BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G34100.1
Length=3660
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg328336 jgi|Araly1|328336|fgenesh1_pm.C_scaffold_7000563 5529 0.0
Ahg353421 jgi|Araly1|353421|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000594 2124 0.0
> Ahg328336 jgi|Araly1|328336|fgenesh1_pm.C_scaffold_7000563
Length=3327
Score = 5529 bits (2994), Expect = 0.0
Identities = 3218/3329 (97%), Gaps = 4/3329 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 124 ATGGAGATTTCCCCGGCCGATTCGTTGTCCATCTCTGGCGCGGCTGCTTCTGAGGTCGTC 183
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGATTTCCTCGGCCGAATCGTTGTCCATCTCTGGCGCGGCCGCTTCTGAGGTCGTC 60
Query 184 TCCGAGCCTTCCGTATCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGCCGAATCAGGCATCACCCAAT 243
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 61 TCTGAGCCTTCCGTATCTTCTTCTTCTTCCTCTTCGTCGCCGAATCAGGCCTCCCCCAAT 120
Query 244 CCTTTCTCAAACATGGATCCTGCAGTTTCGACGGCGACAGGATCGAGGTACGTTGATGAT 303
||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCTTTGTCAACCATGGATCCCGCAGTTGCGACGGCGACAGGGTCGAGGTACGTTGATGAT 180
Query 304 GACGAAGATGAAGAGGACGTTTGCAGGATCTGCAGAAATCCTGGTGATGCAGACAATCCG 363
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 181 GACGAAGATGAGGAGGACGTGTGCAGGATCTGCAGAAATCCTGGCGATGCGGACAATCCG 240
Query 364 CTTCGGTATCCGTGTGCCTGTAGCGGAAGTATCAAATTTGTTCACCAGGATTGTCTCCTT 423
|||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTTCGGTATCCGTGTGCCTGTAGCGGGAGCATCAAGTTTGTTCACCAGGATTGTCTCCTT 300
Query 424 CAGTGGCTTAATCACAGCAACGCTCGTCAATGCGAGGTTTGCAAGCATCCTTTTTCATTC 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CAGTGGCTTAATCACAGCAACGCTCGTCAATGCGAGGTTTGCAAGCATCCTTTTTCATTC 360
Query 484 TCCCCAGTATATGCTGACAATGCTCCGTCAAGGCTCCCTTTCCAGGAGTTTGTAGTTGGC 543
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TCCCCAGTGTATGCTGACAATGCTCCGTCAAGGCTCCCTTTCCAGGAGTTTGTAGTTGGC 420
Query 544 ATTGCTATGAAAGCTTGCCATGTTTTACAGTTCTTTCTGCGGTTGAGTTTTGTGCTTTCT 603
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 421 ATTGCTATGAAAGCTTGCCATGTTTTACAGTTCTTTCTGCGGTTAAGTTTTGTGCTTTCT 480
Query 604 GTCTGGCTTCTCACTATACCTTTCATTACATTTTGGATATGGCGTTTGGCTTTCGTGCGA 663
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 481 GTCTGGCTTCTCACTATACCTTTCATTACATTTTGGATATGGCGATTGGCTTTCGTGCGA 540
Query 664 ACTTTTGGTGAAGCTCAAAGGTTGTTCTTAAGCCACATCTCCACCACAGTAATTCTCACT 723
| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGTTTTGGTGAAGCTCAGAGGTTGTTCTTAAGTCACATCTCCACCACAGTAATTCTCACC 600
Query 724 GATTGCTTGCATGGGTTCTTACTATCTGCAAGTATTGTCTTCATCTTCCTTGGAGCTACT 783
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GATTGCTTGCATGGGTTCTTACTATCGGCAAGTATTGTCTTCATCTTCCTTGGAGCTACT 660
Query 784 TCATTAAGGGACTACTTTAGGCACTTACGAGAGCTTGGGGGACAAGAAGAGAGAGATGAT 843
|| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 661 TCCTTAAGGGACTACTTTAGGCATTTACGAGAGCTTGGGGGACAAGAAGAGAGAGAAGAT 720
Query 844 GATGTGGACAGAAATGGTGCTCGTGCTGCAAGAAGACCTGCTGGACAGGCTAATAGGAAT 903
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GATGGGGACAGAAATGGTGCTCGTGCTGCAAGAAGACCTGCTGGACAGGCTAATAGGAAT 780
Query 904 CTTGCTGGAGAGGGGAATGGTGAAGATGCTGGGGATCAGGGTGCTGCGGTTGGTCAGATT 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 781 CTTGCTGGAGAGGGGAATGGTGAAGATGCTGGGGATCAGGGTGCTGCTGCTGGTCAGATT 840
Query 964 GCTAGAAGGAATCCTGAAAATGTTCTGGCAAGGTTGGACATACAAGCAGCTCGTCTTGAG 1023
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GTTAGAAGGAATCCTGAAAATGTTCTGGCAAGGTTGGACATACAAGCAGCTCGTCTTGAG 900
Query 1024 GCTCAGGTTGAACAGATGTTTGATGGGTTGGATGACGCTGATGGTGCAGAAGACGTTCCA 1083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GCTCAGGTTGAACAGATGTTTGATGGGTTGGATGACGCTGATGGTGCAGAAGACGTTCCA 960
Query 1084 TTTGATGAGCTGGTTGGAATGCAAGGTCCAGTGTTTCATTTGGTTGAGAATGCCTTTACT 1143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TTTGATGAGCTGGTTGGAATGCAAGGTCCAGTGTTTCATTTGGTTGAGAATGCCTTTACT 1020
Query 1144 GTTCTAGCAAGCAATATGATATTCCTTGGTGTTGTTATCTTCGTGCCCTTTACCTTGGGA 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1021 GTTCTAGCAAGCAATATGATATTCCTTGGTGTTGTGATCTTCGTGCCCTTTACCTTAGGA 1080
Query 1204 CG-GATTATATTGTATCACGTGTCATGGCTTTTTGCTGCTGCTAGAGGCCCTGCTGTGGC 1262
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1081 CGAG-TTATATTGTATCACGTGTCATGGCTTTTTGCTGCTGCTAGAGGCCCTGCTGTGAC 1139
Query 1263 TGCATCATTGCATCTTACAGATACCGGACTCTCATTGGAAAATATTACTCTGAAGAGTGC 1322
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1140 TGCATCATTGCATCTTATGGATACCGGACTCTCATTGGAAAATATTACTCTTCAGAGTGC 1199
Query 1323 GCTGACTGCTGTCTCGAATTTGACTAGCGAGGGCCAAGGAAATGGGCTGCTTGGTCAGCT 1382
||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1200 GCTGACTGCTGTCTCAAATTTGACTAACGAAGGCCAAGAAAATGGGCTACTTGGCCAGCT 1259
Query 1383 CACTGAAATGATGAAAGTCAACGGAAGTGAATTGAATGGAGCAAACAATACGCTATCAGT 1442
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1260 CACTGAGATGATGAAAGTCAACGGAAGTGAATTGAATGGAGCAAACAATACGCTATCGGT 1319
Query 1443 TGCTACTGATCTCCTGAAAGGTTCTACTGTTGGGGCCTCAAAGCTTTCTGATATTACAAC 1502
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1320 TGCTACTGATCTCCTGAAAGGTTCTGCTGTTGGGGCCTCAAAGCTATCTGATATTACAAC 1379
Query 1503 TCTGGCTGTTGGGTACATGTTTATCGTATTTCTGGTGTTCCTTTACCTTGGGATCATTGC 1562
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1380 TCTGGCTGTTGGGTACATGTTTATAGTATTTCTGGTGTTCCTTTACCTGGGGATCATTGC 1439
Query 1563 ACTGATTCGATATGCCAAGGGTGAGCCACTGACTGTTGGAAGATTTTATGGTATTGCATC 1622
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 ACTGATTCGATATGCCAAGGGTGAGCCACTGACCGTTGGAAGATTTTATGGTATTGCATC 1499
Query 1623 TATAGTAGAAGCTGTACCATCCCTCCTTAGACAGTTCTTGGCAGCAATGAGGCATCTGAT 1682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TATAGTAGAAGCTGTACCATCCCTCCTTAGACAGTTCTTGGCAGCAATGAGGCATCTGAT 1559
Query 1683 GACCATGATCAAAGTTGCCTTTCTTTTGGTCATCGAGCTTGGGGTCTTTCCTCTGATGTG 1742
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1560 GACAATGATCAAAGTTGCCTTTCTTTTGGTCATCGAGCTTGGGGTCTTTCCTTTGATGTG 1619
Query 1743 TGGTTGGTGGCTAGATGTTTGCACTGTTAGGATGTTCGGTAAAACAATGTCCCACAGGGT 1802
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1620 TGGGTGGTGGCTAGATGTTTGCACCGTTAGGATGTTTGGTAAAACAATGTCCCACAGAGT 1679
Query 1803 ACAGTTTTTATCAATTTCTCCTCTGGCAAGCTCACTTGTTCATTGGGTTGTTGGAATCAT 1862
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1680 ACAGTTTTTATCAATTTCTCCACTGGCAAGCTCACTTGTTCATTGGGTTGTTGGTATCAT 1739
Query 1863 GTACATGTTGCAAATAAGCATCTTCGTCAGCCTTCTTCGAGGGGTTCTTCGTCCTGGAGT 1922
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1740 GTACATGTTGCAAATAAGCATCTTCGTCAGCCTTCTACGAGGGGTTCTTCGCCCTGGAGT 1799
Query 1923 TCTGTATTTCCTTCGTGATCCAGCAGATCCTAATTACAATCCATTCCGAGATTTGATTGA 1982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 TCTGTATTTCCTTCGTGATCCAGCAGATCCTAATTACAATCCATTCCGAGATTTGATTGA 1859
Query 1983 TGATCCAGTGCACAAGCATGCTCGGAGGGTACTGTTATCAGTTGCAGTGTATGGAAGTTT 2042
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 TGATCCAGTGCACAAGCATGCTCGTAGAGTACTGTTATCTGTTGCAGTGTATGGAAGTTT 1919
Query 2043 GATTGTGATGCTGGTATTTTTACCAGTCAAACTTGCGATCCGGATGGCTCCTTCAATCTT 2102
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GATTGTCATGCTGGTATTTTTACCAGTCAAACTTGCGATCCGGATGGCTCCTTCAATCTT 1979
Query 2103 TCCACTTGACATATCTGTATCCGACCCATTCACTGAGATTCCCGCCGACATGCTTCTGTT 2162
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1980 TCCACTCGACATATCTGTATCCGACCCATTCACTGAGATTCCGGCCGACATGCTTCTGTT 2039
Query 2163 TCAAATATGCATTCCATTTATCATCGAGCATTTCAGACTTCGGACCACAATTAAGTCCCT 2222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 TCAAATATGCATTCCATTTATCATCGAGCATTTCAGACTTCGGACCACAATTAAGTCCCT 2099
Query 2223 TCTACGCTGCTGGTTCACTGGGGTTGGTTGGGCGCTTGGTTTAACAGACTTCCTCTTGCC 2282
||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2100 TCTACGCTGCTGGTTCACTGGTGTTGGCTGGGCACTTGGTTTGACAGACTTCCTCTTGCC 2159
Query 2283 AAGACCAGAAGACAACATTGGTCAGGACAATGGAAATGGTGAACCAGGAAGGCAGAACAG 2342
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 AAGACCAGAGGACAACATTGGTCAGGACAATGGAAATGGTGAACCAGGAAGGCAGAACAG 2219
Query 2343 AGCACAAGTGTTGCAGGTCGGAGGACCTGACAGGGCCATGGCTGCGCTTCCAGTAGCTGA 2402
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2220 AGCACAAGTATTGCAGGTGGGAGGACCTGACAGGGCCATGGCTGCGCTCCCAGTAGCTGA 2279
Query 2403 TGACCCTAACAGAAGTCGCCTCCGTGCTGGGAATGTCAACACGGGTGAGGAATATGAAGA 2462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TGACCCTAACAGAAGTCGCCTCCGTGCTGGGAATGTCAACACGGGTGAGGAATATGAAGA 2339
Query 2463 TGATGACGAACAATCTGATTCTGACAGGTACAACTTTGTGGTCCGGATAATTCTCCTTCT 2522
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2340 TGATGAAGAACAATCTGATTCAGACAGGTACAACTTTGTCGTCAGGATAATCCTCCTTCT 2399
Query 2523 ACTTGTTGCATGGGTGACTCTTCTTCTCTTCAATTCAGCATTGATAGTTGTGCCAGTTTC 2582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2400 ACTTGTTGCATGGGTGACTCTTCTTCTCTTCAATTCAGCATTGATAGTTGTACCAGTTTC 2459
Query 2583 GCTGGGACGTGCTCTATTCAGTGCCATTCCCA-TTCTTCCAATAACTCATGGCATCAAGT 2641
||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2460 GCTTGGACGTGCTCTATTCAGTGCCAT-CCCAATTCTTCCAATAACTCATGGCATCAAAT 2518
Query 2642 GCAATGATCTGTATGCTTTCGTCATTGGCACATATGCCTTTTGGACTACCATATCTGGGG 2701
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 GCAATGACCTGTATGCTTTCGTCATTGGTACATATGCCTTTTGGACTACCATATCTGGGG 2578
Query 2702 CCAGGTATGCTATCGAGCATGTCAAGTCAAAGAGGACTTCAGTCTTGCTTAACCAAATAT 2761
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 CCAGGTATGCTATTGAGCATGTCAAGTCAAAGAGGACTTCAGTCTTGCTTAACCAAATAT 2638
Query 2762 GGAAATGGTGTGGGATTGTATTCAAGAGCTCGGTGCTGTTAGCCATATGGGTTTTTATCA 2821
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 GGAAATGGTGTGGGATTGTTTTCAAGAGCTCGGTGCTGTTAGCCATATGGGTTTTTATCA 2698
Query 2822 TTCCGGTGCTAATTGGACTTCTGTTTGAGCTTTTGGTGATTGTCCCAATGAGAGTCCCAG 2881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 TTCCGGTGCTAATTGGACTTCTGTTTGAGCTTTTGGTTATTGTCCCAATGAGAGTCCCAG 2758
Query 2882 TTGATGAAAGCCCTGTGTTCCTCCTGTATCAAGACTGGGCTCTTGGGCTCATCTTTTTGA 2941
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 TTGATGAAAGCCCTGTCTTCCTCCTGTATCAAGACTGGGCTCTTGGGCTCATCTTTTTGA 2818
Query 2942 AAATCTGGACTAGACTGGTAATGCTGGATCATATGCTTCCAATAGTGGATGATAGCTGGA 3001
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819 AGATCTGGACTAGACTGGTAATGCTGGATCATATGCTTCCAATAGTGGATGATAGCTGGA 2878
Query 3002 GAGCAAAGTTTGAGCGGGTAAGAGAAGATGGCTTCTCGAGGCTTCAAGGGTTATGGGTAC 3061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 GAGCAAAGTTTGAGCGGGTAAGAGAAGATGGCTTCTCGAGGCTTCAAGGGTTATGGGTAC 2938
Query 3062 TTAGAGAGATTGTGTTCCCGATCGTCATGAAACTCCTAACGGCTTTATGCGTGCCTTATG 3121
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 TTAGAGAGATTGTGTTTCCGATCGTGATGAAACTCCTAACGGCTTTATGCGTGCCTTATG 2998
Query 3122 TGTTGGCAAGAGGAGTGTTCCCAATGCTCGGATATCCGCTTGTTGTGAACTCAGCGGTCT 3181
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 2999 TGTTGGCGAGAGGAGTGTTCCCAATGCTCGGATATCCGCTAGTAGTGAACTCAGCGGTCT 3058
Query 3182 ACAGATTCGCGTGGATAGGTTGTCTTTCAGTGAGCCTCTTCTGCTTCTGTGCAAAAAGAT 3241
|||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 ACAGATACGCATGGATAGGTTGTCTCTCAGTTAGCCTCTTCTGCTTCTGTGCAAAAAGAT 3118
Query 3242 GCCATGTCTGGTTTAGAAACCTTCACAACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTC 3301
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 GCCATGTCTGGTTCAGAAACCTTCACAACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTC 3178
Query 3302 GGAGACTGCATAACTTTGGGGAAGCTGCTTTAGCTAATCAAAACCAAAACCAAAGTAGTG 3361
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 GGAGACTGCATAACTTTGGGGAAGCTGCTTTGGCAAATCAAAACCAAAACCAAAGTAGTG 3238
Query 3362 AGGATGCAGGAGATGGTGTCTTGATAGGACGAGAGGGAGATGTTGATAATGGACTTAGGC 3421
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3239 AGGATGCAGGAGATGGTGTCCTGATAGGACGTGAGGGAGATGTTGATAATGGACTTAGGC 3298
Query 3422 TCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGCTTAG 3450
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 TCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGCTTAG 3327
> Ahg353421 jgi|Araly1|353421|fgenesh1_pg.C_scaffold_7000594
Length=2643
Score = 2124 bits (1150), Expect = 0.0
Identities = 1550/1735 (89%), Gaps = 59/1735 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1629 AGAAGCTGTACCATCCCTCCTTAGACAGTTCTTGGCAGCAATGAGGCATCTGATGACCAT 1688
|||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 945 AGAAGCTGGATCATCCCTCCTTAAACAGTTCTCGGCAGCAATGAGGCATCTGATGACTAT 1004
Query 1689 GATCAAAGTTGCCT-TTCTTT-TGGTCAT-CGAGCTT-GGGGTCTTTCCTCTGATGTGTG 1744
| |||||| | ||| || ||| | ||| | | ||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1005 GCTCAAAGCTACCTGTT-TTTAT-GTC-TAC-TTCTTAGGGGTCTTCCCTCTGATGTGTG 1060
Query 1745 GTTGGTGGCTAGATGTTTGCACTGTTAGGATGTTCGGTAAAACAATGTCCCACAGGGTAC 1804
| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1061 GGTGGTCGCTAGATATTTGCACGGTTGGGATGTTTGGTAAAACAATGTCCCACAGAGTAC 1120
Query 1805 AGTTTTTATCAATTTCTCC-TCTGGCAAGCTCACTTGTTCATTGGGTTGTTGGAATCATG 1863
|||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1121 AGTTTTTATCAACTTCTCCAT-TGGTAAGCTCACTTCTTCATTGGGTTGTTGGATTCATG 1179
Query 1864 TA---CATG-TTGCAAATAAGCATCTTCGTCAGCCTTCTTCGAGGGGTTCTTCGTCCTGG 1919
|| |||| || | ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1180 TACCTCATGTTTAC-AAT--G-ATCTTCGAAAGCCTTCTTCGAGAGGTTCTTCGACCTGG 1235
Query 1920 AGTTCTGTATTTCCTTCG-TGATCCAGCAGATCCTAAT-TACAATCCATTCCGAGATTTG 1977
|||| ||||||||||| | | ||| | |||||||||| | | |||| |||| |||| ||
Sbjct 1236 AGTTTTGTATTTCCTT-GATTATCTTGAAGATCCTAATGT-CGATCCGTTCCAAGATATG 1293
Query 1978 ATTGATGATCCAGTGCACAAGCATGCTCGGAGGGTACTGTTATCAGTTGCAGTGTATGGA 2037
|||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||
Sbjct 1294 ATTGATGATCCAGTACACAAGCAAGCTCGGAAGGTTCTGTTAGAAACTGCAGTGTATGGA 1353
Query 2038 AGTTTGATTGTGATGCTGGTATTTTTACCAGTCAAACTTGCGATCCGGATGGCTCCTTCA 2097
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354 AGTTTGATTGTCATGCTGGTATTTTTGCCAGTCAAACTTGCGATCCGGATGGCTCCTTCA 1413
Query 2098 ATCTTTCCACTTGACATATCTGTATCCGACCCATTCACTGAGATTCCCGCCGACATGCTT 2157
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1414 ATCTTTCCACTCGACATATCTGTATCCGACCCATTCACTGAGATTCCAGCCGACATGCTT 1473
Query 2158 CTGTTTCAAATATGCATTCCATTT-ATCATCGAGCATTTCAGACTT-CGGACCACAATTA 2215
||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| || | |||| ||||||
Sbjct 1474 CTGTTACAAATATGCATACCATTTGGT-ATCAAGCATTTCAGA-TTCCAGACCTCAATTA 1531
Query 2216 AGTCCCTTCTACGCTGCTGGTTCACTGGGGTTGGTTGGGCGCTTGGTTTAACAGACTTCC 2275
||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1532 AGTCCCTTCTACGTTACTGGTTCACTGGTGTTGGTTGGGCGCTTGGTTTGACAGACTTCC 1591
Query 2276 TCTTGCCAAGACCAGAAGACAACATTGGTCAGGACAATGGAAATGGTGAACCAGGAAGGC 2335
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1592 TCTTGCCAAGACCAGAGGACAACATTGGTCAGGACAATGGAAACGGTGAACCAGGAAGGC 1651
Query 2336 AGAACAGAGCACAAGTGTTGCAGGTCGG-AGGACCTGACAGGGCCATGGCTGCGCTTCCA 2394
||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| || ||| ||||||||| ||||||
Sbjct 1652 AGAACAGAGTACAAGTATTGCAGGTCGGTA-GACCAGATAGGCCCATGGCTGTTCTTCCA 1710
Query 2395 GTAGCTGATGACCCTAACAGAAGTCGCCTCCGTGCTGGGAATGTCAACACGGGTGAGGAA 2454
| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1711 GCAGCTGGTGACCCTAACAGAAGTCGCCTATGTGCTGGGAGTGTCAACACGGGTGAGGAA 1770
Query 2455 TATGAAGATGATGACGAACAATCTGATTCTGACAGGTACAACTTTGTGGTCCGGATAATT 2514
|||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1771 TATGAAGATGATGAAGAACAATCTGATTC--AGA-GTACAACTTTGTCGTCAGGATAA-- 1825
Query 2515 CTCCTTCTACTTGTTGCATGGGTGACTCTTCTTCTCTTCAATTCAGCATTGATAGTTGTG 2574
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1826 -TCCTCCTACTTGTTGCATGGGTGACTCTTCTTCTCTTCAATTCGGCATTGATAGTTGTA 1884
Query 2575 CCAGTTTCGCTGGGACGTGCTCTATTCAGTGCCATTCCC-ATTCTTCCAATAACTCATGG 2633
||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||
Sbjct 1885 CCAGTTTCGGTTGGACGTACTCTATTCAGTGTCA-TCCCAATTCTCCCAACAACTCATGG 1943
Query 2634 CATCAAGTGCAATGATCTGTATGCTTTCGTCATTGGCACATATGCCTTTTGGACTACCAT 2693
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1944 CATCAAATGCAATGACCTGTATGCTTTTGTCATTGGCACATATGCCTTGTGGACTACCAT 2003
Query 2694 ATCTGGGGCCAGGTATGCTATCGAGCATGTCAAGTCAAAGAGGACTTCAGTCTTGCTTAA 2753
||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004 ATCTGGGGCCACGTACGCTATTGAGCATGTCAAGTCGAAGAGGACTTCAGTCTTGCTTAA 2063
Query 2754 CCAAATATGGAAATGGTGTGGGATTGTATT-CAAGAGCTCGGTGCTGTTAGCCATATGGG 2812
||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2064 CCAAACATGGAAATGGTGTGAGATTGT-TTCCAAGAGCCCGGTGCTGTTAGCCATATGGG 2122
Query 2813 TTTTTATCATTCCGGTGCTAATTGGACTTCTGTTTGAGCTTTTGGTGATTGTCCCAATGA 2872
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2123 TTTTTATCATTCCGGTGCTAATTGGACTTCTGTTTGAGCTTTTGGTTATTGTCCCAATGA 2182
Query 2873 GAGTCCCAGTTGATGAAAGCCCTGTGTTCCTCCTGTATCAAGACTGGGCTCTTGGGCTCA 2932
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2183 GAGTCCCAGTTGATGAAAGCCCTGTCTTCCTCCTGTACCAAGACTGGGCTCTTGGGCTCA 2242
Query 2933 TCTTTTTGAAAATCTGGACTAGACTGGTAATGCTGGATCATATGCTTCCAATAGTGGATG 2992
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2243 TCTTTTTGAAGATCTGGACTAGACTGGTAATGCTGGACCATATGCTTCCTATAGTGGATG 2302
Query 2993 ATAGCTGGAGAGCAAAGTTTGAGCGGGTAAGAGAAGATGGCTTCTCGAGGCTTCAAGGGT 3052
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2303 ATAGCTGGAGAGCAAAGTTTGAGAGGGTAAGAGAAGATGGCTTCACAAGGCTTCAAGGGT 2362
Query 3053 TATGGGTACTTAGAGAGATTGTGTTCCCGATCGTCATGAAACTCCTAACGGCTTTATGCG 3112
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2363 TATGGGTACTTAGAGAGATTGTGTTCCCGATTGTGATGAAACTCCTAACAGCTTTATGCG 2422
Query 3113 TGCCTTATGTGTTGGCAAGAGGAGTGTTCCCAATGCTCGGATATCCGCTTGTTGTGAACT 3172
|||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2423 TGCCTTATGTCCTGGCGAGAGGCGTGTTTCCAATGCTCGGATATCCGCTAGTAGTGAACT 2482
Query 3173 CAGCGGTCTACAGATTCGCGTGGATAGGTTGTCTTTCAGTGAGCCTCTTCTGCTTCTGTG 3232
| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||| || || ||||||
Sbjct 2483 CGGCGGTCTACAGATTCACATGGATAGGCTGTCTCTCGGTGA---TC--CT-CTTCTG-- 2534
Query 3233 CAAAAAGATGCCATGTCTGGTTTAGAAACCTTCACAACTCTATCCGTGATGACCGTTATC 3292
| | | | || | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2535 C-----G-T-C--TG---G-TTCAGAAACCTTCACAACTCCATCCGTGATGACCGTTATC 2581
Query 3293 TCATTGGTCGGAGACTGCATAACTTTGGGGAAGCTGCTTTAGCTAATCAAAACCA 3347
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2582 TCATTGGTCGGAGACTCCATAACTTTGGGGAATCTGCTTTGGCTAATCAAAACCA 2636
Score = 869 bits (470), Expect = 0.0
Identities = 821/981 (84%), Gaps = 62/981 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 124 ATGGAGATTTCCCCGGCCGATTCGTTGTCCATCTCTGGCGCGGCTGCTTCTGAGGTCGTC 183
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGATTTCCTCGGCCGAATCGTTGTCCATCTCTGGCGCAACCGCCTCTGAGGTCGTC 60
Query 184 TCCGAGCCTTCCGTATCTTCTTC-T--T-CT--T-----C---CT-CTTCCTCGCCGAAT 228
|| |||||||| ||||||||||| | | || | | || |||| |||||||||
Sbjct 61 TCGGAGCCTTCGGTATCTTCTTCGTCATCCTCCTCGCGCCTGTCTGCTTCGTCGCCGAAT 120
Query 229 CAGGCATCACCCAATC-CTTTCTCAAACATGGATC-CTGCAGTTTCGACGGCGACAGGAT 286
||||| || || | | ||||||| | |||||||| | ||| ||| || || || |
Sbjct 121 CAGGCCTCTTCC-ACCGCTTTCTCCACCATGGATCAC-GCA-TTT-----GCTAC-GG-T 170
Query 287 CGAGGTACGTTGATGATGACGAAGATGAAGAGGACGTTTGCAGGATCTGCAGAAATCCTG 346
|| | | | | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||
Sbjct 171 ---GG--C----A-G-T--TGAAGATGAGGAGGACGTGTGCAGGATTTGCAGAATTCCTG 217
Query 347 GTGATGCAGACAATCCGCTTCGGTATCCGTGTGCCTGTAGCGGAAGTATCAAATTTGTTC 406
| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||
Sbjct 218 GGGATACGGACAATCCGCTTCGGTATCCGTGCACCTGCCGCGGGAGCATCAAATTTGTTC 277
Query 407 ACCAGGATTGTCTCCTTCAGTGGCTTAATCACAGCAACGCTCGTCAATGCGAGGTTTGCA 466
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||
Sbjct 278 ACCAGGATTGCCTCCTTCAGTGGCTTAATCACTGCAAAGCTCGTCACTGCGAGCTTTGCA 337
Query 467 AGCATCCTTTTTCATTCTCCCCAGTATATGCTGACAATGCTCCGTCAAGGCTCCCTTTCC 526
| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 338 AACATCCTTTTTCATTCTCCCCAGTGTATGCTGAAAATGCTCCAACAAGGCTCCCTTTCC 397
Query 527 AGGAGTTTGTAGTTGGCATTGCTATGAAAGC-TTGCCATGTTTTACAGTTCTTTCTGCGG 585
||||||||||||||| |||||| | |||| | || | ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 398 AGGAGTTTGTAGTTGCCATTGCCACGAAA-CTTTTCGGTGTTTTACACTTCTTTCTGCGG 456
Query 586 TTGAGTTTTGTGCTTTCTGTCTGGCTTCTCACTATACCTT-TCATTACATTTTGGATATG 644
||||| || || |||| | |||| || ||||||| |||| | || ||||||||| ||||
Sbjct 457 TTGAGCTTCCTGATTTCGGCCTGGTTTATCACTATTCCTTAT-ATCACATTTTGGGTATG 515
Query 645 GCGTTTGGCTTTCGTGCGAACTTTTGGTGAAGCTCAAAGGTTGTTCTTAAGCCACATCTC 704
||| |||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 516 GCGATTGGCTTTTGTACGGAGTTTTGGTGAAGCTCAGCGGTTGTTCTTAAGTCACATCTC 575
Query 705 CACCACAGTAATTCTCACTGATTGCTTGCATGGGTTCTTACTATCTGCAAGTATTGT-CT 763
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| | ||
Sbjct 576 CACCACAGTAATTCTCACTGATTGTTTGCATGGGTTCTTACTGTCGGCAACAATT-TACT 634
Query 764 TCATCTT-CCTTGGAGCT-ACTTCA-TTAAG-GGACTACTTTAGGCACTTACGAGAGCT- 818
|| | || | |||||| | | || | | ||| || | |||||||| || ||||||||
Sbjct 635 TC-TTTTACTTTGGAG-TAATTTTACTAAAGATGA-T-CTTTAGGCGTTTGCGAGAGCTA 690
Query 819 TGGGGGACAAGAAGAGAGAGATGATGATGTGGACAGAAATGGTGCTCGTGCTG-CAAGAA 877
||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 691 AGGGGG-CAAGAAGAGAGAGACGATGAAGTGGACAGAAATGGTGCTCGTGCTGTC-AGAA 748
Query 878 GACCTGCTGGACAGGCTAATAGGAATCTTGCTGGAGAGGGGAATGGTGAAGATGCTGGGG 937
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||
Sbjct 749 GACCTGCTGGACAGGCTAATAGGAATCTTGCGGGAGAGGAGAATTGCGAAGATGCTGGGG 808
Query 938 ATCAGGGTGCTGCGGTTGGTCAGATTGCTAGA-AGGAATCCTGAAAATGTTCTGGCAAGG 996
||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 809 ATCAGGGTGCTGCGGTTGGTCAGATTGTTA-ATAGGAACCCTGAAAATGTTCTGGAAAGG 867
Query 997 TTGGACATACAAGCAGCTCGTCTTGAGGCTCAGGTTGAACAGATGTTTG-ATGGGTTGGA 1055
|||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||
Sbjct 868 TTGGGCATACAAGCAGTTCGTATCGAGGCTCAGGTTGAACAGA-GTTTTCATGGTTTGGA 926
Query 1056 TGACGCTGATGGTGCAGAAGA 1076
||||||||||||| ||||||
Sbjct 927 CGACGCTGATGGTGAAGAAGA 947
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 138263162709
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5