BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G12350.1
Length=3931
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg940724 jgi|Araly1|940724|scaffold_601268.1 5572 0.0
Ahg488831 jgi|Araly1|488831|fgenesh2_kg.6__1965__AT5G19420.1 3369 0.0
Ahg488082 jgi|Araly1|488082|fgenesh2_kg.6__1216__AT5G12360.1 167 6e-40
> Ahg940724 jgi|Araly1|940724|scaffold_601268.1
Length=3271
Score = 5572 bits (3017), Expect = 0.0
Identities = 3190/3275 (97%), Gaps = 6/3275 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 424 CTTCGTTGAGAtttttttttGTGTATGTCGAGAAACGGAAGGATGGCTTCGGATCTTAGT 483
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTTCGTTGAGA----TTTTTGTGTATGTCGAGAAACGGAAGGATGGCTTCGGATCTTAGT 56
Query 484 AGAGCTGGTCCTGTGGAGAGAGATATCGAGCAGGCTATCATTGCCCTGAAAAAGGGAGCT 543
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 57 AGAGCTGGTCCTGTGGAGAGAGATATCGAGCAGGCTATCATTGCCCTGAAAAAGGGTGCT 116
Query 544 TACTTGCTAAAGTATGGAAGAAGAGGGAAACCTAAGTTCTGCCCATTTCGCCTTTCTAAT 603
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 117 TACTTGCTAAAGTATGGGAGAAGAGGGAAACCTAAGTTCTGCCCATTTCGCCTTTCTAAT 176
Query 604 GATGAAACTGTTTTGATATGGTTCTCTGGAAACGAGGAGAAACATCTGAAGCTGAGCCAT 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 GATGAAACTGTTTTGATATGGTTCTCTGGAAACGAGGAGAAACATCTGAAGCTGAGCCAT 236
Query 664 GTTTCTAGGATCATATCTGGACAACGCACTCCTATTTTTCAGAGGTATCCTCGTCCCGAG 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 GTTTCTAGGATCATATCTGGACAACGCACTCCTATTTTTCAGAGGTATCCTCGTCCCGAG 296
Query 724 AAGGAATATCAGTCGTTTTCACTAATATATAGTGAGAGGTCTTTGGATGTGATATGTAAG 783
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 297 AAGGAATATCAGTCGTTTTCACTAATATATAGTGAGAGGTCTTTGGATTTGATATGCAAG 356
Query 784 GATAAAGATGAGGCTGAGGTGTGGTTTACTGGTCTTAAGGCCTTGATTTCGCATTGCCAT 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 GATAAAGATGAGGCTGAGGTGTGGTTTACTGGTCTTAAGGCCTTGATTTCGCATTGCCAT 416
Query 844 CAAAGAAACAGGAGAACTGAATCAAGAAGTGACGGTACACCATCTGAAGCTAATAGCCCA 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 CAAAGAAACAGGAGAACTGAATCAAGAAGTGACGGTACACCATCTGAAGCTAATAGCCCA 476
Query 904 AGAACATATACCCGGAGAAGCTCTCCTTTACATTCTCCATTTAGTAGCAATGACAGTTTG 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 AGAACATATACCCGGAGAAGCTCTCCTTTACATTCTCCATTTAGTAGCAATGACAGTTTG 536
Query 964 CAGAAGGATGGTTCTAATCACCTTCGTATTCATAGTCCATTTGAGAGCCCGCCTAAGAAT 1023
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 537 CAGAAGGATGGTTCTAATCACCTTCGTATTCATAGTCCATTTGAGAGCCCACCTAAGAAT 596
Query 1024 GGCCTCGACAAGGCATTTTCGGACATGGCTTTATATGCAGTTCCTCCAAAAGGATTTTAC 1083
|| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 GGGCTTGACAAGGCATTTTCGGACATGGCATTATATGCAGTTCCTCCAAAAGGATTTTAC 656
Query 1084 CCCTCAGATTCTGCAACTATTTCTGTTCATTCTGGAGGCTCGGATAGCATGCATGGACAT 1143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 CCCTCAGATTCTGCAACTATTTCTGTTCATTCTGGAGGCTCGGATAGCATGCATGGACAT 716
Query 1144 ATGAGGGGTATGGGCATGGATGCCTTTAGAGTTAGTATGTCAAGTGCTGTTAGTTCCTCG 1203
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 ATGAGGGGTATGGGGATGGATGCTTTTAGAGTTAGTATGTCAAGTGCTGTTAGTTCCTCG 776
Query 1204 AGCCATGGTTCTGGTCATGATGATGGAGATGCATTAGGAGATGTTTTCATCTGGGGAGAA 1263
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 AGCCACGGTTCTGGTCATGATGATGGAGATGCGTTAGGAGATGTTTTCATCTGGGGAGAA 836
Query 1264 GGCATAGGAGAAGGTGTTTTGGGTGGTGGAAACCGTAGAGTTGGTAGTTCATTTGATATA 1323
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 837 GGCATAGGAGAAGGTGTTTTGGGTGGTGGAAACCGTAGAGTTGGAAGTTCGTTTGACATG 896
Query 1324 AAAATGGATTCCTTATTGCCAAAAGCTTTAGAATCTACAATAGTACTGGACGTCCAAAAT 1383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 AAAATGGATTCCTTATTGCCAAAAGCTTTAGAATCTGCAATAGTACTGGACGTCCAAAAT 956
Query 1384 ATTGCTTGTGGTGGACAGCACGCTGTCCTCGTGACAAAACAAGGGGAAAGTTTTTCTTGG 1443
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 957 ATTGCTTGTGGTGGACAACACGCTGTCCTTGTGACAAAACAAGGAGAAAGTTTTTCTTGG 1016
Query 1444 GGAGAGGAATCTGAAGGCAGGCTTGGCCACGGTGTTGATTCCAATATTCAACAACCAAAG 1503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 GGAGAGGAATCTGAAGGCAGGCTTGGCCACGGTGTTGATTCCAATATTCAACAACCAAAG 1076
Query 1504 CTCATCGATGCACTCAACACCACAAATATTGAGCTTGTAGCATGTGGTGAATTTCATAGT 1563
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CTCATTGATGCACTCAACACCACAAATATTGAGCTTGTAGCATGTGGTGAATTTCATAGT 1136
Query 1564 TGTGCAGTTACCCTATCAGGGGATTTGTATACCTGGGGTAAAGGAGATTTTGGTGTTCTT 1623
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 TGTGCGGTTACCCTATCAGGGGATTTGTATACCTGGGGTAAAGGAGATTTTGGTGTTCTT 1196
Query 1624 GGACATGGAAATGAAGTAAGTCACTGGGTCCCTAAGAGGGTTAATTTTCTGCTGGAAGGG 1683
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 GGACATGGAAATGAAGTCAGTCACTGGGTCCCTAAGAGGGTTAATTTTCTGCTGGAAGGG 1256
Query 1684 ATACATGTATCATCTATTGCTTGTGGACCTTACCACACAGCAGTCGTTACCTCTGCTGGG 1743
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1257 ATACATGTATCATCCATTGCTTGTGGACCTTACCACACAGCAGTCGTTACATCTGCTGGG 1316
Query 1744 CAGTTGTTTACTTTTGGTGATGGGACCTTTGGTGTTTTAGGCCACGGAGACAAGAAAAGT 1803
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 1317 CAGTTGTTTACTTTTGGGGATGGGACCTTTGGTGTTTTGGGCCATGGAGACAAGAAAAGT 1376
Query 1804 GTTTTCATACCTCGGGAGGTAGACTCTTTGAAAGGTCTTCGCACTGTCCGGGCAGCTTGT 1863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 GTTTTCATACCTCGGGAGGTAGACTCTTTGAAAGGTCTTCGCACTGTCCGGGCAGCTTGT 1436
Query 1864 GGTGTATGGCACACAGCAGCAGTTGTGGAAGTAATGGTTGGGAGCTCAAGCTCAAGTAAT 1923
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 GGTGTATGGCACACAGCAGCAGTTGTGGAAGTCATGGTTGGGAGCTCAAGCTCAAGTAAT 1496
Query 1924 TGCTCTTCTGGAAAGCTCTTTACATGGGGTGATGGTGATAAGGGTCGTCTTGGTCATGGT 1983
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497 TGCTCTTCTGGAAAGCTCTTTACATGGGGGGATGGTGATAAGGGTCGTCTTGGTCATGGT 1556
Query 1984 AATAAAGAACCAAAACTTGTGCCTACCTGTGTTGCTGCTCTGGTTGAACCCAATTTTTGC 2043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1557 AATAAAGAACCAAAACTTGTGCCTACCTGTGTTGCTGCTCTTGTTGAACCCAATTTTTGC 1616
Query 2044 CAAGTTGCATGTGGGCACAGTCTAACGGTTGCACTTACAACATCAGGCCATGTCTATACT 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 CAAGTTGCATGTGGGCACAGTCTAACGGTTGCACTTACAACATCAGGCCATGTCTATACT 1676
Query 2104 ATGGGCAGTCCTGTCTATGGTCAGCTTGGAAACTCACATGCAGACGGAAAAACT-CCAAA 2162
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||
Sbjct 1677 ATGGGCAGTCCTGTATATGGTCAGCTTGGAAACTCACATGCAGATGGAAAA-CTTCCAAA 1735
Query 2163 CCGTGTCGAAGGTAAACTTCACAAGAGTTTTGTCGAAGAGATAGCCTGTGGTGCTTATCA 2222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1736 CCGTGTCGAAGGTAAACTTCACAAGAGTTTTGTCGAAGAGATAGCCTGCGGTGCTTATCA 1795
Query 2223 TGTTGCAGTTTTAACTTCGAGGACTGAGGTTTACACTTGGGGAAAGGGATCAAATGGTAG 2282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 TGTTGCAGTTTTAACTTCGAGGACTGAGGTTTACACTTGGGGAAAGGGATCAAATGGTAG 1855
Query 2283 ACTTGGTCATGGAGATGTAGATGATAGAAATTCCCCGACATTGGTTGAGTCACTTAAGGA 2342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1856 ACTTGGTCATGGAGATGTAGATGATAGAAATTCCCCGACATTGGTTGAGTCGCTTAAGGA 1915
Query 2343 TAAACAGGTGAAAAGTATTGCCTGTGGCACTAACTTCACAGCAGCTGTCTGCATTCACAG 2402
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 TAAACAGGTTAAAAGTATTGCCTGTGGCACTAACTTCACAGCAGCTGTCTGCATTCACAG 1975
Query 2403 GTGGGCATCAGGGATGGACCAGTCCATGTGTTCAGGTTGCCGTCAGCCCTTCAGTTTTAA 2462
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 ATGGGCATCAGGGATGGACCAGTCCATGTGTTCAGGTTGCCGTCAGCCCTTCAGTTTTAA 2035
Query 2463 AAGAAAGAGGCACAATTGCTATAATTGCGGACTAGTGTTTTGCCACTCGTGCACTAGTAA 2522
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 2036 AAGAAAGAGACACAATTGCTATAATTGCGGACTAGTGTTTTGCCACTCATGCTCTAGTAA 2095
Query 2523 AAAGTCATTGAAGGCTTGTATGGCACCGAACCCCAACAAACCATATCGAGTGTGTGATAA 2582
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2096 AAAGTCGTTGAAGGCTTGTATGGCACCGAACCCAAACAAACCATATCGAGTGTGTGACAA 2155
Query 2583 GTGTTTTAACAAATTGAAAAAGACCATGGAAACAGATCCATCATCCCATTCTTCTCTGAG 2642
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 2156 GTGTTTTAACAAATTGAAAAAGACGATGGAAACAGATCCATCGTCTCATTCTTCTCTGAG 2215
Query 2643 TAGAAGAGGAAGCATTAACCAGGGATCAGATCCCATTGACAAAGATGACAAGTTCGATTC 2702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 TAGAAGAGGAAGCATTAACCAGGGATCAGATCCCATTGACAAAGATGACAAGTTCGATTC 2275
Query 2703 TAGATCCGATGGACAGTTAGCTAGATTTTCATTAATGGAATCCATGAGACAAGTGGACAG 2762
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 TAGATCCGATGGACAGTTAGCTAGATTTTCATTGATGGAGTCCATGAGACAAGTGGACAG 2335
Query 2763 TCGACATAAGAAGAACAAGAAGTATGAATTCAATAGTAGTCGTGTCTCACCCATACCGAG 2822
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||
Sbjct 2336 TCGATATAAGAAGAACAAGAAATATGAATTCAATAGTAGCCGTGTCTCGCCTATACCTAG 2395
Query 2823 TGGAAGCTCTCAACGGGGTGCACTTAACATAGCCAAGTCTTTCAATCCAGTATTTGGAGC 2882
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 TGGAAGCTCTCAACGGGGTGCGCTTAACATAGCCAAGTCTTTCAATCCAGTATTTGGAGC 2455
Query 2883 ATCAAAGAAGTTCTTCTCAGCTTCTGTTCCTGGTTCTCGAATTGTGTCTCGGGCAACTTC 2942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 ATCAAAGAAGTTCTTCTCAGCTTCTGTTCCTGGTTCTCGAATTGTGTCTCGGGCAACTTC 2515
Query 2943 CCCAATATCGAGGCGTCCTAGTCCACCCCGGTCAACTACACCGACTCCCACTCTTTCAGG 3002
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2516 CCCAATATCGAGACGTCCTAGTCCACCCCGGTCAACTACACCAACTCCCACTCTTTCGGG 2575
Query 3003 ACTAGCCACACCAAAATTTGTAGTGGATGATACTAAGAGAACCAATGATAACCTAAGCCA 3062
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 ACTAGCCACACCAAAATTTGTTGTGGATGATACTAAGAGAACCAATGATAACCTAAGCCA 2635
Query 3063 AGAGGTCGTTAAGCTAAGATCTCAGGTTGAAAGTCTTACAAGGAAGGCCCAGCTTCAAGA 3122
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 AGAGGTTGTTAAGCTAAGATCTCAGGTTGAAAGTCTTACAAGGAAGGCCCAGCTTCAAGA 2695
Query 3123 AGTTGAGCTGGAAAGAACAACCAAGCAGCTAAAAGAGGCGTTGGCAATAACTAATGAAGA 3182
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2696 AGTTGAGCTGGAAAGAACAGCCAAGCAGCTAAAAGAGGCGTTAGCAATCGCTAATGAAGA 2755
Query 3183 AACGACAAGATGCAAGGCAGCAAAAGAAGTGATCAAATCACTTACCGCTCAATTAAAAGA 3242
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2756 AACGACGAGATGCAAGGCAGCAAAAGAAGTGATCAAATCACTTACCGCTCAATTAAAGGA 2815
Query 3243 CATGGCCGAAAGATTACCCGTTGGATCAGCTCGGACTGTGAAGTCTCCTCCTTCTCTTAA 3302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2816 CATGGCCGAAAGATTACCCGTTGGATCAGCTCGGACTGTGAAGTCTCCTCCTTCTCTTAA 2875
Query 3303 CTCATTTGGTTCCAGCCCTGGTCGCATTGACCCTTTTAATATCTTAAACCAAGCAAATAG 3362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2876 TTCATTTGGTTCCAGCCCTGGTCGCATTGACCCTTTTAATATCTTAAACCAACCAAATAG 2935
Query 3363 CCAAGAATCCGAGCCAAATGGCATCACGACCCCAATGTTTTCTAATGGGACCATGACACC 3422
|||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2936 CCAAGAATCCGAGCCAAATGGCATTAATACGCCAATGTTTTCTAATGGGACCATGACACC 2995
Query 3423 TGCATTTGGGAATGGTGAAGCAACGAATGAAGCACGGAACGAGAAGGAATGGGTTGAACA 3482
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2996 TGCATTTGGTAATGGTGAATCAACGAATGAAGCACATAACGAGAAGGAATGGGTTGAACA 3055
Query 3483 AGATGAACCTGGTGTCTATATCACTCTTACAGCCTTAGCCGGAGGTGCTAGAGATCTCAA 3542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 AGATGAACCTGGTGTCTATATCACTCTTACAGCCTTAGCCGGAGGTGCTAGAGATCTCAA 3115
Query 3543 ACGCGTCCGTTTCAGCCGAAAAAGGTTTAGTGAGATACAAGCAGAACAGTGGTGGGCAGA 3602
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 ACGCGTCCGTTTCAGCCGAAAAAGGTTTAGTGAGAAACAAGCAGAACAGTGGTGGGCAGA 3175
Query 3603 TAACAGAGGAAGAGTCTATGAACAATACAATGTTCGCATGGTTGACAAAGCCAGTGAGGA 3662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176 TAACAGAGGAAGAGTCTATGAACAATACAATGTTCGCATGGTTGACAAAGCCAGTGAGGA 3235
Query 3663 CTTGCCTCGCTGAAACTCTTTAACACCAACCAGTT 3697
|||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3236 CTTGCCTCATTGAAACTCTTTAACACCAACCAGTT 3270
> Ahg488831 jgi|Araly1|488831|fgenesh2_kg.6__1965__AT5G19420.1
Length=3774
Score = 3369 bits (1824), Expect = 0.0
Identities = 2589/2960 (87%), Gaps = 45/2960 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 440 ttttGTGTATGTCGAGAAACGGAAGGATGGC-T--TCGGATC-T--TAGTAGAGCTGGTC 493
|||||| ||||||||| |||||| | ||||| | ||||||| | ||||||||| ||||
Sbjct 226 TTTTGTTTATGTCGAGGAACGGACGAATGGCGTCCTCGGATCTTACTAGTAGAGCCGGTC 285
Query 494 CTGTGGA-GAGAGATATCGAGCAGGCTATCATTGCCCTGAA-AAAGGGAGCTTACTTGCT 551
| || || ||| || || ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| |||||
Sbjct 286 CAGT-GACGAGGGACATTGAGCAGGCTATCACTGCCCTTAAGAAA-GGAGCTTATTTGCT 343
Query 552 AAAGTATGGAAGAAGAGGGAAA-CCTAAGTTCTGCCCATTTCGCCTTTCTAATGATGAAA 610
|||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 344 TAAGTATGGCAGAAG-GGGAAAGCCTAAGTTCTGTCCATTTCGCCTTTCAAATGATGAAT 402
Query 611 CTGTTTTGATATGGTTCTCTGGAAACGAGGAGAAACATCTGAAGCTGAGCCATGTTTCTA 670
|||||||||||||||| || || || |||||||||||| ||||||| || ||||| || |
Sbjct 403 CTGTTTTGATATGGTTTTCGGGGAAGGAGGAGAAACATTTGAAGCTAAGTCATGTCTCCA 462
Query 671 GGATCATATCTGGACAACGCACTCCTATTTTTCAGAGGTATCCTCGTCCCGAGAAGGAAT 730
||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 463 GGATCATATCTGGGCAGCGCACTCCTATTTTTCAAAGATATCCACGTCCCGAGAAGGAAT 522
Query 731 ATCAGTCGTTTTCACTAATATATAG-TGAGAGGTCTTTGGATGTGATATGTAAGGATAAA 789
|||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||||
Sbjct 523 ATCAATCGTTCTCACTAATATAT-GACGAGAGGTCACTGGATGTGATATGCAAAGATAAA 581
Query 790 GATGAGGCTGAGGTGTGGTTTA-CTGGTCTT-AAGGCCTTGATTTCGCATTGCCATCAA- 846
||||||||||| |||||||||| | ||| || || |||||||| || | ||| ||||||
Sbjct 582 GATGAGGCTGAAGTGTGGTTTAGC-GGT-TTAAAAGCCTTGATATCTCGTTGTCATCAAC 639
Query 847 AGAAACAGGAGAACTGAATCAAGAAGTGACGGTACACCATCTGAAGCTAATAGCCCAAGA 906
|||| |||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 640 GGAAA-TGGAGGACCGAATCGAGAAGTGATGGAACGCCATCCGAAGCTAATAGTCCGAGA 698
Query 907 ACATATACCCGGAGAAGCTCTCCTTTACATTCTCCATTTAGTAGCAATGACAGTTTGCAG 966
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 699 ACATATACCCGGAGAAGCTCCCCTTTACATTCTCCATTTAGTAGCAATGAAAGTTTCCAG 758
Query 967 AAGGATGGTTCTAATCACCTTCGTATTCATAGTCCATTTGAGAGCCCGCCTAAGAATGGC 1026
||||| || || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 759 AAGGAGGGCTCAAATCACCTTCGTCTTCACAGTCCATATGAGAGCCCGCCTAAGAATGGC 818
Query 1027 CTCGACAAGGCATTTTCGGACATGGCTTTATATGCAGTTCCTCCAAAAGG-ATTTTACCC 1085
| |||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 819 ATTGACAAGGCATTTTCAGACATGTCGTTGTATGCAGTTCCTCCAAAAGGTTTTTTTCCC 878
Query 1086 CTCAGATTCTGCAACTATTTCTG-T---TC---AT--TCTGGAGGCTCGGATAGCA-TGC 1135
| ||||||| ||||| || |||| | || || |||||||||| |||| || | |
Sbjct 879 C-CAGATTCGGCAACCATGTCTGTTCACTCTTTATCATCTGGAGGCTTAGATA-CACTAC 936
Query 1136 ATGGACATATGAGGGGTATGGGCATGGATGCCTTTAGAGTTAGTATGTCAAGTGCTG-TT 1194
|||| || |||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||
Sbjct 937 ATGGTCACATGAAAGGAATGGGTATGGATGCTTTTAGAGTTAGTCTGTCAAGTGC-GATT 995
Query 1195 AGTTCCTCGAGCCATGGTTCTGGTCATGATGATGGAGATGCATTAGGAGATGTTTTCATC 1254
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||
Sbjct 996 AGTTCGTCGAGCCATGGTTCTGGTCACGATGATGGAGACACATTGGGAGACGTTTTCATG 1055
Query 1255 TGGGGAGAAGGCATAGGAGAAGGTGTTTTGGGTGGTGGAAACCGTAGAGTTGGTAGTTCA 1314
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1056 TGGGGAGAAGGAATAGGCGAAGGTGTTTTGGGTGGTGGAAATTACAGAGTTGGAAGTTCG 1115
Query 1315 TTTGATATAAAAATGGATTCCTTATTGCCAAAAGCTTTAGAATCTACAATAGTACTGGAC 1374
|| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||
Sbjct 1116 TTGGAGATCAAAATGGATTCCTTATTGCCAAAAGCTTTAGAGTCTACTATAGTACTTGAT 1175
Query 1375 GTCCAAAATATTGCTTGTGGTGGACAGCACGCTGTCCTCGTGACAAAACAAGGGGAAAGT 1434
|| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1176 GTACAGAATATTGCTTGTGGTGGACAACATGCTGTCCTTGTGACAAAACAAGGAGAAAGT 1235
Query 1435 TTTTCTTGGGGAGAGGAATCTGAAGGCAGGCTTGGCCACGGTGTTGATTCCAATATTCAA 1494
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1236 TTTTCTTGGGGAGAGGAATCTGAAGGTAGGCTTGGCCATGGTGTAGATTCCAATGTTCAA 1295
Query 1495 CAACCAAAGCTCATCGATGCACTCAACACCACAAATATTGAGCTTGTAGCATGTGGTGAA 1554
|| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296 CATCCAAAGCTCATTGATGCCCTCAGTACCACAAATATTGAGCTTGTAGCATGTGGTGAA 1355
Query 1555 TTTCATAGTTGTGCAGTTACCCTATCAGGGGATTTGTATACCTGGGGTAAAGGAGATTTT 1614
| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1356 TACCATAGTTGTGCAGTTACTCTATCGGGGGATTTGTATACCTGGGGTAAAGGAGATTTT 1415
Query 1615 GGTGTTCTTGGACATGGAAATGAAGTAAGTCACTGGGTCCCTAAGAGGGTTAATTTTCTG 1674
||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||
Sbjct 1416 GGTATTCTGGGACATGGAAATGAAGTCAGTCACTGGGTCCCCAAAAGAGTAAATTTTCTG 1475
Query 1675 CTGGAAGGGATACATGTATCATCTATTGCTTGTGGACCTTACCACACAGCAGTCGTTACC 1734
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||
Sbjct 1476 ATGGAAGGGATACATGTATCATCCATCGCTTGTGGACCTTACCACACAGCTGTTGTGACT 1535
Query 1735 TCTGCTGGGCAGTTGTTTACTTTTGGTGATGGGACCTTTGGTGTTTTAGGCCACGGAGAC 1794
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1536 TCTGCTGGCCAGTTGTTTACTTTTGGTGATGGGACCTTTGGTGTTTTGGGCCATGGAGAC 1595
Query 1795 AAGAAAAGTGTTTTCATACCTCGGGAGGTAGACTCTTTGAAAGGTCTTCGCACTGTCCGG 1854
| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1596 AGGAAAAGTGTTTTCATACCTAGAGAGGTAGACTCCTTGAAAGGTCTTCGCACTGTTCGG 1655
Query 1855 GCAGCTTGTGGTGTATGGCACACAGCAGCAGTTGTGGAAGTAATGGTTGGGAGCTCAAGC 1914
||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1656 GCAGCCTGTGGTGTATGGCACACAGCCGCAGTTGTAGAAGTCATGGTTGGGAGCTCGAGC 1715
Query 1915 TCAAGTAATTGCTCTTCTGGAAAGCTCTTTACATGGGGTGATGGTGATAAGGGTCGTCTT 1974
|| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1716 TCTAGTAACTGCTCTTCAGGAAAGCTCTTTACATGGGGTGATGGTGACAAGAGTCGTCTT 1775
Query 1975 GGTCATGGTAATAAAGAACCAAAACTTGTGCCTACCTGTGTTGCTGCTCTGGTTGAACCC 2034
||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 1776 GGTCACGGTGACAAAGAACCAAAACTTGTGCCTACCTGTGTTGCAGCTCTTGTAGAACCC 1835
Query 2035 AATTTTTGCCAAGTTGCATGTGGGCACAGTCTAACGGTTGCACTTACAACATCAGGCCAT 2094
|||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1836 AATTTTTGTCAAGTTGCGTGCGGACATAGCCTAACAGTTGCACTGACAACATCGGGCCAT 1895
Query 2095 GTCTATACTATGGGCAGTCCTGTCTATGGTCAGCTTGGAAACTCACATGCAGACGGAAAA 2154
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 1896 GTCTATACTATGGGTAGTCCTGTTTATGGTCAGCTTGGAAACCCACATGCAGATGGAAAG 1955
Query 2155 ACTCCAAACCGTGTCGAAGGTAAACTTCACAAGAGTTTTGTCGAAGAGATAGCCTGTGGT 2214
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||
Sbjct 1956 GTTCCAACCCGTGTTGAAGGTAAACTTCACAAGAGTTTTGTCGAAGAGATTGCTTGCGGT 2015
Query 2215 GCTTATCATGTTGCAGTTTTAACTTCGAGGACTGAGGTTTACACTTGGGGAAAGGGATCA 2274
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2016 GCTTATCATGTTGCAGTTTTAACTTCAAGGACTGAGGTTTACACTTGGGGAAAAGGATCA 2075
Query 2275 AATGGTAGACTTGGTCATGGAGATGTAGATGATAGAAATTCCCCGACATTGGTTGAGTCA 2334
||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2076 AATGGTAGACTAGGCCATGGGGATGCAGATGATCTAAATTCCCCGACATTGGTTGAGTCG 2135
Query 2335 CTTAAGGATAAACAGGTGAAAAGTATTGCCTGTGGCACTAACTTCACAGCAGCTGTCTGC 2394
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2136 CTGAAGGATAAACAGGTGAAAAGTATTGCCTGTGGTTCTAACTTCACCGCAGCTGTTTGC 2195
Query 2395 ATTCACAGGTGGGCATCAGGGATGGACCAGTCCATGTGTTCAGGTTGCCGTCAGCCCTTC 2454
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2196 CTTCACAAGTGGGCATCAGGGATGGACCAGTCCATGTGTTCAGGTTGCCGTCAGCCTTTC 2255
Query 2455 AGTTTTAAAAGAAAGAGGCACAATTGCTATAATTGCGGACTAGTGTTTTGCCACTCGTGC 2514
| ||| || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 2256 AATTTCAAGAGAAAGCGGCACAATTGTTATAACTGTGGACTTGTGTTTTGCCATTCTTGC 2315
Query 2515 ACTAGTAAAAAGTCATTGAAGGCTTGTATGGCACCGAACCCCAACAAACCATATCGAGTG 2574
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 2316 ACTAATAAAAAGTCCCTGAAGGCTTGTATGGCACCGAACCCGAACAAACCATATAGAGTG 2375
Query 2575 TGTGATAAGTGTTTTAACAAATTGAAAAAGACCATGGAAACAGATCCATCATCCCATTCT 2634
||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2376 TGTGATAGGTGTTTCAATAAATTGAAAAAGGCCATGGAAACGGATCCATCATCTCATTCT 2435
Query 2635 TCTCTGAGTAGAAGAGGAAGCATTAACCAGGGATCAGATCCCATTGACAAAGATGACAAG 2694
||| ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||
Sbjct 2436 TCTTTGAGTCGAAGAGAAAGTGTCAACCAAGGATCAGATGCAATTGACAGAGATGAGAAG 2495
Query 2695 TTCGATTCTAGATCCGATGGACAGTTAGCTAGATTTTCATTAATGGAATCCATGAGACAA 2754
|| ||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||
Sbjct 2496 TTGGATACTAGATCTGACGGACAGCTAGCTAGATTCTCATTGTTGGAGCCCATGAGGCAA 2555
Query 2755 GTGGACAGTCGA-CATAAGAAGAACAAGAAGTATGAATTCAATAGTAGTCGTGTCTCACC 2813
||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2556 GTGGACAGTCGTTCC-AAGAAAAATAAGAAATATGAATTCAATAGTAGTCGTGTCTCACC 2614
Query 2814 CATACCGAGTGGAAGCTCTCAACGGGGTGCACTTAACATAGCCAAGTCTTTCAATCCAGT 2873
||||| |||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| || |||
Sbjct 2615 AATACCAAGTGGAGGCTCTCACCGGGGTTCACTAAACATAACCAAGTCTTTTAACCCAAC 2674
Query 2874 ATTTGGAGCATCAAAGAAGTTCTTCTCAGCTTCTGTTCCTGGTTCTCGAATTGTGTCTCG 2933
|| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2675 CTTCGGATCATCAAAAAAGTTCTTCTCAGCATCAGTTCCTGGTTCCCGAATTGTGTCTCG 2734
Query 2934 GGCAACTTCCCCAATATCGAGGCGTCCTAGTCCACCCCGGTCAACTACACCGACTCCCAC 2993
|||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||
Sbjct 2735 AGCAACTTCACCAATATCAAGACGTCCTAGCCCACCTCGCTCAACAACGCCAACTCCCAC 2794
Query 2994 TCTTTCAGGACTAGCCACACCAAAATTTGTAGTGGATGATACTAAGAGAACCAATGATAA 3053
||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2795 TCTTTCAGGACTAACTACACAAAAAATTGTCGTGGATGATACCAAGAGAACCAATGATAA 2854
Query 3054 CCTAAGCCAAGAGGTCGTTAAGCTAAGATCTCAGGTTGAAAGTCTTACAAGGAAGGCCCA 3113
||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||
Sbjct 2855 CCTAAGCCAGGAGGTGGTTATGCTAAGATCTCAAGTTGAAAATCTTACACGGAAGGCACA 2914
Query 3114 GCTTCAAGAAGTTGAGCTGGAAAGAACAACCAAGCAGCTAAAAGAGGCGTTGGCAATAAC 3173
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |
Sbjct 2915 GCTTCAAGAAGTTGAATTGGAAAGAACAACCAAACAGCTAAAGGAGGCACTAGCAATCGC 2974
Query 3174 TAATGAAGAAAC-GACAAGATGCAAGGCAGCAAAAGAAGTGATCAAATCACTTACCGCTC 3232
|| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2975 TAGCGAAGAATCAG-CAAGATGCAAGGCAGCGAAAGAAGTGATTAAATCACTTACCGCTC 3033
Query 3233 AATTAAAAGACATGGCCGAAAGATTACCCGTTGGATCAGCTCGGACTGTGAAGTCTCCTC 3292
|||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 3034 AATTGAAAGACATGGCTGAAAGACTACCTGTTGGATCAGCTCGGACTATCAAGTCTCCT- 3092
Query 3293 CTTCTCTTAACTCATTTGGTTCCAGCCCTGGTCGCATTGACCCTT-TT--AATATCTTAA 3349
| ||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| ||||| || || | |||||
Sbjct 3093 -T-CTCTTAATTCATTTGGTTCCAGTCCTGATTACGTTGCCCCTTCTTCTAACACCTTAA 3150
Query 3350 ACCAAGCAAATAGCCAAGAA 3369
||| |||| |||| ||||
Sbjct 3151 ACCGTCCAAACAGCCGAGAA 3170
Score = 239 bits (129), Expect = 1e-61
Identities = 185/212 (87%), Gaps = 3/212 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3450 TGAAGCACGGAACGAGAAGGAATGGGTTGAACAAGATGAACCTGGTGTCTATATCACTCT 3509
|||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 3311 TGAACCCCGTAACGAGAAGGAATGGGTTGAACAAGATGAACCTGGTGTGTACATCACTCT 3370
Query 3510 TACAGCCTTAGCCGGAGGTGCTAGAGATCTCAAACGCGTCCGTTTCAGCCGAAAAAGGTT 3569
||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||
Sbjct 3371 CACAGCCTTAGCTGGAGGTGCAAGGGATCTCAAACGTGTCCGTTTCAGTCGGAAGCGGTT 3430
Query 3570 TAGTGAGATACAAGCAGAACAGTGGTGGGCAGATAACAGAGGAAGAGTCTATGAACAATA 3629
||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 3431 TAGCGAGAAACAAGCAGAAGAATGGTGGGCAGAGAACAGAGGAAGAGTTTACGAACAATA 3490
Query 3630 CAATGTTCGCAT-G--GTTGACAAAGCCAGTG 3658
|||||| ||||| | ||||| ||| ||||||
Sbjct 3491 CAATGTACGCATAGTCGTTGATAAATCCAGTG 3522
> Ahg488082 jgi|Araly1|488082|fgenesh2_kg.6__1216__AT5G12360.1
Length=961
Score = 167 bits (90), Expect = 6e-40
Identities = 97/100 (97%), Gaps = 2/100 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 3832 AAAGTTGTAAATTCTTTGTGGTTAAATCATTCTGTAAATCCTATAAAACATACAGTGTTT 3891
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 961 AAAGTTGTAAATTCTTTGTGGTT-AATCATTCTGTAAATCCTAT-AAACATACAGTGTTT 904
Query 3892 TTACCCCCTAGAAACAATGCTGAGTAATTGGATTTCGAGC 3931
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 903 TTACCCCCTAGAAACAATGCTGAGTAATTGGTTTTCGAGC 864
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 148576764992
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5