BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G32820.2
Length=5911
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg944668 jgi|Araly1|944668|scaffold_700897.1 4946 0.0
> Ahg944668 jgi|Araly1|944668|scaffold_700897.1
Length=5579
Score = 4946 bits (2678), Expect = 0.0
Identities = 3085/3274 (94%), Gaps = 57/3274 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 173 CAGCTTCGAGTATCAAGATGTTTTCGATTGCAGCGATCAATGATACGGAGTCCACAGAGA 232
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 7 CAGCTTCGAGTATCAAGATGTTTTCAATTGCAGCGATCAATGATACAGAGACCACAGAGA 66
Query 233 AGTGGGAACCTTTAGCTCCTAGCAAAGAAGCTCAGGAGTTTCATCTGTCACAAACATATC 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 AGTGGGAACCTTTAGCTCCTAGCAAAGAAGCTCAGGAGTTTCATCTGTCACAAACATATC 126
Query 293 ATGATGGTCTTCTCAAGCTGCAAGCTAAAGACTATGACAAGGCTCGGGAGCTGCTAGAAT 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 ATGATGGTCTTCTCAAGCTGCAAGCTAAAGACTATGAAAAGGCTCGGGAGCTGCTAGAAT 186
Query 353 CTATCCTTAAAGATCCTATTATAACCAACTCCAAAGTGGAGACTATTGCAAACGACAATC 412
|||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 CTATCCTTAAGGATCCTATTATAGCTAACTCCAAAGTGGAGACTATTGCAAACGACAATC 246
Query 413 ATCTCCATCATCTCAGATTTTTGGCTCTGAAGAATCTTGCCACTGTCTTTCTTGAGCTTG 472
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 247 ATCTCCATCATCTCAGATTTTTGGCTCTGAAGAATCTTGCCACTGTATTTCTTGAGCTTG 306
Query 473 GTTCAAGTCACTACGAGAATGCTCTAAACTGTTATCTTCAAGCTATAGACTTAGATGCAA 532
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 307 GTTCAAGTCATTACGAGAGTGCTCTAAACTGTTATCTTCAAGCTATAGACTTAGACGCAA 366
Query 533 AAGATTCTGTGCTCTGGAACCATCTTGGAACCCTATCATGTTCTATGGGATTACTGAGTA 592
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 AAGATTCTGTCCTGTGGAACCATCTTGGAACCCTATCATGTTCTATGGGATTACTGAGTA 426
Query 593 TTTCACGATGGGCATTTGAACAGGGACTTCTCTGCAGCCCCAATAACTGGAACTGCATGG 652
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 427 TCTCACGATGGGCATTTGAACAGGGACTTCTCTGCAGCCCCAATAATTGGAACTGCATGG 486
Query 653 AGAAACTTCTAGAAGTTCTCATTGCCGTAGGTGATGAAGTTTCCTGTCTTTCAGTTGCAA 712
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 487 AGAAACTTCTAGAAGTTCTCATTGCTATAGGTGATGAAGTTTCCTGTCTCTCAGTTGCAA 546
Query 713 ATCTGATTTTAAGGCATTGGCCATCACATTCTCGTGCTTTGCATGTTAAACATTGTATTG 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 547 ATCTGATTTTAAGGCATTGGCCATCACATTCTCGTGCTTTGCATGTTAAACATTGTATTG 606
Query 773 AAGAC-ACAGATTCAGCTCCTTTTGCTCCCAAGGGTATAGATAAACTTGAACCTCAGCAC 831
||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 607 AAG-CAACAGATTCAGCTCCTTTTGCGCCCAAGGGTATAGATAAACTTGAACCTCAGCAC 665
Query 832 GTTCGGCTCAAATTTCTTGGCAAAAGAAAGGTGTCTGACATGAATCAGGACATGGATGCT 891
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GTCCGGCTCAAATTTCTTGGCAAAAGAAAGGTGTCTGACATGAATCAGGACATGGATGCT 725
Query 892 ACCTCCAAGAAGTT-AAGAAAAAGAGTGCAATTTAAACTTCCTGAAGCTTCATGGGTGGC 950
||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 GCCTCCAAGAAGTTGAA-AAAAAGAGTGCAAGTTAAACTTCCTGAAGCTTCATGGGTGGC 784
Query 951 ACTGCTAAATATTCTAATTGGGATAGTGCATCCTTCGCGTGAAACTGTGGGCATATCAGC 1010
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785 ACTGATAAATATTCTAATTGGGATAGTGCATCCTTCGCGTGAAACTGTGGGCATATCAGC 844
Query 1011 TGATATACCGATAACCATTGAATTATCCCTTAGTACAGAGGCTGTTATGCAAGGTATGAA 1070
||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 845 TGATATACCAATAACCATTGAACTAGCCCTTAGTACTGAGGCTGTTATGCAAGGTCTGAA 904
Query 1071 AAAGAAGGATCATTGTGTGGATTCAGATTCAAGTAATGTGTCTGTTAAGGATTGCAACAT 1130
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 905 AAAGAAGGATCATTGTGTGGATTCAGATTCAAGTAATGTGTCTGTTAAGGATTGTAACAT 964
Query 1131 CGAGAGAGAAAGTGGTGGTTCTGTAAAAGAAAAAGAGCCTGTGTTTTCTGAAGAACACCC 1190
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 CGAAAGAGAAAGTGGTGGTTCTGTAAAAGAAAAAGAGCCTGTGTTTTCTGAAGAACACCC 1024
Query 1191 CCAAGAGAGGCGGAGTACTCGTCTTGAACGGCTTCGGAACCAGAAACCTGAGAAGGAAGG 1250
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 CCAAGAGAGGCGGAGTACTCGTCTTGAACGGCTTCGGAACCAGAAACCTGAGAAGGAAGA 1084
Query 1251 GTTAGAATTTGATAACAGTAAGGATCCTAGCAGTGACATCCTTCAATATCTTGAGAAATT 1310
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1085 GTTAGAATTTGATAATAGCAAGGATCCTAGCAGTGACATCCTTCAATATCTTGAAAAATT 1144
Query 1311 TGTCCTTAAAAGGGGTTTTGACAGAGAGTCTGCTGGTTCTTTCTGCAATGAAGAATCTGA 1370
|||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1145 TGTCCTTACGAGGGAATTCAACAGAGTTTCTGCTGGTTCTTTCTGCCTTGAGGAATCTGA 1204
Query 1371 TCCAATTTCTGAACACGCCGTCGTTTCTAATTTTGTGAAGGAAAATTTAGAAAATTATGG 1430
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1205 TCCAATTTCTGAACACGCTGTCGTTTCTAATTTTGTGAAGGAAAATTCAGAAAATTATGG 1264
Query 1431 TGCGTATCATATGGGTCACTTGCTTCTAGAATATATTGCTAATAAATGTGAACATGTATT 1490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 1265 TGCGTATCATATGGGTCACTTGCTTCTAGAATATATTGCTAGTAAATGTGAACATATATT 1324
Query 1491 GAGTCGTGA-GACTGCCTTGAAAATTTTGGAGTTAGAAAAGCTTACAAGACATTGGGGCC 1549
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1325 GAGTCGTGATG-CTGCCTTGAAAATTTTGGAGTTAGAAAAGCTAACAAGACATTGGGGCC 1383
Query 1550 GAGATCGGAAACCTGAATGCAGTCTTTTTCTCGCCGAGCTGTACCATGACTTTGACTCTA 1609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384 GAGATCGGAAACCTGAATGCAGTCTTTTTCTCGCCGAGCTGTACCATGACTTTGACTCTA 1443
Query 1610 AACGATCAGATATCCCTGATGCCCCATCATGCATGGTAGAAGTAACATACCATCTCTCTA 1669
|| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1444 AAGGTTCAGATATTCCTGATGACCGATCATGCATGGTTGAAATAACATACCATCTCTCTA 1503
Query 1670 AGATAATTGAATCTGTTTCCCTTGATTATGCTATCGACTCTACACCTAGTTCTCGAGGGA 1729
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||
Sbjct 1504 AGATAATTGAATCTGTCTCCCTTGATTATGCTATCGACTTTACGCCTAGTTCTTGGGGGG 1563
Query 1730 AAATG-TTTTCTGACTCCTCATTTAAGAGTTTTCAAGGTGATGAGGCTGCTAAGGAGGTG 1788
||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1564 AAA-GATTTTCTGACTCCTCATT----------CAAGG--------CTGCTAAAGAGGTG 1604
Query 1789 TTAGATTATGATACAAGATCTTTCTGGGCTCGATATTTCTGGCTGAGTGCACGGTTATCA 1848
||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1605 TTAGATTATGAGAAAAGATCTTTCTGGGCTCAATATTTCTGGCTGAGTGCACGGTTATCA 1664
Query 1849 ATTTTGGAGGATAATAAAGCTAAAGCACTTGAAGAATATCTCAGGTGTTTGTCATTGTTG 1908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||
Sbjct 1665 ATTTTGGAGGATAATAAAGCTAAAGCACTTGAAGAATTTCTTAGATGTTTGTCATTGTTG 1724
Query 1909 GGCAGGGAAGGTATCGGAGAAGCTCCTGTCTTAATTCAGCGACCTCATTGCAGAAGAGTT 1968
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 1725 GACAAGGAAGGTATCGGAGAAGCTCCTGTCTTAATTCAGCTACCTCATTGCAGAAGAATT 1784
Query 1969 CGAGAGCTGACCATCAATAGAATCATTCATGAAATTAATCTGCTTAAGATTGATTTCCTG 2028
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1785 CGAGAGCTGAACATTAATAGAATCATTCATGAAATAAATCTGCTTAAGACTGATTTCTTG 1844
Query 2029 TTGGAAAATAACATACCTGAGATGATGGAGAAAGAATTTTATTCGGAGTGTGTAAATTTA 2088
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 TTGGAAAATACCATACCTGAGATGATGGAGAAAGAATTTTATTCGGAGTGTGTAAATTTA 1904
Query 2089 CTGGCACCTCTTTTGTTTCCAGATAAAGACATCTTGCCTGCATACGCTGTAAAAACGGAA 2148
|||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905 CTGGCACCTCTTTTATTTCCAAATAAAGACATGTTGCCTGCATACGCTGTAAAAACGGAA 1964
Query 2149 GAAGGGATCTCCTCTGTTGAGTTATCGGCACTTGAGGTTTTAATAAAAGCATGCCAGAAG 2208
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1965 GAAGGGATCTCCTCTGTTGAGTTATCAGCACTTGACGTTTTAATAAAAGCCTGCCAGAAG 2024
Query 2209 AGTAAGCCTATAGATGTAGAGGTTTATATGAACTGTCATAGAAGAAAGTTGCAAGTTCTC 2268
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 AGTAAGCCTATAGATGTGGAGGTTTATATGAACTGTCATAGAAGAAAGTTGCAAGTTCTC 2084
Query 2269 TTAGATTCAACTGGTACGGGAGAATCTGTTGTGACACCTAAAAC-CTCGTCCAAAAATTC 2327
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 2085 TTGGAATCAACTGGTACGGGAGAATCTGTTGTGACACCTAAAAAGC-CGTATAAAAATTC 2143
Query 2328 AAGTGAGAGTTGGGATCACTTGGTGGCGGAGGAAGTCAAGGCAATTCTTCTCTGTATCTC 2387
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 AAATGAGAGTTGGGATCACTTGGTGGCGGAGGAAGTCAAGGCAATTCTTCTCTGTATCTC 2203
Query 2388 TCAAGTGAAGAACTCCCTTGACCAGTCAGGAAACTCTGATGACATGGTTGCCCCAAGAGA 2447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
Sbjct 2204 TCAAGTGAAGAACTCCCTTGACCAGTCAGGAAACTCTAATGACATGGTTGCCCCAAAATA 2263
Query 2448 TTGTGTAGCTGGTATACAAGCTCTGCTTTTGAGAGTTATGTCAAATATCGTGAGGCAttt 2507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2264 TTGTGTAGCTGGTATACAAGCTCTGCTTTTGAGAGTTATGTCAAATATCATGAGGCATTT 2323
Query 2508 tttttCTAAGAGATATTCAGATTCTCAAAATGCTGATGGGATTGAAGAAGAGAAGAAGTC 2567
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324 TCTTTCTAAGAGATATTCAGATTCTCAAAATGCTGATGGGATTGAAGAAGAGAAGAAGTT 2383
Query 2568 TTGCTTTCTCGATGCAGCTATTGGATTCTGTAAACTTCAGCACCTTGATGCTACTATATC 2627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 2384 TTGCTTTCTCGATGCAGCTATTGGATTCTGTAAACTTCAACACCTTGATGCTACCATGTC 2443
Query 2628 TACTAAATACCAATTTGACATAGTTAAGCGAGTCTGTTTGGTTGAGTTGATCATAAGACT 2687
||| ||||||||| |||| ||| | | || | || | || | |
Sbjct 2444 TACCAAATACCAAGTTGA----GTT--G--A-TCA-T-------AG--G-TC-T----C- 2477
Query 2688 CCATGATTTGCTTGCTGAATATGGGCTCTGCTGTGCTGGTAAAAATTGTGCGGGGGAGGA 2747
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2478 C-ATGATTTGCTTGCTGAATATGGGCTCTGCTGTGCTGGTAAAAATTGTTCGGGGGAGGA 2536
Query 2748 AGGAGCTTTTCTTAGATTTGCGATTAAGCATTTATTGGCAGTGGACATGAAAGTCAAATC 2807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2537 AGGAGCTTTTCTTAGATTTGCGATTAAGCATTTATTGGCTGTGGACATGAAAGTCAAATC 2596
Query 2808 CAGTATTAACTCCCCAGATGGTCTTGGACATGATATGGGACTGCCTGACAAATTATGCAG 2867
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2597 CAGTATTAACTCCCCAGATGGTCTTGGACATGATATGGCACTGCCTGACAAATTATGCAG 2656
Query 2868 AAATGAAGTAAAATCATTTCTCGA-AGAGGTGCATGTTGAGAAAAACGAAAACAACAAAA 2926
||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2657 AAATGAAATAAAATCATTTCTC-ACAGAGGTGCATATTAAGAATAACGAAACCAACAAAA 2715
Query 2927 CTGAGTCTAAGAAGGATGGTTCTGAAGAACAAGTTGGTTATAGGGAGAAAGAACAGTCAG 2986
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2716 CTGATTCTAAGAAGGATGGTTCTGAAGAACAAGTTGGTTATAGGGAAAAAGAACAGTCAG 2775
Query 2987 AACAACAAAGCAAACAGATTCCAGAACACACAGAAGAAGTTGCTGAAGAAGAAAAAGATG 3046
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2776 AACAAGAAAGCAAACAGATTACAGAACACACAGAAGTGGTTGCGGAAGAAGAAAAAGATG 2835
Query 3047 AACTTGAGTTGTTAATCAACAACGCTTTAGATCAATGCtttttttGCCTGTATGGTCTAA 3106
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2836 AACCTGAGTTGTTAATCAACAACGCTTTAGATCAATGTTTTTTTTGCCTTTATGGTCTAA 2895
Query 3107 ATCTGAGAGTCGATGGTTCCTACGAAGATGAGCTTGCTGTGCACAAAAACACTAGCCGCG 3166
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2896 ATCTTAGAGTCGATGGTTCCTACGAAGATGAGCTCGCTGTGCACAAAAACACTAGCCGGG 2955
Query 3167 GAGATTATCAGACCAAGGAACAATGTGTTGATGTCTTCCAGTACATACTACCCTATGCCA 3226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2956 GAGATTATCAGACCAAGGAACAATGTGTTGATGTCTTCCAGTACATACTACCCTATGCCA 3015
Query 3227 AAGCTTCATCTAGAACTGGACTAGTTAAACTCCGGAGAGTCTTGAGAGCAATAAAAAAGC 3286
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3016 AAGCTTCATCTAGAACTGGACTAGTTAAACTCCGAAGAGTCTTGAGAGCAATAAAAAAGC 3075
Query 3287 ATTTTTCACAACCACCAGATGATCTCCTAATTGGCAATGTGATAGATAAATTCTTAGATG 3346
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3076 ATTTTGCACAACCACCAGATGATCTCCTAATTGGCAATGTGATAGAGAAATTCTTAGATG 3135
Query 3347 ACCCTGAATTATGTGAAGACAAACTCTCATATGAGGCTGGTTCTGAAGGTTTCCTTGAAA 3406
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3136 ACCCTGATTTATGTGAAGACAAACTCTCATATGAGGCTGGTTCTGAAGGTTTCCTTGAAA 3195
Query 3407 CTATAACTAAATGTCTAATTCCCAGCAGAACTCT 3440
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3196 CCATAACTAAATGTCTAATTCCCAGCAAAACTCT 3229
Score = 3275 bits (1773), Expect = 0.0
Identities = 2027/2148 (94%), Gaps = 23/2148 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3518 CTCAATCCGAAGAAGTTAGTGCTAGTGATAAATGGCCCGGTTTTGTTCTGACAAAGGAAG 3577
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 3232 CTCAGTCTGAAGAAGTTAGTGCTAGTGATAAATGGCCCGGCTTTGTTCTGACGAAGGAAG 3291
Query 3578 GAGAAGAGTTTGAACAGCAGAATACAAATCTGTTCAAATATGATCTGCTCTATAATCCTC 3637
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3292 GAGAAGAGTTTGTACAGCAGAATACAAATCTGTTCAAATATGATCTGATCTATAATCCTC 3351
Query 3638 TCCGCTTTGAGAGTTGGGAAAAGCTTGGCAATATATACGACGAGG-AAGTAGATTT-GTT 3695
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||
Sbjct 3352 TGCGCTTTGAGAGTTGGGAAAAGCTTGGCAATATATACGACGAGGCAAGT-TCTTTCATT 3410
Query 3696 AC-TAAATGATGGGA--G-TAAGC--ACA-TAAATGTT---GTAG--GATGGAGGAAGAA 3743
| | || || | | | | | | | | || ||| |||||||||| ||
Sbjct 3411 -CATTCTTGTTGTTACTGTTTTTCTGAAATTTTACCTTCAAATAGCAGATGGAGGAAAAA 3469
Query 3744 TTCCGCTCTTTCGCAAAGAGTTGAGACAAGTAGAAGAAGAAGCAGACGTTGCCTGCTAAT 3803
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3470 TTCCGCTCTTTCGCAAAGAGTTGAGACAAGCAGAAGAAGAAGCAGACGTTGCCTGCTAAT 3529
Query 3804 GAGTTTGGCATTGGCAAATTCACCAGATCAACAGTCTGAGATACATGAGCTTTTGGCGCT 3863
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3530 GAGTTTGGCATTGGCAAAATCACCAGATCAACAGTCTGAGATACATGAGTTTTTGGCGCT 3589
Query 3864 GGTCTACTATGACAGCCTTCAGAGTGTTGTGCCGTTTTATGATCAGCGGTCTGTGCTTCC 3923
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3590 GGTATACTATGACAGTCTTCAGAGTGTTGTGCCGTTTTATGATCAGCGGTCTGTGCTACC 3649
Query 3924 CTCCAAGGATGCAACATGGACAAGATTTTGTGAGAACTCAATGAAGCATTTCAACAAAGC 3983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 CTCCAAGGATGCAACATGGACAAGATTTTGTGAGAACTCAATGAAGCATTTCAACAAAGC 3709
Query 3984 CTTTTCACATCGACAAGATTGGTCACATGCATTCTACATGGGAAAACTCAGTGAGAAGCT 4043
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3710 CTTTGCACATCGACAAGATTGGTCACATGCATTCTACATGGGAAAAATCAGTGAGAAGCT 3769
Query 4044 TGGGCACTCGTATGAAATTTCTTTATCCTATTATAAGCAAGCCATGACATTGAATCCGTC 4103
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3770 TGGGCACTCATATGAAATTTCTTTATCCTATTATAAGCAAGCCATGACATTAAATCCGTC 3829
Query 4104 AGCCGTAGATCCTGTGTATAGAATGCATGCTTCTCGTTTGAAGCTGCTAAATGCATGCGG 4163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3830 AGCCGTAGATCCTGTGTATAGAATGCATGCTTCTCGTTTGAAGCTGCTAAATGCATGTGG 3889
Query 4164 GAAACAAAACTTAGAAGCCTTAAAGGTCCTCGCTTCTTATTGCTTTGATGAATCTATAAA 4223
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3890 GAAACAGAACTTAGAAGCCTTAAAGGTCCTCGCCTCTTATTGCTTTGATGAATCTATAAA 3949
Query 4224 GGATACGGCTATGACAATCATTGGCACAACGACTTTTGGATCCTCTCGTACACTGGAAGA 4283
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3950 GGATACTGCTATGACAATCATTGGTACAACGACTTTTGGATCCTCTCGTACACTGGAAGA 4009
Query 4284 AGCTCAAGATGGAAACTTGGAAGCATGTTATGCTAAATCTGGAGAGGGGTCAATTCAGAT 4343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 4010 AGCTCAAGATGGAAACTTGGAAGCATGTTATGCTAAAACTGGAGAGGGATCAATTCAGAT 4069
Query 4344 GGAAGGGGTATGGCATATGCTCTACAACGACAGCCTCTCTGCACTTGGAATTTGTGTAGA 4403
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 4070 GGAAGGGGTATGGCATATGCTCTACAACGACAGCCTTTCTGCACTGGGAATTTGTGTTGA 4129
Query 4404 AGGAGATCTTAAACACTTTCATAAGGCGAGATACATGCTTGCTCAAGGTCTGTACAGAAG 4463
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 4130 AGGAGATCTTAAACACTTTCATAAGGCGAGATACATGCTTGCCCAAGGACTGTACAGAAG 4189
Query 4464 GGGTGGGAGCAGTGATCTGCAAAGAGCAAAGGAAGAACTTTCCTTTTGTTTCAAATCATC 4523
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4190 GGGTGGGAGCAGTGATCTGCAAAGAGCAAAAGAAGAACTTTCTTTTTGTTTCAAATCATC 4249
Query 4524 ACGGTCAAGTTTTACGATCAATATGTGGGAGATTGATGGCATGGTTAAAAAGGGAAGGCG 4583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4250 CCGGTCAAGTTTTACGATCAATATGTGGGAGATTGATGGCATGGTTAAGAAGGGAAGGCG 4309
Query 4584 AAAAACTCCAGGTTTGGCTGGGAACAAGAAGGCTCTTGAAGTTAACCTGCCAGAAAGTTC 4643
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4310 GAAAACTCCAGGTTTGGCGGGGAACAAGAAGGCTCTTGAAGTTAACCTGCCAGAAAGTTC 4369
Query 4644 ACGGAAATTCATAACTTGCATTCGCAAATACTTACTGTTCTATTTGAGACTATTGGAGGA 4703
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4370 ACGGAAATTCATTACCTGCATTCGCAAATACTTACTGTTCTATCTGAGACTATTGGAGGA 4429
Query 4704 AACTGAAGATGTCAACACACTAGAACGAGCCTTTAATTCTCTTCGATCAGATAAGAGGTT 4763
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4430 AACTGGAGATGTCAACACACTAGAACGAGCCTTTAATTCTCTTCGATCAGATAAGAGGTT 4489
Query 4764 CTCTCTATGCGTTGAAGACCTTGTACCAGTTGCAATAGGAAGATACGTAAAAGCACTGGT 4823
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 4490 CTCTCTATGCATTGAAGACCTTGTACCAATTGCAATAGGAAGATACATAAATGCACTGGT 4549
Query 4824 TTCCTCGATGAGTCGGGTTGAGTCTGCAGGAGC-AATAATCAACCCTGATAGCCAGCTAG 4882
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 4550 TTCCTCGATGAGCCGGGTTGAGTCTGCAGGAGCAAAT-ATCAACCCTGATAGTCAGCTAG 4608
Query 4883 AGAAAATATTTTCCCTCTTTATAGAACAAGGAAGCATATGGCCAGACATATGCAATTTTC 4942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 4609 AGAAAATATTTTCCCTCTTTATAGAACAAGGAAGCATATGGCCGGACATATGCAATTTCC 4668
Query 4943 CTGAAACAAGAGGTCCAGAAACCTCAGAGAGCAGCTTATACAGATATCTACATCAATACA 5002
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4669 CTGAAATAAGAGGTCCAGAAACCTCAGAAAGCAGCTTATACAGATATCTACATCAATACA 4728
Query 5003 TCGTATCTCTTGAGCTAGACAACAAGGTTGAGACCCTGGAAACCATAAATGAAAAGATTC 5062
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4729 TCGTATCTCTTGAGCTAGACAACAAGGTTGAGACCCTGGAAACCATTAATGAAAAGATTC 4788
Query 5063 GAAAGCGTTTCAAGAATCCAAAGTTGTCTAATAGTTTTTCGGCAAAAGTTGGCAGACATG 5122
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4789 GAAAGCGTTTCAAGAATCCAAAGTTGTCTAATACTTTTTCGGCAAAAGTTGGCAGACATG 4848
Query 5123 CTTCTCTTGCTTGGTGCCGAGCTCTGATTATAAGCTTGGCA-CTGATAACTCCCTTGCAG 5181
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||
Sbjct 4849 CTTCTCTTGCTTGGTGCCGAGCTCTGATAATAAGCTTGGCATC-GATAACCCCCTTGCAG 4907
Query 5182 CCAGTATCCTCGGAGGAAAGTCAAGCAATAACTCCATCATTTGGTTTACTGGAAAACAGA 5241
| || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4908 CAAGCATCCTCAGAGGAAAGTCCAGCAGTAACTCCATCATTTGGTTTACTGGAAAAAAGA 4967
Query 5242 CGGGTGCTTTGTGTTGATCTCCAGTCTGAATTCTGGAGTTCTTCGTTCGAGGATCCCTTA 5301
|| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4968 CGTGTGCTTTGTGTTGATCTACAGTCAGAATTCTGGAGTTCTTCGTTCGAGGATCCCTTA 5027
Query 5302 GAATCCCAAATGCTTGAGGCAAAATGGCGCCCTGTTCTGTCCAAGATTAAGAACGTACTG 5361
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5028 GAATCCCAAATGCTTGAGGCAAAATGGCTCCCTGTTCTGTCCAAGATCAAGAACGTACTG 5087
Query 5362 ATTTTTAATAAAGTTGTGGAGGGGAATTTGGAGATCGCTAATTCCCTACTTAAAAGCTGT 5421
||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 5088 ATTTTCAATAAAGTTTTGGAGGAGAATCTGGAGGTCGCTAATGCCCTACTTAAAAGTTGT 5147
Query 5422 TACAATTTCTTCCGAGAAACTGCTTCGGTGACACTCCCTTCTGATATCAACCTCTATTTC 5481
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5148 TACAATTTCTTCCGAGAAACTGCCTCGGTGACACTCCCTTCTGATATCAACCTCTATTTC 5207
Query 5482 GCACTGCCCCGACTCGCACCAGCTGGAGAACTTCTTCCAGGCAATGAAGGAGTTGAAGTC 5541
|||||||| | ||| || ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5208 GCACTGCCTCAACTAGCGCCAGCAGGAGAACTTC--C-AGGCAGTGAAGGAGTTGAAGTC 5264
Query 5542 ATTGATGTAAGCATCCCAAGGAAGCTTCTTTTGTGGGCTTACACGTTGTTTCATGGACAT 5601
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5265 ATTGATGTAAGCATCCCAAGGAAGCTTCTTTTGTGGGCTTACACGTTGGTTCATGGACAT 5324
Query 5602 TGTGGAAGCATCTCTCAGGTCGTGAAATATATGGAAGAAAATACCAAG 5649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5325 TGTGGAAGCATCTCTCAGGTCGTGAAATATATGGAAGAAAATACCAAG 5372
Score = 95.3 bits (51), Expect = 5e-18
Identities = 55/57 (96%), Gaps = 0/57 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5648 AGCCAAAAATGAAGAGAGGAGCCTCAACTTCATCAGTGGTTCCTTCGGTTCAATCAG 5704
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5406 AGCCAAAAATTAAGAGAGGAGCCTCAACTTCATCAGTGGTTCCTTTGGTTCAATCAG 5462
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 223930759532
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5