BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G08490.1 Length=2550 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg487687 jgi|Araly1|487687|fgenesh2_kg.6__821__AT5G08490.1 4222 0.0 Ahg892794 jgi|Araly1|892794|Al_scaffold_0006_790 3282 0.0 Ahg887550 jgi|Araly1|887550|Al_scaffold_0487_3 1491 0.0 Ahg940335 jgi|Araly1|940335|scaffold_600879.1 558 6e-158 Ahg952241 jgi|Araly1|952241|scaffold_48700003.1 542 6e-153 > Ahg487687 jgi|Araly1|487687|fgenesh2_kg.6__821__AT5G08490.1 Length=2550 Score = 4222 bits (2286), Expect = 0.0 Identities = 2459/2545 (97%), Gaps = 2/2545 (0%) Strand=Plus/Plus Query 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66 Query 67 GTTTTTCTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGATCTCACATCAGGGAGGGCT 126 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 67 GTTTTTTTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGAGCTCACATCAGGGAGGGCT 126 Query 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCTCTGAGGTTTCGAAGTCAGTT 186 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCACTGAGGTCTCGAAGTCAGTT 186 Query 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246 Query 247 GACAGTCTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGCGGT 306 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 247 GACAGTGTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGTGGT 306 Query 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCGAGCTCT 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCCAGCTCC 366 Query 367 GTTACCTTTGCGATTGTTCTTCCTTTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAG 426 ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 367 GTTACCTTTGCGATTCTTCTTCCTGTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAA 426 Query 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAGCCGGTTTGGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486 |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAACCGGTTTAGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486 Query 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGTTTTATTTTTCCCGATGCTTATACTGCATTTGAT 546 |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGGTATATTATTCCTGATGCTTTTACTGCATTTGAT 546 Query 547 GGTATAGCTGATAAAGATGTTGTCTCTTGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606 | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 547 GATATAGCTGACAAAGATGTTGTCTCATGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606 Query 607 AATATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAGGAACCTACAGAGCCA 666 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 607 AAGATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAAGAACCTACAGAGCCA 666 Query 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCTGTTTGCGCTTCTATGGACAAGAACATTGCA 726 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCAGTTTGCGCTTCCATGGGCAAGAACATTGCA 726 Query 727 TGTCGAAGTGGTAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGGTCTTGGCTGCAAACCCAT 786 | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 727 TATCGAAGTGGGAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGATCTTGGTTGCAAACCCAT 786 Query 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTTAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGGATAGAAGAAGCA 846 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTGAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGAATAGAAGAAGCA 846 Query 847 GCCTCATTGTTTACCAGGATGGGTTCTAAAGATCTAGTTTCATGGAATGTTGTCATAGCT 906 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 847 GCCTCATTGTTTACGAGGATGGGTTCCAAAGATCTGGTTTCATGGAACGTTGTCATAGCC 906 Query 907 GGTTATGCATCAAATTGTGAGTGGTTTAAAGCATTTCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAT 966 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 907 GGTTATGCATCAAATCATGAGTGGCTTAAAGCATTGCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAA 966 Query 967 AAGGGGGATGTTTCTCCTGATTCGGTAACTATTATCAGTATCCTTCCTGTCTGTGCGCAA 1026 |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct 967 AAGGGGGATGTTTCTCTTGATTCAGTAACTATTCTCAGCATCCTTCCTGTCTGTGCGCAG 1026 Query 1027 TTAACTGACTTGGCCTCTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATATTGCGCCATTCTTACCTT 1086 |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1027 TTAACTGACTTGACCTGTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATTTTGCGCCATTCTTACCTT 1086 Query 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGGAATGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACA 1146 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGTAACGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACG 1146 Query 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCACGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCATGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206 Query 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266 Query 1267 TTACTTAATGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTAAAGTTTTGC 1326 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1267 TTATTTAACGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTCAAGTTCTGC 1326 Query 1327 ATAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1327 ACAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386 Query 1387 CTTTTACACGATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1387 CTTTTACACAATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446 Query 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCTGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCAGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506 Query 1507 GTTTCCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1507 GTTACCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566 Query 1567 ATGCTCTTCACTGAGATGTCTACTACTGATCTCACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626 ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1567 ATGCTGTTCAGTGAGATGTCTACTACTGATCTGACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626 Query 1627 TATGCTGAAAGTTGTTGCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1627 TATGCTGAAAGTTGTTTCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686 Query 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATCATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATAATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746 Query 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCGGACTTGGTGATATC 1806 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCAGACTTGGTGATATC 1806 Query 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866 Query 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926 Query 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGCAAGGAAGCACTTATGATCTACTCTCATATGACTGAATCA 1986 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| Sbjct 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGTAAGGAAGCACTTATGATCTTCTCTCATATGATTGACTCA 1986 Query 1987 AACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTATGTTGACTGCATGCTGTCATGCAGGG 2046 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1987 AACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTCTGTTGACTGCATGCTGTCATGC-GGG 2045 Query 2047 -TTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGACAGTTCACGGTATGAAACC 2105 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2046 ATTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGGCAGTTCACGGTATGAAACC 2105 Query 2106 TACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTAATTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGA 2165 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2106 TACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTACTTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGA 2165 Query 2166 TGCATATTCTTTTGTCACACAGATGCCAGTTGAACCTAATGCAAATATATGGGGAACACT 2225 |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2166 TGCATATTCTTTCATCACACAGATGCCAGTTGAACCCAATGCAAATATATGGGGAACACT 2225 Query 2226 GTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCT 2285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2226 GTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCT 2285 Query 2286 CTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGC 2345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2286 TTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTCATATCGAATATGTATGCTGC 2345 Query 2346 AGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAA 2405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2346 AGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAA 2405 Query 2406 AAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGG 2465 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| Sbjct 2406 AAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGAAAAGGGATGTTTTTGTGTCTGG 2465 Query 2466 AGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCTTCA 2525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2466 AGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTCAATGCTTTATATCTTCA 2525 Query 2526 GATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 2550 ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2526 GATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 2550 > Ahg892794 jgi|Araly1|892794|Al_scaffold_0006_790 Length=2499 Score = 3282 bits (1777), Expect = 0.0 Identities = 1925/1999 (96%), Gaps = 0/1999 (0%) Strand=Plus/Plus Query 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66 Query 67 GTTTTTCTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGATCTCACATCAGGGAGGGCT 126 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 67 GTTTTTTTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGAGCTCACATCAGGGAGGGCT 126 Query 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCTCTGAGGTTTCGAAGTCAGTT 186 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCACTGAGGTCTCGAAGTCAGTT 186 Query 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246 Query 247 GACAGTCTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGCGGT 306 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 247 GACAGTGTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGTGGT 306 Query 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCGAGCTCT 366 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCCAGCTCC 366 Query 367 GTTACCTTTGCGATTGTTCTTCCTTTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAG 426 ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 367 GTTACCTTTGCGATTCTTCTTCCTGTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAA 426 Query 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAGCCGGTTTGGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486 |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAACCGGTTTAGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486 Query 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGTTTTATTTTTCCCGATGCTTATACTGCATTTGAT 546 |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGGTATATTATTCCTGATGCTTTTACTGCATTTGAT 546 Query 547 GGTATAGCTGATAAAGATGTTGTCTCTTGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606 | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 547 GATATAGCTGACAAAGATGTTGTCTCATGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606 Query 607 AATATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAGGAACCTACAGAGCCA 666 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 607 AAGATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAAGAACCTACAGAGCCA 666 Query 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCTGTTTGCGCTTCTATGGACAAGAACATTGCA 726 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| Sbjct 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTACCAGTTTGCGCTTCCATGGGTAAGAACATTGCA 726 Query 727 TGTCGAAGTGGTAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGGTCTTGGCTGCAAACCCAT 786 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 727 TATCGAAGTGGTAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGATCTTGGTTGCAAACCCAT 786 Query 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTTAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGGATAGAAGAAGCA 846 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTGAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGAATAGAAGAAGCA 846 Query 847 GCCTCATTGTTTACCAGGATGGGTTCTAAAGATCTAGTTTCATGGAATGTTGTCATAGCT 906 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 847 GCCTCATTGTTTACGAGGATGGGTTCCAAAGATCTGGTTTCATGGAACGTTGTCATAGCC 906 Query 907 GGTTATGCATCAAATTGTGAGTGGTTTAAAGCATTTCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAT 966 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 907 GGTTATGCATCAAATCATGAGTGGCTTAAAGCATTGCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAA 966 Query 967 AAGGGGGATGTTTCTCCTGATTCGGTAACTATTATCAGTATCCTTCCTGTCTGTGCGCAA 1026 |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct 967 AAGGGGGATGTTTCTCTTGATCCAGTAACTATTCTCAGCATCCTTCCTGTCTGTGCGCAG 1026 Query 1027 TTAACTGACTTGGCCTCTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATATTGCGCCATTCTTACCTT 1086 |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1027 TTAACTGACTTGACCTGTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATTTTGCGCCATTCTTACCTT 1086 Query 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGGAATGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACA 1146 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGTAACGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACG 1146 Query 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCACGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCATGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206 Query 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266 Query 1267 TTACTTAATGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTAAAGTTTTGC 1326 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1267 TTATTTAACGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTCAAGTTCTGC 1326 Query 1327 ATAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1327 ACAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386 Query 1387 CTTTTACACGATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446 ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1387 CTTTTACACAATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGTAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446 Query 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCTGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCAGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506 Query 1507 GTTTCCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1507 GTTACCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566 Query 1567 ATGCTCTTCACTGAGATGTCTACTACTGATCTCACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626 ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1567 ATGCTGTTCAGTGAGATGTCTACTACTGATCTCACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626 Query 1627 TATGCTGAAAGTTGTTGCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1627 TATGCTGAAAGTTGTTTCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686 Query 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATCATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATAATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746 Query 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCGGACTTGGTGATATC 1806 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCAGACTTGGTGATATC 1806 Query 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866 Query 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926 Query 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGCAAGGAAGCACTTATGATCTACTCTCATATGACTGAATCA 1986 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| Sbjct 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGTAAGGAAGCACTTATGATCTTCTCTCATATGATTGACTCA 1986 Query 1987 AACATAAAGCCCGATCATG 2005 ||||||||||||||||||| Sbjct 1987 AACATAAAGCCCGATCATG 2005 Score = 848 bits (459), Expect = 0.0 Identities = 483/495 (98%), Gaps = 0/495 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2056 GATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGACAGTTCACGGTATGAAACCTACAATGGAA 2115 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2005 GATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGGCAGTTCACGGTATGAAACCTACAATGGAA 2064 Query 2116 CAATATGCTTGTGCTGTAGATCTAATTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGATGCATATTCT 2175 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2065 CAATATGCTTGTGCTGTAGATCTACTTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGATGCATATTCT 2124 Query 2176 TTTGTCACACAGATGCCAGTTGAACCTAATGCAAATATATGGGGAACACTGTTAAGGGCG 2235 || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2125 TTCATCACACAGATGCCAGTTGAACCCAATGCAAATATATGGGGAACACTGTTAAGGGCG 2184 Query 2236 TGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTCTTGCAAGCT 2295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2185 TGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTTTTGCAAGCT 2244 Query 2296 GAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTAAA 2355 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2245 GAATCTGACGAGACCGGAAACCATGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTAAA 2304 Query 2356 TGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAAAAAGCCAGCG 2415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2305 TGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAAAAAGCCAGCG 2364 Query 2416 GGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGGAGATTGTTCT 2475 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2365 GGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGAAAAGGGATGTTTTTGTGTCTGGAGATTGTTCT 2424 Query 2476 CACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAGAG 2535 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2425 CACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTCAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAGAG 2484 Query 2536 CCTGTGGTGTTTTAA 2550 ||||||||||||||| Sbjct 2485 CCTGTGGTGTTTTAA 2499 > Ahg887550 jgi|Araly1|887550|Al_scaffold_0487_3 Length=867 Score = 1491 bits (807), Expect = 0.0 Identities = 848/868 (98%), Gaps = 2/868 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1684 CGAGGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATCATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTA 1743 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CGAGGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATAATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTA 60 Query 1744 GCCTCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCGGACTTGGTGAT 1803 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 61 GCCTCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCAGACTTGGTGAT 120 Query 1804 ATCCGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCA 1863 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATCCGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCA 180 Query 1864 TATTCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCT 1923 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TATTCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCT 240 Query 1924 GGGTATGCTGTACATGGTAGGGGCAAGGAAGCACTTATGATCTACTCTCATATGACTGAA 1983 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 241 GGGTATGCTGTACATGGTAGGGGTAAGGAAGCACTTATGATCTTCTCTCATATGATTGAC 300 Query 1984 TCAAACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTATGTTGACTGCATGCTGTCATGCA 2043 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TCAAACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTCTGTTGACTGCATGCTGTCATGC- 359 Query 2044 GGG-TTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGACAGTTCACGGTATGAA 2102 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 360 GGGATTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGGCAGTTCACGGTATGAA 419 Query 2103 ACCTACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTAATTGCTCGAGGGGGTCGACTTGA 2162 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 420 ACCTACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTACTTGCTCGAGGGGGTCGACTTGA 479 Query 2163 TGATGCATATTCTTTTGTCACACAGATGCCAGTTGAACCTAATGCAAATATATGGGGAAC 2222 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 480 TGATGCATATTCTTTCATCACACAGATGCCAGTTGAACCCAATGCAAATATATGGGGAAC 539 Query 2223 ACTGTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCA 2282 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 ACTGTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCA 599 Query 2283 TCTCTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGC 2342 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 600 TCTTTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTCATATCGAATATGTATGC 659 Query 2343 TGCAGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAAT 2402 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 TGCAGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAAT 719 Query 2403 GAAAAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTC 2462 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| Sbjct 720 GAAAAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGAAAAGGGATGTTTTTGTGTC 779 Query 2463 TGGAGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCT 2522 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 780 TGGAGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTCAATGCTTTATATCT 839 Query 2523 TCAGATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 2550 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 TCAGATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 867 > Ahg940335 jgi|Araly1|940335|scaffold_600879.1 Length=338 Score = 558 bits (302), Expect = 6e-158 Identities = 312/317 (98%), Gaps = 0/317 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2234 CGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTCTTGCAAG 2293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1 CGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTTTTGCAAG 60 Query 2294 CTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTA 2353 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTCATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTA 120 Query 2354 AATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAAAAAGCCAG 2413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 121 AATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAGGGAAATGAAAAAGCCAG 180 Query 2414 CGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGGAGATTGTT 2473 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CAGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGGAGATTGTT 240 Query 2474 CTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAG 2533 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTGAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAG 300 Query 2534 AGCCTGTGGTGTTTTAA 2550 ||||||||||||||||| Sbjct 301 AGCCTGTGGTGTTTTAA 317 > Ahg952241 jgi|Araly1|952241|scaffold_48700003.1 Length=338 Score = 542 bits (293), Expect = 6e-153 Identities = 309/317 (97%), Gaps = 0/317 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2234 CGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTCTTGCAAG 2293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1 CGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTTTTGCAAG 60 Query 2294 CTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTA 2353 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTCATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTA 120 Query 2354 AATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAAAAAGCCAG 2413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 121 AATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAGGGAAATGAAAAAGCCAG 180 Query 2414 CGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGGAGATTGTT 2473 | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 181 CAGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGAAAAGGGATGTTTTTGTGTCTGGAGATTGTT 240 Query 2474 CTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAG 2533 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTCAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAG 300 Query 2534 AGCCTGTGGTGTTTTAA 2550 ||||||||||||||||| Sbjct 301 AGCCTGTGGTGTTTTAA 317 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 96139778380 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5