BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G38120.1 Length=3694 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg490568 jgi|Araly1|490568|fgenesh2_kg.7__1__AT4G38120.1 5834 0.0 Ahg356214 jgi|Araly1|356214|fgenesh1_pg.C_scaffold_8000001 929 0.0 > Ahg490568 jgi|Araly1|490568|fgenesh2_kg.7__1__AT4G38120.1 Length=3683 Score = 5834 bits (3159), Expect = 0.0 Identities = 3533/3708 (95%), Gaps = 47/3708 (1%) Strand=Plus/Plus Query 5 TTCTCGTTTTTGATTGCTTAGTTTTTTCCCGGGAGACTGAAACATGTTCACGGCGGCAGC 64 ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTCTCGTTTGTGATTGCTTAG-TTTTCCCCCGGAGATTGAAACATGTTCACGGCGGCAGC 59 Query 65 TTCGTCAAGCGTGGGAAGGTGGCGGACGGCGTTTCTCTCTCTCAGGGACGAAATCTCAAC 124 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct 60 TTCGTCAAGCGCGGGAAGGTGGCGGACGGCGTTTCTCTCTCTGAGGGACGAAATCGCAAC 119 Query 125 CACTCCACCGCCGCCGGTTCCTCTGTTGCTCGAGGATCTACTCTTCTCTCAATCCCATTC 184 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 GACTCCACCGCCGCCGGTTCCTCTGTTGCTCCAGGATCTACTCTTCTCTCAATCCCATTC 179 Query 185 CCTTATCTCTGCCGTCTCTCACCTCCCACTGCACGAGCTCACTTCCGATTGCTTGTTCCT 244 |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 CCTTGTCTCTGCCGTCTCTCACCTCCCACCGCACGAGCTCACTTCCGATTGCTTGTTCCT 239 Query 245 GCTCGATTTGGTTTCCAAAGCTGATGGTCCTGACTGGATCCCTGTCTCTCGTCATACTTG 304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 GCTCGATTTGGTTTCCAAAGCTGATGGTCCTGACTGGATCCCTGTCTCTCGTCATACTTG 299 Query 305 TCAACTGATTCACGATGTTTGTGCTCGTCTACTTTTCCAACTAAATTCTTCGTCATGGCC 364 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 300 TCAACTGATTCACGATGTTTGTGCTCGTCTACTTTTCCAACTTAATTCTTCGTCATGGCC 359 Query 365 GCTCCTTCTTCACTCTTTTGCTTCTGTCTTGGAGTTTCTTCTTCGCCAACCCATGCCTTC 424 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 GTTCCTTCTTCACTCTTTTGCTTCTGTCTTGGAGTTTCTTCTTCGCCAACCCATGCCTTC 419 Query 425 TTCACCTTATTCCGCTGCCTATTTCTCCAGAATCGAACCTGTGATCCAATGCTTCGAGAC 484 |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 420 TTCACCCTATTCCACTGCATATTTCTCCAGAATCGAACCTGTCATCCAATGCTTCGAGAC 479 Query 485 TTTAAGACGTTTGGCCCCTATGCATCCGGAGAACATTCATCTAGTCAAGTTTCTTGTGCG 544 | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct 480 TCTAAGACGTTTGGCCGCTATGCACCCGGAGGACATTCATCTTGTCAAGTTTCTTCTGCG 539 Query 545 CGTAGTTCCTTTATTACACCAGGATTTAGTTTTATCCTATGGTTTCTCAAATCAAGACCC 604 | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct 540 CATAATTCCTTTATTACACCAGGATTTAGTTTTATCGTATGGTTTCTCAAATCAAAACCC 599 Query 605 TTCTCCTACTTTACTTGTGGAAAAGAAACTGCCTCAACAGAATCGCTTATGGGATTCCAT 664 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 600 CCCTCCTACTTTAGATCTGGAAAAGAAACTGCCTCAACAGAATAGCTTATGGGATTTCAT 659 Query 665 GGCTCTTGCCTTTGACATGTTTGGTAGAGCATTTTCTCTATCTGAGTCTTTGTTTCCTAC 724 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| Sbjct 660 GGCTCTTGCCTTTGACATGTTTGGTAGAGCATTCTCTGTATCTGAATCTTTGTTTCCTAC 719 Query 725 TGACGTCTCCCAATGCACGCTAGAGGTTCTAAGGAAAGTAATGGACGTATTAGCATCTAA 784 |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 720 TGACGTCTGCCAATGCTCGCTAGAGGTTCTAAGGAAAGTAATGGACGTCCTAGCATCTAA 779 Query 785 GGGCCAGCTTGTCGAAGACCGATTCATGT----G---G-----A-GG---T---A-TATG 824 |||||||||||||||| ||||||| |||| | | | || | | |||| Sbjct 780 GGGCCAGCTTGTCGAAAACCGATTTATGTGGAGGTACGTCTTAAGGGCTTTACAACTATG 839 Query 825 CCTTTGGTTTTGTGGAGACTACAATTTACTCCt-ttttttCTGGGTTCTATTAGACTTGT 883 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| Sbjct 840 CCTTTGGTTTTGTGGAGACTACAATTTACTCCTCTTTTTCCTGGTTTATATTAGACTTGT 899 Query 884 TGCCCTCTTAGCGTCATTGAGAATGTTTTTCTGTTTTGGACTTACTGGCCCACCTCAGTT 943 |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 GGCCCCCTTAGCGGCATTGAGAATGTTTTTCTGTTTTGGACTTACTGGCCCACCTCAGTT 959 Query 944 ATCAGTTTCTGATGTTGTTCACAACGATAAGCATTTGAATGTCAAGCTTTCTCCATTGAT 1003 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 960 ATCTCATTCTGATGTTGTTCACAAAGATAAGCATTTGAATGTCAAGCTTTCTACATTGAT 1019 Query 1004 TTCTGGAGTAAGTAAGAATGCCAAGAATACTCCTTATAGGCCACCCCACTTGCGCAAGAG 1063 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 TTCTGGAGTAAGTAAGAATGCCAAGAATACTCCTTATAGGCCACCCCACTTGCGCAAGAG 1079 Query 1064 GGATGATTTGAACACTAGGCAGCCAGTGTCTTCAAG-CTGGCGGCGCCTATCTGCTCATG 1122 ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| Sbjct 1080 GGATGATTTGAACACTAAGCAGCCAGTGTATT-GTGACTGGCGGCGCCTGTCTGCTCATG 1138 Query 1123 ATTCTGGTAGTTCTGATGTTATATCATCAGATTCCGATTTTAGTGACAGTGACGGCTCCG 1182 ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1139 ATTCTTGTAGTTCTGATGTTATATCATCAGATTCTGATTTTAGTGACAGTGACGGTTCCG 1198 Query 1183 TACCGGATTCTTATTTTGCCCAAAGCTCCAAGGTTAGAATAGCTGCAATTGTTTGCATAC 1242 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 TACCGGATTCTTATTTTGCCCAAAGCTCGAAGGTTAGAATAGCTGCAATTGTTTGCATAC 1258 Query 1243 AGGATCTTTGCCAGGCTGATTCAAAGTCATTTACCACTCAGTGGGTGACTCTCTTTCCAA 1302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1259 AGGATCTTTGCCAGGCTGATTCAAAGTCATTTACCACTCAGTGGGTGACTCTCTTTCCAA 1318 Query 1303 CAAGTGATGTACTCAAGCCAAGGAAGTTTGAAGCTACTCTAATGACCTGCTTGCTTTTTG 1362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1319 CAAGTGATGTACTCAAGCCAAGGAAGTTTGAAGCTACTCTAATGACCTGCTTGCTTTTTG 1378 Query 1363 ATCCTCATTTGAAGGTAAGGATTGCATCTGCGTCAGCTCTTGCCACCATGATGGATGGGC 1422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1379 ATCCTCATTTGAAGGTAAGGATTGCATCTGCGTCAGCTCTTGCCACCATGATGGATGGGC 1438 Query 1423 CTTCATCTATTTTCCTTCAAGTGGCAGAGTACAAGGAATCTACTAAATATGGATCATTTA 1482 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1439 CTTCATCTATTTTCCTTCAAGTGGCAGAGTACAAGGAATCTACCAAATATGGATCATTTA 1498 Query 1483 TGCCCCTCTCCAATTCCCTTGGTCTAATATTAATGCAACTCCACACAGGCATTCTACATT 1542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1499 TGCCCCTCTCCAATTCCCTTGGTCTAATATTAATGCAACTCCACACAGGCATTCTACATT 1558 Query 1543 TGATTCACAGTGATAATCATGGTAGATTGTTGATTCAGCTGTTCAAGATCCTCTTGCTTC 1602 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1559 TGATTCACAGTGATAATCATGGTAGATTGTTGATTCAGCTGTTCAAGATCCTCTTGCTTC 1618 Query 1603 TAATATCAAGCACACCTTACTCGAGAATGCCGGGAGAATTGCTGCCAAAAGTTATAATGT 1662 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1619 TGATATCAAGCACACCTTACTCGAGAATGCCGGGAGAATTGCTGCCAAAAGTTATAATGT 1678 Query 1663 CTCTGCATGCTAGGATTAATGAGGGCTTTCCTTTCAAAAATGATAAAACTGGTCTGCTGG 1722 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1679 CTCTGCATGCTAGGATTAATGAGGGGTTTCCTTTCAAAAATGATAAAACTGGTCTGCTGG 1738 Query 1723 TTGCCGCAATAGGTTGCCTGTCAGCTGCATTTTCCACCTTTCCTCCTCAAATGAAAGTGC 1782 |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1739 TTGCTGCAATAGGTTGCCTGACAGCTGCATTTTCCACCTTTCCTCCTCAAATGAAAGTGC 1798 Query 1783 ATAATATGCTTTTGGATGAGACATCAGCAGGATTCAATGGATGTGAATGGAATTCAGGAG 1842 || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 ATTATATGCTTTTGGATGAGACATCAGCAGGATTCGATGGATGTGAATGGAATTCAGGAG 1858 Query 1843 TTCTTTCTACTTTATTTCGTTTTGCTGAGCAATTTTCTGACGCATCAACATGCATTGAGG 1902 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 TTCTTTCTACTTTATTTCGTTTTGCTGAGCAATTTTCTGACGCATCAACATGCATTGAGG 1918 Query 1903 CTCTTCAGGTCCTCCGAGCTGTGGCTCTCAATTATCCAACCTTAGTGCCAGCATATTGGG 1962 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1919 CTCTTCAGGTCCTCCGAGCTGTGGCTCTCAATTACCCAACCTTAGTGCCAGCATATTGGG 1978 Query 1963 AAAGGGTCTCTATCCTCGTGTATAAACTTTTGCAGTCTGCTGTTGTTGAAGATTCTCCAA 2022 || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1979 AACGGGTCTCTGTCCTCGTGTATAAACTTTTGCAGTCTGCTGTTGTTGAAGATTCTCAAA 2038 Query 2023 CGACATGGAAGTCTTCGGTTAGAGAGTCTGTTGGATATAATGGGGATAAAGTCCTTACAG 2082 ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | Sbjct 2039 CGACATGGAAGGCTTCAGTTAGAGAGTCTGTTGGATATAAT-GGG-----G-------A- 2084 Query 2083 CTGCTATTAAGGTTTTGGATGGATGCCTTCGCGCAATATCTGGATTTAAGGGAACCGAAG 2142 || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2085 ----TA--AA-GTTTTGGATGGATGCCTTCGCGCAATATCTGGATTTAAGGGAACAGAAG 2137 Query 2143 ATCTTCAGTATGATAGATTAATGGATACACCATTTACATCTGACTGCATAAGGTCAATAA 2202 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2138 ATCTTCAGTACGATAGATTAATGGATACACCATTTACATCTGACTGCATAAGGTCAATAA 2197 Query 2203 GAATCTCATCTGCACCATCATATGGATTTGATAATACCCAAGAGCCAATCTTTCAGGCAG 2262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2198 GAATCTCATCTGCACCATCATATGGATTTGATAATACCCAAGAGCCAATCTTTCAGGCAG 2257 Query 2263 GATGTGACCAATGGTCTGAGGCTATTCGTAAACATATAGTTCTGGTGTTACACCATGGTT 2322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2258 GATGTGACCAATGGTCTGAGGCTATTCGTAAACATATAGTTCTGGTGTTACACCATGGTT 2317 Query 2323 CTGCAGTGGTGAGGAGCACTACAGTTACTTGCTTTGCTGGTATTACATCCTCCATATTTT 2382 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2318 CTGCAGTGGTGAGGAGCACTACAGTTACTTGCTTTGCTGGTATAACATCCTCCATATTTG 2377 Query 2383 CCGCTTTCAATAAGCAGGAAAAGGACTTTATTACTTCATCAATTATAACCGCTGCATTGC 2442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2378 CCGCTTTCAATAAGCAGGAAAAGGACTTTATTACTTCATCAATTATAACCGCTGCATTGC 2437 Query 2443 ATGACAAAACACCTTCAGTCAGATCAGCAGCTTGCCGAGCGATTGGTGTTATTTCATGTT 2502 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| Sbjct 2438 ATGACAAAACACCTTCAGTCCGATCAGCAGCTTGCCGCGCTATTGGTGTAATTTCATGTT 2497 Query 2503 TTCCAGAAACTTCTTTAAGTGCGGAGATATATGAAAAATTTATCTTAGCTGTTGAAGCGA 2562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct 2498 TTCCAGAAACTTCTTTAAGTGCGGAGATATATGAAAAATTTATCATAGCTGTTGAAGCAA 2557 Query 2563 ATACCCGGGACTCCTTGACCTCGGTGCGTATAACAGCATCATGGGCTTTGGCCAATCTAT 2622 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct 2558 ATACCCGCGACTCCTTGACCTCGGTGCGTATAACAGCATCATGGGCCTTGGCCAATGTAT 2617 Query 2623 GCGATGCTCTGCGATACCGCGTTGATGATAGGTCCTTTGAAGGATTGAAGACAACTTCAC 2682 |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2618 GCGATGCTCTACGATACCGCGTCGATGATAGATCCTTTGAAGGATTAAAGACAACTTCAC 2677 Query 2683 AAGTTGTGGATGCACTAATAGAATGTGCTTTGCGCCTAACTGAGGATGGGGACAAGGTTA 2742 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2678 AAGTTGTGGATGCACTAATAGAATGTGCTTTGCGCCTAACTGAGGATGGGGACAAGGTTA 2737 Query 2743 AATCCAATGCAGTTCGGGCACTGGGGAGTATTTCAAAATATGTAAAATTGAGATGCATGA 2802 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2738 AATCCAATGCAGTTCGGGCACTGGGGAGTATTTCAAAATATGTAAACTTGAGATGCATGA 2797 Query 2803 CAAGTATAAAGTCAGTGGACCAAGATGTGTTACCTTTTCCCCATCAACAGTCATCAAATT 2862 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2798 CAAGTATAAAGTCAGTGGACCAAGATGTATTACCTTTTCCCCATCAACATTCATCAAATT 2857 Query 2863 CTCACCATCTATCCTGCGCGGTAGATACAAGGTGGTTGGAGAGAACCGTGCAAGCATTTC 2922 | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 2858 CCCACCATCTATCCTGCGCGGGAGATACAAGGTGGTTGGAGAGAACCGTTCAGGCATTTC 2917 Query 2923 TTTCCTGTGTTACTACTGGTAATGTTAAGGTTCAATGGAATGTTTGTCATGCGTTGAGCA 2982 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2918 TTTCCTGTGTTACTACTGGTAATGTTAAGGTTCAATGGAATGTTTGTCATGCGTTGAGCA 2977 Query 2983 ATTTATTCTCCAATGAGACAGTAAAACTGCAAGATATGGATTGGGCTCCAAGTGTTTTTA 3042 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2978 ATTTATTCTCCAATGAGACAGTAAAATTGCAAGATATGGATTGGGCTCCAAGTGTTTTTA 3037 Query 3043 GTATCTTACTATTGCTACTTCGTGATGCATCAAACTTTAAGATAAGAATACAAGCTGCTT 3102 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3038 GTATCTTACTATTGCTGCTTCGTGATGCATCAAACTTTAAGATTAGAATACAAGCTGCTG 3097 Query 3103 CCGCTTTAGCTGTCCCAGCAACCCCACTTGCTTATGGGAGATCATTCCCTGATGTTGTCA 3162 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3098 CCGCTTTAGCTGTCCCAGCAACCCCACTTGCTTATGGGAGATCATTCCCTGATGTTGTCA 3157 Query 3163 AAGGTGTAGAGCATACTTTACAAAGTCTCCATTCTGACAGAGAGACGACTCCAGCAAATT 3222 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3158 AAGGTGTAGAGCATACTTTACAAAGTCTGCATTCTGACAGAGAGACGACTCCAACAAATT 3217 Query 3223 TCAAATATAAGAGGTCGCTTGAGAATCAGTTAACGTCAACCATGCTGCATCTCCTGAGCC 3282 | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3218 TTAAATATAAGAGATCGCTTGAGAATCAGTTAACCTCAACCATGCTGCATCTCCTGAGCC 3277 Query 3283 TAGTTTCAAGCTGTCATTTCGAAGCGTTGTCAGAATTTCTTATAAGAAAAGCCTCATTTC 3342 ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||| Sbjct 3278 TAGTTTCAAGCTGTCATTTCGAAGCGTTGACTGATTTTCTTATAAGAAAAGCCGCTTTTC 3337 Query 3343 TAGAGGAGTGGTTGAGAGGATTGTGTGTGACATTGAAAGAGGAAGATAATGTTTCTGGAT 3402 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 3338 TAGAGGAGTGGTTGAGAGGATTGTGTGTGACATTGAAGGAGGAAGATAATGTGTCTGGAT 3397 Query 3403 CAAGCGGCACAAGCACTTCGGGTGGGAAGCAGAAGAAAGAGTTGATCTCTAGAGCTATAC 3462 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3398 CAAGCGGCACAAGCACTTCGGGTGGGAAGCTGAAGAAAGAGTTGATCTCTAGAGCGATAC 3457 Query 3463 GGTCGCTTGCCAGAAGTTTGCGGGCTGGACATAGCTCTGAAATGGCTCAAAAGTTGCAGG 3522 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3458 GGTCGCTTGCCAGAAGCTTGCGGGCTGGACATAGCTCTGAAATGGCTCTAAAGTTGCAGG 3517 Query 3523 AGTTAGATAGCAATGTGAATTGACTGAGCAAGCAATGCTTCTCGATCGGGTTAACTTGGC 3582 ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3518 AGTTAGAGAGCAATG--AATTGACTGAGCAAGCAATGCTTCTCGATCTGGTTAACTTGGC 3575 Query 3583 CCTGTAATTTCCAACTCAAGTGACTGTAAACAGTTCAACACATGTACATTAGCTCCCATG 3642 |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3576 TCTGTAATTTCTAACTCAAGTGACTGTAAACAATTCAATACATGTACATTAGCTCCCATG 3635 Query 3643 ACAAATTTTGCCAAAAGCATCAGAATGAAATTGGCGGATATATTATAG 3690 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3636 ACAAATTTTGCTAAAAGAATCAGAATGAAATTGGCGGATATATTATAG 3683 > Ahg356214 jgi|Araly1|356214|fgenesh1_pg.C_scaffold_8000001 Length=795 Score = 929 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 690/776 (89%), Gaps = 29/776 (4%) Strand=Plus/Plus Query 622 TGGAAAAGAAA-CTGCCTCAACAGAATCGCTTATGGGATTCCATGGCTCTTGCCTTTGAC 680 ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2 TGGAAAA-AAAGCTGCCTGAACAGAATAGCTTATGGGATTCCATGGCTCTTGCCTTTGAA 60 Query 681 ATGTTTGGTAGAGCATTTTCTCTATCTGAGTCTTTGTTTCCTACTGACGTCTCCCAATGC 740 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 61 ATGTTTGGTAGAGCATTTTCTGTGTCTGAGTCTTTGTTTCCTACTGACGTCTGCCAATGC 120 Query 741 ACGCTAGAGGTTCTAAGGAAAGTAATGGACGTATTAGCATCTAAGGGCCAGCTTGTCGAA 800 ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct 121 ACGCTAGAGGTTCTAAGGAAAGTAATGGATGTCTTAGCATCCAAGGGCCTGCTTGTCGAA 180 Query 801 GACCGATTCATGTGGAG---GTA-T-ATGCCTT-T-GGTTTTGTG---GA-G-AC-TACA 847 |||||||| |||||||| || | ||||||| | || | || | || | | |||| Sbjct 181 GACCGATTTATGTGGAGATTTTATTCATGCCTTCTAGGCTGTGCGCACGAGGTCCTTACA 240 Query 848 ATTTACTCCtttttttCTGGGTTCT-ATTA-GACTTGTTGCCCTCTTAGCGTCATTGAGA 905 | || | | | | || | |||| || | | ||| | || ||||| |||||||| Sbjct 241 A-ATA-T-CAAATGTCCT-GTTTCTGATCACGTCTT-AAG-TTTCATAGCGGCATTGAGA 294 Query 906 ATGTTTTTCTGTTTTGGACTTACTGGCCCACCTCAGTTATCAGTTTCTGATGTTGTTCAC 965 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| Sbjct 295 ATGTTTTTCTGTTTTGGACTTACTGGCCCACCCCAGTTCTCTCATTCTGATGTTGTTCAC 354 Query 966 AACGATAAGCATTTGAATGTCAAGCTTTCTC-CATTGATTTCTGGAGTAAGTAAGAATGC 1024 || |||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 355 AAAGATAAGCAATTAAATGTCATGCTTTC-CACATTGATTTCTGGAGTAAGTAAGAACGC 413 Query 1025 CAAGAATACTCCTTATAGGCCACCCCACTTGCGCAAGAGGGATGATTTGAACACTAGGCA 1084 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 414 CAAGAATAATCCTTATAGGCCACCCCACTTGCGCAAGAGGGATGTTTTGAACACTAAGCA 473 Query 1085 GCCAGTGTCTTCAAG-CTGGCGGCGCCTATCTGCTCATGATTCTGGTAGTTCTGATGTTA 1143 ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 474 GCCAGTGTCTT-GTGACTGGCGGCGCCTGTCTGCTCATGATTCTGGTAGTTGTGATGTTA 532 Query 1144 TATCATCAGATTCCGATTTTAGTGACAGTGACGGCTCCGTACCGGATTCTTATTTTGCCC 1203 ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 533 TATCATCAGATTCTGATTTTAGTGACAGTGATGGTTCCGTACGGGATTCTTATTGTGCCC 592 Query 1204 AAAGCTCCAAGGTTAGAATAGCTGCAATTGTTTGCATACAGGATCTTTGCCAGGCTGATT 1263 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 593 AAAGCTCGAAGGTTAGAATAGCTGCCATTGTTTGCATACAGGATCTTTGCCAGGCTGATT 652 Query 1264 CAAAGTCATTTACCACTCAGTGGGT-GACTCTCTTTCCAACAAGTGATGTACTCAAGCCA 1322 ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 653 CAAAGTCATTTACCACTCAGTGGATGGA-TCTCTTTCCAACCAGTGATGTACTCAAGCCA 711 Query 1323 AGGAAGTTTGAAGCTACTCTAATGACCTGCTTGCTTTTTGATCCTCATTTGAAGGT 1378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 712 AGGAAGTTTGAAGCTACTCTAATGACCTGCTTGCTTTTTGATCCTCATTTGAAGGT 767 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 139557120191 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5