BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G08490.1
Length=2550
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg487687 jgi|Araly1|487687|fgenesh2_kg.6__821__AT5G08490.1 4222 0.0
Ahg892794 jgi|Araly1|892794|Al_scaffold_0006_790 3282 0.0
Ahg887550 jgi|Araly1|887550|Al_scaffold_0487_3 1491 0.0
Ahg940335 jgi|Araly1|940335|scaffold_600879.1 558 6e-158
Ahg952241 jgi|Araly1|952241|scaffold_48700003.1 542 6e-153
> Ahg487687 jgi|Araly1|487687|fgenesh2_kg.6__821__AT5G08490.1
Length=2550
Score = 4222 bits (2286), Expect = 0.0
Identities = 2459/2545 (97%), Gaps = 2/2545 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66
Query 67 GTTTTTCTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGATCTCACATCAGGGAGGGCT 126
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 67 GTTTTTTTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGAGCTCACATCAGGGAGGGCT 126
Query 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCTCTGAGGTTTCGAAGTCAGTT 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCACTGAGGTCTCGAAGTCAGTT 186
Query 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246
Query 247 GACAGTCTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGCGGT 306
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 247 GACAGTGTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGTGGT 306
Query 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCGAGCTCT 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCCAGCTCC 366
Query 367 GTTACCTTTGCGATTGTTCTTCCTTTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAG 426
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 GTTACCTTTGCGATTCTTCTTCCTGTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAA 426
Query 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAGCCGGTTTGGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAACCGGTTTAGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486
Query 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGTTTTATTTTTCCCGATGCTTATACTGCATTTGAT 546
|||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGGTATATTATTCCTGATGCTTTTACTGCATTTGAT 546
Query 547 GGTATAGCTGATAAAGATGTTGTCTCTTGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606
| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 547 GATATAGCTGACAAAGATGTTGTCTCATGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606
Query 607 AATATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAGGAACCTACAGAGCCA 666
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 607 AAGATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAAGAACCTACAGAGCCA 666
Query 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCTGTTTGCGCTTCTATGGACAAGAACATTGCA 726
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCAGTTTGCGCTTCCATGGGCAAGAACATTGCA 726
Query 727 TGTCGAAGTGGTAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGGTCTTGGCTGCAAACCCAT 786
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 727 TATCGAAGTGGGAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGATCTTGGTTGCAAACCCAT 786
Query 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTTAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGGATAGAAGAAGCA 846
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTGAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGAATAGAAGAAGCA 846
Query 847 GCCTCATTGTTTACCAGGATGGGTTCTAAAGATCTAGTTTCATGGAATGTTGTCATAGCT 906
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 847 GCCTCATTGTTTACGAGGATGGGTTCCAAAGATCTGGTTTCATGGAACGTTGTCATAGCC 906
Query 907 GGTTATGCATCAAATTGTGAGTGGTTTAAAGCATTTCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAT 966
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 GGTTATGCATCAAATCATGAGTGGCTTAAAGCATTGCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAA 966
Query 967 AAGGGGGATGTTTCTCCTGATTCGGTAACTATTATCAGTATCCTTCCTGTCTGTGCGCAA 1026
|||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 967 AAGGGGGATGTTTCTCTTGATTCAGTAACTATTCTCAGCATCCTTCCTGTCTGTGCGCAG 1026
Query 1027 TTAACTGACTTGGCCTCTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATATTGCGCCATTCTTACCTT 1086
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1027 TTAACTGACTTGACCTGTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATTTTGCGCCATTCTTACCTT 1086
Query 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGGAATGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACA 1146
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGTAACGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACG 1146
Query 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCACGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCATGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206
Query 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266
Query 1267 TTACTTAATGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTAAAGTTTTGC 1326
||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1267 TTATTTAACGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTCAAGTTCTGC 1326
Query 1327 ATAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 ACAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386
Query 1387 CTTTTACACGATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 CTTTTACACAATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446
Query 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCTGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCAGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506
Query 1507 GTTTCCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 GTTACCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566
Query 1567 ATGCTCTTCACTGAGATGTCTACTACTGATCTCACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626
||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1567 ATGCTGTTCAGTGAGATGTCTACTACTGATCTGACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626
Query 1627 TATGCTGAAAGTTGTTGCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 TATGCTGAAAGTTGTTTCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686
Query 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATCATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATAATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746
Query 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCGGACTTGGTGATATC 1806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCAGACTTGGTGATATC 1806
Query 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866
Query 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926
Query 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGCAAGGAAGCACTTATGATCTACTCTCATATGACTGAATCA 1986
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||
Sbjct 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGTAAGGAAGCACTTATGATCTTCTCTCATATGATTGACTCA 1986
Query 1987 AACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTATGTTGACTGCATGCTGTCATGCAGGG 2046
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1987 AACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTCTGTTGACTGCATGCTGTCATGC-GGG 2045
Query 2047 -TTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGACAGTTCACGGTATGAAACC 2105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2046 ATTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGGCAGTTCACGGTATGAAACC 2105
Query 2106 TACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTAATTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGA 2165
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106 TACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTACTTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGA 2165
Query 2166 TGCATATTCTTTTGTCACACAGATGCCAGTTGAACCTAATGCAAATATATGGGGAACACT 2225
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2166 TGCATATTCTTTCATCACACAGATGCCAGTTGAACCCAATGCAAATATATGGGGAACACT 2225
Query 2226 GTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCT 2285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2226 GTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCT 2285
Query 2286 CTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGC 2345
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2286 TTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTCATATCGAATATGTATGCTGC 2345
Query 2346 AGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAA 2405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2346 AGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAA 2405
Query 2406 AAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGG 2465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2406 AAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGAAAAGGGATGTTTTTGTGTCTGG 2465
Query 2466 AGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCTTCA 2525
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2466 AGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTCAATGCTTTATATCTTCA 2525
Query 2526 GATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 2550
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2526 GATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 2550
> Ahg892794 jgi|Araly1|892794|Al_scaffold_0006_790
Length=2499
Score = 3282 bits (1777), Expect = 0.0
Identities = 1925/1999 (96%), Gaps = 0/1999 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 CCTTTACGGCAATTTGTTCAGAATTTCAGACTTTTGTCTGGTTTTGGAACTGATCACAGG 66
Query 67 GTTTTTCTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGATCTCACATCAGGGAGGGCT 126
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 67 GTTTTTTTGGATGTTGTCAAAGCTTGTGCTTCAGTGTCTGAGCTCACATCAGGGAGGGCT 126
Query 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCTCTGAGGTTTCGAAGTCAGTT 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 127 CTGCACGGTTGCGTGTTCAAGCTTGGTCATATAGCCTGCACTGAGGTCTCGAAGTCAGTT 186
Query 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 CTTAACATGTATGCGAAATGCAGGAGAATGGATGATTGCCAGAAGATGTTTAGGCAAATG 246
Query 247 GACAGTCTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGCGGT 306
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 247 GACAGTGTTGATCCTGTTGTTTGGAATATTGTTCTGACTGGACTTTCTGTTTCTTGTGGT 306
Query 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCGAGCTCT 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 307 CGTGAAACGATGAGGTTTTTCAAAGCAATGCACTTTGCAGATGAACCTAAGCCCAGCTCC 366
Query 367 GTTACCTTTGCGATTGTTCTTCCTTTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAG 426
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 GTTACCTTTGCGATTCTTCTTCCTGTGTGTGTTCGCCTTGGGGATTCATACAATGGGAAA 426
Query 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAGCCGGTTTGGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 427 AGTATGCATTCTTATATTATTAAAACCGGTTTAGAGAAAGATACACTTGTGGGGAATGCT 486
Query 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGTTTTATTTTTCCCGATGCTTATACTGCATTTGAT 546
|||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 487 TTGGTTTCCATGTATGCCAAATTTGGGTATATTATTCCTGATGCTTTTACTGCATTTGAT 546
Query 547 GGTATAGCTGATAAAGATGTTGTCTCTTGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606
| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 547 GATATAGCTGACAAAGATGTTGTCTCATGGAATGCGATTATTGCTGGGTTTTCTGAGAAT 606
Query 607 AATATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAGGAACCTACAGAGCCA 666
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 607 AAGATGATGGCTGATGCATTTAGATCGTTTTGTCTAATGCTGAAAGAACCTACAGAGCCA 666
Query 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTGCCTGTTTGCGCTTCTATGGACAAGAACATTGCA 726
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 667 AATTATGCAACAATTGCAAATGTTTTACCAGTTTGCGCTTCCATGGGTAAGAACATTGCA 726
Query 727 TGTCGAAGTGGTAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGGTCTTGGCTGCAAACCCAT 786
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 727 TATCGAAGTGGTAGACAGATTCACAGTTATGTTGTGCAGAGATCTTGGTTGCAAACCCAT 786
Query 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTTAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGGATAGAAGAAGCA 846
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 787 GTTTTTGTATGTAATTCACTTGTGAGTTTCTATTTGAGAGTCGGAAGAATAGAAGAAGCA 846
Query 847 GCCTCATTGTTTACCAGGATGGGTTCTAAAGATCTAGTTTCATGGAATGTTGTCATAGCT 906
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 847 GCCTCATTGTTTACGAGGATGGGTTCCAAAGATCTGGTTTCATGGAACGTTGTCATAGCC 906
Query 907 GGTTATGCATCAAATTGTGAGTGGTTTAAAGCATTTCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAT 966
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 GGTTATGCATCAAATCATGAGTGGCTTAAAGCATTGCAGTTATTTCACAACTTGGTGCAA 966
Query 967 AAGGGGGATGTTTCTCCTGATTCGGTAACTATTATCAGTATCCTTCCTGTCTGTGCGCAA 1026
|||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 967 AAGGGGGATGTTTCTCTTGATCCAGTAACTATTCTCAGCATCCTTCCTGTCTGTGCGCAG 1026
Query 1027 TTAACTGACTTGGCCTCTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATATTGCGCCATTCTTACCTT 1086
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1027 TTAACTGACTTGACCTGTGGGAAAGAGATCCACAGTTATATTTTGCGCCATTCTTACCTT 1086
Query 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGGAATGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACA 1146
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087 TTGGAGGATACATCAGTTGGTAACGCTCTCATTAGTTTCTATGCAAGATTTGGTGACACG 1146
Query 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCACGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147 AGTGCAGCATATTGGGCCTTTTCACTGATGTCCATGAAGGATATAATATCTTGGAATGCT 1206
Query 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207 ATACTTGATGCCTTTGCAGACAGTCCAAAGCAGTTTCAATTTTTGAATCTCTTGCACCAC 1266
Query 1267 TTACTTAATGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTAAAGTTTTGC 1326
||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1267 TTATTTAACGAAGCAATCACTCTTGACTCTGTTACTATTTTAAGCCTACTCAAGTTCTGC 1326
Query 1327 ATAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 ACAAATGTACAGGGAATTGGTAAAGTAAAAGAAGTTCATGGGTACTCAGTTAAGGCTGGT 1386
Query 1387 CTTTTACACGATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGCAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 CTTTTACACAATGAAGAGGAACCCAAGCTTGGTAATGCATTGCTTGATGCATATGCCAAA 1446
Query 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCTGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 TGTGGTAATGTTGAATACGCTCATAAGATTTTTCAGGGTTTATCAGAGAGGAGAACTTTG 1506
Query 1507 GTTTCCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 GTTACCTATAACTCATTGTTATCAGGATATGTTAATAGTGGAAGTCATGATGATGCTCAG 1566
Query 1567 ATGCTCTTCACTGAGATGTCTACTACTGATCTCACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1567 ATGCTGTTCAGTGAGATGTCTACTACTGATCTCACCACTTGGAGTTTGATGGTTCGTATC 1626
Query 1627 TATGCTGAAAGTTGTTGCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 TATGCTGAAAGTTGTTTCCCTAATGAAGCCATTGGTGTTTTCCGTGAGATTCAAGCTCGA 1686
Query 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATCATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 GGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATAATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTAGCC 1746
Query 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCGGACTTGGTGATATC 1806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1747 TCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCAGACTTGGTGATATC 1806
Query 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1807 CGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCATAT 1866
Query 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867 TCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCTGGG 1926
Query 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGCAAGGAAGCACTTATGATCTACTCTCATATGACTGAATCA 1986
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||
Sbjct 1927 TATGCTGTACATGGTAGGGGTAAGGAAGCACTTATGATCTTCTCTCATATGATTGACTCA 1986
Query 1987 AACATAAAGCCCGATCATG 2005
|||||||||||||||||||
Sbjct 1987 AACATAAAGCCCGATCATG 2005
Score = 848 bits (459), Expect = 0.0
Identities = 483/495 (98%), Gaps = 0/495 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2056 GATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGACAGTTCACGGTATGAAACCTACAATGGAA 2115
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 GATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGGCAGTTCACGGTATGAAACCTACAATGGAA 2064
Query 2116 CAATATGCTTGTGCTGTAGATCTAATTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGATGCATATTCT 2175
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 CAATATGCTTGTGCTGTAGATCTACTTGCTCGAGGGGGTCGACTTGATGATGCATATTCT 2124
Query 2176 TTTGTCACACAGATGCCAGTTGAACCTAATGCAAATATATGGGGAACACTGTTAAGGGCG 2235
|| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125 TTCATCACACAGATGCCAGTTGAACCCAATGCAAATATATGGGGAACACTGTTAAGGGCG 2184
Query 2236 TGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTCTTGCAAGCT 2295
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2185 TGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTTTTGCAAGCT 2244
Query 2296 GAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTAAA 2355
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2245 GAATCTGACGAGACCGGAAACCATGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTAAA 2304
Query 2356 TGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAAAAAGCCAGCG 2415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2305 TGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAAAAAGCCAGCG 2364
Query 2416 GGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGGAGATTGTTCT 2475
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 GGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGAAAAGGGATGTTTTTGTGTCTGGAGATTGTTCT 2424
Query 2476 CACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAGAG 2535
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2425 CACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTCAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAGAG 2484
Query 2536 CCTGTGGTGTTTTAA 2550
|||||||||||||||
Sbjct 2485 CCTGTGGTGTTTTAA 2499
> Ahg887550 jgi|Araly1|887550|Al_scaffold_0487_3
Length=867
Score = 1491 bits (807), Expect = 0.0
Identities = 848/868 (98%), Gaps = 2/868 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1684 CGAGGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATCATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTA 1743
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGAGGAATGAGGCCTAACACTGTGACTATAATGAATCTCCTTCCTGTTTGTGCGCAGCTA 60
Query 1744 GCCTCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCGGACTTGGTGAT 1803
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 61 GCCTCTCTGCATCTAGTAAGACAATGTCATGGATATATTATTAGAGGCAGACTTGGTGAT 120
Query 1804 ATCCGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCA 1863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATCCGCCTGAAGGGGACTCTACTAGATGTATATGCTAAATGTGGCAGCTTGAAGCATGCA 180
Query 1864 TATTCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCT 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TATTCTGTCTTCCAGTCAGATGCTCGTAGAGATCTGGTTATGTTCACTGCTATGGTAGCT 240
Query 1924 GGGTATGCTGTACATGGTAGGGGCAAGGAAGCACTTATGATCTACTCTCATATGACTGAA 1983
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 241 GGGTATGCTGTACATGGTAGGGGTAAGGAAGCACTTATGATCTTCTCTCATATGATTGAC 300
Query 1984 TCAAACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTATGTTGACTGCATGCTGTCATGCA 2043
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TCAAACATAAAGCCCGATCATGTTTTCATAACTACTCTGTTGACTGCATGCTGTCATGC- 359
Query 2044 GGG-TTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGACAGTTCACGGTATGAA 2102
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 360 GGGATTAATACAGGATGGATTGCAAATATATGACTCAATAAGGGCAGTTCACGGTATGAA 419
Query 2103 ACCTACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTAATTGCTCGAGGGGGTCGACTTGA 2162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 ACCTACAATGGAACAATATGCTTGTGCTGTAGATCTACTTGCTCGAGGGGGTCGACTTGA 479
Query 2163 TGATGCATATTCTTTTGTCACACAGATGCCAGTTGAACCTAATGCAAATATATGGGGAAC 2222
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TGATGCATATTCTTTCATCACACAGATGCCAGTTGAACCCAATGCAAATATATGGGGAAC 539
Query 2223 ACTGTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCA 2282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 ACTGTTAAGGGCGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCA 599
Query 2283 TCTCTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGC 2342
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 600 TCTTTTGCAAGCTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTCATATCGAATATGTATGC 659
Query 2343 TGCAGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAAT 2402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGCAGATGCTAAATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAAT 719
Query 2403 GAAAAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTC 2462
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||
Sbjct 720 GAAAAAGCCAGCGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGAAAAGGGATGTTTTTGTGTC 779
Query 2463 TGGAGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCT 2522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 780 TGGAGATTGTTCTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTCAATGCTTTATATCT 839
Query 2523 TCAGATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 2550
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TCAGATGAAAGAGCCTGTGGTGTTTTAA 867
> Ahg940335 jgi|Araly1|940335|scaffold_600879.1
Length=338
Score = 558 bits (302), Expect = 6e-158
Identities = 312/317 (98%), Gaps = 0/317 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2234 CGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTCTTGCAAG 2293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 CGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTTTTGCAAG 60
Query 2294 CTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTA 2353
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTCATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTA 120
Query 2354 AATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAAAAAGCCAG 2413
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 121 AATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAGGGAAATGAAAAAGCCAG 180
Query 2414 CGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGGAGATTGTT 2473
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CAGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGGAGATTGTT 240
Query 2474 CTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAG 2533
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTGAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAG 300
Query 2534 AGCCTGTGGTGTTTTAA 2550
|||||||||||||||||
Sbjct 301 AGCCTGTGGTGTTTTAA 317
> Ahg952241 jgi|Araly1|952241|scaffold_48700003.1
Length=338
Score = 542 bits (293), Expect = 6e-153
Identities = 309/317 (97%), Gaps = 0/317 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2234 CGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTCTTGCAAG 2293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 CGTGTACAACCTATAATAGGATGGATCTGGGGCACTCAGTTGCAAATCATCTTTTGCAAG 60
Query 2294 CTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTAATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTA 2353
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTGAATCTGACGACACCGGAAACCACGTTCTCATATCGAATATGTATGCTGCAGATGCTA 120
Query 2354 AATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAAGGAAATGAAAAAGCCAG 2413
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 121 AATGGGAAGGCGTGATGGAGTTGAGAAACCTAATGAAGAAAAGGGAAATGAAAAAGCCAG 180
Query 2414 CGGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGCAAAGGAATGTCTTTGTGTCTGGAGATTGTT 2473
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 181 CAGGATGTAGCTGGCTAGAAGTGGATGGGAAAAGGGATGTTTTTGTGTCTGGAGATTGTT 240
Query 2474 CTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTAAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAG 2533
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTCACCCTCGTAGAGACAGTATTTTTGACTTAGTCAATGCTTTATATCTTCAGATGAAAG 300
Query 2534 AGCCTGTGGTGTTTTAA 2550
|||||||||||||||||
Sbjct 301 AGCCTGTGGTGTTTTAA 317
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 96139778380
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5