAAATTTAGATGGACTTGTT  598
             |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  511   ATTGCGGCCACTAAGAACAGAGATTGTCTTGATGTTTTTGTAAATTTAGATGGACTCGTT  570

Query  599   TACTTAAGTAGCTGGCTAGCTGAAGCTCAGATGTTGGATAACGATTCAGTTGACAGATCT  658
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  571   TACTTAAGTAGCTGGCTAGCTGAAGCTCAGATGTTGGCTAACGATTCAGTTGACAGATCT  630

Query  659   GTAGAGGAGTCAATTCTTGCTTTGTTAGAAGCTGTTGAAAATCTAGGTGTAGACAGTTCC  718
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  631   GTAGAGGAGTCAATTCTTGCTTTGTTAGAAGCTGTTGAAAATCTAGGTGTAGACAGTTCG  690

Query  719   AAGTTAGTTTCTTCTGGGTTATGGGTTGCTGTCAAGAAACTTGTGGACCATGGTAGTTCT  778
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  691   AAGTTAGTTTCTTCTGGGATATGGGTTGCTGTCAAGAAACTTGTTGACCATGGTAGTTCT  750

Query  779   CGAGTTCAGGATCAGGCGAGAAAGCTCTTTGGTAGCTGGAAGGATAAGGATGAT-TATGA  837
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||
Sbjct  751   CGGGTTCAGGATCAGGCGAGAAAGCTCTTTGGTAGCTGGAAAGATAAGGATG-TGTATGA  809

Query  838   CCACTCTGAACATGACAGTGAAAGCTGTAACAAAATTCATGAAGATGAGATGAGAGTTGT  897
             ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  810   CCACTCTGAACATGACATTGAAAGCTGCAACAAAATTCATGAAGATGAGATGAGAGTCGT  869

Query  898   AGCAGCAAGCATCGAGAGCAGTGGGCAAAAATCTGCTGTTACACTTTGTTCGATGCAAAG  957
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
Sbjct  870   AGCAGCAAGCATGGAGAGCAGTGGGCAAAAATCTGCTGTTACACTTTGTTCGACAAAAAG  929

Query  958   TACTAGTGAAAAACATTGTCCTGAAATAGCAGATGAAGCCTTGCTATCAGGATGCTCAGA  1017
             || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  930   TAATAATGAAAAACACTGTCCTGAAATAGCAGATGAAGCCTTGCTGTCAGGATGCTCAGA  989

Query  1018  AGGAAACATCCCAGATCAAGATAAGGGTTTGGGACTGCAGAACGACAAGGCTGGGTTTGT  1077
             |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  990   AGGAAACATCCCAGATCAAGATGAGGGTTTGGAACTGCAGAACGACAAGGCTGGGTTTGA  1049

Query  1078  CTCGAACGTGAATTCCCACTGCTCTAATTCGATGACTGAAACT-----TT-CAATGGTTC  1131
             |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||     || |||||||||
Sbjct  1050  CTCGAACGTGAATTCCCATTGCTCGAATACGATGACTGAAACTGAAACTTTCAATGGTTC  1109

Query  1132  TT-GTACCGATGATATCATGAAAGAGGTTCAAGAAAAACTTTCTGTGAAGGAAAAAAGCT  1190
             || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct  1110  TTCG-ACGGATGATATCATGAAAGAGGTTCAAGAAAAACTTTCCGTGAAGGAGAAAAGCT  1168

Query  1191  CTATGG-GGGAGACAAGTGGCCCAACGACTTTTGGTACTATGCCTACTGGGTCTAGTAGC  1249
             |||||  ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1169  CTATGAAGGG-GACAGGTGGTCCAACGATTTTTGGTACTATGCCTACTGGTTCTAGTAGC  1227

Query  1250  CTACTTTATTTAGAGCGTGATAGTGCT-GAAGGCCCATCAAATGCTCCACTGGATGCTGA  1308
             ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1228  CTACTTTATTTAGAGCGCGATAGTG-TAGAAGGGCCATCAAATGCTCCACTGGGTGCTGA  1286

Query  1309  GATACCCAAGGAAAAGCAGATGGCAAACTATTTTCTTGAAAAATTGGGTGAAGCAGGGAC  1368
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1287  GATACCCAAGGAAAAGCAGATGGCAAACTATTTTCTTGAAAAATTGGGTGAAGCAGGGAC  1346

Query  1369  ATCTAGTGCAGCAGGACACGTAGCTGTGTCTTCTGATTCTATTG-TTGCCAGCATGGAGT  1427
             |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct  1347  ATCTAGTGCAACAGGATATGTAGCTGTGTCTTCTGATTCTAT-GATTGCCAGCATGGAGT  1405

Query  1428  TGGAGAAAAATAGTCTTTTGCAGAGTAGTCTTGATTCAAATGAGGTGAGCAAGAATGTGT  1487
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
Sbjct  1406  TGGAGAAAAATAGTCTTTTGCAGAGTAGTCTTGATTCAAATGAGGTGAGCAAGAATGCAT  1465

Query  1488  CTGGGACGATATGTGGGTCGCACGATGTGAGCGTAGCCCATAATAGCAAACAGGTGTCTT  1547
             ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1466  CTGAGACGATATGTGGGTCGCACGGTGCGAGCGTAGCCCATAATAGCAAACAGGTGTCTT  1525

Query  1548  CATTGACTCATATGACGGACAATCAAGATTCTGACAATTCATCAAGATTATCAGGTGGCC  1607
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1526  CATTGACTCATATAACGGACAATCAAGATTCTGACAGTTCATCAAGATTATCAGGTGGCC  1585

Query  1608  TTGGTAGAAGTAGAAAATTTGAGAGTGACAATTTAACTGGTCTTGCTGACAATGAAGGAA  1667
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct  1586  TTGGTAGAAGTAGAAAATTTGAGAGTGACAATTTAAATGCTCTTGCTGACAATGAAGGAA  1645

Query  1668  AAGATGATATGGGTCATTCTGACAAAAAGAGGAGAGTAAAACGGAGaaaaaaaCGCATCT  1727
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct  1646  AAGATGATATGGGTCATTCAGACAAAAAGAGGAGAGTAAAACGGATAAAAAAACGCAGCT  1705

Query  1728  CTTCTAGATCAATGACCATATCCCAGCGCCTTGGAGCAATTGACAAAACAACTACTGATA  1787
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1706  CTTCTAGATCAATGACCATATCCCAGCGCCTGGGAGCAATTGATAAAACAACTACTGATA  1765

Query  1788  TTGATCTTGGTATTTTGGATGCCTTGGAGGTCGCTACCAAAGTCGCACAGGAAGTCGCAA  1847
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct  1766  TTGATCTTGGTATTTTGGATGCCTTGGAGGTCGCTACCAAAGTCGCACAAGAAGTCGCTA  1825

Query  1848  GAGAAGTGGACTCTGGAGAACCTTCTCATAGTTCTTCAGAAGAACTATCCGATGAAAGCG  1907
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1826  GAGAAGTAGACTCTGGAGAACCTTCTCATAGTTCTTCAGAAGAACTATCCGATGAAAGCG  1885

Query  1908  GGCAGTCTGGTTCGCAATACTCCCGCGATGATGATGTACATACAGGTTCTCCATCTAAGG  1967
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  1886  GGCAGTCTGGTTCGCAAGACTCCCGCGATGATGATGTACATACAGGTTCTCGATCTAAGG  1945

Query  1968  GATTATCAGT-GACTGAAAACCATTCCTTTGAGGAACCTCATGTTGGAGATGATGATCTA  2026
             |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | 
Sbjct  1946  GATTATCAGTAGG-TGAAAACCATTCCTTTGAGGAACCTAATGTTGGAGATGATGATGTC  2004

Query  2027  ATGGATGAGAAAGATGACAAACCTGAAAGTGGTGATGTTGAAGAAAGACACCTAGCAACA  2086
             ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||
Sbjct  2005  ATGGATGAGAATGTTGACAAACCTGAAAGTGATGATGTTGAAGAAAGCCACTTAGCAGCA  2064

Query  2087  GCTGCTAAATCTGAAGTAGGCAGAGAGAAAAGCCCATGTGGCTTTGATCTTAATCAAGAT  2146
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2065  GCTGCTAAATCTGAAGTAGGCAGAGAGAAAAGCCCATGTGGATTTGATCTTAATCAAGAT  2124

Query  2147  ATATGTCCTGATGAAACAGATGTCATTATGTCCTCCACATCTACAACCCCTGCTCCTATG  2206
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||
Sbjct  2125  ATATGTCCTGATGAAACAGATGTCATTATGTCCTCCATATCTACAGCCCCTACTCCTATG  2184

Query  2207  TCTGTTTCATTTTCTGTCTCATCTTCTGCAATGCCTGCAGCAGCACCGTGGCATTTGGAA  2266
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct  2185  TCTGTTTCATTTTCTGTCTCATCTTCTGGAATGCCTGCAGCAGCACCGTTGCAATTGGAA  2244

Query  2267  AGATCTCTTAGCGGGAAAGGATCAGCTGCTACGAGTGTATTTCACTCAGCATTACCTCAT  2326
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct  2245  AGATCTCTTAGCGGGAAAGGATCAGCTGCTACTAGTGTATTCCACCCAGCATTACCTCAT  2304

Query  2327  AAAGTTCCTAGTGGGGATTTAAGAGAAAAGCAGGTGATTTCTCGTGGTATCGATCTGAAC  2386
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2305  AAAGTTCCTAGTGGGGATTTAAGAGAAAAGCAGGTGATTTCCCGTGGTATCGATCTGAAC  2364

Query  2387  GTGGCTGAGGTAGGAGATGATCAAGTTGAAGATCTTACTCCTTGGAAACAGTTTCCTTTC  2446
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2365  GTGGCTGAGCTAGGAGATGATCAAGTTGAAGATCTGACTCCCTGGAAACAGTTTCCTTTC  2424

Query  2447  TCCTCATCAAACTCTAGGGGTGGAGAGTCTTCACATGAAGCCAGTCTGCGAGGATCAAGC  2506
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2425  TCCTCATCAAACTCTAGGGGTGGAGAGTCTTCACATGAAGCCAGTCTCCGAGGATCAAGC  2484

Query  2507  AAGTTCAACTTGGATTTGAATTGTATGAACGAGGACGATGAGATGCCTCCACCTTCTGAG  2566
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2485  AGGTTCAACTTGGATTTGAATTGTATGAACGAGGACGATGAGATGCCTCCACCTTCTGAG  2544

Query  2567  TCGAAGATGGAAACAAGATTGTTTTTAAGTCACAATGGTCAGCAAAGCGCATCACCTGTC  2626
             | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2545  TTGAAGATGGAGACAAGATTGTTTTTAAGTCACAATGGTCAGCAAAGCGCATCACCTGTC  2604

Query  2627  TCCTCATCGTCAGTTGCTCAACAATCAGGCAAGGAAGTAAACTTTGATTTGAATGACAGG  2686
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2605  TCCTCATCGTCAGTTGCTCAGCAATCAGGCAAGGAAGTTAACTTTGATTTGAATGACAGG  2664

Query  2687  CCACAGTTTTTCATTGATTCACGTGATCAGGGTCCCTACTATGGGCGGCACCCATGGAGT  2746
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2665  CCACAGTTTTTCATCGATTCACGTGATCAGGGTCCCTACTATGGGCGGCACCCATGGAGT  2724

Query  2747  ACAGCCTCCTATGGGGGGCACAAATTGGAAGAACCAGGTATATCTATCTTGGGTACAAAA  2806
             || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2725  ACGGCCTCCTATGGAGGGCACAAATTGGAAGAACCAGGTATTTCTATCTTGGGTACAAAA  2784

Query  2807  GTGGAAGCTGACAGAAAAGACTCTGTACCTCAGATGGCTTCGTTCTTGTCCAATGGCAAG  2866
             ||||| | ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2785  GTGGATGTTGATAGAAAAGAGTCTGGATCTCAGATGGCTTCGTTCTTGTCCAATGGCAAG  2844

Query  2867  TCCCTCGAGCCTGCAACAGGTTTACACATGGGAAGAACGGGAAACTCTTTGGGTCTAGCC  2926
             |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2845  TCCCTCGAACCTGCAGCAGGATTATACATGGGAAGAACGGGAACCTCTTTGGGTCTAGCC  2904

Query  2927  CCTGGTGTCTCCTTTTCTCCAGCCCCTATGTATGGCTACAACGGATTGACTGGTCCTCCT  2986
             || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct  2905  CCAGGTGTCTCCTTTTCTCCAGCTCCTATTTATGGCTACAACGGAATGAGTGGTCCTCCT  2964

Query  2987  GGTTTGTCAATGTCATCACCCATGTATGTTCCTGGAACTGCTATTCCATACATGGTGGAT  3046
             ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2965  GGTTTGTCAATGTCATCGCCAATGTATGTTCCTGGAACTGCTATTCCATACATGGTGGAT  3024

Query  3047  TCAAGAGGTACCCCAGTGATGATGCCGCAAATAATCGGATC-AGCGCCGTATGTGCAGCC  3105
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||
Sbjct  3025  TCAAGAGGTACTCCAGTGATGATGCCGCAAATAATCGGATCGACC-CCGTATGTGCAGCC  3083

Query  3106  ACCATTCCCTCAACAACACATGTTCATGAGCTTGGCGGGTGGATCGCCTAGTACGAATGG  3165
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct  3084  ACCATTCCCTCAACAACACATGTTCATGAGCTTGGCGGGTGGATCCCCTAGTATGAATGG  3143

Query  3166  ATCAATGCGGCCAAACTTTGATCAGAACTCTGGGTTTGGACTTGAGATAGGAAACAGAGA  3225
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3144  ATCAGTGCGGCCAAACTTTGATCAGAACTCTGGGTTTGGACTTGAGATAGGAAACAGAGA  3203

Query  3226  GTCGCTAAATTTGAGGCAGTTTCTATCACCTTCACAAAGCGGGGCTATGGGAGAGCATTC  3285
             |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3204  GTCGATAAATTTGAGGCAGTTTCTATCGCCGTCACAAAGCGGGGCAATGGGAGAGCATTC  3263

Query  3286  AGGAGCAAATGTAGAGCCCTCATCGAGTTCTTCTATCAGCATTGGTGGAAAGCGAAAAGA  3345
              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  3264  GGGAGCAAATGTAGAGCCCTCATCGAGTTCGTCTATTAGCATTGGTGGAAAGCGAAAAGA  3323

Query  3346  GCCGGAGCCACGTTGGGAGTTTCCTCCATGGAGGTGAGTGATCTACAAAGTGGTGGAGAT  3405
             ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||
Sbjct  3324  GCCGGAGACACGGTGGGAGTTCCCTCCATGGAGGTGAGTGATGTACAA-GTGGTGGGGAT  3382

Query  3406  GGGTTCTTGAATAGGTTGATGAATTGATTGATTGGTCAAAGGATGATGACAAGTGTTTTG  3465
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
Sbjct  3383  GGGTTCTTGAATAGGTTGATGAATTGATTGATTGGTCAAAGGATGATGACAAGTGTT--G  3440

Query  3466  AGGTAACTTATAAAGTG-TCTTGCTGAACttttc-cttcttttttttttatttcctcagt  3523
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||   | |||  |||| 
Sbjct  3441  AGGTAACTTATAAAGTGGTCTTGCTGAACTTTTCTCT-CAGTTTTCCCT-TTT--TCAGG  3496

Query  3524  tttcccatttttcaggttttttattttatttcATAACATATAGGAGGATTAGTTCAAACA  3583
             |||    ||||  |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3497  TTT----TTTT--A--TTTT--ATTTTATTTCATAACATATAGGAGGATTAGTTCAAACA  3546

Query  3584  TT-GGTATATGTCAAGCTTCTTTTT-AACCTTGTTGGGTTTTTCTCCATAAATAAATATA  3641
             || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3547  TTTGGTATATGTCAAGCTTCTTTTTTAACCTTGTTGGGTTTTTCTCCATAAATAAATATA  3606

Query  3642  TAGTTTTAAGATACAG  3657
             ||||||||||||||||
Sbjct  3607  TAGTTTTAAGATACAG  3622



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 138377335428


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5