BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G31210.1 Length=4183 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg353700 jgi|Araly1|353700|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000873 2311 0.0 > Ahg353700 jgi|Araly1|353700|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000873 Length=3978 Score = 2311 bits (1251), Expect = 0.0 Identities = 1297/1320 (98%), Gaps = 0/1320 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1755 GAGCTGAAAATCTGATTCTTGCATCGGACCCAGATCGTGAAGGAGAGGCAATTGCCTGGC 1814 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1814 GAGCTGAAAATCTGATTCTTGCATCGGATCCAGATCGTGAAGGAGAGGCAATTGCCTGGC 1873 Query 1815 ACATTATAGAGATGTTGCAGCAGCAGGGTGCCTTACATGAAAGTATGACAGTAGCAAGGG 1874 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1874 ACGTTATAGAGATGTTGCAGCAGCAGGGTGCCTTACATGAAAGTATGACAGTAGCAAGGG 1933 Query 1875 TTGTATTCCATGAGATAACTGAATCAGCAATAAAAAGTGCACTTCAATCTCCACGAGAAA 1934 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1934 TTGTTTTCCATGAGATAACTGAATCAGCAATAAAAACTGCACTTCAATCTCCACGAGAAA 1993 Query 1935 TCGACGGGGACTTGGTGCATGCTTATCTTGCACGGCGTGCTCTTGATTATCTCATCGGAT 1994 | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1994 TTGACGGGGACTTGGTGCATGCTTATCTTGCACGACGTGCTCTTGATTATCTCATCGGAT 2053 Query 1995 TCAATATTTCACCACTACTATGGAGGAAACTTCCGGGTTGCCCGTCAGCTGGGCGGGTCC 2054 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2054 TTAATATTTCACCACTACTTTGGAGGAAACTTCCGGGTTGCCCGTCAGCTGGGCGGGTCC 2113 Query 2055 AGTCTGCTGCTTTGGCTCTTGTATGTGATAGAGAAAGTGAAATTGATGGATTTAAGCCTC 2114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2114 AGTCTGCTGCTTTGGCTCTTGTATGTGATAGAGAAAGTGAAATTGACGGATTTAAGCCTC 2173 Query 2115 AGGAGTACTGGACTGTAGGAATCAAAGTGAAAGGGAAAGATAATTCAGCCACCTTTTCTG 2174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2174 AGGAGTACTGGACTGTAGGAATCAAAGTGAAAGGGAAAGATAATTCAGCCACCTTTTCTG 2233 Query 2175 CTCACTTGACCAGTTTAAATTCAAAAAGATTAAATCAGCTTTCTATCAGCTCTGAAGCAA 2234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2234 CTCACTTGACCAGTTTAAATTCAAAAAGATTAAATCAGCTTTCTATCAGCTCTGAAGCAA 2293 Query 2235 ATGCACAGGACATTGAGCAAAGGATCAAATCAGAAGGTTTTCTAGTGAAGGGCACTAAAA 2294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2294 ATGCACAGGACATTGAGCAAAGGATCAAATCAGAAGGTTTTCTAGTGAAGGGCACTAAAA 2353 Query 2295 CAAGTACTACACGGAAGAATCCGCCAACTCCGTACATAACATCAACCCTTCAGCAGGATG 2354 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2354 CAAGTACTACACGGAAGAATCCACCAACTCCGTACATAACATCAACCCTTCAGCAGGATG 2413 Query 2355 CTGCTAACAAATTACATTTTTCAACAGCACATACCATGAAGCTCGCTCAAAAATTATATG 2414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct 2414 CTGCTAACAAATTACATTTTTCAACAGCACATACCATGAAGCCCGCTCAAAAACTATATG 2473 Query 2415 AGGGTGTCCAACTGTCCGATGGTAAATCAGCTGGTCTTATAACATACATGCGGACAGATG 2474 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2474 AGGGTGTCCAACTGTCCGATGGTAAATCAGCTGGTCTTATAACATACATGCGGACGGATG 2533 Query 2475 GTTTACATATAGCTGATGAAGCTATCAAAGATATACAGTCCTTGGTGGCAGAAAGGTATG 2534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2534 GTTTACATATAGCTGATGAAGCTATCAAAGATATACAGTCCTTGGTGGCAGAAAGGTATG 2593 Query 2535 GGAAGAATTTTACATCAGATAGTCCTCGTAAATATTTTAAAAAGGTTAAGAACGCTCAGG 2594 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2594 GGAAGAATTTTACATCAGATAGTCCTCGTAAATATTTTAAAAAGGTTAAGAACGCTCAGG 2653 Query 2595 AGGCCCATGAAGCTATTAGACCTACTGATATACGTAGATTACCGTCAACGATTGCTAGCC 2654 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2654 AGGCCCATGAAGCTATTAGACCTACCGATATACGTAGATTACCGTCAACGATTGCTAGCC 2713 Query 2655 TGCTTGATGCGGATTCTCTAAAATTATATACCTTGATATGGTCACGAGCTGTGGCATGTC 2714 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2714 TGCTTGATGCGGATTCTCTAAAATTATATACCTTGATATGGTCACGAGCTGTGGCATGTC 2773 Query 2715 AAATGGAGCCTGCTTCCATTGCGCAGATACAACTTGATATTGGCAATGCCTCTGAATCCA 2774 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2774 AAATGGAGCCTGCTTCCATTGCGCAGATACAACTTGATATTGGAAATGCCTCTGAATCCA 2833 Query 2775 TCATCTTCAGATCATCATGCTCAAAAGTTGAATTCCTTGGGTACCAGGCAGTTTACGAGG 2834 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2834 TCATCTTCAGATCATCATGCTCAAAAGTCGAATTCCTTGGATACCAGGCAGTTTACGAGG 2893 Query 2835 ATCCTGAAGCTAAGGCAATCAAAAATAACGATAATGATCAGAGTAGTGAGCGTGAGGAAA 2894 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2894 ATCCTGAAGCTAAGGCAATCAAAAATAAAGACGGTGATCAGAGTAGTGAGCGTGAGGAAA 2953 Query 2895 CTTTTAAAACTCTCAGTTCGTTGAAGGATGGAGATTTGCTACAGATTGGTGAAGTGGAGC 2954 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2954 CTTTTAAAACTCTCAGTTTGTTGAAGGATGGAGATTTGCTACAGATTGGTGAAGTGGAGC 3013 Query 2955 TCAAGCAGCACCATACTCAGCACCCACCACGCTATTCTGAGGGCTCTCTGGTTAAAAAGC 3014 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3014 TCAAGCAGCACCATACTCAGCACCCACCACGCTATTCTGAGGGCTCTCTGATTAAAAAGC 3073 Query 3015 TCGAGGAGCTCGGGATAGGTAGACCCTCGACATATGCATCTATATTTAGGGTTTTACAGC 3074 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3074 TCGAGGAGCTCGGGATAGGTAGACCCTCGACATATGCATCTATATTTAGGGTTTTACAGC 3133 Score = 1367 bits (740), Expect = 0.0 Identities = 813/848 (96%), Gaps = 6/848 (1%) Strand=Plus/Plus Query 3135 TTTCAGCTTTTCTTACCCACTACTTTACTGAGATCACAGACTATAGTTTCACTGCGGATA 3194 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3134 TTTCAGCTTTTCTTACCCACTACTTCACTGAGATCACAGACTATAGTTTCACTGCTGATA 3193 Query 3195 TGGAGACTGAGCTTGATAACGTTTCTGGTGGTGTAACTGAATGGAAAGGTCTCCTAAGAG 3254 ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3194 TGGAGGTTGAGCTTGATAATGTTTCTGGTGGTGTAACTGAATGGAAAGGTCTCCTAAGAG 3253 Query 3255 ACTACTGGACACGATTCAGCGCATATTGTAAACGTGTTGAAAATGTCCAACGCTC-ACAG 3313 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 3254 ACTACTGGACACGATTCAGCGCATATTGTAAACGTGTTGAAAATGTCCAACGC-CAACAG 3312 Query 3314 GTGGAAAAAATGTTGGAAAAGAAATATGAGGACGTTCTGTTTTCTTTGCTTCCTTATCCC 3373 ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3313 GTGGAGAAAATGTTGGAAAAGAAATATGAGGACTTTCTGTTTTCTTCCCTTCCTTATCCC 3372 Query 3374 AGTAGGACATGCCCGAGTTGTATGGAAGGCACCTTAAGTTTCAAAGCAAGTAAGTTTGGT 3433 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3373 AGTAGGACATGCCCGAGTTGTATGGAAGGCACCTTAAGTTTCAAAGCAAGTAAGTATGGT 3432 Query 3434 GCGGGGTATTTCATCGGTTGTGATCAGCACCCTTCATGCAAGTTCATTGCTAAAACGCTT 3493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3433 GCGGGGTATTTCATCGGTTGTGATCAGCACCCTTCATGCAAGTTCATTGCTAAAACGCTT 3492 Query 3494 TATGGAGAGGATGAAGATGAAGATGATCCTCCAAAGAATAACTGCGTAGAAGAGCCCAAA 3553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3493 TATGGAGAGGATGAAGATGAAGATGATCCTCCAAAGAATACCTGCGTAGAAGAGCCCAAA 3552 Query 3554 TTGCTGGGTCTTCATCCCAATACCAGTGAGAAGGTTATTCTAAAGTGTGGACCCTATGGG 3613 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct 3553 TTGCTGGGTCTTCATCCCAATACCAGTGAGAAGGTTATTTTAAAGTGTGGCCCCTATGGG 3612 Query 3614 CATTATGTACAGCTCGGTGAAGATAAAAAAGGGCACACACCAAAACGAGCAAATGCGGCC 3673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3613 CATTATGTACAGCTCGGTGAAGATAAAAAAGGGCACACACCAAAACGAGCAAATGCGGCC 3672 Query 3674 CATATAAAGGATGTGAACTCCATTACGCTTGAAAGTGCTCTCGAATTATTACGCTATCCT 3733 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3673 CATATAAAGGATGTGAACTCCATTACGCTTGAAAGTGCTCTCGAATTATTACGCTATCCT 3732 Query 3734 TTGACACTGGGAACCCACCCTGA-AGATGGACAGCCTGTGGTCTTGAAG-CTTAGTAAAT 3791 ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 3733 TTGACACTGGGAAACCACCCT-ATAGATGGACATCCTGTGGTCTT-AAGGCTTAGTAAAT 3790 Query 3792 CTGGATTTACTATTAAACATCGCCGCAATATGGCTACTGTTCCAAAGAACACGGAACCAG 3851 ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3791 CTGGATTTACTATTAAACATCGCTGCACTATGGCTACTGTTCCAAAGAACACGGAACCAG 3850 Query 3852 GTGAGGTTACTTTAGAGAGAGCAATGAAGCTCTTGTCTGGCAAAAATGTGAGAAAAAGTG 3911 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| Sbjct 3851 GTGAGGTTACTTTAGAGAAAGCAATGAAGCTCTTGTCTGGCAAAAATGCGAGACATAGTG 3910 Query 3912 GCAGACCTCCTAAGAGTATACTGCCTGAGGAAGAGAAAGGAGATGAAGAAGTTGTGGTAG 3971 ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| Sbjct 3911 GCAGACCACCTAAGGGTATCCAGCCTGAGGAAGAGAAAGGAGAGGAAGAAGTTGCGGTAG 3970 Query 3972 CGATATAA 3979 ||| ||| Sbjct 3971 TGATGTAA 3978 Score = 1182 bits (640), Expect = 0.0 Identities = 798/868 (92%), Gaps = 35/868 (4%) Strand=Plus/Plus Query 125 ATGCAGAGAACCATCTCACTTGCGGCTGCTAAG---TCTTCTTCTTCGACTTCAGTTCTG 181 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGCAGAGAACCATCTCACTTGCGGCTGCTAAGTCTTCTTCTTCTTCGACTTCAGTTCTG 60 Query 182 TCTCTTCATCCTCTCATGGCT-A-----AGTTGCAGTGCAGGGCGATTCAAAATTTCCCA 235 ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 61 TCTCTTCGTCCTCTCATGGCTAAGTTGCAGTTGCAGTGCAGGGCGATTCAGAATTTCCCA 120 Query 236 GCTTCCTCTTCCTCTTCAGTAGTTCGGGTCGATAGAGTGTATAGAAATGTATCCCAGCTT 295 |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 121 GCTTACTCTTCCTCTTCACTAGTTCAGGTCGATAGAGTGTATAGAAATGTATCACAGCTT 180 Query 296 CAGTTTAAAAGAGAAAATTCAAGTTGTCTTAAGTTAGCTTGTGCACTTCCTTCGCATCTA 355 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 181 CAGTTTAAAAGAGAAAATTCAAGCTGTCTTAAGTTAGCTTGTGCACTTCCTTCG---C-- 235 Query 356 AGTCTTCTCGGTTCTCTTAGTTATGCAACACATTGGAGCAGCTCCACTTCAAGGGCCTTT 415 | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| Sbjct 236 A----TCTCGGTTCCCTTAGTTATGCAACACATTGGAGCAGCTTCACTTCAAGGTCCTTT 291 Query 416 GGATATAGTTTCAGACCGTTTGCGAGGAGATATTTTTCTCAAGTCGCTAGTACT-GAGAT 474 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || || Sbjct 292 GGATATAGTTTCAGATCGTTTACGAGGAGATATATTTCTCAAGTCCCTAATACTGGA-AT 350 Query 475 TAAGGATAGCATTGTTGGTGGTGTTGAAAAGTTTGGTGGGAATAAAATAGGTTTCAAGAA 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 351 TAAGGATAGCATTGTTGGTGGTGTTGAAAAGTTTGGTGGGAATAAAATAGGTTTCAAGAA 410 Query 535 ATTCAATAAGAAGTGGAAGAAGCATAGGGTTTTGGCTTCCACAAAAGCTGAAGTGGTGGC 594 ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 411 ATTTAATAAGAAGTGGAAGAAGCATAAGGTTTTGGCTTCCACAAAAGCTGATGTGGTGGC 470 Query 595 TTCTACTGAACCAGTTATTGGAGATGTTAACAGTGGCATCAAGGCGAAACTATCAACTGC 654 | | || | ||||| |||||||||||| || || |||||| | | ||||||| Sbjct 471 -T-T-CT--A-CAGTTGTTGGAGATGTTAGCATTGCCATCAA-G-G-------CAACTGC 515 Query 655 AGCTTCACCTGCTAGCAATGCTAAGCAAGCCTCTACTGTCAAAACAAAACGGCAGCCAAA 714 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 516 AGCTTCACCTGCTAGCAATGCTAAGCAAGCCTCTACTGTCAAAACAAAACGGCGGCCAAA 575 Query 715 GAGCAAGAAATTCGAAGATAAATCTTCTCCAACGGTATCGGTTTTGGAGACCGTCTCTGT 774 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 576 GAGCAAGAAAGTCGAAAATAAATCTTCTCCAACGGTATCGGTTTTGGAAACGGTCTCTGT 635 Query 775 AGACGAGAGTTTGCAAAGCTTTCCCAAGCCTAGACATTCGGGTTCCGGAAATCGGAAGTC 834 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 636 AGACGAGAGTTTGCAAAGCTTTCCCAAGCCAAGACATTCGGGTTCCGGAAATCGGAAGTC 695 Query 835 TTCATCTGCTGAGTACAGTTCTCAGAAGGAGGTGGTaaaaaaaaCCAATGTGGAGGGGCC 894 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| Sbjct 696 TTCATCTGCTGAGTACAGTTCTCAGAAGGAGGTGGCAAAAAATCCCATTGTGGAGGGGCC 755 Query 895 CAAAAGTTCTACTCCATCGAATTCCATGTCAGAACAACAGCATTGGACCTCAACAAAAGC 954 ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 756 CAAAAGTCCTACTCCATCAAATTCCATGTCGGAACAACAGCATTGGACCTCAACAAAAGC 815 Query 955 AAGCAATGCACCAAAACAGGAGCAGGAT 982 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 816 AAGCAATGCACCAAAACAGGAGCAGGAT 843 Score = 691 bits (374), Expect = 0.0 Identities = 388/395 (98%), Gaps = 0/395 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1347 AGAAGGAGGTGGCAAAAAATCACCCTGTGGAAGAGCCCAAAAGTCCTGCTCCATCAAATT 1406 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1313 AGAAGGAGGTGGCAAAAAATCACCCTGTGGAGGAGCCCAAAAGTCCTGCTCCATCAAATT 1372 Query 1407 CCAAGTCGGAACAACAGCATTTGAAGTCAACTAAAGCAAGTAAGGCACCAAAACAAAAGC 1466 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1373 CCAAGTCGGAACAACAGCATTTGAAGTCAACAAAAGCAAGTAAGGCACCAAAACAGAAGC 1432 Query 1467 TGGTTCCTCAACACATGAAAAACAGCATAGAACATCGAGGTCAAAATGCATCTAAACCGC 1526 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1433 TGGTTCCTCAACACATGAAAAACAGCATAGAGCATCGAGGTCAAAATGCATCTAAACCGC 1492 Query 1527 TTTATCCGCCAAGTGGAAAATCTGTTATTGTCGTTGAGTCAATGACAAAAGCAAAGATTA 1586 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1493 TTTATCCACCAAGTGGAAAATCTGTTATTGTCGTTGAGTCAATCACAAAAGCAAAGATTA 1552 Query 1587 TTCAGGGTTATCTTGGTGACATGTATGAGGTTTTGCCAAGTTATGGTCATATCAGGGACC 1646 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1553 TTCAGGGTTATCTTGGTGACATGTATGAGGTTTTGCCAAGTTATGGTCATATCAGGGACC 1612 Query 1647 TGGCCACAAGGTCTGGTTCAGTGAGGCCAGATGACGATTTTAGCATGGTTTGGGAGGTTC 1706 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1613 TGGCCACAAGGTCTGGTTCAGTGAGGCCAGATGACGATTTTAGCATGGTTTGGGAGGTTC 1672 Query 1707 CATCTTCCGCCTGGACTCATATTAAGAGCATTAAG 1741 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1673 CATCTTCCGCCTGGACTCATATTAAGAGCATAAAG 1707 Score = 566 bits (306), Expect = 6e-160 Identities = 355/377 (94%), Gaps = 9/377 (2%) Strand=Plus/Plus Query 978 AGGATAACATTGTTGGTGGTGATGAGAAGGCTGGTGGGAATAAAGTAGGTTTCAAGAAAT 1037 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 893 AGGATAACATTGTTGGTGGTGATGAGAAGGCTGGTGGGAATAAATTAGGTTTCAAGAAAT 952 Query 1038 TTAACAAGAACCGAAAGAAGCATAATGTGTTGGCTTCCTCAGAAGCTGAAGTGGTGACTT 1097 |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 953 TTAATAAGAACCAAAAGAAGCATAATGTTTTGGCTTCCTCGGAAGCTGAAGTGGTGACTT 1012 Query 1098 CTACTGAACCAGTTATTGGAGATGGTAGCAGTGGCATCAAGGCGGAACTATCCACGGCAG 1157 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct 1013 CTACTGAACCAGTTATTGGAGATGGTAACAGTGGCATCAAGGCGGAACTATCAACAGCAG 1072 Query 1158 CCTCACCTGCTAG--C-A--A-TGGTAATCAAGCCACTACTGTCAAATCAAAACGGCGCC 1211 ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 1073 CCTCACCTGCTAGTGCTAGCAATGGTAATCAAGCCACTACTGTCAAA--AAT-CGGCGCC 1129 Query 1212 CCAAGAACAAGAAAGTCGAAGATAAATCTTCTTCAGTGGTACCAGTTTTGGAGGCGGTCT 1271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1130 CTAAGAACAAGAAAGTCGAAGATAAATCTTCTTCAGTGGGACCAGTTTTGGAGGCGGTCT 1189 Query 1272 CTCTAGATGAGAGTCCGATAAGCGTTCCCAAGCCAAAACATTCTGGTTCTGGAAATCGGA 1331 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1190 CTCTAGAAGAGAGTCCGATAAGCGTTCCCAAGCCAAAACATTCTGGTTCTAGAAATCGGA 1249 Query 1332 AGTCTTCATCTGCTAAG 1348 ||||||||||||||||| Sbjct 1250 AGTCTTCATCTGCTAAG 1266 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 158167273388 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5