BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G08450.1
Length=3087
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg487684 jgi|Araly1|487684|fgenesh2_kg.6__818__AT5G08450.2 4663 0.0
Ahg350108 jgi|Araly1|350108|fgenesh1_pg.C_scaffold_6000701 2204 0.0
> Ahg487684 jgi|Araly1|487684|fgenesh2_kg.6__818__AT5G08450.2
Length=3039
Score = 4663 bits (2525), Expect = 0.0
Identities = 2788/2915 (96%), Gaps = 17/2915 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 149 CAGTGAATTTCTGGGTTAT-TGAATTTGGGAGTGATGAGTGGTGTTCCAAAGAGATCTCA 207
||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 CAGTGGATTTTTGGGTT-TGTGAATTTTGGAGTGATGAGTGGTGTTCCAAAGAGATCTCA 195
Query 208 CGAAGAGGGTGTTACTCATCCATCTTCTTCTTCATCAGTAGCAAAATACCCTCACGAGGA 267
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 196 CGAAGAGGGTGTTACTCATCCATCTTCTTCTTCTTCAGCACCAAAATACCCTCACGAGGA 255
Query 268 TTCTGGATCTTACCCTAAATCGCCGCATCAGCCTGTGACGCCACCACCGGCTCAGGTTCA 327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 256 TTCTGGATCTTACCCTAAATCGCCGCATCAGCCTGTTACGCCACCACCGGCTCAGGTTCA 315
Query 328 TCATAACCAT---CAACAGCCCCATCAGCATCCCCAATCTCAATCTCAATCTCAGCCTCA 384
|||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 316 TCATCACCATCAACAACAACCCCATCAGCATCCCCAATCTCAATCTCAACCTCAACCTCA 375
Query 385 ACCTC-ACCTCCAGGCGCTTCCTCACCCTCATTCTCATTCTCACTCCCATTCACCACTTG 443
||||| |||| || | | ||| ||| || | ||||| | ||||| |||||||||| |
Sbjct 376 ACCTCAACCT-CA--C-C-TCCACACGCT--TCCTCATCCCCACTCTCATTCACCAC-T- 426
Query 444 CTGCTGCTGCTTCTGCTTCTGCTCCTTATGAGGTTGAATCTAGAACGGTGGTTAAGGTTG 503
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 427 -TGCTGCTGCTTCTGCTTCTGCTGCTTATGAGGTTGAATCTAGAACGGTGGTTAAGGTTG 485
Query 504 CGAGAAGCGAGCCTAGAGATGGAGAGAGACGCTCTCCTCTGCCTCTTGTCTATCGGTCTC 563
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 486 CGAGAAGTGAGCCTAGAGATGGAGAGAGACGCTCTCCTCTCCCTCTTGTCTATCGGTCTC 545
Query 564 CGTCGCTGCCCACAACTGTTTCTTCTAGTGATCCTCATTTGACTCACGCCCCTGTGCCGA 623
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 546 CGTCCCTGCCCACTACTGTTTCTTCTAGTGATCCTCATTTGACTCACGCCCCTGTGCCCA 605
Query 624 TGGAGCCGAGAGATGGTGCTAAGGATGGCAGGGAAATTAGGGTTGAGAGTAGAGAAAATA 683
|||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 606 TGGAACCGAGAGAAGGTACTAAGGATGGCAGGGAAATTAGGGTTGAGAACAGAGAAAGTA 665
Query 684 GGAGTGATGGGAGAGAGATATATGGTGAGACAAAGAGGGAGATTCAGGGTCCTAAGGGAG 743
|||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
Sbjct 666 GGAGTGATGGAAGGGAGATTTATGGTGAGACAAAGAGAGAGATTCAGGGTCCTAAGAGTG 725
Query 744 ACAGAGATGTGAAATTTGAGAGATCAGTAGATGACTTTAGCGGAAAAGGTAATACCGGAA 803
||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 726 ACAGAGATGTGAAGTTTGATAGATCAGTAGACGATTTTACCGGAAAAGGTAATACCGGAA 785
Query 804 GCTATACTAGGAATGATGGGAGAGAGATGTATGGTGAGACTAAGAGGGAGATTCAGGGTC 863
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 GCTATTCTAGGAATGATGGGAGAGAGATGTATGGTGAGACTAAGAGGGAGATTCAGGGTC 845
Query 864 CTAAGAGTGACAGGGATGCCAAGTTTGAGCGTCCAGGGGATGATTTTAGCGGGAAAAGTA 923
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 846 CTAAGAGTGACAGGGATGCCAAGTTTGAGCGTCCAGGGGATGATTTTAGCGGAAAAAGTA 905
Query 924 ATGCCGGTAGCTATACTAGGGATACAAAATTTGATAGGGAGAATCAAAATTATAATGAAC 983
|| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 906 ATACCGGTAGCTATACGAGGGATACGAAATTTGATAGGGAGAATCAGAATTATAATGAAC 965
Query 984 AAAAGGGGGAGATTAAGATGGAAAAGGAAGGGCATGCTCACTTGGCTTGGAAAGAGCAGA 1043
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 966 AAAAGGCGGAGATTAAGATGGAAAAGGACGGGCATGCTCACTTGGCTTGGAAAGAGCAGA 1025
Query 1044 AGGATTACCATAGAGGGAAGAGAGTTGCTGAAGGTTCGACTGCAAATGTGGACCCGTGGG 1103
||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1026 AGGATTACCCTAGAGGCAAGAGAGTTGCTGAAGGTTCGACTGCAAATGTGGATCCGTGGG 1085
Query 1104 TTGTATCCCGCGGTAATCCGCAAGGCCCAACTGAGGTTGGGCCTAAAGATCTCTCTGCGC 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||
Sbjct 1086 TTGTATCCCGCGGTAATCCGCAAGGCCCAACTGAGGTTGAGCCTAAGGATTTCTCCGCGC 1145
Query 1164 CTGTGGAGGGGTCTCATTTGGAAGGACGTGAAACCGTCGGagaaaacaaggttgatgcca 1223
||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1146 CTGTGGAGGGGCCCCATTTAGAAGGACGTGAAACTGTCGGAGAAAACAAGGTTGATGCAA 1205
Query 1224 aaaacgaagatagatttaaggaaaaagataagaaaagaaaagagttaaagCATCGAGAAT 1283
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 AAAATGAAGATAGATTTAAGGACAAAGATAAGAAAAGAAAAGAGTTAAAGCATCGAGAAT 1265
Query 1284 GGGGGGACCGAGACAAGGATAGAAATGACCGTCGAGTATCTGTGCTTGTTGGTAGTGTCA 1343
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 1266 GGGGGGACCGAGATAAGGATAGAAATGACCGTCGAGGATCCGTGCTTATTGGTAGTGTCA 1325
Query 1344 TGAGTGAACCCAAAGAGATTGGAAGAGAAGAAAGGGAATCCGATAGGTGGGAACGGGAGA 1403
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 TGAGTGAACCCAAAGAGATTGGAAGAGACGAAAGAGAATCCGATAGGTGGGAACGGGAGA 1385
Query 1404 GGATGGAGCagaaagatcgagaaagaaataaagagaaagataaagatcatatcaaaagag 1463
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 GGATGGAGCAGAAAGATCGAGAAAGGAATAAAGAGAAAGATAAAGATCATATCAAAAGAG 1445
Query 1464 agCCAAGGACTGGTGCTGAGAAAGAGATCTCGCAGAACGAGAAAGAGCTGGGAGAAGCAT 1523
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1446 AGCCAAGGACTGGTGCTGAGAAAGAGATCTCACAGAACGAGAAAGAGTTGGGAGAAGCAT 1505
Query 1524 CTGCCAAACCCTCAGAGCAGGAATATGTGGCACCAGAGCAGAAGAAGCAGAACGAACCGG 1583
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506 CTGCCAAACCATCAGAGCAGGAATATGTGGCACCAGAGCAGAAGAAGCAGAACGAACCGG 1565
Query 1584 ATAATTGTgaaaaagacgaaagagaaacaaaggaaaaaaggagagagagggatggtgatt 1643
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566 ATAATTGGGAAAAAGACGAAAGAGAATCAAAGGAAAAAAGGAGAGAGAGGGATGGTGATT 1625
Query 1644 cagaggcagaaagaGCTGAAAAGCGCAGCAGAATCAGTGAAAAAGAATCTGAAGATGGGT 1703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CAGAGGCAGAAAGAGCTGAAAAGCGCAGCAGAATCAGTGAAAAAGAATCTGAAGATGGGT 1685
Query 1704 GTTTAGAGGGTGAAGGAGCTACCGAGAGGGAAAAGGATGCCTTCAATTATGGGGTTCAGC 1763
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1686 GTTTGGAGGGTGAAGGAGCTACTGAGAGGGAAAAGGATGCCTTCAATTATGGAGTTCAGC 1745
Query 1764 AGAGGAAGAGAGCGCTGAGACCGAGAGGCAGCCCACAAACCACTAATCGCGACAATGTCC 1823
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||
Sbjct 1746 AGCGGAAGAGAGCGCTGAGACCGAGAGGCAGCCCACAAACCACAAACCGCGACCATGTCC 1805
Query 1824 GCTCACGGAGTCAGGACAACGAAGGAGTACAAGGCAAGTCAGAGGTGTCGATTGTTGTTT 1883
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1806 ACTCACGGAGTCAGGACAACGAAGGAGTACAAGGCAAGTCAGAGGTGTCGATTGTTGTTT 1865
Query 1884 ACAAAGTTGGCGAATGTATGCAAGAACTGATTAAGTTGTGGAAAGAATATGATTTGTCTC 1943
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1866 ACAAAGTTGGCGAATGTATGCAAGAACTGATTAAATTGTGGAAAGAATATGATTTGTCTC 1925
Query 1944 ATCCTGATAAAAGCGGTGATTTCGCTAATAATGGCCCCACTCTTGAAGTTAGGATTCCAG 2003
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926 ATCCTGATAAAAGCGGTGATTTTGCAAATAATGGCCCCACTCTTGAAGTTAGGATTCCAG 1985
Query 2004 CTGAGCATGTTACTGCTACAAATCGCCAAGTAAGAGGTGGCCAACTATGGGGAACAGATA 2063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1986 CTGAGCATGTTACTGCTACAAATCGCCAAGTAAGAGGTGGCCAGCTATGGGGAACAGATA 2045
Query 2064 TATACACAGACGATTCCGATCTTGTTGCTGTTCTCATGCATACAGGTTACTGTCGTCCCA 2123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046 TATACACAGACGATTCCGATCTTGTTGCTGTTCTCATGCATACAGGTTACTGTCGTCCCA 2105
Query 2124 CAGCTTCTCCTCCTCCACCGACAATGCAAGAGCTGCGCACTACTATTAGAGTCTTGCCGT 2183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106 CAGCTTCTCCTCCTCCACCGACAATGCAAGAGCTGCGCACTACTATTAGAGTCTTGCCGT 2165
Query 2184 CACAAGATTACTACACCTCCAAGCTAAGGAACAATGTCCGTTCTCGAGCATGGGGAGCTG 2243
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2166 CACAAGATTACTACACCTCCAAGCTAAGGAATAATGTCCGTTCTCGAGCATGGGGAGCTG 2225
Query 2244 GAATCGGATGCAGTTATAGAGTTGAGCGGTGCTATATACTGAAGAAAGGAGGTGGGACTA 2303
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2226 GAATCGGATGCAGTTACAGAGTTGAGCGGTGCTATATACTGAAGAAAGGAGGTGGGACTA 2285
Query 2304 TTGAACTGGAACCTTCCCTTACACACTCCTCAACTGTGGAGCCAACTCTTGCACCAATGG 2363
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2286 TTGAACTGGAACCTTCTCTTACACACTCCTCAACTGTGGAGCCAACACTTGCACCAATGG 2345
Query 2364 CTGTTGAAAGATCTATGACCACCAGAGCTGCAGCTTCGAATGCTCTGCGGCAACAAAGGT 2423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2346 CTGTTGAAAGATCTATGACCACCAGAGCTGCAGCTTCGAATGCTCTGCGGCAACAAAGGT 2405
Query 2424 TTGTACGAGAAGTCACAATACAATACAATCTCTGCAATGAACCTTGGATTAAATATAGCA 2483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2406 TTGTACGAGAAGTCACAATACAATACAATCTCTGCAATGAACCTTGGATCAAATATAGCA 2465
Query 2484 TAAGCATTGTTGCTGATAAAGGTCTCAAGAAGCCTCTTTTCACCTCTGCCCGCTTGAAGA 2543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2466 TAAGCATTGTTGCTGATAAAGGTCTCAAGAAGCCTCTTTTCACCTCTGCCCGCTTGAAGA 2525
Query 2544 AAGGGGAAGTTTTGTACTTAGAAACTCATTCATGCAGGTATGAGCTCTGTTTCGCAGGAG 2603
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2526 AAGGAGAAGTTTTGTACTTAGAAACTCATTCATGCAGGTATGAGCTCTGTTTCGCTGGAG 2585
Query 2604 AGAAGACCATCAAAGCAATCCAAGCCTCACAACAACAATCATCACATGAAGCTATGGAGA 2663
|||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2586 AGAAAACCATCAAAGCAATCCAAGCGTCTCAACAACAATCATCACATGAAGCTATGGAGA 2645
Query 2664 CAGATAATAATAATAACAAGTCACAGAACCATCTGACAAACGGTGACAAAACAGATTCAG 2723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2646 CAGATAATAATAATAACAAGTCACAGAACCATCTGACAAACGGTGACAAAACAGATTCAG 2705
Query 2724 ACAACAGTTTAATTGATGTTTTCCGCTGGTCACGATGTAAGAAACCTCTCCCACAGAAGC 2783
||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2706 ACAACAGTTTAATCGATGTTTTCCGTTGGTCACGCTGTAAGAAACCTCTCCCGCAGAAGC 2765
Query 2784 TTATGCGGTCTATCGGGTTTCCACTCCCAGCAGATCATATCGAGGTGTTGGAGGAGAATC 2843
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2766 TTATGCGGTCTATCGGGATTCCACTCCCAGCAGATCATATCGAGGTGTTGGAGGAGAATC 2825
Query 2844 TTGATTGGGAAGATGTACAGTGGTCACAAACTGGTGTTTGGATTGCTGGAAAAGAGTACA 2903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2826 TTGATTGGGAAGATGTACAGTGGTCACAAACTGGTGTTTGGATTGCTGGAAAAGAGTACA 2885
Query 2904 CTCTTGCTCGTGTTCATTTTCTCTCCCCCAACTaaaaaaaaCCTTTCATGCTTTGCTTCT 2963
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 2886 CACTTGCTCGTGTTCATTTTCTCTCGCCCAACTAAAAAAAACCTTTCATGCATTGCTTTT 2945
Query 2964 ATCTTACAAAACTTTTTATATTTTATTTATGGATTAGAGACTACAGTTACTTTGGCCTAT 3023
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |
Sbjct 2946 TTCTTACAAAACTTTTTATATTTTATTTATG-ATTAGAGACTACAGTTACTTTGTCTTGT 3004
Query 3024 CTTGTCTTGTGTACTTCTTCCTTGTAACATTTATT 3058
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3005 CTTGTCTTGTGTTCTTCTTCCTTGTAACATTTATT 3039
Score = 159 bits (86), Expect = 8e-38
Identities = 96/100 (96%), Gaps = 3/100 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 51 AGAGAGGCAAAAGTCCGAATCCAGTTTGCCATTTATTACTTCCCGGCGGCAAAA--TCCA 108
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1 AGAGAGGCAAAAGTCCGAATCCAGTTTGGCATTTAT-ACTTCCCGGCGGCAAAAAATCCA 59
Query 109 AAAGGGTTTGCTTCTTCGTGCTCTGCTTCAGTTTCAATTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 AAAGGGTTTGCTTCTTCGTGCTCTGCTTCAGTTTCAATTG 99
> Ahg350108 jgi|Araly1|350108|fgenesh1_pg.C_scaffold_6000701
Length=3267
Score = 2204 bits (1193), Expect = 0.0
Identities = 1375/1461 (94%), Gaps = 20/1461 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 182 ATGAGTGGTGTTCCAAAGAGATCTCACGAAGAGGGTGTTACTCATCCATCTTCTTCTTCA 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGGTGTTCCAAAGAGATCTCACGAAGAGGGTGTTACTCATCCTTCTTCTTCTTCT 60
Query 242 TCAGTAGCAAAATACCCTCACGAGGATTCTGGATCTTACCCTAAATCGCCGCATCAGCCT 301
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCAGCAGCAAAATACCCTCACGAGGATTCTGGATCTTACCCTAAATCGCCGCATCAGCCT 120
Query 302 GTGACGCCACCACCGGCTCAGGTTCATCATAACCAT---CAACAGCCCCATCAGCATCCC 358
|| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 121 GTTACGCCACCACCGGCTCAGGTTCATCATCACCATCAACAACAACCCCATCAGCATCCC 180
Query 359 CAATCTCAATCTCAATCTCAGCCTCAACCTCACCTCCAGGCGCTTCCTCA-CCCTCATTC 417
||| | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||
Sbjct 181 CAA---C---CTCAA--T----CTCAACCTCACCTCCACACGCTTCCTCATCCC-CATTC 227
Query 418 TCATTCTCACTCCCATTCACCACTTGCTGCTGCTGCTTCTGCTTCTGCTCCTTATGAGGT 477
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 228 TCATTCTCACTCTCATTCACCACTTGCTGCTGCTG---CTGCTGCTGCTCCTTATGAGGT 284
Query 478 TGAATCTAGAACGGTGGTTAAGGTTGCGAGAAGCGAGCCTAGAGATGGAGAGAGACGCTC 537
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 TGAACCTAGAACGGTGGTTAAGGTTGCGAGAAGTGAGCCTAGAGATGGAGAGAGACGCTC 344
Query 538 TCCTCTGCCTCTTGTCTATCGGTCTCCGTCGCTGCCCACAACTGTTTCTTCTAGTGATCC 597
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 345 TCCTCTCCCTCTTGTCTATCGGTCTCCGTCCCTGCCCACTACTGTTTCTTCTAGTGATCC 404
Query 598 TCATTTGACTCACGCCCCTGTGCCGATGGAGCCGAGAGATGGTGCTAAGGATGGCAGGGA 657
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 405 TCATTTGACTCACGCCCCTGTGCCCATGGAACCGAGAGATGGTACTAAGGATGGTAGGGA 464
Query 658 AATTAGGGTTGAGAGTAGAGAAAATAGGAGTGATGGGAGAGAGATATATGGTGAGACAAA 717
|||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 465 AATTAGGGTTGACAACAGAGAAAGTAGGAGTGATGGAAGAGAGATTTATGGTGAGACAAA 524
Query 718 GAGGGAGATTCAGGGTCCTAAGGGAGACAGAGATGTGAAATTTGAGAGATCAGTAGATGA 777
||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 525 GAGAGAGATTCAGGGTCCTAAGAGTGACAGAGATGTGAAGTTTGATAGATCAGTAGACGA 584
Query 778 CTTTAGCGGAAAAGGTAATACCGGAAGCTATACTAGGAATGATGGGAGAGAGATGTATGG 837
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 585 CTTTAGCGGAAAAGGTAATACTGGAAGCTATACTAGGAATGATGGGAGTGAGATGTATGG 644
Query 838 TGAGACTAAGAGGGAGATTCAGGGTCCTAAGAGTGACAGGGATGCCAAGTTTGAGCGTCC 897
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 CGAGACTAAGAGGGAGATTCAGGGTCCTAAGAGTGACAGGGATGCCAAGTTTGAGCGTCC 704
Query 898 AGGGGATGATTTTAGCGGGAAAAGTAATGCCGGTAGCTATACTAGGGATACAAAATTTGA 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 705 AGGGGATGATTTTAGCGGGAAAAGTAATGCCGGTAGCTATACTAGGGATACCAAATTTGA 764
Query 958 TAGGGAGAATCAAAATTATAATGAACAAAAGGGGGAGATTAAGATGGAAAAGGAAGGGCA 1017
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 765 TAGGGAGAATCAGAATTATAATGAACAAAAGGCGGAGATTAAGATGGAAAAGGACGGGCA 824
Query 1018 TGCTCACTTGGCTTGGAAAGAGCAGAAGGATTACCATAGAGGGAAGAGAGTTGCTGAAGG 1077
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 825 TGCTCACTTGGCTTGGAAAGAGCAGAAGGATTACCATAGAGGCAAGAGAGTTGCTGAAGG 884
Query 1078 TTCGACTGCAAATGTGGACCCGTGGGTTGTATCCCGCGGTAATCCGCAAGGCCCAACTGA 1137
||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 TTCCACTGCAAATGTGGATCCGTGGGTTGCATCCCGTGGTAATCCGCAAGGCCCAACTGA 944
Query 1138 GGTTGGGCCTAAAGATCTCTCTGCGCCTGTGGAGGGGTCTCATTTGGAAGGACGTGAAAC 1197
|||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | || || || |||||||||||
Sbjct 945 GGTTGGGCCTAAGGATTTCTCCGCGCCTGTGGAGGGGCCCCAGTTAGAGGGACGTGAAAC 1004
Query 1198 CGTCGGagaaaacaaggttgatgccaaaaacgaagatagatttaaggaaaaagataagaa 1257
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1005 TGTCGGAGAAAACAAGGTTGATGCAAAAAACGAAGATAGATTTAAGGACAAAGATAAGAA 1064
Query 1258 aagaaaagagttaaagCATCGAGAATGGGGGGACCGAGACAAGGATAGAAATGACCGTCG 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 AAGAAAAGAGTTAAAGCATCGAGAATGGGGGGACCGAGATAAGGATAGAAATGACCGTCG 1124
Query 1318 AGTATCTGTGCTTGTTGGTAGTGTCATGAGTGAACCCAAAGAGATTGGAAGAGAAGAAAG 1377
|| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125 AGGATCCGTGCTTATTGGTAGTGTCATGAGTGAACCCAAAGAGATTGGAAGAGAAGAAAG 1184
Query 1378 GGAATCCGATAGGTGGGAACGGGAGAGGATGGAGCagaaagatcgagaaagaaataaaga 1437
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1185 AGAATCCGACAGGTGGGAACGGGAGAGGATGGAGCAGAAAGATCGAGAAAGGAATAAAGA 1244
Query 1438 gaaagataaagatcatatcaaaagagagCCAAGGACTGGTGCTGAGAAAGAGATCTCGCA 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 GAAAGATAAAGATCATATCAAAAGAGAGCCAAGGACTGGTGCTGAGAAAGAGATCTCGCA 1304
Query 1498 GAACGAGAAAGAGCTGGGAGAAGCATCTGCCAAACCCTCAGAGCAGGAATATGTGGCACC 1557
||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 GAATGAGAAAGAGTTGGGAGAAGCATCTGCCAAACCATCAGAGCAGGAATATGTGGCACC 1364
Query 1558 AGAGCAGAAGAAGCAGAACGAACCGGATAATTGTgaaaaagacgaaagagaaacaaagga 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1365 AGAGCAGAAGAAGCAGAACGAACCGGATAATTGGGAAAAAGACGAAAGAGAATCAAAGGA 1424
Query 1618 aaaaaggagagagagggatgg 1638
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1425 AAAAAGGAGAGAGAGGGATGG 1445
Score = 861 bits (466), Expect = 0.0
Identities = 528/555 (95%), Gaps = 16/555 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1847 GGAGTACAA-GGCAAGTCAGAGGTGTCGATTGTTGTTTACAAAGTTGGCGAATGTATGCA 1905
|||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1632 GGAGAACAATAGCAAGTCAGAGGTGTCGATTGTTGTTTACAAAGTTGGCGAATGTATGCA 1691
Query 1906 AGAACTGATTAAGTTGTGGAAAGAATATGATTTGTCTCATCCTGATAAAAGCGGTGATTT 1965
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692 AGAACTGATTAAATTGTGGAAAGAATATGATTTGTCTCATCCTGATAAAAGCGGTGATTT 1751
Query 1966 CGCTAATAATGGCCCCACTCTTGAAGTTAGGATTCCAGCTGAGCATGTTACTGCTACAAA 2025
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1752 TGCAAATAATGGCCCCACTCTTGAAGTTAGGATTCCAGCTGAGCATGTTACTGCTACAAA 1811
Query 2026 TCGCCAAGTAAGAGGTGGCCAACTATGGGGAACAGATATATACACAGACGATTCCGATCT 2085
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812 TCGCCAAGTAAGAGGTGGCCAGCTATGGGGAACAGATATATACACAGACGATTCCGATC- 1870
Query 2086 TGTTGCTGTTCTCATGCATACAGGTTACTGTCGTCCCACAGCTTCTCCTCCTCCACCGAC 2145
| || | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1871 ---T--TG---T--TGC-T---GGTTACTGTCGTCCCACAGCTTCTCCTCCTCCACCTAC 1916
Query 2146 AATGCAAGAGCTGCGCACTACTATTAGAGTCTTGCCGTCACAAGATTACTACACCTCCAA 2205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 AATGCAAGAGCTGCGCACTACTATTAGAGTCTTGCCGTCACAAGATTACTACACCTCCAA 1976
Query 2206 GCTAAGGAACAATGTCCGTTCTCGAGCATGGGGAGCTGGAATCGGATGCAGTTATAGAGT 2265
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1977 GCTAAGGAACAATGTCCGTTCTCGAGCATGGGGAGCTGGAATCGGATGCAGTTACAGAGT 2036
Query 2266 TGAGCGGTGCTATATACTGAAGAAAGGAGGTGGGACTATTGAACTGGAACCTTCCCTTAC 2325
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2037 TGAGCGGTGCTATATACTGAAGAAAGGAGGTGGGACTATTGAACTGGAACCTTCTCTTAC 2096
Query 2326 ACACTCCTCAACTGTGGAGCCAACTCTTGCACCAATGGCTGTTGAAAGATCTATGACCAC 2385
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 ACACTCCTCAACTGTGGAGCCAACACTTGCACCAATGGCTGTTGAAAGATCTATGACCAC 2156
Query 2386 CAGAGCTGCAGCTTC 2400
||| |||||||||||
Sbjct 2157 CAGGGCTGCAGCTTC 2171
Score = 780 bits (422), Expect = 0.0
Identities = 454/470 (97%), Gaps = 0/470 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2469 GGATTAAATATAGCATAAGCATTGTTGCTGATAAAGGTCTCAAGAAGCCTCTTTTCACCT 2528
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2798 GGATCAAATATAGCATAAGCATTGTTGCTGATAAAGGTCTCAAGAAGCCACTTTTCACCT 2857
Query 2529 CTGCCCGCTTGAAGAAAGGGGAAGTTTTGTACTTAGAAACTCATTCATGCAGGTATGAGC 2588
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2858 CTGCCCGCTTGAAGAAAGGAGAAGTTTTGTACTTAGAAACTCATTCATGCAGGTATGAGC 2917
Query 2589 TCTGTTTCGCAGGAGAGAAGACCATCAAAGCAATCCAAGCCTCACAACAACAATCATCAC 2648
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2918 TCTGTTTCGCTGGAGAGAAAACCATCAAAGCAATCCAAGCCTCACAACAACAATCATCGC 2977
Query 2649 ATGAAGCTATGGAGACAGATAATAATAATAACAAGTCACAGAACCATCTGACAAACGGTG 2708
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2978 ATGAAGCTATGGAGACGGATAATAATAATAACAAGTCACAGAACCATCTGACAAACGGTG 3037
Query 2709 ACAAAACAGATTCAGACAACAGTTTAATTGATGTTTTCCGCTGGTCACGATGTAAGAAAC 2768
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 3038 ACAAAACAGATTCAGACAACAGTTTAATCGATGTTTTCCGTTGGTCACGCTGTAAGAAAC 3097
Query 2769 CTCTCCCACAGAAGCTTATGCGGTCTATCGGGTTTCCACTCCCAGCAGATCATATCGAGG 2828
||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3098 CTCTCCCGCAGAAGCTTATGCGGTCTATTGGGGTTCCACTCCCTGCAGATCATATCGAGG 3157
Query 2829 TGTTGGAGGAGAATCTTGATTGGGAAGATGTACAGTGGTCACAAACTGGTGTTTGGATTG 2888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3158 TGTTGGAGGAGAATCTTGATTGGGAAGATGTACAGTGGTCACAAACTGGTGTTTGGATTG 3217
Query 2889 CTGGAAAAGAGTACACTCTTGCTCGTGTTCATTTTCTCTCCCCCAACTaa 2938
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3218 CTGGAAAAGAGTACACACTTGCTCGTGTTCATTTTCTCTCGCCCAACTAA 3267
Score = 479 bits (259), Expect = 6e-134
Identities = 351/390 (90%), Gaps = 27/390 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 2033 GTAAGAGGTGGCCAACTATGGGGAACAGATATATACACAGACGATTCCGATCTTGTTGCT 2092
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 2437 GTAAGAGGTGGCCAGCTATGGGGAACCGATATATACACAGACGATTCCGATC----T--T 2490
Query 2093 GTTCTCATGCATACAGGTTACTGTCGTCCCACAGCTTCTCCTCCTCCACCGACAATGCAA 2152
| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491 G---T--TGC-T---GGTTACTGTCGTCCCACAGCTTCTCCTCCTCCACCGACAATGCAA 2541
Query 2153 GAGCTGCGCACTACTATTAGAGTCTTGCCGTCACAAGATTACTACACCTCCAAGCTAAGG 2212
||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2542 GAGTTGCGCACTACTATTAGAGTCTTACCGTCACAGGATTACTACACCTCCAAGCTAAGG 2601
Query 2213 AACAATGTCCGTTCTCGAGCATGGGGAGCTGGAATCGGATGCAGTTATAGAGTTGAGCGG 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2602 AACAATGTCCGTTCTCGAGCATGGGGAGCTGGAATCGGATGCAGTTACAGAGTTGAGCGG 2661
Query 2273 TGCTATATACTGAAGAAAGGAGGTGGGACTATTGAACTGGAACCTTCCCTTACACACTCC 2332
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 2662 TGCTATATACTGAAGAAAGGAGGTGGAACTATTGAACTGGAGCCTTCTCTTACACACTCC 2721
Query 2333 TCAACTGTGGAGCCAACTCTTGCACCAATGGCTGTTGAAAGATCTATGACCACCAGAGCT 2392
||||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||| ||||||
Sbjct 2722 TCAACTGTGGAGCCAACACTCGCACCAATGGCT----A----T----GACCACTAGAGCT 2769
Query 2393 GCAGCTTCGAATGCTCTGCGGCAACAAAGG 2422
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2770 GCAGCTTCGAATGCTCTGCGGCAACAAAGG 2799
Score = 374 bits (202), Expect = 3e-102
Identities = 225/236 (95%), Gaps = 2/236 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1614 aggaaaaaaggagagagagggatggtgattcagaggcagaaagaGCTGAAAAGCGCAGCA 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2174 AGGAAAAAAGGAGAGAGAGGGATGGTGATTCAGAGGCAGAAAGAGCTGAAAAGCGTAGCA 2233
Query 1674 GAATCAGTGAAAAAGAATCTGAAGATGGGTGTTTAGAGGGTGAAGGAGCTACCGAGAGGG 1733
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2234 GAATCAGTGAAAAAGAATCTGAAGATGGGTGTTTGGAGGGTGAAGGAGCTACAGAGAGGG 2293
Query 1734 AAAAGGATGCCTTCAATTATGGGGTTCAGCAGAGGAAGAGAGCGCTGAGACCGAGAGGCA 1793
|||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 AAAAGGATGCCTTCAACTATGGAGTTCAGCAGCGGAAGAGAGCGCTGAGACCGAGAGGCA 2353
Query 1794 GCCCACAAACCACTAATCGCGA-CAATGTCCGCTCACGGAGTCAGGACAACGAAGG 1848
||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 GCCCACAAACCACGAACCGCGAACA-TGTCCACTCACGGAGTCAGGACAACGAAGG 2408
Score = 222 bits (120), Expect = 1e-56
Identities = 146/158 (92%), Gaps = 3/158 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1708 AGAG-GGTGAAGGAGCTACCGAGAGGGAAAAGGATGCCTTCAATTATGGGGTTCAGCAGA 1766
|||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1434 AGAGAGG-GATGGAGCTACTGAGAGGGAAAAGGATGCCTTCAATTATGGAGTTCAGCAGC 1492
Query 1767 GGAAGAGAGCGCTGAGACCGAGAGGCAGCCCACAAACCACTAATCGCGACAATGTCCGCT 1826
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||
Sbjct 1493 GGAAGAGAGCGCTGAGACCGAGAGGCAGCCCACAAACCACAAACCGCGACCATGTCCTCT 1552
Query 1827 CACGGAGTCAGGACAACGAAGGAGTACAAGGCAAGTCA 1864
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1553 CACGGAGTCAGGACAACGAAGGAGTACAAGGTAA-TCA 1589
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 116594239945
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5