BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G38440.1 Length=4620 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg490606 jgi|Araly1|490606|fgenesh2_kg.7__39__AT4G38440.1 5986 0.0 > Ahg490606 jgi|Araly1|490606|fgenesh2_kg.7__39__AT4G38440.1 Length=4366 Score = 5986 bits (3241), Expect = 0.0 Identities = 3668/3872 (95%), Gaps = 38/3872 (1%) Strand=Plus/Plus Query 612 TTCTCCTCCCCTAGCTGTTTCGAATGGACTTGGGACTCGACACGCGTCTTCGTCTCTTGA 671 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| Sbjct 521 TTCTCCTCCCCTAGCTGTTTCCAATGGACTTGGGACTAGACAGGCGTCTTCCTCTCTTGA 580 Query 672 AAGTGATATTGATGTTGAGAACCATGCAAAGTTGCAGACAATGTCACCCGACGAGATTGC 731 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 581 GAGTGATATTGATGTTGAGAACCATGCAAGGTTGCAGACAATGTCCCCCGAAGAGATTGC 640 Query 732 TGAGGCTCAGGCTGAGTTATTGGACAAGATGGATCCTGCACTACTCTCCATTTTGAAGAA 791 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 641 TGAGGCACAGGCCGAGTTATTGGACAAGATGGATCCTGCACTACTCTCCATTTTGAAGAA 700 Query 792 ACGAGGTGAGGCAAAATTGAAGAAGCGAAAGCATTCTGTGCAGGGGGTTTCCATCACCGA 851 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | Sbjct 701 ACGAGGTGAGGCAAAATTGAAGAAGCGAAAGCATTCAGTACAGGGGGTTTCCATTACCCA 760 Query 852 TGAAACAGCAAAGAATTCAAGAACTGAGGGTCATTTTGTCACTCCTAAAGTGATGGCAAT 911 ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 761 TGAGACATCAAAGAATTCAAGAACTGACGGTCATTTTGTCACTCCTCAAGTGATGGCAAC 820 Query 912 ACCGA-AAGAAAAAAGTGTGGTGCAAAAGCCAGGGATAGCCCAAGGATTCGTGTGGGATG 970 ||| | ||||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 821 ACC-AGAAGAAAAAACTGTGCTGCACAAGTCAGCGATAGCCCAAGGATTTGTGTGGGATA 879 Query 971 CATGGACTGAGAGGGTTGAGGCAGCCAGAGACTTGAGATTTTCTTTTGACGGGAATGTTG 1030 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 880 CATGGACTGAGAGGGTTGAGGCAGCCAGGGACTTGAGATTTTCTTTTGACGGGAATGTTG 939 Query 1031 TTGAGGAAGATG---TTGTCTCGCCAGCTGAAACTGGTGGAAAGTGGTCTGGTGTTGAAT 1087 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 940 TTGAGGATGATGTTCTTGTCTCGCCAGCTGAAACTGGTGGAAAGTGGTCTGGCGTTGAAT 999 Query 1088 CTGCTGCCGAACGTGATTTCTTGAGAACCGAGGGGGATCCTGGGGCCGCAGGTTACACTA 1147 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | Sbjct 1000 CTGCTGCCGAACGTGACTTCTTGAGAACCGAGGGGGATCCTGGGGCAGCAGGGTACACCA 1059 Query 1148 TCAAAGAAGCTATTGCTCTTGCACGAAGTGTGATTCCCGGGCAGAGATGTCTTGCTTTGC 1207 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 1060 TCAAAGAAGCTATTGCTCTTGCACGAAGTGTGATTCCCGGGCAGAGAAGCCTTGCTTTGC 1119 Query 1208 ATCTGCTTGCATCTGTACTCGACAAAGCTTTGAACAAACTTTGTCAAAGCAGAATAGGCT 1267 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1120 ATCTGCTTGCATCTGTACTCGACAAAGCTTTGAACAAACTTTGTCAGAGCAGAATAGGCT 1179 Query 1268 ACGCAAGGGAAGAAAAAGATAAATCCACTGACTGGGAAGCCATCTGGGCTTATGCCCTTG 1327 || ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1180 ACACAAGGGAAGGAAAAGATAAAGCCACCGATTGGGAAGCCATCTGGGCATATGCCCTTG 1239 Query 1328 GACCGGAACCTGAGCTTGTCTTAGCATTGAGGATGGCTCTTGATGACAACCATGCCTCTG 1387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1240 GACCGGAACCTGAGCTTGTCTTAGCATTGAGGATGGCTCTTGATGACAACCATGCCTCTG 1299 Query 1388 TTGTTATAGCATGTGTAAAAGTGATTCAGTGTCTACTGAGCTGTTCTCTTAACGAGAATT 1447 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1300 TTGTTCTAGCATGTGTAAAAGTGATTCAGTGTCTACTGAGCTGTTCTCTTAACGAGAACT 1359 Query 1448 TCTTTAATATTCTGGAGAACATGGGACCACACGGGAAAGATATCTTCACGGCCTCGGTGT 1507 ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1360 TCTTTGATATTTTGGAGAACATGGGACCACACGGGAAGGATATCTTCACGGCCTCGGTGT 1419 Query 1508 TCAGGAGTAAGCCGGAAATTGATCTTGGCTTCCTCCGTGGTTGCTACTGGAAGTACAGCG 1567 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1420 TCAGGAGTAAGCCGGAAATTGATCTTGGCTTCCTCCGTGGTTGCTACTGGAAGTACAGTG 1479 Query 1568 CTAAACCCTCCAATATTGTTGCGTTCCGTGAAGAAATCTTGGATGACGGGACAGAAGATA 1627 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| Sbjct 1480 CTAAACCCTCCAATATTGTTCCTTTCCGTGAAGAAATCATGGATGAAGGCACAGAAGATA 1539 Query 1628 CGGATACTATTCAGAAAGATGTTTTTGTAGCCGGACAAGATGTTGCTGCTGGTCTCGTCA 1687 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1540 CGGATACTATTCAGAAAGATGTTTTTGTAGCCGGACAAGATGTTGCTGCTGGTCTTGTCA 1599 Query 1688 GAATGGATATCCTTCCAAGAATTTATCACCTTCTGGAGACAGAACCAACAGCAGCGCTTG 1747 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1600 GAATGGATATCCTTCCAAGAATTTATCATCTTCTGGAGACAGAACCAACAGCAGCGCTTG 1659 Query 1748 AGGACAGCATAATCTCTGTTACTATTGCGATAGCAAGGCATTCTCCAAAATGCACAACTG 1807 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1660 AGGACAGCATAATCTCTATTACTATTGCGATAGCAAGGCATTCTCCAAAATGCACAACTG 1719 Query 1808 CAATCTTGAAGTATCCCAAATTTGTGCAAACAATTGTGAAAAGATTCCAATTGAACAAAA 1867 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || Sbjct 1720 CAATCTTGAAGTATCCCAAATTTGTGCAAACAATTGTGAAGAGCTTCAAATTGAACAGAA 1779 Query 1868 GAATGGACGTTCTTTCTTCTCAGATCAACTCTGTCCGCCTCTTAAAGGTGTTGGCCCGGT 1927 |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1780 GAATGGACGTTCTTCCTTCTCAGATCAATTCTGTCCGCCTCTTAAAGGTGTTGGCCCGGT 1839 Query 1928 ATGATCAAAGTACTTGCATGGAATTTGTGAAGAATGGGACTTTCAATGCGGTCACATGGC 1987 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1840 ATGATCAAAGTACTTGCATGGAATTTGTGAAGAACGGGACTTTCAATGCGGTCACGTGGC 1899 Query 1988 ATTTGTTTCAGTTCACCTCATCTCTTGACTCATGGGTGAAGCTAGGGAAGCAGAACTGCA 2047 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1900 ATTTGTTTCAGTTCACCTCCTCTCTTGACTCATGGGTGAAGCTAGGGAAGCAGAACTGCA 1959 Query 2048 AGCTTTCATCTACCTTGATGGTTGAACAGCTCCGGTTTTGGAAGGTCTGTATCCATAGTG 2107 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1960 AGCTTTCATCTACTTTGATGGTTGAACAGCTCCGGTTTTGGAAGGTCTGTATCCATAGTG 2019 Query 2108 GCTGTTGCGTATCTCGCTTCCCAGAGCTATTCCCAGCTCTGTGTCTGTGGTTGAGTTGTC 2167 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2020 GCTGTTGCGTAGCTCGCTTCCCAGAGCTATTCCCAGCTCTGTGTCTGTGGTTGAGTTGTC 2079 Query 2168 CATCATTCGAAAAGCTCAGGGAGAAAAATCTCATCAGCGAGTTTACTTCTGTGTCAAACG 2227 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | Sbjct 2080 CATCATTTGAAAAGCTCAGGGAGAAAAATCTCATCAACGAGTTTACTTCTGTGTCAAAGG 2139 Query 2228 AGGCCTACCTGGTCCTTGAGGCTTTTGCCGAGACACTTCCTAATATGTACTCACAAAACA 2287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2140 AGGCCTACCTGGTCCTTGAGGCTTTTGCCGAGACACTTCCTAATATGTACTCACAAAACA 2199 Query 2288 TTCCACGGAATGAATCTGGGACATGGGACTGGAGCTATGTTAGCCCTATGATTGATTCAG 2347 ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2200 CTCCACGGAACGAATCTGGGACATGGGACTGGAGTTATGTTAGCCCTATGATTGATTCAG 2259 Query 2348 CACTGAGTTGGATAACATTGGCCCCGCAATTACTC-AAGTGGGAGAAAGGAATCGAAAGT 2406 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 2260 CACTGAGCTGGATAACATTGGCCCCTCAATTACTCGAA-TGGGAGAAAGGAATCGAAAGT 2318 Query 2407 GTCTCTGTATCAACTACTACTCTGTTGTGGTTGTATTCAGGTGTCATGCGTACAATTTCC 2466 ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2319 GTCTCTGTATCCACTACTTCTCTGTTGTGGTTGTATTCAGGTGTCATGCGTACAATTTCC 2378 Query 2467 AAAGTCCTTGAGAAAATCTCTGCGGAGGGAGAGGAAGAACCTCTACCATGGCTACCGGAG 2526 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2379 AAAGTCCTTGAGAAAATCTCTGCCGAGGGAGAGGAAGAACCTCTACCATGGCTGCCGGAG 2438 Query 2527 TTTGTTCCAAAGATTGGCCTTGCCATTATCAAGCACAAGCTTCTTAGTTTTTCTGTTGCA 2586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2439 TTTGTTCCAAAGATTGGCCTTGCCATTATCAAGCACAAGCTTCTTAGTTTTTCTGTTGCA 2498 Query 2587 GACGTAAGTAGGTTTGGAAAAGACTCTTCCAGGTGTTCCTCTTTTATGGAGTATTTGTGT 2646 |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 2499 GACGTAAGTAGGCTTGGAAATGACTCCTCCAGGTGTTCCTCTTTTATGGAATTTTTGTGT 2558 Query 2647 TTTCTAAGAGAACGATCTCAAGATGACGAACTAGCATTAGCTTCTGTGAATTGTCTTCAT 2706 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2559 TTTCTGAGAGAACGATCTCAAGATGACGAACTAGCATTAGCTTCTGTGAGTTGTCTTCAT 2618 Query 2707 GGGTTAACACGGACTATCGTGTCCATCCAAAATCTGATAGAATCTGCTAGATCCAAGATG 2766 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2619 GGGTTAACACAGACTATCGTGTCCATCCAAAATCTGATAGAATCTGCTAGATCGAAGATG 2678 Query 2767 AAAGCTCCGCATCAGGTAAGTATTTCCACTGGAGATGAATCTGTGCTTGCAAATGGGATA 2826 ||| || | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 2679 AAAACTTCTCATGAGGAAAGTATTTCCACTAGAGATGAATCTGTGCTTGCAAAAGGAATA 2738 Query 2827 CTGGCAGAGTCTCTGGCTGAGCTAACATCTGTGTCGTGCTCTTTTAGAGATTCTGTTTCA 2886 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2739 CTGGCAGAGTCTCTGGCTGACCTAACATCTGTGTCGAGCTCTTTTAGAGATTCTGTTTCA 2798 Query 2887 TCAGAATGGCCCATCGTGCAATCAATTGAGCTACATAAACGAGGCGGATTGGCCCCCGGC 2946 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2799 TCAGAATGGCCCATCGTGCAATCCATTGAGCTACATAAACGAGGCGGATTGGCTCCCGGC 2858 Query 2947 GTTGGACTTGGTTGGGGAGCTAGCGGTGGTGGGTTTTGGTCAACCAGAGTTCTGTTGGCA 3006 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2859 GTTGGACTTGGTTGGGGAGCTAGCGGTGGTGGGTTTTGGTCAACCAGAGTTCTGTTGGCA 2918 Query 3007 CAGGCTGGTGCCGGTCTTCTGAGTCTCTTTCTTAACATCTCTCTGA-GCGACTCGCAGAA 3065 ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct 2919 CAGGCCGATGCCGATCTTCTGAGTCTCTTTCTTAACATCTCTCTGATG-GACTCGCAGAA 2977 Query 3066 TGATCAGGGATCTGTTGGCTTTATGGATAAAGTAAACTCCGCTTTAGCTATGTGTTTGAT 3125 ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2978 TGATCAGGGATCTGTTGGCTTAATAGATAAAATGAACTCCGCTTTAGCTATGTGCTTGAT 3037 Query 3126 TGCAGGTCCAAGGGATTATTTACTCGTGGAAAGAGCCTTTGAATATGTCCTTAGACCGCA 3185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3038 TGCAGGTCCAAGGGATTATTTACTCGTGGAAAGAGCCTTTGAATATGTCCTTAGACCGCA 3097 Query 3186 TGCTTTAGAACACCTGGCCTGCTGTATCAAGTCAAACaaaaaaaaCATATCGTTTGAATG 3245 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3098 TGCTTTAGAGCACCTGGCCTGCTGTATCAAGTCAAACAAAAAAAACATATCGTTTGAATG 3157 Query 3246 GGAATGCAGCGAAGGGGACTATCATCGTATGAGCAGTATGCTTGCTTCTCACTTCAGACA 3305 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3158 GGAATGCAGCGAAGGGGACTATCATCGTATGAGCAGTATACTTGCTTCTCACTTCAGACA 3217 Query 3306 TAGATGGTTACAGCAAAAGGGAAGATCGATAGCCGAGGAAGGGGTCAGTGGGGTAAGGAA 3365 |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3218 TAGATGGTTACAGCCAAAGGGAAAATCAAAAGCCGAGAAAGGGGTCAGTGGGGTAAGGAA 3277 Query 3366 GGGCACAGTTGGTCTGGAGACTATTCATGAGGACGGTGAAATGTCAAATAGTTCAACTCA 3425 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 3278 GGGCACAGTTGGTCTGGAGACTATTCATGAGGACGGTGAAATGCCAAATTGTTCAACTCA 3337 Query 3426 GGATAAAAAATCAGACTCCTCGACCATAGAGTGGGCTCACCAGAGAATGCCCCTACCTCC 3485 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3338 GTATAAACAATCAGACTCCTCGACCATAGAGTGGGCTCACCAGAGAATGCCCCTACCTCC 3397 Query 3486 ACACTGGTTTCTCAGCGCCATCTCAGCAGTCCACAGTGGTAAAACCTCAACAGGGCCACC 3545 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3398 ACACTGGTTTCTCAGCGCCATCTCAGCAGTCCACAGTGGAAAAACCTCAACAGGGCCACC 3457 Query 3546 AGAATCCACAGAGTTGCTTGAAGT-TGCAAAAGCTGGAGTTTTCTTTCTTGCAGGACTTG 3604 ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3458 AGAATCCACGGAGTTGCTTGAAGTAT-CAAAAGCTGGAGTTTTCTTTCTTGCAGGACTTG 3516 Query 3605 AGTCATCGTCTGGTTTTGGATCGCTTCCCTCTCCTGTTGTGAGTGTACCGTTGGTTTGGA 3664 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3517 AGTCATCGTCTGGTTTTGGATCGCTTACGTCTCCTGTTGTGAGTGTGCCGTTGGTTTGGA 3576 Query 3665 AGTTTCACGCTTTGTCTACCGTATTGCTTGTTGGAATGGACATCATCGAAGACAAGAACA 3724 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3577 AGTTTCACGCTTTGTCTACCGTATTGCTTGTTGGAATGGACATCATCGAAGACAAGAACA 3636 Query 3725 CTAGGAACTTGTACAATTATCTGCAGGAGCTTTATGGGCAGTTTCTTGATGAAGCGAGAC 3784 |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3637 CTAGGAACTTGTACAATTTTCTGCAGGAGCTCTATGGGCAGTATCTTGATGAAGCGAGAC 3696 Query 3785 TAAATCACCGTGACACTGAGCTTCTGAGGTTCAAGTCAGACATTCATGAGAACTACTCTA 3844 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 3697 TAAATCACCGTGACATTGAGCTCCTGAGGTTCAAGTCAGAGATTCACGAGAACTACTCTA 3756 Query 3845 CTTTTCTGGAGATGGTGGTGGAGCAGTATGCTGCGGTGTCATATGGTGATGTAGTGTATG 3904 ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3757 CTTTTATGGAGATGGTCGTGGAGCAGTATGCTGCGGTGTCATATGGTGATGTAGTATATG 3816 Query 3905 GCCGGCAGGTCTCGGTTTACCTGCATCAATGCGTGGAACACTCTGTTCGGCTTTCGGCAT 3964 | || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3817 GGCGACAGGTCTCGATTTACCTGCATCAATGTGTGGAACACTCTGTTCGGCTTTCGGCAT 3876 Query 3965 GGACAGTGCTCTCCAATGCCCGTGTTCTCGAGCTTCTGCCGAGTCTAGACAAGTGCTTGG 4024 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3877 GGACGGTGCTCTCCAATGCCCGTGTTCTCGAGCTTCTACCGAGTCTAGACAAGTGCTTGG 3936 Query 4025 GAGAAGCGGATGGTTACCTCGAACCTGTTGAGGAAAATGAGGCCGTCCTTGAGGCCTACC 4084 ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | Sbjct 3937 GAGAAGCGGATGGTTACCTTGAACCGGTTGAGGAAAATGAGGCAGTCATTGAGGCCTATC 3996 Query 4085 TGAAGTCATGGACTTGTGGGGCATTGGACAGAGCTGCGACGCGTGGATCAGTAGCCTATA 4144 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3997 TGAAGTCATGGACTTGTGGAGCATTGGACAGAGCTGCGACGCGTGGATCAATAGCCTATA 4056 Query 4145 CGCTGGTTGTGCATCACTTTTCATCTTTAGTCTTTTGCAACCAAGCCAAGGATAAAGTAT 4204 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4057 CGCTGGTTGTGCATCACTTTTCATCATTAGTCTTGTGCAACCAAGCCAAGGATAAAGTAT 4116 Query 4205 CCCTGCGGAATAAGATTGTCAAGACTCTTGTCAGGGATTTATCAAGAAAGCGGCATCGTG 4264 ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| Sbjct 4117 CCCTGCGGAATAAGATTGTTAAGACTCTTGTCAGAGATTTATCCAGAAAGAGGCATCGTG 4176 Query 4265 AGGGGATGATGTTAGATCTCCTGCGGTATAAG-AAAGGGTCTGCGAACGCCATGGAAGAA 4323 ||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4177 AGGGGATGATGCTAGATCTCCTGAGGTATA-GTAAAGGGTCTGAGAACGCCATGGAAGAA 4235 Query 4324 GAAGTGATAGCAGCGGAGACAGAGAAAAGAATGGAGGTGTTGAAAGAGGGTTGCGAAGGG 4383 || | | | | ||| | | || || | || ||||||| ||||||||||| Sbjct 4236 GA-G--A-A--A----AGA-AT-G----GA--GGCG-TG--GAAAGAGTGTTGCGAAGGG 4274 Query 4384 AACTCCACCCTCCTCTTGGAACTGGAGAAGCTGAAATCAGCCGCTCTCTGTGGAAGAAGG 4443 ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 4275 AACTCGGCCCTCCTCTCGGAACTGGAGAAGCTCAAATTGGCCGCTCTCTGTGGAAGAAGG 4334 Query 4444 TGAA--C--GAGAGAATGAGAGGAAAGAAAGT 4471 |||| | |||||| |||||||||||||||| Sbjct 4335 TGAAAACCTGAGAGAGTGAGAGGAAAGAAAGT 4366 Score = 658 bits (356), Expect = 0.0 Identities = 472/526 (90%), Gaps = 16/526 (3%) Strand=Plus/Plus Query 44 GAGTGATGGAGCAAAGTAGCGGGAGA---GTCAATCCGGAACA-GCCGAACAACGTCTTG 99 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct 1 GAGTGATGGAGCAAAGTAGCGGGAGACTCATCAATCCGGAACAGGCC-AACAACGTCTTG 59 Query 100 GCGAGCCTTGTCGGGAGCATCGTGGAGAAAGGAATATCGGAGAATAAGCCTCCAAGCAAG 159 | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct 60 GGGAGGCTTGTGGGGAGCATCGTGGAGAAAGGAATATCGGAGAATAAGCCGCCAAACAAG 119 Query 160 CCGCTTCCCCCAAGGCCCTCCCTTCTTTCCTTCCCCGTCGCTCGTCATCGTTCTCACGGA 219 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 CCGCTTCCCCCAAGACCCTCCCTTCTGTCCTTCCCCGTCGCTCGTCATCGTTCTCACGGA 179 Query 220 CCCCATTTGGCTCCTGTGGGAAGCAGCATAGCACAACCTAAGGATTACAATGACGATCAG 279 ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || | Sbjct 180 CCCCAAGGGGTTCCTGTGGGAAGCAGCATTGCACAACCTAAAGATAACGATGAGGAAGAA 239 Query 280 GAAGAAGAAGAAGCAGAAGAACGTTTCATGAATGCAGACTCCATTGCTGCTTTTGCTAAA 339 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 240 GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAACGTTTCATGAATGCAGACTCCGTTTCTGCTTTTGCTAAA 299 Query 340 CCGCTTCAAAGAAAAGAGAAGAAAGACATGGACCTCGGGAGGTGGAAAGATATGGTCTCT 399 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 300 CCGCTTCAAAGAAAGGAGAAGAAAGACATGGATCTCCGGAGGTGGAAAGATATGCTCTCT 359 Query 400 GGGGATGATCCTGCATCCACACATGTCCCTCAGCAATCAAGGAAACTTAAGATCATTGAA 459 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 360 AGGGATGAGCCTGCATCCACACATGGCCCTCAGCAATCAAGGAGAGTTAAGATCATTGAA 419 Query 460 ACGAGACCGCC-CTATGTTGCTTCAGCCGATGCGGCCACTACATCCAGCAACACTTTACT 518 ||||| || || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 420 ACGAGGCC-CCTCTCTGTTGCTTCAGCCGATGCGGCCGCTACATCCAGCAACACTTTACT 478 Query 519 GGCT---------GCCAGGGCATCAGACCAGAGAGAGTTTGTTTCT 555 |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct 479 GGCTCAAAAACCTGCCAGGGCATCATACCAGAGAGACATTGTTTCT 524 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 174798432789 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5