BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G12950.1
Length=2919
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488069 jgi|Araly1|488069|fgenesh2_kg.6__1203__AT5G12950.1 4200 0.0
Ahg940758 jgi|Araly1|940758|scaffold_601302.1 4161 0.0
Ahg350453 jgi|Araly1|350453|fgenesh1_pg.C_scaffold_6001046 4032 0.0
> Ahg488069 jgi|Araly1|488069|fgenesh2_kg.6__1203__AT5G12950.1
Length=2800
Score = 4200 bits (2274), Expect = 0.0
Identities = 2582/2729 (95%), Gaps = 27/2729 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 120 TTTAGTT--ACACttttttcattcttttttAAGACAAAAGAGATACGATGAAGTCTGGTC 177
||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 86 TTTAGTTACACACTTTTTT--TTTTTTTTTAAGACAAAAAAGATACGATGAAGTCTGGTG 143
Query 178 TCATCATAACCATTGCTCTGTTACTATACACAAGCAGCTTTGTTCTTGTTTCTGTAGCGA 237
||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 144 TCATCATTACCATTGCTCTGTTATTATACAC-A--AGCTTTCTTCTTGTTTGTGTAGCGA 200
Query 238 AAGAGTGTACCA-ACACTCCTACGC-AGCTCTCATCCCATACTTTCCGCAGCGAGCTTCT 295
||||||||| || ||| |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||
Sbjct 201 AAGAGTGTA-CAGACATTCCTAC-CAAGCTCTCATCGCATACTTTGCACAGCGAGCTTCT 258
Query 296 GCAATCAAAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCATTACCATTTAACTCCAGC 355
|||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 259 ACAATCACACAACAAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCATTACCATTTAACTCCAAC 318
Query 356 TGATGACTCTGCTTGGTCTAGTTTATTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGAGGCAGATGA 415
||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 319 TGATGACGCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGAGACGGATGA 378
Query 416 ATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATTCCT-CTGGTAACTTTC 474
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 379 ATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATT-CTGTTGGTAACTTTC 437
Query 475 TTAAAGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGA-CCCAGACTCCTTTCATTGGAGGGCT 533
| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 438 TCAAGGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCCCGACCCCA-ACTCCTTTCATTGGAGGGCT 496
Query 534 CAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTTTGGCCTGGAGCTTC 593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||
Sbjct 497 CAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGACGGTTTAGCCTATAGCTTC 556
Query 594 CGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCACCTGGAGATT-ACTATGGAGGATGGGAGAGACCAGA 652
||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 557 CGTAAAGTTGCTGGTCTTGATGCTTCTGGAG-TTCCCTATGGAGGATGGGAGAAACCAGA 615
Query 653 TAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTTATATGTGGGC 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 616 TAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTCATATGTGGGC 675
Query 713 TAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGAGAAAATGTCAGCTCTTGTCTCAGCTCTATCGGA 772
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 676 AAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGCGAAAATGTCAGCTCTTGTCTCAGCTTTAGCGGA 735
Query 773 ATGCCAACAGAAGTCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCCAGTTTTTTCGACCG 832
||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 ATGTCAGCAGAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCCAGTTTTTTCGACCG 795
Query 833 CTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCACAAGATTTTAGCTGG 892
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 796 GTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCACAAGATTTTGGCCGG 855
Query 893 TCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTAAAGATGGCAACCGGGAT 952
||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 856 CCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCTGGGAATATTCAAGCTTTAAAGATGGCAACAGGGAT 915
Query 953 GGCTGATTA-TTTCTATGGCCGTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTACAGTGTTGAACGAC 1011
||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 916 GGCTGATTACTTT-TATGGTCGTGTTCGTAATGTGATAACGAAGTACAGTGTTGAACGAC 974
Query 1012 ATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGCTATACA 1071
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 ATTATCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGCTATACA 1034
Query 1072 GCATCACTGGAGATTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTTGCTTTC 1131
|||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTTGCTTTC 1094
Query 1132 TCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTAATACACATATTC 1191
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 TCGGGGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTAATACACATATTC 1154
Query 1192 CCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATAAGGAAA 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 CCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATAAGGAAA 1214
Query 1252 TCTCGATGTTCTTTATGGACATTTTTAATGCTTCTCACAGCTATGCAACAGGAGGAACAT 1311
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1215 TCTCGATGTTCTTTATGGACATAATTAATGCTTCTCACAGCTATGCAACTGGAGGAACAT 1274
Query 1312 CAGTCAGTGAGTTCTGGCAAGATCCCAAGAGAATGGCGACTGCACTGCAAACTGAAAACG 1371
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1275 CAGTCAGAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACACTGCAAACTGAAAACG 1334
Query 1372 AGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGATGGACAA 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335 AGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGATGGACAA 1394
Query 1432 AAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCCTTGACCAACGGCGTGTTGGGAATTC 1491
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||
Sbjct 1395 AAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTCGGAATTC 1454
Query 1492 AAAGAGGAACCCAGCCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAGGTAAAGGTGTTTCTA 1551
||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1455 AAAGAGGAACCCAACCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTAGGTCAAGGTGTTTCTA 1514
Query 1552 AGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTGGTGTTGCTATGGCA 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515 AGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTGGTGTTGCTATGGCA 1574
Query 1612 CTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATGGTGCAA 1671
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1575 CTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATGGTGCAT 1634
Query 1672 CTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTGCTGGTC 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635 CTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTGCTGGTC 1694
Query 1732 TTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTGTGACAT 1791
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 TTTTGCTATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTGTGACAT 1754
Query 1792 TCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTTTGAATCTAAGAATTC 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 TCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGAAGTCGACTTTGAATCTAAGAATTC 1814
Query 1852 CTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGCGACCCTTAAACGTAC 1911
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1815 CTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGAAACCCTTAAAAGTAC 1874
Query 1912 CAACTTCAGGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGAAATCTGGTGATCAAGTAACCA 1971
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1875 CAACTTCAGGTAATTTCCTATCGATCAAACAGAACTGGAAATCTGGCGATCAAGTAACCA 1934
Query 1972 TGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATCGGCCAGAGTACGCAT 2031
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1935 TGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATCGTCCGGAGTACGCAT 1994
Query 2032 CTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACACGAGCAGGGACTGGA 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 CTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACACGAGCAGGGACTGGA 2054
Query 2092 GCATCACAACTCAGGCTAAACCTGGAAAATGGATAACCCCTATACCTGAAACTCAAAACA 2151
|||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 2055 GCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAATTGGATAACCCCTATACCTGAAACTTATAACA 2114
Query 2152 GTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACGTATCTTACGTGTTTTCAAATAGCA 2211
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 2115 GTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCAAATACCA 2174
Query 2212 ACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGGACACAAGATGCCGTTGCAGCGA 2271
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2175 ACCAAACCATCACAATGAGGGTATCACCCGAGCTAGGGACACAAGATGCCGTTGCAGCGA 2234
Query 2272 CTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATTTCGGGTCCAGAAGG-ACTAATT 2330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||
Sbjct 2235 CTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATTTCGGGTCTAGA-GGCACTAATT 2293
Query 2331 GGAAGGCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATTGTAAAGCAAGCAACT 2390
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2294 GGAAGCCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATTGTAAAGCAAACAACT 2353
Query 2391 GATAGCTCCCTCACAGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGAGCTTCTAGCTTTCGG 2450
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 GATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGAGCTTCTAGCTTTCGG 2413
Query 2451 TTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCTAGGAAGCGTTTCGTTAAGACTAGAGAGCAAAAAA 2510
|||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2414 TTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTTAAGACTAGAGAGCAACAAT 2473
Query 2511 GGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACCCTAAAGCAAGGGACAAAACTAAGGCTAGAATGT 2570
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||
Sbjct 2474 GGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGGACGAAACTAAAGCTTGAATGT 2533
Query 2571 GGTTCGGATGCGACTGATGAGAAGTTTAAAGAGGCAGCAAGCTTTA-GTTTAAAGACAGG 2629
||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||
Sbjct 2534 GGTCCGGTTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAGCTTTAAGTT-AAACACAGG 2592
Query 2630 AATGCATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACTTTGTGTT 2689
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2593 AATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACTTTGTGTT 2652
Query 2690 ATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGCAAACTTG 2749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2653 ATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGCAAACTTG 2712
Query 2750 AAGAAAGAAACCCTTAT-TGGGTGAAAATATAAGAAAGAAAAGTCTCATTTGAAATATA- 2807
||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 AAGAAAGAAACCCTTTTATGGGAGAAAAAATAAGAAA-AAAAGTCTCATTTGAAATATAA 2771
Query 2808 -GACATGTGTTTAGATGTTTAGCCTCTTA 2835
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2772 AGACATGTGTTTAGATGTTTAGCCTCTTA 2800
Score = 80.5 bits (43), Expect = 6e-14
Identities = 54/59 (92%), Gaps = 2/59 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 CTCTTCTCACATTATCCTCTTCT-TCATATTCAAATCTCCTCTCCCTAACTGTTTTATG 59
|||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCTACTCACATTATTCTCTTCTCCCA-ATTCAAATCTCCTCTCCCTAACTGTTTTATG 58
> Ahg940758 jgi|Araly1|940758|scaffold_601302.1
Length=2637
Score = 4161 bits (2253), Expect = 0.0
Identities = 2497/2615 (95%), Gaps = 15/2615 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 158 AGATACGATGAAGTCTGGTCTCATCATAACCATTGCTCTGTTACTATACACAAGCAGCTT 217
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| | |||||
Sbjct 16 AGATACGATGAAGTCTGGTCTCATTATAACCATTGCTTTATTATTATACAC-A--AGCTT 72
Query 218 TGTTCTTGTTTCTGTAGCGAAAGAGTGTACCAACACTCCTACGCAGCTCTCATCCCATAC 277
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 73 TGTTCTTGTTTGTGTAGCGAAAGAGTGTACGAACACTCCTACGCAGCTCTCATCGCATAC 132
Query 278 TTTCCGCAGCGAGCTTCTGCAATCAAAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCA 337
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 TTTCCGCAACGAGCTTCTTCAATCAAAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCA 192
Query 338 TTACCATTTAACTCCAGCTGATGACTCTGCTTGGTCTAGTTTATTGCCAAGGAAGATGTT 397
|||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 193 TTACCATTTAACACCAACTGATGACGCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTT 252
Query 398 GAAAGAAGAGGCAGATGAATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAA 457
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 253 GAAAGAAGAGGCTGATGAATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGACGTTCAAGGACTCTAA 312
Query 458 TTCCTCTGGTAACTTTCTTAAAGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGACCCAGACTC 517
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||
Sbjct 313 TTCCTCTGGTAACTTTCTTAAAGAAGTCTCTTTGCACCACGTTAGGCTGGATCCAAACTC 372
Query 518 CTTTCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGG 577
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 CATTCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGG 432
Query 578 TTTGGCCTGGAGCTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCACCTGGAGATTACTATGGAGG 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 433 TTTGGCCTGGAGCTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCTCCTGGAGATCACTATGGAGG 492
Query 638 ATGGGAGAGACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAAC 697
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 ATGGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAAC 552
Query 698 AGCTTATATGTGGGCTAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGAGAAAATGTCAGCTCTTGT 757
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 AGCTTATATGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGAGAAAATGTCAGCTCTTGT 612
Query 758 CTCAGCTCTATCGGAATGCCAACAGAAGTCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTC 817
|||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 CTCAGCTCTATCGGAATGTCAGCAGAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTC 672
Query 818 CAGTTTTTTCGACCGCTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCA 877
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 CAGTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCA 732
Query 878 CAAGATTTTAGCTGGTCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTAAA 937
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 733 CAAGATTATAGCTGGTCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTACA 792
Query 938 GATGGCAACCGGGATGGCTGATTATTTCTATGGCCGTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTA 997
||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 GATGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTCTATGGCCTTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTA 852
Query 998 CAGTGTTGAACGACATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCT 1057
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 CAGCGTTGAAAGACATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCT 912
Query 1058 TTATCAGCTATACAGCATCACTGGAGATTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGA 1117
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 CTATCAGCTATACAGCATCACTGGAGACTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGA 972
Query 1118 CAAGCCTTGCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGC 1177
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 973 CAAGCCTTGCTTTCTTGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATAAGTGGATTCCACTC 1032
Query 1178 TAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCT 1237
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 TAACACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCC 1092
Query 1238 ACTCCATAAGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATTTTTAATGCTTCTCACAGCTATGC 1297
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 ACTCCATAAGGAAATCTCGATTTTCTTTATGGACATCGTTAATGCTTCTCACAGCTATGC 1152
Query 1298 AACAGGAGGAACATCAGTCAGTGAGTTCTGGCAAGATCCCAAGAGAATGGCGACTGCACT 1357
||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||
Sbjct 1153 AACTGGAGGAACATCAGTCAGTGAGTTCTGGCAAAATCCAAAGAGAATGGCGACTACGCT 1212
Query 1358 GCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCT 1417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 GCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCT 1272
Query 1418 GTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCCTTGACCAACGG 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1273 GTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGTGCTTTGACCAACGG 1332
Query 1478 CGTGTTGGGAATTCAAAGAGGAACCCAGCCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAGG 1537
||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TGTGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCCAACCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAGG 1392
Query 1538 TAAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTG 1597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 TAAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTG 1452
Query 1598 GTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCA 1657
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1453 GTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCTTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATTTATTTTCA 1512
Query 1658 AGAAGATGGTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTG 1717
|||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1513 AGAAGATGATGTATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTG 1572
Query 1718 GAAATCTGCTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTA 1777
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1573 GAAATCTGCTGGTCTTTCGCTATCTCAGAAAGTTAATCCCGTTGTATCGTGGGATCCGTA 1632
Query 1778 CATGCGTGTGACATTCACTCTT-TCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTT 1836
|||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||
Sbjct 1633 CATGCGTGTGACATTCTCT-TTCTCTTCTTCCAAAGGGGGAATGGCAAAGGAGTCGACTT 1691
Query 1837 TGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGC 1896
|||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1692 TGAATCTAAGAATTCCAGTTTGGACAAACTCTGTAGGTGCCAAAATATCTTTGAATGGGC 1751
Query 1897 GACCCTTAAACGTACC-AACTTCAG-----GTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGA 1950
| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1752 AATCCTTAAAAGTACCAAACTTCAGAACCCGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAACTGGA 1811
Query 1951 AATCTGGTGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAG 2010
||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812 AATCTGGCGATCAAGTAACCATGGAGTTACCATTGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAG 1871
Query 2011 ATGATCGGCCA-GAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCC 2069
|||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1872 ATGATCGG-CAGGAGTACTCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCC 1930
Query 2070 GGACACACGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAACCTGGAAAATGGATAACC 2129
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1931 GGACACACGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAAATGGATAACC 1990
Query 2130 CCTATACCTGAAACTCAAAACAGTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACGTA 2189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1991 CCTATACCTGAAACTCAAAACAGTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATA 2050
Query 2190 TCTTACGTGTTTTCAAATAGCAACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGG 2249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2051 TCTTACGTGTTTTCAAATAGCAACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGG 2110
Query 2250 ACACAAGATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATT 2309
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2111 ACACAAGATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATA 2170
Query 2310 TCGGGTCCAGAAGGACTAATTGGAAGGCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGC 2369
||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2171 TCGGGTCCAGAGGGACTAATTGGAAGCCTGGTCAAGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCCGGC 2230
Query 2370 ATGATTGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACAGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGAC 2429
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2231 ATGATTGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGAC 2290
Query 2430 AAAGGAGCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCTAGGAAGCGTTTCG 2489
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||
Sbjct 2291 AAAGGAGCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCG 2350
Query 2490 TTAAGACTAGAGAGCAAAAAAGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACCCTAAAGCAAGGG 2549
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2351 TTAAGACTAGAGAGCAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGG 2410
Query 2550 ACAAAACTAAGGCTAGAATGTGGTTCGGATGCGACTGATGAGAAGTTTAAAGAGGCAGCA 2609
|| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2411 ACGAAACTAAGGCTTGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCA 2470
Query 2610 AGCTTT-AGTTTAAAGACAGGAATGCATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGG 2668
|||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2471 AGCTTTAAG-TTAAAGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGG 2529
Query 2669 AACACAGAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGT 2728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2530 AACACAGAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGT 2589
Query 2729 GTACTTCAGTGTGCAAACTTGAAGAAAGAAACCCT 2763
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 GTACTTCAGTGTGCAAACTTGAAGAAAGAAACCCT 2624
> Ahg350453 jgi|Araly1|350453|fgenesh1_pg.C_scaffold_6001046
Length=2583
Score = 4032 bits (2183), Expect = 0.0
Identities = 2461/2594 (95%), Gaps = 23/2594 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 165 ATGAAGTCTGGTCTCATCATAACCATTGCTCTGTTACTATACACAAGCAGCTTTGTTCTT 224
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGTCTGGTGTCATCATAACCATTGCTCTGTTATTATTCAC-A--AGCTTTGTTCTT 57
Query 225 GTTTCTGTAGCGAAAGAGTGTACCA-ACACTCCTACGC-AGCTCTCATCCCATACTTTCC 282
|||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||| |||||||| |
Sbjct 58 GTTTGTGTAGCGAAAGAGTGTA-CAGACATTCCTAC-CAAGCTCTCATCGCATACTTTGC 115
Query 283 GCAGCGAGCTTCTGCAATCAAAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCATTACC 342
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 116 GCAGCGAGCTTCTGCAATCACAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTCCTCTCATTACC 175
Query 343 ATTTAACTCCAGCTGATGACTCTGCTTGGTCTAGTTTATTGCCAAGGAAGATGTTGAAAG 402
||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 ATTTAACTCCAACTGATGACGCCGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAG 235
Query 403 AAGAGGCAGATGAATTT-GCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATTCC 461
||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 AAGAGACGGATG-ATTTCGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATTCC 294
Query 462 TCTGGTAACTTTCTTAAAGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGA-CCCAGACTCCTT 520
|||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 295 TCTGGTAACTTTCTCAAGGACGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGACCCCAG-CTCCTT 353
Query 521 TCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTTT 580
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 354 TCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGAATGTTGATGGTTT 413
Query 581 GGCCTGGAGCTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCACCTGGAGATT-ACTATGGAGGAT 639
||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||
Sbjct 414 GGCCTATAGCTTCCGTAAAGTTGCTGGTCTTGATGCTCCTGGAG-TTCCCTATGGAGGAT 472
Query 640 GGGAGAGACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAG 699
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 473 GGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAG 532
Query 700 CTTATATGTGGGCTAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGA-GAAAATGTCAGCTCTTGTC 758
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 533 CTTATATGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAA-GACGAAAATGTCAGCTCTTGTC 591
Query 759 TCAGCTCTATCGGAATGCCAACAGAAGTCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCC 818
|| ||| || |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TCTGCTTTAGCGGAATGCCAGCAAAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCC 651
Query 819 AGTTTTTTCGACCGCTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCAC 878
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 AGTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCAC 711
Query 879 AAGATTTTAGCTGGTCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTAAAG 938
|||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 712 AAGATTTTGGCCGGCCTGGTGGATCAATATAAGTTGGCTGGGAATACTCAAGCTTTAAAG 771
Query 939 ATGGCAACCGGGATGGCTGATTA-TTTCTATGGCCGTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTA 997
|||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 772 ATGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTT-TATGGCCGTGTTCAAAATGTGATAAGGAAGTA 830
Query 998 CAGTGTTGAACGACATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCT 1057
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 CAGTGTTGAACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCT 890
Query 1058 TTATCAGCTATACAGCATCACTGGAGATTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGA 1117
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 891 TTATCAGCTATACAGCATCACTCGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGA 950
Query 1118 CAAGCCTTGCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGC 1177
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 CAAGCCTTGCTTTCTCGGGGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGC 1010
Query 1178 TAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCT 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 TAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGATATGAAATCACTGGTGATCT 1070
Query 1238 ACTCCATAAGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATTTTTAATGCTTCTCACAGCTATGC 1297
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 ACTCCATAAGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATAGTTAATGCTTCTCACAGCTATGC 1130
Query 1298 AACAGGAGGAACATCAGTCAGTGAGTTCTGGCAAGATCCCAAGAGAATGGCGACTGCACT 1357
||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1131 AACTGGAGGAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACACT 1190
Query 1358 GCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCT 1417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 GCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCT 1250
Query 1418 GTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCCTTGACCAACGG 1477
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1251 GTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGG 1310
Query 1478 CGTG-TTGGGAATTCAAAGAGGAACCCAGCCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAG 1536
||| |||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 TGTGCTTGG-AATTCAAAGAGGAACCCAACCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTAG 1369
Query 1537 GTAAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCT 1596
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370 GTCAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCT 1429
Query 1597 GGTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTC 1656
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1430 GGTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTTTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTC 1489
Query 1657 AAGAAGATGGTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATT 1716
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 AAGAAGATGGTGCATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATT 1549
Query 1717 GGAAATCTGCTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGT 1776
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 GGAAATCTGCTGGTCTTTTGCTATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGT 1609
Query 1777 ACATGCGTGTGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTT 1836
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1610 ACATGCGTGTGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGAAGTCGACTT 1669
Query 1837 TGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGC 1896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670 TGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGA 1729
Query 1897 GACCCTTAAACGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGAAATCTG 1956
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1730 AACCCTTAAAAGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCGATCAAACAGAACTGGAAATCTG 1789
Query 1957 GTGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATC 2016
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 GCGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATC 1849
Query 2017 GGCCAGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACA 2076
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 GTCCGGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACA 1909
Query 2077 CGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAACCTGGAAAATGGATAACCCCTATAC 2136
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1910 CGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAATTGGATAACCCCTATAC 1969
Query 2137 CTGAAACTCAAAACAGTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACGTATCTTACG 2196
|||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1970 CTGAAACTTATAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCTTACG 2029
Query 2197 TGTTTTCAAATAGCAACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGGACACAAG 2256
|||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2030 TGTTGTCAAATACCAACCAAACCATCACAATGAGGGTATCACCCGAGCTAGGGACACAAG 2089
Query 2257 ATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATTTCGGGTC 2316
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2090 ATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATATCGGGTC 2149
Query 2317 CAGAAGG-ACTAATTGGAAGGCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATT 2375
|||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2150 CAGA-GGCACTAATTGGAAGCCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATT 2208
Query 2376 GTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACAGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGA 2435
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 GTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGA 2268
Query 2436 GCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCTAGGAAGCGTTTCGTTAAGA 2495
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 2269 GCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTTAAGA 2328
Query 2496 CTAGAGAGCAAAAAAGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACCCTAAAGCAAGGGACAAAA 2555
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 2329 CTAGAGAGCAACAATGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGGACGAAA 2388
Query 2556 CTAAGGCTAGAATGTGGTTCGGATGCGACTGATGAGAAGTTTAAAGAGGCAGCAAGCTTT 2615
|||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2389 CTAAAGCTTGAATGTGGTCCGGTTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAGCTTT 2448
Query 2616 A-GTTTAAAGACAGGAATGCATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAACACA 2674
| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2449 AAGTT-AAACACAGGAATAAATCAATACAATCCAATGAGTTTTGTGATGAGCGGAACACA 2507
Query 2675 GAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTT 2734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2508 GAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTT 2567
Query 2735 CAGTGTGCAAACTT 2748
||||||||||||||
Sbjct 2568 CAGTGTGCAAACTT 2581
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 110195078785
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5