BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G16070.1 Length=1932 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg893517 jgi|Araly1|893517|Al_scaffold_0006_1513 2748 0.0 Ahg477487 jgi|Araly1|477487|fgenesh2_kg.3__188__AT3G02530.1 2060 0.0 Ahg891256 jgi|Araly1|891256|Al_scaffold_0007_3242 159 5e-38 Ahg926202 jgi|Araly1|926202|scaffold_201763.1 154 2e-36 Ahg343780 jgi|Araly1|343780|fgenesh1_pg.C_scaffold_4000122 147 4e-34 > Ahg893517 jgi|Araly1|893517|Al_scaffold_0006_1513 Length=1608 Score = 2748 bits (1488), Expect = 0.0 Identities = 1568/1608 (98%), Gaps = 0/1608 (0%) Strand=Plus/Plus Query 130 ATGTCAGTGCGAGTTCTGAATCCTAATGCCGAGGTTCTCAACAAATCTGCGGCGCTTCAT 189 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1 ATGTCAGTGCGAGTTCTGAATCCTAATGCGGAGGTTCTCAACAAATCGGCGGCGCTTCAT 60 Query 190 ATGACCATCAACGCCGCCAAGGGTTTGCAAGATGTACTCAAGTCGAATCTCGGTCCTAAA 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| Sbjct 61 ATGACCATCAACGCCGCCAAGGGTTTGCAAGATGTGCTAAAGTCGAACCTCGGGCCTAAA 120 Query 250 GGAACAATCAAAATGCTTGTTGGTGGTTCTGGGGATATTAAGCTTACCAAAGATGGGAAC 309 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GGAACAATCAAGATGCTTGTTGGTGGTTCTGGGGATATTAAGCTTACCAAAGATGGGAAC 180 Query 310 ACGCTATTGAAGGAAATGCAAATTCAGAATCCAACAGCCATTATGATTGCGAGGACAGCT 369 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACGCTATTGAAGGAAATGCAAATTCAGAATCCAACCGCCATTATGATTGCGAGGACAGCC 240 Query 370 GTTGCACAGGATGATATAAGTGGTGATGGTACTACTTCCACTGTTATCTTCATTGGTGAG 429 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 241 GTTGCACAGGATGACATAAGTGGTGATGGTACTACTTCCACTGTCATCTTCATTGGTGAG 300 Query 430 CTTATGAAACAGTCTGAACGCTGCATCGATGAAGGTATGCATCCACGAGTCCTAGTTGAT 489 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 301 CTTATGAAACAGTCTGAACGCTGCATCGATGAAGGTATGCATCCACGTGTCCTAGTTGAT 360 Query 490 GGTTTCGAGATTGCTAAGAGAGCTACTCTTCAATTTCTTGACAACTTCAAGACCCCTGTT 549 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GGTTTCGAGATTGCTAAGAGAGCTACTCTTCAATTTCTTGACAACTTCAAGACCCCTGTG 420 Query 550 GTTATGGGTGATGAAGTTGATAAAGAGATCCTAAAAATGGTTGCAAGAACGACACTAAGA 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GTTATGGGTGATGAAGTTGATAAAGAGATCCTAAAAATGGTTGCAAGAACGACACTAAGA 480 Query 610 ACAAAATTGTACGAAGGCTTAGCTGATCAACTGACTGACATTGTCGTCAATTCGGTTCTT 669 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 481 ACAAAATTGTACGAAGGCTTAGCTGATCAACTGACTGACATTGTCGTTAATTCGGTTCTC 540 Query 670 TGCATCCGAAAGCCTGAGGAAGCTATTGATCTGTTTATGGTGGAAATAATGCACATGCGT 729 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TGCATCCGAAAGCCTGAAGAAGCTATTGATCTGTTTATGGTGGAAATAATGCACATGCGT 600 Query 730 CACAAATTCGATGTTGACACACGATTGGTTGAGGGGCTTGTTCTGGATCATGGTTCGAGA 789 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CACAAATTCGATGTTGACACACGATTGGTTGAGGGACTTGTTCTGGATCATGGTTCGAGA 660 Query 790 CACCCTGACATGAAACGACGCGCAGAAAATTGCCACATCTTAACTTGCAATGTGTCACTA 849 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 661 CACCCTGACATGAAACGACGCGCAGAAAATTGCCACATCCTAACTTGCAATGTGTCACTG 720 Query 850 GAGTATGAGAAGAGTGAAATCAATGCAGGATTTTTCTACTCTAATGCGGAGCAGAGGGAA 909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GAGTATGAGAAGAGTGAAATCAATGCAGGATTTTTCTACTCTAATGCGGAGCAGAGGGAA 780 Query 910 GCCATGGTTACCGCAGAGAGGCGATCTGTTGATGAAAGAGTTAAGAAAATAATTGAGCTG 969 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 781 GCAATGGTTACCGCAGAGAGGCGATCTGTTGATGAAAGAGTTAAGAAAATCATTGAGCTG 840 Query 970 AAGAAGAAGGTGTGTGGTGATAATGACAACTTTGTTGTCATAAATCAGAAGGGTATTGAC 1029 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AAGAAAAAGGTGTGTGGTGATAATGACAACTTTGTTGTCATAAATCAGAAGGGTATTGAC 900 Query 1030 CCACCATCATTGGATCTTCTTGCTAGAGAAGGGATTATTGGTCTTAGAAGAGCAAAGAGG 1089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CCACCATCATTGGATCTTCTTGCTAGAGAAGGGATTATTGGTCTTAGAAGAGCAAAGAGG 960 Query 1090 AGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGCTGTGAATTCTGTTGACGAC 1149 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 961 AGGAATATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGCTGTGAATTCTGTTGATGAC 1020 Query 1150 TTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTGGACTTGTCTATGAGCACGTTCTTGGGGAGGAA 1209 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 TTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTGGACTTGTCTATGAGCACGTTCTTGGGGAGGAA 1080 Query 1210 AAGTACACCTTTGTGGAGCAAGTGAAGAATCCTAATTCATGTACCATCCTCATAAAAGGG 1269 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 AAGTACACCTTTGTGGAACAAGTGAAGAATCCTAATTCATGTACCATCCTCATAAAAGGG 1140 Query 1270 CCTAATGATCACACTATTGCCCAAATTAAGGACGCTGTTCGTGATGGTCTGAGATCGGTC 1329 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1141 CCTAATGATCACACCATTGCTCAAATTAAGGACGCTGTTCGTGATGGTCTAAGATCGGTC 1200 Query 1330 AAGAACACCATAGAAGACGAGTGTGTTGTGTTAGGAGCAGGAGCTTTTGAAGTTGCAGCA 1389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 AAGAACACCATAGAAGACGAGTGTGTTGTGTTAGGAGCAGGAGCTTTTGAAGTTGCAGCA 1260 Query 1390 AGGCAACACTTACTCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTCAAGGGCGTGCCCAACTTGGCGTT 1449 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 AGGCAACACTTAATCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTCAAGGGCGTGCCCAACTTGGCGTT 1320 Query 1450 GAAGCTTTTGCTAATGCCCTTCTCGTGGTGCCTAAGACACTTGCAGAAAATGCAGGTCTT 1509 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GAAGCTTTTGCTAATGCTCTTCTCGTGGTGCCTAAGACACTTGCAGAAAATGCAGGTCTT 1380 Query 1510 GATACCCAAGATGTGATCATTTCTCTTACGAGCGAGCATGACAAAGGGAACGTTGTGGGA 1569 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1381 GATACCCAAGATGTGATCATTTCTCTTACGAGCGAGCATGACAAAGGGAACATTGTGGGG 1440 Query 1570 CTGAACCTTCAGGACGGTGAACCTATTGACCCGCAGCTTGCTGGTATTTTTGATAATTAC 1629 ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1441 CTGGACCTTCAGGACGGTGAACCAATTGACCCGCAACTTGCTGGTATTTTTGATAACTAC 1500 Query 1630 TCAGTGAAACGCCAACTTATCAATTCAGGGCCAGTGATTGCGTCGCAATTACTTTTGGTG 1689 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 1501 TCAGTGAAACGCCAACTTATCAATTCAGGGCCCGTGATTGCGTCACAATTGCTTTTGGTG 1560 Query 1690 GACGAAGTGATTCGTGCAGGCAGAAATATGAGGAAGCCTACTGCTTGA 1737 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 GACGAAGTGATTCGTGCAGGAAGAAATATGAGGAAGCCTACTGCTTGA 1608 > Ahg477487 jgi|Araly1|477487|fgenesh2_kg.3__188__AT3G02530.1 Length=1756 Score = 2060 bits (1115), Expect = 0.0 Identities = 1451/1616 (90%), Gaps = 11/1616 (1%) Strand=Plus/Plus Query 123 ATCGAAAATGTCAGTGCGAGTTCTGAATCCTAATGCCGAGGTTCTCAACAAATCTGCGGC 182 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || Sbjct 50 ATCGAAAATGTCTGTGCGTGTTCTGAATCCTAATGCGGAGGTGCTCAACAAATCGGCCGC 109 Query 183 GCTTCATATGACCATCAACGCCGCCAAGGGTTTGCAAGATGTACTCAAGTCGAATCTCGG 242 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 110 GCTTCATATGACCATCAACGCCGCCAAGGGTTTACAGGATGTACTCAAGTCGAATCTCGG 169 Query 243 TCCTAAAGGAACAATCAAAATGCTTGTTGGTGGTTCTGGGGATATTAAGCTTACCAAAGA 302 |||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct 170 TCCTAAGGGAACTATTAAGATGCTTGTTGGTGGTTCCGGGGATATCAAGCTTACCAAGGA 229 Query 303 TGGGAACACGCTATTGAAGGAAATGCAAATTCAGAATCCAACAGCCATTATGATTGCGAG 362 ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || Sbjct 230 TGGCAACACGCTTTTGAAGGAAATGCAAATTCAAAATCCAACAGCCATCATGATTGCCAG 289 Query 363 GACAGCTGTTGCACAGGATGATATAAGTGGTGATGGTACTACTTCCACTGTTATCTTCAT 422 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 290 GACAGCTGTTGCTCAGGATGACATAAGTGGTGATGGTACTACTTCCACTGTCATCTTCAT 349 Query 423 TGGTGAGCTTATGAAACAGTCTGAACGCTGCATCGATGAAGGTATGCATCCACGAGTCCT 482 ||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct 350 TGGTGAGCTTATGAAGCAGTCGGAGCGTTGCATCGATGAAGGAATGCATCCACGAGTCTT 409 Query 483 AGTTGATGGTTTCGAGATTGCTAAGAGAGCTACTCTTCAATTTCTTGACAAC-TTCAAGA 541 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| Sbjct 410 AGTTGATGGTTTCGAGATTGCAAAAAGAGCTACTCTCCAATTTCTCGAC-ACTTTCAAGA 468 Query 542 CCCCTGTTGTTATGGGTGATGAAG-TTGATAAAGAGATCCTAAAAATGGTTGCAAGAACG 600 | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| || || Sbjct 469 CACCTGTGGTTATGGGTGATG-AGCCTGACAAAGAGATCCTGAAAATGGTTGCCAGGACA 527 Query 601 ACACTAAGAACAAAATTGTACGAAGGCTTAGCTGATCAACTGACTGACATTGTCGTCAAT 660 || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| Sbjct 528 ACGCTAAGAACTAAGCTGTATGAAGGCTTAGCTGATCAACTGACTGATATTGTTGTTAAT 587 Query 661 TCGGTTCTTTGCATCCGAAAGCCTGAGGAAGCTATTGATCTGTTTATGGTGGAAATAATG 720 |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||| Sbjct 588 TCGGTTCTCTGCATTCGGAAGCCTGAGGAACCTATTGATCTGTTTATGGTTGAGATTATG 647 Query 721 CACATGCGTCACAAATTCGATGTTGACACACGATTGGTTGAGGGGCTTGTTCTGGATCAT 780 |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 648 CACATGCGCCATAAATTTGATGTTGACACACGATTGGTTGAGGGGCTTGTTCTTGATCAT 707 Query 781 GGTTCGAGACACCCTGACATGAAACGACGCGCAGAAAATTGCCACATCTTAACTTGCAAT 840 ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| | ||||||||| Sbjct 708 GGTTCAAGACACCCTGACATGAAGCGACGTGCGGAGAATTGTCACATCCTGACTTGCAAT 767 Query 841 GTGTCACTAGAGTATGAGAAGAGTGAAATCAATGCAGGATTTTTCTACTCTAATGCGGAG 900 |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 768 GTGTCATTAGAGTATGAGAAGAGTGAAATTAATGCAGGATTCTTCTACTCGAATGCGGAG 827 Query 901 CAGAGGGAAGCCATGGTTACCGCAGAGAGGCGATCTGTTGATGAAAGAGTTAAGAAAATA 960 |||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 828 CAGAGGGAAGCCATGGTTACTGCTGAGCGACGTTCTGTTGATGAAAGAGTTCAGAAAATT 887 Query 961 ATTGAGCTGAAGAAGAAGG--TGTG-TGGTGATAATGACAACTTTGTTGTCATAAATCAG 1017 |||||||||||||| |||| |||| |||| || || ||| |||||||||| ||||||| Sbjct 888 ATTGAGCTGAAGAACAAGGTTTGTGCTGGTAATGATAACAGCTTTGTTGTCCTAAATCAA 947 Query 1018 AAGGGTATTGA-CCCACCATCATTGGATCTTCTTGCTAGAGAAGGGATTATTGGTCTTAG 1076 ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| Sbjct 948 AAGGGTATTGATCCC-CCGTCATTGGATCTTCTTGCTAGAGAAGGGATAATCGCCCTTAG 1006 Query 1077 AAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGCTGTGAA 1136 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1007 AAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTGGTTTTGGCATGTGGTGGAGAAGCTGTGAA 1066 Query 1137 TTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTGGACTTGTCTATGAGCACGT 1196 |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1067 CTCTGTTGATGACTTGACCCCTGATTCTCTTGGTTGGGCTGGACTTGTATATGAGCACGT 1126 Query 1197 TCTTGGGGAGGAAAAGTACACCTTTGTGGAGCAAGTGAAGAATCCTAATTCATGTACCAT 1256 |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct 1127 TCTTGGAGAGGAGAAGTACACATTTGTCGAGCAAGTGAAGAATCCTCATTCATGTACTAT 1186 Query 1257 CCTCATAAAAGGGCCTAATGATCACACTATTGCCCAAATTAAGGACGCTGTTCGTGATGG 1316 |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1187 CCTCATAAAAGGCCCTAACGACCACACTATTGCTCAAATTAAGGACGCTGTCCGTGATGG 1246 Query 1317 TCTGAGATCGGTCAAGAACACCATAGAAGACGAGTGTGTTGTGTTAGGAGCAGGAGCTTT 1376 | | ||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| Sbjct 1247 TTTAAGATCAGTTAAGAATACCCTAGAAGATGAGTGTGTCGTATTAGGAGCTGGAGCTTT 1306 Query 1377 TGAAGTTGCAGCAAGGCAACACTTACTCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTCAAGGGCGTGC 1436 ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1307 TGAAGTTGCAGCAAGACAACACTTAATCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTCAAGGGCGCGC 1366 Query 1437 CCAACTTGGCGTTGAAGCTTTTGCTAATGCCCTTCTCGTGGTGCCTAAGACACTTGCAGA 1496 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1367 TCAACTCGGTGTTGAAGCTTTTGCTAATGCCCTTCTCGTGGTGCCTAAGACACTTGCTGA 1426 Query 1497 AAATGCAGGTCTTGATACCCAAGATGTGATCATTTCTCTTACGAGCGAGCATGACAAAGG 1556 |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 1427 AAATGCTGGGCTTGACACTCAAGACGTTATCATTTCTCTAACGAGTGAGCATGACAAAGG 1486 Query 1557 GAACGTTGTGGGACTGAACCTTCAGGACGGTGAACCTATT-GACCCGCAGCTTGCTGGTA 1615 ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| | | ||||| |||||||| |||| Sbjct 1487 AAACGTCGTGGGACTAAACCTACAGGATGGAGAACC-AGTCGACCCTCAGCTTGCCGGTA 1545 Query 1616 TTTTTGATAATTACTCAGTGAAACGCCAACTTATCAATTCAGGGCCAGTGATTGCGTCGC 1675 |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct 1546 TTTTCGACAATTACTCGGTGAAACGCCAACTTATCAATTCAGGGCCGGTGATTGCTTCGC 1605 Query 1676 AATTACTTTTGGTGGACGAAGTGATTCGTGCAGGCAGAAATATGAGGAAGCCTACT 1731 | || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1606 AGTTGCTATTAGTGGATGAAGTGATTCGTGCAGGAAGAAATATGAGGAAGCCTACT 1661 > Ahg891256 jgi|Araly1|891256|Al_scaffold_0007_3242 Length=696 Score = 159 bits (86), Expect = 5e-38 Identities = 100/107 (93%), Gaps = 0/107 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1071 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGC 1130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 441 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTGGTTTTGGCATGTGGTGGAGAAGC 500 Query 1131 TGTGAATTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTG 1177 |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| Sbjct 501 TGTGAACTCTGTTGATGACTTGACCCCTGATTCTCTTTGTTGGGCTG 547 > Ahg926202 jgi|Araly1|926202|scaffold_201763.1 Length=915 Score = 154 bits (83), Expect = 2e-36 Identities = 99/107 (93%), Gaps = 0/107 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1071 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGC 1130 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 682 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACTTTTGGTTTTGGCATGTGGTGGAGAAGC 741 Query 1131 TGTGAATTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTG 1177 |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| Sbjct 742 TGTGAACTCTGTTGATGACTTGACCCCTGATTCTCTTTGTTGGGCTG 788 > Ahg343780 jgi|Araly1|343780|fgenesh1_pg.C_scaffold_4000122 Length=600 Score = 147 bits (79), Expect = 4e-34 Identities = 98/107 (92%), Gaps = 1/107 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1071 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGC 1130 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 456 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTGGTTTTGGCATGTGGTGGAGAAGC 515 Query 1131 TGTGAATTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTG 1177 |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| || | ||||||| Sbjct 516 TGTGAACTCTGTTGATGACTTGACCC-TGATTCTTTTTGTTGGGCTG 561 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 72600006970 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5