BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G12960.1
Length=2835
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488069 jgi|Araly1|488069|fgenesh2_kg.6__1203__AT5G12950.1 4152 0.0
Ahg350453 jgi|Araly1|350453|fgenesh1_pg.C_scaffold_6001046 4152 0.0
Ahg940758 jgi|Araly1|940758|scaffold_601302.1 3903 0.0
> Ahg488069 jgi|Araly1|488069|fgenesh2_kg.6__1203__AT5G12950.1
Length=2800
Score = 4152 bits (2248), Expect = 0.0
Identities = 2507/2633 (95%), Gaps = 14/2633 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 78 TTTTTTGTTTATG--AAAAAACATACGATGAAGTCTGGTGTGATCATAACCATTGCTCTG 135
|||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 104 TTTTTTTTTTAAGACAAAAAAGATACGATGAAGTCTGGTGTCATCATTACCATTGCTCTG 163
Query 136 TTATTATACACAAGCTTTCTTCTTGTTTGTCTGGCGAAAGAGTGTACAGACATTCCTACG 195
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 TTATTATACACAAGCTTTCTTCTTGTTTGTGTAGCGAAAGAGTGTACAGACATTCCTACC 223
Query 196 AAGCTCTCATCGCATACTCTCCGCAGCGAGCTTCTGCAATCACAGAACGCAAA-TTTGAA 254
|||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||
Sbjct 224 AAGCTCTCATCGCATACTTTGCACAGCGAGCTTCTACAATCACACAAC-AAAACTTTGAA 282
Query 255 GTCAGAGGAGTTCTCTCATTACCATTTAACTCCAACTGATGACTCTGCTTGGTCTACTTT 314
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 283 GACAGAGTTGTTCTCTCATTACCATTTAACTCCAACTGATGACGCTGCTTGGTCTACTTT 342
Query 315 GTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGAGACTGATGATTTTGCTTGGACTATGTTGTATAG 374
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 GTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGAGACGGATGAATTTGCTTGGACTATGTTGTATAG 402
Query 375 AAAGTTCAAGGACTCTAATTCCT-CTGGTAACTTTCTCAAGGATGTCTCTTTGCACGACG 433
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403 GAAGTTCAAGGACTCTAATT-CTGTTGGTAACTTTCTCAAGGATGTCTCTTTGCACGACG 461
Query 434 TTAGGCTGGACCCGAGCT-CTTTCCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTA 492
|||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 TTAGGCCCGACCCCAACTCCTTT-CATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTA 520
Query 493 TTGATGTTGGATGTTGATGGTTTGGCCTATAACTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTAATGCT 552
||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 521 TTGATGTTGGATGTTGACGGTTTAGCCTATAGCTTCCGTAAAGTTGCTGGTCTTGATGCT 580
Query 553 CCTGGAGTTCCCTATGGAGGATGGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTC 612
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 TCTGGAGTTCCCTATGGAGGATGGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTC 640
Query 613 GGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTTATATGTGGGCAAGTACTCATAACGAAACTCTCAAG 672
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 641 GGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTCATATGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAAG 700
Query 673 GCGAAAATGACAGCTCTTGTCTCAGCTCTAGCGGAATGCCAGCAGAAATATGGCACAGGA 732
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 701 GCGAAAATGTCAGCTCTTGTCTCAGCTTTAGCGGAATGTCAGCAGAAATCTGGCACAGGA 760
Query 733 TATCTCTCAGCTTTCCCTTCCAGTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGG 792
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 TATCTCTCTGCTTTTCCTTCCAGTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGG 820
Query 793 GCTCCTTACTATACCATTCACAAGATTTTGGCCGGCCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCT 852
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GCTCCTTACTACACCATTCACAAGATTTTGGCCGGCCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCT 880
Query 853 GGGAATACTCAAGCTTTAAAGATGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGCCGTGTT 912
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 881 GGGAATATTCAAGCTTTAAAGATGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGTCGTGTT 940
Query 913 CAAAATGTGATAAAGAAGTACAGTGTTGAACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACT 972
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 941 CGTAATGTGATAACGAAGTACAGTGTTGAACGACATTATCAATCACTAAACGAAGAGACT 1000
Query 973 GGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGCTATACAGCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTG 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 GGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGCTATACAGCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTG 1060
Query 1033 TTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTTGCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGAT 1092
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 TTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTTGCTTTCTCGGGGTCCTCGCAATTCAGGCCGAT 1120
Query 1093 GATATTAGTGGATTCCACGCTAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGG 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121 GATATTAGTGGATTCCACGCTAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGG 1180
Query 1153 TATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATAAGGAAATCCCGATGTTCTTTATGGACATAGTT 1212
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1181 TATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATAAGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATAATT 1240
Query 1213 AATGCTTCACACAGCTATGCAACTGGAGGAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCA 1272
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1241 AATGCTTCTCACAGCTATGCAACTGGAGGAACATCAGTCAGAGAGTTCTGGCAAGATCCA 1300
Query 1273 AAGAGAATGGCGACTACGTTGCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATG 1332
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 AAGAGAATGGCGACTACACTGCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATG 1360
Query 1333 CTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTAC 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361 CTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTAC 1420
Query 1393 GAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCGATCCCGGACGGATG 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1421 GAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCCAACCCGGACGGATG 1480
Query 1453 ATCTACATGCTCCCATTGGGTAAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGA 1512
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATCTACATGCTCCCATTAGGTCAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGA 1540
Query 1513 ACACCTTATGATTCCTTTTGGTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTG 1572
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 ACACCTTATGATTCCTTCTGGTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTG 1600
Query 1573 GGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATGGTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATAT 1632
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 GGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATGGTGCATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATAT 1660
Query 1633 ATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTGCTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCT 1692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1661 ATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTGCTGGTCTTTTGCTATCTCAGAAAGTTAATCCT 1720
Query 1693 GTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTGTGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGA 1752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1721 GTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTGTGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGA 1780
Query 1753 GTGGCGAAGGAGTCGACTTTGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCC 1812
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781 GTGGCGAAGAAGTCGACTTTGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCC 1840
Query 1813 AAAGTATCTTTGAATGGGCGACCCTTAAACGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCAATC 1872
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1841 AAAGTATCTTTGAATGGGAAACCCTTAAAAGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCGATC 1900
Query 1873 AAACAGAAATGGAAATCTGGTGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACC 1932
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1901 AAACAGAACTGGAAATCTGGCGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACC 1960
Query 1933 GAAGCTATAAAAGATGATCGGCCGGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCT 1992
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1961 GAAGCTATAAAAGATGATCGTCCGGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCC 2020
Query 1993 TACTTGTTAGCCGGACACACGAGCATGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGA 2052
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2021 TACTTGTTAGCCGGACACACGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGA 2080
Query 2053 AACTGGATAACCCCTATACCTGAAACTCT-TAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACA 2111
|| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 AATTGGATAACCCCTATACCTGAAACT-TATAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACA 2139
Query 2112 ATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCAAACAGCAACCAAACCATCATAATGAAAGTATC 2171
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2140 ATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCAAATACCAACCAAACCATCACAATGAGGGTATC 2199
Query 2172 ACCCGAGCCAGGGACACAAGACGCTGTTTCGGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATGATTC 2231
|||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2200 ACCCGAGCTAGGGACACAAGATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTC 2259
Query 2232 TAAAC-ATCCGATTTCGAGTCCAGAGGGACTAATTGGAAGCCTTGTCATGCTTGAGCCGT 2290
||||| | | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2260 TAAACCA-CGGATTTCGGGTCTAGAGGCACTAATTGGAAGCCTGGTCATGCTTGAGCCGT 2318
Query 2291 TTGATTTCCCTGGCATGATCGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTT 2350
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2319 TTGATTTCCCTGGCATGATTGTAAAGCAAACAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTT 2378
Query 2351 CTTCTCCTAGTGACAAAGGATCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGC 2410
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 2379 CTTCTCCTAGTGACAAAGGAGCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGC 2438
Query 2411 CAGGAAGCGTGTCGTTAAGCCTAGAGAGCAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAA 2470
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 CAGGAAGCGTGTCGTTAAGACTAGAGAGCAACAATGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAA 2498
Query 2471 CATTAAAGCAAGGGACGAAACTAAGGCTTGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGT 2530
|| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 2499 CACTAAAGCAGGGGACGAAACTAAAGCTTGAATGTGGTCCGGTTGCGACTGATGAGAAGT 2558
Query 2531 TTAAACAGGCAGCAAGCTTTA-GTTTAAAGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGT 2589
||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2559 TTAAACAGGCAGCAAGCTTTAAGTT-AAACACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGT 2617
Query 2590 TTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACTTTGTGCTATCGCCATTGTTTAGCCTAAGAGAT 2649
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2618 TTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGAT 2677
Query 2650 GAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGCAAGCTTGAAGAAATAAACCCTTTTA 2702
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 2678 GAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGCAAACTTGAAGAAAGAAACCCTTTTA 2730
> Ahg350453 jgi|Araly1|350453|fgenesh1_pg.C_scaffold_6001046
Length=2583
Score = 4152 bits (2248), Expect = 0.0
Identities = 2475/2586 (96%), Gaps = 10/2586 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 103 ATGAAGTCTGGTGTGATCATAACCATTGCTCTGTTATTATACACAAGCTTTCTTCTTGTT 162
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGAAGTCTGGTGTCATCATAACCATTGCTCTGTTATTATTCACAAGCTTTGTTCTTGTT 60
Query 163 TGTCTGGCGAAAGAGTGTACAGACATTCCTACGAAGCTCTCATCGCATACTCTCCGCAGC 222
||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 61 TGTGTAGCGAAAGAGTGTACAGACATTCCTACCAAGCTCTCATCGCATACTTTGCGCAGC 120
Query 223 GAGCTTCTGCAATCACAGAACGCAAA-TTTGAAGTCAGAGGAGTTCTCTCATTACCATTT 281
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||
Sbjct 121 GAGCTTCTGCAATCACAGAACG-AAACTTTGAAGACAGAGTTGTCCTCTCATTACCATTT 179
Query 282 AACTCCAACTGATGACTCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGA 341
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 AACTCCAACTGATGACGCCGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGA 239
Query 342 GACTGATGATTTTGCTTGGACTATGTTGTATAGAAAGTTCAAGGACTCTAATTCCTCTGG 401
||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GACGGATGATTTCGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATTCCTCTGG 299
Query 402 TAACTTTCTCAAGGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTGGACCCGAGCT-CTTTCCATT 460
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||
Sbjct 300 TAACTTTCTCAAGGACGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGACCCCAGCTCCTTT-CATT 358
Query 461 GGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTTTGGCCT 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 359 GGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGAATGTTGATGGTTTGGCCT 418
Query 521 ATAACTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTAATGCTCCTGGAGTTCCCTATGGAGGATGGGAGA 580
||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 ATAGCTTCCGTAAAGTTGCTGGTCTTGATGCTCCTGGAGTTCCCTATGGAGGATGGGAGA 478
Query 581 AACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTTATA 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 AACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTTATA 538
Query 641 TGTGGGCAAGTACTCATAACGAAACTCTCAAGGCGAAAATGACAGCTCTTGTCTCAGCTC 700
||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 539 TGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAAGACGAAAATGTCAGCTCTTGTCTCTGCTT 598
Query 701 TAGCGGAATGCCAGCAGAAATATGGCACAGGATATCTCTCAGCTTTCCCTTCCAGTTTTT 760
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 599 TAGCGGAATGCCAGCAAAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCCAGTTTTT 658
Query 761 TCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTATACCATTCACAAGATTT 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 659 TCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCACAAGATTT 718
Query 821 TGGCCGGCCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCTGGGAATACTCAAGCTTTAAAGATGGCAA 880
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TGGCCGGCCTGGTGGATCAATATAAGTTGGCTGGGAATACTCAAGCTTTAAAGATGGCAA 778
Query 881 CAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGCCGTGTTCAAAATGTGATAAAGAAGTACAGTGTTG 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 779 CAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGCCGTGTTCAAAATGTGATAAGGAAGTACAGTGTTG 838
Query 941 AACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 AACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGC 898
Query 1001 TATACAGCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTT 1060
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TATACAGCATCACTCGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTT 958
Query 1061 GCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTAATACAC 1120
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GCTTTCTCGGGGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTAATACAC 1018
Query 1121 ATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATA 1180
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 ATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGATATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATA 1078
Query 1181 AGGAAATCCCGATGTTCTTTATGGACATAGTTAATGCTTCACACAGCTATGCAACTGGAG 1240
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1079 AGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATAGTTAATGCTTCTCACAGCTATGCAACTGGAG 1138
Query 1241 GAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACGTTGCAAACTG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1139 GAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACACTGCAAACTG 1198
Query 1301 AAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGAT 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 AAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGAT 1258
Query 1361 GGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTCG 1420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1259 GGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTTG 1318
Query 1421 GAATTCAAAGAGGAACCGATCCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTGGGTAAAGGTG 1480
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1319 GAATTCAAAGAGGAACCCAACCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTAGGTCAAGGTG 1378
Query 1481 TTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTTTGGTGTTGCT 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1379 TTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTGGTGTTGCT 1438
Query 1541 ATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATG 1600
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 ATGGCACTGGAATTGAATCCTTTTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATG 1498
Query 1601 GTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTG 1660
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 GTGCATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTG 1558
Query 1661 CTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTG 1720
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CTGGTCTTTTGCTATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTG 1618
Query 1721 TGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTTTGAATCTAA 1780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1619 TGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGAAGTCGACTTTGAATCTAA 1678
Query 1781 GAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGCGACCCTTAA 1840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1679 GAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGAAACCCTTAA 1738
Query 1841 ACGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGAAATCTGGTGATCAAG 1900
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1739 AAGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCGATCAAACAGAACTGGAAATCTGGCGATCAAG 1798
Query 1901 TAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATCGGCCGGAGT 1960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1799 TAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATCGTCCGGAGT 1858
Query 1961 ACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCTTACTTGTTAGCCGGACACACGAGCATGG 2020
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1859 ACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACACGAGCAGGG 1918
Query 2021 ACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAACTGGATAACCCCTATACCTGAAACTC 2080
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 ACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAATTGGATAACCCCTATACCTGAAACT- 1977
Query 2081 T-TAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCA 2139
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 TATAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCA 2037
Query 2140 AACAGCAACCAAACCATCATAATGAAAGTATCACCCGAGCCAGGGACACAAGACGCTGTT 2199
|| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||
Sbjct 2038 AATACCAACCAAACCATCACAATGAGGGTATCACCCGAGCTAGGGACACAAGATGCCGTT 2097
Query 2200 TCGGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATGATTCTAAAC-ATCCGATTTCGAGTCCAGAGGG 2258
| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||| |||||||||
Sbjct 2098 GCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCA-CGGATATCGGGTCCAGAGGC 2156
Query 2259 ACTAATTGGAAGCCTTGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATCGTAAAGCA 2318
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2157 ACTAATTGGAAGCCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATTGTAAAGCA 2216
Query 2319 AGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGATCTTCTAG 2378
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2217 AGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGAGCTTCTAG 2276
Query 2379 CTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTTAAGCCTAGAGAG 2438
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2277 CTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTTAAGACTAGAGAG 2336
Query 2439 CAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACATTAAAGCAAGGGACGAAACTAAGGCT 2498
||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 2337 CAACAATGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGGACGAAACTAAAGCT 2396
Query 2499 TGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAGCTTTA-GTTTAA 2557
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 2397 TGAATGTGGTCCGGTTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAGCTTTAAGTT-AA 2455
Query 2558 AGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACT 2617
| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 ACACAGGAATAAATCAATACAATCCAATGAGTTTTGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACT 2515
Query 2618 TTGTGCTATCGCCATTGTTTAGCCTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGC 2677
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 TTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGC 2575
Query 2678 AAGCTT 2683
|| |||
Sbjct 2576 AAACTT 2581
> Ahg940758 jgi|Araly1|940758|scaffold_601302.1
Length=2637
Score = 3903 bits (2113), Expect = 0.0
Identities = 2459/2627 (94%), Gaps = 19/2627 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 98 ATACGATGAAGTCTGGTGTGATCATAACCATTGCTCTGTTATTATACACAAGCTTTCTTC 157
||||||||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||
Sbjct 18 ATACGATGAAGTCTGGTCTCATTATAACCATTGCTTTATTATTATACACAAGCTTTGTTC 77
Query 158 TTGTTTGTCTGGCGAAAGAGTGTACAG-ACATTCCTACGAAGCTCTCATCGCATACTCTC 216
|||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 78 TTGTTTGTGTAGCGAAAGAGTGTAC-GAACACTCCTACGCAGCTCTCATCGCATACTTTC 136
Query 217 CGCAGCGAGCTTCTGCAATCACAGAACGCAAA-TTTGAAGTCAGAGGAGTTCTCTCATTA 275
|||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 137 CGCAACGAGCTTCTTCAATCAAAGAACG-AAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCATTA 195
Query 276 CCATTTAACTCCAACTGATGACTCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAA 335
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 CCATTTAACACCAACTGATGACGCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAA 255
Query 336 AGAAGAGACTGATGATTTTGCTTGGACTATGTTGTATAGAAAGTTCAAGGACTCTAATTC 395
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 256 AGAAGAGGCTGATGAATTTGCTTGGACTATGTTGTATAGGACGTTCAAGGACTCTAATTC 315
Query 396 CTCTGGTAACTTTCTCAAGGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTGGACCCGAGCT-CTT 454
||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| || | || | |
Sbjct 316 CTCTGGTAACTTTCTTAAAGAAGTCTCTTTGCACCACGTTAGGCTGGATCCAAACTCCAT 375
Query 455 TCCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTT 514
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 T-CATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTT 434
Query 515 TGGCCTATAACTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTAATGCTCCTGGAGTTCCCTATGGAGGAT 574
|||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 435 TGGCCTGGAGCTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCTCCTGGAGATCACTATGGAGGAT 494
Query 575 GGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAG 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 GGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAG 554
Query 635 CTTATATGTGGGCAAGTACTCATAACGAAACTCTCAAGGCGAAAATGACAGCTCTTGTCT 694
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 555 CTTATATGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGAGAAAATGTCAGCTCTTGTCT 614
Query 695 CAGCTCTAGCGGAATGCCAGCAGAAATATGGCACAGGATATCTCTCAGCTTTCCCTTCCA 754
|||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 615 CAGCTCTATCGGAATGTCAGCAGAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCCA 674
Query 755 GTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTATACCATTCACA 814
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 675 GTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCACA 734
Query 815 AGATTTTGGCCGGCCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCTGGGAATACTCAAGCTTTAAAGA 874
||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||
Sbjct 735 AGATTATAGCTGGTCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTACAGA 794
Query 875 TGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGCCGTGTTCAAAATGTGATAAAGAAGTACA 934
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 795 TGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTCTATGGCCTTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTACA 854
Query 935 GTGTTGAACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTT 994
| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 855 GCGTTGAAAGACATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTCT 914
Query 995 ATCAGCTATACAGCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGACA 1054
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 915 ATCAGCTATACAGCATCACTGGAGACTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGACA 974
Query 1055 AGCCTTGCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTA 1114
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 975 AGCCTTGCTTTCTTGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATAAGTGGATTCCACTCTA 1034
Query 1115 ATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCTAC 1174
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1035 ACACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCCAC 1094
Query 1175 TCCATAAGGAAATCCCGATGTTCTTTATGGACATAGTTAATGCTTCACACAGCTATGCAA 1234
|||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1095 TCCATAAGGAAATCTCGATTTTCTTTATGGACATCGTTAATGCTTCTCACAGCTATGCAA 1154
Query 1235 CTGGAGGAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACGTTGC 1294
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1155 CTGGAGGAACATCAGTCAGTGAGTTCTGGCAAAATCCAAAGAGAATGGCGACTACGCTGC 1214
Query 1295 AAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGT 1354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1215 AAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGT 1274
Query 1355 TCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGGTG 1414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1275 TCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGTGCTTTGACCAACGGTG 1334
Query 1415 TGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCGATCCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTGGGTA 1474
||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1335 TGCTCGGAATTCAAAGAGGAACCCAACCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAGGTA 1394
Query 1475 AAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTTTGGT 1534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1395 AAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTGGT 1454
Query 1535 GTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAG 1594
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1455 GTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCTTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATTTATTTTCAAG 1514
Query 1595 AAGATGGTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGA 1654
|||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515 AAGATGATGTATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGA 1574
Query 1655 AATCTGCTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACA 1714
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1575 AATCTGCTGGTCTTTCGCTATCTCAGAAAGTTAATCCCGTTGTATCGTGGGATCCGTACA 1634
Query 1715 TGCGTGTGACATTCACTCTT-TCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTTTG 1773
|||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 1635 TGCGTGTGACATTCTCT-TTCTCTTCTTCCAAAGGGGGAATGGCAAAGGAGTCGACTTTG 1693
Query 1774 AATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGCGA 1833
|||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1694 AATCTAAGAATTCCAGTTTGGACAAACTCTGTAGGTGCCAAAATATCTTTGAATGGGCAA 1753
Query 1834 CCCTTAAACGTACCAA-CTTCAG-----GTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGAAA 1887
||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1754 TCCTTAAAAGTACCAAACTTCAGAACCCGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAACTGGAAA 1813
Query 1888 TCTGGTGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGAT 1947
||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814 TCTGGCGATCAAGTAACCATGGAGTTACCATTGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGAT 1873
Query 1948 GATCGGCCGGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCTTACTTGTTAGCCGGA 2007
||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1874 GATCGGCAGGAGTACTCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGA 1933
Query 2008 CACACGAGCATGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAACTGGATAACCCCT 2067
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1934 CACACGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAAATGGATAACCCCT 1993
Query 2068 ATACCTGAAACTCTTAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCT 2127
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 ATACCTGAAACTCAAAACAGTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCT 2053
Query 2128 TACGTGTTGTCAAACAGCAACCAAACCATCATAATGAAAGTATCACCCGAGCCAGGGACA 2187
|||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054 TACGTGTTTTCAAATAGCAACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGGACA 2113
Query 2188 CAAGACGCTGTTTCGGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATGATTCTAAAC-ATCCGATTTC 2246
||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||
Sbjct 2114 CAAGATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCA-CGGATATC 2172
Query 2247 GAGTCCAGAGGGACTAATTGGAAGCCTTGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCAT 2306
| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2173 GGGTCCAGAGGGACTAATTGGAAGCCTGGTCAAGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCCGGCAT 2232
Query 2307 GATCGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAA 2366
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2233 GATTGTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAA 2292
Query 2367 AGGATCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTT 2426
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2293 AGGAGCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTT 2352
Query 2427 AAGCCTAGAGAGCAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACATTAAAGCAAGGGAC 2486
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 2353 AAGACTAGAGAGCAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGGAC 2412
Query 2487 GAAACTAAGGCTTGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAG 2546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2413 GAAACTAAGGCTTGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAG 2472
Query 2547 CTTTA-GTTTAAAGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAA 2605
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2473 CTTTAAGTT-AAAGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAA 2531
Query 2606 CACAGAGGAACTTTGTGCTATCGCCATTGTTTAGCCTAAGAGATGAAACATACAATGTGT 2665
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2532 CACAGAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGT 2591
Query 2666 ACTTCAGTGTGCAAGCTTGAAGAAATAAACCCTTTTAAAACTCCTTT 2712
|||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || |||
Sbjct 2592 ACTTCAGTGTGCAAACTTGAAGAAAGAAACCCTCTTAAAATTC-TTT 2637
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 106995498205
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5