BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G34450.1
Length=3008
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg491217 jgi|Araly1|491217|fgenesh2_kg.7__650__AT4G34450.1 4944 0.0
Ahg931790 jgi|Araly1|931790|scaffold_304247.1 3094 0.0
> Ahg491217 jgi|Araly1|491217|fgenesh2_kg.7__650__AT4G34450.1
Length=2989
Score = 4944 bits (2677), Expect = 0.0
Identities = 2893/2996 (97%), Gaps = 20/2996 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 16 ATTAGAGATCTTCTTCTTTCTCCTGTTGCATCTGAAGATAAAGGAAACAGAAAGCGCGAG 75
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||
Sbjct 1 ATTACAGATCTTCTTCCTTCTCCTGTTGCATCTGAAGATTAAGGTAACAGAAA--GCGAG 58
Query 76 ATCTGAGTGACGGAGTAATTTCAAAGGGAGGTTTTCGAGATCAGAAATGGCGCAACCCCT 135
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 59 ATCTGAGTGACGGAGTAATTTCAAAGGGAGGTTTTCGAGATCAGCAATGGCGCAACCCCT 118
Query 136 CGTGAAGAAAGACGATGATCACGACGATGAGTTGGAGTATTCTCCATTCATGGGAATTGA 195
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 TGTGAAGAAAGACGATGATCACGACGATGAGTTGGAGTATTCTCCATTCATGGGAATTGA 178
Query 196 GAAAGGAGCGGTTCTTCAAGAGGCTAGAGTCTTTAATGACCCTCAGGTTGATCCTAGACG 255
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 GAAAGGAGCGGTACTTCAAGAAGCTAGAGTCTTTAATGACCCTCAGGTTGATCCTAGACG 238
Query 256 ATGCTCCCAGGTCATTACGAAGCTTCTTTATTTGCTTAACCAAGGGGAGTCATTCACCAA 315
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 ATGCTCCCAGGTCATCACCAAGCTTCTTTATTTGCTTAACCAAGGGGAGTCATTCACCAA 298
Query 316 GGTTGAAGCAACGGAAGTTTTCTTTTCAGTTACAAAGCTTTTTCAATCAAAAGACACGGG 375
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 299 GGTCGAAGCAACGGAAGTTTTCTTTTCAGTTACAAAGCTTTTTCAATCAAAAGACACAGG 358
Query 376 TTTGAGGAGAATGGTCTACTTGATCATTAAGGAGTTATCTCCATCATCTGATGAGGTTAT 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 TTTGAGGAGAATGGTCTACTTGATCATTAAGGAGTTATCTCCATCATCTGATGAGGTTAT 418
Query 436 CATCGTAACAAGCTCTCTGATGAAGGATATGAATAGTAAAATTGATATGTATCGAGCAAA 495
||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CATTGTAACAAGCTCCCTGATGAAGGATATGAACAGTAAAATTGATATGTATCGAGCAAA 478
Query 496 TGCTATCCGTGTCCTCTGCCGGATAATAGACGGAACCCTTCTCACTCAGATTGAGCGATA 555
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 479 TGCTATTCGTGTCCTCTGCCGGATAATAGACGGAACCCTTCTCACTCAAATTGAGCGATA 538
Query 556 CTTGAAACAAGCCATTGTGGATAAGAATCCCGTTGTTTCAAGTGCAGCTTTAGTCAGTGG 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 539 CTTGAAACAAGCCATTGTGGATAAGAATCCCGTTGTTTCTAGTGCAGCTTTAGTCAGTGG 598
Query 616 GCTTCACTTGCTCAAGACAAACCCAGAAATTGTTAAAAGATGGAGCAATGAAGTTCAAGA 675
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 599 GCTTCACTTGCTAAAGACAAACCCAGAAATTGTTAAAAGATGGAGCAATGAGGTTCAAGA 658
Query 676 AGGTATTCAATCCAGATCAGCCCTTGTTCAGTTCCATGCCCTAGCTTTGCTCCATCAGAT 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 AGGTATTCAATCCAGATCAGCCCTTGTTCAGTTCCATGCCCTAGCTTTGCTCCATCAGAT 718
Query 736 ACGCCAAAATGATCGCTTGGCTGTTAGCAAATTGGTTGGTAGCTTGACCAGGGGATCTGT 795
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 719 ACGCCAAAATGATCGCTTGGCTGTCAGCAAGTTGGTTGGCAGCTTGACCAGGGGATCTGT 778
Query 796 CCGCTCTCCCTTGGCTCAGTGTCTTTTGATACGTTACACCAGCCAGGTTATCCGTGACAT 855
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 CCGCTCCCCCTTGGCTCAGTGTCTTTTGATACGTTACACCAGCCAGGTTATCCGTGACAT 838
Query 856 GGCCAACCACGGTCAATCTGGAGAACGTCCGTTCTATGAATTTTTGGAGAGTTGCCTGCG 915
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 GGCCAACCACGGTCAGTCTGGAGAACGTCCGTTCTATGAATTTTTGGAGAGTTGCCTGCG 898
Query 916 CCATAAGGCAGAAATGGTGATCCTTGAGGCTGCCAGGGCAATTACTGAGCTTGATGGTGT 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 899 CCATAAGGCAGAAATGGTGATCCTTGAGGCTGCCAGGGCGATCACTGAGCTTGATGGTGT 958
Query 976 GACAAGCCGAGAACTGACTCCAGCAATCACTGTTCTTCAGCTCTTTTTGAGTTCCCCCAG 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GACAAGCCGAGAACTGACTCCAGCAATCACTGTTCTTCAGCTCTTTTTGAGTTCCCCCAG 1018
Query 1036 ACCAGTGTTGAGATTTGCCGCTGTCCGGACTCTGAACAAGGTTGCAATGACTCATCCTAT 1095
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 ACCAGTGTTGAGATTTGCTGCTGTCCGGACTCTGAACAAGGTTGCAATGACTCATCCTAT 1078
Query 1096 GGCTGTCACCAACTGCAACATTGATATGGAGAGTTTAATCTCTGATCAAAATAGAAGCAT 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1079 GGCTGTCACCAACTGCAACATTGATATGGAGAGCTTAATCTCTGATCAGAATAGAAGCAT 1138
Query 1156 TGCTACACTCGCAATAACCACACTATTGAAAACAGGGAACGAATCAAGTGTAGAACGTTT 1215
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1139 TGCTACACTCGCAATAACCACACTCTTGAAAACAGGGAACGAATCAAGTGTAGAACGCTT 1198
Query 1216 GATGAAGCAGATAACTAATTTTATGTCAGATATTGCTGATGAGTTCAAAATTGTGGTCGT 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 GATGAAGCAGATAACTAATTTTATGTCAGATATTGCTGATGAGTTCAAAATTGTGGTCGT 1258
Query 1276 GGACGCAATAAGATCGTTGTGTGTGAAATTCCCACTGAAATACAGATCCTTGATGACCTT 1335
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGAAGCAATAAGATCGTTGTGTGTGAAATTTCCACTGAAATACAGATCCTTGATGACCTT 1318
Query 1336 CTTAAGCAACATTCTTAGGGAAGAAGGTGGATTTGAGTATAAAAGAGCAATAGTAGATTC 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 CTTAAGCAACATTCTTAGGGAAGAAGGTGGATTTGAGTATAAAAGAGCAATAGTAGATTC 1378
Query 1396 TATTGTGACCATTATCAGAGATATTCCGGATGCAAAGGAAAGTGGACTGCTTCATCTATG 1455
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 1379 TATTGTGACCATTATCAGAGATATTCCTGATGCAAAGGAAAGTGGATTGCTTCATCTTTG 1438
Query 1456 TGAATTCATTGAAGATTGTGAATTCACATATCTTTCAACACA-G--ATCCTTCATTTTCT 1512
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||
Sbjct 1439 TGAATTCATTGAAGATTGTGAATTCACATATCTTTCAACACAGGTAATTCTTCATTTTCT 1498
Query 1513 GGGAATTGAGGGGCCTAACACCTCAGATCCAAGCAAGtatatacgatatatatataATCG 1572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 GGGAATTGAGGGGCCTAACACCTCAGATCCAAGCAAGTATATACGATATATATATAATCG 1558
Query 1573 TGTGCATCTAGAAAACGCCACTGTCCGGGCTGCTGCTGTTTCCACACTTGCAAAGTTTGG 1632
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 TGTGCATCTAGAAAATGCCACTGTCCGGGCTGCGGCTGTTTCCACACTTGCAAAGTTTGG 1618
Query 1633 GTTTATGGTTGAATCCTTGAAGCCCCGGATTACTGTTCTATTGAAGCGTTGCATCTATGA 1692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 GTTTATGGTTGAATCCTTGAAGCCCCGGATTACTGTTCTGTTGAAGCGTTGCATCTATGA 1678
Query 1693 CAGTGATGATGAGGTCCGTGATAGGGCAACACTATATTTGAGTGTTCTTGGTGGTGATGG 1752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 CAGTGATGATGAGGTCCGTGATAGGGCAACACTATATTTGAGTGTTCTTGGTGGTGATGG 1738
Query 1753 TACTGTTGACACTGATAAAGAGAGCAAGGATTTCCTATTTGGTTCCCTGGAGGTTCCTCT 1812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 TACTGTTGACACTGATAAAGAGAGCAAGGATTTCCTATTTGGTTCCCTGGAGGTTCCTCT 1798
Query 1813 AGTCAACATGGAAACTAGTCTGAAGAATTATGAGCCCTCTGAAGAAGCTTTTGATATCAA 1872
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 GGTCAACATGGAAACTAGTCTGAAGAATTATGAGCCCTCTGAAGAAGCTTTTGATATCAA 1858
Query 1873 CTCCGTACCTAAGGAAGTTAAATCTCAGCCCCTTGCAGAGAAGAAAGCCCAGGGTAAAAA 1932
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 CTCCGTGCCTAAGGAAGTTAAATCCCAGCCCCTTGCAGAGAAGAAAGCCCAGGGTAAAAA 1918
Query 1933 GCCCACTGGTCTTGGTGCACCACCAGCTGCACCTGCTTCTGGTTTTGATGGCTATGAAAG 1992
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 GCCCACTGGTCTTGGTGCGCCACCAGCTGCACCTGCTTCTGGTTTTGATGGCTATGAAAA 1978
Query 1993 ACTTCTCTCATCCATTCCAGAGTTTGCCGCCTTTGGAAAACTTTTCAAG-T-----CTTC 2046
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1979 ACTTCTCTCATCTATTCCAGAGTTTACCGCCTTTGGAAAACTTTTCAAGGTTAGGGCTTC 2038
Query 2047 TTTACCTGTGGAGCTAACTGAAGCAGAAACAGAATACGCTGTCAATGTTGTTAAGCATAT 2106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 2039 TTTACCTGTGGAGCTAACTGAAGCAGAAACAGAATACGCCGTCGATGTTGTTAAGCATAT 2098
Query 2107 CTTTGACAGTCATGTGGTGTTTCAGTACAACTGCACTAACACAATACCAGAGCAGTTGTT 2166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 CTTTGACAGTCATGTGGTGTTTCAGTACAACTGCACTAACACAATACCAGAGCAGTTGTT 2158
Query 2167 GGAGAGGGTCAATGTCATTGTAGATGCTTCAGAAGCTGAGGAATTCAGTGAAGTAACTTC 2226
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 GGAGAGGGTCAATGTCATTGTAGATGCTTCAGAAGCAGAGGAATTCAGTGAAGTAACTTC 2218
Query 2227 AAAGGCCCTAAACTCACTTCCTTACGATTCACCCGGTCAAGCCTTTGTGGTTTTTGAGAA 2286
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 AAAGGCCCTAAACTCACTTCCTTATGATTCACCCGGTCAAGCCTTTGTGGTTTTTGAGAA 2278
Query 2287 GCCAGCTGGGGTCCCTGCTGTTGGAAAGTTCTCCAACACATTGACTTTCGTTGTTAAGGA 2346
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 ACCAGCTGGGGTCCCTGCTATTGGAAAGTTCTCCAACACATTGACTTTCGTTGTTAAGGA 2338
Query 2347 GGTTGACCCAAGCACAGGTGAAGCAGAAGATGATGGAGTAGAAGATGAGTACCAGCTAGA 2406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2339 GGTTGACCCAAGCACAGGTGAAGCAGAAGATGATGGAGTAGAAGATGAATACCAGCTAGA 2398
Query 2407 GGATCTTGAGGTTGTAGCTGGAGATTACATGGTGAAAGTGGGTGTCTCCAATTTCAGGAA 2466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 GGATCTTGAGGTTGTAGCTGGAGATTACATGGTGAAAGTGGGTGTCTCCAATTTCAGGAA 2458
Query 2467 TGCGTGGGAAAGCATGGATGAAGAAGATGAGCGTGTAGACGAATATGGCCTTGGCCAAAG 2526
||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 TGCATGGGAAAGCTTGGATGAAGAAGATGAGCGCGTCGACGAATATGGCCTTGGCCAAAG 2518
Query 2527 AGAGAGTTTGGGAGAAGCTGTAAAGGCTGTCATGGATCTTCTTGGCATGCAGACTTGTGA 2586
||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 AGACAGTTTGGGAGAAGCTGTAAAAGCTGTCATCGATCTTCTTGGCATGCAGACTTGTGA 2578
Query 2587 GGGGACGGAGACAATTCCGCTCAATGCAAGGTCACACACGTGTCTATTGTCAGGTGTGTA 2646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2579 GGGGACGGAGACAATTCCGCTCAATGCAAGGTCACACACGTGTCTATTGTCTGGTGTGTA 2638
Query 2647 CATAGGCAACGTGAAAGTGTTAGTGAGGGCACAGTTTGGAATGGACAGCTCAAAGGACAT 2706
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 CATAGGGAACGTGAAAGTGTTAGTGAGGGCACAGTTTGGAATGGACAGCTCAAAGGACAT 2698
Query 2707 TGCAATGAAGCTGACAGTTAGAGCTGAAGACGTTTCTGTCGCCGAGGCCATTCACGAGAT 2766
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 TGCAATGAAGCTGACAGTTAGAGCTGAGGACGTTTCTGTAGCCGAGGCCATTCACGAGAT 2758
Query 2767 TGTTGCCAGCGGCTAAAACCTCTTGCGTTTCTTCAGTATCAGA-GAATGTCATCTATTCC 2825
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || ||| | |||||||
Sbjct 2759 TGTTGCCAGCGGCTAAA-CCTCTCGCGTTTCTTCAATATCAAAAGAGTGTTA-CTATTCC 2816
Query 2826 TGCTGCTAAA-CCTCAAAAATACATCAACTATTATAAATAGCATAGTATTACTTTCTTTC 2884
| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||
Sbjct 2817 TACTGCTAAAACCTCAAAA-TACATCAACTATTATAAATAGTATAGTATTT-TTTATTTC 2874
Query 2885 TTTTTTCCTTGCATTATTACTGTCAAATACACT-ATGGAGGttttctttttatt-ttatg 2942
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||
Sbjct 2875 TTTTTTTCTTGCATTATTACTGTCAAATACACTTATGGAAGTTTTCGTTTTATTATT-TG 2933
Query 2943 acggtgctttttgatttctcatttctgaattttattattacccgttttCTCGCCAA 2998
|||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2934 ACGGTGTTTTTTGATTTTTCATTGCTGAATTTTGTCATTACCCGTTTTCTCGCCAA 2989
> Ahg931790 jgi|Araly1|931790|scaffold_304247.1
Length=2703
Score = 3094 bits (1675), Expect = 0.0
Identities = 2360/2692 (88%), Gaps = 42/2692 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 113 AGATCAGAAATGGCGCAACCCCTCGTGAAGAAAGACGATGATCACGACGATGAGTTGGAG 172
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||
Sbjct 12 AGATCAGCGATGGCGCAACCACTCGTGAAGAAAGACGACGATCACGATGATGAGCTGGAG 71
Query 173 TATTCTCCATTCATGGGAATTGAGAAAGGAGCGGTTCTTCAAGAGGCTAGAGTCTTTAAT 232
|||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 72 TATTCTCCATTCGTGGGAATTGAGAAAGGAGCAGTGCTTCAGGAAGCTAGAGTCTTCAAT 131
Query 233 GACCCTCAGGTTGATCCTAGACGATGCTCCCAGGTCATTACGAAGCTTCTTTATTTGCTT 292
|| |||||| ||||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct 132 GATCCTCAGCTTGATCCTAGAAGGTGTTCCCAGGTCATCACAAAACTTCTTTATTTGCTT 191
Query 293 AACCAAGGGGAGTCATTCACCAAGGTTGAAGCAACGGAAGTTTTCTTTTCAGTTACAAAG 352
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 192 AACCAAGGAGAGTCATTCACAAAGGTTGAAGCAACAGAAGTTTTCTTTTCCGTTACAAAG 251
Query 353 CTTTTTCAATCAAAAGACACGGGTTTGAGGAGAATGGTCTACTTGATCATTAAGGAGTTA 412
||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 252 CTTTTCCAATCAAAAGATACTGGTTTGAGGAGAATGGTCTACTTGATCATAAAGGAATTA 311
Query 413 TCTCCATCATCTGATGAGGTTATCATCGTAACAAGCT-CTCTGATGAAGGATATGAATAG 471
||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| || |||||||||| ||||||||
Sbjct 312 TCTCCATCAGCTGACGAGGTTATTATTGTAACAAGCTCCT-TGATGAAGGACATGAATAG 370
Query 472 TAAAATTGATATGTATCGAGCAAATGCTATCCGTGTCCTCTGCCGGATAATAGACGGAAC 531
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 371 TAAGATTGATATGTATCGTGCAAATGCTATCCGTGTCCTGTGCCGAATAATAGACGGAAC 430
Query 532 CCTTCTCACTCAGATTGAGCGATACTTGAAACAAGCCATTGTGGATAAGAATCCCGTTGT 591
|||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 431 CCTTCTGACACAAATTGAGCGGTACTTGAAACAAGCTATTGTGGATAAGAATCCTGTTGT 490
Query 592 TTCAAGTGCAGCTTTAGTCAGTGGGCTTCACTTGCTCAAGACAAACCCAGAAATTGTTAA 651
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 TTCAAGTGCAGCTTTAGTCAGTGGACTTCACATGCTAAAGACAAACCCAGAAATTGTTAA 550
Query 652 AAGATGGAGCAATGAAGTTCAAGAAGGTATTCAATCCAGATCAGCCCTTGTTCAGTTCCA 711
|||||||||||| || |||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 551 AAGATGGAGCAACGAGGTTCAAGAAGCTGTCCAGTCCAGGGCAGCCCTTGTTCAGTTTCA 610
Query 712 TGCCCTAGCTTTGCTCCATCAGATACGCCAAAATGATCGCTTGGCTGTTAGCAAATTGGT 771
|||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 611 TGCCTTGGCTTTGCTTCATCAGATACGCCAAAATGACCGCTTGGCTGTCAGCAAGTTGGT 670
Query 772 TGGTAGCTTGACCAGGGGATCTGTCCGCTCTCCCT-TGGCTCAGTGTCTTTTGATACGTT 830
||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 671 TGGTACCTTGACCAGGGGAGCTGTCCGCTCT-CCTCTGGCCCAGTGCCTCTTGATACGTT 729
Query 831 ACACCAGCCAGGTTATCCGTGACATGGCCAACCACGGTCAATCTGGAGAACGTCCGTTCT 890
||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||
Sbjct 730 ACACCAGTCAGATAATCCGAGACATGTCCAACCATGGCCAGTCTGGGGAACGTCCGTTCT 789
Query 891 ATGAATTT-TTGGAGAGTTGCCTGCGCCATAAGGCAGAAATGGTGATCCTTGAGGCTGCC 949
||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 ATG-ATTTCCTGGAGAGTTGTCTGCGCCATAAGGCAGAAATGGTGATCCTTGAGGCTGCC 848
Query 950 AGGGCAATTACTGAGCTTGATGGTGTGACAAGCCGAGAACTGACTCCAGCAATCACTGTT 1009
|| || || |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||
Sbjct 849 AGAGCTATAACTGAGCTTGATAATGTGACCAGTCGAGAATTGACTCCAGCAATTACGGTG 908
Query 1010 CTTCAGCTCTTTTTGAGTTCCCCCAGACCAGTGTTGAGATTTGCCGCTGTCCGGACTCTG 1069
||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 909 CTTCAGCTCTTCCTGAGTTCCCCTAAACCGGTGCTGAGATTTGCTGCTGTCCGGACTTTG 968
Query 1070 AACAAGGTTGCAATGACTCATCCTATGGCTGTCACCAACTGCAACATTGATATGGAGAGT 1129
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 AACAAGGTTGCAATGACTCATCCCATGGCTGTCACCAACTGCAACATTGATATGGAGAGT 1028
Query 1130 TTAATCTCTGATCAAAATAGAAGCATTGCTACACTCGCAATAACCACACTATTGAAAACA 1189
||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||
Sbjct 1029 TTAATTTCTGATCAGAATAGAAGTATTGCTACACTTGCTATCACCACACTCCTGAAAACA 1088
Query 1190 GGGAACGAATCAAGTGTAGAACGTTTGATGAAGCAGATAACTAATTTTATGTCAGATATT 1249
||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1089 GGGAATGAATCTAGTGTGGAACGGTTGATGAAGCAGATAACTAATTTCATGTCAGATATT 1148
Query 1250 GCTGATGAGTTCAAAATTGTGGTCGTGGACGCAATAAGATCGTTGTGTGTGAAATTCCCA 1309
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||
Sbjct 1149 GCTGATGAGTTCAAAATTGTGGTCGTGGAAGCCATAAGATCACTGTGTTTGAAATTTCCA 1208
Query 1310 CTGAAATACAGATC-CTTGATGACCTTCTTAAGCAACATTCTTAGGGAAGAAGGTGGATT 1368
|||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1209 TTGAAGTATAGATCACT-GATGAACTTCTTAAGCAACATTCTTAGAGAAGAAGGTGGTTT 1267
Query 1369 TGAGTATAAAAGAGCAATAGTAGATTCTATTGTGACCATTATCAGAGATATTCCGGATGC 1428
||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1268 TGAGTTTAAAAGGGCAATTGTAGATTCCATTGTAACCATTATCAGAGATATTCCAGATGC 1327
Query 1429 AAAGGAAAGTGGACTGCTTCATCTATGTGAATTCATTGAAGATTGTGAATTCACATATCT 1488
|||||||| |||| |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 AAAGGAAAATGGATTGCTCCATCTTTGCGAGTTCATCGAAGATTGTGAATTCACATATCT 1387
Query 1489 TTCAACACAGATCCTTCATTTTCTGGGAATTGAGGGGCCTAACACCTCAGATCCAAGCAA 1548
|||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1388 TTCAACACAGATACTTCATTTCCTGGGAATGGAAGGGCCAAACACCTCAGATCCTAGCAA 1447
Query 1549 GtatatacgatatatatataATCGTGTGCATCTAGAAAACGCCACTGTCCGGGCTGCTGC 1608
|||||| || ||||||||||| ||||||||| | || || || ||||| || ||||||||
Sbjct 1448 GTATATCCGTTATATATATAACCGTGTGCATTTGGAGAATGCAACTGTTCGAGCTGCTGC 1507
Query 1609 TGTTTCCACACTTGCAAAGTTTGGGTTTATGGTTGAATCCTTGAAGCCCCGGATTACTGT 1668
||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||
Sbjct 1508 TGTTTGCACACTTGCAAAGTTTGGCTTTATGGTTAAAGCGTTGAAGCCCCGGATTACTGT 1567
Query 1669 TCTA-TTGAAGCGTTGCATCTATGACAGTGATGATGAGGTCCGTGATAGGGCAACACTAT 1727
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 1568 -CTTGTTGAAGCGCTGCATCTATGACAGTGATGATGAGGTTCGTGATAGAGCAACACTCT 1626
Query 1728 ATTTGAGTGTTCTTGGTGGTGATGGTACT-GTTGACACTGATAAAGAGAGCA-AG-GATT 1784
||||||| | |||||| |||||| || | ||||||||| ||||| |||| || | ||
Sbjct 1627 TTTTGAGTATACTTGGTAATGATGGC-CTTGCTGACACTGAAAAAGATAGCATAGAG-TT 1684
Query 1785 TCCTATTTGGTTCCCTGGAGGTTCCTCTAGTCAACATGGAAACTAGTCTGAAGAATTATG 1844
|| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||
Sbjct 1685 TC-TATTTGGTTCCCTGGAGGCCCCTCTTGTCAACTTGGAGACAAGTCTGAAAAACTATG 1743
Query 1845 AGCCCTCTGAAGAAGCTTTTGATATCAACTCCGTACCTAAGGAAGTTAAATCTCAGCCCC 1904
||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 1744 AGCCCTCTGAAGAAGCTTTTGATGTTGACTCTGTGCCTAAGGAAGTCAAATCGCAGCCGC 1803
Query 1905 TTGCAGAGAAGAAAGCCCAGGGTAAAAAGCCCACTGGTCTTGGTGCACCACCAGCTGCAC 1964
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 1804 TTGCAGAGAAGAAAGCCAAGGGTAAAAAGCCCACTGGTCTCGGTGCTCCACCACCTGCAC 1863
Query 1965 CTGCTTCTGGTTTTGATGGCT-ATGAAAGACTTCTCTCATCCATTCCAGAGTTTGCCGCC 2023
||| |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1864 CTGTTTCTGGTTTTGATG-CTTATGAAAGAGTTCTATCATCCATTCCAGAGTTTGCTACC 1922
Query 2024 TTTGGAAAACTTTTCAAGTCTTCTTTACCTGTGGAGCTAACTGAAGCAGAAACAGAATAC 2083
||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 TTTGGCAAACTTTTCAAGTCATCTTCACCTGTGGAGCTAACTGAAGCAGAAACAGAATAC 1982
Query 2084 GCTGTCAATGTTGTTAAGCATATCTTT-GACAGTCATGTGGTGTTTCAGTACAACTGCAC 2142
| ||||||||||| |||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1983 TCAGTCAATGTTGTAAAGCATAT-TTTCGAGAGTCACGTTGTGTTTCAGTATAACTGCAC 2041
Query 2143 TAACACAATACCAGAGCAGTTGTTGGAGAGGGTCAATGTCATTGTAGATGCTTCAGAAGC 2202
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042 AAACACAGTACCAGAGCAATTGTTGGAGAGGGTCAATGTCATTGTAGATGCTTCAGAAGC 2101
Query 2203 TGAGGAATTCAGTGAAGTAACTTC-AAAGGCC-CTAAACTCACTTCCTTACGATTCACCC 2260
||||| ||||||||| || |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2102 GGAGGAGTTCAGTGAATTATCTTCTAAA--CCACTAAACTCACTCCCTTACGATTC-CCC 2158
Query 2261 -GGTCAAGCCTTTGTGGTTTTTGAGAAGCCAGCTGGGGTCCCTGCTGTTGGAAAGTTCTC 2319
||||| |||| ||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 TGGTCAGGCCTATGTGGCGTTTGAGAAGCCAGAAGGAGTACCTGCTGTTGGAAAGTTCTC 2218
Query 2320 CAACACATTGACTTTCGTTGTTAAGGAGGTTGACCCAAGCACAGGTGAAGCAGAAGATGA 2379
||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||
Sbjct 2219 AAACACATTGACTTTCATTGTTAAGGAGGTTGAGCTAAGCACAGGTGAACCATTGGATGA 2278
Query 2380 TGGAGTAGAAGATGAGTACCAGCTAGAGGATCTTGAGGTTGTAGCTGGAGATTACATGGT 2439
|| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||
Sbjct 2279 CGGTGTGGAAGATGAGTACCAGCTCGAGGACCTTGAGGTTGTCGCTGCTGACTACATGGT 2338
Query 2440 GAAA-GTGGGTGTCTCCAATTTCAGGAATGCGTGGGAAAGCATGGATGAAG-AAGATGAG 2497
||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| || | || | |||
Sbjct 2339 -AAACGTCGGTGTCTCCAATTTCCGTAATGCATGGGAAAACATGGACGAGGGAA-ACGAG 2396
Query 2498 CGTGTAGACGAATATGGCCTTGG-CCAAAGAGAGAGTTT-GGGAGAAGCTGTAAAGGCTG 2555
| |||||| || || || || || |||| |||| || || ||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2397 CTTGTAGATGAGTACGGTCTAGGTCCAA-GAGACAGCTTAGGG-GAAGCTGTAAAAGCTG 2454
Query 2556 TCA-TGGATCTTCTTGGCATGCAGACTTGTGAGGGGACGGAGACAATTCCGCTCAATGCA 2614
| | || ||||||||||||||||| |||||||||| || || | || || ||| |||
Sbjct 2455 TAACTG-ATCTTCTTGGCATGCAGTCTTGTGAGGGTACAGAAATGGTTGCGAGCAACGCA 2513
Query 2615 AGGTCACACACGTGTCTATTGTCAGGTGTGTACATAGGCAACGTGAAAGTGTTAGTGAGG 2674
||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |
Sbjct 2514 AGGTCACACACATGTTTACTATCAGGTTTGTACATAGGGAACGTGAAAGTGTTGGTGAAG 2573
Query 2675 GCACAGTTTGGAATGGACAGCTCAAAGGACATTGCAATGAAGCTGACAGTTAGAGCTGAA 2734
||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||| ||
Sbjct 2574 GCACAGTTTGGGATGGACAGCTCAAAGGAAATTGTAATGAAACTGGCTGTTAGAGCAGAG 2633
Query 2735 GA-CGTTTCTGTC-GCCGAGGCCATTCACG-AGATTGTTGCCAGCGGCTAAA 2783
|| | | ||||| || || || ||||||| | ||||||||| ||||||||
Sbjct 2634 GATCCAT-CTGTCAGC-GATGCGATTCACGCAC-TTGTTGCCAACGGCTAAA 2682
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 113585110590
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5