BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G24610.2
Length=3908
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg492382 jgi|Araly1|492382|fgenesh2_kg.7__1815__AT4G24610.1 3740 0.0
> Ahg492382 jgi|Araly1|492382|fgenesh2_kg.7__1815__AT4G24610.1
Length=3668
Score = 3740 bits (2025), Expect = 0.0
Identities = 2172/2242 (97%), Gaps = 14/2242 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1665 GGCTGAGAAACTTCGCTGGTGGTCTGTTTTTCGTGAGCCAGAACATCAACATGTGGGAAA 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 GGCTGAGAAACTTCGCTGGTGGTCTGTTTTTCGTGAGCCAGAACATCAACATGTGGGAAA 1490
Query 1725 ACTCCAGCTCTATATTGACTATTCAGCAAGTTTTGATGATAACAGCCATTTGAAGTGTGC 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 ACTCCAGCTCTATATTGACTATTCAGCAAGTTTTGATGATAACAGCCATTTGAAGTGTGC 1550
Query 1785 TTCTGTTGCGGAAACAGTCGCATATGACCTAGTCCTGGAAGTGGCCTTGAAAATGCAGCG 1844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TTCTGTTGCGGAAACAGTCGCATATGACCTAGTCCTGGAAGTGGCCTTGAAAATGCAGCG 1610
Query 1845 ATTTCAGCAAAGAAACTTGTTGTTATATGGTTCATGGAAATGGCTTTTGGAAGAATTTGC 1904
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 GTTTCAGCAAAGAAACTTGTTGTTATATGGTTCATGGAAATGGCTTTTGGAAGAATTTGC 1670
Query 1905 CACCTACTATGGGATTTCAGATGTCTACACCAAGCTCAGATACTTGTCCTATGTAATGGA 1964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 CACCTACTATGGGATTTCAGATGTCTACACCAAGCTCAGATACTTGTCCTATGTAATGGA 1730
Query 1965 TGTCGCTACACCGACTTCCGACTGTCTCCATTTGGTACATGACTTGTTAACACCTGTCAT 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 TGTCGCTACACCGACTTCCGACTGTCTCCATTTGGTACATGACTTGTTAACACCTGTCAT 1790
Query 2025 CATGAAGGGAAATGGCAAGAGCGCCTTGAGTCATCAAGAGAATCGGATCTTGAATGAAAT 2084
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 AATGAAGGGAAATGGCAAGAGCGCCTTGAGTCATCAAGAGAATCGGATCTTGAATGAAAT 1850
Query 2085 CAAGGACCAGATCGAGCAGATTCTAAAACTGGTCTTTGAGAATTACAAATCTCTTGACGA 2144
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAAGGACCAGATCGAGCAGATTCTGAAGCTGGTCTTTGAGAACTACAAATCTCTTGACGA 1910
Query 2145 GTCGTCATTTTCTGGAATGATTGATGTGGTCAATTCTGCGTCAGGTGTTCCAGCGCCAGC 2204
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1911 GTCATCATTTTCTGGAATGATTGATGTGGTCAGTTCTGCATCAGGGGTTCCAGCGCCAGC 1970
Query 2205 ACTCATTCCTGCTGTGAAATTGTACACGCTTCTGCACGATGTCTTATCACCCGAGGATCA 2264
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 ACTCACTCCTGCTGTTAAATTGTACACGCTTCTGCACGATGTCTTATCACCCGAGGATCA 2030
Query 2265 GACTCATCTTTGTCATTATTTCCAGGCAGCAGCAAAGAAGAGATCTAGAAGGCACATGGG 2324
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 GACTAATCTTTGTCATTATTTTCAGGCAGCAGCAAAGAAGAGATCTAGAAGGCACATGGG 2090
Query 2325 TGAGACAGATGAGTTTGTTGCAAACAACAGCGAGCCCAATTTTTGGGATATGTCTGCAAT 2384
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2091 TGAGACAGATGAGTTTGTTGCAAACAATAGTGAGCCCAATTTTTGGGATACGTCTGCAAT 2150
Query 2385 GTCGGCTGCATACCAGAAAATGACAATGGCCTGCAAGAATGTAAAGAATGAGATCTATAC 2444
||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2151 GTCAGCTGCTTACCAGAAAATGACAATGGTCTGCCAGAATGTAAAGAATGAGATCTACAC 2210
Query 2445 TGATATTGAGATCCAAAATGAAGATATACTTCCCAGCTTTCTTGACCTTCCAAACCTGTC 2504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 TGATATTGAGATCCAAAATGAAGATATACTTCCCAGCTTTCTTGACCTTCCAAACCTGTC 2270
Query 2505 AGCGTCTATATATAGCACTGATCTCTGTAATAGACTTCGAGCATTTCTCGTTGCTTGTCC 2564
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2271 AGCGTCAATATATAGCACTGATCTCTGTAATAGACTTCGAGCATTCCTCGTTGCATGTCC 2330
Query 2565 GCCCTCTGGCCCTTCACCAACAGTTGCAGAGCTCGTGATTGCAACTGCAGACTTTCAACG 2624
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2331 ACCCTCTGGCCCTTCACCAACAGTTGCAGAGCTTGTGATTGCTACTGCAGACTTTCAACG 2390
Query 2625 TGATCTTTCCAGCTGGAACATTAGTCCTATCCAAGGCGGTGTTGATGCAAAAGAGTTGTT 2684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 TGATCTTTCCAGCTGGAACATTAGTCCTATCCAAGGCGGTGTTGATGCAAAAGAGTTGTT 2450
Query 2685 TCATCTATATATCATGATTTGGATTCAAGATAAACGCCTTTCATTACTTGAGTCCTGCAA 2744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2451 TCATCTATATATCATGATTTGGATTCAAGATAAACGCCTTTCATTACTTGAGTCCTGCAA 2510
Query 2745 ACTTGATAAGCAGGTAAAATGGTCTGGAGTCAGGACACAGCATTCAACAACTCCATTCGT 2804
|||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2511 ACTTGATAAG--GTTAAA-TGGTCTGGAGTCAGGACACAGCATTCAACAACCCCATTTGT 2567
Query 2805 TGATGAAATGTACAAGAGGCTGAACGAAACCATTCAAGACTATCAAGTTATCATTTCCAG 2864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2568 TGATGAAATGTACAAGAGGCTGAACGAAACCATTCAAGACTATCAAGTTATCATTTCCAG 2627
Query 2865 ATGGCCAGAATATATCTTTGTTCTGGAGAGTGCCATTGCTGATGTTGAAAAGGCAACAGT 2924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2628 ATGGCCAGAATATATCTTTGTTCTGGAGAGTGCCATTGCTGATGTTGAAAAAGCAACTGT 2687
Query 2925 GGAAGCTCTGGAGAAGCAGTATGCAGATGTCTTATCACCTCTCAAAGAAAACTTGGCTCC 2984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2688 GGAAGCTCTGGAGAAGCAGTATGCAGATGTCTTATCACCTCTCAAAGAAAACTTGTCTCC 2747
Query 2985 aaaaaaaCTAAGCTTCAAGTATGTCCAAAAACTGACCAAAAGATCTGTGATTCCATATGT 3044
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2748 AAAAAAACTAAGCTTCAAGTATGTCCAAAAACTGACCAAAAGATCTGTGATTCCATATAT 2807
Query 3045 AGTCCCGGATGAGCTGGGCATTCTATTAAACTCCATGAAGAGGATGCTTGATGTTCTACG 3104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 AGTCCCGGATGAGCTGGGCATTCTATTAAACTCCATGAAGAGGATGCTTGATGTTCTACG 2867
Query 3105 GCCTAATATAGAGGCTAAATTTAAAGCATGGTCTTCATGCATTCCTGATGGTGGGAATGC 3164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868 GCCTAATATAGAGGCTAAATTTAAAGCATGGTCTTCATGCATTCCTGATGGTGGGAATGC 2927
Query 3165 AGCTCCTGGTGATCGTCTTTCTGAGGTGACAGTGATGCTCAGAGCCAAGTTTCGTAGTTA 3224
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2928 TGCTCCTGGTGATCGTCTTTCTGAGGTGACAGTGATGCTCAGAGCCAAGTTTCGTAGTTA 2987
Query 3225 CCTTCAGGCTGTGGTCGAAAAACTTGTAGAAAATAGCAAGCTACAAAAAACGACAATGTT 3284
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2988 CCTTCAGGCTGTGGTCGAAAAGCTTGTAGAAAATAGCAAGCTACAAAAGACGACAATGTT 3047
Query 3285 GAAGAAGATTCTTCAGGACTCTAAAGAAAGTGTTGGAGAATCAGACATCAGAAGCAAAAT 3344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3048 GAAGAAGATTCTTCAGGACTCTAAAGAAAGTGTTGGAGAATCAGACATCAGAAGCAAAAT 3107
Query 3345 GAATAACCTCAAGGAGCAGCTCACCAACACAGTGAATCATCTACACTCGGTTTGTGAGAC 3404
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 GAATAACCTCAAGGAGCAGCTCACCAACACAGTGAATCATCTACACTCGGTTTGTGAGAT 3167
Query 3405 GCATGTCTTCATCGCATTGTCTAGAGGATATTGGGATCGTATGGGACAG--A--T-T-GT 3458
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | | ||
Sbjct 3168 GCATGTCTTCATCGCATTGTCTCGAGGATATTGGGATCGTATGGGGCAGGTAACTATTGT 3227
Query 3459 TTTAAGCTTTTTGGAGAACAGGAAAGAGAACAGAGCTTGGTACAAGGGTTCTAGAGTTGC 3518
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3228 TTTAAGCTTTTTGGAGAACAGGAAAGAGAATAGAGCTTGGTACAAGGGTTCTAGAGTTGC 3287
Query 3519 TGTCTCGATATTAGACGATACATTTGCAGCACAGATGCAACAGCTGCTTGGCAACTCGCT 3578
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3288 TGTCTCGATATTAGACGATACATTTGCAGCACAGATGCAACAGCTGCTTGGCAACTCGTT 3347
Query 3579 AAGAGAGCAAGACCTGGAGCCTCCGAGATCGATCATGGAGGTCCGGTCGATTCTTTGCAA 3638
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3348 AAGAGAGCAAGACCTGGAGCCTCCTAGATCGATCATGGAGGTTCGGTCGATTCTTTGCAA 3407
Query 3639 GGACCCTGCAGATAATAAAGCCAAATCGTTCTACTACTGAGCACCTTAACAGCTAAAAAT 3698
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3408 GGACACTGCAGATAATAAAGCCAAGTCGTTCTACTACTGAGCATCTTAACAGCTAAAAAT 3467
Query 3699 GCTTGAAAGATTTCAGATCTCATTTGCTCGTCTGCTTGAAGCTTCAAGTATTTT-ACTTG 3757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
Sbjct 3468 GCTTGAAAGATTTCAGATCTCATTTGCTCGTCTGCTTGAAGCTGCAAGTATTTTTACTGG 3527
Query 3758 GTGGAGCAAATCGTGGAAACCTTGAGAAAGCTTTAGATGTATAAGAAAGTACAATGGGTA 3817
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 3528 GTGGAGCAAATCGACGAAACCTTGAGAAAGCTTTAGATGTATAATAAAGTACAATGGTTA 3587
Query 3818 CCACATCTTTCTTTAGTGCTAATCAAATGTCAATATATTACAA---GACTGGCATCACAT 3874
||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3588 CCACATCTTTCTTTAGTGCTAATGAA-TCTCAATATATTACAACAAGACTGGCATCACAT 3646
Query 3875 CTGATACGAATTGTAATAAGAG 3896
|||||||||||||| |||||||
Sbjct 3647 CTGATACGAATTGTGATAAGAG 3668
Score = 1729 bits (936), Expect = 0.0
Identities = 978/999 (98%), Gaps = 0/999 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 667 CAGGAGTTTGATGAGACGTTTTCTTCTGAAGAAGTAAGCGATATTCCCAGTGCCCCTCCA 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 CAGGAGTTTGATGAGACGTTTTCTTCTGAAGAAGTAAGCGATATTCCCAGTGCCCCTCCA 456
Query 727 TTTTCCGGGGCAGCAGAGGAATCTGAAGAAATTAAACCAGCAACTTCAAGCGTTCAAGTT 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457 TTTTCCGGGGCAGCAGAGGAATCTGAAGAAATTAAACCAGCAACTTCAAGCGTTCAAGTT 516
Query 787 TCAGAAGTCAAAACAGGAGATTGTGTAGAAAGTAGAAAGACTGGCCACTTTACTAGACCT 846
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 TCAGAAGTCAAAACAGAAGATTGTGTAGAAAGTAGAAAGACTGGCCACTTTACTAGACCT 576
Query 847 AGTGCAGCTTCTGAGTCATCTGGGCCACCTGATCAACATCCAGCTCGGCTTCCTACTTTT 906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 577 AGTGCAGCTTCTGAGTCATCTGGGCCACCTGATCAACATCCAGCTCGGCTTCCAACTTTT 636
Query 907 CATGCAAGTTCTCGTGGGCCATGGCATGCTGTGGTTTCCTATGATGCATGTGTACGACTT 966
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 CATGCAAGTTCTCGTGGGCCATGGCATGCCGTGGTTTCCTATGATGCATGTGTACGACTT 696
Query 967 TGTCTGCATGCGTGGTCAACCGGTTGCATGGAGGCTCCCATGTTTTTGGAAAATGAGTGT 1026
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 TGTCTGCATGCATGGTCAACGGGTTGCATGGAGGCTCCCATGTTTTTGGAAAATGAGTGT 756
Query 1027 GCTCTTCTACGAGAAGCATTTGGGTTGCAGCAACTCCTTTTGCAATCAGAGGAAGAGCTT 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||
Sbjct 757 GCTCTTCTACGAGAAGCATTTGGGTTGCAGCAACTCCTTTTGCAATCGGAGGAGGAGATT 816
Query 1087 CTGGCAAAGCGATCTTCACAAGCTCCGCACGAAGGAGTTGCACCAAAACCCAAGAAAAAC 1146
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 817 CTGGCAAAGCGATCTTCACAAGCTCCGCACGAAGGAGTTGCACCAAAATCCAAGAAAAAC 876
Query 1147 ATTGGCAAAATGAAGGTGCAAGTACGACGTGTTAAAACAGTTATGGATGGTCCAACCGGC 1206
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 877 ATTGGCAAAATGAAGGTGCAAGTACGACGTGTTAAAACAGTTATGGATGGTCCAACTGGC 936
Query 1207 TGTAGTATATCATCTTTGAAACCATCGTTGATAAAGTTTGAGAAAATCCGGATTCACTTT 1266
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 TGTAGTATATCATCTTTGAAGCCATCATTGATAAAGTTTGAGAAAATCCGGATTCACTTT 996
Query 1267 TCCAATATGTCAACACGCTTATTTTCTGGATGGCGGGCTCTAAGGAAGATCCATGTCCGT 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 TCCAATATGTCAACACGCTTATTTTCTGGATGGCGGGCTCTAAGGAAGATCCATGTCCGT 1056
Query 1327 GTACCAGCCAATGGTTCTTCTCTTCCTCGTCAAAGTCTGGCATATGTTCATGCCAGTACA 1386
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1057 GTACCAGCCAATGGCTCTTCTCTTCCTCGTCAAAGTCTGGCATATGTACATGCCAGTACA 1116
Query 1387 CAGTACTTAAAACAAGTTTCTGGTCTCCTGAAAACCGGTGTCACAAGTCTACGTAATAAT 1446
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 CAGTACTTAAAACAAGTTTCTGGTCTCCTGAAAACTGGTGTCACAAGTCTACGTAATAAT 1176
Query 1447 TCAACATCTTATGATATTGTACAAGAAACATACTCGTGTAAGTTAAGATTGAAAAGCTTA 1506
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 TCAACGTCTTATGATGTTGTACAAGAAACATACTCTTGTAAGTTAAGATTGAAAAGCTTA 1236
Query 1507 GCTGAAGATAACGCCATTATGATGCAACCCGGATCTGGTGAAAGCCATGTTTTCTTTCCT 1566
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 GCTGAAGATGACGCCATTATGATGCAACCCGGATCTGGTGAAAGCCATGTTTTCTTTCCT 1296
Query 1567 GATAGTCATGGAGATGATCTGATTGTTGAGATCCTGGATCCAATGGGGAAGGATTTTGGG 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 GATAGTCATGGAGATGATCTGATTGTTGAGATCCTTGATCCAATGGGGAAGGATTTTGGG 1356
Query 1627 CGTGTACTTGTGCAACTAGCTAATATTTCTGAAGATTCG 1665
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1357 CGTGTGCTTGTGCAACTAGCTAATATTTCTGAAGATTCG 1395
Score = 619 bits (335), Expect = 4e-176
Identities = 379/400 (95%), Gaps = 3/400 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 211 ATGATCCCCAACGGAGAATTGAGATTACCTGCTCTCAAGGTCCGTGAAGACCGCGTGTCA 270
|||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1 ATGATCCCCAACGGAGAATTGAGATTGCCAGCTCCCAAGGTCCGTGATGGCCGCGTGTCT 60
Query 271 CCCTCAGCTCCTATTCCGGTCACCAGAACCCTAGTGGCTGATACTGACGTCACTTCCGAT 330
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 61 CCCTCAGCTCCTATTCCGGTCACCAGAACCCTCGTGGCCGATACTGACGCCACTTCCGAT 120
Query 331 ---GACGATATGAGTACAAATTCCGAGGATGTCTCTCTCGATTCGTCTCCCGAGAACAGT 387
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GACGACGATATGAGTACAAATTCCGAGGATGTCTCTCTCGATTCGTCTCCCGAGAACAGT 180
Query 388 AGAGTGTCCAGTGCCGTTGGTCGCAGCTACGGGAGAAATTCTTCTTATTATACTTACTCC 447
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 AGAGTGTCCAGTGCCGTTGGTCGCAGCTACGGAAGAAATTCTTCTTATTATACATACTCC 240
Query 448 GAGGTGAGCTCATCAAGAGAGACTTTGGTCGGTGCGCGCGAACAGACGGGACCTAGATTT 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GAGGTGAGCTCATCAAGAGAGACTTTGGTCGGTGCACGCGAACAGACGGGACCTAGATTT 300
Query 508 GATGGTGATACGGAGGAAGATGAATCCACCGATTCAGCTTCTAGCACGCAATTTTCTCCG 567
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 301 GATGGTGATACGGAGGAGGATGAATCCACCGATTCAGCTTCTAGCTCGCAATTTTCTCCG 360
Query 568 CCGCCGGCAGCTGGGAGGATTAACGACGGCGTATCTCAGG 607
|||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct 361 CCGCCGGCAGCTGGAAGGATTAATGGCGGCGTACCTCAGG 400
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 147701440813
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5