BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G31570.1
Length=8511
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg944826 jgi|Araly1|944826|scaffold_701055.1 7005 0.0
Ahg952051 jgi|Araly1|952051|scaffold_34300002.1 3408 0.0
> Ahg944826 jgi|Araly1|944826|scaffold_701055.1
Length=4504
Score = 7005 bits (3793), Expect = 0.0
Identities = 4201/4395 (96%), Gaps = 40/4395 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3736 TGTCGAGTAAATCAAACGATATGGAGGAAATGACGCAGCGAAGCCTTGATTCCACTTCAC 3795
||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2 TGTTGAGT-AATCAAACGATATGGAGGAACTGACGCAGCGAAGCCTTAATTCCACTTCAC 60
Query 3796 TTCGAGAGTTAGTTGAGAAGGTTGAGGGTCTTCTGGAACTTGAAAGTGGAGTGATTTTTG 3855
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 61 TTCGAGAGTTAGTTGAGAAGATTGAGGGTGTTCTGGAACTTGAAAGTGGAGTGAGTTTTG 120
Query 3856 AATCTCCTAGTTCACAGGTGGAGTTTCTCGTTTCCCAACTTGTTCAGAAGTTTATAGAGA 3915
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AATCTCCTAGTTCACATGTGGAGTTTCTTGTTTCCCAACTTGTTCAGAAGTTTATAGAGA 180
Query 3916 TTGAGGAATTAGCTAATCTCCTCAGAAAACAGTTAGAGGCCAAGGGGAATGAGTTGATGG 3975
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 181 CTGAGGAATTAGCTAATCTCCTCAGAAAACAGTTAGAGGCCAAGGAGAATGAGTTGATGG 240
Query 3976 AGA-TCGAGGAGAGTTTACTGCACCATAAGACTAAAATAGCTGGTCTCAGGGAAAGTTTA 4034
||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 241 AGATTC-AGGAGAGTTTACTGCACCATAAAACTGAAATAGGTGGTCTCAGGGAAAATTTA 299
Query 4035 ACCCAGGCTGAGGAGTCCCTTGTGGCTGTACGATCTGAGTTACAAGATAAATCTAATGAA 4094
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 300 ACCCAGGCAGAGGAGTCCCTTGTGGCTGTACGATCTGAGTTACAAGATAAATCTGATGAA 359
Query 4095 CTTGAACAATCAGAGCAGAGGTTATTATCGACTCGAGAGAAGCTTAGCATAGCTGTTACT 4154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 CTTGAACAATCAGAGCAGAGGTTATTATCGACTCGAGAGAAGCTTAGCATAGCTGTTACT 419
Query 4155 AAAGGAAAAGGTTTGATTGTTCAGCGTGACAATGTCAAGC-AGTCGTTGGCCGAAGCCT- 4212
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 420 AAAGGAAAAGGTTTGATTGTTCAACGTGACAATGTCAAGCAAG-CGTTGGCCGAAACCTC 478
Query 4213 CTGCTAAACTGCAGAAGTGCTCAGAAGAATTGAATTCGAAGGACGCTAGGCTTGTAGAAG 4272
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||
Sbjct 479 CT-CTAAACTGCAGAAGTGCTCAGAAGAATTGAATTTGAAGGATGCAAGGCTTGTGGAAG 537
Query 4273 TTGaaaaaaaaCTGAAGACCTATATTGAGGCAGGTGAACGTGTGGAAGCATTAGAATCTG 4332
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 TTGAAGAAAAACTTAAGACCTATATTGAGGCAGGTGAACGTGTGGAAGCATTAGAATCTG 597
Query 4333 AGCTGTCATACATCCGAAACTCAGCTACTGCATTGCGAGAATCGTTTCTTCTGAAAGACT 4392
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 598 AGCTTTCATACATCCGAAACTCAGCTACTGCACTGCGAGAATCTTTTCTTCTCAAAGACT 657
Query 4393 CTCTGCTTCATAGAATTGAAGAAATTTTGGAAGATTTGGATCTCCCAGAGCATTTTCATG 4452
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 CTCTGCTTCACAGAATTGAAGAAATTTTGGAAGATTTGGATCTCCCAGAGCATTTTCATG 717
Query 4453 CCCGAGATATATTGGAAAAGGTGGAGTGGTTAGCAAGATCAGCTAACGGCAACTCT-TCG 4511
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 718 CTCGAGATATATTGGAAAAGGTGGAGTGGTTAGCAAGATCAGCTAACGGCAACTCTAT-G 776
Query 4512 CGCCCCTCTGGTTGGGATCAGAAGAGTTCTGATGGAGGTGCGGGATTTGTTCTCTCAGAG 4571
|| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 777 CGTCCCTCTGATTGGGATCAGAAGAGTTCTGATGGAGGTGCAGGATTTGTTCTATCAGAG 836
Query 4572 CCCTGGAGGGAGGATGTACAAACTGGCACAAGTTCTGAGGATGACTTGAGGATCAAGTTT 4631
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 837 CCGTGGAGGGAGGATGTACAAACTAACACAAGTTCTGAGGATGAATTAAGGATCAAGTTT 896
Query 4632 GAGGAGCTCAAAGGAAAGTTTTATGGATTGGCTGAACAGAATGAAATGCTGGAGCAGTCC 4691
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 GAGGAGCTCAAAGGGAAGTTTTATGGATTGGCTGAACAGAATGAAATGCTGGAGCAGTCC 956
Query 4692 TTGATGGAAAGGAATACTTTGGTTCAGAGATGGGAAAAACTCCTGGAAAATATTGATATC 4751
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 957 TTGATGGAAAGGAATACCTTGGTTCAGAGATGGGAAAAAATCCTAGAAAATATTGATATA 1016
Query 4752 CCTCCACAGCTACACTCCATGGAAGTGGAAAACAAGATTGAATGGCTTGCAAGTACAATT 4811
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 CCTCCACAGCTACAGTCCATGGAAGTGGAAAACAAGATTGAATGGCTTGCAAGTACAATT 1076
Query 4812 ACAGAGGCTACACATGACCGGGATAATCTCCAACAGAAGATTGATAACCTTGAAGTCTAT 4871
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 ACAGAGGCTACACATGACAGGGATAATCTCCTACAGAAGATTGATAACCTTGAAGTCTAT 1136
Query 4872 TGTCAATCAGTAACTACTGATTTGGAAGTCTCACAAAAGCAAGTAGGTGATGTCGAGGGA 4931
||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1137 TGTCAATCACTAACTGCTGATTTGGAAGTCTCACGAAAGCAAGTAAGTGATGTCGAGGCA 1196
Query 4932 AATCTTCAATCATGTGTTAGTGAGAGGGTGAATCTTTCTGAAAGGCTGGAAAGTTTGATT 4991
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1197 AATCTACAATCGTGTGTTAGTGAGAGGGTGAATCTTTCTGAAAGACTGGAAAGTTTGATT 1256
Query 4992 GGTGATCATGAGAGTCTTTCTGCAAGGGGCATTCACCTTGAAGTTGAGAATGAGAAACTG 5051
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 GGTGATCATGAAAGTCTTTCTGCAAGGGGCATTCACGTTGAAGTTGAGAATGAGAAACTG 1316
Query 5052 CAGAATCAAGTGAAAGATTTGCATGAAAAATTGGTTGAGAAACTTGGGAATGAAGAACAT 5111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 CAGAATCAAGTGAAAGATTTGCATGAAAAATTGGTTGAGAAACTTGGGAATGAAGAACAT 1376
Query 5112 TTTCAGACTATTGAAGGAGACTTGTTAAGTTTGAGGTACATGATTGATGATGTTATACAG 5171
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1377 CTTCAGACTATTGAAGGAGACTTATTAAGTTTGAGGTACATGATTAATGATGTTATACAG 1436
Query 5172 GAAGATGGCTTGCAAGATTTGGCTTTAGCAAGTAATTCTGAGAACTTGGATGGAGTGCTG 5231
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 1437 GAAGATGGCTTGCAGGATTTGGCTTTAGCAAGTAATTCTGAGAACTTGGATGGACTACTG 1496
Query 5232 AGAAAGCTGATAGACTATTATAAGAATTTGGTGAAATCTAGTTTGCCAGGTGAAACCGAT 5291
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1497 AGAAAACTGATAGACTATTATAAGAATTTGGTGAAATCTAGTTTGCCACTTGAAACCAAT 1556
Query 5292 GACAACGTCTGTGAAACTCGTCCATCAGATGCTGATGTTAGAAGCGGAGAGTCAT-TGGG 5350
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||
Sbjct 1557 GACAACGTCTGTGAAACTCGCCCATCAGATGCTGATGTTAGAAGCGGAGAGCCATCT-GG 1615
Query 5351 TGCACATGGAGCAACTTCTCATGGGCAACATTTTGAATTGTCTGATTCTAATGTAGTTGA 5410
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1616 CGCACATGAAGCAACTTCTCATGGGCACCATTTTGAATTGTCTGATTCTAATATAGATGA 1675
Query 5411 AGCAACAAGTAGAGACATAGCAGTCGTAGAGACACCTGATGTAGCTTCCCTAACAAAAGA 5470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 AGCAACAAGTAGAGACATAGCAGTCGTAGAGACACCTGATGTAGCTTCCCTAACAAAAGA 1735
Query 5471 TCTGGATCAGGCACTGCATGTTCAAAAGCTGACAAGGGAAGAAAGAGATTTGTACATGGC 5530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 TCTGGATCAGGCACTGCATGTTCAAAAGCTGACAAGGGAAGAAAGAGATTTGTACATGGC 1795
Query 5531 AAAACAACAATCCTTGGTTGCGGAAAATGAGGCACTTGATAAGAAAATAATAGAACTGCA 5590
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 AAAACAACAATCCTTGGTTGCTGAAAATGAGGCACTTGATAAGAAAATAATAGAACTGCA 1855
Query 5591 GGAGTTTCTTAAACAAGAAGAGCAGAAGTCAGCTTCTGTAAGGGAGAAGTTAAATGTAGC 5650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 GGAGTTTCTTAAACAAGAAGAGCAGAAGTCAGCTTCTGCAAGGGAGAAGTTAAATGTAGC 1915
Query 5651 TGTTAGGAAAGGGAAGGCTTTGGTCCAGCAAAGGGATAGCCTGAAGCAAACTATTGAAGA 5710
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 TGTTAGGAAAGGGAAAGCTTTGGTCCAGCAAAGGGATAGCCTGAAGCAAACTATTGAAGA 1975
Query 5711 GGTGAACGCTGAGCTTGGTCGCCTGAAATCAGAGATTATCAAAAGAGATGAAAAGCTCTT 5770
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1976 GATGAACGCTGAGCTTGGTCGCCTGAAATCGGAGATTATCAACAGAGATGAAAAGCTCTT 2035
Query 5771 GGAAAATGAAAAG-AAATTTAGGGAGTTGGAATCTTATTCTGTGAGGGTAGAATCCCTAG 5829
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 GGAAAATGAAA-GTAAATTTAGGGAGTTGGAATCTTATTCTGTGAGGGTAGAATCCCTAG 2094
Query 5830 AGTCTGAGTGCCAATTGTTGAAAATTCATTCGCAAGAAACAGAATATCTTTTACAGGAAA 5889
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2095 AGTCTGAGTGCCAATTGTTGAAAATCCATTCGCAAGAAACAGAATATCTTTTGCAGGAAA 2154
Query 5890 GAAGTGGTA-ATTTGAGCATGACGTTGAATGCGTTAAATAGCATTGATATTGGTGATGAA 5948
||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2155 GAAGTGGTACATT-GAGCATGACGTTGAATGCTTTAAATAGCATTGATATTGGTGTTGAA 2213
Query 5949 GGTGACATAAATGATCCAGTCATGAAGCTTCAACGAATCTCCCAACTGTTTCAAACAATG 6008
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 2214 GGTGACATGAATGACCCAGTCATGAAGCTTCAACGGATCTCACAACTGTTTCAAACTATG 2273
Query 6009 AGTACAACCGTGACTTCTGCTGAGCAGGAGTCGAGAAAATCTAGAAGAGCAGCTGAGTTG 6068
||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274 GGTACAGCTGTGTCTTCTGCTGAGCAGGAGTCGAGAAAATCTAGAAGAGCAGCTGAGTTG 2333
Query 6069 CTACTTGCTGAGTTGAACGAAGTTCAGGAGACAAACGATAGTCTGCAAGAGGATCTATCA 6128
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2334 CTACTTGCTGAGTTGAACGAAGTTCAGGAGAGAAACGATAGTCTGCAAGAGGATCTATCA 2393
Query 6129 AAATTTACATATGAAATCCAGCAACTTTCCAGAGAGAAGGATGCAGCGGAGGCTGCAAAG 6188
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 AAATTTACATATGAAATCCAGCAACTTTCCAGAGAGAAGGATGCAGCGGAGGCTGCAAAA 2453
Query 6189 GTTGAAGCCATATCTCGTTTTGAAAATTTATCAGCAGTCAGCAACGAAGAAAAGAATAAG 6248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2454 GTTGAAGCCATATCTCGTTTTGAAAATTTATCAGCAGTCAGCAACGAAGAAAAGAATAAG 2513
Query 6249 CTATATGCTCAACTGCTATCATGTGGAACCAGTGTGAACTCTCTAAGGAAAATACTCGCA 6308
||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 CTATATGCTCAACTGCTGTTATGTCGAACCAGTGTGAACTCTCTAAGGAAAATACTCGCA 2573
Query 6309 GGTACCAACAGTTGCCTAGCTGATATTTTCATCATGGATATGGAGTTTCTGCATCATCTG 6368
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2574 GGTACCAACAGTTGCCTAGCTGATATATTCACCATGGATATGGAGTTTCTGCATCATCTG 2633
Query 6369 AAGGCAAATATGGAATTATGTGCGAAGAAAACTGGAACTGATTTGTCTGGCTTGCCTCAA 6428
||| |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2634 AAGACAAATATGGAATCATATGCGAAGCAAACTGGTACTAATTTGTCTGGCTTGCCTCAA 2693
Query 6429 CTCAGTACAGAGAATCTG-GTAGACAAGGAAATCTTTGCACGCTTGAGTGCTGCTTGGTC 6487
|||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2694 CTCAGTACAG-GTTTTTTTGTAGACAAGGATTTCTTTGCACGCTTGAGTGCTGCGTGGTC 2752
Query 6488 TAACATTAACTTGCATGAGACATCAAGTGGTGGAAACATAGCCGAAATTTGTGGTTCTCT 6547
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2753 TAACATTAACTTGCATGAGACATCAAGTGGTGGAAACATAACCGAAATTTGTGGTTCTCT 2812
Query 6548 CTCCCAAAACCTTGATCAATTTGTGGTTGGTGTTAGCCATCTCGAAGAGAAAGTAAGCAA 6607
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2813 CTCCCAAAACCTTGATCAATTTGTGGCTGGTGTTAGCCATCTCGAAGAGAATGTAAGCAA 2872
Query 6608 GCACTTGGCCACATGGCACGACCAGATCAATATTGTATCCAACAGTATCGACACCTTTTT 6667
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 GCACTTGGCCACATGGCACGACCAGGTCAATATTGTATCCAACAGTATCGACACCTTTTT 2932
Query 6668 CAAGTCAATTGGAACAGGAACGGACTCTGAAGTTGCCGCTCTTGGTGAAAGAATTGCCTT 6727
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 CAAGTCAATTGGAACAGGAACGGACTCTGAAATTGCCGCTCTTGGTGAAAGAATTGCCTT 2992
Query 6728 GCTTCATGGAGCATGTTCTAGCGTGTTGGTGGAAATTGAAAGGCGTAAAGCTGAACTTGT 6787
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2993 GCTTCATGGAGCATGTTCTAGCGTGTTGGTGGAAATCGAAAGGCGTAAAGCTGAACTTGT 3052
Query 6788 TGGAAATGACGATTTTAATATGAGTCTCCACCAAGTAGATGAGGACTTTTCGTCTATGGA 6847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3053 TGGAAATGACGATTTTAATATGAGTCTCCACCAAGTAGATGAGGATTTTTCGTCCATGGA 3112
Query 6848 ATCTGTCAGGTCCATGGTAAATAGGCTATCGTCAGCTGTTAAGGAGCTTGTTGTAGCGAA 6907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 3113 ATCTGTCAGGTCCATGGTAAATAGGCTATCGTCAGCTATTAAGGAGCTTGTTGTTGCGAA 3172
Query 6908 CGCTGAGACTCTGGAGAGAAATGAAAAGGAGATGAAGGTAATCATCGCCAATTTGCAAAG 6967
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 CGCTGAGACTGTAGAGAGAAATGAAAAGGAGATGAAGGTAATCATCGCCAATTTGCAAAG 3232
Query 6968 GGAGTTACACGAAAAGGACATCCAAAATAATAGGACGTGCAATGAACTTGTGGGTCAAGT 7027
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233 GGAGTTACACGAAAAGGACATCCAGAATGATAGGATGTGCAATGAACTTGTGGGTCAAGT 3292
Query 7028 TAAGGAAGCCCAGGCTGGTGCAAAAATCTTTGCGGAAGATCTTCAATCTGCAAGTGCCCG 7087
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 TAAGGAAGCCCAGGCTGGTGCTAAAATCTTTGCGGAAGATCTTCAATCTGCAAGTGCCCG 3352
Query 7088 GATGCGTGATATGCAAGACCAGCTGGGTATTTTGGTTCGGGAACGGGATTCTATGAAGGA 7147
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3353 AATGCGTGATATGCAAGACCAGCTGGGTATTATGGTGCGGGAACGGGATTCTATGAAGGA 3412
Query 7148 GAGAGTAAAAGAGCTGCTAGCAGGGCAGGCGTCACACTCAGAATTACAGGAGAAGGTCAC 7207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3413 GAGAGTAAAAGAGCTGCTAGCAGGGCAGGCGTCACACTCAGAATTACAGGAGAAGGTCAC 3472
Query 7208 ATCTCTTAGTGATCTACTAGCTGCGAAAGACCTAGAAATTGAGGCCTTAATGCAAGCGCT 7267
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3473 ATCTCTTAGTGATCTACTAGCTGCGAAAGACTTAGAAATTGAGGCCTTAATGCAAGCGCT 3532
Query 7268 TGACGAGGAAGAGTCTCAGATGGAGGATCTGAAACTCAGAGTTACAGAATTAGAACAGGA 7327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3533 TGACGAGGAAGAGTCTCAGATGGAGGATCTGAAACTCAGAGTTACAGAATTAGAACAGGA 3592
Query 7328 AGTGCAACAGAAGAACCTAGACTTGCAGAAAGCTGAAGCTTCTCGTGGGAAGATTTCCAA 7387
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3593 AGTGCAACAGAAGAACCTAGACTTGCAGAGAGCTGAAGCTTCTCGTGGGAAGATTTCCAA 3652
Query 7388 AAAGCTATCAATTACTGTGGATAAATTCGATGAGCTCCATCACCTCTCTGAAAATCTTCT 7447
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3653 AAAGCTATCAATTACTGTCGATAAATTCGATGAGCTCCATCATCTCTCTGAAAATCTTCT 3712
Query 7448 -TGCTGAAATCGAGAAACTTCAACAGCAAGTGCAAGATCGGGATACAGAGGTTTCTTTCT 7506
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3713 CT-CTGAAATAGAGAAACTTCAACAGCAAGTGCAAGATCGGGATACAGAGGTTTCTTTCT 3771
Query 7507 TAAGACAAGAAGTCACTAGGTGCACCAATGAGGCTCTTGCTGCTTCTCAGATGGGCACTA 7566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3772 TAAGACAAGAAGTCACTAGGTGCACCAATGAGGCTCTTGCTGCTTCTCAGATGGGCACTA 3831
Query 7567 AGAGAGATTCAGAAGAGATCCAAACTGTACTGTCT-TGGTTCGACACGATAGCTTCACTA 7625
||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 3832 AGAGAGATTCAGAAGAGATGGAAACTGTACTGTCTCTG-TTCGACACGATAGCTTCACTA 3890
Query 7626 CTTGGTATAGAAGATTCGC-TGTCCACTGATGCTGACAGTCATATAAACCACTACATGGA 7684
||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3891 CTTGGTATAGAAGATTCGCCT-TCCACTGATTCTCACAGTCATATAAACCACTACATGGA 3949
Query 7685 GACATTTGAGAAAAGGATAGCGTCTATGCTATCTGAAATAGACGAATTACGGTTGGTTGG 7744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3950 GACATTTGAGAAAAGGATAGCGTCTATGCTATCTGAAATAGACGAATTACGGTTGGTTGG 4009
Query 7745 ACAAAGCAAGGACGTTTTGCTTGAAGGC-GAGAGGAGTAGAGTGGCTGAGCTCAGACAGA 7803
|||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4010 ACAAAGCAAGGACGAGTTGCTTGAAG-CTGAGAGGAGTAGAGTGGCAGAGCTCAGACAGA 4068
Query 7804 AAGAAGCAACTCTTGAGAAATTCTTACTTGAGAAAGAATCCCAAC-AAGACATTTCAACA 7862
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||
Sbjct 4069 AAGAAGCAACTCTTGAGAAATTCTTACTAGAGAAAGAATCCCAACCAA-ATATGTCAACA 4127
Query 7863 AGCTCGACGTCAGAGATCGTTGAAGTGGAACCTCTGATAAACAAGTGGACAAAAACATCG 7922
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4128 AGCTCAACGTCAGAGATCGTTGAAGTGGAACCTCTGATAAACAAGTGGACGAAAACATCA 4187
Query 7923 ATTCCATCACAAGTCCGGAGTTTGCGTAAGGGAAATATGGATCAAGTCGCCATTAGTATA 7982
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4188 ATCCCATCTCAAGTCCGGAGTTTGCGTAAGGGAAATATGGATCAAGTCGCCATTAGTATA 4247
Query 7983 GATGCAGATCAAACTGATCAAAGCGGTAGCTTAGAAGAAGATGATGATAAAG---AT--- 8036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4248 GATGCAGATCAAACTGATCAAAGCGGTAGCTTAGAAGAAGATGATGATAAAGCTCATGGT 4307
Query 8037 --CA---C--TCTCTACGTCAAGAATCATTCCTAGATTCACAAGACCCATCACTAACATG 8089
|| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4308 TTCAGATCACTCTCTACGTCAAGAATCATCCCTAGATTCACAAGACCCCTCACTAACATG 4367
Query 8090 GTCGATGGTTTATGG 8104
|||||||||||||||
Sbjct 4368 GTCGATGGTTTATGG 4382
Score = 193 bits (104), Expect = 2e-47
Identities = 112/116 (97%), Gaps = 0/116 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8138 GGTCTCTTGTGATCGGACGCTCATGAGACAACCTGCTTTACGGTTAGGGATCATGCTATA 8197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||
Sbjct 4382 GGTCTCTTGTGATCGGACGCTCATGAGACAACCTGCCTTACGGTTAGGGATAATGATTTA 4441
Query 8198 CTGGGCGATATTGCATGCTCTTTTGGCTGCTTTCGTGGTCTAACCAAACTTCCAAT 8253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4442 CTGGGCGATATTGCATGCTCTTTTGGCTGCTTTCGTGGTCTAACCAAACTTCCAAT 4497
> Ahg952051 jgi|Araly1|952051|scaffold_34300002.1
Length=3392
Score = 3408 bits (1845), Expect = 0.0
Identities = 2330/2554 (91%), Gaps = 73/2554 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 25 GGAACAAGAACACAGTGAATCGAATGGACAAGAAAAAGAACCGTGCTGATCCGCTTGCTG 84
|||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 GGAACAAGAACAGAGTAAATCAAATGGACAAGAAAAAGAACCGTGCTGATCCACTTGCTG 60
Query 85 CTGGGCGCCAGAAGCTTCAACAATTTCGTCAAAAGAAGGCTGACAAAGGCACTGATCAGA 144
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTGGGCGCCACAAGCTTCAACAATTTCGTCAAAAGAAGGCTGACAAAGGCACTGATCAGA 120
Query 145 AAAAGGACTCCAAAGGCAGTACAAGCCAAGGCAAATCCTCCAAAAAATCTAATAAATCTG 204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |
Sbjct 121 AAAAGGACTCCAAAGGCAGTACAAGCCAAGGCAAATCCTCCAAAAAATC---T-AA--T- 173
Query 205 AGAAGCATGAGCGTAAACCTGACACTAGTGCTGTCAGTGACGAGGCACAAGCTCCATCCC 264
| || | ||| | || | || | | || || | || | ||| || | | |
Sbjct 174 A-AATC-TGA--G--AA---G-CA-T-GAGC-GT-A--AACCTGACACTAG-TGC-T-GT 214
Query 265 CTGTGACTGTAGG-AGGAGCTACATCTCATGTGAATGTTGCTGAGGAGGTTGTCGATTCT 323
| ||||| | ||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 CAGTGAC-G-AGGCACAAGCTCCATCCCATGTCAATGTTGCTGAGGAGGTTGTCGATTCT 272
Query 324 CCACAAACTTCTTCAGATACAAAAGCTCACGAATATGTTTCAGTCCATGGTTCCTCATCA 383
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 273 CCACAAACTTCTTCACATACAAAAGCTCACGAATATGTTTCAGTCCATGGTTCATCATCA 332
Query 384 GAGCCTGATGCGCTTCAGCCAGGACACACCACTTCTAATGATGGATCTGAAGCGAGAAAA 443
|| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||
Sbjct 333 GAACCTGATATGCCTCAGCCAGGAAACACCACTTCTGATGATGTATCTGAAGTGAGAAAA 392
Query 444 GAAGTAGTTAATTCTGAAAATGATATCAGTAAATCTTTATCCACTGAAGAAGAGAATGTG 503
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 393 GAAGTAGTTAATTCTGAAAACGATATCAGTATATCTTTATCCACTGAAGAAGAGAATATG 452
Query 504 AAGTCTATCAACAGTGGAGTGGCTGGCACAGT-GGATTCTTTGATATCTGACCCTGCAGA 562
|||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 453 AAGTCTATCAACGGTGGAGTTGCTGGCACAGTAGG-TTCTTTGACATCTGACACTGCAGT 511
Query 563 TTCTGAGAAGGGAGTTACACATGACGATGCATC---TAATGTTGATGGAATCTTTGCTG- 618
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |
Sbjct 512 TTCTGAGAAGGGAGTTACTCATGACGATGCATCTATTAATGTTGACGGAATCTTTAC-GT 570
Query 619 CTTCTGGAAACATAGCGGAGGGGGAAGGTGTTGAAGTTGAAGGTGGTTCTGGGAATGTGG 678
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 571 CTTCTGGAAACATAGCGGAGGGGGAAGGAGTTGAAGTTGAAGGTGGGTCTGGAAATGTGG 630
Query 679 AAAAGCCGCATCAGCCATCCTCTCTCCAAGAATATATTCCTGATGTTTCCTTGATTCGTG 738
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 AAAAGCCGCATCAGCCATCCTCTCTCCATGAAGGCATTCCTGATGTTTCCTTGATTCGTG 690
Query 739 CAAGGGGAGATCAGGTAACTGATGTAGGGGAAATGCAGGAAGAAGACATGGAGCAGTTTT 798
||||||||||||||| || || | || | || | | ||||||||||||||
Sbjct 691 CAAGGGGAGATCAGG-AA--GA---A--GG---T---GGTTCACG-CATGGAGCAGTTTT 735
Query 799 CTGAATTATCTGCAAAGGCAGGCGTGGATAAGATTGCAACTGAAGAAAGGCAAACAAGCT 858
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 CTGAATCATCTGCAAAGGCAGGTGTGGATAAGATTGCAACTGAAGAAAGGCAAACAAGCT 795
Query 859 ATCCAGCTGTTGTGGATTCATCTGCTTCTCCTTCACACTTTTCAGAGGGATCCTCAGTTG 918
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 ATCCAGCTGTTGTGGATTTATCTGCTTCTCCTTCACATTTTTCAGAGGGATCCTCAGTTG 855
Query 919 CCTTTGATACAGTTGAACTAGAAGGTATAAA-TGGTAATTTTAGAAGCCAACAGATTAGA 977
| || ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 856 CATTAGATTCAGTTGAACTAGAAGG-ACAAAATGGTAATATTAGAAGCCAACAGATGAGG 914
Query 978 GAAGCTGCAGAGCTTAACGAAGAGAAACCAGAAACATCTATTGATTTTCCTAATAACAGA 1037
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 915 GAAGCTGCAGAGCTTAATGAAGAGAAACCAGAAACATCTATTGATTTTCCTAATGATAGA 974
Query 1038 GATCACGTGCTTTCAGCTGAACCTGAGGAAAGCTCTGTTGCAGAAATGGCCAGTCAGCTG 1097
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 975 GATCACGTGCTTTCAGCTGAACCTGAGGAAAGCTCTGTTGCAGATATGGCTAGTCAGCTG 1034
Query 1098 CAATTGCCTGAGAGCGTCAGTATATCTGGAGTTT-TGAGCCACGAGGAAACTCGTAAAAT 1156
||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||| |||||
Sbjct 1035 CAATTGCCTGAGAGCATCAGTATATCTGGA-TTAGTGAGCCATGAGGAACCTCAAAAAAT 1093
Query 1157 TGACACATTGAATTTATCTGCAGAACTTACC-TCTGCTCATGTTCATGAAGGCCGCTCAG 1215
||||||||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1094 CGACACATTGAATTTATCTGGAGAAGTTTCCGT-TGCTCATGTTCATGAAGGCCCCTCAT 1152
Query 1216 TCAGCTTCTTACAGCTTATGGATATTGTAAAAGGACTTGGCCAAGATGAATATCAAATTT 1275
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1153 TCAGCTTCTTACAGCTTATTGATATTGTTAAAGGACTTGGCCAAGACGAATATCAAATTT 1212
Query 1276 TGTGCAACGCAAGAGAGGCTGCTTCTAGTACTGAGCCAGGAACAAGTTCGTTGGAGCGAC 1335
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 TGTGCAACGCAAGAGAGGCTGCTTCCAGTACTGAGCCAGGAACAAGTTCGTTGGAGCGAG 1272
Query 1336 TAAGAGAAGAACTGTTTGTTTCGAGTACCATGGAAGATATACTCCATGTGCAACTCACAG 1395
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1273 TAAGAGAAGAACTGTTTGTTTCGAGTACCATGGAAGATTTACTCCACGTGCAACTCACAG 1332
Query 1396 AACAGTCTCATCTACAAATAG-AGTTTGATCATCAACATAACCAATTTGTAGCTGAAATA 1454
||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1333 AACAGTCTCATCTGCAAA-AGGAGTTTGATCATCAACATAACGAATTGGTAGCTGAAATA 1391
Query 1455 TCACAGCTTCGTGCATCATATAGTGCGGTGACAGAGAGAAATGATTCTCTTGCGGAGGAA 1514
|||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392 TCACAGCTTCGTGCATCATATAATGCAGTGATAGAGAGAAATGATTCTCTTGCGGAGGAA 1451
Query 1515 CTA-TCAGAGTGCCAGTCTAAACTCTATGCTGCTACAAGCTCAAAC-ACGAACCTTGAAA 1572
||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||
Sbjct 1452 CTACT-AGAGTGGCAGTCTAAACTCTATGCTGCTACTAGCTCTAATGA-GAACCTTGAAA 1509
Query 1573 ATCAGCTTCTTGCTACAGAAGCACAAGTGGAGGATTTCACTGCTAAGATGAATGAGTTGC 1632
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1510 ATCAGCTTCTTGCTACAGAAGCTCAAGTGGAGGATTTCACTGCTAAGATGAATGACTTGC 1569
Query 1633 AGCTTAGCCTAGAAAAGTCCCTGTTGGATCTATCTGAGACAAAAGAAAAATTCATTAATC 1692
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||
Sbjct 1570 AGCTTAGCCTAGAAAAGTCCCTGTTGGATCTATCTGAGGCGAAAGAAAAGTGCATTAATC 1629
Query 1693 TTCAGGTAGAGAATGATACGTTGGTTGCAGTTATATCTTCCATGAATGATGAGAAAAAGG 1752
||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 1630 TTCAGGTGGAGAATGATACGTTGGTTGCAATTATTTCTTCCGTGAATGATGAGAAAAAAG 1689
Query 1753 AACTTATTGAAGAAAAAGAATCCAAGAACTATGAGATTAAGCATCTTTCATCTGAGTTAT 1812
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 AACTTCTTGAAGAAAAAGAATCCAAGAACTATGAGATTAAGCATCTTTCATCTGAGTTAT 1749
Query 1813 -GCAATTGCAAGAACCTGGCGGCCATACTAAAGGCAGAAGTTGAGCAATTTGAAAACACT 1871
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1750 TG-AATTGCAAGAACCTGGCGGCTATACTAAAGGCAGAAGTTGAGCAATTGGAAAACACT 1808
Query 1872 ATTGGTCCATTAACAGATGAGAAGATACATCTTGTGGAGGAAAAATATAGTTTATTGGGT 1931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1809 ATTGGTCCATTAACAGATGAGAAGATACATCTTGTGGAGGAAAGATATAGTTTATTGGGT 1868
Query 1932 GAGGCCGAAAAGTTACAGGAAGAATTGGCAAATTGTAAGACCGT-GGTCACCCTGCAAGA 1990
||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1869 GAGGCAGAGAACTTACAGGAAGAATTGGCAAATTGTAAGAC-GTTGGTCACCCTGCAAGA 1927
Query 1991 GGTGGAAAACTCAAACATGAAGG-AGACGCTTTCTTTACTGACACGCCAGCAGACTATGT 2049
||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||
Sbjct 1928 GGTGGAAAATTCAAACAT-AAGGGAGACGCTTTCTTTACTGACAGGCCAACAGACTAAGT 1986
Query 2050 TTGAAGAGAACAACATACATCTCAGAGAAGAAAATGAGAAAGCACATCTAGAACTGAGTG 2109
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1987 TTGAAGAGAACAACCTACATCTCAGAGAAGAAAATGAGAAAGCACATCTAGAACTTAGTG 2046
Query 2110 CACATCTGATCTCGGAGACTTATTTATTATCCGAGTATTCCAATCTAAAGGAGGGATATA 2169
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2047 CACATCTGATCTCGGAGACTTATTTATTGTCCGAGTATTCCAATCTAAAGGAAGGATATT 2106
Query 2170 CTTTGTTAAATAATAAGCTCTTGAAGTTTCAAGGGGAAAAGGAACATTTGGTTGAGGAAA 2229
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2107 CTTTGTTGAATAATAAGCTCTTGAAGTTTCAAGGGGAAAAGGAACATTTGATTGAGGAAA 2166
Query 2230 ATGATAAACTTACACAGGAACTTCTTACTCTTCAAGAGCACATGTCAACTGTAGAAGAAG 2289
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||
Sbjct 2167 ATGATAAACTTACACATGAACTTCTTACTCTTCAAGAGCGTACGTCAATTGTAGATGAAG 2226
Query 2290 AGCGGACTCATCTAGAAGTTGAGTTAAGAGAAGCAATAGCGCGCCTTGATAAATTGGCTG 2349
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2227 AGCGGAGTCATCTAGAAGTTGAGTTAAGAGAAGCAATAGCGCGCCTTGATAAATTGACTG 2286
Query 2350 AAGAAAATACATCTTTAACTAGCAGCATCATGGTAGAAAAAGCAAGAATGGTAGACAATG 2409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 2287 AAGAAAATACATCTTTAACTAGCAGCATCATGGTAGAAAAAGCTAGAATGGTAGACATTG 2346
Query 2410 GTAGCGCAG-ATG-TGTCAGGGTTGATCAATCAGGAAATTTCTGAGAAACTTGGTAGAAG 2467
|||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2347 GTAGCG-AGGATGCT-TCAGGTTTGATCAATCAGGAAATTTCTGAGAAACTTAGTGGAAG 2404
Query 2468 TTCGGAAATCGGGGTTAGTAAACAGAGTGCATCTTTTCTTGAAAATACGCAATATACAAA 2527
||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2405 TTCAGAAGTCGTGGTTAGTAAACAGGGTGCATCTCTTCTTGAAAATACACAATATACAAA 2464
Query 2528 TTTGGAAGAGGTTAGGGAATATACTTCTGAGTTT 2561
|| | ||||||| | |||| ||||||||||||||
Sbjct 2465 TTCGAAAGAGGTAATGGAAGATACTTCTGAGTTT 2498
Score = 1264 bits (684), Expect = 0.0
Identities = 777/823 (94%), Gaps = 2/823 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2663 CGATAAAGGTGCCACGCCAGCAGTATCAAAACTGATTCAAGCTTTTGAGTCAAAACGGAA 2722
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2501 CGATAAAGGTGCCACACCAGCAGTATCAAAATTGATTCAAGCTTTTGAGTCAAAACGGAA 2560
Query 2723 ACCAGAAGAACCTGAATCTGAGAATGCACAGTTAACTGATGATCTGTCAGAAGCAGATCA 2782
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2561 ACCAGAAGAACATGAATCTGAGAACGCACAGTTAACTGATGATCCATCAGAAGCAGATCA 2620
Query 2783 ATTTGTTTCTGTTAATGTGCAGATTAGAAATTTGAGAGGTTTGCTTGATCAGTTACTGTT 2842
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 2621 ATTTGTTTCTGTGAATGTGCAGATTAGAAATTTGAGAGGCTTGCTTCATCAGTTACTGTT 2680
Query 2843 GAATGCTAGGAAGGCTGGCATACAATTCAACCAGTTAAATGATGACAGGACATCGACAAA 2902
||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2681 GAATGGTAGGAAGGCTGGTATACAATTCAAGCAGTTAAATGATGACAGGACATCAACAAA 2740
Query 2903 TCAAAGACTCGAGGAGTTAAATGTTGAGTTTGCATCACATCAGGACCACATTAATGTTCT 2962
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2741 TCAAAGACTCGAGGAGTTAAATGTCGAGTTTGCATCTCATCAGGATCACATTAATGTTCT 2800
Query 2963 GGAGGCAGATACTATTGAGAGTAAGGTTTCGTTCGAAGCTCTGAAGCATTATTCGTATGA 3022
||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2801 GGAGGCAGATACTATTGAGAGTAAGATTTCATTTGAAGCTCTGAAGCATTATTCGTATGA 2860
Query 3023 GCTGCAACATAAAAACCATGATCTTGAACTTCTCTGTGATTCATTAAAGCTAAGAAATGA 3082
| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2861 GTTGCAACATAAAAACAATGAACTTGAACTTCTCTGTGATTCATTAAAGCTAAGAAATGA 2920
Query 3083 TAATATCAGTGTAGAAAACACGGAGCTCAATAAGAAGCTGAATTATTGCTCATTGAGAAT 3142
|||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2921 TAATGTCGGTGTAGAAAACACGGAGCTCAAGAAGAAGCTGAATTCTTGCTTATTGAGAAT 2980
Query 3143 TGATGAGCTTGAAATTCAGCTGGAAAACTTACAGCAGAATTTAACTAGCTTTTTGTCCAC 3202
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 2981 TAATGAGCTTGAAATTCAGCTGGAAAACTTACAGCAGAATTTAAGTAGCTTTTTGTCCTC 3040
Query 3203 AATGGAAGAACAGTTAGTGGCCTTGCAGGATGAATCTGAGCGGGCAATGATGGTAGAACA 3262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 3041 AATGGAAGAACAGTTAGTGGCCTTGCAGGATGAATCTGAGAGGGCAATGATGCTAGAACA 3100
Query 3263 TGAATTGACATCATTGATGTCTGAATTTGGTGAAGCAGTTGTGAGGCTTGATGATTGTTT 3322
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3101 TGAACTGACATCATTGATGTCTGAATTTGGTGAAGCAGTTGTAAGGCTTGATGATTGTTT 3160
Query 3323 ACTCAGATCTGGCACTTCTGGAGCTCATACTGGCTTAGATATGACCAAACGCATATCTGG 3382
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3161 ACTCAGATCTGGCACTTCTGGAGCTAATGCTGGCTTAGATATGACCAAGCGCATATCTGG 3220
Query 3383 TTCTGTTGATGTGGCTGTAAACGTGATTGAAGACCTCAAGGAAAAACTAGAAGCAGCTTA 3442
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3221 TTCTGTTGATGTGGCTGTAAAGGTGATTGACGACCTGGAGGAAAAACTTGAAGCTGCTTA 3280
Query 3443 TGTGAAGCATGAGTCCACCTCAAA-CAAATATGAGGAATTGAA 3484
|||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 3281 TGTGAAGCATGAGTCCACGTCAAATCAA-TATGAGGAATTGAA 3322
Score = 119 bits (64), Expect = 4e-25
Identities = 68/70 (97%), Gaps = 0/70 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3526 CTTCTTCAATGCAGAAGGTCTATGCTGATCTGACGAAATTGATTACTGAATCATGTGGGT 3585
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3323 CTTCTTCAATGCAGAAGGTCTATGCCGATCTGACGAAATTGATTACTGAATCATGTGGGT 3382
Query 3586 CAGCGGAGAT 3595
||| ||||||
Sbjct 3383 CAGTGGAGAT 3392
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 322565235183
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5