BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G16070.1
Length=1932
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg893517 jgi|Araly1|893517|Al_scaffold_0006_1513 2748 0.0
Ahg477487 jgi|Araly1|477487|fgenesh2_kg.3__188__AT3G02530.1 2060 0.0
Ahg891256 jgi|Araly1|891256|Al_scaffold_0007_3242 159 5e-38
Ahg926202 jgi|Araly1|926202|scaffold_201763.1 154 2e-36
Ahg343780 jgi|Araly1|343780|fgenesh1_pg.C_scaffold_4000122 147 4e-34
> Ahg893517 jgi|Araly1|893517|Al_scaffold_0006_1513
Length=1608
Score = 2748 bits (1488), Expect = 0.0
Identities = 1568/1608 (98%), Gaps = 0/1608 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 130 ATGTCAGTGCGAGTTCTGAATCCTAATGCCGAGGTTCTCAACAAATCTGCGGCGCTTCAT 189
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAGTGCGAGTTCTGAATCCTAATGCGGAGGTTCTCAACAAATCGGCGGCGCTTCAT 60
Query 190 ATGACCATCAACGCCGCCAAGGGTTTGCAAGATGTACTCAAGTCGAATCTCGGTCCTAAA 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||
Sbjct 61 ATGACCATCAACGCCGCCAAGGGTTTGCAAGATGTGCTAAAGTCGAACCTCGGGCCTAAA 120
Query 250 GGAACAATCAAAATGCTTGTTGGTGGTTCTGGGGATATTAAGCTTACCAAAGATGGGAAC 309
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GGAACAATCAAGATGCTTGTTGGTGGTTCTGGGGATATTAAGCTTACCAAAGATGGGAAC 180
Query 310 ACGCTATTGAAGGAAATGCAAATTCAGAATCCAACAGCCATTATGATTGCGAGGACAGCT 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ACGCTATTGAAGGAAATGCAAATTCAGAATCCAACCGCCATTATGATTGCGAGGACAGCC 240
Query 370 GTTGCACAGGATGATATAAGTGGTGATGGTACTACTTCCACTGTTATCTTCATTGGTGAG 429
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 241 GTTGCACAGGATGACATAAGTGGTGATGGTACTACTTCCACTGTCATCTTCATTGGTGAG 300
Query 430 CTTATGAAACAGTCTGAACGCTGCATCGATGAAGGTATGCATCCACGAGTCCTAGTTGAT 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 CTTATGAAACAGTCTGAACGCTGCATCGATGAAGGTATGCATCCACGTGTCCTAGTTGAT 360
Query 490 GGTTTCGAGATTGCTAAGAGAGCTACTCTTCAATTTCTTGACAACTTCAAGACCCCTGTT 549
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGTTTCGAGATTGCTAAGAGAGCTACTCTTCAATTTCTTGACAACTTCAAGACCCCTGTG 420
Query 550 GTTATGGGTGATGAAGTTGATAAAGAGATCCTAAAAATGGTTGCAAGAACGACACTAAGA 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTTATGGGTGATGAAGTTGATAAAGAGATCCTAAAAATGGTTGCAAGAACGACACTAAGA 480
Query 610 ACAAAATTGTACGAAGGCTTAGCTGATCAACTGACTGACATTGTCGTCAATTCGGTTCTT 669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 481 ACAAAATTGTACGAAGGCTTAGCTGATCAACTGACTGACATTGTCGTTAATTCGGTTCTC 540
Query 670 TGCATCCGAAAGCCTGAGGAAGCTATTGATCTGTTTATGGTGGAAATAATGCACATGCGT 729
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TGCATCCGAAAGCCTGAAGAAGCTATTGATCTGTTTATGGTGGAAATAATGCACATGCGT 600
Query 730 CACAAATTCGATGTTGACACACGATTGGTTGAGGGGCTTGTTCTGGATCATGGTTCGAGA 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CACAAATTCGATGTTGACACACGATTGGTTGAGGGACTTGTTCTGGATCATGGTTCGAGA 660
Query 790 CACCCTGACATGAAACGACGCGCAGAAAATTGCCACATCTTAACTTGCAATGTGTCACTA 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 661 CACCCTGACATGAAACGACGCGCAGAAAATTGCCACATCCTAACTTGCAATGTGTCACTG 720
Query 850 GAGTATGAGAAGAGTGAAATCAATGCAGGATTTTTCTACTCTAATGCGGAGCAGAGGGAA 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GAGTATGAGAAGAGTGAAATCAATGCAGGATTTTTCTACTCTAATGCGGAGCAGAGGGAA 780
Query 910 GCCATGGTTACCGCAGAGAGGCGATCTGTTGATGAAAGAGTTAAGAAAATAATTGAGCTG 969
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 781 GCAATGGTTACCGCAGAGAGGCGATCTGTTGATGAAAGAGTTAAGAAAATCATTGAGCTG 840
Query 970 AAGAAGAAGGTGTGTGGTGATAATGACAACTTTGTTGTCATAAATCAGAAGGGTATTGAC 1029
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AAGAAAAAGGTGTGTGGTGATAATGACAACTTTGTTGTCATAAATCAGAAGGGTATTGAC 900
Query 1030 CCACCATCATTGGATCTTCTTGCTAGAGAAGGGATTATTGGTCTTAGAAGAGCAAAGAGG 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CCACCATCATTGGATCTTCTTGCTAGAGAAGGGATTATTGGTCTTAGAAGAGCAAAGAGG 960
Query 1090 AGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGCTGTGAATTCTGTTGACGAC 1149
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 961 AGGAATATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGCTGTGAATTCTGTTGATGAC 1020
Query 1150 TTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTGGACTTGTCTATGAGCACGTTCTTGGGGAGGAA 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTGGACTTGTCTATGAGCACGTTCTTGGGGAGGAA 1080
Query 1210 AAGTACACCTTTGTGGAGCAAGTGAAGAATCCTAATTCATGTACCATCCTCATAAAAGGG 1269
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 AAGTACACCTTTGTGGAACAAGTGAAGAATCCTAATTCATGTACCATCCTCATAAAAGGG 1140
Query 1270 CCTAATGATCACACTATTGCCCAAATTAAGGACGCTGTTCGTGATGGTCTGAGATCGGTC 1329
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1141 CCTAATGATCACACCATTGCTCAAATTAAGGACGCTGTTCGTGATGGTCTAAGATCGGTC 1200
Query 1330 AAGAACACCATAGAAGACGAGTGTGTTGTGTTAGGAGCAGGAGCTTTTGAAGTTGCAGCA 1389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 AAGAACACCATAGAAGACGAGTGTGTTGTGTTAGGAGCAGGAGCTTTTGAAGTTGCAGCA 1260
Query 1390 AGGCAACACTTACTCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTCAAGGGCGTGCCCAACTTGGCGTT 1449
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 AGGCAACACTTAATCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTCAAGGGCGTGCCCAACTTGGCGTT 1320
Query 1450 GAAGCTTTTGCTAATGCCCTTCTCGTGGTGCCTAAGACACTTGCAGAAAATGCAGGTCTT 1509
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GAAGCTTTTGCTAATGCTCTTCTCGTGGTGCCTAAGACACTTGCAGAAAATGCAGGTCTT 1380
Query 1510 GATACCCAAGATGTGATCATTTCTCTTACGAGCGAGCATGACAAAGGGAACGTTGTGGGA 1569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1381 GATACCCAAGATGTGATCATTTCTCTTACGAGCGAGCATGACAAAGGGAACATTGTGGGG 1440
Query 1570 CTGAACCTTCAGGACGGTGAACCTATTGACCCGCAGCTTGCTGGTATTTTTGATAATTAC 1629
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1441 CTGGACCTTCAGGACGGTGAACCAATTGACCCGCAACTTGCTGGTATTTTTGATAACTAC 1500
Query 1630 TCAGTGAAACGCCAACTTATCAATTCAGGGCCAGTGATTGCGTCGCAATTACTTTTGGTG 1689
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1501 TCAGTGAAACGCCAACTTATCAATTCAGGGCCCGTGATTGCGTCACAATTGCTTTTGGTG 1560
Query 1690 GACGAAGTGATTCGTGCAGGCAGAAATATGAGGAAGCCTACTGCTTGA 1737
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GACGAAGTGATTCGTGCAGGAAGAAATATGAGGAAGCCTACTGCTTGA 1608
> Ahg477487 jgi|Araly1|477487|fgenesh2_kg.3__188__AT3G02530.1
Length=1756
Score = 2060 bits (1115), Expect = 0.0
Identities = 1451/1616 (90%), Gaps = 11/1616 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 123 ATCGAAAATGTCAGTGCGAGTTCTGAATCCTAATGCCGAGGTTCTCAACAAATCTGCGGC 182
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 50 ATCGAAAATGTCTGTGCGTGTTCTGAATCCTAATGCGGAGGTGCTCAACAAATCGGCCGC 109
Query 183 GCTTCATATGACCATCAACGCCGCCAAGGGTTTGCAAGATGTACTCAAGTCGAATCTCGG 242
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 110 GCTTCATATGACCATCAACGCCGCCAAGGGTTTACAGGATGTACTCAAGTCGAATCTCGG 169
Query 243 TCCTAAAGGAACAATCAAAATGCTTGTTGGTGGTTCTGGGGATATTAAGCTTACCAAAGA 302
|||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 170 TCCTAAGGGAACTATTAAGATGCTTGTTGGTGGTTCCGGGGATATCAAGCTTACCAAGGA 229
Query 303 TGGGAACACGCTATTGAAGGAAATGCAAATTCAGAATCCAACAGCCATTATGATTGCGAG 362
||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 230 TGGCAACACGCTTTTGAAGGAAATGCAAATTCAAAATCCAACAGCCATCATGATTGCCAG 289
Query 363 GACAGCTGTTGCACAGGATGATATAAGTGGTGATGGTACTACTTCCACTGTTATCTTCAT 422
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 290 GACAGCTGTTGCTCAGGATGACATAAGTGGTGATGGTACTACTTCCACTGTCATCTTCAT 349
Query 423 TGGTGAGCTTATGAAACAGTCTGAACGCTGCATCGATGAAGGTATGCATCCACGAGTCCT 482
||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 350 TGGTGAGCTTATGAAGCAGTCGGAGCGTTGCATCGATGAAGGAATGCATCCACGAGTCTT 409
Query 483 AGTTGATGGTTTCGAGATTGCTAAGAGAGCTACTCTTCAATTTCTTGACAAC-TTCAAGA 541
||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||
Sbjct 410 AGTTGATGGTTTCGAGATTGCAAAAAGAGCTACTCTCCAATTTCTCGAC-ACTTTCAAGA 468
Query 542 CCCCTGTTGTTATGGGTGATGAAG-TTGATAAAGAGATCCTAAAAATGGTTGCAAGAACG 600
| ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 469 CACCTGTGGTTATGGGTGATG-AGCCTGACAAAGAGATCCTGAAAATGGTTGCCAGGACA 527
Query 601 ACACTAAGAACAAAATTGTACGAAGGCTTAGCTGATCAACTGACTGACATTGTCGTCAAT 660
|| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 528 ACGCTAAGAACTAAGCTGTATGAAGGCTTAGCTGATCAACTGACTGATATTGTTGTTAAT 587
Query 661 TCGGTTCTTTGCATCCGAAAGCCTGAGGAAGCTATTGATCTGTTTATGGTGGAAATAATG 720
|||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||
Sbjct 588 TCGGTTCTCTGCATTCGGAAGCCTGAGGAACCTATTGATCTGTTTATGGTTGAGATTATG 647
Query 721 CACATGCGTCACAAATTCGATGTTGACACACGATTGGTTGAGGGGCTTGTTCTGGATCAT 780
|||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 648 CACATGCGCCATAAATTTGATGTTGACACACGATTGGTTGAGGGGCTTGTTCTTGATCAT 707
Query 781 GGTTCGAGACACCCTGACATGAAACGACGCGCAGAAAATTGCCACATCTTAACTTGCAAT 840
||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| | |||||||||
Sbjct 708 GGTTCAAGACACCCTGACATGAAGCGACGTGCGGAGAATTGTCACATCCTGACTTGCAAT 767
Query 841 GTGTCACTAGAGTATGAGAAGAGTGAAATCAATGCAGGATTTTTCTACTCTAATGCGGAG 900
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 768 GTGTCATTAGAGTATGAGAAGAGTGAAATTAATGCAGGATTCTTCTACTCGAATGCGGAG 827
Query 901 CAGAGGGAAGCCATGGTTACCGCAGAGAGGCGATCTGTTGATGAAAGAGTTAAGAAAATA 960
|||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 828 CAGAGGGAAGCCATGGTTACTGCTGAGCGACGTTCTGTTGATGAAAGAGTTCAGAAAATT 887
Query 961 ATTGAGCTGAAGAAGAAGG--TGTG-TGGTGATAATGACAACTTTGTTGTCATAAATCAG 1017
|||||||||||||| |||| |||| |||| || || ||| |||||||||| |||||||
Sbjct 888 ATTGAGCTGAAGAACAAGGTTTGTGCTGGTAATGATAACAGCTTTGTTGTCCTAAATCAA 947
Query 1018 AAGGGTATTGA-CCCACCATCATTGGATCTTCTTGCTAGAGAAGGGATTATTGGTCTTAG 1076
||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||
Sbjct 948 AAGGGTATTGATCCC-CCGTCATTGGATCTTCTTGCTAGAGAAGGGATAATCGCCCTTAG 1006
Query 1077 AAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGCTGTGAA 1136
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 AAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTGGTTTTGGCATGTGGTGGAGAAGCTGTGAA 1066
Query 1137 TTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTGGACTTGTCTATGAGCACGT 1196
|||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1067 CTCTGTTGATGACTTGACCCCTGATTCTCTTGGTTGGGCTGGACTTGTATATGAGCACGT 1126
Query 1197 TCTTGGGGAGGAAAAGTACACCTTTGTGGAGCAAGTGAAGAATCCTAATTCATGTACCAT 1256
|||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 1127 TCTTGGAGAGGAGAAGTACACATTTGTCGAGCAAGTGAAGAATCCTCATTCATGTACTAT 1186
Query 1257 CCTCATAAAAGGGCCTAATGATCACACTATTGCCCAAATTAAGGACGCTGTTCGTGATGG 1316
|||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1187 CCTCATAAAAGGCCCTAACGACCACACTATTGCTCAAATTAAGGACGCTGTCCGTGATGG 1246
Query 1317 TCTGAGATCGGTCAAGAACACCATAGAAGACGAGTGTGTTGTGTTAGGAGCAGGAGCTTT 1376
| | ||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 1247 TTTAAGATCAGTTAAGAATACCCTAGAAGATGAGTGTGTCGTATTAGGAGCTGGAGCTTT 1306
Query 1377 TGAAGTTGCAGCAAGGCAACACTTACTCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTCAAGGGCGTGC 1436
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1307 TGAAGTTGCAGCAAGACAACACTTAATCAATGAAGTCAAGAAAACCGTTCAAGGGCGCGC 1366
Query 1437 CCAACTTGGCGTTGAAGCTTTTGCTAATGCCCTTCTCGTGGTGCCTAAGACACTTGCAGA 1496
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1367 TCAACTCGGTGTTGAAGCTTTTGCTAATGCCCTTCTCGTGGTGCCTAAGACACTTGCTGA 1426
Query 1497 AAATGCAGGTCTTGATACCCAAGATGTGATCATTTCTCTTACGAGCGAGCATGACAAAGG 1556
|||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1427 AAATGCTGGGCTTGACACTCAAGACGTTATCATTTCTCTAACGAGTGAGCATGACAAAGG 1486
Query 1557 GAACGTTGTGGGACTGAACCTTCAGGACGGTGAACCTATT-GACCCGCAGCTTGCTGGTA 1615
||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| | | ||||| |||||||| ||||
Sbjct 1487 AAACGTCGTGGGACTAAACCTACAGGATGGAGAACC-AGTCGACCCTCAGCTTGCCGGTA 1545
Query 1616 TTTTTGATAATTACTCAGTGAAACGCCAACTTATCAATTCAGGGCCAGTGATTGCGTCGC 1675
|||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1546 TTTTCGACAATTACTCGGTGAAACGCCAACTTATCAATTCAGGGCCGGTGATTGCTTCGC 1605
Query 1676 AATTACTTTTGGTGGACGAAGTGATTCGTGCAGGCAGAAATATGAGGAAGCCTACT 1731
| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1606 AGTTGCTATTAGTGGATGAAGTGATTCGTGCAGGAAGAAATATGAGGAAGCCTACT 1661
> Ahg891256 jgi|Araly1|891256|Al_scaffold_0007_3242
Length=696
Score = 159 bits (86), Expect = 5e-38
Identities = 100/107 (93%), Gaps = 0/107 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1071 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGC 1130
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 441 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTGGTTTTGGCATGTGGTGGAGAAGC 500
Query 1131 TGTGAATTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTG 1177
|||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||
Sbjct 501 TGTGAACTCTGTTGATGACTTGACCCCTGATTCTCTTTGTTGGGCTG 547
> Ahg926202 jgi|Araly1|926202|scaffold_201763.1
Length=915
Score = 154 bits (83), Expect = 2e-36
Identities = 99/107 (93%), Gaps = 0/107 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1071 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGC 1130
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 682 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACTTTTGGTTTTGGCATGTGGTGGAGAAGC 741
Query 1131 TGTGAATTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTG 1177
|||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||
Sbjct 742 TGTGAACTCTGTTGATGACTTGACCCCTGATTCTCTTTGTTGGGCTG 788
> Ahg343780 jgi|Araly1|343780|fgenesh1_pg.C_scaffold_4000122
Length=600
Score = 147 bits (79), Expect = 4e-34
Identities = 98/107 (92%), Gaps = 1/107 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1071 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTAGTTTTGGCCTGTGGTGGAGAAGC 1130
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 456 TCTTAGAAGAGCAAAGAGGAGGAACATGGAACGTTTGGTTTTGGCATGTGGTGGAGAAGC 515
Query 1131 TGTGAATTCTGTTGACGACTTGACCCCTGAGTCTCTTGGATGGGCTG 1177
|||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| || | |||||||
Sbjct 516 TGTGAACTCTGTTGATGACTTGACCC-TGATTCTTTTTGTTGGGCTG 561
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 72600006970
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5