BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G13520.1
Length=2120
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg940818 jgi|Araly1|940818|scaffold_601362.1 3055 0.0
Ahg893177 jgi|Araly1|893177|Al_scaffold_0006_1173 1485 0.0
Ahg350435 jgi|Araly1|350435|fgenesh1_pg.C_scaffold_6001028 1483 0.0
Ahg488173 jgi|Araly1|488173|fgenesh2_kg.6__1307__AT5G13510.1 82.4 1e-14
> Ahg940818 jgi|Araly1|940818|scaffold_601362.1
Length=1891
Score = 3055 bits (1654), Expect = 0.0
Identities = 1815/1894 (96%), Gaps = 6/1894 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 81 CAAGCTTCTCTCACTCAGCAATGGCACCCATTGATCCACACTCTTTCACCGATTCCTCTC 140
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CAAGCTTTTCTCACTCAGCAATGGCACCCATTGATCCACACTCTTTCACCGATTCCTCTC 60
Query 141 ATCCTCTCACCACGCATGTCGCTCTCTCCCTCTACCTCGATTTCAACACCTCCATAATCC 200
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 61 ATCCTCTCACCACGCATCTCGCTCTCTCCCTTTACCTCGATTTCAACACCTCCATCATCC 120
Query 201 ATGGctccgctctcctcactctctcctccgccttctccggcgaactctctctTGATACTC 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATGGCTCCGCTCTCCTCACTCTCTCCTCCGCCTTCTCCGGCGAACTCTCTCTTGATACTC 180
Query 261 GCTGCATTTCCATTGC-TATGGTCCTCGATCCTCTCACTCTCGAGCCTATCCCTTACTC- 318
|||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |
Sbjct 181 GCTGCATTTCCA-TCCATATGTTCCTCGATCCTCTAACTCTCGATCCCCTCCCTTAC-CG 238
Query 319 CGTCTCCACCACACCGGATCGAATTCGGGGCACCGAAGTTGTCGTAGTCCTCTCCGGTCA 378
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 CGTCTCCACCACGCCGGATCGAATTCGAGGCACCGAAGTTGTCGTAGTCCTCTCCGGTCA 298
Query 379 ATCTTCACTGCTAATTGTCTACTCCACTTCGCCTTCTGCTTCCGCTCTCCAGTGGCTTTC 438
|||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 299 ATCTTCGCTGTTAATCGTCTACTCCACTTCGCCTTCCGCCTCCGCTCTCCAGTGGCTATC 358
Query 439 GCCGCTTCAAACTTTCTCCAAATTGCATCCTTATGTCTACACGCAGTGTCAAGCGATTCA 498
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 359 TCCGCTTCAAACCTTCTCCAAATTGCATCCCTATGTCTACACGCAGTGCCAGGCGATCCA 418
Query 499 CGCCAGATCCATTTTCCCATGCCAGGACACTCCTGCCGCGAGGATCCGTTACGACGTCGT 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct 419 CGCCAGATCCATTTTCCCATGCCAGGACACTCCTGCCGCGAGGATTCGCTACGATGTCGT 478
Query 559 TATGAACATACCGAATTCGCTCTCTGCCGTCATGTCGGCTCGCCACGTCCGTCGTAGGCT 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 CATGAACATACCGAATTCGCTCTCTGCCGTCATGTCAGCTCGCCACGTCCGTCGTAGGCT 538
Query 619 TGCGGTTCCTGAGGAGGCTAAACATCTCGAGGCTGGGTCGCTGGGGT-CGTCACTGTGGT 677
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 539 GGCGGTTCCTGAGGAGGCTAAACATCTCGAGGCGGGGTCGCT-GGGTCCGTCACTGTGGT 597
Query 678 GTGGTGAGGATAGAGTTGTGGAAGAGTTTGCTATGGAACAGCCTATACCGCCTTATCTAT 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 GTGGTGAGGATAGAGTTGTGGAAGAGTTTGCTATGGAACAGCCTATACCGCCTTATCTAT 657
Query 738 TTGCTTTTGCCGTTGGTGAGTTAGGGTTTCGGGAAGTTGGACCTAGGACTCGGGTATACA 797
|||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TTGCGTTCGCCGTAGGTGAGTTAGGGTTTCGGGAAGTTGGACCTAGGACTCGGGTATACA 717
Query 798 CAGAATCTGCCGCCATTGAAGTTCTAGATGCGGCTGCTCTGGAGTTTGCAGGAACGGAGG 857
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CAGAATCTGCCGCCGTTGAAGTTCTAGATGCGGCGGCTCTGGAGTTTGCAGGAACGGAGG 777
Query 858 ATATGATCAAGCAAGGGGAGAAGCTGTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGATTTGACTTAC 917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 ATATGATCAAGCAAGGGGAGAAGCTGTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGATTTGACTTAC 837
Query 918 TGGTGCTGCCTCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGA 977
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 TGGTGCTGCCTCCGAGTTTTCCTTATGGAGGGATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGA 897
Query 978 CGCCTACTGTTATCAAAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCAC 1037
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 CGCCTACTGTAATCAAAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCAC 957
Query 1038 ATAGCTGGACTGGGAATTTGATCACTAATATCAACAATGAACACTTCTGGTTGAATGAGG 1097
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 958 ATAGCTGGACTGGGAATTTGATCACTAACATCAACAACGAACATTTCTGGTTGAATGAGG 1017
Query 1098 GATTTACAACTTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAGGTTGTTCAAGGGGCGGATATAGCTA 1157
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 1018 GATTTACAACTTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAAGTTGTTCAAGGCCCGGATAGAGCTA 1077
Query 1158 CTTTGAACATTGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACA 1217
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 CTCTGAACATTGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACA 1137
Query 1218 ACTTGGAGTGCACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATT 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1138 ACTTGGAGTGCACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTGTATT 1197
Query 1278 CTCAGGTCCCATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAACGCCAGATTGGAA 1337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 CTCAGGTCCCATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAACGCCAGATTGGAA 1257
Query 1338 GAACTGCTTTTGACGAATTCCTCAAGAAATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCG 1397
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GGACTGCGTTTGACGAATTCCTCAAGAAATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCG 1317
Query 1398 ATACAAACACATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCA 1457
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1318 ATACAAGCACATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAATATCCCCGGCATAGAGAAAGAGATCA 1377
Query 1458 ATCTACAGCTGTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCAGAGGATGCATATGAACCAGTCTCAA 1517
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 ACCTACAGCTGTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCAGAGGATGCATATGAACCAGTCTCAA 1437
Query 1518 CCATTTACACAAAGATCATATCCCTGGCGAAAGAGTTTAAGGAAGGAAAGATGCCAAGTG 1577
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1438 CCATTTACACAAAGATCATATCCCTGGCAAAAGAGTTTAAGGAAGGAAGGATGCCAAGTG 1497
Query 1578 AGGATGATGTTGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTCCTA 1637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 AGGATGATGTTGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTCCTA 1557
Query 1638 AATCATGTGAACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTGGCAGAATCGA 1697
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1558 AATCATGTGAACCTTCTCAGGTGATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTAGCAGAATCGA 1617
Query 1698 AAGACTATGAAGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAACTTGCAGTCACATCCAAGTGCAGAGAGT 1757
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1618 AGGACTATGAAGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAGCTTGCAGTCGCATCCAAGTGCAGAGAGT 1677
Query 1758 ACCATGGGGAAGTGAAGAAAACACTAAAAGAGGTAGGAAGGATGAAGTACCTGCGTCCAC 1817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 ACCATGGGGAAGTGAAGAAAACACTAAAAGAGGTAGGGAGGATGAAGTACCTGCGTCCAC 1737
Query 1818 TCTTCACTGCTCTTGCACAATCTGGTGGAACAGAAGAGAAGCAGCTGGCAAAACAGGTGT 1877
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 TCTTCACTGCTCTTGCACAAGCTGGTGGAACAGAAGAGAAGCAGCTGGCAAAACAGGTGT 1797
Query 1878 TTGCAGAAGCTCGAGAAACTTATCACCCCATAGCTCAGGGAGTTGTTGAATCTATCCTCT 1937
| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 1798 TCGCAGAGGCTCGAGAAACTTACCACCCTATAGCTCAGGGAGTGGTTGAGTCTATTCTCT 1857
Query 1938 CTAAGTACATCTAAACAAGACCGTTATGATAGCT 1971
|||||||||||| ||||||||| || | ||||||
Sbjct 1858 CTAAGTACATCTGAACAAGACCCTTCTTATAGCT 1891
> Ahg893177 jgi|Araly1|893177|Al_scaffold_0006_1173
Length=966
Score = 1485 bits (804), Expect = 0.0
Identities = 868/900 (96%), Gaps = 0/900 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 868 GCAAGGGGAGAAGCTGTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGATTTGACTTACTGGTGCTGCC 927
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 3 GCAAGGGGAGGAGCTCTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGGTTTGACTTACTGGTGCTACC 62
Query 928 TCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGACGCCTACTGT 987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 TCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGACGCCTACTGT 122
Query 988 TATCAAAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCACATAGCTGGAC 1047
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 TATCAGAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCACATAGCTGGAC 182
Query 1048 TGGGAATTTGATCACTAATATCAACAATGAACACTTCTGGTTGAATGAGGGATTTACAAC 1107
|||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 TGGGAATTTGATCACTAACATCAACAACGAACATTTCTGGTTGAATGAGGGATTTACAAC 242
Query 1108 TTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAGGTTGTTCAAGGGGCGGATATAGCTACTTTGAACAT 1167
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||
Sbjct 243 TTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAAGTTGTCCAAGGGGCGGATAGAGCTACTCTGAATAT 302
Query 1168 TGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACAACTTGGAGTG 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 TGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACAACTTGGAGTG 362
Query 1228 CACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATTCTCAGGTCCC 1287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 CACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATTCTCAGGTCCC 422
Query 1288 ATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAACGCCAGATTGGAAGAACTGCTTT 1347
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 423 ATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAGCGCCAGATTGGAAGGACTGCATT 482
Query 1348 TGACGAATTCCTCAAGAAATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCGATACAAACAC 1407
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 483 TGACGAATTCCTCAAGATATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCGATGCAAACAC 542
Query 1408 ATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCAATCTACAGCT 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 543 ATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCAACCTACAGCT 602
Query 1468 GTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCAGAGGATGCATATGAACCAGTCTCAACCATTTACAC 1527
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 603 GTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCTGAGGATGCATATGAACTGGCCTCAACCATTTACAC 662
Query 1528 AAAGATCATATCCCTGGCGAAAGAGTTTAAGGAAGGAAAGATGCCAAGTGAGGATGATGT 1587
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 663 AAAGATCATATCCCTGGCAAAAGAGTTTAAGGAAGGAAGGATGCCAGGTGAGGATGATGG 722
Query 1588 TGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTCCTAAATCATGTGA 1647
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 723 TGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTACTAAATCATGTGA 782
Query 1648 ACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTGGCAGAATCGAAAGACTATGA 1707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 783 ACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTAGCAGAATCGAAGGACTATGA 842
Query 1708 AGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAACTTGCAGTCACATCCAAGTGCAGAGAGTACCATGGGGA 1767
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 AGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAGCTTGCAGTCGCATCCAAGTGCAGAGAGTACCATGGGGA 902
> Ahg350435 jgi|Araly1|350435|fgenesh1_pg.C_scaffold_6001028
Length=1200
Score = 1483 bits (803), Expect = 0.0
Identities = 869/902 (96%), Gaps = 0/902 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 866 AAGCAAGGGGAGAAGCTGTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGATTTGACTTACTGGTGCTG 925
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 229 AAGCAAGGGGAGGAGCTCTTTGGAGATTACGAGTGGGAGAGGTTTGACTTACTGGTGCTA 288
Query 926 CCTCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGACGCCTACT 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 CCTCCGAGTTTTCCTTATGGAGGTATGGAGAATCCAAGAATGGTTTTCCTGACGCCTACT 348
Query 986 GTTATCAAAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCACATAGCTGG 1045
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 GTTATCAGAGGAGACGCCACTGGAGCTCAAGTTGTAGCTCACGAGCTCGCACATAGCTGG 408
Query 1046 ACTGGGAATTTGATCACTAATATCAACAATGAACACTTCTGGTTGAATGAGGGATTTACA 1105
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 ACTGGGAATTTGATCACTAACATCAACAACGAACATTTCTGGTTGAATGAGGGATTTACA 468
Query 1106 ACTTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAGGTTGTTCAAGGGGCGGATATAGCTACTTTGAAC 1165
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 469 ACTTACGCAGAGAGGAGAATTGTGGAAGTTGTCCAAGGGGCGGATAGAGCTACTCTGAAT 528
Query 1166 ATTGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACAACTTGGAG 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 ATTGGCATTGGTTGGAGGGGTTTAACTGATGAAATGGAACGGTTTAAGGACAACTTGGAG 588
Query 1226 TGCACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATTCTCAGGTC 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 TGCACTAAACTGTGGAACAAACAAGAAGGTGTTGATCCAGATGATGTATATTCTCAGGTC 648
Query 1286 CCATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAACGCCAGATTGGAAGAACTGCT 1345
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 649 CCATATGAAAAAGGATTCCAATTTGTGTTGCGAATTGAGCGCCAGATTGGAAGGACTGCA 708
Query 1346 TTTGACGAATTCCTCAAGAAATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCGATACAAAC 1405
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 709 TTTGACGAATTCCTCAAGATATACATTGCTACTTTCAAGTTCAAGTCAATCGATGCAAAC 768
Query 1406 ACATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCAATCTACAG 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 769 ACATTTCTTGAATTCCTGAAAGCAAACATCCCTGGCATAGAGAAAGAGATCAACCTACAG 828
Query 1466 CTGTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCAGAGGATGCATATGAACCAGTCTCAACCATTTAC 1525
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 829 CTGTGGACTGAGGGCGTTGGTATACCTGAGGATGCATATGAACTGGCCTCAACCATTTAC 888
Query 1526 ACAAAGATCATATCCCTGGCGAAAGAGTTTAAGGAAGGAAAGATGCCAAGTGAGGATGAT 1585
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 889 ACAAAGATCATATCCTTGGCAAAAGAGTTTAAGGAAGGAAGGATGCCAGGTGAGGATGAT 948
Query 1586 GTTGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTCCTAAATCATGT 1645
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 949 GGTGCTGAGTGGAACGGACAGGAATGGGAGCTGTACTTGGAGAATCTTACTAAATCATGT 1008
Query 1646 GAACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTGGCAGAATCGAAAGACTAT 1705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 1009 GAACCTTCTCAGGTCATGGCCTTGGACAAGCGGTACAGACTAGCAGAATCGAAGGACTAT 1068
Query 1706 GAAGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAACTTGCAGTCACATCCAAGTGCAGAGAGTACCATGGG 1765
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 GAAGTGAAGGTCTCGTTTCTGCAGCTTGCAGTCGCATCCAAGTGCAGAGAGTACCATGGG 1128
Query 1766 GA 1767
||
Sbjct 1129 GA 1130
> Ahg488173 jgi|Araly1|488173|fgenesh2_kg.6__1307__AT5G13510.1
Length=757
Score = 82.4 bits (44), Expect = 1e-14
Identities = 59/65 (91%), Gaps = 5/65 (8%)
Strand=Plus/Minus
Query 2051 AAAAATT-GAATTGCCTTTTGTTGCGTACATTACATTCTCCAAAAGAT--T-AGTACAAG 2106
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
Sbjct 757 AAAAATTGGAATTTCCTTTTGTTGCGTACATTACATTCTCCAAAAGATGATTAGTACA-G 699
Query 2107 CTTAA 2111
|||||
Sbjct 698 CTTAA 694
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 79760973030
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5