BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G33200.1
Length=4984
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg944613 jgi|Araly1|944613|scaffold_700842.1 7862 0.0
Ahg919092 jgi|Araly1|919092|scaffold_100373.1 178 4e-43
> Ahg944613 jgi|Araly1|944613|scaffold_700842.1
Length=4610
Score = 7862 bits (4257), Expect = 0.0
Identities = 4479/4590 (98%), Gaps = 0/4590 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 157 GTCGAGCTCTTCACGAGTTCATGAGAAATTGTCTTCCAATGGAATTGAATCTGCGCAAGG 216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GTCGAGCTCTTCACGAGTTCATGAGAAATTGTCTTCCAATGGAATTGAATCTGCGCAAGG 60
Query 217 GCGACAAGGTTTGGGTCGAAGATAAGGATTTGGCTTGGATTGCTGCTGATGTCCTCGATT 276
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 61 GGGACAAGGTTTGGGTCGAAGATAAGGATTTGGCTTGGATTGCTGCTGATGTGCTCGATT 120
Query 277 CTTTTGATAACAAACTCCATGTTGAAACTTCTACTGGGAAGAAGGTTTTTGTTTCCCCGG 336
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CTTTTGATAACAAGCTCCATGTTCAAACTTCTACTGGGAAGAAGGTTTTTGTTTCCCCGG 180
Query 337 AAAAGCTATTTCGGAGGGATCCTGACGATGAAGAGCATAATGGAGTGGATGATATGACCA 396
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AAAAGCTATTTCGGAGGGATCCCGATGATGAAGAGCATAATGGAGTGGATGATATGACCA 240
Query 397 AACTGACATACTTGCACGAAGCTGGTGTTCTTTATAATCTACAGAGGAGATATGCTCTGA 456
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 241 AACTGACATACTTGCACGAAGCTGGTGTGCTTTATAATCTACAGAGGAGATACGCTCTGA 300
Query 457 ATGATATCTATACATACACTGGAAGCATTCTGATCGCTGTTAATCCATTCAAAAAGCTTC 516
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 301 ATGATATATATACATACACTGGAAGCATTCTGATCGCTGTAAATCCATTTAAAAAGCTTC 360
Query 517 CACATCTCTACAATGGGCACATGATGGAACAGTACATGGGAGCACCATTCGGTGAGCTCA 576
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CACATCTCTACAATGGGCACATGATGGAGCAGTACAAGGGAGCACCATTCGGTGAGCTCA 420
Query 577 GTCCTCATGTTTTTGCAGTTTCTGATGTTGCATACAGAGCAATGATTGACGACAGTCGAA 636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTCCTCATGTTTTTGCAGTTTCTGATGTTGCATACAGAGCAATGATTGACGACAGTCGAA 480
Query 637 GTCAGTCAATACTTGTTAGCGGTGAAAGTGGAGCTGGAAAAACTGAGACAACCAAACTAA 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GTCAGTCAATACTTGTTAGCGGTGAAAGTGGAGCTGGAAAAACTGAGACAACCAAACTAA 540
Query 697 TCATGCAGTATCTTACATTTGTTGGGGGACGTGCTACTGACGATGATAGAAGTGTTGAGC 756
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 541 TCATGCAGTATCTTACATTTGTTGGGGGACGTGCTACTGACGATAATAGAAGTGTTGAGC 600
Query 757 AGCAAGTCCTTGAATCAAATCCTCTCTTGGAAGCATTTGGCAATGCAAAAACAGTTAGAA 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AGCAAGTCCTTGAATCAAATCCTCTCTTGGAAGCATTTGGCAATGCAAAAACAGTTAGAA 660
Query 817 ATGATAATTCCAGCCGTTTTGGAAAGTTTGTCGAAATCCAGTTTGACACAAATGGTAGAA 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATGATAATTCCAGCCGTTTTGGAAAGTTTGTCGAAATCCAGTTTGACACAAATGGTAGAA 720
Query 877 TATCTGGTGCCGCAATCAGAACCTATCTTCTGGAGAGATCACGTGTTGTCCGGATAACAG 936
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 721 TATCTGGTGCCGCAATCAGAACCTATCTTCTGGAGAGATCACGTGTAGTCCGGATAACAG 780
Query 937 ACCCCGAGAGGAATTATCATTGTTTTTATCAATTGTGCGCTTCGGGGAATGACGCTGAGA 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ACCCCGAGAGGAATTATCATTGTTTTTATCAATTGTGCGCTTCGGGGAATGACGCTGAGA 840
Query 997 AATATAAACTAAGCAACCCTCGTCAATTTCATTATCTAAATCAAAGCAAGACCTATGAAT 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AATATAAACTAAGCAACCCTCGTCAATTTCATTATTTAAATCAAAGCAAGACCTATGAAC 900
Query 1057 TAGAAGGAGTCAGCAGCGCAGAAGAGTATAAGAATACAAGGAGGGCAATGGATATTGTGG 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TAGAAGGAGTCAGCAGCGCAGAAGAGTATAAGAATACAAGGAGGGCAATGGATATTGTGG 960
Query 1117 GCATAAGTCAGGATGAGCAGGAAGGGATATTTCGCACACTTGCTGCGATTCTACATCTTG 1176
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GCATAAGTCATGATGAGCAGGAAGGGATATTCCGCACACTTGCTGCGATTCTACATCTTG 1020
Query 1177 GAAATGTTGAGTTTTCCTCAGGGAGAGAGCACGACTCTTCAGTGGTAAAGGATCCGGAAT 1236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1021 GAAATGTTGAGTTTTCCTCAGGGAGAGAGCACGACTCTTCAGTGGTAAAGGATCTGGAAT 1080
Query 1237 CTAGACATCATCTGCAGATGGCTGCTGATCTTTTCAAGTGTGATGCAAATCTTTTGCTGG 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CTAGACATCATCTGCAGATGGCTGCTGATCTTTTCAAGTGTGATGCAAATCTTTTGCTGG 1140
Query 1297 CTTCGCTCTGCACACGTTCAATTCTGACCCGTGAAGGTATCATTATCAAAGCACTTGACC 1356
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1141 CTTCTCTCTGCACACGTTCAATTCTGACCCGTGAAGGTATCATTATCAAAGCACTCGACC 1200
Query 1357 CTAATGCTGCTGTTACTAGCCGGGATACCCTCGCGAAGACTGTTTACGCCCATCTATTTG 1416
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1201 CTAATGCTGCTGTTGCTAGCCGAGATACCCTCGCGAAGACCGTTTACGCCCATCTGTTTG 1260
Query 1417 ACTGGCTGGTTGATAAGATCAATAAGTCTGTTGGGCAAGATCCAGAATCTCGTTTTCAAA 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 ACTGGCTGGTTGATAAGATCAATAAGTCTGTTGGGCAAGATCCAGAATCTCGTTTTCAAA 1320
Query 1477 TAGGAGTCCTGGACATTTATGGCTTTGAATGTTTTAAGAATAACAGTTTTGAACAATTTT 1536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TAGGAGTCCTGGACATTTATGGCTTTGAATGTTTTAAGAATAACAGTTTTGAACAATTTT 1380
Query 1537 GCATCAACTTTGCAAATGAAAAGCTGCAGCAACATTTCAACGAGCATGTATTCAAGATGG 1596
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GCATCAACTTTGCAAATGAAAAGCTGCAGCAACATTTCAATGAGCATGTATTCAAGATGG 1440
Query 1597 AGCAGGATGAGTACAGAAAAGAAGAAATTAATTGGAGTTATATCGAGTTTATTGACAACC 1656
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 AGTAGGATGAGTACAGAAAAGAAGAAATTAATTGGAGTTATATCGAGTTTATTGACAACC 1500
Query 1657 AAGATGTCTTGGACCTTATTGAGAAGAAGCCTATTGGGGTGATTGCACTCTTAGATGAAG 1716
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1501 AAGATGTCTTGGACCTTATTGAGAAGAAGCCTATTGGGGTAATTGCACTCTTGGATGAAG 1560
Query 1717 CTTGCATGTTTCCTAGATCAACTCATGAGTCATTTTCAATGAAGCTGTTTCAGAACTTTA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 CTTGCATGTTTCCTAGATCAACTCATGAGTCATTTTCAATGAAGCTGTTTCAGAACTTTA 1620
Query 1777 GATTTCATCCGAGATTGGAGAAGCCAAAATTTTCAGAGACGGATTTTACTCTCTCTCATT 1836
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 AATTTCATCCGAGATTGGAGAAGGAAAAATTTTCAGAGACGGATTTTACTCTCTCTCATT 1680
Query 1837 ATGCTGGCAAGGTTACTTATCAAACTGAAGCCTTTTTGGATAAAAACCGTGATTATACTA 1896
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 ATGCTGGCAAGGTTACTTATCAAACTGAATCCTTTTTGGATAAAAACCGTGATTATACTA 1740
Query 1897 TAGTGGAGCATTGCAATCTGCTGTCTTCCTCCAAATGCCCTTTTGTTGCTGGAATTTTCC 1956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 1741 TAGTGGAGCATTGCAATCTGCTGTCTTCCTCCAAATGCCCTTTCGTTGCTGGACTTTTCC 1800
Query 1957 CCTCAGCCCCGGAGGAGTCTACCAGATCTTCTTACAAATTTTCTTCTGTATCTTCCAGAT 2016
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1801 CCTCAGCCCCAGAGGAGTCTACCAGATCTTCTTACAAATTTTCTTCTGTGTCTTCCAGAT 1860
Query 2017 TTAAGCAACAACTTCAAGCCCTCATGGAAACTCTCAGCAAAACAGAGCCTCACTATGTTC 2076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 TTAAGCAACAACTTCAAGCCCTCATGGAAACTCTCAGCAAAACAGAGCCTCACTATGTTC 1920
Query 2077 GGTGTGTGAAGCCAAACTCACTCAACAGACCTCAAAAGTTTGAGAGTCTTAGTGTTTTAC 2136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GGTGTGTGAAGCCAAACTCACTCAACAGACCTCAAAAATTTGAGAGTCTTAGTGTTTTAC 1980
Query 2137 ATCAACTTCGTTGTGGGGGTGTACTGGAAGCTGTTCGGATTAGTCTAGCAGGGTATCCCA 2196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 ATCAACTTCGTTGTGGGGGTGTACTGGAAGCTGTTCGGATTAGTCTAGCAGGGTATCCCA 2040
Query 2197 CTCGAAGGAATTATTCAGACTTCGTGGATCGTTTTGGTCTGCTAGCTCCAGAATTCATGG 2256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 CTCGAAGGAATTATTCAGACTTCGTGGATCGTTTTGGTCTGCTAGCTCCAGAATTCATGG 2100
Query 2257 ATGAGAGCAATGATGAGCAGGCACTGACTGAGAAAATCTTGAGTAAATTAGGTCTTGGGA 2316
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2101 ATGAGAGCAATGATGAGCAGGCACTAACTGAGAAAATCTTGAGTAAATCAGGTCTTGGGA 2160
Query 2317 ATTATCAGCTAGGAAGGACAAAAGTGTTCCTAAGAGCTGGTCAAATTGGCATTTTGGACT 2376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 ATTATCAGCTAGGAAGGACAAAAGTGTTCCTAAGAGCTGGTCAAATTGGCATTTTGGACT 2220
Query 2377 CTAGGCGGGCTGAAGTCCTTGATGCTTCTGCAAGACTTATTCAGCGAAGACTGAGAACAT 2436
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTAGGCGGACTGAAGTGCTTGATGCTTCTGCAAGACTCATTCAGCGAAGACTGAGAACAT 2280
Query 2437 TTGTAACGCATCAGAACTTCATCTCTGCACGGGCTTCTGCAATTTCAATTCAGGCATACT 2496
|||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2281 TTGTTACACATCAGAACTTCATCTCTGTGCGGGCTTCTGCAATTTCAATTCAGGCATATT 2340
Query 2497 GTAGAGGATGCCTGTCTCGAAATGCTTATGCCACCAGAAGGAATGCGGCGGCAGCTGTCT 2556
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 2341 GTAGAGGATGCCTGTCTCGAAATGCTTATGCCACCAGAAGGAATGCTGCGGCAGCGGTCT 2400
Query 2557 TGGTCCAAAAGCATGTGCGCAGGTGGCTGTCAAGATGTGCATTTGTAAAACTTGTATCAG 2616
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2401 TGGTCCAAAAGCATGTACGCAGGTGGCTGTCAAGATGTGCATTTGTAAAGCTTGTATCAG 2460
Query 2617 CTGCCATTGTATTACAGTCTTGCATCCGTGCTGACTCAACTCGCTTAAAGTTTTCACATC 2676
||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2461 CTGGCATTGTAATGCAGTCTTGCATCCGTGGTGACTCAACTCGTTTAAAGTTTTCACATC 2520
Query 2677 AGAAAGAGCATCGAGCTGCTTCTCTAATTCAGGCTCATTGGAGAATCCATAAGTTTCGCT 2736
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 AGAAAGAGCATCGAGCAGCTTCTCTAATTCAGGCTCATTGGAGAATCCATAAGTTTCGCT 2580
Query 2737 CAGCATTCAGGCACCGTCAGTCATCTATTATTGCTATTCAGTGTCGTTGGCGACAGAAGC 2796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 CAGCATTCAGGCACCGTCAGTCATCTATTATTGCTATTCAGTGTCGTTGGCGACAGAAGC 2640
Query 2797 TTGCGAAGAGAGAGTTTAGAAAACTTAAACAGGTTGCTAATGAAGCAGGTGCTTTGCGAT 2856
||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2641 TTGCGAATAGAGAGTTCAGAAAACTTAAACAGGCTGCTAATGAAGCAGGTGCTTTGCGGT 2700
Query 2857 TAGCTAAAACGAAACTTGAAAAACGGTTAGAAGATCTTGAATGGCGGTTGCAGCTTGAGA 2916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 TAGCTAAAACGAAACTTGAAAAACGGTTAGAAGATCTTGAATGGCGGTTGCAGCTTGAGA 2760
Query 2917 AACGATTGAGAACAAGTGGTGAAGAGGCCAAGTCAAGTGAAATATCCAAGCTTCAGAAAA 2976
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 AACGATTGAGAACAAGTGGTGAGGAGGCCAAGTCAAGTGAAATATCCAAGCTTCAGAAAA 2820
Query 2977 CATTGGAATCCTTCAGCCTCAAACTAGACGCAGCTAGGCTGGCTACCATTAATGAGTGCA 3036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2821 CATTGGAATCCTTCAGCCTCAAACTAGACGCAGCTAGGCTGGCTACCATTAATGAGTGCA 2880
Query 3037 ATAAAAATGCGGTACTTGAAAAGCAACTAGACATATCCATGAAGGAGAAGTCTGCTGTTG 3096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881 ATAAAAATGCGGTACTTGAAAAGCAACTAGACATATCCATGAAGGAGAAGTCTGCTGTTG 2940
Query 3097 AAAGAGAGCTTAATGGAATGGTTGAACTaaaaaaaGATAACGCCTTGCTGAAGAATTCGA 3156
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2941 AAAGAGAGCTTAATGGAATGGTTGAACTAAAAACAGATAACGCCTTGTTGAAGAATTCGA 3000
Query 3157 TGAACTCCTTGGAAAAGAAGAATCGGGTTCTTGAGAAGGAGCTTCTCAATGCTAAAACCA 3216
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3001 TGAACTCCTTGGAAAAGAAGAATCTGGTTCTGGAGAAGGAGCTTCTCAATGCTAAAACCG 3060
Query 3217 ATTGCAATAATACACTACAGAAGTTGAAGGAAGCTGAAAAAAGGTGTTCTGAACTCCAGA 3276
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 3061 ATTGCAATAACACACTACAGAAGTTGAAGGAAGCTGAAATAAGATGTTCTGAACTCCAGA 3120
Query 3277 CGAGTGTTCAAAGTCTTGAGGAGAAACTCTCTCATCTGGAAAACGAGAACCAGGTCTTGA 3336
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3121 CGAGTATTCAAAGTCTTGAGGAGAAACTCTCTCATCTGGAAAACGAGAACCATGTCTTGA 3180
Query 3337 TGCAAAAGACGCTAATTACATCCCCAGAGAGAATAGGACAGATACTTGGTGAAAAACACT 3396
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3181 GGCAAAAGACGCTAATCACATCCCCAGAGAGAATAGGACAGGTACTTGGTGAAAAACACG 3240
Query 3397 CTAGTGCTGTTGTACCAGCCCAAAATGACAGGAGATCTGTATTTGAGACACCAACACCTT 3456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 CTAGTGCTGTTGTACCAGCCCAAAATGACAGGAGATCTGTATTTGAGACACCAACACCTT 3300
Query 3457 CAAAGCACATCATGCCATTTTCACATAGCCTGTCAGAGTCGCGTAGATCCAAATTAACCG 3516
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
Sbjct 3301 CAAAGCACATCATGCCATTTTCACATAGCCTGTCAGAGTCACGTAGATCCAAATTCACTG 3360
Query 3517 CAGAAAGAAACCTGGAGAACTACGAATTGCTCTCCAGGTGTATAAAGGAAAATTTGGGAT 3576
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3361 CAGAAAGAAACCGGGAGAACTACGAATTGCTCTCCAGGTGTATAAAGGAAAATTTGGGAT 3420
Query 3577 TCAATGATGATAAGCCACTGGCTGCCTGTGTAATATACAAATGTCTTCTGCACTGGCGTG 3636
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 3421 TCAATGATGATAAGCCACTGGCTGCTTGTGTAATATACAAATGTCTTCTGCAGTGGCATG 3480
Query 3637 CCTTTGAATCTGAGAGCACAGCCATATTTAACATCATTATTGAGGGAATCAATGAAGCCC 3696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 CCTTTGAATCTGAGAGCACAGCCATATTTAACATCATTATTGAGGGAATCAATGAAGCCC 3540
Query 3697 TGAAGGGCGGAGATGAGAACGGTGTATTACCATATTGGCTCTCAAACGCTTCAGCACTTC 3756
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3541 TGAAGGGCGGAGATGAAAACGGTGTATTACCATATTGGCTCTCAAACGCTTCAGCACTTC 3600
Query 3757 TATGCCTCTTGCAGAGAAATCTGCGGTCAAATAGTTTTCTAAATGCAAGTGCTCAGCGTT 3816
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3601 TATGCCTCTTGCAGAGAAATCTGCGGTCAAATAGTTTTCTAAATGCTAGTGCTCAGCGTT 3660
Query 3817 CTGGGAGGGCTGCATATGGAGTAAAGTCTCCTTTTAAACTTCATGGACCTGATGATGGTG 3876
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3661 CTGGGAGGGCTGCATATGGAGTAAGGTCTCCTTTTAAACTTCATGGACCTGACGATGGTG 3720
Query 3877 CTTCGCATATAGAAGCAAGATATCCAGCATTATTATTTAAACAGCAGCTGACAGCATGTG 3936
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3721 CTTCGCATATAGAAGCTAGATATCCAGCATTATTATTTAAACAGCAGCTGACAGCATGTG 3780
Query 3937 TGGAGAAGATTTATGGTTTAATTCGTGATAATTTGAAAAAAGAATTATCACCGCTTCTGG 3996
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3781 TGGAGAAGATTTATGGTTTAATTCGTGATAATTTGAAAAAGGAATTATCACCGCTTCTGG 3840
Query 3997 GATCATGCATTCAGGCACCGAAAGCTTCACGAGGGATTGCTGGAAAATCTAGATCACCAG 4056
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3841 GATCATGCATTCAGGCACCCAAAGCTTCACGAGGGATTGCTGGAAAATCTAGATCACCAG 3900
Query 4057 GTGGTGTGCCGCAGCAATCACCGAGTAGTCAATGGGAAAGTATACTCAAATTCTTGGATT 4116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3901 GTGGTGTGCCGCAGCAATCACCGAGTAGTCAATGGGAAAGTATACTCAAATTCTTGGATT 3960
Query 4117 CTCTCATGTCTCGCCTACGCGAAAATCATGTACCCTCGTTCTTCATTCGCAAACTTGTGA 4176
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3961 CTCTTATGTCCCGCCTACGCGAAAATCATGTACCCTCGTTCTTCATTCGCAAACTTGTGA 4020
Query 4177 CTCAGGTTTTCTCATTCATCAACCTATCACTTTTCAACAGTCTTCTTCTTCGTCGTGAAT 4236
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4021 CTCAGGTTTTCTCATTTATCAACCTATCACTTTTCAACAGTCTGCTTCTTCGTCGTGAAT 4080
Query 4237 GTTGCACATTTTCAAATGGGGAATATGTGAAATCTGGGATTTCAGAATTGGAGAAGTGGA 4296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4081 GTTGCACATTTTCAAATGGGGAATATGTGAAATCTGGGATTTCAGAATTGGAGAAGTGGA 4140
Query 4297 TAGCTAATGCGAAGGAGGAGTTTGCAGGAACATCTTGGCACGAGTTAAATTACATAAGAC 4356
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4141 TAGCCAATGCGACGGAGGAGTTTGCAGGAACATCTTGGCACGAGTTAAATTACATTAGAC 4200
Query 4357 AAGCTGTTGGATTCTTGGTTATACACCAGaaaaaaaaGAAATCATTGGATGAAATCAGGC 4416
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4201 AAGCTGTTGGATTTTTGGTTATACACCAGAAAAGAAAGAAATCATTGGATGAAATCAGGC 4260
Query 4417 AGGATCTATGCCCAGTATTGACTATAAGGCAAATATATCGAATAAGTACGATGTACTGGG 4476
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4261 AGGATCTATGCCCGGTATTGACAATAAGGCAAATATATCGAATAAGTACGATGTACTGGG 4320
Query 4477 ATGATAAATATGGAACTCAAAGTGTCTCAAGTGAGGTGGTTTCTCAAATGAGGGTACTTG 4536
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4321 ATGATAAATATGGAACTCAAAGTGTCTCAAATGAGGTGGTTTCTCAAATGAGGGTACTTT 4380
Query 4537 TGGACAAGGATAACCAAAAACAAACATCAAATTCGTTCTTGCTGGACGATGATATGAGCA 4596
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4381 TGGACAAGGATAACCAAAAACTAACATCAAATTCGTTCTTGCTGGATGATGATATGAGCA 4440
Query 4597 TTCCTTTCTCTGCAGAAGATATAGACAAGGCTATTCCAGTATTAGACCCATCAGAAATAG 4656
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4441 TTCCTTTCTCCGCAGAAGATATAGACAAGGCTATTCCAGTATTAGACCCATCAGAAATAG 4500
Query 4657 AACCTCCAAAATTCGTATCAGAATATACTTGTGCACAGTCCCTTGTGAAGAAACCCTCCA 4716
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4501 AACCACCAAAATTCGTATCAGAATATACTTGTGCACAGTCCCTTGTGAAGAAACCTTCCA 4560
Query 4717 TAGCTTCAACCTCAAAGCAGATCATTTGAT 4746
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4561 CAGCTTCAACCTCAAAGCAGATCATTTGAT 4590
> Ahg919092 jgi|Araly1|919092|scaffold_100373.1
Length=4545
Score = 178 bits (96), Expect = 4e-43
Identities = 268/349 (77%), Gaps = 20/349 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 1413 TTTGACTGGCTGGTTGATAAGATCAATAAGTCTGTTGGGCAAGATCCAGAATC-TCGT-T 1470
||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||| |||||||| || || ||
Sbjct 1250 TTTGACTGGCTCGTTGAGAAGATTAATACTTCAATTGGTCAAGATCCTGATTCAAAGTAC 1309
Query 1471 TTCAAATAGGAGTCCTGGACATTTATGGCTTTGA-ATGTTTTAAGA-ATAACAGTTTTGA 1528
|| || || || || || |||||||| || || | |||| |||| | |||||||||||
Sbjct 1310 TT--GATTGGTGTTCTTGATATTTATGGATTCGAGA-GTTTCAAGACA-AACAGTTTTGA 1365
Query 1529 ACAATTTTGCATCAACTTTG-CAAATGA-AAAGCTGCAGCAACA-TTTCAA-CGAGCATG 1584
|||||||| ||||| |||| | ||||| ||| || ||||| || ||| || | |||| |
Sbjct 1366 GCAATTTTGTATCAA-TTTGACTAATGAGAAA-CTTCAGCAGCACTTT-AATC-AGCACG 1421
Query 1585 TATTCAAGATGGAGCAGGATGAGTA-CAGAAAAGAAGAAATTAATTGGAGTTATATCGAG 1643
| || || |||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||
Sbjct 1422 TCTTTAAAATGGAGCAAGAGGAGTATAAG-AAAGAGGAGATCAACTGGAGCTATATTGAG 1480
Query 1644 TTTATTGACAACCAAGATGTCTTGGACCTTATTGAGAAGAAGCCTATTGGGGTGATTGCA 1703
||| ||||||| |||||| | || ||||| || || ||||| || || | |||||
Sbjct 1481 TTTGTTGACAATCAAGATATTTTAGACCTAATAGAAAAGAAACCCGGAGGTATTATTGCT 1540
Query 1704 C-TCTTAGATGAAGCTTGCATGTTTCCTAGATCAACTCATGAGTCATTT 1751
| || | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||
Sbjct 1541 CTTC-TCGATGAAGCTTGCATGTTTCCTAGATCAACACACGAGACATTT 1588
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 188651389361
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5