BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G05570.1
Length=3776
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg487352 jgi|Araly1|487352|fgenesh2_kg.6__486__AT5G05570.1 3061 0.0
> Ahg487352 jgi|Araly1|487352|fgenesh2_kg.6__486__AT5G05570.1
Length=3709
Score = 3061 bits (1657), Expect = 0.0
Identities = 1842/1927 (96%), Gaps = 30/1927 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCGGTCATCCTCTCTGACTCTCTCAAATCGAATCTGAAGCTTTTAGTT-TTATTCTACG 59
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||
Sbjct 1 ATCGGTCATCCTCTCTGACTCTCTCAAATCGAATCTCAAG-TTTT-CTTCTTATTCTACG 58
Query 60 ATCAAATTCCGAACGAACAAAATTCTCTTGATTCCGCTGATTTCTCCGTCCGATGCATCT 119
|||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 59 ATCAGATTCCG-ACGAACAAAATTCTCTTGCTTCCACCGATTTCTCCGTCCGATGCATCG 117
Query 120 TCTCGATTGAAAATTCCATTCTCGTTT---------GTTATTCCACCGGAGGAGTGAGCA 170
|||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 118 TCTCGATTGATAATTCTATCCTCGTTTAAAAGACAAGTTGTTCCACCGGAGGAGTGAGCA 177
Query 171 ATCGGCTCTCATTTGTCTTGTTTTAGCTCGATGTTCGTCAGAAAATTTCTGCAGAAATCC 230
|||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 ATCGGCTCTCATCTGTCTTGATCTAGCTCGATGTTCGCCAGAAAATTTCTGCAGAAATCC 237
Query 231 TCCGGCGGTCAGAATCCTCCTCCTCCTATAGCTCCTCCGCCTCGGGGATGTTTGATGGCA 290
|||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 238 TCCGGCGGTCAGAA------TCCT-C-----CTCCT---CCTCGGGGATGTTTGATAGCA 282
Query 291 GAAGATTTGGATCCTCATATTA-TCACCCACTCTGGGATACCTTCGACGGCGTCTCTTCT 349
||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 283 GAAGACTTGGATCCCCAT-TTAGTCACCCACTGTGGGATACCTTCGACTGCGTCTCTTCT 341
Query 350 TGCCTTTGACCCTATTCAATGCCTCTTGGCTGTGGGAACACTAGATGGAAGGATAAAAGT 409
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 342 TGCCTTTGACCCTATTCAATGCCTCTTGGCTGTAGGAACTCTAGATGGAAGGATAAAAGT 401
Query 410 GATTGGTGGCGATAACATCGAGGCAATTCTTGCATCTCCTAAGCAGTTACCTTTCAAAAA 469
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 GATTGGTGGCGATAACATCGAGGCGATTCTTGCATGTCCTAAGCAGTTACCTTTCAAAAA 461
Query 470 CTTAGAGTTCATGCAGAACCAAGGCTTTCTGGTTAGCATCTCAAATGAAAACGAGATTCA 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 CTTAGAGTTCATGCAGAACCAAGGCTTTCTGGTTAGCATCTCAAATGAAAACGAGATTCA 521
Query 530 GGTTTGGGACTTGGATCTTAGGCAACCAGCATCAAGCTTAAAGTGGGAGTCAAACATTAC 589
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 522 GGTTTGGGACTTGGATCTTAGGCAACCAGCATCAAGCTTAAAATGGGAGTCAAACATTAC 581
Query 590 TGCGTTTGCAATCCTTCATGGCACTGGTTACATGTATGTTGGTGATGAGTACGGTATGGT 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 582 TGCGTTTGCAATCCTTCATGGCACTGGTTACATGTATGTTGGTGATGAGTATGGTATGGT 641
Query 650 GTCTGTTCTAAACTACAGCGCTGACGAAGGGAAATTACTGCAGCTTCCTTATTATGTTCC 709
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 GTCTGTTATAAACTACAGTGCTGACGAAGGGAAATTACTGCAGCTTCCTTATTATGTTCC 701
Query 710 AACTGATGCTTTATCTGAAGCAGCGGGGCTTTCATCTCCTATTGATTATCCGGTTGTTGG 769
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 AACTGATGCTTTAGCTGAAGCAGCGGGGCTTTCATCTCCTATTGATTATCCGGTTGTTGG 761
Query 770 ACTTCTTTCCCAGCCTTGTTCAAAGGGAACTAGATTGTTGATTGCATTTTCAAATGGATT 829
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 ACTTCTTTCTCAGCCTTGTTCAAAGGGAACTAGATTGTTGATTGCATTTTCAAATGGATT 821
Query 830 ACTTTTTCTTTGGGATGCATCAGAAGATCATGTCGTGTTAGTTCGGGGGAACAAAGATCT 889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 822 ACTTTTTCTTTGGGATGCATCAGAAGATCATGTCGTGTTAGTTCGGGGGAACAAAGATCT 881
Query 890 ACCTGTGGAGGGTAAAACAGTTGCTGATTCTCTTGAAGCTTCACATGATGAGCTTTCCAA 949
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 882 ACCTGTGGAGGGTAACACAGTTGCTGATTCTCTGGAAGCCTCACATGATGAGCTTTCTGA 941
Query 950 TCTTGAACTCGATGGAAAAGAGATAAGTTCTTTGTGTTGGGCATCAACTGATGGTTCAGT 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 TCTTGAACTCGATGGAAAAGAGATAAGTTCTTTGTGTTGGGCATCAACTGATGGTTCAGT 1001
Query 1010 TCTTGCTGTTGGCTATGTGGATGGGGATATATTATTTTGGGACTTTTCTGATGGGCAAAA 1069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 TCTTGCTGTTGGCTATGTGGATGGGGATATATTATTTTGGGACTTTTCTGATGGGCAAAA 1061
Query 1070 GGGGAAGCCATCTAATCACGTTGTTAAGTTACAGTTGTCTTCGGCTGAGAAAAGACTTCC 1129
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1062 GGGGAAGCCATCTAATCACGTTGTCAAGTTACAGTTGTCTTCAGCTGAGAAAAGACTTCC 1121
Query 1130 TGTCATTGTTATGCATTGGTGTTTGGATGTATCCCGCAAGAGTAGTGGTGGAAAACTCTT 1189
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 TGTCATTGTTATGCACTGGTGTTTGGATGTATCCCACAAGAGTAGTGGTGGAAAACTCTT 1181
Query 1190 CATCTATGGTGGTGATATCATTGGATCTGACGAAGTACTTACGATGTTAGGTCTTGATTG 1249
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CATCTACGGTGGTGATATCATTGGATCTGACGAAGTACTTACGATGTTAGGTCTTGATTG 1241
Query 1250 GTCTTCTGGTATGGGAGGTCTGAAATGTGTTGGCCGTGCTGACCTGACCCTTAGTGGTTC 1309
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1242 GTCTTCTGGTATGAGAGGTCTGAAATGTGTTGGCCGCGCTGACCTGACCCTTAGCGGTTC 1301
Query 1310 ATTTGCTGATATGGTCTTGTCTCCAATTGCCAGTTCAAGGCAGAGTGGGGTGTTTTTATT 1369
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 1302 ATTTGCTGATATGGTCTTGTCTCCAATAGCCAGTTCAAGGCAAAGTGGGATGTTTTTATT 1361
Query 1370 TCTGTTGACAAATCCAGGACAACTGCAAGCATATGACGATACCTCTCTGGCTTCTCTGAT 1429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 TCTGTTGACAAATCCAGGACAACTGCAAGCATATGACGATACCTCTCTGGCTTCTCTGAT 1421
Query 1430 GTCTCAGAAAGAGAATAAGATTTCTGTTTCTCCACTGCCATATCCAATGGTTGTACCAAC 1489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422 GTCTCAGAAAGAGAATAAGATTTCTGTTTCTCCACTGCCATATCCAATGGTTGTACCAAC 1481
Query 1490 GATGGATCCACATATGACAGTAGCAACGTTTTCTGCATTAAATGTGAATGATAAAACGTC 1549
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 GATGGATCCACATATGACAGTAGCAACGTTTGCTGCATTAAATGTGAATGATAAAACGTC 1541
Query 1550 ATTAGCTCTTTCTGAGATAGTCTTAGCTGCAAAAGCTCGAACCCCTCGTACCCCATCCGG 1609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1542 ATTAGCTCTTTCTGAGATAGTCTTAGCTGCAAAAGCTCGAACCCCACGTACTCCATCCGG 1601
Query 1610 AGAAAGTGCACAATGGCCTCTGACAGGTGGTGTTCCAAGCCACGTTGATGACTACAAGCT 1669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1602 AGAAAGTGCACAATGGCCTCTGACAGGTGGTGTTCCAAGCCACCTTGATGACTACAAGCT 1661
Query 1670 TGAAAGACTTTACATGGCAGGATATCAAGATGGGTCTATGCGAATATGGGATGCAACCTA 1729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662 TGAAAGACTTTACATGGCAGGATATCAAGATGGGTCTATGCGAATATGGGATGCAACCTA 1721
Query 1730 TCCATGTCTGTCCCTTATTTATATTTTGGAGCCAAAGGCAAGTGTTATTGACATAACTGG 1789
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722 TCCATGTCTGTCTCTTATTTATATTTTGGAACCAAAGGCAAGTGTTATTGACATAACTGG 1781
Query 1790 AGTAGATGCATCTGTAACGGCATTTTGCTTCTGCTCTAAGACTTCTTGTTTGGCTGTTGG 1849
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782 AGTAGATGCATCAGTAACGGCATTTTGCTTCTGCTCTAAGACTTCTTGTTTGGCTGTTGG 1841
Query 1850 TAACGAATGTGGTATGGTTCGCCTATACAAGTTGGTCGGCCATACAAGTGGAGGAACTTT 1909
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 TAACGAATGTGGTATGGTTCGCCTATTCAAGCTGGTCGGCCATACAAGTGGAGGAACTTT 1901
Query 1910 GGAAGTT 1916
|||||||
Sbjct 1902 GGAAGTT 1908
Score = 3009 bits (1629), Expect = 0.0
Identities = 1749/1807 (97%), Gaps = 7/1807 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1971 ATTTGTTATGCTTTATCTCATGCTGTTGGTTCATTACTTGTAGCTCACCATTTGCATCAA 2030
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1909 ATTTGTTATGCTTTATCTCATGCTGTAGGTTCATTACTTGTAGCTCACCATTTGTATCAA 1968
Query 2031 GAAGATGGTCCTCAATGGTTGGCTGCGTTTTCCTTCCTGAGTTCCCCAGTGTGCACCCTG 2090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 GAAGATGGTCCTCAATGGTTGGCTGCGTTTTCCTTCCTGAGTTCCCCAGTGTGCACCCTG 2028
Query 2091 CAATTTGTACAGTCTACAAGAAGGCTTGCCGTGGGATTTAAATGTGGCAAGGTTGCAGTG 2150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2029 AAATTTGTACAGTCTACAAGAAGGCTTGCCGTGGGATTTAAATGTGGCAAGGTTGCAATG 2088
Query 2151 CTTGACATTGGTGTGCCGTCAGTATTATTTGTTACAAATAGCTTATCTGACTCAGGTTCT 2210
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 CTTGACATTGGTGTGCCGTCAGTATTATTCGTTACAAATAGCTTATCTGACTCAGGTTCT 2148
Query 2211 CCGATCAAGTCACTCTATGTGAAATCCTCTTCAGCTCCAACAGGCTCAAAAAGTGATCCA 2270
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 CCGATCAAGTCACTCTATGTGAAATTCACTTCAGCTCCATCAGGCTCAAAAAGTGATCCA 2208
Query 2271 ACTGATCACAACTCCATAAATTCTGAAGATGA-TTTACTCTTGTGTGCAATGACCAAAGA 2329
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 ACTGATCACAACTCCATAAATTCTGAAGAT-ATTTTAATCTTGTGTGCAATGACCAAAGA 2267
Query 2330 TGGACAGACCATTCTTTTGGATGGCAATACTGGGAAAATACTTGCCTCTTGCCTGAGACC 2389
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||
Sbjct 2268 TGGACAGACCATTCTTTTGGATGGCAATACTGGAAAAATACTCGCCTCATGCTTGAGACC 2327
Query 2390 TCTAAAGAACCCAACTGCGATTTGTATGCACATTATAGAGAACTGCTATGAAAACTATGA 2449
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2328 TCTAAAGAACCCAACTGCGATTTGTATGCACATTATAGAGAACTGCTATGAAAACTCTGA 2387
Query 2450 AACGCCCAGTGAAAAACCAGCTGAAAATCCATCTGGGAAGGATAAACATGAGAACAAATC 2509
|||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2388 AACGCCCAATGGAAAGCCAGCTGGAAATCCATCTGGGAAGGAGAAACATGAGAACAAATC 2447
Query 2510 TCATATAATCAAAGCTAGTGAGAGTCATTCACCAGACGGTGAACAGAATGCTGTCACAGA 2569
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 2448 TCATATAATCAACGCTAGTGAGAGTCATTCACCA-TC--TGAACAGAATGCTGTCACAGA 2504
Query 2570 AACAAAACTTATTGATCAGATATTTGCGAATTCATTATTTCTCATGTGTTCTGAGGATGC 2629
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2505 AACAAAACTTGCTGATCAGATGTTTGCGAACTCAGTATTTCTCATGTGTTCGGAGGATGC 2564
Query 2630 ACTGCGCTTGTATACTGTAAAGTCTCTATCTCAGGGAAGTCTTGAGAGCATTATGGAGGT 2689
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 ACTGCGCTTGTATACTTTAAAGTCTCTATCTCAGGGAAGTCTTGAGAGCATTATGGAGGT 2624
Query 2690 AAATCTTCCAAGGCCGTGTTGCTGGATGGGAATCCTaaaaaaaGATGGAAGGGAATGTGC 2749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2625 AAATCTTCCAAGGCCGTGTTGCTGGATGGGAATCCTAAAAAAAGATGGAAGGGAATGTGC 2684
Query 2750 AGTACTCCTGTTTTACCGAACAGGGCATATTGAAATAAGATCTTTCCCGAATCTTGAAGT 2809
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2685 AGTACTCCTGCTTTACCGAACAGGGCATATTGAAATAAGATCTTTTCCGGATCTTGAAGT 2744
Query 2810 TGTGGGAGAGAGCTCTTTGCTGTCACTTCTTAGGTGGAACTTCAAGCCTAACATGGAGAA 2869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2745 TGTGGGAGAGAGCTCTTTGCTGTCACTTCTTAGGTGGAACTTCAAGCCTAACATGGAGAA 2804
Query 2870 GACAGTATGTTCAGATGATTTCGGCCATGTCGTCCTGGTAAATGGTTGTGAAGTTGCCAT 2929
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2805 GACAGTATGTTCGGATGATTTCGGCCATGTCGTCCTGGTAAATGGTTGTGAAGTTGCCAT 2864
Query 2930 CCTTTCGTTTTTGGCCCACGCAAACGGCTTCAGGCTCCCAGAGTCTTTACCTTTGCTTCA 2989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2865 CCTTTCGTTTTTGGCCCACGCAAACGGCTTCAGGCTCCCAGAGTCTTTACCTTTGCTTCA 2924
Query 2990 TGACAAAGTCCTTGCAGCAGCTGCTGACGCTACCTTTAGCCATATCTCTGTTCATAAGAA 3049
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2925 TGACAAAGTCCTTGCAGCAGCTGCTGACGCTACCTTTAGCCATATCTCTGCTCATAAGAA 2984
Query 3050 AAATCATGATGGCGCTCCCAAATTCCTAAGTAACATTATCAAAGGCTTCAGATCAAGCAC 3109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2985 AAATCATGATGGCGCTCCCAAATTCCTAAGTAACATTATCAAAGGCTTCAGATCAAGCAC 3044
Query 3110 TGAACAGAAGATGGACCAAGTACAAGATTTCTCCCACCTGGGGAACATCTTTTCTAATCC 3169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3045 TGAACAGAAGATGGACCAAGTACAAGATTTCTCCCACCTGGGGAACATCTTTTCTAATCC 3104
Query 3170 ACCATACTTAAAACCTTCTGATACCGGTGGCGACGACGAAAAGATTGTTGAGCTAAACAT 3229
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3105 ACCATACTTAAAACCTTCTGATACCGGTGGCGACGACGAAAAGATTGTCGAGCTAAACAT 3164
Query 3230 AGATGACATCGAGATAGATGAACCTGTGATCATCTTGCCGTTGACagagaaagacaaaaa 3289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3165 AGATGACATCGAGATAGATGAACCTGTGATCATCTTGCCTTTGACAGAGAAAGACAAAAA 3224
Query 3290 agaaaagaaagataagagaacggataaggaaaagCTGTTCGACGGTGCATCCAGCGATGC 3349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 3225 AGAAAAGAAAGATAAGAGAACGGATAAGGAAAAGCTGTTTGACAGTGCATCCAGCGATGC 3284
Query 3350 ACAACCCAAAACAAGAACAGTGGATGAAATTAAGTCCAAATACAGAAAAGCTGGGGAAAC 3409
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3285 ACAACCCAAAACGAGAACAGTGGAAGAAATTAAGTCCAAATACAGAAAAGCAGGGGAAAC 3344
Query 3410 CTCAGCAATAGCTTCACAAGCGAAGGACAAACTTCATGAGCGGGGAGAAAAACTCGAGAG 3469
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3345 CTCAGCAATAGCTTCACAAGCGAAGGACAAACTTCTTGAGCGGGGAGAAAAACTCGAGAG 3404
Query 3470 AATCAGCCAACGCACAGCTGAGCTTCAAGACAATGCTGAGAACTTTGCATCCATGGCACA 3529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 AATCAGCCAACGCACAGCTGAGCTTCAAGACAATGCTGAGAACTTTGCATCCATGGCACA 3464
Query 3530 TGAACTTGCTAAGCAAATGGAGAAGCGAAAATGGTGGAACATATGAGAGAGTTGCAGCCA 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3465 TGAACTTGCTAAGCAAATGGAGAAGCGAAAATGGTGGAACATATGAGAGAGTTGCAGTCA 3524
Query 3590 TTGTGGGCTCTTCCGTATATAAACTAATTATCTTTTGTGTTTCCACAGGTGAAAATTTCT 3649
||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3525 TTGTGGGTTCTTCCGTATATAAACTAATTATCTTG-G-GTTTCCACAGGTGAAAAACTCT 3582
Query 3650 TTTTCATGTTTATTTATCAATCAAATCTGTAAAATAGATTGACCAAAGAGAGCAACCCTT 3709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3583 CTTTCATGTTTATTTATCAATCAAATCTGTAAAATAGATTGATCAAAGGGAGCAACCCTT 3642
Query 3710 CTAACTTGAAAAGTTGCTTGTGAGCTGATTTGAGGCTGCTTTGACTGTCTATCAGAATTT 3769
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3643 CTAACTTGAGAAGTTGCTTGTGAGCTGATTTGAGGCTGCTATGACTGTCTATCAGAATTT 3702
Query 3770 TAAATTT 3776
|||||||
Sbjct 3703 TAAATTT 3709
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 142677841177
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5