BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G13520.1 Length=2120 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg940818 jgi|Araly1|940818|scaffold_601362.1 3055 0.0 Ahg893177 jgi|Araly1|893177|Al_scaffold_0006_1173 1485 0.0 Ahg350435 jgi|Araly1|350435|fgenesh1_pg.C_scaffold_6001028 1483 0.0 Ahg488173 jgi|Araly1|488173|fgenesh2_kg.6__1307__AT5G13510.1 82.4 1e-14 > Ahg940818 jgi|Araly1|940818|scaffold_601362.1 Length=1891 Score = 3055 bits (1654), Expect = 0.0 Identities = 1815/1894 (96%), Gaps = 6/1894 (0%) Strand=Plus/Plus Query 81 CAAGCTTCTCTCACTCAGCAATGGCACCCATTGATCCACACTCTTTCACCGATTCCTCTC 140 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CAAGCTTTTCTCACTCAGCAATGGCACCCATTGATCCACACTCTTTCACCGATTCCTCTC 60 Query 141 ATCCTCTCACCACGCATGTCGCTCTCTCCCTCTACCTCGATTTCAACACCTCCATAATCC 200 ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 61 ATCCTCTCACCACGCATCTCGCTCTCTCCCTTTACCTCGATTTCAACACCTCCATCATCC 120 Query 201 ATGGctccgctctcctcactctctcctccgccttctccggcgaactctctctTGATACTC 260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATGGCTCCGCTCTCCTCACTCTCTCCTCCGCCTTCTCCGGCGAACTCTCTCTTGATACTC 180 Query 261 GCTGCATTTCCATTGC-TATGGTCCTCGATCCTCTCACTCTCGAGCCTATCCCTTACTC- 318 |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| | Sbjct 181 GCTGCATTTCCA-TCCATATGTTCCTCGATCCTCTAACTCTCGATCCCCTCCCTTAC-CG 238 Query 319 CGTCTCCACCACACCGGATCGAATTCGGGGCACCGAAGTTGTCGTAGTCCTCTCCGGTCA 378 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 239 CGTCTCCACCACGCCGGATCGAATTCGAGGCACCGAAGTTGTCGTAGTCCTCTCCGGTCA 298 Query 379 ATCTTCACTGCTAATTGTCTACTCCACTTCGCCTTCTGCTTCCGCTCTCCAGTGGCTTTC 438 |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || Sbjct 299 ATCTTCGCTGTTAATCGTCTACTCCACTTCGCCTTCCGCCTCCGCTCTCCAGTGGCTATC 358 Query 439 GCCGCTTCAAACTTTCTCCAAATTGCATCCTTATGTCTACACGCAGTGTCAAGCGATTCA 498 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || Sbjct 359 TCCGCTTCAAACCTTCTCCAAATTGCATCCCTATGTCTACACGCAGTGCCAGGCGATCCA 418 Query 499 CGCCAGATCCATTTTCCCATGCCAGGACACTCCTGCCGCGAGGATCCGTTACGACGTCGT 558 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct 419 CGCCAGATCCATTTTCCCATGCCAGGACACTCCTGCCGCGAGGATTCGCTACGATGTCGT 478 Query 559 TATGAACATACCGAATTCGCTCTCTGCCGTCATGTCGGCTCGCCACGTCCGTCGTAGGCT 618 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 CATGAACATACCGAATTCGCTCTCTGCCGTCATGTCAGCTCGCCACGTCCGTCGTAGGCT 538 Query 619 TGCGGTTCCTGAGGAGGCTAAACATCTCGAGGCTGGGTCGCTGGGGT-CGTCACTGTGGT 677 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| Sbjct 539 GGCGGTTCCTGAGGAGGCTAAACATCTCGAGGCGGGGTCGCT-GGGTCCGTCACTGTGGT 597 Query 678 GTGGTGAGGATAGAGTTGTGGAAGAGTTTGCTATGGAACAGCCTATACCGCCTTATCTAT 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 GTGGTGAGGATAGAGTTGTGGAAGAGTTTGCTATGGAACAGCCTATACCGCCTTATCTAT 657 Query 738 TTGCTTTTGCCGTTGGTGAGTTAGGGTTTCGGGAAGTTGGACCTAGGACTCGGGTATACA 797 |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 TTGCGTTCGCCGTAGGTGAGTTAGGGTTTCGGGAAGTTGGACCTAGGACTCGGGTATACA 717 Query 798 CAGAATCTGCCGCCATTGAAGTTCTAGATGCGGCTGCTCTGGAGTTTGCAGGAACGGAGG 857 |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 CAGAATCTGCCGCCGTTGAAGTTCTAGATGCGGCGGCTCTGGAGTTTGCAGGAACGGAGG 777 Query 858 ATATGATCAAGCAAGGGGAGAAGCTGTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGATTTGACTTAC 917 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 ATATGATCAAGCAAGGGGAGAAGCTGTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGATTTGACTTAC 837 Query 918 TGGTGCTGCCTCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGA 977 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 TGGTGCTGCCTCCGAGTTTTCCTTATGGAGGGATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGA 897 Query 978 CGCCTACTGTTATCAAAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCAC 1037 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 CGCCTACTGTAATCAAAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCAC 957 Query 1038 ATAGCTGGACTGGGAATTTGATCACTAATATCAACAATGAACACTTCTGGTTGAATGAGG 1097 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 958 ATAGCTGGACTGGGAATTTGATCACTAACATCAACAACGAACATTTCTGGTTGAATGAGG 1017 Query 1098 GATTTACAACTTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAGGTTGTTCAAGGGGCGGATATAGCTA 1157 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| Sbjct 1018 GATTTACAACTTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAAGTTGTTCAAGGCCCGGATAGAGCTA 1077 Query 1158 CTTTGAACATTGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACA 1217 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 CTCTGAACATTGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACA 1137 Query 1218 ACTTGGAGTGCACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATT 1277 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1138 ACTTGGAGTGCACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTGTATT 1197 Query 1278 CTCAGGTCCCATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAACGCCAGATTGGAA 1337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 CTCAGGTCCCATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAACGCCAGATTGGAA 1257 Query 1338 GAACTGCTTTTGACGAATTCCTCAAGAAATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCG 1397 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1258 GGACTGCGTTTGACGAATTCCTCAAGAAATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCG 1317 Query 1398 ATACAAACACATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCA 1457 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1318 ATACAAGCACATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAATATCCCCGGCATAGAGAAAGAGATCA 1377 Query 1458 ATCTACAGCTGTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCAGAGGATGCATATGAACCAGTCTCAA 1517 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1378 ACCTACAGCTGTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCAGAGGATGCATATGAACCAGTCTCAA 1437 Query 1518 CCATTTACACAAAGATCATATCCCTGGCGAAAGAGTTTAAGGAAGGAAAGATGCCAAGTG 1577 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1438 CCATTTACACAAAGATCATATCCCTGGCAAAAGAGTTTAAGGAAGGAAGGATGCCAAGTG 1497 Query 1578 AGGATGATGTTGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTCCTA 1637 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1498 AGGATGATGTTGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTCCTA 1557 Query 1638 AATCATGTGAACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTGGCAGAATCGA 1697 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1558 AATCATGTGAACCTTCTCAGGTGATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTAGCAGAATCGA 1617 Query 1698 AAGACTATGAAGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAACTTGCAGTCACATCCAAGTGCAGAGAGT 1757 | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1618 AGGACTATGAAGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAGCTTGCAGTCGCATCCAAGTGCAGAGAGT 1677 Query 1758 ACCATGGGGAAGTGAAGAAAACACTAAAAGAGGTAGGAAGGATGAAGTACCTGCGTCCAC 1817 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1678 ACCATGGGGAAGTGAAGAAAACACTAAAAGAGGTAGGGAGGATGAAGTACCTGCGTCCAC 1737 Query 1818 TCTTCACTGCTCTTGCACAATCTGGTGGAACAGAAGAGAAGCAGCTGGCAAAACAGGTGT 1877 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1738 TCTTCACTGCTCTTGCACAAGCTGGTGGAACAGAAGAGAAGCAGCTGGCAAAACAGGTGT 1797 Query 1878 TTGCAGAAGCTCGAGAAACTTATCACCCCATAGCTCAGGGAGTTGTTGAATCTATCCTCT 1937 | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| Sbjct 1798 TCGCAGAGGCTCGAGAAACTTACCACCCTATAGCTCAGGGAGTGGTTGAGTCTATTCTCT 1857 Query 1938 CTAAGTACATCTAAACAAGACCGTTATGATAGCT 1971 |||||||||||| ||||||||| || | |||||| Sbjct 1858 CTAAGTACATCTGAACAAGACCCTTCTTATAGCT 1891 > Ahg893177 jgi|Araly1|893177|Al_scaffold_0006_1173 Length=966 Score = 1485 bits (804), Expect = 0.0 Identities = 868/900 (96%), Gaps = 0/900 (0%) Strand=Plus/Plus Query 868 GCAAGGGGAGAAGCTGTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGATTTGACTTACTGGTGCTGCC 927 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 3 GCAAGGGGAGGAGCTCTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGGTTTGACTTACTGGTGCTACC 62 Query 928 TCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGACGCCTACTGT 987 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 63 TCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGACGCCTACTGT 122 Query 988 TATCAAAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCACATAGCTGGAC 1047 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 123 TATCAGAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCACATAGCTGGAC 182 Query 1048 TGGGAATTTGATCACTAATATCAACAATGAACACTTCTGGTTGAATGAGGGATTTACAAC 1107 |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 183 TGGGAATTTGATCACTAACATCAACAACGAACATTTCTGGTTGAATGAGGGATTTACAAC 242 Query 1108 TTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAGGTTGTTCAAGGGGCGGATATAGCTACTTTGAACAT 1167 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || Sbjct 243 TTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAAGTTGTCCAAGGGGCGGATAGAGCTACTCTGAATAT 302 Query 1168 TGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACAACTTGGAGTG 1227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 TGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACAACTTGGAGTG 362 Query 1228 CACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATTCTCAGGTCCC 1287 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 363 CACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATTCTCAGGTCCC 422 Query 1288 ATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAACGCCAGATTGGAAGAACTGCTTT 1347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || Sbjct 423 ATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAGCGCCAGATTGGAAGGACTGCATT 482 Query 1348 TGACGAATTCCTCAAGAAATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCGATACAAACAC 1407 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 483 TGACGAATTCCTCAAGATATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCGATGCAAACAC 542 Query 1408 ATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCAATCTACAGCT 1467 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 543 ATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCAACCTACAGCT 602 Query 1468 GTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCAGAGGATGCATATGAACCAGTCTCAACCATTTACAC 1527 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct 603 GTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCTGAGGATGCATATGAACTGGCCTCAACCATTTACAC 662 Query 1528 AAAGATCATATCCCTGGCGAAAGAGTTTAAGGAAGGAAAGATGCCAAGTGAGGATGATGT 1587 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 663 AAAGATCATATCCCTGGCAAAAGAGTTTAAGGAAGGAAGGATGCCAGGTGAGGATGATGG 722 Query 1588 TGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTCCTAAATCATGTGA 1647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 723 TGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTACTAAATCATGTGA 782 Query 1648 ACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTGGCAGAATCGAAAGACTATGA 1707 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 783 ACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTAGCAGAATCGAAGGACTATGA 842 Query 1708 AGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAACTTGCAGTCACATCCAAGTGCAGAGAGTACCATGGGGA 1767 ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 843 AGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAGCTTGCAGTCGCATCCAAGTGCAGAGAGTACCATGGGGA 902 > Ahg350435 jgi|Araly1|350435|fgenesh1_pg.C_scaffold_6001028 Length=1200 Score = 1483 bits (803), Expect = 0.0 Identities = 869/902 (96%), Gaps = 0/902 (0%) Strand=Plus/Plus Query 866 AAGCAAGGGGAGAAGCTGTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGATTTGACTTACTGGTGCTG 925 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 229 AAGCAAGGGGAGGAGCTCTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGGTTTGACTTACTGGTGCTA 288 Query 926 CCTCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGACGCCTACT 985 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 289 CCTCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGACGCCTACT 348 Query 986 GTTATCAAAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCACATAGCTGG 1045 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 349 GTTATCAGAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCACATAGCTGG 408 Query 1046 ACTGGGAATTTGATCACTAATATCAACAATGAACACTTCTGGTTGAATGAGGGATTTACA 1105 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 409 ACTGGGAATTTGATCACTAACATCAACAACGAACATTTCTGGTTGAATGAGGGATTTACA 468 Query 1106 ACTTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAGGTTGTTCAAGGGGCGGATATAGCTACTTTGAAC 1165 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct 469 ACTTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAAGTTGTCCAAGGGGCGGATAGAGCTACTCTGAAT 528 Query 1166 ATTGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACAACTTGGAG 1225 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 529 ATTGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACAACTTGGAG 588 Query 1226 TGCACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATTCTCAGGTC 1285 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 589 TGCACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATTCTCAGGTC 648 Query 1286 CCATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAACGCCAGATTGGAAGAACTGCT 1345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 649 CCATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAGCGCCAGATTGGAAGGACTGCA 708 Query 1346 TTTGACGAATTCCTCAAGAAATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCGATACAAAC 1405 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 709 TTTGACGAATTCCTCAAGATATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCGATGCAAAC 768 Query 1406 ACATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCAATCTACAG 1465 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 769 ACATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCAACCTACAG 828 Query 1466 CTGTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCAGAGGATGCATATGAACCAGTCTCAACCATTTAC 1525 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 829 CTGTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCTGAGGATGCATATGAACTGGCCTCAACCATTTAC 888 Query 1526 ACAAAGATCATATCCCTGGCGAAAGAGTTTAAGGAAGGAAAGATGCCAAGTGAGGATGAT 1585 ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| Sbjct 889 ACAAAGATCATATCCTTGGCAAAAGAGTTTAAGGAAGGAAGGATGCCAGGTGAGGATGAT 948 Query 1586 GTTGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTCCTAAATCATGT 1645 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 949 GGTGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTACTAAATCATGT 1008 Query 1646 GAACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTGGCAGAATCGAAAGACTAT 1705 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 1009 GAACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTAGCAGAATCGAAGGACTAT 1068 Query 1706 GAAGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAACTTGCAGTCACATCCAAGTGCAGAGAGTACCATGGG 1765 ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1069 GAAGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAGCTTGCAGTCGCATCCAAGTGCAGAGAGTACCATGGG 1128 Query 1766 GA 1767 || Sbjct 1129 GA 1130 > Ahg488173 jgi|Araly1|488173|fgenesh2_kg.6__1307__AT5G13510.1 Length=757 Score = 82.4 bits (44), Expect = 1e-14 Identities = 59/65 (91%), Gaps = 5/65 (8%) Strand=Plus/Minus Query 2051 AAAAATT-GAATTGCCTTTTGTTGCGTACATTACATTCTCCAAAAGAT--T-AGTACAAG 2106 ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | Sbjct 757 AAAAATTGGAATTTCCTTTTGTTGCGTACATTACATTCTCCAAAAGATGATTAGTACA-G 699 Query 2107 CTTAA 2111 ||||| Sbjct 698 CTTAA 694 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 79760973030 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5