BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G15680.1
Length=6798
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488411 jgi|Araly1|488411|fgenesh2_kg.6__1545__AT5G15680.1 1.128e+04 0.0
> Ahg488411 jgi|Araly1|488411|fgenesh2_kg.6__1545__AT5G15680.1
Length=6581
Score = 1.128e+04 bits (6110), Expect = 0.0
Identities = 6429/6586 (98%), Gaps = 9/6586 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 99 TTTCGCT-TTTGAGGATCTATTCTTGCTGAACGTGATGAAGTCTGGGAGTGCTGCGAAAT 157
||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 TTTCG-TCTTTGGGGATCTATTCTTGTTGAACGTGATGAAGTCTGGGAGTGCGGCGAAAT 59
Query 158 TGATAGTAGAAGCGCTTCTTCAGCGTTTCCTGCCTCTCGCAAGACGACGAATCGAGACAG 217
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 TGATAGTAGAGGCGCTTCTTCAGCGTTTCCTTCCTCTCGCAAGACGACGAATCGAGACAG 119
Query 218 CTCAGGCTCAGGATGGACAGTACCTTCGTCCATCAGATCCTGCTTATGAGCAGGTGTTGG 277
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 CTCAGGCTCAGGATGGACAGTATCTTCGTCCATCAGATCCTGCTTATGAGCAGGTGTTGG 179
Query 278 ATTCATTGGCTATGATTGCCCGTCATACACCTGTTCCTCTTTTAGAAGCTCTTCTTAGAT 337
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 ATTCATTGGCCATGATTGCGCGTCATACACCTGTTCCTCTTTTAGAAGCTCTTCTTAGAT 239
Query 338 GGAGGGAAAGTGAATCACCTAAAGGTGCAAATGATGCCTCGACTTTCCAGAGAAAGTTGG 397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GGAGGGAAAGTGAATCACCTAAAGGTGCAAATGATGCATCGACTTTCCAGAGAAAGTTGG 299
Query 398 CTGTTGAGTGCATCTTCTGCTCAGCTTGCATTCGCTTTGTGGAGTGTTGCCCGCAGGAAG 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CTGTTGAGTGCATCTTCTGCTCAGCTTGCATTCGCTTTGTGGAGTGTTGCCCGCAGGAAG 359
Query 458 GGCTCACTGAGAAGCTATGGTCTGGACTTGAGAACTTTGTTTTTGATTGGCTAATCAACG 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GGCTCACTGAGAAGCTATGGTCTGGACTTGAGAACTTTGTTTTTGATTGGCTAATCAACG 419
Query 518 CTGACAGGGTTGTTAGCCAAGTGGAATACCCATCGCTGGTCGATTTGAGGGGTCTCCTTC 577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 CTGACAGGGTTGTTAGCCAAGTGGAATACCCATCGCTGGTCGATTTGAGGGGTCTCCTTC 479
Query 578 TTGACTTGGTTGCTCAACTCCTGGGTGCACTGTCCCGTATTAGATTCAGCTCTGTCACGG 637
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TTGACTTGGTTGCTCAACTCCTGGGTGCACTATCCCGTATTAGATTCAGCTCTGTCACGG 539
Query 638 AGAGGTTTTTCATGGAACTCAATACTCGCCGGATTGATACAAGCGTTGCAAGAAGTGAAA 697
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 540 AGCGGTTTTTCATGGAACTCAATACTCGCCGGATTGATACAAGTGTTGCAAGAAGTGAAA 599
Query 698 CTCTCAGCATCATTAATGGGATGCGTTACTTGAAGCTTGGGGTTAAGAGTGAGGGTGGGC 757
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CTCTCAGCATCATTAATGGGATGCGATACTTGAAGCTTGGGGTTAAGAGTGAGGGTGGGC 659
Query 758 TGAATGCGTCTGCCTCCTTTGTAGCAAAAGCAAACCCTCTTATCCGGGATATACACAAAC 817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 660 TGAATGCGTCTGCCTCCTTTGTAGCAAAAGCAAACCCTCTTATTCGTGATATACACAAAC 719
Query 818 GTAAAAGTGAGCTTTATCATGCGCTTTGCAATATGCTCTCTAACATCTTGGCGCCACTTT 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 720 GTAAAAGTGAGCTTTATCATGCGCTTTGCAATATGCTTTCTAACATTTTGGCGCCACTTT 779
Query 878 CCGATGGTGGCAAAAGCCAGTGGCCTCCTTCAGTTGCAGAACCTGCACTGACACTCTGGT 937
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 780 CCGATGGTGGCAAAAGCCAGTGGCCTCCTTCAGTTGCAGAGCCTGCACTGACACTCTGGT 839
Query 938 ATGAGGCTGTTGGACGCATCAGAGTGCAGCTAATCCAGTGGATGGAGAAACAGAGTAAAC 997
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 ATGAGGCTGTGGGACGCATTAGAGTGCAGCTAATCCAGTGGATGGAGAAACAGAGTAAAC 899
Query 998 ATCTTGGTGTTGGCTATCCGCTTGTGAGTCTTCTTCTCTGTCTCGGTGACCCGCTTATAT 1057
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 900 ATCTTGGTGTTGGCTATCCGCTTGTGAGTCTTCTTCTCTGTCTCGGTGACCCACTTATAT 959
Query 1058 TTCATCATAATTTAAGCTCTCACATGGAACAACTGTACAAGCTTCTGAGAGATAAGAACC 1117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 TTCATCATAATTTAAGCTCTCACATGGAACAACTGTACAAGCTTCTGAGAGATAAGAACC 1019
Query 1118 ATCGCTACATGGCACTTGATTGTCTTCACCGGGTGTTGAGGTTTTATTTGAGTGTCTATG 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 ATCGCTACATGGCACTTGATTGTCTTCACCGGGTGTTGAGGTTTTATTTGAGTGTCTATG 1079
Query 1178 CTTCGTCCCAGCCACCAAATCGTATATGGGATTACTTGGATAGTGTGACATCACAATTGC 1237
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CTTCCTCCCAGCCACCAAATCGTATATGGGATTACTTGGATAGTGTGACATCACAATTGC 1139
Query 1238 TAACAGTTCTGAGAAAAGGAATGCTCACTCAGGATGTCCAGCAAGATAAACTCGTTGAGT 1297
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1140 TAACAGTTCTGAGAAAAGGAATGCTCACTCAGGATGTCCAACAAGATAAACTAGTTGAGT 1199
Query 1298 TCTGTGTGACCATAGCTGAACATAACCTTGACTTTGCTATGAATCACATGTTACTAGAAC 1357
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TCTGTGTGACCATCGCTGAACATAACCTTGACTTCGCTATGAATCACATGTTACTAGAAC 1259
Query 1358 TGTTAAAGCAAGATAGTCCAAGCGAAGCAAAGATTATTGGTCTCCGTGCTTTACTTGCCC 1417
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1260 TGTTAAAACAAGATAGTCCAAGCGAAGCAAAGATTATTGGTCTTCGTGCTTTGCTTGCCC 1319
Query 1418 TTGTTATGTCGCCTTCAAGCCAGTATGTTGGGTTGGAGATATTTAAGGGTCATGGGATAG 1477
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1320 TCGTTATGTCACCTTCAAGCCAGTATGTTGGGTTGGAGATATTTAAGGGTCATGGAATAG 1379
Query 1478 GCCATTACATACCAAAGGTGAAAGCAGCAATTGAGTCAATTTTAAGATCCTGCCACAGGA 1537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 GCCATTACATACCAAAGGTGAAAGCAGCAATTGAGTCAATTTTAAGATCCTGCCACAGGA 1439
Query 1538 CCTACAGTCAAGCTCTTCTAACATCATCGAGGACTACAATCGATGCTGTGAATAAAGAAA 1597
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1440 CCTATAGTCAAGCTCTTCTAACATCATCGAGGACTACAATAGATGCTGTGAATAAAGAAA 1499
Query 1598 AGTCTCAAGGATCTCTCTTCCAGTCAGTGCTGAAGTGCATACCTTATCTGATTGAGGAAG 1657
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1500 AGTCTCAAGGGTCTCTCTTCCAGTCAGTGCTGAAGTGCATACCTTATCTAATTGAGGAAG 1559
Query 1658 TTGGCCGGAGTGATAAGATCACGGAAATAATACCTCAGCATGGTATAAGTATTGATCCTG 1717
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1560 TTGGTCGGAGTGATAAGATCACGGAAATAATACCTCAGCACGGTATAAGTATTGATCCTG 1619
Query 1718 GAGTTCGAGTGGAAGCAGTGCAAGTCCTGAACCGGATTGTTAGATACCTTCCTCATCGTC 1777
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GAGTTCGAGTGGAAGCGGTGCAAGTTCTGAACCGGATTGTTAGATACCTTCCTCATCGTC 1679
Query 1778 GTTTTGCAGTCATGAGAGGAATGGCAAACTTCATCTTAAAGCTTCCTGATGAATTCCCAC 1837
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GTTTTGCAGTCATGAGAGGGATGGCAAACTTCATCTTAAAGCTTCCTGATGAATTCCCAC 1739
Query 1838 TCCTCATTCAAGCATCACTAGGACGTCTGTTGGAACTCATGCGTTTCTGGAGGGCTTGTT 1897
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 TCCTCATTCAAGCATCACTAGGACGCCTGTTGGAACTCATGCGTTTCTGGAGGGCTTGTT 1799
Query 1898 TAGTAGATGACAGACAAGATACTGATGCTGAAGAAGAAAACAAAACAGCAAAGGGAAATG 1957
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct 1800 TAGTAGATGACAGACAAGATACTGATGCTGAGGAAGAAAAGAAAACAGCAAAGGCAAACG 1859
Query 1958 ATAGGTTCAAGAAATTATCTTTTCATCAAGCAGCAGATGCAATTGAGTTTCGCGCTTCTG 2017
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1860 ATAGGTTCAAGAAATTATCTTTTCATCAAGCAGCAGATGCAATTGAGTTTCGCGCTGCTG 1919
Query 2018 ATATTGATGCTGTTGGGCTAATATTTCTTAGTTCAGTCGACAGTCAGATTCGGCACACTG 2077
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1920 ATATTGATGCTGTTGGGCTAATTTTTCTTAGTTCAGTCGACAGCCAGATTCGGCACACTG 1979
Query 2078 CCCTAGAATTATTACGATGTGTACGTGCTTTGAGAAATGATATTCGGGATCTCATGATTC 2137
| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CGCTAGAATTATTGCGATGTGTACGTGCATTGAGAAATGATATTCGGGATCTCATGATTC 2039
Query 2138 AAGAGCACCCAGACCATGTTATGAAATTTGAAGCTGAACCCATATACATGATCGATGTCT 2197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 AAGAGCACCCAGACCATGTTATGAAATTTGAAGCTGAACCCATATACATGATCGATGTCT 2099
Query 2198 TGGAAGAACATGGGGATGATATTGTTCAAAGTTGCTATTGGGATTCTGCCCGTCCTTTTG 2257
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 TAGAAGAACATGGGGATGATATTGTTCAAAGTTGCTATTGGGATTCTGCCCGTCCTTTTG 2159
Query 2258 ATTTAAGACGAGATTCCGATGCCATTCCTTCTGATGTGACTCTTCAATCCATTATCTTTG 2317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2160 ATTTAAGACGAGATTCCGATGCCATTCCTTCTGATGTGACTCTTCAATCCATAATCTTTG 2219
Query 2318 AGAGCCTTGATAAAAACAAATGGGGTCGATGTCTCAGCGAGCTTGTTAAATATGCTGCTG 2377
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 AGAGCCTTGATAAAAACAAATGGGGTCGGTGTCTCAGCGAGCTTGTTAAATATGCTGCTG 2279
Query 2378 AGCTCTGCCCACGCTCTGTTCAAGAAGCCAAGTCTGAAATTATGCACCGCCTGGCCCATA 2437
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2280 AGCTCTGCCCACGCTCTGTTCAAGAAGCCAAGTCTGAAATTATGCACCGCCTTGCCCATA 2339
Query 2438 TTACACCTGTTGAGTTTGGTGGAAAGGCAAACCAGTCACAAGATACAGATAACAAACTGG 2497
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 TTACACCTGTTGAATTTGGTGGAAAGGCAAGCCAGTCACAAGATACAGATAACAAACTGG 2399
Query 2498 ATCAATGGCTTCTGTATGCTATGTTTGTGTGTTCGTGTCCACCTGATGGCAAAGATGCGG 2557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 ATCAATGGCTTCTGTATGCTATGTTTGTGTGTTCGTGTCCACCTGATGGCAAAGATGCGG 2459
Query 2558 GTAGCATTGCATCAACCAGAGACATGTACCACCTTATTTTCCCTTATCTTAGATTTGGGT 2617
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 GTAGCATTGCATCAACTAGAGACATGTACCACCTTATTTTCCCTTATCTTAGATTTGGGT 2519
Query 2618 CAGAGACCCACAACCATGCTGCAACTATGGCTCTCGGGCGCTCTCATTTGGAAGCATGTG 2677
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2520 CAGAAACCCACAACCATGCTGCGACTATGGCTCTTGGGCGCTCACATTTGGAAGCATGTG 2579
Query 2678 AAATTATGTTTAGCGAGCTTGCATCTTTCATGGAGGAGATTTCATCAGAGACAGAGACGA 2737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 AAATTATGTTTAGCGAGCTTGCATCTTTCATGGAGGAGATTTCATCAGAGACAGAGACGA 2639
Query 2738 AGCCAAAGTGGAAGATCCAAAAAGGAGGTCGAAGAGAGGACCTCCGTGTTCATGTCTCTA 2797
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2640 AGCCAAAGTGGAAGATCCAAAAAGGAGGTCGCAGAGAGGACCTCCGTGTTCATGTTTCTA 2699
Query 2798 ATATATATCGAACAGTGTCTGAGAATGTCTGGCCTGGAATGCTTGCTCGTAAACCAGTTT 2857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 ATATATATCGAACAGTGTCTGAGAATGTCTGGCCTGGAATGCTTGCTCGTAAACCAGTTT 2759
Query 2858 TCCGCCTCCATTATCTGCGGTTCATTGAAGATTCAACAAGACAAATATCGTTGGCACCTC 2917
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2760 TCCGCCTCCATTATCTGCGGTTTATTGAAGATTCAACAAGACAGATATCGTTGGCACCTC 2819
Query 2918 ATGAAAGCTTTCAGGACATGCAGCCTCTGCGATATGCACTTGCGTCTGTTTTAAGATTCC 2977
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 ATGAAAGCTTTCAGGACATGCAGCCTCTGCGCTATGCACTTGCGTCTGTTTTAAGATTCC 2879
Query 2978 TTGCCCCTGAATTTGTTGAATCAAAATCAGAGAAGTTTGATGTTAGAAGTAGGAAACGTC 3037
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2880 TTGCCCCTGAATTTGTTGAATCAAAATCAGAGAAATTTGATGTTAGAAGTAGAAAACGTC 2939
Query 3038 TATTCGATCTGCTTCTTTCCTGGTCCGATGACACTGGAAATACGTGGGGACAGGATGGTG 3097
||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 TATTCGATCTGCTTCTTTCCTGGTCTGATGATACAGGAAGTACGTGGGGACAGGATGGTG 2999
Query 3098 TTAGTGATTATCGCCGTGAAGTAGAGCGCTATAAGACCTCACAGCATAACCGGTCCAAAG 3157
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3000 TTAGTGATTATCGCCGTGAAGTAGAGCGCTATAAGACCTCGCAGCATAACCGGTCAAAAG 3059
Query 3158 ATTCTGTAGACAAGATTTCTTTTGACAAGGAACTGAATGAGCAAATTGAAGCCATCCAGT 3217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3060 ATTCTGTAGACAAGATTTCTTTTGACAAGGAACTGAATGAGCAAATTGAAGCCATACAGT 3119
Query 3218 GGGCCTCATTGAATGCAATGGCTTCCCTTCTTTATGGACCGTGTTTTGATGACAATGCAA 3277
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 GGGCCTCATTGAATGCAATGGCTTCCCTTCTGTATGGACCGTGTTTTGATGACAATGCAA 3179
Query 3278 GAAAAATGAGCGGCCGTGTGATATCTTGGATAAATAGTTTGTTCATTGAGCCTGCTCCCA 3337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 GAAAAATGAGCGGCCGTGTGATATCTTGGATAAATAGTTTGTTCATTGAGCCTGCTCCCA 3239
Query 3338 GGGTCCCTTTTGGTTACTCGCCTGCTGATCCAAGAACTCCATCTTACTCCAAATACACGG 3397
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3240 GGGTCCCTTTTGGTTACTCGCCTGCTGATCCAAGAACTCCATCTTACTCCAAATACACAG 3299
Query 3398 GAGAAGGTGGACGAGGGACAACAGGTCGTGATAGGCATAGAGGTGGTCATCAACGTGTTG 3457
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3300 GAGAAGGTGGACGAGGGGCAACAGGCCGTGATAGGCATAGAGGTGGTCATCAACGTGTTG 3359
Query 3458 CGTTGGCAAAATTGGCCCTGAAGAATCTTCTACTTACAAACTTGGATCTCTTTCCTGCCT 3517
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 CGTTGGCAAAATTGGCTCTGAAGAATCTTCTACTTACAAACTTGGATCTCTTTCCTGCCT 3419
Query 3518 GCATTGATCAGTGTTACTACTCTGATGCGGCTATAGCTGATGGGTACTTCAGTGTGTTGG 3577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 GCATTGATCAGTGTTACTACTCTGATGCGGCTATAGCTGATGGGTACTTCAGTGTGTTGG 3479
Query 3578 CTGAGGTTTACATGCGACAAGAAATACCAAAATGTGAAATCCAGAGGCTCTTAAGTCTAA 3637
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3480 CTGAGGTTTACATGCGACAAGAAATACCAAAATGTGAAATCCAGAGGCTCTTGAGTCTAA 3539
Query 3638 TTCTCTACAAGGTAGTCGATCCATCTAGACAAATTCGCGATGATGCTCTTCAAATGCTTG 3697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 TTCTCTACAAGGTAGTCGATCCATCTAGACAAATTCGCGATGATGCTCTTCAAATGCTTG 3599
Query 3698 AGACACTTTCTATGCGTGAGTGGGCTGAGGATGGTATAGAAGGTTCAGGAGGCTATAGAG 3757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 AGACACTTTCTATGCGTGAGTGGGCTGAGGATGGTATAGAAGGTTCAGGAGGCTATAGAG 3659
Query 3758 CAGCAGTTGTAGGTAATCTTCCAGATTCATATCAACAGTTCCAATACAAGCTCTCCTGCA 3817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3660 CAGCAGTTGTAGGTAATCTTCCAGATTCATATCAACAGTTCCAGTACAAGCTCTCCTGCA 3719
Query 3818 AACTCGCCAAGGATCATCCGGAGTTAAGCCAGCTGCTTTGTGAAGAAATTATGCAGCGTC 3877
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3720 AACTCGCCAAGGATCATCCTGAGTTAAGCCAGCTGCTTTGTGAAGAAATTATGCAGCGTC 3779
Query 3878 AGCTTGATGCTGTTGATATAATTGCTCAGCATCAGGTCTTGACCTGTATGGCTCCATGGA 3937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3780 AGCTTGATGCTGTTGATATAATTGCTCAGCATCAGGTCTTGACCTGTATGGCTCCATGGA 3839
Query 3938 TTGAGAACCTTAATTTCTGGAAACTCAAGGATTCGGGTTGGAGTGAAAGATTACTAAAAA 3997
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3840 TTGAGAACCTTAATTTCTGGAAACTCAAGGATTCAGGTTGGAGTGAAAGATTACTGAAAA 3899
Query 3998 GTCTTTACTATGTGACATGGCGACACGGGGATCAATTCCCTGATGAAATTGAAAAACTTT 4057
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3900 GTCTTTACTATGTCACATGGCGACATGGGGATCAATTCCCTGATGAAATTGAAAAACTTT 3959
Query 4058 GGAGTACCATTGCTAGTAAGCCCAGAAACATCAGCCCTGTATTGGATTTCTTGATCACAA 4117
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3960 GGAGTACCATTGCTAGTAAGCCTAGAAACATCAGCCCTGTTTTGGATTTCTTGATCACAA 4019
Query 4118 AGGGAATTGAGGACTGTGATTCAAATGCATCTGCCGAAATAACTGGTGCATTTGCTACAT 4177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4020 AGGGAATTGAGGACTGTGATTCAAATGCATCTGCCGAAATAACTGGTGCATTTGCTACAT 4079
Query 4178 ATTTTTCAGTTGCTAAGCGTGTAAGT-TTGTACCTCGCACGAATATGTCCTCAGCGTACT 4236
|||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4080 ATTTTTCAGTTGCTAAACGTGTAAGTCTT-TACCTAGCACGGATATGTCCTCAGCGTACT 4138
Query 4237 ATTGATCACCTGGTTTACCAACTGTCACAGCGGATGCTGGAAGACAGTATTGAACCCATT 4296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4139 ATTGATCACCTGGTTTACCAACTGTCACAGCGGATGCTGGAAGACAGTATTGAACCCATT 4198
Query 4297 GGTTATAGTGCAAACCGGGGTGATTCCAATGGAAACTTTGTGCTGGAGTTCTCTCAGGGA 4356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4199 GGTTATAGTGCAAACCGGGGTGATTCCAATGGAAACTTTGTGCTGGAGTTCTCTCAGGGA 4258
Query 4357 CCTGCCACAGCACCTCAAGTTGTTTCAGTTGCAGACAGCCAACCACATATGTCACCACTT 4416
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4259 CCTGCCACAGCACCTCAAGTTGCTTCAGTTGCAGACAGCCAACCACATATGTCACCACTT 4318
Query 4417 CTTGTCAGAGGCTCCCTTGATGGTCCCCTTAGGAATACAAGTGGAAGCCTAAGCTGGAGA 4476
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4319 CTTGTCCGAGGCTCCCTTGATGGTCCCCTTAGGAATACAAGTGGAAGTCTAAGCTGGAGA 4378
Query 4477 ACAGCAGGGATGACTGGGCGAAGTGCTTCTGGGCCTTTAAGTCCAATGCCTCCTGAGTTG 4536
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4379 ACAGCAGGCATGACTGGGCGAAGTGCTTCTGGGCCTTTAAGTCCAATGCCTCCTGAGTTG 4438
Query 4537 AATATTGTTCCTGTAGCTACTGGTCGTTCTGGTCAGCTCCTGCCATCATTGGTGAATGCA 4596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4439 AATATTGTTCCTGTAGCTACTGGTCGTTCTGGTCAGCTCCTGCCATCATTGGTGAATGCA 4498
Query 4597 TCAGGACCTTTAATGGGAGTTCGTAGCTCTACAGGAAGTTTGAGGAGTCGCCATGTCTCA 4656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4499 TCAGGACCTTTAATGGGAGTTCGTAGCTCTACAGGAAGTTTGAGGAGCCGCCATGTCTCA 4558
Query 4657 CGTGATAGCGGAGATTACCTCATAGATACACCAAATTCTGGAGAAGATGTGTTGCATTCA 4716
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4559 CGTGATAGTGGAGATTACCTCATTGATACACCAAATTCTGGAGAAGATGTGTTGCATTCT 4618
Query 4717 GGGATCGCAATGCACGGCGTCAATGCAAAGGAACTTCAATCAGCCTTGCAGGGACATCAA 4776
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4619 GGGATCGCAATGCACGGCGTCAATGCAAAGGAACTTCAATCAGCTTTGCAGGGACATCAA 4678
Query 4777 CAGCACTCACTCACTCATGCTGACATAGCTCTGATTCTTCTTGCAGAAATCGCATATGAG 4836
||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4679 CAGCATTCACTCACTCATGCCGATATAGCTCTGATTCTTCTTGCAGAAATCGCATATGAG 4738
Query 4837 AATGATGAAGATTTTAGGGAACATCTGCCTTTGCTCTTCCACGTCACTTTTGTTTCGATG 4896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4739 AATGATGAAGATTTTAGGGAACATCTGCCTTTGCTCTTCCACGTCACTTTTGTTTCGATG 4798
Query 4897 GATAGCTCTGAAGACATTGTGCTAGAGCATTGTCAACATTTACTTGTGAATTTATTGTAC 4956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 4799 GATAGCTCTGAAGACATTGTGCTAGAGCATTGTCAACATTTGCTTGTGAATTTGTTGTAC 4858
Query 4957 TCACTAGCGGGTCGGCATTTGGAGCTATATGAGGTGGAAAACAGCGATGGAGAGAACAAA 5016
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 4859 TCACTAGCGGGTCGGCATTTGGAGCTATATGAGGTGGAGAACAGTGATGGAGAGAACAAA 4918
Query 5017 CAACAGGTTGTGAGTTTAATTAAGTATGTGCAATCAAAACGAGGAAGCATGATGTGGGAG 5076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4919 CAACAGGTTGTGAGTTTAATTAAGTATGTGCAATCAAAACGAGGAAGCATGATGTGGGAG 4978
Query 5077 AATGAAGATCCAACGGTTGTGAGAACAGATCTTCCTAGTGCCGCTCTTTTGTCTGCACTT 5136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4979 AATGAAGATCCAACGGTTGTGAGAACAGATCTTCCTAGTGCCGCTCTTTTGTCTGCACTT 5038
Query 5137 GTTCAGAGTATGGTTGATGCTATATTCTTCCAAGGAGATCTTCGAGAAACTTGGGGAACT 5196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5039 GTTCAGAGTATGGTTGATGCTATATTCTTCCAAGGAGATCTTCGAGAAACTTGGGGAACT 5098
Query 5197 GAAGCTCTCAAATGGGCTATGGAATGCACGTCAAGACATCTAGCATGTCGGTCACACCAA 5256
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5099 GAAGCTCTCAAATGGGCTATGGAATGCACGTCTAGACATCTAGCATGTCGGTCACACCAA 5158
Query 5257 ATATACCGTGCGCTACGCCCAAGTGTGACAAGTGATGCATGTGTCTCCCTTCTACGCTGT 5316
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5159 ATATACCGTGCGCTACGGCCAAGTGTGACAAGTGATGCATGTGTCTCCCTTCTACGCTGT 5218
Query 5317 CTTCATCGATGTCTTAGCAATCCCATTCCTCCAGTTTTGGGTTTTATTATGGAAATCCTT 5376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5219 CTTCATCGATGTCTTAGCAATCCCATTCCTCCAGTTTTGGGTTTTATTATGGAAATCCTT 5278
Query 5377 CTGACGCTACAGGTCATGGTAGAGAACATGGAGCCAGAGAAAGTCATACTCTACCCACAG 5436
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5279 CTGACGCTACAAGTCATGGTAGAGAACATGGAGCCAGAGAAAGTCATACTCTACCCACAG 5338
Query 5437 CTCTTCTGGGGCTGTGTCGCCATGATGCACACAGACTTCGTCCATGTCTATTGCCAGGTT 5496
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5339 CTCTTCTGGGGCTGTGTTGCCATGATGCACACAGACTTCGTCCATGTCTATTGCCAGGTT 5398
Query 5497 CTTGAGCTCTTCTCCCGTATTATTGACCGGCTATCATTTCGTGACAAAACAACTGAAAAT 5556
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5399 CTTGAGCTTTTCTCCCGTATTATTGACCGTCTATCATTTCGTGACAAAACAACTGAAAAT 5458
Query 5557 GTACTCTTGTCAAGTATGCCTCGGGATGAATTCAACACTAATGATTTGGGGGAATTCCAA 5616
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5459 GTGCTCTTGTCAAGTATGCCTCGGGATGAATTCAACACTAATGATTTGGGGGAATTCCAA 5518
Query 5617 AGGTCAGAATCTAGAGGGTACGAGATGCCGCCGTCAAGTGGAACTCTTCCAAAGTTCGAA 5676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5519 AGGTCAGAATCTAGAGGGTACGAGATGCCGCCGTCAAGTGGAACTCTTCCAAAGTTCGAA 5578
Query 5677 GGTGTACAACCTCTTGTCCTCAAAGGACTGATGTCTACTGTTAGCCACGAGTTCTCTATT 5736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5579 GGTGTACAACCTCTTGTCCTCAAAGGACTGATGTCTACTGTTAGCCACGAGTTCTCTGTT 5638
Query 5737 GAGGTCCTATCAAGGATTACAGTGCCTTCATGTGACTCTATATTTGGCGATGCTGAGACA 5796
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5639 GAGGTCCTATCAAGGATTTCAGTGCCTTCATGTGACTCTATATTTGGCGATGCCGAGACA 5698
Query 5797 AGACTCCTTATGCATATCACAGGTCTACTTCCTTGGCTTTGCTTGCAGCTGACCCAAGAC 5856
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5699 AGACTCCTTATGCATATCACAGGTCTACTTCCTTGGCTTTGCTTGCAGCTGAGCCAAGAC 5758
Query 5857 CAAGTCATGGTTTCTGCGTTACCACTCCAGCAGCAATATCAAAAGGCATGTTCTGTGGCA 5916
||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5759 CAAGTCATGATTTCTTTGTTACCACTCCAGCAGCAGTATCAAAAGGCATGTTCTGTGGCA 5818
Query 5917 TCTAACATTGCTGTCTGGTGTCGGGCAAAATCACTCGATGAATTAGCGACTGTTTTTGTC 5976
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||
Sbjct 5819 GCTAACATTGCTGTCTGGTGTCGGGCGAAATCACTCGATGAATTGGCTACGGTTTTTGTC 5878
Query 5977 GCATATGCTCGTGGCGAGATTAAAAGAGTTGAAAATCTCCTTGCATGTGTCTCTCCTCTG 6036
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5879 GCATATGCTCGTGGGGAGATTAAAAGAGTTGAAAATCTCCTTGCATGTGTCTCTCCTCTG 5938
Query 6037 CTCTGCAACAAATGGTTCCCGAAACACTCAGCTTTAGCTTTCGGTCACTTGTTAAGACTG 6096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5939 CTCTGCAACAAATGGTTCCCGAAACACTCAGCTTTAGCTTTCGGTCACTTGTTAAGACTG 5998
Query 6097 CTaaaaaaaGGACCAGTGGATTACCAACGAGTCATATTACTTATGCTCAAGGCATTGCTC 6156
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5999 CTAAAAAAAGGACCAGTGGATTACCAGCGAGTCATATTACTTATGCTCAAGGCATTGCTC 6058
Query 6157 CAACACACTCCCATGGATGCTTCGCAGAGTCCCCACATGTACACAATTGTTTCACAGCTA 6216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 6059 CAACACACTCCCATGGATGCTTCGCAGAGTCCCCACATGTACACAATCGTTTCGCAGCTA 6118
Query 6217 GTCGAAAGCACTCTGTGTTGGGAGGCATTGAGTGTTCTCGAAGCTCTTCTTCAGAGCTGC 6276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6119 GTCGAAAGCACTCTGTGTTGGGAGGCATTGAGTGTTCTCGAAGCTCTTCTTCAGAGCTGC 6178
Query 6277 AGCCCGGTACAAGGGGGCACCGGTGGATCCCACCCTCAGGATT-CGAGTTACTCTGAAAA 6335
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 6179 AGCCCGGTACAAGGGGGCACTGGTGGATCCCACCCTCAGGATTTC-AGTTACTCTGAAAA 6237
Query 6336 CGGGACTGATGAGAAAACGCTTGTACCTCAGACTTCATTTAAAGCCCGAAGCGGACCTCT 6395
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6238 TGGGGCTGATGAGAAAACGCTTGTACCTCAGACTTCATTTAAAGCCCGAAGCGGACCTCT 6297
Query 6396 TCAGTACGCAATGATGGCTGCAACAATGTCGCAACCTTTCCCTCTTGGTGCAGCTGCGGC 6455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 6298 TCAGTACGCAATGATGGCTGCAACAATGTCGCAACCTTTCCCTCTCAGTGCAGCTGCAGC 6357
Query 6456 AGAGTCAGGGATACCTCCGAGAGATGTGGCTTTACAGAACACAAGGCTAATGTTGGGTCG 6515
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6358 AGAGTCAGGGATACCTCCGAGAGATGTGGCTTTGCAGAACACAAGGCTAATGTTGGGTCG 6417
Query 6516 GGTTCTTGATAATTGCGCTCTAGGAAGAAGAGATTACAGAAGATTGGTACCTTTTGTCAC 6575
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6418 GGTTCTTGATAATTGCGCTCTAGGAAGAAGAGATTACAGAAGATTGGTGCCTTTTGTCAC 6477
Query 6576 AACGATCGCAAACATGTAACATTTTCAGTAAAGTTTTG-AATTTATTTTTGGTAATTTGT 6634
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||
Sbjct 6478 AACGATCGCAAACATGTAACATTTTCAGTAAAGTTTTGCAATTT-TTTT-GGTTATTTGT 6535
Query 6635 ATGCTTTCCAGAAGTTTTAAAGAAGCAATGTGTCTGTGTGTGAATA 6680
||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 6536 ATGATTTTCATAAGTTTTAAAGAAGCAATGCGTTTGTGTGTGAATA 6581
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 257687826783
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5