BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G33240.1
Length=5786
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2 9382 0.0
Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1 52.8 3e-05
> Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2
Length=5668
Score = 9382 bits (5080), Expect = 0.0
Identities = 5485/5682 (97%), Gaps = 22/5682 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 95 TCTTGAATCAAGCATAAATTCTGGA-TTTTGAAGTTTGAGAGTGACCCAGTGACTTTGGT 153
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1 TCTTGAATCGAGCATAAATTCTGGATTTTTGAAGTTTGAGAGTGATCCAGTGAC-TTGGT 59
Query 154 CTGAATCTCGGAGGTATCTTATTCCAGGGATCAAGGATTAGACTTAATGCGATTAAGCAA 213
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 60 CTCAATCTCGGAGGTATCTTATTCCAGGGATCAAGGATTAGACTTAATGCGATTTAGCAA 119
Query 214 ATGGGTTTTTCACGATGACTCTCCTTGTTGTTGGGGAGATTCAATAAATGGACTCACAAG 273
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 120 ATGGGTTTTTCATGAAGACTCTCCTTGTTGTTGGGGAGATTCAATAAATGGACTCACCAG 179
Query 274 ATCACAAAGCACCTGGCTTTGTTGACATAGTCAAATCTTGGATCCCTAGAAAGAGTGAGT 333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 ATCACAAAGCACCTGGCTTTGTTGACATAGTCAAATCTTGGATCCCTAGAAAGAGTGAGT 239
Query 334 CCTCAAATATGTCGAGGGATTTTTGGATGCCTGACCAAAGCTGTCCTGTGTGTTATGAGT 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct 240 CCTCAAATATGTCGAGGGATTTTTGGATGCCTGACCAGAGTTGTCCTGTGTGTTACGAGT 299
Query 394 GTGATGCTCAGTTCACTGTGTTTAATCGAAGACATCATTGCCGCCTTTGTGGTCGAGTTT 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 300 GTGATGCTCAGTTCACTGTGTTTAATCGAAGACATCATTGCCGGCTTTGTGGTCGAGTGT 359
Query 454 TTTGTGCCAAATGCGCTGCAAATTCCATTCCATCTCCATCAGATGAAACAAAGGATAGTC 513
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TTTGTGCCAAATGCGCTGCAAATTCTATCCCATCTCCATCAGATGAAACAAAGGATAGTC 419
Query 514 ATGAGGAACCAGAAAGGATTAGGGTGTGTAATTACTGCTACAAACAGTGGGAACAGGGGA 573
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 ATGAGGAGCCAGAAAGGATTAGGGTTTGTAATTACTGCTACAAACAGTGGGAACAGGGGA 479
Query 574 TAGTTCCCCCTGATAATGGGGCTTCTATTATTAGCCTTCATTTTAGTTCATCGCCTTCTG 633
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 480 TAGTTCCCCCTGATAATGGGGCTTCTATTATTAGCCTTCATTTTAGTTCATCCCCTTCTG 539
Query 634 CTAGAAGCGTCGCAAGTACTACCTCTAATAGTAGCAACTGCACCATTGATTCAACTGCTG 693
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CTAGAAGCGTGGCAAGTACTACCTCTAATAGTAGCAATTGCACCATTGATTCAACTGCTG 599
Query 694 GACCTTCCCCTAGACCCAAAATGAATCCCCGAGCTAGCCGTCGTGTCTCGTCAAACATGG 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
Sbjct 600 GACCTTCCCCTAGACCCAAAATGAATCCCCGAGCTAGCCGTCGCGTCTCGTTAAACATAG 659
Query 754 ATTCTGAAAAGTCTGAGCAGCAGAATGCAAAATCGCGTAGGAG-CTCAGATCATTATGGG 812
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||
Sbjct 660 ATTCTGAAAAGTCTGAGAAGCAGAATGCAACATCGCGTAGGAGCCT-GGATCCTTATGGG 718
Query 813 CATGTGTTAGATTCTTCTGATAATCAAGTTGAATTCTTTGTCAACAGTAGTGGCAGGAGT 872
|||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 719 CATGTGCTAGA---TTCTGAAAATCAAGTTGAATTCTTTGTGAAC---AGTGGCAGGAGT 772
Query 873 GATGGTGAAGCTGATGACGATGACGATTATCAATCTGATTTTGCACAATCTTACGCTCAA 932
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 GATGGTGAAGCTGATGATGATGACGATTATCACTCTGATTTTGCACAATCTTACGCTCAA 832
Query 933 GGAAATGACTACTATGGTGCCATCAACCTCGATGAAGTAGACCATATCTATGGGTCACAT 992
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 833 GGAAATGACTACTATGGTGCCATCAGCCTCGATGAAGTAGACCAGATCTATGGGTCACAT 892
Query 993 GAAGCTCATGACGTTGGTGTAAAAATAGAACCAAACATAAGTGGCTTTCCCCCTGATCAA 1052
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 893 GAAGCTCATGACGTTGGTGTAAAAATAGAACCAAACATAAGTTGCTTTCCCCCTGATCAA 952
Query 1053 GATCTTGACTCACTGAATACAGAGACGATAGATAAAACCAGACAACAAGAAAATGGATGG 1112
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 GATCTTGACTCACTGAATACAGATACGATAGATAAAACCAGACAACAAGAAAATGGATGG 1012
Query 1113 AACGATGTAAAGGAGGGAAGCCCTCCTTGTGAAGAGTCCTTTGAGCCCGAAGTTGTTGAT 1172
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct 1013 AACGATGTGAAGGAGGGAAGCCCTCCTTGTGAAGAGTCTTTTGAGCCCGAAGTAGTGGAT 1072
Query 1173 TTTGAGAGTGATGGGCTCTTATGGCTACCACCAGAGCCAGAGAACGAAGAAGATGAAAGA 1232
|||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 TTTGAGAGCGATGGCCTGTTATGGCTACCGCCAGAGCCAGAGAACGAAGAAGATGAAAGA 1132
Query 1233 GAAGCAGTGCTATCTGATGATGACGGTGATGAAGGTGATAGAGGTGATTGGGGGTACCTT 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1133 GAAGCAGTGCTATCTGATGATGACGGTGATGAAGGTGATAGAGGTGACTGGGGCTACCTT 1192
Query 1293 CGCCCATCAAATAGCTTTAACGAGAAGGATTTCCACTCTAAGGACAAGTCCAGTGGTGCT 1352
|||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1193 CGCCCATCAAATAGCTTTAATGATAAGGACTTCCACTCTAAGGATAAGTCCAGTGGTGCT 1252
Query 1353 ATGAAAAATGTTGTTGAAGGGCACTTTAGGGCTTTGGTAGCACAACTTTTGGAGGTTGAT 1412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1253 ATGAAAAATGTTGTTGAAGGGCACTTTAGGGCTTTGGTAGCCCAACTTTTGGAGGTTGAT 1312
Query 1413 AATCTACCTATGGTCAACGAAGGTGATGAAGAGGGCTGGCTTGATATAATTACATCATTA 1472
|||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 AATCTACCCATGGTCAATGAAGGGGATAAAGAGGGCTGGCTTGATATAATTACATCATTA 1372
Query 1473 TCTTGGGAGGCTGCAACGCTTCTCAAGCCAGATACAAGTAAAAGTGGAGGAATGGATCCA 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 TCTTGGGAGGCTGCAACGCTTCTCAAGCCAGATACAAGTAAAAGTGGAGGAATGGATCCA 1432
Query 1533 GGAGGATACGTGAAGGTTAAATGCATCCCTTGTGGACGTCGCAGTGAGAGTATGGTCGTG 1592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1433 GGAGGATACGTGAAGGTTAAATGCATCCCTTGTGGACGTCGCAGTGAAAGTATGGTCGTG 1492
Query 1593 AAAGGAGTTGTTTGTAAGAAAAATGTGGCTCATCGGCGAATGACTTCAAAGATCGAGAAG 1652
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1493 AAAGGAGTTGTTTGTAAAAAAAATGTGGCCCATCGGCGAATGACTTCAAAGATTGAGAAG 1552
Query 1653 CCGCGTCTGCTAATCCTTGGAGGAGCTCTGGAGTATCAGCGCATCTCTAACCAGCTGTCT 1712
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 CCACGTCTGCTAATCCTTGGAGGAGCTCTGGAGTATCAGCGCATCTCTAACCAGCTGTCT 1612
Query 1713 AGTTTTGACACTTTGTTGCAACAGGAAATGGACCATTTGAAGATGGCTGTTGCCAAAATT 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 AGTTTTGACACTTTGTTGCAACAGGAAATGGACCATTTGAAGATGGCTGTTGCCAAAATT 1672
Query 1773 GATTCTCACAATCCTGACATTCTCTTGGTGGAGAAATCTGTCTCGCGGTTTGCGCAGGAA 1832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1673 GATTCTCACAATCCTGACATTCTCTTGGTGGAGAAATCTGTATCGCGATTTGCGCAGGAA 1732
Query 1833 TATCTTCTCGCGAAGGACATATCTCTCGTGTTAAATATTAAAAGGTCCCTTCTAGAGCGC 1892
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1733 TATCTTCTTGCGAAGGACATATCTCTTGTGTTAAATATTAAAAGGTCCCTTCTAGAGCGC 1792
Query 1893 ATATCCCGCTGTACTGGTGCGCAGATTGTCCCTTCGATCGACCAGCTCACATCACCAAAG 1952
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 ATATCTCGCTGTACTGGTGCGCAGATTGTCCCTTCGATCGACCAGCTCACATCACCAAAG 1852
Query 1953 CTAGGTTATTGTGACCTGTTCCATGTGGAAAAGTTTGTGGAGACACATGTTAGTCCTTGT 2012
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 1853 CTGGGTTATTGTGACCTGTTCCATGTGGAAAAGTTTGTCGAGAAACATGTTAGTCCTTGT 1912
Query 2013 CAAGTTGCGAAGAAAATGGCCAAGACTTTAATGTTTTTTGATGGCTGCCCGAAACCTTTG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 CAAGTTGCGAAGAAAATGGCCAAGACTTTAATGTTTTTTGATGGCTGCCCGAAACCTTTG 1972
Query 2073 GGTTGTACAATATTGCTCAAGGGGGCACATGAAGATGAGCTAAAGAAGGTGAAACATGTG 2132
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973 GGTTGTACAATATTGCTTAAGGGGGCGCATGAAGATGAGCTAAAGAAGGTGAAACATGTG 2032
Query 2133 ATTCAGTATGGAGTTTTTGCAGCATATCACTTGGCTCTTGAGACATCCTTCCTAGCAGAT 2192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 ATTCAGTATGGAGTTTTTGCAGCATATCACTTGGCTCTTGAGACATCCTTCCTAGCAGAT 2092
Query 2193 GAAGGTGCTTCCATT-CACGAACTTCCTCTGCAGACCCCAATTACTGTGGCGTTACCTGA 2251
|||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2093 GAAGGTGCTTCCCTTCCA-GAACTTCCTCTGCAGACCCCAATTACAGTGGCTTTACCTGA 2151
Query 2252 TAAACCATCAATGGTTAACAGATCAATATCCACAATACCTGGTTTTACTGTGTCAAGTGC 2311
||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 TAAACCATCAACGATTAACAGATCAATATCGACAATACCTGGTTTTACTGTGTCAAGTGC 2211
Query 2312 TGAAAAGTCTCCAACTACTGAGTTAAGGGGTGAGCCACATAAAGCCAATGGCGACCTTAC 2371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 TGAAAAGTCTCCAACTACTGAGTTAAGGGGTGAGCCACATAAAGCCAATGGCGACCTTAC 2271
Query 2372 TGGTAATTTCACTTCTAGTAAGACTCATTTCCAAGGGAAATTGGATGGAAACGACAGGAT 2431
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 CGGTAATTTCACTTCTAGTAAGACTCATTTGCAAGGGAAATTGGATGGAAACGACAGGAT 2331
Query 2432 TGACCCATCTGAAAGACTGCTTCACAACTTGGATACTGTTTACTGTAAGCCTCCAGAAAC 2491
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 TGACCCATCTGAAAGACTGCTTCACAACTTGGATACTGTTTACTGTAAGCCTCCAGAAAT 2391
Query 2492 TATTACCTCTAAGGACGATGGGTTAGTTCCTACTCTAGAATCCAGGCAGCTATCATTTCA 2551
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 2392 TATTACCACTAAGGTCGATGGGTTAGTTCCTACTCTAGAACCCAGGCAGCTATCGTTTCA 2451
Query 2552 CGTGGAAGAACCTTCTGTTCAAAAAGATCAGTGGTCTGTTTTATCCGGTGCCACAGAACA 2611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2452 CGTGGAAGAACCTTCTGTTCAAAAAGATCAGTGGTCTGTTTTACCCGGTGCCACAGAAAA 2511
Query 2612 AGTAACAGATGGTGGTTACACGAATGACTCCGCAGTAATAGGAAATCAAAATTTTAATAG 2671
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2512 AGTAACCGAGGGTGCTTACACGAATGACTCCGCAGTAATAGGAAATCAAAATTGTAGTAG 2571
Query 2672 ACAGGAACAAATGGAATCTTCAAAAGGAGACTTTCATCCGTCAGCTTCTGACCATCAAAG 2731
||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 ACAGGAACAGATAGACTCTTCAAAAGGAGACTTTCTTCCATCAGCTTCTGACCATCAAAG 2631
Query 2732 TATATTGGTTTCCTTATCAACAAGATGCGTATGGAAAGGATCTGTGTGTGAGCGGGCTCA 2791
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2632 TATATTGGTTTCCTTATCAACAAGATGTGTATGGAAAGGATCTGTGTGTGAGCGGGCTCA 2691
Query 2792 TCTACTCCGTATCAAATACTATGGGAGCTTTGACAAGCCTTTAGGACGGTTTTTAAGGGA 2851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2692 TCTACTCCGTATCAAATACTATGGGAGCTTTGACAAGCCTTTAGGACGGTTCTTAAGGGA 2751
Query 2852 TAATCTCTTTGATCAGGATCAGTGCTGCCCGTCATGTACGATGCCAGCGGAAGCACACAT 2911
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2752 TAATCTCTTTGATCAGGATCAGTACTGCCCGTCATGTACGATGCCAGCGGAAGCACACAT 2811
Query 2912 TCATTGTTATACTCATAGGCAAGGTAGTCTGACAATATCTGTTAAGAAACTGCCTGAATT 2971
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 TCATTGTTATACTCATAGGCAAGGTAGCCTGACAATATCTGTTAAGAAACTGCCTGAATT 2871
Query 2972 GCTACCTGGGCAACGTGAAGGGAAGATTTGGATGTGGCATCGGTGCCTGAAATGTCCTCG 3031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 GCTACCTGGGCAACGTGAAGGGAAGATTTGGATGTGGCATCGGTGCCTGAAATGTCCTCG 2931
Query 3032 GATCAATGGCTTTCCTCCAGCCACACGCAGAATTGTAATGTCAGATGCTGCGTGGGGCCT 3091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 GATCAATGGCTTTCCTCCAGCCACACGCAGAATTGTAATGTCAGATGCTGCGTGGGGCCT 2991
Query 3092 GTCTTTTGGCAAATTTTTGGAGCTGAGCTTTTCTAACCATGCAGCGGCTAGTCGTGTGGC 3151
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2992 GTCTTTTGGCAAATTTTTGGAACTGAGCTTTTCTAACCATGCAGCGGCTAGTCGTGTGGC 3051
Query 3152 CAACTGTGGTCATTCCCTTCACAGAGACTGTCTCCGGTTCTACGGTTTTGGGAGAATGGT 3211
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3052 CAACTGTGGTCATTCCCTTCACAGAGACTGTCTCCGGTTCTATGGTTTTGGGAGAATGGT 3111
Query 3212 TGCTTGCTTCCGCTATGCTTCAATCAATATTTACGCAGTGACTCTGCCACCAGCAAAGCT 3271
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 3112 GGCTTGCTTCCGCTATGCTTCAATCAATATTTTCGCAGTGTTTCTGCCACCAGCAAAACT 3171
Query 3272 TTATTTTAACTATGAGAACCAGGAATGGCTCCAAAAGGAATCAAAAGAGGTGATTAAAAA 3331
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3172 TGAGTTTAACTATGAGAACCAGGAATGGCTCCAAAAGGAATCAAAAGAGGTGATTAAAAA 3231
Query 3332 AGCGGAAGTCCTTTTTAATGAGGTTCAGGAGGCTCTTAGTCAAATTTCAGC-GAAAACTA 3390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
Sbjct 3232 AGCGGAAGTCCTTTTTAATGAGGTTCAGGAGGCTCTTAGTCAAATTTCA-CTGAAAACAA 3290
Query 3391 TGGGCGCAGGTTCCAAGGGCAGCACTCCCAACAAGATCAAGCTTTCTCTTGAAGAACTTG 3450
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 TGGGTACAGGTTCCAAGGGCAGCACTCTCAACAAGATAAAGCTTTCTCTTGAAGAACTTG 3350
Query 3451 CAGGACTTCTTGAGCAACGTAAAAAGGAATATAAGGATTCATTGCAGCAAATGTTAAATG 3510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3351 CAGGACTTCTTGAGCAACGTAAAAAGGAATATAAGGAATCATTGCAGCAAATGTTAAATG 3410
Query 3511 TGGTTAAGGATGGACAACCTACTATTGATATCCTTCTGATAAATAAACTTCGAAGGCTGA 3570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 TGGTTAAGGATGGACAACCTACTATTGATATCCTTCTGATAAATAAACTTCGAAGGCTGA 3470
Query 3571 TAATTTTCGATTCATATGCTTGGGATGAATGCCTAGCAGGGGCGGCCAATATGGTAAGAA 3630
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 3471 TACTTTTCGATTCATATGCTTGGGATGAATGCCTAGCAAGGGCGGCCAGTATGGTAAGAA 3530
Query 3631 ATAACTATT-TGGAAGCTCCGAAGAATTCAGCCCCAAAAGTTATGGGTCGTAACGTCTCC 3689
||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3531 ATAACTATTCT-GAAGCTCCGAAGAATTCTGCCTCAAAATTTATGGGTCGTAACGTCTCC 3589
Query 3690 TTAGAGAAGCTCAGTGATGAAAAAGTAAAGTCGATACCGACCCATGTTGCAATTTGTAAT 3749
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | |||||
Sbjct 3590 TTAGAGAAGCTCAGTGATGAAAAAATAAAGTCGATACCGTCCCATGTTGCCAGTAGTAAT 3649
Query 3750 GACTCTCTTCTCCAGGATGCAGACTACGAAACGTGTCTTAACCAAGGTAAATCATTTGCT 3809
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 GACTCTCTTCTCCAGGATGCAGAGTACGAAACATGTCCTAACCAAGGTAAATCATTTGCT 3709
Query 3810 GATACTAGTGGCAAATTTGCTATTCCTGAAGATGTAGGCTCAGACAGACCCCCAGATTGT 3869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||
Sbjct 3710 GATACTAGTGGCAAATTTGCTATTCCTGAAGATGTAGGCCCAGACATACCCCCAGAATGT 3769
Query 3870 AGGATGGAGTTCGACCCTAGTGAAGGTGGTAAAGATAATTTTGTAGAGTCTTCGCAGGTG 3929
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct 3770 AGGATGGAGTTCGACCCTAGTGAAGGTGGTAAAGATAACTTTGTGGAGTCTTCACAGGTG 3829
Query 3930 GTTAAACCAGCACACACCGAGAGCCAGTTTCAAGCAACAGACTTATCTGATACTCTTGAT 3989
|||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3830 GTTAAAGCAGTACACTCCGAGAGCCAGTATCAAGCAACAGACTTATCTGATACTCTTGAT 3889
Query 3990 GCAGCATGGATAGGTGAACAAACTACTTCAGAGAATGGTATTTTCCGTCCGCCTAGCAGA 4049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3890 GCAGCATGGATAGGTGAACAAACTACTTCAGAGAATGGTCTTTCCCGTCCGCCTAACAGA 3949
Query 4050 GCTGCTTCAACAAATGGAACTCAGATCCCTGATTTAAGGCTGTTGGGTTCAGAAAGTGAG 4109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3950 GCTGCTTCAACAAATGGAACTCAGATCCCTGATTTAAGGCTGTTGGGTTCAGAAAGTGAG 4009
Query 4110 CTGAACTTTAAAGGAGGCCCTACCAATGATGAACATACAACACAAGTTCAGTTGCCTTCT 4169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4010 CTGAACTTTAAAGGAGGCCCTACCAATGATGAACATACAACACAAGTTCAGTTGCCTTCT 4069
Query 4170 CCTAGTTTCTACTATTCACTCAACAAGAATTATTCGCTTAATTCTCGCAAGCATATCATG 4229
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4070 CCTAGTTTCTACTATTCACTCAACAAGAATTATTCGCTTAATTCTCGCAAGCATATTATG 4129
Query 4230 GCTGAAGACCGGCCTGTTTATGTTTCTTCATATAGAGAGCTTGAATGGCGAAGTGGTGCA 4289
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4130 GCTGAAGACCGGCCGGTTTATGTTTCTTCATATAGAGAGCTTGAATGGCGAAGTGGTGCG 4189
Query 4290 AGGCTGCTGCTTCCTCTGGGATGTAATGACTTAGTACTGCCAGTTTATGATGACGAACCT 4349
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4190 AGGTTGCTGCTTCCTCTGGGATGTAATGACTTAGTACTGCCAGTTTATGATGACGAACCT 4249
Query 4350 ACTAGTATCATAGCTTATGCCCTTACATCATCAGAATATAAAGCTCAGATGTCTGGATCA 4409
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4250 ACTAGTATCATAGCTTATGCCCTTACGTCATCAGAATATAAAGCTCAGATGTCTGGATCA 4309
Query 4410 GATAAGTCAAGAGATCGCTTGGATAGTGGAGGTTCCTTTTCACTTTTTGATTCTGTTAAT 4469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4310 GATAAGTCAAGAGATCGCTTGGATAGTGGAGGTTCCTTTTCACTTTTTGATTCTGTTAAT 4369
Query 4470 CTTCTCTCATTGAACTCTTTGAGTGATTTGTCGGTCGACATGAGTAGAAGTCTTAGCTCT 4529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4370 CTTCTCTCATTGAACTCTTTGAGTGATTTGTCGGTCGACATGAGTAGAAGTCTTAGCTCT 4429
Query 4530 GCTGATGAACAAGTCTCGCAGCTGCTACATTCATCACTGTATTTGAAAGATCTGCATGCG 4589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4430 GCTGATGAACAAGTCTCGCAGCTGCTACATTCATCACTGTATTTGAAAGATCTGCATGCG 4489
Query 4590 AGGATTTCGTTTACAGATGAAGGTCCTCCTGGGAAAGTGAAGTACTCTGTGACGTGTTAT 4649
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4490 AGGGTTTCGTTTACAGATGAAGGTCCTCCTGGGAAAGTGAAGTACTCTGTGACGTGTTAT 4549
Query 4650 TATGCTAAGGAGTTTGAAGCCCTGAGGATGATTTGCTGTCCTTCAGAAACAGATTTCATT 4709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4550 TATGCTAAGGAGTTTGAAGCCCTGAGGATGATTTGCTGTCCTTCAGAAACAGATTTCATT 4609
Query 4710 AGATCTCTTGGTCGTTGTAGAAAATGGGGAGCCCAGGGTGGAAAGAGCAACGTCTTCTTT 4769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4610 AGATCTCTTGGTCGTTGTAGAAAATGGGGAGCCCAGGGTGGAAAGAGCAACGTCTTCTTT 4669
Query 4770 GCAAAAAGTTTGGATGACCGTTTTATCATCAAGCAAGTTACAAAGACAGAGCTTGAGTCC 4829
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4670 GCAAAAAGTTTGGATGACCGTTTTATAATCAAGCAAGTTACAAAGACAGAGCTTGAGTCC 4729
Query 4830 TTCATCAAATTTGGGCCAGCTTACTTCAAATACCTGACTGAGTCCATCAGTACTAAAAGC 4889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4730 TTCATCAAATTTGGGCCAGCTTACTTCAAATACCTGACTGAGTCCATCAGTACTAAAAGC 4789
Query 4890 CCTACAAGCCTTGCAAAGATCTTGGGAATCTATCAGGTTTCATCCAAACACCTTAAAGGA 4949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4790 CCTACAAGCCTTGCAAAGATCTTGGGAATCTATCAGGTTTCATCCAAACACCTTAAAGGA 4849
Query 4950 GGAAAAGAGTTCAAAATGGACGTCTTGGTGATGGAGAATCTTCTGTTCAAGCGAAACTTC 5009
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4850 GGAAAAGAGTTCAAAATGGACGTCTTGGTGATGGAAAATCTTCTGTTCAAGCGGAACTTC 4909
Query 5010 ACTAGGCTTTATGACCTAAAAGGCTCCACTCGGGCTCGTTACAATCCCGATACAAGTGGT 5069
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4910 ACTAGGCTTTATGACCTAAAAGGCTCCACTCGTGCTCGTTACAATCCCGATACAAGTGGT 4969
Query 5070 AGCAATACAGTTTTGCTGGATCAGAATCTTGTCGAAGCAATGCCAACATCTCCAATATTT 5129
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4970 AGCAATACAGTTTTGCTGGACCAGAATCTGGTCGAAGCAATGCCGACATCTCCAATATTT 5029
Query 5130 GTTGGGAGCAAGGCAAAACGGCTTCTTGAAAGAGCAGTCTGGAATGATACATCATTTCTT 5189
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5030 GTTGGGAGCAAGGCAAAACGTCTTCTTGAAAGAGCAGTCTGGAATGATACATCCTTTCTT 5089
Query 5190 GCTTCGATTCACGTAATGGATTACTCCTTACTAGTCGGGGTAGATGAGGAAAGAAACGAG 5249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5090 GCTTCGATTCACGTAATGGATTACTCCTTACTAGTCGGGGTAGATGAGGAAAGAAACGAG 5149
Query 5250 CTGGTTCTAGGAATTATCGATTTCATGAGGCAATACACTTGGGACAAACATCTGGAGACT 5309
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5150 CTGGTTTTAGGAATTATCGATTTCATGAGGCAATACACTTGGGACAAACATTTGGAGACT 5209
Query 5310 TGGGTCAAGACTTCAGGGCTCCTTGGAGGACCCAAGAACTCAACTCCCACAGTGATATCG 5369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 5210 TGGGTCAAGACTTCAGGGCTCCTTGGAGGACCCAAGAACTCAACTCCAACAGTAATATCG 5269
Query 5370 CCGCAGCAATACAAGAAAAGATTCAGGAAAGCGATGACGGCTTATTTTCTGATGGTTCCT 5429
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5270 CCTCAGCAATACAAGAAAAGATTCAGGAAAGCGATGACGGCTTATTTTGTGATGGTTCCT 5329
Query 5430 GACCAGTGGTCGCCTGCCGCGGTTGTGCCAAGCAACAGTTCTTCAGCAGAGGTGAAGGAG 5489
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5330 GACCAATGGTCGCCTGCCACGGTTGTGCCAAGCAACAGTTCTGCAGCAGAGGTGAAGGAG 5389
Query 5490 GAAGAAGAGAAAGACAATCCTCAAGCTGTTGGTAACAAGTCCTGAAGTATTTTCAGCAA- 5548
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 5390 GAAGAAGAGAGAGACAATCCTCAAGCTGTTGGTAACAAGTCCTGAAGCATTTTCTGCAAG 5449
Query 5549 A--CATACACAATATTCAGTTAGCAAATATAGtttttattttttttGGTTGGAATGGTCT 5606
| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5450 AGACATACACGATATTCAGTTAGCAGATATAGTTTTTATTCTTTTTGGTTGGAATGGTCT 5509
Query 5607 TTTGGGTAATTTGTGTTTATGTATTACCCTTGGCCTTAAGTGTGGCATATGCCTCTTCCA 5666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 5510 TTTGGGTAATTTGTGTTTATGTATTACCCTTGGCCTTAGGTGTGGCCTATGCCTCTTCCA 5569
Query 5667 TCGCCTTTGCATCAGAATTAATAAAAGAAAGATGCAATTGTACAGACACTGCTTCTATCT 5726
|||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5570 TCGCCTTTGCATCAGAATTAATGAAAGCAAGATGCAATTGTACATACACTGCTTCTATCT 5629
Query 5727 TTTAGTGTTTGTTATTCGTCGTAACTTATGTTTTTATCAACA 5768
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 5630 TTTAGTGTTTGTTATTCGT--TA-CTTATGTTTTTATCAACA 5668
> Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1
Length=5702
Score = 52.8 bits (28), Expect = 3e-05
Identities = 28/28 (100%), Gaps = 0/28 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3981 ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC 4008
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4100 ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC 4127
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 219173562907
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5