BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G31210.1
Length=4183
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg353700 jgi|Araly1|353700|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000873 2311 0.0
> Ahg353700 jgi|Araly1|353700|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000873
Length=3978
Score = 2311 bits (1251), Expect = 0.0
Identities = 1297/1320 (98%), Gaps = 0/1320 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1755 GAGCTGAAAATCTGATTCTTGCATCGGACCCAGATCGTGAAGGAGAGGCAATTGCCTGGC 1814
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814 GAGCTGAAAATCTGATTCTTGCATCGGATCCAGATCGTGAAGGAGAGGCAATTGCCTGGC 1873
Query 1815 ACATTATAGAGATGTTGCAGCAGCAGGGTGCCTTACATGAAAGTATGACAGTAGCAAGGG 1874
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1874 ACGTTATAGAGATGTTGCAGCAGCAGGGTGCCTTACATGAAAGTATGACAGTAGCAAGGG 1933
Query 1875 TTGTATTCCATGAGATAACTGAATCAGCAATAAAAAGTGCACTTCAATCTCCACGAGAAA 1934
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1934 TTGTTTTCCATGAGATAACTGAATCAGCAATAAAAACTGCACTTCAATCTCCACGAGAAA 1993
Query 1935 TCGACGGGGACTTGGTGCATGCTTATCTTGCACGGCGTGCTCTTGATTATCTCATCGGAT 1994
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 TTGACGGGGACTTGGTGCATGCTTATCTTGCACGACGTGCTCTTGATTATCTCATCGGAT 2053
Query 1995 TCAATATTTCACCACTACTATGGAGGAAACTTCCGGGTTGCCCGTCAGCTGGGCGGGTCC 2054
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054 TTAATATTTCACCACTACTTTGGAGGAAACTTCCGGGTTGCCCGTCAGCTGGGCGGGTCC 2113
Query 2055 AGTCTGCTGCTTTGGCTCTTGTATGTGATAGAGAAAGTGAAATTGATGGATTTAAGCCTC 2114
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2114 AGTCTGCTGCTTTGGCTCTTGTATGTGATAGAGAAAGTGAAATTGACGGATTTAAGCCTC 2173
Query 2115 AGGAGTACTGGACTGTAGGAATCAAAGTGAAAGGGAAAGATAATTCAGCCACCTTTTCTG 2174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2174 AGGAGTACTGGACTGTAGGAATCAAAGTGAAAGGGAAAGATAATTCAGCCACCTTTTCTG 2233
Query 2175 CTCACTTGACCAGTTTAAATTCAAAAAGATTAAATCAGCTTTCTATCAGCTCTGAAGCAA 2234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2234 CTCACTTGACCAGTTTAAATTCAAAAAGATTAAATCAGCTTTCTATCAGCTCTGAAGCAA 2293
Query 2235 ATGCACAGGACATTGAGCAAAGGATCAAATCAGAAGGTTTTCTAGTGAAGGGCACTAAAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 ATGCACAGGACATTGAGCAAAGGATCAAATCAGAAGGTTTTCTAGTGAAGGGCACTAAAA 2353
Query 2295 CAAGTACTACACGGAAGAATCCGCCAACTCCGTACATAACATCAACCCTTCAGCAGGATG 2354
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 CAAGTACTACACGGAAGAATCCACCAACTCCGTACATAACATCAACCCTTCAGCAGGATG 2413
Query 2355 CTGCTAACAAATTACATTTTTCAACAGCACATACCATGAAGCTCGCTCAAAAATTATATG 2414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 2414 CTGCTAACAAATTACATTTTTCAACAGCACATACCATGAAGCCCGCTCAAAAACTATATG 2473
Query 2415 AGGGTGTCCAACTGTCCGATGGTAAATCAGCTGGTCTTATAACATACATGCGGACAGATG 2474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2474 AGGGTGTCCAACTGTCCGATGGTAAATCAGCTGGTCTTATAACATACATGCGGACGGATG 2533
Query 2475 GTTTACATATAGCTGATGAAGCTATCAAAGATATACAGTCCTTGGTGGCAGAAAGGTATG 2534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2534 GTTTACATATAGCTGATGAAGCTATCAAAGATATACAGTCCTTGGTGGCAGAAAGGTATG 2593
Query 2535 GGAAGAATTTTACATCAGATAGTCCTCGTAAATATTTTAAAAAGGTTAAGAACGCTCAGG 2594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2594 GGAAGAATTTTACATCAGATAGTCCTCGTAAATATTTTAAAAAGGTTAAGAACGCTCAGG 2653
Query 2595 AGGCCCATGAAGCTATTAGACCTACTGATATACGTAGATTACCGTCAACGATTGCTAGCC 2654
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2654 AGGCCCATGAAGCTATTAGACCTACCGATATACGTAGATTACCGTCAACGATTGCTAGCC 2713
Query 2655 TGCTTGATGCGGATTCTCTAAAATTATATACCTTGATATGGTCACGAGCTGTGGCATGTC 2714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2714 TGCTTGATGCGGATTCTCTAAAATTATATACCTTGATATGGTCACGAGCTGTGGCATGTC 2773
Query 2715 AAATGGAGCCTGCTTCCATTGCGCAGATACAACTTGATATTGGCAATGCCTCTGAATCCA 2774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2774 AAATGGAGCCTGCTTCCATTGCGCAGATACAACTTGATATTGGAAATGCCTCTGAATCCA 2833
Query 2775 TCATCTTCAGATCATCATGCTCAAAAGTTGAATTCCTTGGGTACCAGGCAGTTTACGAGG 2834
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2834 TCATCTTCAGATCATCATGCTCAAAAGTCGAATTCCTTGGATACCAGGCAGTTTACGAGG 2893
Query 2835 ATCCTGAAGCTAAGGCAATCAAAAATAACGATAATGATCAGAGTAGTGAGCGTGAGGAAA 2894
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2894 ATCCTGAAGCTAAGGCAATCAAAAATAAAGACGGTGATCAGAGTAGTGAGCGTGAGGAAA 2953
Query 2895 CTTTTAAAACTCTCAGTTCGTTGAAGGATGGAGATTTGCTACAGATTGGTGAAGTGGAGC 2954
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954 CTTTTAAAACTCTCAGTTTGTTGAAGGATGGAGATTTGCTACAGATTGGTGAAGTGGAGC 3013
Query 2955 TCAAGCAGCACCATACTCAGCACCCACCACGCTATTCTGAGGGCTCTCTGGTTAAAAAGC 3014
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3014 TCAAGCAGCACCATACTCAGCACCCACCACGCTATTCTGAGGGCTCTCTGATTAAAAAGC 3073
Query 3015 TCGAGGAGCTCGGGATAGGTAGACCCTCGACATATGCATCTATATTTAGGGTTTTACAGC 3074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3074 TCGAGGAGCTCGGGATAGGTAGACCCTCGACATATGCATCTATATTTAGGGTTTTACAGC 3133
Score = 1367 bits (740), Expect = 0.0
Identities = 813/848 (96%), Gaps = 6/848 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3135 TTTCAGCTTTTCTTACCCACTACTTTACTGAGATCACAGACTATAGTTTCACTGCGGATA 3194
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3134 TTTCAGCTTTTCTTACCCACTACTTCACTGAGATCACAGACTATAGTTTCACTGCTGATA 3193
Query 3195 TGGAGACTGAGCTTGATAACGTTTCTGGTGGTGTAACTGAATGGAAAGGTCTCCTAAGAG 3254
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3194 TGGAGGTTGAGCTTGATAATGTTTCTGGTGGTGTAACTGAATGGAAAGGTCTCCTAAGAG 3253
Query 3255 ACTACTGGACACGATTCAGCGCATATTGTAAACGTGTTGAAAATGTCCAACGCTC-ACAG 3313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3254 ACTACTGGACACGATTCAGCGCATATTGTAAACGTGTTGAAAATGTCCAACGC-CAACAG 3312
Query 3314 GTGGAAAAAATGTTGGAAAAGAAATATGAGGACGTTCTGTTTTCTTTGCTTCCTTATCCC 3373
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3313 GTGGAGAAAATGTTGGAAAAGAAATATGAGGACTTTCTGTTTTCTTCCCTTCCTTATCCC 3372
Query 3374 AGTAGGACATGCCCGAGTTGTATGGAAGGCACCTTAAGTTTCAAAGCAAGTAAGTTTGGT 3433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3373 AGTAGGACATGCCCGAGTTGTATGGAAGGCACCTTAAGTTTCAAAGCAAGTAAGTATGGT 3432
Query 3434 GCGGGGTATTTCATCGGTTGTGATCAGCACCCTTCATGCAAGTTCATTGCTAAAACGCTT 3493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3433 GCGGGGTATTTCATCGGTTGTGATCAGCACCCTTCATGCAAGTTCATTGCTAAAACGCTT 3492
Query 3494 TATGGAGAGGATGAAGATGAAGATGATCCTCCAAAGAATAACTGCGTAGAAGAGCCCAAA 3553
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3493 TATGGAGAGGATGAAGATGAAGATGATCCTCCAAAGAATACCTGCGTAGAAGAGCCCAAA 3552
Query 3554 TTGCTGGGTCTTCATCCCAATACCAGTGAGAAGGTTATTCTAAAGTGTGGACCCTATGGG 3613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 3553 TTGCTGGGTCTTCATCCCAATACCAGTGAGAAGGTTATTTTAAAGTGTGGCCCCTATGGG 3612
Query 3614 CATTATGTACAGCTCGGTGAAGATAAAAAAGGGCACACACCAAAACGAGCAAATGCGGCC 3673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3613 CATTATGTACAGCTCGGTGAAGATAAAAAAGGGCACACACCAAAACGAGCAAATGCGGCC 3672
Query 3674 CATATAAAGGATGTGAACTCCATTACGCTTGAAAGTGCTCTCGAATTATTACGCTATCCT 3733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3673 CATATAAAGGATGTGAACTCCATTACGCTTGAAAGTGCTCTCGAATTATTACGCTATCCT 3732
Query 3734 TTGACACTGGGAACCCACCCTGA-AGATGGACAGCCTGTGGTCTTGAAG-CTTAGTAAAT 3791
||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3733 TTGACACTGGGAAACCACCCT-ATAGATGGACATCCTGTGGTCTT-AAGGCTTAGTAAAT 3790
Query 3792 CTGGATTTACTATTAAACATCGCCGCAATATGGCTACTGTTCCAAAGAACACGGAACCAG 3851
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3791 CTGGATTTACTATTAAACATCGCTGCACTATGGCTACTGTTCCAAAGAACACGGAACCAG 3850
Query 3852 GTGAGGTTACTTTAGAGAGAGCAATGAAGCTCTTGTCTGGCAAAAATGTGAGAAAAAGTG 3911
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||
Sbjct 3851 GTGAGGTTACTTTAGAGAAAGCAATGAAGCTCTTGTCTGGCAAAAATGCGAGACATAGTG 3910
Query 3912 GCAGACCTCCTAAGAGTATACTGCCTGAGGAAGAGAAAGGAGATGAAGAAGTTGTGGTAG 3971
||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 3911 GCAGACCACCTAAGGGTATCCAGCCTGAGGAAGAGAAAGGAGAGGAAGAAGTTGCGGTAG 3970
Query 3972 CGATATAA 3979
||| |||
Sbjct 3971 TGATGTAA 3978
Score = 1182 bits (640), Expect = 0.0
Identities = 798/868 (92%), Gaps = 35/868 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 125 ATGCAGAGAACCATCTCACTTGCGGCTGCTAAG---TCTTCTTCTTCGACTTCAGTTCTG 181
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAGAGAACCATCTCACTTGCGGCTGCTAAGTCTTCTTCTTCTTCGACTTCAGTTCTG 60
Query 182 TCTCTTCATCCTCTCATGGCT-A-----AGTTGCAGTGCAGGGCGATTCAAAATTTCCCA 235
||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 61 TCTCTTCGTCCTCTCATGGCTAAGTTGCAGTTGCAGTGCAGGGCGATTCAGAATTTCCCA 120
Query 236 GCTTCCTCTTCCTCTTCAGTAGTTCGGGTCGATAGAGTGTATAGAAATGTATCCCAGCTT 295
|||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 121 GCTTACTCTTCCTCTTCACTAGTTCAGGTCGATAGAGTGTATAGAAATGTATCACAGCTT 180
Query 296 CAGTTTAAAAGAGAAAATTCAAGTTGTCTTAAGTTAGCTTGTGCACTTCCTTCGCATCTA 355
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 181 CAGTTTAAAAGAGAAAATTCAAGCTGTCTTAAGTTAGCTTGTGCACTTCCTTCG---C-- 235
Query 356 AGTCTTCTCGGTTCTCTTAGTTATGCAACACATTGGAGCAGCTCCACTTCAAGGGCCTTT 415
| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 236 A----TCTCGGTTCCCTTAGTTATGCAACACATTGGAGCAGCTTCACTTCAAGGTCCTTT 291
Query 416 GGATATAGTTTCAGACCGTTTGCGAGGAGATATTTTTCTCAAGTCGCTAGTACT-GAGAT 474
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||
Sbjct 292 GGATATAGTTTCAGATCGTTTACGAGGAGATATATTTCTCAAGTCCCTAATACTGGA-AT 350
Query 475 TAAGGATAGCATTGTTGGTGGTGTTGAAAAGTTTGGTGGGAATAAAATAGGTTTCAAGAA 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 TAAGGATAGCATTGTTGGTGGTGTTGAAAAGTTTGGTGGGAATAAAATAGGTTTCAAGAA 410
Query 535 ATTCAATAAGAAGTGGAAGAAGCATAGGGTTTTGGCTTCCACAAAAGCTGAAGTGGTGGC 594
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 411 ATTTAATAAGAAGTGGAAGAAGCATAAGGTTTTGGCTTCCACAAAAGCTGATGTGGTGGC 470
Query 595 TTCTACTGAACCAGTTATTGGAGATGTTAACAGTGGCATCAAGGCGAAACTATCAACTGC 654
| | || | ||||| |||||||||||| || || |||||| | | |||||||
Sbjct 471 -T-T-CT--A-CAGTTGTTGGAGATGTTAGCATTGCCATCAA-G-G-------CAACTGC 515
Query 655 AGCTTCACCTGCTAGCAATGCTAAGCAAGCCTCTACTGTCAAAACAAAACGGCAGCCAAA 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 516 AGCTTCACCTGCTAGCAATGCTAAGCAAGCCTCTACTGTCAAAACAAAACGGCGGCCAAA 575
Query 715 GAGCAAGAAATTCGAAGATAAATCTTCTCCAACGGTATCGGTTTTGGAGACCGTCTCTGT 774
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 576 GAGCAAGAAAGTCGAAAATAAATCTTCTCCAACGGTATCGGTTTTGGAAACGGTCTCTGT 635
Query 775 AGACGAGAGTTTGCAAAGCTTTCCCAAGCCTAGACATTCGGGTTCCGGAAATCGGAAGTC 834
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 AGACGAGAGTTTGCAAAGCTTTCCCAAGCCAAGACATTCGGGTTCCGGAAATCGGAAGTC 695
Query 835 TTCATCTGCTGAGTACAGTTCTCAGAAGGAGGTGGTaaaaaaaaCCAATGTGGAGGGGCC 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 696 TTCATCTGCTGAGTACAGTTCTCAGAAGGAGGTGGCAAAAAATCCCATTGTGGAGGGGCC 755
Query 895 CAAAAGTTCTACTCCATCGAATTCCATGTCAGAACAACAGCATTGGACCTCAACAAAAGC 954
||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 CAAAAGTCCTACTCCATCAAATTCCATGTCGGAACAACAGCATTGGACCTCAACAAAAGC 815
Query 955 AAGCAATGCACCAAAACAGGAGCAGGAT 982
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 AAGCAATGCACCAAAACAGGAGCAGGAT 843
Score = 691 bits (374), Expect = 0.0
Identities = 388/395 (98%), Gaps = 0/395 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1347 AGAAGGAGGTGGCAAAAAATCACCCTGTGGAAGAGCCCAAAAGTCCTGCTCCATCAAATT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 AGAAGGAGGTGGCAAAAAATCACCCTGTGGAGGAGCCCAAAAGTCCTGCTCCATCAAATT 1372
Query 1407 CCAAGTCGGAACAACAGCATTTGAAGTCAACTAAAGCAAGTAAGGCACCAAAACAAAAGC 1466
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1373 CCAAGTCGGAACAACAGCATTTGAAGTCAACAAAAGCAAGTAAGGCACCAAAACAGAAGC 1432
Query 1467 TGGTTCCTCAACACATGAAAAACAGCATAGAACATCGAGGTCAAAATGCATCTAAACCGC 1526
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 TGGTTCCTCAACACATGAAAAACAGCATAGAGCATCGAGGTCAAAATGCATCTAAACCGC 1492
Query 1527 TTTATCCGCCAAGTGGAAAATCTGTTATTGTCGTTGAGTCAATGACAAAAGCAAAGATTA 1586
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1493 TTTATCCACCAAGTGGAAAATCTGTTATTGTCGTTGAGTCAATCACAAAAGCAAAGATTA 1552
Query 1587 TTCAGGGTTATCTTGGTGACATGTATGAGGTTTTGCCAAGTTATGGTCATATCAGGGACC 1646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 TTCAGGGTTATCTTGGTGACATGTATGAGGTTTTGCCAAGTTATGGTCATATCAGGGACC 1612
Query 1647 TGGCCACAAGGTCTGGTTCAGTGAGGCCAGATGACGATTTTAGCATGGTTTGGGAGGTTC 1706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 TGGCCACAAGGTCTGGTTCAGTGAGGCCAGATGACGATTTTAGCATGGTTTGGGAGGTTC 1672
Query 1707 CATCTTCCGCCTGGACTCATATTAAGAGCATTAAG 1741
||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1673 CATCTTCCGCCTGGACTCATATTAAGAGCATAAAG 1707
Score = 566 bits (306), Expect = 6e-160
Identities = 355/377 (94%), Gaps = 9/377 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 978 AGGATAACATTGTTGGTGGTGATGAGAAGGCTGGTGGGAATAAAGTAGGTTTCAAGAAAT 1037
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 893 AGGATAACATTGTTGGTGGTGATGAGAAGGCTGGTGGGAATAAATTAGGTTTCAAGAAAT 952
Query 1038 TTAACAAGAACCGAAAGAAGCATAATGTGTTGGCTTCCTCAGAAGCTGAAGTGGTGACTT 1097
|||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 953 TTAATAAGAACCAAAAGAAGCATAATGTTTTGGCTTCCTCGGAAGCTGAAGTGGTGACTT 1012
Query 1098 CTACTGAACCAGTTATTGGAGATGGTAGCAGTGGCATCAAGGCGGAACTATCCACGGCAG 1157
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 1013 CTACTGAACCAGTTATTGGAGATGGTAACAGTGGCATCAAGGCGGAACTATCAACAGCAG 1072
Query 1158 CCTCACCTGCTAG--C-A--A-TGGTAATCAAGCCACTACTGTCAAATCAAAACGGCGCC 1211
||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1073 CCTCACCTGCTAGTGCTAGCAATGGTAATCAAGCCACTACTGTCAAA--AAT-CGGCGCC 1129
Query 1212 CCAAGAACAAGAAAGTCGAAGATAAATCTTCTTCAGTGGTACCAGTTTTGGAGGCGGTCT 1271
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 CTAAGAACAAGAAAGTCGAAGATAAATCTTCTTCAGTGGGACCAGTTTTGGAGGCGGTCT 1189
Query 1272 CTCTAGATGAGAGTCCGATAAGCGTTCCCAAGCCAAAACATTCTGGTTCTGGAAATCGGA 1331
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1190 CTCTAGAAGAGAGTCCGATAAGCGTTCCCAAGCCAAAACATTCTGGTTCTAGAAATCGGA 1249
Query 1332 AGTCTTCATCTGCTAAG 1348
|||||||||||||||||
Sbjct 1250 AGTCTTCATCTGCTAAG 1266
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 158167273388
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5