BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G13680.1
Length=4121
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488188 jgi|Araly1|488188|fgenesh2_kg.6__1322__AT5G13680.1 6623 0.0
> Ahg488188 jgi|Araly1|488188|fgenesh2_kg.6__1322__AT5G13680.1
Length=3985
Score = 6623 bits (3586), Expect = 0.0
Identities = 3858/3992 (97%), Gaps = 8/3992 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAAAATTTGAAGCTTTTCTCGGAGGTTCCTCAGAACATCCAATTGCATTCGACTGAA 60
||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGAAAAATTTGAAGCTTTACTCCGAGGTTTCTCAGAACATCCAATTGCATTCGACCGAA 60
Query 61 GAAGTTGTACAGTTCGCAGCTTATGACATCGACCAAAGTCGCTTATTTTTCGCATCTTCT 120
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GAAGTTGTACAGTTCGCAGCTTACGACATCGACCAAAGTCGCTTATTTTTCGCATCTTCT 120
Query 121 GCTAATTTCGTTTACGCCCTTCAGCTCTCTTCCTTCCAAAATGAAAGCGCTGGGGCAAAG 180
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || |
Sbjct 121 GCTAATTTCGTTTACTCCCTTCAGCTCTCTTCCTTCCAAAATGGAATATCT--GG----G 174
Query 181 AGTGCTATGCCTGTGGAGGTCTGCAGTATTGATATTGAGCCTGGGGATTTCATCACGGCT 240
|||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 AGTGCTTTGCCTGCGGAGGTCTGCAGTATCGATATGGAGCCTGGGGATTTCATCACGGCC 234
Query 241 TTCGATTATCTCGCGGAGAAGGAGTCTCTATTAATTGGGACTTCTCATGGGCTTTTGCTA 300
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 235 TTCGATTATCTGGCGGAGAAGGAGTCTCTATTAATTGGGACTTCTCATGGGCTTCTGCTA 294
Query 301 GTGCATAATGTGGAGAGTGATGTGACTGAGCTAGTTGGAAATATAGAAGGAGGTGTCAAG 360
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 CTGCATAATGTGGAGAGCGATGTGACTGAGCTAGTTGGAAATATAGAAGGAGGTGTCAAG 354
Query 361 TGTATCTCGCCTAATCCGACTGGAGATCTACTTGGATTGATTACTGGTCTTGGGCAGTTG 420
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 TGTATCTCGCCTAGTCCGACTGGAGATCTACTTGGATTGATTACTGGTCTTGGGCAGTTG 414
Query 421 CTTGTAATGACTTATGATTGGGCTTTGATGTACGAGAAGGCGCTTGGAGAGGTTCCTGAA 480
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 CTTGTAATGACTTATGATTGGGTTTTGATGTACGAGAGGGCGCTTGGAGAGGTTCCTGAA 474
Query 481 GGTGGTTACGTACGTGAAACGAATGATTTGTCTGTAAATTGTGGGGGTATTTCCATTTCC 540
||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 GGTGGTTACGTACGTGAGGCGGAGGATGTGTCTGTAAATTGTGGGGGTATTTCCATTTCC 534
Query 541 TGGAGGGGTGATGGAAAGTATTTTGCGACTATGGGTGAGGTTTATGAGTCTGGTTGTATG 600
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 535 TGGAGAGGTGATGGAAAGTATTTTGCGACTATGGGTGAGGTTTATGAATCCGGTTGTATG 594
Query 601 TCTAAGAAGATTAAGATATGGGAAAGTGATTCCGGTGCTTTGCAGTCTTCTTCAGAAACA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 TCTAAGAAGATTAAGATATGGGAAAGTGATTCCGGCGCTTTGCAGTCTTCTTCAGAAACA 654
Query 661 AAAGAATTTACGCAGGGGATTCTTGAATGGATGCCGAGTGGTGCTAAAATCGCAGCTGTT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 AAAGAATTTACGCAGGGGATTCTTGAATGGATGCCGAGTGGTGCTAAAATCGCAGCTGTT 714
Query 721 TATAAGAGGAAGTCAGATGATAGCAGTCCATCGATTGCTTTCTTTGAGAGGAATGGACTT 780
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 715 TATAAGAGGAAGTCAGATGATAGCTGTCCATCAATTGCTTTCTTCGAGAGGAATGGACTT 774
Query 781 GAGAGAAGCTCGTTTAGAATTGGTGAACCAGAAGATGCTACGGAATCATGTGAAAATCTG 840
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 775 GAGAGGAGCTCGTTTAGAATTGGTGAACCAGAAGATGCTACGGAATCATGTGAAACTCTG 834
Query 841 AAATGGAATTCTGCATCAGATCTTCTTGCAGGGGTTGTTAGTTGTAAAACATATGATGCC 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 835 AAATGGAATTCTGCATCAGATCTTCTTGCAGGGGTTGTTAGTTGCAAAACATATGATGCC 894
Query 901 ATTAGGGTGTGGTTCTTTAGCAACAACCACTGGTACCTGAAACAGGAGATTAGGTATCCA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 ATTAGGGTGTGGTTCTTTAGCAACAACCACTGGTACCTGAAACAGGAGATTAGGTATCCA 954
Query 961 AGGGAAGCTGGGGTAACAGTCATGTGGGATCCAACAAAGCCACTGCAGTTAATATGTTGG 1020
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 AGGGAAGCTGGGGTAACGGTCATGTGGGATCCAACAAAGCCACTGCAGTTAATATGTTGG 1014
Query 1021 ACTCTGTCAGGGCAGGTGTCTGTTCGCCACTTTATGTGGGTAACAGCGGTCATGGAGGAC 1080
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 ACTCTGTCAGGGCAGGTGTCTGTTCGCAACTTTATGTGGGTAACAGCGGTCATGGAGGAC 1074
Query 1081 TCAACAGCCTTTGTCATAGATAACTCCAAGATACTCGTGACACCACTATCTTTGTCCTTG 1140
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 TCCACAGCGTTTGTCATAGATAACTCCAAGATACTCGTGACACCACTATCTTTGTCCTTG 1134
Query 1141 ATGCCACCTCCTATGTATTTGTTCAGCCTTAGTTTTTCTTCTGCTGTCAGAGATATAGCA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 ATGCCACCTCCTATGTATTTGTTCAGCCTTAGTTTTTCTTCTGCTGTCAGAGATATAGCA 1194
Query 1201 TATTACTCAAGGAATTCTAAGAATTGTCTGGCTGTGTTTTTGTCAGATGGAAACCTGTCT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 TATTACTCAAGGAATTCTAAGAATTGTCTGGCTGTGTTTTTGTCAGATGGAAACCTGTCT 1254
Query 1261 TTTGTTGAGTTCCCTGCACCTAATACTTGGGAAGATCTCGAAGGCAAAGACTTCAGTGTG 1320
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1255 TTTGTTGAGTTTCCTGCACCTAATACTTGGGAAGATCTCGAAGGCAAAGACTTCATTGTG 1314
Query 1321 GAAATTTCAGACTGTAAAACAGCACTGGGCTCTTTTGTACATCTTCTATGGTTGGATGTC 1380
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1315 GAAATATCAGACTGTAACACAGCACTGGGCTCTTTTGTACATCTTCTATGGTTGGATGCC 1374
Query 1381 CACTCACTTCTGTGTGTCTCCGCTTATGGTTCTAGCCACAACAAGTGTCTCTCTTCGGGA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 CACTCACTTCTGTGTGTCTCCGCTTATGGTTCTAGCCACAACAAGTGTCTCTCTTCGGGA 1434
Query 1441 GGGTATGACACAGAGCTTCATGGTTCTTATTTACAAGAAGTTGAAGTAGTCTGTCATGAG 1500
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1435 GCGTATGAGACAGAGCTTCATGGTTCTTATTTACAAGAAGTCGAAGTAGTCTGTCACGAG 1494
Query 1501 GATCATGTTCCTGATCAAGTGACTTGCTCTGGCTTTAAGGCTAGCATTACTTTCCAGACA 1560
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1495 GATCATGTTTCTGATCAAGTGACTTGCTCTGGCTTTAAGGCTAGCGTTACTTTCCAGACA 1554
Query 1561 CTTCTCGAATCACCGGTCCTGGCTCTTGCCTGGAATCCTAGTAAGCGTGATTCAGCCTTT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTTCTCGAATCACCGGTCCTGGCTCTTGCCTGGAATCCTAGTAAGCGTGATTCAGCCTTT 1614
Query 1621 GTGGAGTTTGAGGGTGGGAAAGTGCTTGGATATGCGTCAAGGTCAGAAATTATGGAAACT 1680
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1615 GTAGAGTTTGAGGGTGGGAAAGTGCTTGGATATGCATCAAGGTCAGGAATTATGGAAACT 1674
Query 1681 CGTAGTAGTGATGATAGTGTATGTTTTCCATCGACTTGTCCTTGGGTGAGGGTGGCACAG 1740
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1675 CGTATTAGTGATGATAGTGTATGTTTTCCATCGACTTGTCCTTGGGTGAGGGTGGCGCAG 1734
Query 1741 GTTGATGCTAGTGGGGTGCATAAACCCTTGATATGTGGGCTTGATGATATGGGTAGACTG 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 GTTGATGCTAGTGGGGTGCATAAACCCTTGATATGTGGGCTTGATGATATGGGTAGACTG 1794
Query 1801 TCCATCAACGGGAAGAACCTATGTAATAACTGTAGCAGTTTCTCATTTTATTCAGAGTTG 1860
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 TACATCAACGGGAAGAACCTATGTAATAACTGTAGCAGTTTCTCATTTTATTCAGAGTTG 1854
Query 1861 GCCAATGAAGTAGTTACCCATCTGATTATTTTGACCAAACAGGATTTTCTCTTTATTGTC 1920
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 GCCAATGAAGTGGTTACCCATCTGATTATTTTGACCAAACAGGATTTTCTCTTTATTGTC 1914
Query 1921 GATACCAAGGATGTACTGAATGGAGATGTGGCACTTGGAAATGTGTTCTTTGTTATTGAT 1980
|||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1915 GATACCAAGGATGTACTGCAGGGAGATGTGGCACTTGGAAATGTGTACTTTGTTATTGAT 1974
Query 1981 GGTAGAAGGCGAGACGAGGAAAATATGAGCTATGTTAATATTTGGGAAAGAGGTGCAAAA 2040
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1975 GGTAGAAGGCGAGATGAGGAAAATATGAGCTATGTTAATATATGGGAAAGAGGTGCAAAA 2034
Query 2041 GTGATAGGAGTCCTCAATGGAGATGAAGCTGCTGTGATATTACAAACTATGCGGGGGAAT 2100
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 GTGATAGGAGTCCTCAATGGAGACGAAGCTGCTGTAATATTACAAACTATGCGGGGGAAT 2094
Query 2101 CTCGAATGCATATATCCCAGAAAGCTGGTCCTCTCTTCCATTACGAATGCGTTAGCTCAG 2160
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 CTGGAATGCATATATCCCAGAAAGCTGGTCCTCTCTTCCATTACGAATGCGTTAGCTCAG 2154
Query 2161 CAACGGTTCAAAGATGCATTTAACTTGGTAAGGCGTCATAGAATCGACTTTAATGTTATC 2220
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 CAACGGTTCAAAGATGCATTAAACTTGGTAAGGCGTCATAGAATCGACTTTAATGTTATC 2214
Query 2221 GTGGATCTATATGGGTGGCAGGCATTTCTACAGTCAGCCGTAGCATTTGTTGAGCAAGTA 2280
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 2215 GTGGATCTATATGGGTGGCAGGCATTTCTACAGTCAGCTGTAGAATTTGTTGAGCAAGTA 2274
Query 2281 AACAATTTGAACCATGTTACAGAATTTGTTTGTGCCATGAAGAATGAAGATGTTACAGAA 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 AACAATTTGAACCATGTTACAGAATTTGTTTGTGCCATGAAGAATGAAGATGTTACAGAA 2334
Query 2341 ACGCTGTACAAAAAGTTTTCCTTTTCCAAAAAGGGAGACGAGGTTTTTCGTGTGAAAGAT 2400
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||
Sbjct 2335 ACACTGTACAAAAAATTTTCCTTTTCCAAAAAGGGAGACAAAGTTTTTCAAGTGAAAGAT 2394
Query 2401 AGTTGCAGTAACAAAGTATCATCAGTTCTACAGGCAATTAGGAAGGCCCTTGAAGAACAT 2460
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 CGTTGCAGTAACAAAGTATCATCAGTTCTACTGGCAATTAGGAAGGCCCTTGAAGAACAT 2454
Query 2461 ATCCCAGAAAGTCCATCAAGGGAACTCTGTATTTTGACCACTCTTGCCCGAAGTGATCCA 2520
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 ATACCAGAGAGTCCATCAAGGGAACTCTGTATTTTGACCACTCTTGCCCGAAGTGATCCA 2514
Query 2521 CCAGCTATCGAAGAATCTCTTTTGAGGATAAAATCTGTTCGTGAAATGGAGTTGCTAAAC 2580
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 CCAGCTATTGAAGAATCTCTTTTGAGGATAAAATCTGTTCGTGAAATGGAGTTGCTAAAC 2574
Query 2581 TCTTCTGATGATATAAGGAAAAAGTCTTGTCCATCTGCAGAAGAAGCCTTGAAACATCTT 2640
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 TCTTCTGATGATATAAGGAAAAAGTCTTGTCCATCTGCAGAAGAAGCCTTGAAACATCTA 2634
Query 2641 CTGTGGTTATTGGATTCTGAGGCTGTCTTTGAAGCTGCCTTAGGTCTTTATGATCTGAAC 2700
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 CTGTGGTTATTGGATTCTGATGCTGTCTTTGAAGCTGCCTTAGGTCTTTATGATCTGAAC 2694
Query 2701 CTTGCAGCTATTGTGGCACTCAATTCCCAGCGTGATCCAAAAGAATTTTTACCTTATCTC 2760
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2695 CTTGCAGCTATTGTGGCACTCAATTCCCAGCGTGATCCAAAAGAATTTCTACCTTATCTC 2754
Query 2761 CAGGAGCTGGAAAAAATGCCCGAATCCCTGATGCATTTCAAGATTGACATTAAATTGCAG 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 CAGGAGCTGGAAAAAATGCCCGAATCCCTGATGCATTTCAAGATTGACATTAAATTGCAG 2814
Query 2821 CGTTTTGATAGTGCTCTTAGGAACATTGTATCAGCAGGGGTTGGCTACTTTCCTGATTGC 2880
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2815 CGTTTTGATAGTGCTCTTAGGAACATTGTATCAGCAGGGGATGGCTACTTTCCTGATTGC 2874
Query 2881 ATGAACTTAATAAAGAAAAACCCTCAACTTTTCCCTCTGGGCCTCCTGCTAATTACTGAT 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 2875 ATGAACTTAATAAAGAAAAACCCTCAACTTTTCCCGCTGGGCCTCCGGCTAATTACCGAT 2934
Query 2941 CCTGAGAAGAAACTAGTTGTTCTAGAGGCTTGGGCAGATCACCTCATTGATGAAAAACGT 3000
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2935 CCTGAGAAGAAACAAGCTGTTCTAGAGGCTTGGGCAGATCATCTCATTGATGAAAAACGT 2994
Query 3001 TTTGAGGATGCTGCTACTACATACCTATGTTGCTGTAAACTGGAAAAGGCTTCAAAGGCA 3060
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 TTTGAGGATGCTGCTACTACGTACCTATGTTGCTGTAAACTGGAAAAGGCTTCAAAGGCA 3054
Query 3061 TATCGTGAATGTGGTGACTGGAGTGGGGTACTCCGAGTGGGGGCGCTAATGAAATTAGGT 3120
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3055 TATCGTGAATGTGGTGACTGGAGTGGGGTACTCAGAGTGGGGGCGCTAATGAAATTAGGT 3114
Query 3121 AAAGATGAGATCTTGAAATTGGCATATGAACTCTGTGAAGAGGTCAATGCTCTTGGGAAA 3180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 3115 AAAGATGAGATCTTGAAATTGGCATATGAACTCTGTGAAGAGGTGAACGCTCTTGGGAAA 3174
Query 3181 CCAGCGGAAGCAGCAAAAATAGCGCTTGAGTATTGCAGCGATATAAGCGGTGGAATTAGT 3240
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 CCAGCGGAAGCAGCAAAAATAGCTCTTGAGTATTGCAGAGATATAAGCGGTGGAATTAGT 3234
Query 3241 TTGCTTATCAATGCGAGGGAATGGGAAGAGGCTTTAAGGGTTGCATTTTTGCATACAGCA 3300
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3235 TTGCTTATCAATGCAAGGGAATGGGAAGAGGCTTTAAGGGTTGCATTTTTGCATACAGCA 3294
Query 3301 GATGATAGAATCTCAGTGGTGAAAAGTTCTGCTTTGGAGTGTGCTAGTGGTCTAGTAAGT 3360
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3295 GATGATAGAATCTCAGTGGTGAAGAGTTCTGCTCTGGAGTGTGCTAGTGGTCTAGTAAGT 3354
Query 3361 GAATTCAAAGAATCAATAGAAAAGGTAGGAAAATATTTGACTCGCTATCTAGCTGTCCGG 3420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 3355 GAATTCAAAGAATCAATAGAAAAGGTAGGAAAATATTTGACTCGCTATTTAGCTGTTCGG 3414
Query 3421 CAGAGACGATTATTGCTTGCAGCAAAGCTCAAATCCGAGGAACGATCTGTTGTTGATCTT 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||
Sbjct 3415 CAGAGACGATTATTGCTTGCAGCAAAGCTCAAATCTGAGGAACGGTCAGTAGTTGATCTG 3474
Query 3481 GACGATGACACAGCTTCAGAAGCAAGTAGCAACCTGAGTGGAATGAGCGCCTATACTTTG 3540
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3475 GACGATGACACAGCTTCAGAGGCTAGTAGCAACCTGAGTGGAATGAGCGCCTATACTTTG 3534
Query 3541 GGGACAAGGAGAGGTTCTGCTGCTTCAGTCAGCTCAAGCAACG-CTACTAGCAGGGCAAG 3599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3535 GGGACAAGGAGAGGTTCTGCTGCTTCAGTCAGCTCAAGCA-CGGCTACTAGCAGGGCAAG 3593
Query 3600 AGATTTGAGGCGCCAGAGAAAGAGTGGGAAAATCCGTGCTGGCAGTGCGGGTGAGGAGAT 3659
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3594 AGATTTGAGGCGCCAGAGAAAGAGCGGGAAAATCCGTGCTGGCAGTGCGGGTGAAGAGAT 3653
Query 3660 GGCTCTTGTTGATCATTTGAAAGGTATGCGTATGACCGATGGAGGAAAGCGAGAGCTGAA 3719
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 3654 GGCTCTTGTTGATCATTTGAAGGGTATGCGTATGACCGAAGGTGGAAAGCGAGAGCTGAA 3713
Query 3720 GTCGTTGTTGATATGTCTGGTAACACTTGGTGAAATGGAGTCTGCACAGAAGTTGCAACA 3779
||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3714 GTCTTTGTTGATATGTCTGGTTACAGTTGGTGAAATGGAGTCTGCACAGAAGTTGCAACA 3773
Query 3780 GACTGCAGAGAATTTCCAGGTCTCCCAAGTAGCAGCTGTAGAGCTAGCACACGATACAGT 3839
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3774 GACTGCAGAGAATTTCCAGGTCTCGCAAGTAGCAGCTGTAGAGCTAGCACACGATACAGT 3833
Query 3840 GTCCAGCGAGAGCGTAGATGAAGAAGTTTATTGCTTTGAACGTTACGCTCAGAAGACGAG 3899
||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3834 GTCCAGCGAGAACGTGGACGAAGAAGTTTATTGTTTTGAACGTTATGCTCAGAAGACGAG 3893
Query 3900 ATCCACAGCACGAGATTCAGATGCCTTTAGCTGGATGCTTAAGGTCTTCATAAGCCCATG 3959
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3894 ATCCACAGCAAGAGATTCAGATGACTTTAGCTGGATGCTTAAGGTCTTCATTAGCCCATG 3953
Query 3960 AAAATCTCTACATCTGTTTTTGACTGAATAAG 3991
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3954 AAAATCTCTACATCTGTTTTTGACTGAATAAG 3985
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 155807703862
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5