BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G24200.1 Length=3663 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg492440 jgi|Araly1|492440|fgenesh2_kg.7__1873__AT4G24200.1 5485 0.0 > Ahg492440 jgi|Araly1|492440|fgenesh2_kg.7__1873__AT4G24200.1 Length=3622 Score = 5485 bits (2970), Expect = 0.0 Identities = 3453/3676 (94%), Gaps = 73/3676 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGTTATTAAATATTTATTGCCAAAAAGAATAAACGAAGAAAAAGCCTTTTCTTCTCTCTC 60 ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGTTATTGAATATTTATTACCAAAAAGAATAAACGAAG--AAAGCCTTTTCTTCTCTCTC 58 Query 61 GTTTTCGCGACAACCTTTTCCTCGAAGAAGAAGAAGAACGAGGTTTTCTC-TCAGAGCTG 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 59 GTTTTCGCGACAACCTTTTCCTCGAAGAAGAAGAAGAACGAGGTTTTCTCAT-AGAGCTG 117 Query 120 CCAACCATCGTTGCCCGGAGATTTAAAAAACCTGTGATAAATCGTAACTGAGTGAGAGAT 179 ||||||| | | | || || |||||||||| |||||||| || Sbjct 118 CCAACCA----T---C---G--TT-----GCC------AAATCGTAACAGAGTGAGAAAT 154 Query 180 ATATACACATATATATACACAGAGGGACAAGGAAAGAGATTGGGATATGCGAGTGCGCAT 239 ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct 155 ATATACACACATATAT--ACAGAGGGACAAGG-AAGGGATTGGGATATGCGAGTGGGCAT 211 Query 240 CGGTTCTGTCGGAACGGCTAACTCGCTTGACCTAGGGTTTCGTCTTCCTTGTGCTTCGTG 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 212 CGGTTCTGTCGGAACGGCTAACTCGCTTGACCTAGGGTTTCGTCTTCCTTGTGCTTCATG 271 Query 300 GAGTTTTTCGAATGGGAGAAAGAACCTTTTTGCTTTC-TAACCGTGTTCTATATTTTTGG 358 || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 272 GACTTTTTCGAATGGGAGAAAGAACCTTTTTGC-TTCATAACAGTGTTCTATATTTTTGG 330 Query 359 AGTTGTCATAAGTAAAGCAGTATGACGCTTGAAGATTTCTTTACCCTAACAGAAATAAAA 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 331 AGTTGTCATAAGTAAAGCAGTATGACGCTTGAAGATTTCTTTACCCTAACAGAAATAAAA 390 Query 419 GATGGACTCACGGTCACTTCTCGTGTTGAAGAGCTTGTGTCTGTTATGCAGAGTAATAAG 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 391 GATGGACTCACGGTCACTTCTCGTGTTGAAGAGCTCGTGTCTGTTATGCAAAGTAATAAA 450 Query 479 GATTCAGTTTTGAAGAATAGTGGTGATGCTTTTAGACAATGGACTGCTGTTGCAAGCACA 538 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 451 GATTCAGTTTTGAAGAATAATGGTGATGCTTCTAGACAATGGACTGCTGTTGCAAGCACA 510 Query 539 ATTGCGGCTACAAAGAACAGAGATTGTCTTGATGTTTTTGTAAATTTAGATGGACTTGTT 598 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 511 ATTGCGGCCACTAAGAACAGAGATTGTCTTGATGTTTTTGTAAATTTAGATGGACTCGTT 570 Query 599 TACTTAAGTAGCTGGCTAGCTGAAGCTCAGATGTTGGATAACGATTCAGTTGACAGATCT 658 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 571 TACTTAAGTAGCTGGCTAGCTGAAGCTCAGATGTTGGCTAACGATTCAGTTGACAGATCT 630 Query 659 GTAGAGGAGTCAATTCTTGCTTTGTTAGAAGCTGTTGAAAATCTAGGTGTAGACAGTTCC 718 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 631 GTAGAGGAGTCAATTCTTGCTTTGTTAGAAGCTGTTGAAAATCTAGGTGTAGACAGTTCG 690 Query 719 AAGTTAGTTTCTTCTGGGTTATGGGTTGCTGTCAAGAAACTTGTGGACCATGGTAGTTCT 778 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 691 AAGTTAGTTTCTTCTGGGATATGGGTTGCTGTCAAGAAACTTGTTGACCATGGTAGTTCT 750 Query 779 CGAGTTCAGGATCAGGCGAGAAAGCTCTTTGGTAGCTGGAAGGATAAGGATGAT-TATGA 837 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| Sbjct 751 CGGGTTCAGGATCAGGCGAGAAAGCTCTTTGGTAGCTGGAAAGATAAGGATG-TGTATGA 809 Query 838 CCACTCTGAACATGACAGTGAAAGCTGTAACAAAATTCATGAAGATGAGATGAGAGTTGT 897 ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 810 CCACTCTGAACATGACATTGAAAGCTGCAACAAAATTCATGAAGATGAGATGAGAGTCGT 869 Query 898 AGCAGCAAGCATCGAGAGCAGTGGGCAAAAATCTGCTGTTACACTTTGTTCGATGCAAAG 957 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 870 AGCAGCAAGCATGGAGAGCAGTGGGCAAAAATCTGCTGTTACACTTTGTTCGACAAAAAG 929 Query 958 TACTAGTGAAAAACATTGTCCTGAAATAGCAGATGAAGCCTTGCTATCAGGATGCTCAGA 1017 || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 930 TAATAATGAAAAACACTGTCCTGAAATAGCAGATGAAGCCTTGCTGTCAGGATGCTCAGA 989 Query 1018 AGGAAACATCCCAGATCAAGATAAGGGTTTGGGACTGCAGAACGACAAGGCTGGGTTTGT 1077 |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 990 AGGAAACATCCCAGATCAAGATGAGGGTTTGGAACTGCAGAACGACAAGGCTGGGTTTGA 1049 Query 1078 CTCGAACGTGAATTCCCACTGCTCTAATTCGATGACTGAAACT-----TT-CAATGGTTC 1131 |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| Sbjct 1050 CTCGAACGTGAATTCCCATTGCTCGAATACGATGACTGAAACTGAAACTTTCAATGGTTC 1109 Query 1132 TT-GTACCGATGATATCATGAAAGAGGTTCAAGAAAAACTTTCTGTGAAGGAAAAAAGCT 1190 || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 1110 TTCG-ACGGATGATATCATGAAAGAGGTTCAAGAAAAACTTTCCGTGAAGGAGAAAAGCT 1168 Query 1191 CTATGG-GGGAGACAAGTGGCCCAACGACTTTTGGTACTATGCCTACTGGGTCTAGTAGC 1249 ||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1169 CTATGAAGGG-GACAGGTGGTCCAACGATTTTTGGTACTATGCCTACTGGTTCTAGTAGC 1227 Query 1250 CTACTTTATTTAGAGCGTGATAGTGCT-GAAGGCCCATCAAATGCTCCACTGGATGCTGA 1308 ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1228 CTACTTTATTTAGAGCGCGATAGTG-TAGAAGGGCCATCAAATGCTCCACTGGGTGCTGA 1286 Query 1309 GATACCCAAGGAAAAGCAGATGGCAAACTATTTTCTTGAAAAATTGGGTGAAGCAGGGAC 1368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1287 GATACCCAAGGAAAAGCAGATGGCAAACTATTTTCTTGAAAAATTGGGTGAAGCAGGGAC 1346 Query 1369 ATCTAGTGCAGCAGGACACGTAGCTGTGTCTTCTGATTCTATTG-TTGCCAGCATGGAGT 1427 |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct 1347 ATCTAGTGCAACAGGATATGTAGCTGTGTCTTCTGATTCTAT-GATTGCCAGCATGGAGT 1405 Query 1428 TGGAGAAAAATAGTCTTTTGCAGAGTAGTCTTGATTCAAATGAGGTGAGCAAGAATGTGT 1487 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1406 TGGAGAAAAATAGTCTTTTGCAGAGTAGTCTTGATTCAAATGAGGTGAGCAAGAATGCAT 1465 Query 1488 CTGGGACGATATGTGGGTCGCACGATGTGAGCGTAGCCCATAATAGCAAACAGGTGTCTT 1547 ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1466 CTGAGACGATATGTGGGTCGCACGGTGCGAGCGTAGCCCATAATAGCAAACAGGTGTCTT 1525 Query 1548 CATTGACTCATATGACGGACAATCAAGATTCTGACAATTCATCAAGATTATCAGGTGGCC 1607 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1526 CATTGACTCATATAACGGACAATCAAGATTCTGACAGTTCATCAAGATTATCAGGTGGCC 1585 Query 1608 TTGGTAGAAGTAGAAAATTTGAGAGTGACAATTTAACTGGTCTTGCTGACAATGAAGGAA 1667 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 1586 TTGGTAGAAGTAGAAAATTTGAGAGTGACAATTTAAATGCTCTTGCTGACAATGAAGGAA 1645 Query 1668 AAGATGATATGGGTCATTCTGACAAAAAGAGGAGAGTAAAACGGAGaaaaaaaCGCATCT 1727 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1646 AAGATGATATGGGTCATTCAGACAAAAAGAGGAGAGTAAAACGGATAAAAAAACGCAGCT 1705 Query 1728 CTTCTAGATCAATGACCATATCCCAGCGCCTTGGAGCAATTGACAAAACAACTACTGATA 1787 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1706 CTTCTAGATCAATGACCATATCCCAGCGCCTGGGAGCAATTGATAAAACAACTACTGATA 1765 Query 1788 TTGATCTTGGTATTTTGGATGCCTTGGAGGTCGCTACCAAAGTCGCACAGGAAGTCGCAA 1847 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 1766 TTGATCTTGGTATTTTGGATGCCTTGGAGGTCGCTACCAAAGTCGCACAAGAAGTCGCTA 1825 Query 1848 GAGAAGTGGACTCTGGAGAACCTTCTCATAGTTCTTCAGAAGAACTATCCGATGAAAGCG 1907 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1826 GAGAAGTAGACTCTGGAGAACCTTCTCATAGTTCTTCAGAAGAACTATCCGATGAAAGCG 1885 Query 1908 GGCAGTCTGGTTCGCAATACTCCCGCGATGATGATGTACATACAGGTTCTCCATCTAAGG 1967 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1886 GGCAGTCTGGTTCGCAAGACTCCCGCGATGATGATGTACATACAGGTTCTCGATCTAAGG 1945 Query 1968 GATTATCAGT-GACTGAAAACCATTCCTTTGAGGAACCTCATGTTGGAGATGATGATCTA 2026 |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 1946 GATTATCAGTAGG-TGAAAACCATTCCTTTGAGGAACCTAATGTTGGAGATGATGATGTC 2004 Query 2027 ATGGATGAGAAAGATGACAAACCTGAAAGTGGTGATGTTGAAGAAAGACACCTAGCAACA 2086 ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || Sbjct 2005 ATGGATGAGAATGTTGACAAACCTGAAAGTGATGATGTTGAAGAAAGCCACTTAGCAGCA 2064 Query 2087 GCTGCTAAATCTGAAGTAGGCAGAGAGAAAAGCCCATGTGGCTTTGATCTTAATCAAGAT 2146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2065 GCTGCTAAATCTGAAGTAGGCAGAGAGAAAAGCCCATGTGGATTTGATCTTAATCAAGAT 2124 Query 2147 ATATGTCCTGATGAAACAGATGTCATTATGTCCTCCACATCTACAACCCCTGCTCCTATG 2206 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| Sbjct 2125 ATATGTCCTGATGAAACAGATGTCATTATGTCCTCCATATCTACAGCCCCTACTCCTATG 2184 Query 2207 TCTGTTTCATTTTCTGTCTCATCTTCTGCAATGCCTGCAGCAGCACCGTGGCATTTGGAA 2266 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 2185 TCTGTTTCATTTTCTGTCTCATCTTCTGGAATGCCTGCAGCAGCACCGTTGCAATTGGAA 2244 Query 2267 AGATCTCTTAGCGGGAAAGGATCAGCTGCTACGAGTGTATTTCACTCAGCATTACCTCAT 2326 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct 2245 AGATCTCTTAGCGGGAAAGGATCAGCTGCTACTAGTGTATTCCACCCAGCATTACCTCAT 2304 Query 2327 AAAGTTCCTAGTGGGGATTTAAGAGAAAAGCAGGTGATTTCTCGTGGTATCGATCTGAAC 2386 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2305 AAAGTTCCTAGTGGGGATTTAAGAGAAAAGCAGGTGATTTCCCGTGGTATCGATCTGAAC 2364 Query 2387 GTGGCTGAGGTAGGAGATGATCAAGTTGAAGATCTTACTCCTTGGAAACAGTTTCCTTTC 2446 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2365 GTGGCTGAGCTAGGAGATGATCAAGTTGAAGATCTGACTCCCTGGAAACAGTTTCCTTTC 2424 Query 2447 TCCTCATCAAACTCTAGGGGTGGAGAGTCTTCACATGAAGCCAGTCTGCGAGGATCAAGC 2506 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2425 TCCTCATCAAACTCTAGGGGTGGAGAGTCTTCACATGAAGCCAGTCTCCGAGGATCAAGC 2484 Query 2507 AAGTTCAACTTGGATTTGAATTGTATGAACGAGGACGATGAGATGCCTCCACCTTCTGAG 2566 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2485 AGGTTCAACTTGGATTTGAATTGTATGAACGAGGACGATGAGATGCCTCCACCTTCTGAG 2544 Query 2567 TCGAAGATGGAAACAAGATTGTTTTTAAGTCACAATGGTCAGCAAAGCGCATCACCTGTC 2626 | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2545 TTGAAGATGGAGACAAGATTGTTTTTAAGTCACAATGGTCAGCAAAGCGCATCACCTGTC 2604 Query 2627 TCCTCATCGTCAGTTGCTCAACAATCAGGCAAGGAAGTAAACTTTGATTTGAATGACAGG 2686 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2605 TCCTCATCGTCAGTTGCTCAGCAATCAGGCAAGGAAGTTAACTTTGATTTGAATGACAGG 2664 Query 2687 CCACAGTTTTTCATTGATTCACGTGATCAGGGTCCCTACTATGGGCGGCACCCATGGAGT 2746 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2665 CCACAGTTTTTCATCGATTCACGTGATCAGGGTCCCTACTATGGGCGGCACCCATGGAGT 2724 Query 2747 ACAGCCTCCTATGGGGGGCACAAATTGGAAGAACCAGGTATATCTATCTTGGGTACAAAA 2806 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2725 ACGGCCTCCTATGGAGGGCACAAATTGGAAGAACCAGGTATTTCTATCTTGGGTACAAAA 2784 Query 2807 GTGGAAGCTGACAGAAAAGACTCTGTACCTCAGATGGCTTCGTTCTTGTCCAATGGCAAG 2866 ||||| | ||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2785 GTGGATGTTGATAGAAAAGAGTCTGGATCTCAGATGGCTTCGTTCTTGTCCAATGGCAAG 2844 Query 2867 TCCCTCGAGCCTGCAACAGGTTTACACATGGGAAGAACGGGAAACTCTTTGGGTCTAGCC 2926 |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2845 TCCCTCGAACCTGCAGCAGGATTATACATGGGAAGAACGGGAACCTCTTTGGGTCTAGCC 2904 Query 2927 CCTGGTGTCTCCTTTTCTCCAGCCCCTATGTATGGCTACAACGGATTGACTGGTCCTCCT 2986 || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 2905 CCAGGTGTCTCCTTTTCTCCAGCTCCTATTTATGGCTACAACGGAATGAGTGGTCCTCCT 2964 Query 2987 GGTTTGTCAATGTCATCACCCATGTATGTTCCTGGAACTGCTATTCCATACATGGTGGAT 3046 ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2965 GGTTTGTCAATGTCATCGCCAATGTATGTTCCTGGAACTGCTATTCCATACATGGTGGAT 3024 Query 3047 TCAAGAGGTACCCCAGTGATGATGCCGCAAATAATCGGATC-AGCGCCGTATGTGCAGCC 3105 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| Sbjct 3025 TCAAGAGGTACTCCAGTGATGATGCCGCAAATAATCGGATCGACC-CCGTATGTGCAGCC 3083 Query 3106 ACCATTCCCTCAACAACACATGTTCATGAGCTTGGCGGGTGGATCGCCTAGTACGAATGG 3165 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct 3084 ACCATTCCCTCAACAACACATGTTCATGAGCTTGGCGGGTGGATCCCCTAGTATGAATGG 3143 Query 3166 ATCAATGCGGCCAAACTTTGATCAGAACTCTGGGTTTGGACTTGAGATAGGAAACAGAGA 3225 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3144 ATCAGTGCGGCCAAACTTTGATCAGAACTCTGGGTTTGGACTTGAGATAGGAAACAGAGA 3203 Query 3226 GTCGCTAAATTTGAGGCAGTTTCTATCACCTTCACAAAGCGGGGCTATGGGAGAGCATTC 3285 |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3204 GTCGATAAATTTGAGGCAGTTTCTATCGCCGTCACAAAGCGGGGCAATGGGAGAGCATTC 3263 Query 3286 AGGAGCAAATGTAGAGCCCTCATCGAGTTCTTCTATCAGCATTGGTGGAAAGCGAAAAGA 3345 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3264 GGGAGCAAATGTAGAGCCCTCATCGAGTTCGTCTATTAGCATTGGTGGAAAGCGAAAAGA 3323 Query 3346 GCCGGAGCCACGTTGGGAGTTTCCTCCATGGAGGTGAGTGATCTACAAAGTGGTGGAGAT 3405 ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| Sbjct 3324 GCCGGAGACACGGTGGGAGTTCCCTCCATGGAGGTGAGTGATGTACAA-GTGGTGGGGAT 3382 Query 3406 GGGTTCTTGAATAGGTTGATGAATTGATTGATTGGTCAAAGGATGATGACAAGTGTTTTG 3465 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3383 GGGTTCTTGAATAGGTTGATGAATTGATTGATTGGTCAAAGGATGATGACAAGTGTT--G 3440 Query 3466 AGGTAACTTATAAAGTG-TCTTGCTGAACttttc-cttcttttttttttatttcctcagt 3523 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||| | ||| |||| Sbjct 3441 AGGTAACTTATAAAGTGGTCTTGCTGAACTTTTCTCT-CAGTTTTCCCT-TTT--TCAGG 3496 Query 3524 tttcccatttttcaggttttttattttatttcATAACATATAGGAGGATTAGTTCAAACA 3583 ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3497 TTT----TTTT--A--TTTT--ATTTTATTTCATAACATATAGGAGGATTAGTTCAAACA 3546 Query 3584 TT-GGTATATGTCAAGCTTCTTTTT-AACCTTGTTGGGTTTTTCTCCATAAATAAATATA 3641 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3547 TTTGGTATATGTCAAGCTTCTTTTTTAACCTTGTTGGGTTTTTCTCCATAAATAAATATA 3606 Query 3642 TAGTTTTAAGATACAG 3657 |||||||||||||||| Sbjct 3607 TAGTTTTAAGATACAG 3622 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 138377335428 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5