BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G33150.1
Length=3576
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg491371 jgi|Araly1|491371|fgenesh2_kg.7__804__AT4G33150.1 4996 0.0
Ahg353505 jgi|Araly1|353505|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000678 2071 0.0
> Ahg491371 jgi|Araly1|491371|fgenesh2_kg.7__804__AT4G33150.1
Length=3302
Score = 4996 bits (2705), Expect = 0.0
Identities = 3054/3219 (95%), Gaps = 37/3219 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 113 GAGGAGAAGAAGTTGGGGAATGGAGTTGTGGGGATTCTAGCTGAAACAGTTAACAAATGG 172
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 19 GAGGAGAACAAGTTGGGGAATGGAGTTGTTGGGATTCTAGCTGAAACAGTGAACAAATGG 78
Query 173 GAGAGACGAACACCATTGACGCCATCGCATTGCGCTCGCCTTTTACACGGTGGGAAAGAC 232
||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 79 GAGAGACGAACGCCCTTGACACCGTCGCATTGCGCCCGCCTTTTACACGGTGGCAAAGAC 138
Query 233 AGAACCGGCATTTCCCGCATTGTGGTTCAGCCATCTGCTAAGCGTATCCATCATGATGCC 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 AGAACCGGCATTTCCCGCATTGTGGTTCAGCCATCTGCTAAGCGTATCCATCATGATGCC 198
Query 293 TTGTATGAAGATGTTGGGTGTGAAATTTCTGATGATTTGTCTGATTGTGGGCTTATACTT 352
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 199 TTGTATGAAGATGTTGGATGTGAAATTTCTGATGATTTGTCTCATTGTGGGCTTATACTC 258
Query 353 GGAATCAAACAACCTGAGCTAGAAATGATTCTTCCAGAGAGAGCATACGCTTTCTTTTCA 412
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 259 GGTATCAAACAACCTGAGCTAGAAATGATTCTACCAGAGAGAGCATATGCTTTCTTTTCA 318
Query 413 CATACTCATAAGGCACAGAAAGAGAACATGCCTTTGTTGGATAAAATTCTTTCTGAGAGA 472
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 CATACTCATAAGGCACAGAAAGAAAACATGCCTTTGTTGGATAAAATTCTTTCTGAGAGA 378
Query 473 GTGACTTTGTGTGATTATGAGCTCATTGTTGGGGATCATGGGAAACGATTATTGGCGTTT 532
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 379 GTGACTTTGTGTGATTATGAGCTCATTGTTGGGGATCATGGGAACCGATTATTGGCCTTT 438
Query 533 GGTAAATATGCAGGCAGAGCTGGTCTTGTTGACTTCTTACACGGACTTGGACAGCGATAT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 439 GGTAAATATGCAGGCAGAGCTGGTCTTGTTGATTTCTTACACGGACTGGGGCAGCGATAT 498
Query 593 CTAAGTCTAGGATACTCAACACCTTTCCTCTCGCTC-GGTGCATCGTATATGTATTCCTC 651
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 499 CTAAGTCTAGGATACTCAACGCCTTTCCTTTCGCTCGGGT-CATCCTATATGTATTCCTC 557
Query 652 ATTGGCTGCTGCAAAAGCCGCTGTAATTTCTGTTGGTGAAGAAATTGCAAGCCAGGGACT 711
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 TTTGGCTGCTGCAAAAGCCGCTGTGATTTCTGTAGGCGAAGAAATTGCAAGCCAGGGACT 617
Query 712 GCCATTAGGAATCTGCCCTCTTGTATTTGTCTTCACCGGAACAGGAAATGTTTCTCTGGG 771
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 618 GCCTTTAGGAATCTGCCCTCTTGTATTTGTCTTCACCGGAACAGGAAATGTTTCTCTCGG 677
Query 772 GGCGCAAGAAATTTTCAAGCTTCTTCCTCACACTTTTGTTGAACCAAGCAAACTTCCTGA 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 GGCGCAAGAAATTTTCAAGCTTCTTCCTCACACTTTTGTTGAACCAAGCAAACTTCCTGA 737
Query 832 ACTATTTGTAAAAGACAAAGGAATTAGTCAAAATGGGATTTCAACAAAGCGAGTCTATCA 891
| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||
Sbjct 738 ATTATTTGTCAAAGACAAAGGAATTAGCCAAAATGGAAAATCCACAAAGCGAGTCTATCA 797
Query 892 AGTATATGGTTGTATTATTACCAGCCAAGACATGGTTGAACACAAAGATCCATCAAAGTC 951
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 798 AGTATATGGTTGTATCATTACCAGCCAAGACATGGTTGAACACAAAGATCCATCAAAGGC 857
Query 952 ATTCGACAAAGCCGACTATTATGCACACCCGGAACATTACAATCCAGTTTTCCACGAAAA 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 858 GTTCGACAAAGCCGACTATTATGCACACCCGGAACAGTACAGTCCAGTTTTCCACGAAAA 917
Query 1012 GATATCGCCATATACGTCTGTTCTTGTAAACTGTATGTACTGGGAGAAGAGGTTTCCCTG 1071
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 918 GATATCGCCGTATACGTCTGTTCTTGTAAACTGTATGTACTGGGAGAAGAGGTTTCCCCG 977
Query 1072 TCTTCTGAGCA-CAAAACAGCTTCAAGATTTAACaaaaaaaGGACTCCCACTAGTAGGCA 1130
||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |
Sbjct 978 TCTTCTGAGCATC-AAACAGCTTCAAGATTTAACAACAAAAGAACTCCCACTAGTGGGAA 1036
Query 1131 TATGTGATATAACTTGTGACATCGGTGGCTCCATTGAATTTGTTAACCGAGCTACTTTAA 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1037 TATGTGATATAACTTGTGACATCGGTGGCTCCATTGAATTTGTTAACCGAGCTACGATAA 1096
Query 1191 TCGATTCCCCTTTCTTCAGGTTTAATCCCTCGAACAATTCATACTACGATGACATGGATG 1250
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 TCGATTCCCCTTTCTTTAGGTTTAATCCCTCAAACAATTCATACTACGATGACATGGATG 1156
Query 1251 GGGATGGCGTACTATGCATGGCTGTTGACATTTTACCCACAGAATTTGCAAAAGAGGCAT 1310
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 GGGATGGCGTACTATGCATGGCCGTCGACATTTTACCCACAGAATTTGCAAAAGAGGCAT 1216
Query 1311 CCCAGCATTTTGGAGATATTCTTTCCGGATTTGTCGGTAGTTTGGCTTCAATGACTGAAA 1370
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1217 CCCAGCATTTTGGAGATATTCTTTCTGGATTTGTCGGTAGTTTGGCTTCGATGACTGAAA 1276
Query 1371 TTTCAGATCTACCAGCACATCTGAAGAGGGCTTGCATAAGCTATAGGGGAGAATTGACAT 1430
|| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1277 TTGCAGATCTGCCAGCACACCTGAAGAGGGCTTGCATAAGCTATAGGGGAGAGTTGACAT 1336
Query 1431 CTTTGTATGAGTATATTCCACGTATGAGGAAGTCAAATCCAGAAGAGGCACAAGATAATA 1490
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1337 CTTTGTATGAGTATATTCCACGTATGAGGAAGTCAAATCCAGAAGAGGCACAAGAT-A-A 1394
Query 1491 TTATCGCCAACGGGGTTTCCAGCCAGAGAACATTCAACATATTGGTATCTCTGAGCGGAC 1550
|||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1395 -TATCACTAACGGAGTTTCCAGCCAGAGAACATACAACATATTGGTATCTCTAAGCGGAC 1453
Query 1551 ACCTATTTGATAAGTTTCTGATAAACGAAGCTCTTGATATGATCGAAGCGGCTGGTGGCT 1610
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1454 ACCTATTTGATAAGTTTCTAATAAACGAAGCTCTTGATATGATCGAAGCAGCAGGTGGCT 1513
Query 1611 CATTTCATTTGGCTAAATGTGAACTGGGGCAGAGCGCTGATGCTGAATCGTACTCAGAAC 1670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 CATTTCATTTGGCTAAATGTGAACTGGGGCAGAGCGCCGATGCTGAATCGTACTCAGAAC 1573
Query 1671 TTGAAGTTGGTGCGGATGATAAGAGAGTATTGGATCAAATCATTGATTCATTAACTCGGT 1730
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1574 TTGAAGTTGGTGCGGATGATAAGAGAGTATTGGATCAAATCATTGATTCATTAACTCGAT 1633
Query 1731 TAGCTAATCCAAATGAAGATTATATATCCCCACATAGAGAAGCAAATAAGATCTCACTGA 1790
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634 TAGCTAATCCAAATGAAGATTATATATCTCCACGTAGAGAAGCAAATAAGATCTCACTGA 1693
Query 1791 AGATTGGTAAA-GTCCAGCAAGAAAATGAGATAAAAGAGAAGCCTGAAATGACGAAAAAA 1849
||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1694 AGATTGG-AAAGGTCCAGCAAGAAAATGAGGTAAAAGAGAAGCCTGAAATGACGAAGAAA 1752
Query 1850 TCAGGTGTTTTGATTCTTGGTGCTGGACGTGTGTGTCGCCCAGCTGCTGATTTCCTAGCT 1909
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||
Sbjct 1753 TCAAGTGTTTTGATTCTTGGTGCTGGACGTGTGTGTCGCCCGGCTGCTGAGCTCCTTGCT 1812
Query 1910 TCAGTTAGAACCATTTCGTCACAGCAATGGTACAAAACATATTTCGGAGCAGACTCTGAA 1969
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1813 TCAGTCAGAACCATTTCGTCACAGCAATGGTACAAAACCTATTTCGGAGCAGACTCTGAA 1872
Query 1970 GAGA-AAACAGATGTTCATGTGATTGTCGCGTCTCTGTATCTTAAGGATGCCAAAGAGAC 2028
|| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 GA-ACAAACAGATGTTCATGTGATTGTCGCATCTCTGTATCTTAAGGATGCCAAAGAGAC 1931
Query 2029 GGTTGAAGGTATTTCAGATGTAGAAGCAGTTCGGCTAGATGTATCTGATAGTGAAAGTCT 2088
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 1932 GGTTGAAGGTATTTCAGATGTAGAAGCAGTTCAGCTAGATGTGTCTGATAGTGAGAGCCT 1991
Query 2089 CCTTAAGTATGTTTCTCAGGTTGATGTTGTCCTAAGTTTATTACCTGCAAGTTGTCATGC 2148
|||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992 CCTTAAGTATATTTCTCTGGTTGATGTTGTTCTAAGTTTATTACCTGCAAGTTGTCATGC 2051
Query 2149 TGTTGTAGCAAAGACATGCATTGAGCTGAAGAAGCATCTCGTCACTGCTAGCTATGTTGA 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2052 TGTTGTAGCAAAGACATGCATTGAGCTGAAGAAACATCTCGTCACTGCTAGCTATGTTGA 2111
Query 2209 TGATGAAACGTCCATGTTACATGAGAAGGCTAAGAGTGCTGGGATAACGATTCTAGGCGA 2268
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2112 TGATGAAACGTCCATGTTACATGAGAAAGCTAAGAGTGCTGGGATAACGATTCTAGGCGA 2171
Query 2269 AATGGGACTGGACCCTGGAATCGATCACATGATGGCGATGAAAATGATCAACGATGCTCA 2328
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2172 AATGGGACTGGACCCTGGAATCGATCACATGATGGCGATGAAAATGATCAACGAGGCTCA 2231
Query 2329 TATCAAAAAAGGGAAAGTGAAGTCTTTTACCTCTTATTGTGGAGGGCTTCCCTCTCCTGC 2388
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2232 TATCAAAAAGGGGAAAGTGAAGTCTTTTACCTCTTATTGTGGAGGGCTTCCCTCTCCTGC 2291
Query 2389 TGCAGCAAATAATCCATTAGCATATAAATTTAGCTGGAACCCTGCTGGAGCAATTCGAGC 2448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 TGCAGCAAATAATCCATTAGCATATAAATTTAGCTGGAACCCTGCTGGAGCAATTCGAGC 2351
Query 2449 TGGTCAAAACCCCGCCAAATACAAAAGCAACGGCGACATAATACATGTTGATGGGAAGAA 2508
|||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2352 TGGTCAAAACCCTGCCAAATACAAAAGCAATGGTGACATAATACATGTTGATGGGAAGAA 2411
Query 2509 TCTCTATGATTCCGCGGCAAGATTCCGAGTACCTAATCTTCCAGCTTTTGCATTGGAGTG 2568
||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2412 TCTGTATGATTCAGCCACAAGATTCCGAGTACCTAATCTTCCAGCTTTTGCATTGGAGTG 2471
Query 2569 TTTTCCAAATCGTGACTCCTTGGTTTACGGGGAACATTATGGCATCGAGAGCGAAGCAAC 2628
| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2472 TCTTCCAAATCGTAACTCCTTGGTTTACGGGGACCATTATGGCATCAAGAGCGAAGCAAC 2531
Query 2629 AACGATATTTCGTGGAACACTCAGATATGAAGGGTTTAGTATGATAATGGCAACACTTTC 2688
|||||||||||| | | | | | | | | | ||||||||||||||||||
Sbjct 2532 AACGATATTTCG---A----T----T-T-A-G--T--A-T--GATAATGGCAACACTTTC 2570
Query 2689 GAAACTTGGATTCTTTGACAGTGAAGCAAATCAAGTACTCTCCACTGGAAAGAGGATTAC 2748
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2571 GAAACTTGGATTCTTTGACAATGAAACAAATCAAGTACTCTCCACTGGAAAGAGGATTAC 2630
Query 2749 GTTTGGTGCTCTTTTAAGTAACATTCTAAATAAGGATGCAGACAATGAATCAGAGCCCCT 2808
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 2631 GTTTGGTGCTCTTTTAAGTAACATTCTAAAGAGGGATGCAGACAATGAGCCAGAGCCTCT 2690
Query 2809 AGCGGGAGAAGAAGAGATAAGCAAGAGAATTATCAAGCTTGGACATTCCAAGGAGACTGC 2868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2691 AGCGGGAGAAGAAGAGATAAGCAAGAGAATTATCAAGCTTGGATATTCCAAGGAGACTGC 2750
Query 2869 AGCCAAAGCTGCCAAAACAATTGTATTCTTGGGGTTCAACGAAGAGAGGGAGGTTCCATC 2928
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2751 AGCCAAAGCTGCCAAAACAATTGTATTCTTGGGGTTCAACGAAGAGAGGGAGATTCCATC 2810
Query 2929 ACTGTGTAAAAGCGTATTTGATGCAACTTGTTACCTAATGGAAGAGAAACTAGCTTATTC 2988
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 ACTGTGTAAAAGCCTATTTGATGCAACTTGCTACCTAATGGAAGAGAAACTAGCTTATTC 2870
Query 2989 CGGAAATGAACAGGACATGGTGCTTTTGCATCACGAAGTAGAAGTGGAATTC-CTTGAAA 3047
|||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2871 TGGAAATGAGCAGGACATGGTGCTTCTGCACCACGAAGTAGAAGTGGAATTCTCT-GAAA 2929
Query 3048 GCAAACGTATAGAGAAGCACACTGCGACTCTTTTGGAATTCGGGGACATCAAGAATGGAC 3107
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2930 GCAAACGTATGGAGAAGCACAGTGCGACTCTTTTGGAATTCGGGGACATCAATAACGGAC 2989
Query 3108 AAACAACAACCGCTATGGCCAAGACTGTTGGGATCCCTGCAGCCATTGGAGCTCTGCTGT 3167
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 AAACAACGACCGCTATGGCCAAGACTGTTGGGATCCCTGCAGCCATTGGAGCTCTGCTGT 3049
Query 3168 TAATTGAAGACAAGATCAAGACAAGAGGAGTCTTAAGGCCTCTCGAAGCAGAGGTGTATT 3227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 3050 TAATTGAAGACAAGATCAAGACAAGAGGAGTCTTAAGGCCTCTCGAACCAGAGGTCTATT 3109
Query 3228 TGCCAGCTTTGGATATATTGCAAGCATATGGTATAAAGCTGATGGAGAAGGCAGAATGAT 3287
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3110 TGCCAGCTTTGGATATATTGCAAGCATATGGTATAAAGCTGATGGAGAAGACAGAATGAT 3169
Query 3288 CAAAGAACTCTGTATATTGTTTCTCTCTATAACTTGGAG 3326
||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 3170 CAA-GAACTCTGTATAATGTTTCTCT--ATAACTTGGAG 3205
> Ahg353505 jgi|Araly1|353505|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000678
Length=1491
Score = 2071 bits (1121), Expect = 0.0
Identities = 1344/1451 (93%), Gaps = 18/1451 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 92 ATGAATTCAAATGGCCATGAGGAGGAGAAGAAGTTGGGGAATGGAGTTGTGGGGATTCTA 151
||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1 ATGAAATCAAGTGG-C--GGGGAGGAGAAGAAGTTGGGGAATGGAGTTGTTGGAATTCTA 57
Query 152 GCTGAAACAGTTAACAAATGGGAGAGACGAACACCATTGACGCCATCGCATTGCGCTCGC 211
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 58 GCTGAAACAGCGAACAAATGGGAGAGACGAACACCATTGACGCCATCTCATTGCGCTCGC 117
Query 212 CTTTTACACGGTGGGAAAGACAGAACCGGCATTTCCCGCATTGTGGTTCAGCCATCTGCT 271
||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 118 CTTTTACGCGGTGACAAAGACAGAACCGGCGTTTCCCGCATTGTGGTTCAGCCATCTGGT 177
Query 272 AAGCGTATCCATCATGATGCCTTGTATGAAGATGTTGGGTGTGAAATTTCTGATGATTTG 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 178 AAGCGTATCCATCATGATGCCTTGTATGAAGATGTCGGATGTGAAATTTCTGATGATTTG 237
Query 332 TCTGATTGTGGGCTTATACTTGGAATCAAACAACCTGAGCTAGAAATGATTCTTCCAGAG 391
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 238 TCTGATTGTGGGCTTATACTCGGAATCAAACAACCTGAGCTAGAAATGATTCTTCCGGAG 297
Query 392 AGAGCATACGCTTTCTTTTCACATACTCATAAGGCACAGAAAGAGAACATGCCTTTGTTG 451
||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 298 AGAGCTTATGCTTTCTTCTCACACACTCATAAAGCACAAAAAGAAAACATGCCTTTGTTG 357
Query 452 GATAAAATTCTTTCTGAGAGAGTGACTTTGTGTGATTATGAGCTCATTGTTGGGGATCAT 511
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 358 GATAAAATTCTTTCTGAGAGAGTGACATTGTGTGATTATGAGCTCATCGTTGGAGATCAT 417
Query 512 GGGAA-ACGATTATTGGCGTTTGGTAAATATGCAGGCAGAGCTGGTCTTGTTGACTTCTT 570
||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 GGGAAGA-GATTATTGGCATTTGGTAAATATGCAGGCAGAGCTGGTCTTGTTGACTTCTT 476
Query 571 ACACGGACTTGGACAGCGATATCTAAGTCTAGGATACTCAACACCTTTCCTCTCGCTCGG 630
||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 477 ACACGGACTGGGACTGAGATATTTAAGTCTAGGATACTCAACGCCTTTCCTCTCGCTCGG 536
Query 631 TGCATCGTATATGTATTCCTCATTGGCTGCTGCAAAAGCCGCTGTAATTTCTGTTGGTGA 690
| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 537 TTCATCCTATATGTATTCCTCCTTAGCTGCAGCAAAAGCCGCTGTGATTTCTGTTGGTGA 596
Query 691 AGAAATTGCAAGCC-AGGGACTGCCATTAGGAATCTGCCCTCTTGTATTTGTCTTCACCG 749
|||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 AGAAATTGCAGGCCAAGGG-CTGCCATTAGGAATCTGCCCTCTTGTATTTGTCTTCACCG 655
Query 750 GAACAGGAAATGTTTCTCTGGGGGCGCAAGAAATTTTCAAGCTTCTTCCTCACACTTTTG 809
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656 GAACAGGAAATGTTTCTCTTGGGGTGCAAGAAATTTTCAAGCTTCTTCCTCACACTTTTG 715
Query 810 TTGAACCAAGCAAACTTCCTGAACTATTTGTAAAAGACAAAGGAATTAGTCAAAATGGGA 869
||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| |
Sbjct 716 TTGAACCAAGCAACCTTCCTGAACTATTTGCAAAAAACCAAGGAATTAGCCAAAATGGAA 775
Query 870 TTTCAACAAAGCGAGTCTATCAAGTATATGGTTGTATTATTACCAGCCAAGACATGGTTG 929
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 776 AATCAACAAAACGAGTCTATCAACTATATGGTTGTATCATTACAAGCCAAGACATGGTTG 835
Query 930 AACACAAAGA-TCCATCAAAGTCATTCGACAAAGCCGACTATTATGCACACCCGGAACAT 988
||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 AACACAA-GAATCCATCAAAGTCGTTCGACAAAGCTGACTATTATGCACACCCGGAACAC 894
Query 989 TACAATCCAGTTTTCCACGAAAAGATAT-CGCCATATACGTCTGTTCTTGTAAACTGTAT 1047
||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 TACAATCCAGTGTTCCACGAAAAGATATTC-CCTTATACGTCTGTTCTTGTAAACTGTAT 953
Query 1048 GTACTGGGAGAAGAGGTTTCCCTGTCTTCTGAGCACAAAACAGCTTCAAGATTTAACaaa 1107
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 GTACTGGGAGAAGAAGTTTCCCCGTCTTCTGAGCACCAAACAGCTTCAAGATTTAACAAA 1013
Query 1108 aaaaGGAC-TCCCACTAGTAGGCATATGTGATATAACTTGTGACATCGGTGGCTCCATTG 1166
|||| || ||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1014 AAAAAGATGTCC-ACTAGTGGGAATATGTGATATAACTTGTGATATCGGTGGCTCCATTG 1072
Query 1167 AATTTGTTAACCGAGCTACTTTAATCGATTCCCCTTTCTTCAGGTTTAATCCCTCGAACA 1226
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1073 AATTTGTTAACCGAGCTACGATAATCGATTCCCCTTTCTTTAGGTTTAATCCCTCGAACA 1132
Query 1227 ATTCATACTACGATGACATGGATGGGGATGGCGTACTATGCATGGCTGTTGACATTTTAC 1286
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||||
Sbjct 1133 ATTCATACTACGATGACATGGATGGTGATGGCGTAATATGCATGGCCATTGAAACTTTAC 1192
Query 1287 CCACAGAATTTGCAAAAGAGGCATCCCAGCATTTTGGAGATATTCTTTCCGGATTTGTCG 1346
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1193 CAACAGAATTTGCAAAAGAGGCATCCCAGCATTTTGGAGATATTCTTTCAGAATTTGTCG 1252
Query 1347 GTAGTTTGGCTTCAATGACTGAAATTTCAGATCTACCAGCACATCTGAAGAGGGCTTGCA 1406
| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 GAAGTTTGGCTTCGATGACTGAAATTGCAGATCTACCAGCACATCTGAAGAGGGCTTGCA 1312
Query 1407 TAAGCTATAGGGGAGAATTGACATCTTTGTATGAGTATATTCCACGTATGAGGAAGTCAA 1466
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 TAAGCTATATGGGAGAGTTGACATCTTTGTATGAGTATATTCCACGTATGAGGAAGTCAA 1372
Query 1467 ATCCAGAAGAGGCACAAGA-TAATATTATCGCCAACGGGGTTTCCAGCCAGAGAACATTC 1525
|||||||||||| |||| | |||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||| |
Sbjct 1373 ATCCAGAAGAGGAACAA-ACTAATATC-TC-C-AACGGGGTTTCCAACCACAGAACATAC 1428
Query 1526 AACATATTGGT 1536
|||||||||||
Sbjct 1429 AACATATTGGT 1439
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 135066326577
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5