BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G32640.1
Length=3942
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg491448 jgi|Araly1|491448|fgenesh2_kg.7__881__AT4G32640.2 5515 0.0
Ahg484854 jgi|Araly1|484854|fgenesh2_kg.5__846__AT3G44340.1 1746 0.0
> Ahg491448 jgi|Araly1|491448|fgenesh2_kg.7__881__AT4G32640.2
Length=3458
Score = 5515 bits (2986), Expect = 0.0
Identities = 3246/3371 (96%), Gaps = 19/3371 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTGAATTTTCTGTCTTCTCTTACGGACAACAAAATTTTAGTTTTTATCAGTCGTCTGAA 60
||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1 TGTGAATTTTCTGTC-T-TC-TACGGACAACAAATTTTTAGTTTTGATTGGTCGTCTGAA 57
Query 61 TCCTGTGACAGACACCGACGCCGTTAACCGTCGTCGCTGTCG-CTGTGTCTCTCTTTCTC 119
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||
Sbjct 58 TCCTGTGACACACACCGACGCCGTTAACCGTCGTCGCTGT-GTATCTCTCTCTCTTTCTC 116
Query 120 ACTCTGTTCCATAGATCTGAGCTTCTATCAATA-TTCTCGGATCGCTATCAGTCAAATCT 178
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 117 ACTCTGTTCCATAGATCTGAGCTTCTACCAATATTTC-CCGATCGCTATCAGTCAAATCT 175
Query 179 T---AAGAATTTCGTCGCTTTAGCTCAATTCGGACTTTAGATTGTGGAGGAA-GTTTTAG 234
| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||| |
Sbjct 176 TAAGAAGAATTTCCACGCTTTAGCTCAATT----C---AGATTGTTGAGCAAGGTTTT-G 227
Query 235 GATTTGATCTCCATCTCGTATCCAAGCATGGTTGCTCCTGTGCCTCCAGGGGCACCTAGA 294
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 228 GGTTTGATCTCCATCTCGTATCCAAGCATGGTTGCTCCTGTGCCTCCAGGGCCACCTAGA 287
Query 295 CCCAACAGCCAGCAAAATTCCGGGCCACCTAATTTCTACCCGGGTTCACAAGGGAACTCA 354
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 CCCAACAGTCAGCAAAATTCCGGGCCACCAAATTTCTACCCGGGTTCACAAGGGAACTCA 347
Query 355 AATGCTTTAGCCGACAATATGCAGAACTTGAGCTTGAATCGACCACCTCCGATGATGCCT 414
||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 AATTCTTTAGCCGACAATATCCAGAATTTGAGCTTGAATCGACCACCTCCGATGATGCCT 407
Query 415 GGCTCAGGTCCTAGACCACCTCCTCCTTTTGGTCAGTCACCACAGCCTTTCCCTCAGCAA 474
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 408 GGCTCAGGTCCTAGACCACCTCCTCCTTTTGGTCAGTCTCCACAGCCTTTCCCTCAGCAA 467
Query 475 TCCCCTTCTTATGGAGCTCCGCAACGTGGGCCTTCACCCATGTCCCGGCCTGGACCTCCA 534
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 468 TCCCCTTCTTATGGAGCTCCTCAACGTGGGCCTTCACCCATGTCCCGGCCTGTACCTCCT 527
Query 535 GCTGGCATGGCGAGACCAGGTGGTCCGCCTCCTGTATCACAACCAGCTGGGTTTCAGTCA 594
||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 528 GCTGGGATGGCGAGGCCAGGTGGTCCCCCTCCGGTATCACAACCAGCTGGATTTCAGTCA 587
Query 595 AATGTACCCTTGAACAGACCCACTGGTCCACCTTCTCGTCAGCCATCATTTGGGTCTAGA 654
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 588 AATGTACCCTTGAACAGACCCACTGGTCCACCTTCTAGTCAGCCACCATTTGGCTCTAGA 647
Query 655 CCTTCAATGCCTGGAGGACCAGTGGCGCAGCCTGCCGCCTCTTCTAGTGGTTTTCCAGCT 714
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 648 CCGTCAATGCCTGGAGGACCAGTGCCGCAGCCTGCCGCCTCATCTAGTGGTTTTCCAGCT 707
Query 715 TTTGGTCCATCAGGTAGTGTAGCTGCAGGTCCTCCTCCAGGATCTCGCCCAATGGCATTT 774
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 708 TTTGGTCCATCAGGTAGTGTAGCTGCAGGTCCTCCTCCAGGAGCTCGCCCAATGGCATTT 767
Query 775 GGTTCACCTCCACCTGTCGGATCTGGCATGTCTATGCCTCCCTCAGGCATGATTGGTGGT 834
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 768 GGTTCACCTCCACCTATCGGATCTGGCATGTCTATGCCTCCCTCAGGCATGCTTGGTGGT 827
Query 835 CCAGTCAGTAATGGGCATCAAATGGTTGGTTCAGGGGGATTTCCGAGGGGAACCCAGTTC 894
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 CCAGTCAGTAATGGGCATCAAATGGCTGCTTCAGGGGGATTTCCGAGGGGAACCCAGTTC 887
Query 895 CCCGGTGCTGCTGTTACAACTCCACAGGCACCCTATGTGCGGCCTCCTTCAGCACCTTAC 954
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |
Sbjct 888 CCCGGTGCTGCTGTTACAACTCCACAGTCACCCTATATGCGGCCTCCCTCAGCACCTTTC 947
Query 955 GCTCGGACTCCTCCGCAGCCACTAGGTTCACATTCTCTTTCCGGAAATCCACCATTAACT 1014
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 948 GCTCGGGCTCCTCCGCAGCCACTAGGTACACATTCTCTTTCTGGAAATCCACCATTAAAT 1007
Query 1015 CCGTTTACTGCTCCTTCAATGCCCCCACCAGCAACCTTTCCTGGAGCCCCTCATGGCAGG 1074
| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 CTGTCTACTGCTCCTTCAATGCCCCCACCGGCAACCTTTCCTGGAGCCCCTCATGGCAGG 1067
Query 1075 CCAGCGGTATCAGGCTTGCCTTATGGTCCACCATCAGCGCAGGTTGCCCCACCTCTAGGC 1134
|||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1068 CCAGCGGTATCAAACTTGCCTTACGGTCCACCATCAGCGCAGGTCCCCCCTCCTCTAGGC 1127
Query 1135 TTTCCTGGTCAAATGCAACCACCAAGATATGGGATGGGTCCTTTGCCAAATCAGTCGATG 1194
|||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 TTTCCTGGCCCAATGCAACCACCAAGATATGGCATGGGTCCTTTGCCAAATCAGTCGATG 1187
Query 1195 ACCAACATACCCACTGCCATGGGCCAACCTGGTGCCACTGTTCCTGGACCCTCAAGAATT 1254
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 ACCAACATACCCACTGCCATGGGCCAACCCGGTGCCTCTGTTCCTGGACCCTCAAGAATT 1247
Query 1255 GATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAACTGTATTTGAAACTCGC 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1248 GATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAACTGTGTTTGAAACTCGC 1307
Query 1315 CAGAGTAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAGTGATTATGTTGTTCGAGACACC 1374
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308 CAGAATAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAGTGATTATGTTGTTCGAGACACT 1367
Query 1375 GGAAATTGTAGTCCCCGTTACATGAGGTGTACCATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGAT 1434
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 GGAAATTGTAGTCCCCGTTACATGAGGTGTACGATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGAT 1427
Query 1435 CTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCAACCGCTGGCGCTTTCTCAT 1494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1428 CTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCAACCTCTGGCGCTTTCTCAT 1487
Query 1495 CCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 CCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCA 1547
Query 1555 CGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATC 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 CGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATC 1607
Query 1615 TGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCA 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 TGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCA 1667
Query 1675 GATGGTAGACGTAGGGATGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTT 1734
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 GATGGTAGACGCAGGGACGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTT 1727
Query 1735 GTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGCAGTATATTTTTTCCTCATT 1794
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1728 GTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGCAGTGTATTTTTTCCTCATT 1787
Query 1795 GATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAG 1854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 GATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAG 1847
Query 1855 CAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGTTGGGATTGCTACATTTGAC 1914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1848 CAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGTTGGGATTGCTACGTTTGAC 1907
Query 1915 TCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTC 1974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 TCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTC 1967
Query 1975 CCTGATGTACAAGATGTCTATACACCTTTAGAAACAGATGTTGTAGTTCAGCTATCTGAG 2034
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1968 CCTGATGTACAAGATGTTTATACACCATTAGAAACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAG 2027
Query 2035 TGCCGTCAACACCTAGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAA 2094
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028 TGCCGTCAACATCTGGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAA 2087
Query 2095 ATTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAA 2154
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2088 ACTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAA 2147
Query 2155 GGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCT 2214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 GGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCT 2207
Query 2215 TCTAGAGAGGCCGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTA 2274
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208 TCTAGAGAGGCTGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTA 2267
Query 2275 CTACAACCAGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTC 2334
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268 CTACAACCGGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTC 2327
Query 2335 TGTGTAGATATATTTATCACAACTCAGGCCTATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTTATT 2394
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2328 TGTGTTGATATATTTATCACAGCTCAGGCCTATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTCATT 2387
Query 2395 CCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCT 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388 CCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCT 2447
Query 2455 CCCAAGCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTC 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2448 CCCAAGCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTC 2507
Query 2515 ATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAATACTCTGGGAATTTCTGCAAA 2574
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2508 ATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAATACTCGGGGAATTTCTGCAAA 2567
Query 2575 CGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCGGAA 2634
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2568 CGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAA 2627
Query 2635 TGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATACTACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT 2694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628 TGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATACTACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT 2687
Query 2695 ACCACATTATCACTCTCCTGTACAAACATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTA 2754
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688 ACCACATTATCACTCTCCTGTACGAACATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTA 2747
Query 2755 GATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCTAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTT 2814
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2748 GATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCGAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTT 2807
Query 2815 CCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATAGTTGCATAAATGCACTCTATGCCTACCGTAAA 2874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 CCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATAGTTGCATAAATGCACTCTATGCCTACCGTAAA 2867
Query 2875 TTTTGTGCTACAGTGACATCATCTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT 2934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868 TTTTGTGCTACAGTGACATCATCTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT 2927
Query 2935 CCATTATACACTCTCGCATTGACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGAAGAATTGAT 2994
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2928 CCATTATATACTCTCGCATTGACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGGAGAATTGAT 2987
Query 2995 GATCGATCATTCTGGATCAACTATGTGTCTTCCCTTTCTACTCCTTTGGCAATCCCATTG 3054
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2988 GATCGATCATTCTGGATTAACTATGTATCTTCCCTTTCTACTCCTTTGGCAATCCCATTG 3047
Query 3055 GTTTATCCGAGAATGATTTCTGTTCACGACCTTGATGTGAAGGACACTGAGGGATCGGTC 3114
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3048 GTTTATCCCAGGATGATTTCTGTTCACGACCTTGATGCGAAGGACAATGAGGGATCGGTT 3107
Query 3115 CTTCCTCCTCCAATCCCATTGTCAGGTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTT 3174
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 CTTCCTCCTCCAATCCCATTGTCAAGTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTT 3167
Query 3175 GAGAATGGTGAAGACGGTCTACTATTTGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAG 3234
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3168 GAGAATGGTGAAGACGGTCTACTATATGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAG 3227
Query 3235 AAACTTTTTGCTGTTTCTTCAGCTGCTGAAATTCCTAACCAGTTTGTGCTGCAGCAGTAT 3294
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3228 AAACTTTTTGGTGTTCCTTCAGCTGCTGAAATTCCTAGCCAGTATGTGCTGCAGCAGTAT 3287
Query 3295 GATAATCAGTTATCAAAGAAATTCAATGATGCGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGT 3354
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3288 GATAATCAGTTATCAAAGAAGTTCAATGATGCTGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGT 3347
Query 3355 TCTTACCTAAG 3365
|||||||||||
Sbjct 3348 TCTTACCTAAG 3358
Score = 139 bits (75), Expect = 1e-31
Identities = 98/108 (91%), Gaps = 6/108 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 3518 AGGAGTCCTTACAGAAGTTTCCTCCCATCTGCATCTGTGTCATGTTCGGAATTTGCGGTA 3577
||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 3357 AGGAGTCCTTACAGAAGTTTCGT--C--C--CATCTGTGTCATGTACGGAATTTGTGGTA 3410
Query 3578 GAAAAGCATAGCAGAAGGGGAAAGGGCATCGGTCTTATGGCTGCTTGA 3625
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3411 GAAAAGCATAGCAGAAGGGGAAAGGGCATTGGTCTTATGGCTGCTTGA 3458
> Ahg484854 jgi|Araly1|484854|fgenesh2_kg.5__846__AT3G44340.1
Length=3669
Score = 1746 bits (945), Expect = 0.0
Identities = 1232/1371 (90%), Gaps = 18/1371 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1243 CCCTC-AAGAATTGATCCT-AATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAA-C- 1298
||||| ||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 1087 CCCTCAAAG-ATTGAT-CTGAATCAGATACCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGTCCAATCA 1144
Query 1299 TGTATTTGAAACTCGCCAG-AGTAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAG-TGAT 1356
|||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||
Sbjct 1145 TGTA--TGAAACTCGTGTGCAG-AATCAGGCTAATCCTCCACCACCTACTACT-GTTGAT 1200
Query 1357 TATGTTGTTCGAGACACCGGAAATTGTAGTCCC-CGTTACATGAGGTGTACCATCAATCA 1415
||| || | | ||||| ||||||| || ||| ||||||||| | || || ||||||||
Sbjct 1201 TATATTACTAGGGACACTGGAAATTCCAG-CCCGCGTTACATGCGATGCACAATCAATCA 1259
Query 1416 GATCCCATGTACAGTTGATCTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCA 1475
|||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||
Sbjct 1260 GATCCCTTGCACTGTTGATCTTCTATCTACATCTGGTATGCAACTGGCGTTAATAGTCCA 1319
Query 1476 ACCGCTGGCGCTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGG 1535
||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1320 ACCAATGGCACTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATCCAAGTTGTGGACTTTGGTGAGAG 1379
Query 1536 TGGGCCTGTTCGATGTTCACGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGA 1595
||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1380 TGGCCCTGTTAGATGTTCACGTTGTAAGGGCTACATGAATCCTTTTATGAAGTTCATTGA 1439
Query 1596 CCAAGGAAGGAAGTTCATCTGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTA 1655
|||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1440 CCAAGGAAGGAAGTTCATATGTAACTTGTGTGGATACACTGATGAGACTCCTCGTGACTA 1499
Query 1656 TCACTGTAATCTGGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTG 1715
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 1500 CCAATGTAATCTGGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGCTGATGAAAGGCCTGAGCTGTG 1559
Query 1716 TAGGGGAACCGTTGAGTTTGTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGC 1775
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1560 TAGGGGAACTGTTGACTTTGTTGCTACAAAAGAATATATGGTACGAGATCCAATGCCAGC 1619
Query 1776 AGTATATTTTTTCCTCATTGATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGC 1835
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1620 AGTATATTTCTTCCTCATTGATGTCTCAATGAATGCGATTCAAACAGGTGCAACTGCAGC 1679
Query 1836 TGCTTGCAATGCAATCCAGCAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGT 1895
| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TACTTGCAGTGCAATCCAGCAAGTCCTCTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGT 1739
Query 1896 TGGGATTGCTACATTTGACTCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCA 1955
||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1740 TGGAATTGCCACATTTGATTCAACAATTCACTTTTATAATTTGAAGCGTGCACTGCAGCA 1799
Query 1956 GCCATTGATGCTCATTGTCCCTGATGTACAAGATGTCTATACACCTTTAGAAACAGATGT 2015
||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 GCCGTTGATGCTCATTGTTCCTGATGTTCAAGATGTGTATACACCTTTAGAAACAGATGT 1859
Query 2016 TGTAGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAAC 2075
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 1860 CATTGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGATTTTGCTGGAAAGTATCCCAAC 1919
Query 2076 GATGTTTCAGGAAAGTAAAATTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTT 2135
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1920 AATGTTTCAGGAAAGTAAGAGTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCCGCATT 1979
Query 2136 CTTGGCGATGAAGAGCAAAGGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGT 2195
||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1980 CTTAGCGATGAAGAGCACTGGAGGAAAGCTCATGGTGTTTCAATCAGTTTTGCCTTCTGT 2039
Query 2196 TGGTGTTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAGGCCGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTG-GTG 2254
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||
Sbjct 2040 TGGCATTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAGGCCGATGGGAGAGCTAATGCCTCTGC-GAGTG 2098
Query 2255 AAAAGGAGGCCCATAAATTACTACAACCAGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTG 2314
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 2099 AAAAGGAGGCCCATAAATTACTTCAACCCGCAGACAAAACTTTAAGGACCATGGCTATTG 2158
Query 2315 AATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATATATTTATCACAACTCAGGCCTATGTTGACA 2374
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2159 AATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATTTGTTTATCACAACTCAAGCCTATGTTGACA 2218
Query 2375 TGGCTTCAATTTCCGTTATTCCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTT 2434
||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2219 TGGCTTCAATTTCCGAGATCCCAAGAACAACTGGAGGACAGGTTTATTGCTATTACCCTT 2278
Query 2435 TCTCAGCTCTCTCAGATCCTCCCAA-GCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGG 2493
|||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||
Sbjct 2279 TCTCAGCTCTTTCAGACCC-CCCAAAGCTATACAACGATCTTAGATGGAATATCACGAGG 2337
Query 2494 CCACAGGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAA 2553
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2338 CCCCAAGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGTCAGGGTATTCAAGTGCATGAA 2397
Query 2554 TACTCTGGGAATTTCTGCAAACGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCG 2604
||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2398 TACTCAGGGAATTTCTGTAAACGCATACCAACTGACATCGATCTACCAGCG 2448
Score = 791 bits (428), Expect = 0.0
Identities = 759/917 (83%), Gaps = 29/917 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2604 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCGGAATGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATAC 2663
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2484 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAATGTGGTTTCCAGTGTGCCCTTCTGTATAC 2543
Query 2664 TACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTTAC--CACATTATCACTCTCC-TGTACAAA 2720
|| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| || ||||||||
Sbjct 2544 CACCATATCTGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT-CTTAAC-TTATCGCTC-CCTTGTACAAA 2600
Query 2721 CATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTAGATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAA 2780
|||||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2601 CATGCTCAGTAACTTGTTCCGCTCAGCTGACCTGGATTCCCAATTTGCTTGTATGCTGAA 2660
Query 2781 ACAAGCGGCTAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTTCCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAA 2840
||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661 ACAAGCGGCTAATGAGATCCCTTCCAAGGCACTTCCGTTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAA 2720
Query 2841 TAGTTGCATAA--ATGCACT-CTATGCCTACCGTAAATTTTGTGCTACAGTGACATCATC 2897
|| |||||| | || ||| | || |||| |||||||| || |||||||| |||||| |
Sbjct 2721 TAATTGCATCACCAT--ACTAC-ATTCCTATCGTAAATTCTGCGCTACAGTTACATCAAC 2777
Query 2898 TGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT-CCATTATACACTCTCGCATTGA 2956
||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || ||||| |||||||| || |
Sbjct 2778 CGGACAACTTATTCTTCCTGAAGCACTCAAGCT-TTTGCCTTTATATACTCTCGCCTTAA 2836
Query 2957 CCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGAAGAATTGATGATCGATCATTCTGGATCAACT 3016
||||| ||||||| ||| | | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 2837 CCAAAGGTGTGGGGTTACGAATGGACGGGAGAATTGATGACCGATCATTTTGGATAAACC 2896
Query 3017 ATGTGTCTTCCCTT-TCTACTCCTTTGGCAATCCCATTGGTTTATCCGAGAATGATTTCT 3075
|||||||||| || || ||||||||||| || || | |||||||| || |||||| ||
Sbjct 2897 ATGTGTCTTCA-TTGTCCACTCCTTTGGCTATTCCGCTAGTTTATCCAAGGATGATTGCT 2955
Query 3076 GTTCACGACCTTGATGTGAAGGACACTGAGGGATCGGTCCTTCCTCCTCCAATCCCATTG 3135
|| || ||||||||||| || || | ||| | | || ||||| ||||||||||||
Sbjct 2956 GTCCATGACCTTGATGTAAACGATAATGAAGAAAATGTGGTTCCTTGTCCAATCCCATTA 3015
Query 3136 TCAG-GTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTTGAGAATGGTGAAGACGGTCT 3194
|| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |
Sbjct 3016 -CAAAGTGAACACCTTAGCGATGAGGGAGTATATTTTCTTGAGAACGGTGAAGATGGTTT 3074
Query 3195 -ACTATTTGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAGAAACTTTTTGCTGTTT-CT 3252
| ||| | |||| ||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| |||| ||
Sbjct 3075 GA-TATATATTGGGGAATCAGTAAATTCAGATATCCTACAGAAGCTCTTTAATGTTCACT 3133
Query 3253 TCAGCTGCTGAAATTCCTAACCAGTTTGTGCTGCAGCAGTATGATAATCAGTTATCAAAG 3312
||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3134 -CAGCTGCTGAACTTCAAAATCAGTATGTGCTGCAAAAGTATGATAATCAGCTATCAAAG 3192
Query 3313 AAATTCAATGATGCGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGTTCTTACCTAAGAATAAAA 3372
|| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||
Sbjct 3193 AAGTTCAATGACGTGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGAAGTTCTTACCTACGCCTTAAA 3252
Query 3373 TTGTGCAAGAAGGGAGAACCATCAGGAA-T--GTTGTTTCTCTCGTATATGGTAGAGGAC 3429
||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct 3253 TTGTGCAAGAAAGGAGATCCAGCAGGAAATATGTTGTTCCAATCGTATATGGTGGAGGAC 3312
Query 3430 AGGACAGCAAGCGGCCCGTCGTATGTGGAGTTTCTCGTG-CAAGTCCATCGCCAAATCCA 3488
||| | | || || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||
Sbjct 3313 AGGGGATCGAGTGGGCCTTCGTACGTGGAGTTTCTCGTTTCA-GTTCACCGTCAAATCCA 3371
Query 3489 GCTAAAAA-TGAACTGA 3504
| | ||| ||||||||
Sbjct 3372 AC-ACAAACTGAACTGA 3387
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 148995398295
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5