BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G32700.2
Length=7100
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg888834 jgi|Araly1|888834|Al_scaffold_0007_820 1.070e+04 0.0
> Ahg888834 jgi|Araly1|888834|Al_scaffold_0007_820
Length=6444
Score = 1.070e+04 bits (5794), Expect = 0.0
Identities = 6251/6471 (97%), Gaps = 33/6471 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 124 ATGGACTCAGATTCTTCTAAATCGCGGATTGATCAGTTTTATGTATCGAAGAAGAGGAAA 183
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACTCAGATTCCTCGAAATCGCGGATTGATCAGTTTTATGTATCAAAGAAGAGGAAA 60
Query 184 CACCAGTCACCAAATTT-AAAGTCTGGGAGGAATGAGAAAAATGTGAAGGTGACAGGGGA 242
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 61 CACCAGTCACCAAATTTGAAA-TCTGGGAGAAATGAGAAAAATGTGAAGGTGACAGGAGA 119
Query 243 AAGATCTCCTGGAGACAAAGGCACTTTGGACAGTTACTTGAAAGCCTCTCTGGATGACAA 302
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 AAGATCTCCTGGAGACAAAGGCACTTTGGACAATTACTTGAAAGCCTCTCTGGATGACAA 179
Query 303 GAGTACTACCAATAGTGGGTTGCAGGCAAGGCAGGAAGCGTTTACAAGAAAATTGGATTT 362
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 GAGCACTACCAATAGTGGGTTGCAGGCAAGGCAGGAGGCGTTTACAAGAAAATTGGATTT 239
Query 363 GGAGGTTTCTGCTTCGTCTGTTGGTCAAAATATACACCCTTGCCTGCCTAAACCTGTAAG 422
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 240 GGAGGTTTCTGCTTCGTCTGTTGGTGAAAATATAAACCCCTGCCTGCCTAAACCTGTAAC 299
Query 423 TTTTGCAACTTTTAAGGAGTGTTTGGGCCAGAACGGATCTCAAGATTTGCATAAAGAAGG 482
| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 300 TATTGCAACTTTTAAAGAGTGTTTGGACCAGAACGGATCTCGAGATTTGCATAAAGAAGG 359
Query 483 TGTTGCAGCTGAAACTCATGCTACAGATGGTTTACTCTGTGCTAACCAGAAAGATAATTC 542
||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TGTTGCAGCTGAAGCTCATGCAACAGATGGTTTGCACTGTGCTAACCAGAAAGATAATTC 419
Query 543 AGAACTACGAGACTTTGCCACTAGTTTCTTGTCCTTGTATTGTAGTGGAGTGCAGTCTGT 602
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 420 AGAACTAAGAGACTTTGCCACTAGTTTCTTGTCCTTGTATTGTAGTGGTTTGCAGTCTGT 479
Query 603 TGTTGGCTCACCTCCACATCAGAAGGAAAATGAATTGAAGCGTCGAAGCAGTTCATCATC 662
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TGTTGGCTCACCTCCACATCAGAAGGCAAATGAACTGAAGCGTCGAAGCAGTTCATCATC 539
Query 663 ACTTGCCCAAGATATACAAATTTCTCACAAGAGGCGTTGTGAGTCCGAAAATATACCATC 722
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 ACTTGCCCAAGATATACAAAGTTCTCACAAGAGGCGTTGTGAGTCCGAAAATATACCATC 599
Query 723 ACTAGATGATCTTACAAATCCTCTCGGGAGTAAGCCTGAATCACTCGCTAGGAATGGTAA 782
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 600 ACTAGATGATCTTGCAAATCCTCTCGGGAGTAAGCCTGAATCACTCGCTAGGAATGGTGA 659
Query 783 TAATAGAGATAAACCTGTTTCAGACCCTACAAAGAAGATGCCGAGCAATGAATCTGTTGA 842
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 660 TAATAGAGATAAATCTGTTTCAGACCATACAAAGAAGATGCCGAGCAATGAATATGTTGA 719
Query 843 AATTCCAATGGGCTTGAGGAAGTGTAGTAAGGCGCCAGAATCATCTGCTCATCTAACTGA 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AATTCCAATGGGCTTGAGGAAGTGTAGTAAGGCGCCAGAATCATCTGCTCATCTAACTGA 779
Query 903 ATTCCACACGCCTGGATCAGCCATTAAATCATGTCCTGTTGGAACCCCTAAGTCAGGATG 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 780 ATTCCACACGCCTGGATCAGCCATTAAATCATGTCCTGTTGGAACCCCTAAGTCAGGAAG 839
Query 963 TGGTAGCTCAATGTTCTCACCTGGTGAGGCTTTCTGGAATGAAGCAATTCAAGTTGCTGA 1022
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TGGTAGCTCAATGTTCTCACCTGGTGATTCTTTCTGGAATGAAGCAATTCAAGTTGCTGA 899
Query 1023 TGGTTTGACAATTCCAATTGAAAATTTTGGTTCTGTAGAAGCTAAAGTTAGAGATCAACA 1082
||||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||
Sbjct 900 TGGTTTGACAATTCCAATTGAGAACTCTGGTTCCGTAAAAGTTAAAGATGGAGATCAACA 959
Query 1083 TGTAACTATTCTTTCATGCAGCAAGAAAACAGATAAATGCACTGAAAAGTTAGAGAGGAG 1142
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||
Sbjct 960 TGGAACTATTCTTTCATGCAGCAACAAAACAGATAAATGCAATGAAATGTTAAAGAGGAG 1019
Query 1143 TTTAGATTTAGATGAAATCAGAGTAAAGGATAAAGATGCCATTGGTTTTTCAAAGGTAGT 1202
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1020 TTTAGATTTAGATGAAAGCAGAGTAAACGATAAAGATGCCATTGGTTTTTCAAAGGTCTT 1079
Query 1203 GGAGAAGCATGGGAGAGATTTTAATAAAGAAGTATATCAGCTTCCTGTCAAGAATCTTGA 1262
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 GGAGAAGCATGGGAGAGACTTTAATAAAGAAGTATCTCCGCTTCCTGTCAAGAATCTTGA 1139
Query 1263 ACTTTTGTTTCAAGATAAGAACATTAATGGAGGTATTCAAGAGCGATGTGCTTCATTTGA 1322
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 1140 ACTTTTGTTTCAAGATAAGAACATTAATGGAGGTCTTCGAGAGCAATGTGCTTCATTTGA 1199
Query 1323 TCAAAATAACATTACTCTAGGAAGCAGTAGGATCTCTGAATCTGCTTTCGTCGGTAATAA 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1200 TCAAAATAACATTACTCTAGGAAGCAGTAGGATCTCTGAATCTGCTTTCGTCGATAATAA 1259
Query 1383 AGGATGTGAAAATCTTGATATTGCAAATAATGCTCAGGCAGATAAAGGTTTGATAGGCAA 1442
||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 AGGATGTGAAACTCTTGATATTGTAAAT--T-CTCAGGCAGATAAAGGTTTGATAGGCAA 1316
Query 1443 GATGTATCCAGAACCCGAAGGAAAGAAAGTTTTACTGTGTGAGGAAAATCGTGGTGTAAG 1502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 GATGTATCCAGAACCCGAAGGAAAGAAAGTTTTACTGTGCGAGGAAAATCGTGGTGTAAG 1376
Query 1503 ATCTGTTTCTATGATAAGCAACATGAGGAAACCAGTTGGTTCTAGTGAATCCGAAGAAAG 1562
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 1377 ATCTGTTTCTATGGTAAGCAACATGAGGAAACCAGTTGATTCTAGTGAATCTGAAGAAAG 1436
Query 1563 TCATACTCCTTCAAGCTCTCATCGTAATTACGATGGCTTGAGTCTCAGCACTTGGCTTCC 1622
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1437 TCATACTCCTTCAAGCTCTCACCGTAATTACGATGGTTTGATTCTCAGCACTTGGCTTCC 1496
Query 1623 CTCAGAAGTTTGCAGTGTATACAATAAGAAAGGAATATCTAAACTCTATCCTTGGCAGGT 1682
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1497 CTCAGAAGTTTGTAGTGTATACAATAAGAAAGGAATATCCAAACTCTATCCTTGGCAGGT 1556
Query 1683 CGAGTGTCTTCAGGTAGATGGTGTTTTGCAGAAAAGGAATCTAGTATATTGTGCTTCTAC 1742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 CGAGTGTCTTCAGGTAGATGGTGTTTTGCAGAAAAGGAATCTAGTATATTGTGCTTCTAC 1616
Query 1743 AAGTGCTGGTAAAAGTTTTGTTGCAGAAGTCTTGATGCTGCGCCGGGTCATAAGAACTGG 1802
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1617 TAGTGCTGGTAAAAGTTTTGTTGCAGAAGTCTTGATGCTGCGCCGGGTCATAACAACTGG 1676
Query 1803 AAAAATGGCATTGCTTGTACTACCTTATGTATCCATTTGTGCCGAGAAGGCGGAACACCT 1862
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 AAAAATGGCATTGCTTGTGCTACCTTATGTATCCATTTGTGCCGAGAAGGCGGAACACCT 1736
Query 1863 TGAGGTCCTTCTTGAACCACTTGGTAAGCATGTTCGTAGTTACTATGGAAATCAGGGTGG 1922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 TGAGGTCCTTCTTGAACCACTTGGTAAGCATGTTCGTAGTTACTATGGAAATCAGGGTGG 1796
Query 1923 TGGAACACTTCCTAAAGACACTTCTGTGGCTGTCTGCACGATTGAGAAGGCAAACTCTTT 1982
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797 TGGAACACTTCCTAAAGGCACTTCTGTGGCTGTCTGCACGATTGAGAAGGCAAACTCTTT 1856
Query 1983 GATAAATCGCTTGCTTGAAGAGGGTCGTTTGTCAGAACTTGGAATAATAGTTATAGATGA 2042
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1857 GATAAATCGCTTGCTCGAAGAGGGTCGTTTGTCAGAACTTGGGATAATAGTTATAGATGA 1916
Query 2043 GCTACATATGGTGGGTGACCAACATAGGGGTTATCTTCTGGAACTTATGTTGACGAAACT 2102
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 GCTACATATGGTGGGTGACCAGCATAGGGGTTATCTTTTGGAACTTATGTTGACGAAACT 1976
Query 2103 TCGTTATGCTGCTGGTGAAGGCAGTTCAGAATCAAGTAGTGGTGAGAGTTCAGGGACTAG 2162
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1977 TCGTTATGCTGCTGGTGAAGGCAGTTCAGAATCAAGTAGTGGTGAGAGTTCAGGGAATAG 2036
Query 2163 CAGTGGCAAAGCTGATCCTGCTCATGGCCTACAAATTGTGGGTATGAGTGCTACAATGCC 2222
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 CAGTGGCAAGGCTGATCCTGCTCATGGCCTACAAATTGTGGGTATGAGTGCTACAATGCC 2096
Query 2223 AAATGTTGGCGCAGTTGCTGACTGGCTTCAAGCAGCTTTATATCAGACAGAGTTTCGACC 2282
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2097 GAATGTTGGCGCAGTTGCTGACTGGCTTCAAGCAGCTTTATATCAAACAGAGTTTCGACC 2156
Query 2283 AGTTCCCCTGGAGGAGTATATTAAAGTAGGTAGCACCATTTACAATAAAAAGATGGAAGT 2342
|||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 AGTTCCACTAGAGGAGTATATTAAAGTTGGTAGCACCATTTACAATAAAAAGATGGAAGT 2216
Query 2343 TGTGAGGACTATACCAAAAGCTGCTGATATGGGAGGGAAAGACCCGGACCATATAGTTGA 2402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2217 TGTGAGGACTATACCAAAAGCTGCTGATATGGGAGGGAAAGACCCAGACCATATAGTTGA 2276
Query 2403 GCTTTGTAACGAGGTTGTTCAAGAGGGCAATTCAGTGCTGATATTTTGCTCGAGTCGAAA 2462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 GCTTTGTAACGAGGTTGTTCAAGAGGGCAATTCAGTGCTGATATTTTGCTCGAGTCGAAA 2336
Query 2463 AGGATGTGAATCAACTGCTAGGCATATTTCAAAGCTCATTAAAAATGTTCCCGTAAACGT 2522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |
Sbjct 2337 AGGATGTGAATCAACTGCTAGGCATATTTCAAAGCTCATTAAAAAAGTTCCCGTAGACAT 2396
Query 2523 TGATGGTGAAAATAGTGAGTTTATGGATATCAGATCTGCTATTGATGCCCTGCGAAGGTC 2582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2397 TGATGGTGAAAATAGTGAGTTTATGGATATCAGATCTGCTATTGATGCCCTGCGAAGGTC 2456
Query 2583 TCCGTCTGGAGTAGATCCTGTACTAGAAGAAACTCTTCCCTCTGGGGTTGCCTATCACCA 2642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2457 TCCGTCTGGAGTAGATCCTGTACTAGAAGAAACTCTTCCCTCTGGAGTTGCCTATCACCA 2516
Query 2643 TGCTGGTCTTACAGTAGAAGAAAGAGAGATAGTTGAGACCTGTTACCGTAAGGGTCTTGT 2702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2517 TGCTGGTCTTACAGTAGAAGAAAGAGAGATAGTTGAGACCTGTTACCGTAAGGGTCTCGT 2576
Query 2703 ACGTGTCTTAACAGCTACATCCACTTTGGCGGCTGGGGTTAACCTGCCTGCAAGGAGGGT 2762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 ACGTGTCTTAACAGCTACATCCACTTTGGCGGCTGGGGTTAACCTGCCTGCAAGGAGGGT 2636
Query 2763 TATTTTTCGACAACCAATGATTGGCCGTGATTTTATTGATGGAACAAGGTACAAGCAAAT 2822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637 TATTTTTCGACAACCAATGATTGGCCGTGATTTTATTGATGGAACAAGGTACAAGCAAAT 2696
Query 2823 GTCTGGTCGAGCTGGGCGAACTGGGATTGATACAAAAGGAGATAGTGTTTTGATTTGCAA 2882
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2697 GTCTGGTCGAGCTGGGCGGACTGGGATTGATACAAAAGGAGAAAGTGTTTTGATTTGCAA 2756
Query 2883 ACCTGGAGAACTCAAGCGAATAATGGCACTTCTTAATGAAACCTGCCCACCATTGCAGTC 2942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2757 ACCTGGAGAACTCAAGCGAATAATGGCACTTCTTAATGAAACCTGCCCACCATTGCAGTC 2816
Query 2943 TTGTTTATCTGAGGATAAAAATGGAATGACTCATGCAATACTAGAAGTTGTGGCAGGTGG 3002
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817 TTGTTTATCTGAGGATAAAAATGGAATGACTCATGCGATACTAGAAGTTGTGGCAGGTGG 2876
Query 3003 AATTGTTCAGACTGCCAAAGATATTCATCGCTATGTTAGGTGTACACTTCTGAATTCTAC 3062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 AATTGTTCAGACTGCCAAAGATATTCATCGCTATGTTAGGTGTACACTTCTGAATTCTAC 2936
Query 3063 AAAGCCCTTTCAAGATGTGGTCAAATCAGCTCAGGATTCTCTTCGGTGGCTGTGCCACAG 3122
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2937 AAAACCCTTTCAAGATGTGGTCAAATCAGCTCAGGATTCTCTGCGGTGGCTGTGCCACAG 2996
Query 3123 GAAATTTCTTGAGTGGAATGAAGAGACAAAGTTATACACTACAACACCCCTTGGACGTGG 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2997 GAAATTTCTTGAGTGGAATGAAGAGACAAAGTTATACACTACAACACCCCTTGGACGTGG 3056
Query 3183 ATCTTTTGGCAGTTCACTCTGCCCAGAGGAGTCACTTATAGTGCTGGATGATCTTCTACG 3242
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3057 ATCTTTTGGAAGTTCACTCTGCCCAGAGGAGTCACTTATAGTGCTGGATGATCTTCTACG 3116
Query 3243 AGCACGTGAAGGACTAGTTATGGCTTCTGATTTGCATCTGGTCTACTTAGTCACACCAAT 3302
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3117 AGCACGTGAAGGACTAGTAATGGCTTCTGATTTGCATTTGGTCTACTTAGTCACACCAAT 3176
Query 3303 TAATGTTGGTGTTGAGCCAAACTGGGAATTGTATTATGAACGGTTCATGGAACTGTCTCC 3362
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3177 CAATGTTGGTGTTGAACCAAACTGGGAATTGTATTATGAACGGTTCATGGAACTGTCTCC 3236
Query 3363 TTTAGAGCAGTCTGTTGGCAATAGAGTTGGAGTGGTCGAACCTTTCCTGATGCGCATGGC 3422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3237 TTTAGAGCAGTCTGTTGGCAATAGAGTTGGAGTGGTCGAACCTTTCCTGATGCGCATGGC 3296
Query 3423 ACATGGTGCAACAGTTCGCACTCTAAACAGACCACAGGATGTaaaaaaaaaTTTGCGTGG 3482
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3297 ACATGGTGCAACAGTTCGCACTATAAACAAACCACAGGATGTAAAAAAAAATTTGCGTGG 3356
Query 3483 AGAATATGACAGTCGGCATGGTTCGACAAGCATGAAGATGCTTTCAGATGAACAAATGCT 3542
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3357 AGAATATGACAATCGGCATGGTTCAACAAGCATGAAGATGCTTTCAGATGAACAAATGCT 3416
Query 3543 TCGAGTGTGCAAAAGATTTTTTGTTGCTCTCATCTTGTCAAAATTAGTTCAGGAAGCTTC 3602
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3417 TCGAGTGTGCAAACGATTTTTTGTTGCTCTAATCTTGTCAAAATTAGTTCAGGAAGCTTC 3476
Query 3603 TGTGACTGAGGTCTGTGAAGCCTTTAAAGTGGCTAGAGGTATGGTTCAAGCGCTACAGGA 3662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3477 TGTGACTGAGGTCTGTGAAGCCTTTAAAGTGGCTAGAGGTATGGTTCAAGCGCTACAGGA 3536
Query 3663 GAACGCTGGAAGGTTTTCTTCCATGGTTTCGGTATTCTGTGAGAGGCTTGGATGGCATGA 3722
||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3537 GAACGCTGGAAGGTTTTCTTCTATGGTTTCAGTGTTCTGTGAGAGGCTTGGATGGCATGA 3596
Query 3723 TTTGGAAGGATTAGTTGCCAAGTTCCAGAACCGTGTTTCATTTGGTGTCAGGGCTGAGAT 3782
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3597 TTTGGAAGGCTTAGTTGCCAAGTTCCAGAACCGTGTTTCATTTGGTGTCAGGGCTGAGAT 3656
Query 3783 TGTTGAACTTACTAGCATTCCATATATAAAGGGTTCAAGAGCTAGAGCGCTGTATAAAGC 3842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3657 TGTTGAACTTACTAGCATTCCATATATAAAGGGTTCAAGGGCTAGAGCGCTGTATAAAGC 3716
Query 3843 TGGCTTGCGTACATCTCAGGCGATAGCTGAAGCGTCCATCCCTGAAATTGTCAAAGCTCT 3902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3717 TGGCTTGCGTACATCTCAGGCGATAGCTGAAGCGTCCATCCCTGAAATTGTCAAAGCTCT 3776
Query 3903 TTTTGAATCTTCAGCGTGGGCTGCAGAAGGTACTGGACAAAGAAGGATACACTTGGGATT 3962
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3777 CTTTGAATCTTCAGCATGGGCTGCAGAAGGTACTGGACAAAGAAGGATACACTTGGGATT 3836
Query 3963 AGCCAAGAAAATCAAGAATGGGGCTCGCAAAATTGTTCTTGAGAAAGCAGAAGAGGCGAG 4022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3837 AGCCAAGAAAATCAAGAATGGGGCTCGCAAAATTGTTCTTGAGAAAGCAGAAGAGGCGAG 3896
Query 4023 GGCTGCTGCATTTTCTGCTTTTAAGTCACTTGGTTTGGATGTTAATGAGCTTTCAAAGCC 4082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3897 GGCTGCTGCATTTTCTGCTTTTAAGTCACTTGGTTTGGATGTTCATGAGCTTTCAAAGCC 3956
Query 4083 CTTGCCGTTGGCTCCTGCTAGTAGTCTCAATGGACAAGAAACTACTGAAAGAGACATTTC 4142
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3957 CTTGCCTTTGGCTCCTGCTAGTAGTCCCAATGGACAAGAAACTACTGAAAGAGAGATTTC 4016
Query 4143 CAGAGGCTCTGTTGGTCCCGATGGATTACAACAAAGCATAGAGGGGCACATGGAATGTGA 4202
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 4017 CAGAATCTCTGTTGGTCCCGATGGATTACAACAAAGCATAAAGGTGCACATGGAATGTGA 4076
Query 4203 AAACTTTGATATGGATAATCACAGAGAAAAGCCAAGTGAAGTATTAGGTGATGCTACCTT 4262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4077 AAACTTTGATATGGATAATCACAGAGAAAAGCCAAGTGAAGTATTAGGTG---CTACCTT 4133
Query 4263 AGGGGTTTCATCAGAAATTAACTTGACCAGTCGTCTTCCTAATTTTAGACCTATAGGAAC 4322
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4134 AGGGGTTTCATCAGAAGTTAACATGACCAGTCGTCTTCCTAATTTTGGACCTATAGGAAC 4193
Query 4323 TGCAGTCGGCACTAATGGGCCTAGTGCTGTTAGTATTCTTTCCAGTGATACTTTCCCTAT 4382
| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4194 TACAGTCGGCACTAATGGGCCTAGTGTTGTTAGTATTCTTTCCAGTGATACTTTGCCTAT 4253
Query 4383 CCCTGTTTACGATAACAGAGAGATAAAACCTAAGGACAATGTTGAGCAGCATTTGACTAG 4442
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4254 CCCTGTTTACGATAACAGAGAGATAAAAACTGAGGACAATGTTGAGCAGCATTTGACTAG 4313
Query 4443 GAATGACCATATTCCTCTGAGTAGTAATAAGGATGGTACAGGTGAAAAGGGTCCAGTAAC 4502
||||| ||| || | || | ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4314 GAATG-CCA-AT-------A--AG------G-ATGGTACAGGTGAAAAGGGTCCAATAAC 4355
Query 4503 TGCAGGAAATATTAGTGGCGGATTTGATTCTTT-CTTGGAACTTTGGGGATCTGCTGGCG 4561
|||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 4356 TGCAGGAAATATTAGTGGTGGATTTGATTCTTTTCT-GGAACTTTGGGAATCTGCTGGGG 4414
Query 4562 AATTTTTCTTCGATCTTCACTATAATAAACTACAAGATTTGAATTCACGCATCTCTTATG 4621
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4415 AATTTTTCTTTGATCTTCACTATAATAAACTACAAGATTTGAATTCCCGCATCTCTTATG 4474
Query 4622 AGATACATGGAATTGCTATCTGCTGGAATTGCTCCCCTGTATACTATGTCAATCTTAATA 4681
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4475 AGATACATGGAATTGCTATATGCTGGAATAGCTCCCCTGTATACTATGTCAATCTTAATA 4534
Query 4682 AGGATCTTCCCAACCTGGAATGTGTAGAAAAACAAAAGCTTATCGAGGATGCAGTTATTG 4741
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||
Sbjct 4535 AGGATCTTCCCAACCTGGAATGTGTAGAAAAACAAAAGCTCATCGAAGATGCAGTTGTTG 4594
Query 4742 GCAAGAGTGAGGTTCTGGCTTCTCACAACATGTTGGATGTTATAAAGTCTAGGTGGAACA 4801
|||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4595 GCAAGAATGAGGTTTTGGCTACCCACAACATGTTTGATGTTATAAAATCTAGGTGGAACA 4654
Query 4802 AAATCAGTAAAATTATGGGGAATGTAAATACGAGAAAGTTCACGTGGAATTTGAAAGTCC 4861
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4655 AAATCAGTAAAATAATGGGGAATGTAAATACGAGAAAGTTCACGTGGAATTTGAAAGTCC 4714
Query 4862 AGATTCAGGTGCTTAAGAGTCCCGCCATTTCAATCCAAAGATGCACTCGCTTGAATCTTC 4921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4715 AGATTCAGGTGCTTAAGAGTCCCGCCATTTCAATCCAAAGATGCAATCGCTTGAATCTTG 4774
Query 4922 CAGAAGGGATCAGGGAT---GAGTTGGTCGATGGATCTTGGTTAATGATGCCTCCTCTTC 4978
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4775 CAGAAGGGATCAGGGATCTTGAGTTGGTTGATGGATCTTGGTTAATGATGCCTCCTCTTC 4834
Query 4979 ACACAAGCCACACCATTGACATGAGCATTGTGATATGGATTCTTTGGCCAGATGAGGAAA 5038
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4835 ACACAAGCCACACCATTGACATGAGCATTGTGACATGGATTCTTTGGCCAGATGAGGAAA 4894
Query 5039 GACACTCAAATCCAAACATCGATAAGGAAGTAAAGAAAAGGCTATCCCCAGAGGCAGCTG 5098
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4895 GACATTCAAATCCAAACATCGATAAGGAAGTAAAGAAAAGGCTATCCCCAGAGGCAGCTG 4954
Query 5099 AAGCTGCTAATCGCAGTGGCAGGTGGAGGAATCAGATCCGAAGGGTTGCCCACAATGGTT 5158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4955 AAGCTGCTAATCGCAGTGGCAGGTGGAGGAATCAGATCCGAAGGGTTGCCCACAATGGTT 5014
Query 5159 GCTGCAGAAGGGTTGCTCAAACGAGAGCCCTTTGTTCAGCACTTTGGAAGATCCTTGTTT 5218
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5015 GCTGCAGACGGGTTGCTCAAACGAGAGCCCTTTGTTCAGCTCTTTGGAAGATCCTTGTTT 5074
Query 5219 CCGAAGAACTTCTTCAAGCACTGACAACCATTGAAATGCCGCTGGTTAATGTCCTTGCAG 5278
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5075 CCGAAGAACTTCTTGAAGCACTGACAACCACTGAAATGCCGCTGGTTAATGTCCTTGCAG 5134
Query 5279 ACATGGAGCTTTGGGGTATAGGTATCGATATAGAAGGATGCCTTAGGGCACGGAATATAT 5338
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5135 ACATGGAGCTCTGGGGTATAGGTGTCGATATAGAAGGATGCCTTAGGGCACGGAATATAC 5194
Query 5339 TGCGGGATAAACTGCGGTCCCTTGAGAAGAAAGCATTTGAATTGGCTGGCATGACATTTT 5398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5195 TGCGGGATAAACTGCGGTCCCTTGAGAAGAAAGCATTTGAATTGGCTGGCATGACATTTT 5254
Query 5399 CATTGCACAACCCAGCTGATATTGCAAATGTGTTGTTTGGACAGTTGAAGTTGCCCATAC 5458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5255 CATTGCACAACCCAGCTGATATTGCAAATGTGTTGTTTGGACAGTTGAAGTTGCCCATAC 5314
Query 5459 CTGAAAACCAATCTAAAGGGAAACTTCATCCAAGTACTGATAAGCATTGCTTGGATCTTT 5518
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5315 CTGAAAACCAATCCAAAGGGAAACTTCATCCAAGTACAGATAAGCATTGCTTGGATCTTT 5374
Query 5519 TAAGGAATGAGCATCCTGTTGTCCCAATTATCAAAGAACACCGCACTTTGGCAAAGCTCT 5578
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5375 TAAGGAATGAGCATCCTGTTGTCCCAATCATCAAAGAACACCGCACTTTGGCAAAGCTCT 5434
Query 5579 TAAATTGTACACTTGGATCAATTTGTTCGCTTGCTAAACTACGCTTGAGCACGCAAAGGT 5638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5435 TAAATTGTACACTTGGATCAATTTGTTCGCTTGCTAAACTACGCTTGAGCACGCAAAGGT 5494
Query 5639 ACACTTTGCATGGCCGCTGGCTTCAAACATCAACAGCAACTGGGCGGCTTTCCATAGAAG 5698
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5495 ACACTTTGCATGGCCGCTGGCTTCAAACATCAACAGCAACTGGGCGGCTTTCCATAGAGG 5554
Query 5699 AGCCTAATCTCCAATCTGTTGAGCATGAAGTAGAGTTCAAATTGGATAAAAATGGAAGGG 5758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 5555 AGCCTAATCTCCAATCTGTTGAGCATGAAGTAGAGTTCATATTGGATAAAAATGGAAAGG 5614
Query 5759 ACGTAAGTTCAGATGCTGATCGTTACAAAATAAATGCACGTGATTTCTTTGTTCCTACTC 5818
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5615 ACGTAAATTCAGATGCTGATAGTTACAAAATAAATGCACGTGATTTCTTTGTTCCTACTC 5674
Query 5819 AGGAAAATTGGTTACTCTTGACGGCAGATTATTCACAGATAGAGTTGCGACTTATGGCAC 5878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5675 AGGAAAATTGGTTACTCTTGACGGCAGATTATTCACAGATAGAGTTGCGACTTATGGCAC 5734
Query 5879 ACTTTTCTAGAGATTCCTCGTTGATTTCAAAGCTTAGTCAGCCAGAAGGCGATGTCTTTA 5938
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 5735 ACTTTTCTAGAGATTCCTCGTTGATTTCACAGCTTAGACAGCCAGAGGGTGATGTCTTTA 5794
Query 5939 CGATGATAGCTGCAAAATGGACTGGAAAAGCCGAGGATTCTGTTAGTCCACATGATAGAG 5998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5795 CGATGATAGCTGCAAAATGGACTGGAAAAGCCGAGGATTCTGTTAGTCCACATGATAGAG 5854
Query 5999 ATCAGACCAAAAGATTGATCTACGGAATTCTTTATGGAATGGGTGCAAACAGACTCGCAG 6058
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5855 ATCAGACCAAAAGATTGATCTACGGAATTCTTTATGGAATGGGTGCAAACAGGCTCGCAG 5914
Query 6059 AACAGCTTGAGTGCACCTCAGATGAAGCTAAGGAGAAAATTCGAAGCTTTAAAAGTTCTT 6118
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5915 AACAGCTTGAGTGCAGCTCAGATGAAGCCAAGGAGAAAATTAGAAGCTTTAAAAGTTCTT 5974
Query 6119 TCCCTGCAGTCACCTCTTGGCTAAACGAAACGATTTCATTCTGCCAGGAAAAAGGATACA 6178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5975 TCCCTGCAGTCACCTCTTGGCTAAACGAAACGATTTCATTTTGCCAGGAAAAAGGATACA 6034
Query 6179 TTCAGACTCTCAAGGGAAGAAGGCGGTTCTTGTCGAAAATAAAATTTGGGAATGCCAAAG 6238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6035 TTCAGACTCTCAAGGGAAGAAGGCGGTTCTTGTCGAAAATAAAATTTGGGAATGCCAAAG 6094
Query 6239 AGAAATCGAAGGCTCAAAGGCAAGCTGTAAATTCCATGTGCCAGGGATCTGCTGCTGATA 6298
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6095 AGAAATCTAAGGCTCAAAGGCAAGCTGTAAATTCCATGTGCCAGGGATCTGCTGCTGATA 6154
Query 6299 TTATCAAGATTGCGATGATAAACATATATTCTGCAATTGCTGAAGATGTTGATACCGCAG 6358
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6155 TTATCAAGATTGCGATGATAAACATATATTCTGCAGTTGCTGAAGATGTTGATACCACAG 6214
Query 6359 CATCTAGTTCTTCAAGTGAAACTAGATTTCACATGTTGAAGGGACGATGCCGAATTCTTC 6418
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 6215 CATCTAGTTCTTCAAGTGAAACTGGGTTTCACATGTTAAAGGGACGATGCCGAATTCTTC 6274
Query 6419 TACAAGTACATGATGAACTTGTGCTGGAAGTTGATCCTTCTTACGTAAAACTAGCTGCAA 6478
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6275 TACAAGTACATGATGAACTTGTGCTAGAAGTTGATCCTTCTTACGTAAAAGTAGCTGCAA 6334
Query 6479 TGTTGCTACAAACCAGCATGGAAAATGCGGTGTCACTTCTTGTCCCTCTT-CATGTGAAA 6537
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||
Sbjct 6335 TGTTGCTACAAACCAGCATGGAAAATGCGGTGTCACTTCTCGTCCCT-TTACATGTGAAA 6393
Query 6538 CTGAAAGTTGGGAAAACATGGGGTTCTTTAGAGCCGTTTCAGACTGATTAA 6588
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 6394 CTGAAAGTTGGAAAAACATGGGGTTCTTTAGAGCCGTTTCAGGCTGATTAA 6444
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 269181213829
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5