BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G32620.2
Length=4928
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg328471 jgi|Araly1|328471|fgenesh1_pm.C_scaffold_7000698 7070 0.0
Ahg353618 jgi|Araly1|353618|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000791 366 7e-100
> Ahg328471 jgi|Araly1|328471|fgenesh1_pm.C_scaffold_7000698
Length=4653
Score = 7070 bits (3828), Expect = 0.0
Identities = 4400/4670 (94%), Gaps = 64/4670 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 256 ATGGAAAATAGACTAGGTAACTCTAATGGAGTGGGAATTTCGAAGAAATCCAGGTCTTTA 315
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1 ATGGAAAATAGACTAGTTAACTCTAATGGAGTGGGAATTTCGAAGAAATCAAGGTCTTTA 60
Query 316 GATCTTAAGACGCTCTATAAGTCTAGCATTTCCAAGGATTCAGTGAATAAGAGCTTTAAA 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GATCTTAAGACGCTCTATAAGTCTAGCATTTCCAAGGATTCAGTGAATAAGAGCTTTAAA 120
Query 376 AGAAAACA-TAGGTCT-GGGATTGATGGTGATCAGTTGAAGCAGGACAAGAAGAGCAGGA 433
|||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 121 AGAAAA-ATTAGGTCTGGGGA-TGATGGTGATCAGTTGAAGCAGGACAAGAAGGGCAGGA 178
Query 434 AAGTTGTTTCTCTAAGTAGTTTTAAGAAAGTAGGTAGCCAGAACGAGAGTATTCTGGATA 493
||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 179 AAGTTGTTTCTTTAAGTAGCTTTAAGAAACTCGGTAGCGAGAACGAGAAAATTCTGGATA 238
Query 494 AGGCATGCAATGGCACCACTATATTGCACAATTTGGAGGACTCCAAGGAGGTGGGTTTGG 553
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 AGGCATGCAATGGCACCACCGGATTGCACAATTTGGAGGACTCCAAGGAGGTGGGTTTGG 298
Query 554 ATGAGAAATTGTGTGACAGTAATGGGCTTCAAGTGATTTCTGTTGGTTTGGCAAGTAGTA 613
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 299 ATGAGAAATTGTGTGACAGTAATGGGCTTCAAGGGATTTCAGTTGGCTTGGCAGGTAGTA 358
Query 614 CGATTTATGTTCCTAGACGCAGGAGAGATTTTGTTGGGAGGAGTAGGTTTGAGAATGGCC 673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 CGATTTATGTTCCTAGACGCAGGAGAGATTTTGTTGGGAGGAGTAGGTTTGAGAATGGCC 418
Query 674 TAGCACAGAAGTCTGCAGGGGAGTCTGATAGTCAGGAGGA---GCTGGTTGTTAATATCC 730
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 419 TAGTACAGAAGTCTGCAGGGGAATCTGATAGTCAGGAGGAGGCGCTGGTTGATAATATCC 478
Query 731 CTAAGGTTACTGCTGAAGAATCTAGTGTTCAGGATCAACCCTCTAAAGTTGAAGAGAAGG 790
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 479 CTAAGGTAACTGCTGAAGAATCTAGTGCTCAGGATCAACTCTCTAAAGTTGAAGAGAAGG 538
Query 791 ACTCTGACAAAGATATCAAAGAATCTAATTCCGCAGCTCCGTTGCAGTTGGAAAATGGGC 850
| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 539 AATCTGACAAAGAAATCAAAGAATCGAATTCAGCAGCTCAGTTGCAGTTGGAAAATGGGC 598
Query 851 ATTCTAATCAGTCTCCAGTGAAAGATGATCAGCTGGTTGTTGTTAAACAAAGAAATAGTA 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 599 ATTCTAATCAGTCTCCAGTGAAAGATGATCAGCTGGTTGCTGTTAAACAAAGAAATAGTA 658
Query 911 ACAGCAGAAAAAGGAAGTCCTCAGCATCAAAC-AGACGCGTGGGAAAAGAGGCCAAGTCT 969
| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 659 ATAGCAGAAAAAGGAAGTCCTCAGCATCAAACAAG-CGCTTGGGAAAAGAGGCCAAGTCT 717
Query 970 TCAGGTGATGCTTCTGGTAGAATATCCAAGGTATCACGGGAAGATGATGAGGAGAATCTT 1029
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 718 TCAGGTGATACTTCTGGTAAAATATCCAAGGTATCACGAGAAGATGATGAGGAGAATCTT 777
Query 1030 GAAGCTAATGCTGCAATAATGCTGTCTTCACGGTTTGATCCAAACTGTACCCAGTTTCCT 1089
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 778 GAAGCTAATGCAGCAAGAATGCTGTCTTCACGGTTTGATCCAAAATGCACCCAGTTTCCT 837
Query 1090 TCAAATTCTGTTACTCCTGGTTCACCATCTGCGAGTAGATTGCATCCATTGCCTTCTGGT 1149
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |
Sbjct 838 TCAAATTCTGTTACTCCTGGTTCACCATCTGCCAGCAGATTGCATCCATTATCTTCTGTT 897
Query 1150 AAGAATTCAGTTG-ATCCTCGGTCCGAGTTGCTTAGTTCTAAATGTGTCTCAGATGACAC 1208
||||||| || || |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 898 AAGAATTTAG-TGAATCCTCCGTCCGAGTTGCATAGTTCGAAATGCGTCTCAGATGACAC 956
Query 1209 TGATGATAGAATGTTGCGACCAAGGAGACATAATGATGATGGGAAGGGTAAAGTTCGGAA 1268
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 TGATGATAGAATGTTGCGACCAAGGAGACAGAATGATGATGGGAAGGGTAAAGTTCGGAA 1016
Query 1269 AAGACGCCACTTTTATGAAATTTTGTTTTCAGATGTGGATTCACACTGGTTGTTAAACAA 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 AAGACGCCACTTTTATGAAATTTTGTTTTCAGATGTGGATTCACACTGGTTGTTAAACAA 1076
Query 1329 AAAGATTAAAGTTTTCTGGCCATTGGATGAGAGATGGTATCATGGGTTTGTGGATGGTTT 1388
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 AAAGATTAAAGTTTTCTGGCCTTTGGATGAGAGTTGGTATCATGGGTTTGTGGATGGTTT 1136
Query 1389 CGATGGAGACAAGAACCTGCATCATGTAAAATATGATGATCGTGATGAGGAGTGGATCAA 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 CGATGGAGACAAGAACCTGCATCATGTAAAATATGATGATCGTGATGAGGAGTGGATCAA 1196
Query 1449 CTTACAGGGTGAAAGATTCAAAATTCTGTTGTTTCCTTCTGAAGTTCCTGGAAAAAATCA 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1197 CTTACAGGGTGAAAGATTCAAAATTCTGTTGTTCCCTACTGAAGTTCCTGGAAAAAACCA 1256
Query 1509 GCGGAAAAGGCGTTGTTCAGAGTCAAAGTCTACTCAGAAAGTAAAAGGGAATGATACTTC 1568
||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 1257 ACGGAAAAGGCGCTGTTCAGTGTCCAAGTCTACTCAGAAAATAAAAGGGAATGATACATC 1316
Query 1569 CAGCAAAGACGAGGAGAAGCAGAAGGAAAAGCTAGAAGATGATAGCTGCATGGAATCAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 CAGCAAAGACGAGGAGAAGCAGAAGGAAAAGCTAGAAGATGATAGCTGCATGGAATCAGA 1376
Query 1629 GCCAATCATCACATGGTTGGCTCGGTCTAGACATCGGGACAAATCCTCCACTCTTAAGGC 1688
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 1377 GCCAATCATCACATGGTTGGCTCGGTCTAGGCATCGGGACAAATCTTCCACTGTTAAGGC 1436
Query 1689 TGTACAAAAGCGGaaaaaaaCTGACGTAATGACATCTAATGAATCTGTTAAAATG-A--- 1744
||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |
Sbjct 1437 TGTACAAAAACGGAAAAAATCTGAAGTAATGACATCCAATGAAACTGTGAAAATGAATGG 1496
Query 1745 --ATG--G---G-G--A---T------G-TCACAGATAGATCGGCTAGTTCTCTTGCATC 1784
||| | | | | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1497 GGATGTTGTTAGAGACACTGTAGGACAGTTCACAGATAGATCTGCTAGTTCTCTTGCATT 1556
Query 1785 ATGTGGATTACCTGGACCAAGTAAAAACGAGTTGGAAAGCTCTGGTTTTCGGAATGGTAG 1844
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1557 ATGTGGATTACCTGGACCAAGTGGAAATGAGTTGGAAAGCTCTGGTTTTCGTAATGGTAG 1616
Query 1845 CATATTTCCTATTGTCTATTGTAGGAGAAGACTTCATACAGCAAAGAAGGATATCTACAA 1904
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1617 CATATTTCCTATTGTCTATTGTAGGAGACGACTTCATACAGCAAAAAAGGAAATCTACAA 1676
Query 1905 AGAGTCAGGTTACAATAGTGTTGAGTTTTTGAAGCAGTTTCTTGTATCAAAAAGTCCGGA 1964
| |||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1677 GGGGTCATGTGACAATAATGTTGAGGTTTTGAAGCAGTTTCATGTATCAAAAAGTCCGGA 1736
Query 1965 TCCTGGTGTAGAGTTTTTGCCTATTGAAGATTCTGGGGATCTGGAGCTTTGTTGCCCGTG 2024
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 1737 TCCTGATGTAGAGTTTTTGCCTATTGAAGATTCTGGGGATCTGGAGATTTGTTGTCCGTG 1796
Query 2025 GAATGA-ATCAGAGCAATTTGAGTTGTCCCTCAGCCTACAGGGTGTTTCCTTGATGAGCT 2083
|||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797 GAATGACA-CAGAGCAATTTGAGTTGTCCTTCAGCTTACAGGGTGTTTCCTTGATGAGCT 1855
Query 2084 ACTTTCTTATGGCCGATGTTGACTGGCTTTCACGTGCTGCTCTTTTGCTTCGTCATGGTA 2143
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 ACTTTCTTATGGCGGATGTTGACTGGCTTTCACGTGTTGCTCTTTTGCTTCGTCATGGTA 1915
Query 2144 CACTTGTGACTTTGTGGCCAAGAGTTCGTTTGGAAATGATTTTCCTGAATAACCAAGATG 2203
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 CACTTGTGACTTTGTGGCCAAGGGTTTGTTTGGAAATGATTTTCCTGAATAACCAAGATG 1975
Query 2204 GGTTAAGGTATCTAATTTTTGAAGGCTGCTTAATGGAAGTTGTTCAATTGATTTTCCGTA 2263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 GGTTAAGGTATCTAATTTTTGAAGGCTGCTTAATGGAAGTTGTTCAATTGATTTTCCGTA 2035
Query 2264 TCTTGATGGTAGTAGATCATTCTAATAAGCAAGGAGCACAAGGAGCGGATGCTGACTTGC 2323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 TCTTGATGGTAGTAGATCATTCTAATAAGCAAGGAGCACAAGGAGCGGATGCTGACTTGC 2095
Query 2324 AGTTGCCAGTTTTCTCAATTGGTCTCCAAGTTTCTTGCATCCCAGGTTTCCAAAGGCAGC 2383
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 AGTTGCCAGTTTTCGCAATTGGTCTCCAAGTTTCTTGCATCCCAGGTTTCCAAAGGCAGC 2155
Query 2384 TTGGATTTCAAATCTACAGTTTCCATGAGGTGAAACATTCAAAGTGGTCATACTTGGAAC 2443
||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 TTGCATTTCAATTCTACAGTTTCCATGAAGTTAAACATTCAAAGTGGTCATACTTGGAAC 2215
Query 2444 AGAATGTCAGGAGACATTCTTTGCTGGTTAAGCAAGTATCAATTGCAGAGTGTACTCACA 2503
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2216 AGAATGTCAGGAGGCATTCTTTGCTAGTTAAGCAAGTATCAATTGCAGAGTGTACACACG 2275
Query 2504 ATAACATGAAGGTCCTGCAGAAGGTTATGCAGAAGAGATCTAGGCATGGAATCAGCTCAG 2563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2276 ATAACATGAAGGTCCTGCAGAAGGTTATGCAGAAGAGATCTAGGCATGGAATCAGGTCAG 2335
Query 2564 GCCTTGTTTCTAGAGGATCATCATCTGCTGAAGCGTGGCCCACATCTGTTTGCTACAAGA 2623
|||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 CCCTTGTATCTAGAGGATCGTCATCTGCTAAAGCCTGGCCCACATCTGTTTGCTACAAGA 2395
Query 2624 AGCAAAATACGTCTCCATTTGCACTTCTTTTTACTGCTCGGCCACCTACACTGTTACTCA 2683
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 AGCAAAATACGTCTCCATTTGCACTTCCTTTTACTGCTCGGCCACCTACACTGTTACTCA 2455
Query 2684 GTTTACACTTGAACATGATAAGGGAGCTGGGTCATGATTCAGCAGACTTCCTAGGAATAG 2743
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2456 GTTTACACCTGAACATGATAAGGGAGCTGGGTCATGATTCAGCAGACTTCCTAGGAACAG 2515
Query 2744 AACGCGATTTGGTAACACATAGAGGTTGTGATATGGCAGATTTTACAAATGAGCATTCTG 2803
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2516 AACGCGATTTGGTAACAGATAGAGGTTTTGATATGGCAGATTGCACAAATGAACATTCTG 2575
Query 2804 AACT-GTCTCTCAAGAGTAAGAGCCAAACTGATGAACCAATTATCACTTCTTCCAGA--G 2860
|| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2576 AA-TCCTCTCTCAAGAGTAAGGGCCATAGTGATGAACCAATTATCACTTCTTCCAGAGCG 2634
Query 2861 C-----GC--AAGAGTCAAAAGACCTTCATACTCCGTCTCAAAGTCAGCAGCTGGGGTCT 2913
| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2635 CAAGAAGCGGAAGAGTCAAAAGATCTTCATACTTCGTCTCAAAGGCAGCAGCTGGGGTCT 2694
Query 2914 GATTCTGAAAACTGGATGTCA-TACAGTTCTTCTGTTGTCAGACATAAGCATGAAACCAG 2972
||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 GATTCTGAAAACTGGGTGTCAGT-CAGTTCTTCTGTTGTCAGACATAAGCATGAAACCAG 2753
Query 2973 GTCTAATGTTTCGGTGAATGGGATTAGTATTCAAGTTCCAATATCTGATGATTGTGAGGA 3032
|||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 2754 GTCTAAAGTTCCAGTGAATGGGATTAGTATTCAAGTTCCAGTATCTGATCATTGTGAGGA 2813
Query 3033 TGGTACTCCGCAGTCAAGTAATCTGGCCTTGAATATTCAAGGTAGTAGCAACTCAAGTCC 3092
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||
Sbjct 2814 TGGTACTCCGCAGTCTAGTAATCTGGCCTTGAATATTCAAGGTA--A-CATCTCAAGTCC 2870
Query 3093 AAAGGCCACTGCCCCAAGAAGTATGTGGAACCGAAGTAAAAGTTCTTTAAATGGCCATCT 3152
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2871 AAAGGCCACTGCCCCAAGAAGTATGTGGAGTCGAAGTAAAAGTTCTTTAAATGGCCATCT 2930
Query 3153 CTCGCATGGTTGGTCGGATTCAAAGGGAGACTTTTTGAACACTAATTTGGCAAATGGACC 3212
||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2931 CTCACATGGTTGGTCGGATTCGAAGGGAGACTTTCTGCACACTAATTTGGCAAATGGACC 2990
Query 3213 TAAGAAGCGACGTACCCAAGTGTCTTATTCATTGCCTTCTGGGGGTTCTGATTCTAGAAA 3272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2991 TAAGAAGCGACGTACCCAAGTGTCTTATTCATTGCCTTCTGGAGGTTCTGATTCTAGAAA 3050
Query 3273 CAAAGGTTCCCTGCTCAAGGGGATGCCGAACAAAAGAATTAGAAGGTCTACCGCTGATGT 3332
|||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3051 CAAAGGTTCCCTGCACAAGGGGCTTCCGAACAAAAGAATTAGGAGGTCTACTACTGATGT 3110
Query 3333 TACCAAAGGTATTCAGAAAGATCTCGAGTCTAGTTTATGTGATGCCAATGTATTAGTCAC 3392
| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3111 TTCCAGAGGTATTCAGAAAGATTTGGAGTCTAGTTTATGTGATGCCAATATATTAGTCAC 3170
Query 3393 TCTTGGTGATAGAGGCTGGCGAGAATATGGAGCTCAGATTTTCCTGGAACCTTTTGATAA 3452
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3171 TCTTGGTGACAGAGGCTGGAGAGAATATGGAGCTCAGATTTTCTTGGAACCTTTTGATAA 3230
Query 3453 TAATGAATGGAGACTTGCGGTAAAAATCTCAGGGACAACAAAATACTCACACAGGGCACA 3512
|||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3231 TAATGAATGGAGACTTGCAGTGAAAATCTCAGGGACGACAAAATACTCACACAGGGCACA 3290
Query 3513 TCAATTTCTGCAACCTGGGTCAGTGAATAGGTTTACACATGCTATGATGTGGAAAGGTGG 3572
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 TCAGTTTCTGCAACCTGGGTCAGTGAATAGGTTTACACATGCTATGATGTGGAAAGGTGG 3350
Query 3573 AAAAGATTGGACCTTGGAGTTCCCTGATAGGGGCCAGTGGTTCCTTTTTAAAGAGATGCA 3632
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3351 AAAAGATTGGACCCTGGAGTTCCCTGATAGGGGCCAGTGGTCCCTTTTTAAAGAGATGCA 3410
Query 3633 TGAAGAGTGCTACAATAGAAATACTCGGGCTGCTTTAGTTAGAAATATTCCTATTCCTGG 3692
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 TGAAGAGTGCTACAATAGAAATAGTCGGGCTGCTTTAGTTAGAAATATTCCTATTCCTGG 3470
Query 3693 CATCCGCATGATAGAAAGGGATAATTTTGATGGAACAGAAACTGAATTTATTCGCAGTTC 3752
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3471 CATCCGCATGATAGAAAGGGAAAATTCTGATGGAACAGAAACTGAATTTATTCGCAGTTC 3530
Query 3753 TTCTAAATATTTTCGGCAGACTGAAACTGATGTTGAGATGGCATTAGATCCTTCACGTGT 3812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3531 TTCTAAATATTTTCGGCAGACTGAAACTGATGTTGAGATGGCATTAGATCCTTCACGTGT 3590
Query 3813 TATGTATGACATGGACAGCGATGATGAGCAGTGCCTTTTGAGAATTCGTGAGTGTTCG-A 3871
| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3591 TTTGTATGACATGGACAGTGATGATGAGCAGTGCCTTTTGAGAATTCGTGAGTGTTCGGA 3650
Query 3872 GTGCTGAGAATAGTGGCTCTTGTGAGATCACTGAGGACATGTTTGAGAAGGCAATGGACA 3931
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3651 -TGCTGAGAATAGTGGCTCTTGTGAGATTACTGAGGACATGTTTGAGAAGGCAATGGACT 3709
Query 3932 TGTTTGAGAAGGCTTCATTTGTAAAGCAGCGTGATAACTTTACCTTAATCGAAATTCAAG 3991
|||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3710 TGTTTGAGAAGGCTTCGTATGTAAAGCAGCGTGATCACTTTACCTTAATCGAAATTCAAG 3769
Query 3992 AATTGACGGCTGGAGTTGGATCCTTGGAAGCAATGGAAACAATATATGAGCTTTGGAGAA 4051
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3770 AATTGACGGCTGGAGTGGGATCCTTGGAAGCAATGGAAACAATATATGAGCTTTGGAGAA 3829
Query 4052 CAAAGAGGCAGAGGAAGGGAATGCCATTGATCAGGCATCTTCAGCCACCTCTATGGGAAA 4111
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3830 TAAAGAGGCAGAGGAAGGGAATGCCGTTAATCAGGCATCTTCAGCCACCTCTGTGGGAAA 3889
Query 4112 AATATC-AAAGGGAGCTCAAAGACTGGGAGTTGGTTATGAGCAAAGCAAACACTCCAAAT 4170
|||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3890 AATATCTAAAAG-AGCTCAAAGACTGGGAGTTGGTTATGAGCAAAGCAAACACTCCAAAT 3948
Query 4171 TCCTGTGGGTCGCAGAAGAAACAGTCACCTACTGAGAAGCCAGCGATGTTTGCTTTCTGT 4230
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3949 TCCTGTGGGTCACAGAAGAAACAGTCACCTATTGAGAAGCCAGCGATGTTTGCTTTCTGT 4008
Query 4231 TTTAAGCCTCGAGGTTTGGAAGTCAAACACAGGGGAACAAAACACAGGTCACAGAAGAAA 4290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4009 TTTAAGCCTCGAGGTTTGGAAGTCAAACACAGGGGAACAAAACACAGGTCACAGAAGAAA 4068
Query 4291 CTCTCAGTTTATGCTCAACATAGTTCTGCTTTGGGAGATTATGATGGCTGTAATTCATCA 4350
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4069 ATCTCGGTTTATGCTCAACATAGTTCTACTTTGGGAGATTATGATGTCTATAATTCATCA 4128
Query 4351 GCAGGAAGAAGACCTGTTGGTTTTGTCTCTGGCGACGAGAGGTTTTTATATTCAAATCAA 4410
||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||
Sbjct 4129 GCAGGAAGAAGACCTGTTGGTTTTGCCTCTGGAGATGAAAGGTTTTTATATTCAAATCAA 4188
Query 4411 AGCTATGAGCAC-TCGAATGAATTTTCTGTACATCCAGGAACATATTCCCCTCGTGACCT 4469
||||||||| || | |||||||| | || | ||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4189 AGCTATGAGAACGT-GAATGAATATCCTATGCATCCGGGAACATATTCCCCCCGTGACCT 4247
Query 4470 AGGCATGGGATATTTCTCGAGCGGTGGAAATGGATATCATAGGAATCACCAAAACAAGTC 4529
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4248 AGGCATGGGATATTTCTCGAGCGGTGGAAATGGATATCATAGGAATCACCAAAACAAGTT 4307
Query 4530 GCAAAGAATCAATGGGAAGAGGAATACGAGTGAACGATGGGATGCAGGCTATTCTGAATG 4589
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4308 GCAAAGAGTCAATGGGAAGAGGAATACGAGTGAACGATGGGATGGAGGCTATTCTGAATG 4367
Query 4590 CCCCAGTTCCAATCTTGTCTGTTACTCCAACGGATCTCAGCGTCCTGATGTGGAAGGAAT 4649
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 4368 CCCCAGTTCCAATCTTGTCTGTTACTCTAACGGATCTCAGCGTCCTGATCTGGAAG-AAT 4426
Query 4650 -ACGGAATAGTACAGACATTGATGAGTACAAATTGCGAGATGCAGCTGGTGCTGCAAGGC 4708
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4427 TACAGAATAGTACAGATATTGATGAGTACAAATTGCGAGATGCAGCTGGTGCTGCAAGGC 4486
Query 4709 GAGCATGCGCTTTGGCGAAGCTCAAGCGGGAAAGAGCAGAGAGTTTGAGGTACAAAGCAG 4768
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4487 GAGCATGCGCATTGGCGAAGCTCAAGCGAGAAAGAGCAGAGAGTTTGAGGTACAAAGCAG 4546
Query 4769 ATCTAGCGATCCAGAAAGCTGCAGCTGCTCTCATGTGTGCAGAGGCAGTTAAAGCTTCTT 4828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4547 ATCTAGCGATCCAGAAAGCTGCAGCTGCTCTCATGTGTGCAGAGGCAGTTAAAGCTTCTT 4606
Query 4829 CCGAGGACCTAGGCAACAACAATGGGGTAGAAAGCTCAAGCGAAGGATGA 4878
| | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4607 CTGTGGACCTAAGCAACAA---TGGGTTAGAAAGCTCAAGCGAAGGATGA 4653
> Ahg353618 jgi|Araly1|353618|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000791
Length=339
Score = 366 bits (198), Expect = 7e-100
Identities = 249/272 (92%), Gaps = 10/272 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 4507 CATAGGAATCACCAAAACAAGTCGCAAAGAATCAATGGGAAGAGGAATACGAGTGAACGA 4566
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 13 CATAGGAATCACCAAAACAAGTTGCAAAGAATCAATGGGAAGAGGAACACGAGTGGACGA 72
Query 4567 TGGGATGCAGGCTATTCTGAATGCCCCAGTTCCAATCTTGTCTGTTACTCCAACGGATCT 4626
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 TGGGATGCAGGCTATTCTGAATGCCCCAGTTCCAGTCTTGTCTGTTACTCCAACGGATCT 132
Query 4627 CAGCGTCCTGATGTGGAAGGAAT-ACGGAATAGTACAGACATTGATGAGTACAAATTGCG 4685
|||| || |||| |||||| ||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 133 CAGCTTCATGATCTGGAAG-AATTACAGAACAGTACAGATATTGATGAGTACAAATTGAG 191
Query 4686 AGATGCAGCTGGTGCTGCAAGGCGAGCATGCGCTTTGGCGAAGCTCAAGCGGGAAAGAGC 4745
||||| |||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 192 AGATGGAGCTGGTGCTGCAAGGCG--C-T----TT-GGCGAAGCTCAAGCGAGAAAGAGC 243
Query 4746 AGAGAGTTTGAGGTACAAAGCAGATCTAGCGA 4777
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 AGAGAGTTTGAGGTACAAAGCAGATCTAGCGA 275
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 186520165273
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5