BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G15280.1
Length=3849
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488376 jgi|Araly1|488376|fgenesh2_kg.6__1510__AT5G15280.1 5734 0.0
> Ahg488376 jgi|Araly1|488376|fgenesh2_kg.6__1510__AT5G15280.1
Length=3672
Score = 5734 bits (3105), Expect = 0.0
Identities = 3499/3690 (95%), Gaps = 24/3690 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCTTAATCTTCTCTCCATCAGTAGCTCTTCTCGGCTTCGTTTTCTTAACAAGGTTTCT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTAATCTTCTCTCCATCAGTAGCTCTTCTCGGCTTCGTTTTCTTAACAAGGTTTCT 60
Query 61 TCACTCACATATCATTACTCTTTCGCGTTTTTCTCTACTAGCTCACCTGCTTCGTCCTCT 120
|| ||| ||| || ||||||||||||| ||||| || | || | | |||||| | |
Sbjct 61 TCTCTCTCATGTCGTTACTCTTTCGCG-TTTTC-CT-C-AG-T--GC--CTTCGT-C-C- 108
Query 121 TCTTCTTCCTTGGGAAATGATTCAGCGATCCCAAGAAATTATGAGTCTTCCTCGTTTAAT 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 109 TCTTCTTCCTTGGGAAATGATTCAGCGATCCCAAGAAATTATGAATCTTCCTCGTTTAAT 168
Query 181 TTACTTTCGAGGTCGAAGGAGAAGCGTGACCTTACTGGTTCCTCTCTAAAAGACTTGCTT 240
||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 TTACTTTCGAGGTCGAATGAAAAGCTTGACCTTACTGGTTCCTCTCTAAAAGACTTGCTT 228
Query 241 TTTGATTTGTCAGATGTAGTTCCCAATATTACCCGTAGGTTTAGAAGATTTCCGGGCTTG 300
|| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct 229 TTGGATTTGTCCGATGTAATTCCCAATATTATCCGTAGATTTAGGAGATTTCCTGGCTTG 288
Query 301 AAACCCGAAGATGTGCTTGAATTATCATTGGGTTTTGAATCTGAGCTTCAGAGAGGTGGA 360
||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 289 AAACCCGAAAATGTGCTTGAACTGTTACTGGGTTTTGAATCTGAGCTTCAGAGAGGTAGA 348
Query 361 ATTGGAAATATAAAGGTTCAAGCTTTATGGGAGATTTTCAGATGGGCTAGTGTGCAATAC 420
||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 349 ATTGGGAGTACAAAGGTTCAAGCTTTATGGGAGATTTTCAGATGGGCTAGTGGGCAATAC 408
Query 421 CAAGGGTTTAAGCATTTACCTCAGGCTTGTGAAATTATGGCGTCGATGCTTATCAGGGAA 480
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 409 CAAGGGTTTAAGCATCTACCTCATGCTTGTGAAATTATGGCATCGATGCTTATCAGGGAA 468
Query 481 GGAATGGTTAAGGAAGTTGAATTGTTGCTTATGGAGATGGAGAGACATGGAGACACAATG 540
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 GGAATGGTTAAGGAAGTTGAATTTTTGCTTATGGAGATGGAGAGACATGGAGACACAATG 528
Query 541 GTTAACGAGGGGATTTTCTGTGATTTGATTGGTAAATATGTTGATGATTTCGATTCCAGG 600
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 529 GTTAAGGAGGGGATTTTCTGTGATTTGATTGGTAAATATGTTGATGCTTTCGATTCCAGG 588
Query 601 AAAGCAGTTATGCTGTTTGATTGGATGAGGCGTAAGGGTTTAGTACCTCTAACTTCGTGT 660
|| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 589 AAGGCGGTTATGCTGTTTGATTGGATGACGCGTAAGGGTTTAGTACCTTTAACTTCGTGT 648
Query 661 TATCAGATTCTAATTGATCAATTGGTTAGAGTTCATAGAACAGAATCAGCTTATAGAATT 720
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 TATCAGATTCTAATTGATCATTTGGTTAGAGTTCATAGAACAGAATCAGCTTATAGAATT 708
Query 721 TGTTTGGATTGGGTGGAGACAAGGGCTGAATTAAATCACATGAACATAGATAGCATCGGG 780
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 TGTTTGGATTGGGTGGAGACAACGGCTGAATCAAATCACATGAACATAGATAGCATCGGG 768
Query 781 AAAGTTATAGAGTTGCTTTGTTTGGACCAGAAGGTTCAGGAGGCTAGAGTTCTGGCAAGA 840
|||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 769 AAAGTTATCGAGTTGCTTTGCTTGGACCAGAGGGTTCAGGAGGCTAGAGTCCTGGAAAGA 828
Query 841 AAGCTTGTGGCTTTAGGTTGTATCCTGAATAGCTCAATATATAGTAAGATTACTATAGGA 900
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 829 AAGCTTGTGGCTTTAGGTTGTAACCTGAATAGCTCAATATATAGTAAGATCACTATAGGA 888
Query 901 TACAACGAGAAGCAAGACTTTGAGGATTTGTTGAGTTTCATTGGTGAAGTTAAATATGAA 960
|||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACAGCGAGAAGCAAGATTTTGATGATTTGTTGAGTTTCATTGGTGAAGTTAAATATGAA 948
Query 961 CCTGATGTGTTTGTTGGCAATAGGATTCTGCATTCTCTCTGCAGGAGGTTTGGCTCAGAG 1020
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 CCTGATGTGTTTGTTGGCAATAGGATTGTGCATTCTCTCTGCAGGAGGTTTGGCTCAGAG 1008
Query 1021 AGAGCTTATGTATATATGGAGGAACTCGAACACTTGGGTTTTAAACAAGATGAAGTTACC 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1009 AGAGCTTATGTATATATGGAGGAACTCGAACACTTGGGTTTTAAACCTGATGAAGTTACA 1068
Query 1081 TTTGGTATCTTGATTGGTTGGTGTTGCTATGAAGGAGATATTAAAAGAGCGGTTCTTTAT 1140
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1069 TTTGGTATCTTGATTGGGTGGTGTTGTTATGAAGGAGATATCAAGAGGGCGGTTCTTTAT 1128
Query 1141 TTATCCGAGATTATGTCAAAGGGTTAT-AAACCCGATGTGTATAGTTATAATGCTATCCT 1199
||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 1129 TTATCCGAGATTACGTCAAAGGGTT-TCAAACCCGATGTGTGTAGTTATGATGCTATCCT 1187
Query 1200 AAGTGGGCTTTTTAGAAAAGGATTGTGGCAACATACCCATTGTATTCTGGATGAGATGAA 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 AAGTGGGCTTTTTAGAAAAGGATTGTGGCAACATACCCATTGTATTCTGGATGAGATGAA 1247
Query 1260 GGAAAATGGAATGATGCTCAGCTTGTCTACTTTTAAGATAATGGTAACTGGATACTGCAA 1319
||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1248 GGAAAATGGAATGCTGCTCAGCTTGTCTACGTGTAAGATTATGGTAACTGGATATTGCAA 1307
Query 1320 AGCTAGACAGTTTGAAGAAGCGAAGAGGATTGTCAACAAGATGTTTGGTTATGGGTTAAT 1379
|||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308 AGCTAGACAGTTTGAAGAAGCGAAGATGATTGTTAATAAGATGTTTGGTTATGGGTTAAT 1367
Query 1380 CGAAGCATCTAAAGTTGAGGATCCACTTTCAGAAGCTTTTAGTTTGGTAGGATTTGATCC 1439
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 CGAAGCATCTAAAGTTGAAGATCCGCTTTCAGAAGCTTTTAGTTTGGTAGGATTTGATCC 1427
Query 1440 GTTAGCTGTTAGATTGAAAAGGGACAATGATTCCACATTTTCCAAAGCTGAGTTCTTTGA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1428 GTTAGCTGTTAGATTGAAAAGGGACAATGATTCCACATTTTCCAAAGCTGAGTTCTTCGA 1487
Query 1500 TGATCTTGGGAATGGGCTATACTTGCACACTGATTTGGATGCTTACGAGCAGAGGGTGAA 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 TGATCTTGGGAATGGGCTATACTTGCACACTGATTTGGATGCTTACGAGCAGAGGGTGAA 1547
Query 1560 TATGGTACTTGACAGGTCCGTGCTACCGGAGTTTAATTCGCTTATCGTTAGAGCATCTGA 1619
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | |
Sbjct 1548 TATGGTACTTGACAGGTCCGTGCTACCGGAATTCAATTCGCTTATTGTTAGAGCATGTAA 1607
Query 1620 GGACGGTGATTTACAAACAGCATTGCGGCTTCTTGATGAAATGGCTCGATGGGGTCAGAA 1679
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 1608 GGACGGTGACTTACAAACAGCATTGCGGCTTCTTGATGAAATGACTCGATGGGGTCAAAA 1667
Query 1680 ACTATCGCGTCGGAGTTTTGCTGTTTTAATGAGGAGTCTCTGTGCATCGCGTGCCCATCT 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 ACTATCGCGTCGGAGTTTTGCTGTTTTAATGAGGAGTCTCTGTGCATCGCGTGCCCATCT 1727
Query 1740 CAGAGTAAGTATTAGTTTATTGGAAAAATGGCCAAAGCTGGCTTATCAGTTAGATGGAGA 1799
|||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1728 CAGAGTAAGTGTTAGCCTCTTGGAAAAATGGCCAAAGCTGGCTAATCAGTTAGATGGAGA 1787
Query 1800 AACCCTTAATTTTCTTGTCCAAGAATATTGCAAGAAGGGATTTAGTCGCCATAGCAAACT 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1788 AACCCTTAATTTTCTTGTCCAAGAATATTGCAAGAAGGGATTTAGCCGCCATAGCAAACT 1847
Query 1860 CATTTTCCATAAAATGGTTCAAATGCATCATCCTATCGATAACGTAACTTACACATCTTT 1919
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 CATTTTCCATAGAATGGTTCAAATGCATCATCCTATCGATAACGTAACTTACACATCTTT 1907
Query 1920 GATACGTTGTTTCTGTAAGAAAGAAACACTCAATGATCTTCTGAATGTCTGGGGTGCTGC 1979
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 1908 GATACGTTGTTTCTGTAAGAAAGAAACACTCAATGATCTTCTGAATGTGTGGGGTGTTGC 1967
Query 1980 CCAGAATGATAACTGGTTACCTGATTTGAACGATTGCGGAGATCTGTGG-AACTGTCTTG 2038
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1968 CCAGAATGATAACTGGTTACCTGATTTGAATGATTGCGGAGATCTGTGGGAA-TGTCTTG 2026
Query 2039 TCCGGAAAGGATTGGTGGAGGAAGTGGTTCAACTCTTTGAGCGTGTATTCATATCTTATC 2098
||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2027 TCCGGAAAGGACTGGTGGCGGAAGCGGTTCAACTCTTTGAGCGTATATTCATATCTTATC 2086
Query 2099 CTCTATCTCAGTCAGAAGCGTGTAGGATTTTTGTCGAGAAGCTGACAGTTCTTGGGTTTT 2158
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 2087 CTCTATCTCAGTCAGAAGCGTGTAGGATTTTGGTCGAGAAGTTCACAGTTCTTGGGTTTT 2146
Query 2159 CTTGTATCGCTCATTCTGTTGTTAAAAGGCTTGA-AGGAGAGGGTTGCATTGTGGAACAA 2217
||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2147 TTTGTATCGCTCATTCTGTTTTTAAAAGGCTT-ATAGGAGAGGGTTACATTGTGGAACAA 2205
Query 2218 GAGGTTTACAATCATCTTATCAAAGGACTCTGCACGGAAAAGAAGGATTCAGCTGCATTT 2277
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2206 GAGGTTTACAATCATCTTATCAAAGGTCTCTGCACGGAGAAGAAGGATTCAGCTGCATTT 2265
Query 2278 GCTATACTCGATGAAATGCTAGACAAGAAACACATTCCAAGTTTGGGAAGTTGTTTGATG 2337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2266 GCTATACTCGATGAAATGCTAGACAAGAAACACATTCCAAGCTTGGGAAGTTGTTTGATG 2325
Query 2338 TTGATTCCTCGGCTTTGTAGAGCTAACAAAGCAGGAACAGCATTTAATTTAGCAGAGCAA 2397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 2326 TTGATTCCTCGGCTTTGTAGAGCTAACAAAGCAGGAATGGCATTTATTTTAGCAGAGCAA 2385
Query 2398 AT-AGATTCATCCT-ATGTACACTATGCTTTGATAAAAGGATTAAGCTTAGCTGGGAAAA 2455
| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2386 -TCAGATTCA-CCTTATGTACACTATGCTTTGATAAAAGGACTATGCTTAGCTGGGAAAA 2443
Query 2456 TGCTCGATGCAGAAAATCAGTTACGTATAATGTTATCAAACGGGCTTTCATCGTATAACA 2515
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2444 TGCTCGATGCAGAAAATCAGTTACGTATAATGTTATCAAACGGGCTTTTACCGTATAACA 2503
Query 2516 AAATCTACAA-TGTGATGTTTCAAGGTTATTGTAAAGGTAACAACTGGATGAAAGTTGAG 2574
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2504 AAATCTACAACT-TGATGTTTCAAGGTTATTGTAAAGGTAACAACGGGATGAAAGTTGAG 2562
Query 2575 GAAGTACTAGGACTCATGGTGAGGAAGAACATAATCTGTTCAGTTAAGAGTTACAGAGAA 2634
|||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2563 GAAGTACTAGGACTCATGGTGAGGAAGAACGTTATATGTTCGGTTAAGAGTTACAGAGAA 2622
Query 2635 TATGTTCGAAAAATGTGTTTAGAGCCTCAGTCTCTCTCTGCAATTAGTCTGAAGGAGTTT 2694
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623 TATGTTCGAAAAATGTGTTTAGAGCCTCAGTTTCTCTCTGCAATTAGTCTGAAGGAGTTT 2682
Query 2695 CTGTTGCTAGGAGAAAGCAATCCTGGTGGCGTAATCATCTATAATATGCTGATTTTCTAT 2754
||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2683 CTGTTATTAGGAGAAAGCAATCCTAGCGGCGTAATCATCTATAATATGCTAATTTTCTAT 2742
Query 2755 ATGTTCAGGGCAAAGAATCACTTGGAGGTTAACAAAGTCTTGCTCGAAATGCAGGGAAGA 2814
||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2743 ATGTTTTGGGCTACGAATCACTTGGAGGTTAATAAAGTCTTGCTCGAAATGCAGGGAAGA 2802
Query 2815 GGAGTGTTGCCTGATGAAACCACATTTAACTTTCTCGTTCACGGATACTCTTCGTCTGCA 2874
||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2803 GGATTGCTGCCTGATGAAACCACGTTTAACTTTCTCGTTCACGGATACTCTTCGTGTGGA 2862
Query 2875 GATTATTCGAGTTCTCTGCGATATCTCTCAGCTATGATCTCCAAGGGGATGAAACCGAAT 2934
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2863 GATTATTCGAGTTCTCTGCGATATATCTCGGCTATGATCTCCAAGGGGATGAAACCGAAT 2922
Query 2935 AATCGAAGCTTAAGAGCGGTTACAAGCTCTCTGTGTGATAATGGAGATGTGAAGAAAGCT 2994
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2923 AATCGAAGCTTAAGAGCGGTTACAAGCTCTCTGTGTGATAATGGAGATGTGAAGAATGCT 2982
Query 2995 CTTGACTTGTGGCAGGTAATGGAATCAAAAGGCTGGAATTTAGGTTCTTCAGTTGTCCAA 3054
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 2983 CTTGACTTATGGCAGGTAATGGAATCAAAAGGCTGGATTTTGGGTTCTTCAGTTGCCCAA 3042
Query 3055 ACCAAAATCGTCGAAACCCTGATTTCGAAAGGCGAAATTCCAAAAGCTGAAGACTTTCTG 3114
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3043 ACCAAAATCGTCGAATCCCTAATTTCGAAAGGCGAAATTCCAAAAGCTGAAGACTTTCTG 3102
Query 3115 ACCCGTGTGACACGCAATGGCATGATGGCTCCCAACTATGATAATATAATCAAGAAACTA 3174
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3103 ACCCGTGTGACACGCAATGTCATGAAGGCTCCCAACTACGATAATATAATCAAGAAACTA 3162
Query 3175 TCTGATCGCGGGAATCTTGACATTGCGGTTCATCTCTTGAACACAATGTTAAAGAACCAA 3234
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 3163 TCTGATCGCGAGAATCTTGACATTGCGGTTCATCTCTTGAACATAATGCTAAAGAACCAA 3222
Query 3235 AGCATTCCGGGTTCTTCAAGCTATGATTCAGTCATCAATGGCTTGCTGAGATACAATCAA 3294
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3223 AGCATTCCGGATTCTTCAAGCTATGATTCAGTCATCAGTGGCTTGCTGAGATGCAATCAA 3282
Query 3295 CTGGATAAAGCTATGGACTTTCATACAGAAATGGTGGAGTTAGGTTTAAGTCCGAGCATA 3354
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
Sbjct 3283 TTGGATAAAGCTATGGACTTTCATACAGAAATGGTGGAGTTAGGTCTAAGTCCAAGCACA 3342
Query 3355 AGTACATGGAGTGGTCTTGTTCATAAGTTCTGTGAGGCATGTCAAGTTTTGGAATCAGAA 3414
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3343 AGTACATGGAGTGGTCTTGTTCATAAGTACTGTGAGGCATGTCAAGTTGAGGAATCAGAA 3402
Query 3415 AGACTTATCAAATCAATGGTTGGGTTAGGCGAATCACCGAGTCAAGAGATGTTTAAGACT 3474
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3403 AGACTTATCAAATCAATGGCTGGGTTAGGCGAAACACCGAGTCAAGAAATGTTTAAGACT 3462
Query 3475 GTGATTGATCGGTTTCGAGTAGAGAAGAATACAGTGAAAGCTTCAGAGATGATGGAAATG 3534
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3463 GTGATTGATCGGTTTCGAGTAGAGAACAATACAGTGAAAGCTTCAGAGATGATGGAAATG 3522
Query 3535 ATGCAAAAGTGTGGGTATGAAGTTGATTTTGAGACTCATTGGTCTTTGATTAGTAACATG 3594
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3523 ATGCAAAAGTGTGGCTATGAAGTTGATTTTGAGACTCATTGGTCTTTGATTAGTAACATG 3582
Query 3595 AGCTCTTCTAAAGAGAAGAAGACAACAACAGCTGGTGAAGGATTCTTATCTAGGCTTCTC 3654
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3583 AGCTCTTGTAAAGAGAAGAAGACAACAACAGTTGGTGAAGGATTCTTGTCTAGGCTTCTC 3642
Query 3655 TCTGGGAATGGGTTTACTTGGAAGCGATGA 3684
|| |||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 3643 TCCGGGAATGGATTTGCTTGGAAGCGATGA 3672
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 145456044006
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5