BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G16210.1
Length=3870
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488471 jgi|Araly1|488471|fgenesh2_kg.6__1605__AT5G16210.1 6407 0.0
> Ahg488471 jgi|Araly1|488471|fgenesh2_kg.6__1605__AT5G16210.1
Length=3857
Score = 6407 bits (3469), Expect = 0.0
Identities = 3741/3870 (97%), Gaps = 27/3870 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 ACCGTCACTCGCTTCCGGAGAGATTCATCGGCGAGAACACCGACACGATCTGGTGAATCG 69
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACCGTCACTCCCTTCCGGTGAGATTCATCGGCGAGAACACCGACACGATCTGGTGAATCG 60
Query 70 AATCCGATCGAATCGAGAGAGGAAAAGTTTGAATTTTCATTT-GGAATGCTCAGTGATAT 128
||| |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||
Sbjct 61 AATTCGATCGAATCGAGAGAGGGATAGTTTGAATTCTC-TTTCGGAATGCTCAGTGATAT 119
Query 129 TGGAACGAAGGAGGTGTTTCCTCTGATTGGATTTTA-GTGTTCCCGTGAAAGAAGAAGAA 187
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||
Sbjct 120 TGGAACGAAGGAGGTGTTTCCTCTGATTGGGTTTTAGGGGTTCCTGTGAAAGAAGGAGAA 179
Query 188 AACAAAACATGGACGCGGAGCGATCGTCGTTGTGCAACTTTTTCGTCAACTTCCTGATGG 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 AACAAAACATGGACGCGGAGCGATCGTCGTTGTGCAACTTTTTCGTCAACTTCCTGATGG 239
Query 248 AGGAGAACTACCTCTTGACGGCGTTTGAGCTTCTTCACGAGCTCCTCGACGATGGCCGCG 307
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 AGGAGAACTACCTTTTGACGGCGTTTGAGCTTCTTCACGAGCTCCTCGACGATGGCCGCG 299
Query 308 ATGCCCAAGCAATTCGTCTTAAGGAGTTCTTTTCCGATCCTTCCCGTTTCCCTCCTGATC 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 ATGCCCAAGCAATTCGTCTTAAGGAGTTCTTTTCCGATCCTTCCCGTTTCCCTCCTGATC 359
Query 368 AGATTTCTCGGTATAATTCAATTCGAGTTGCGGATCCACAAAGTTTGTTGGAGGAGAAAG 427
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 360 AGATTTCTCGGTATAATTCAATTCGAGTTGCGGATCCACAAAGTTTATTGGAGGAGAAAG 419
Query 428 AAGCTTTAGCTGAGAAGTTAGCTATCAGCGAATATGAATTTCGTCTAGCTCAGGAGGATA 487
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 AAGCATTAGCTGAGAAGTTAGCTATCAGCGAATATGAATTTCGTCTAGCTCAGGAGGATA 479
Query 488 TTGCAAGATTGAAAACTGAAGGACAGAAGAAATCTGTTCCTTCGATTGACAAGTCAGAAG 547
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TTACAAGATTGAAAACTGAAGGACAGAAGAAATCTAATCCTTCGATTGACAAGTCAGAAG 539
Query 548 AGATGGATTCGGATGAGTTTGGAGGCAACAGGCCAGAGATTCAACGGAAAAAGAAAGATT 607
|| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 AGTTGGACTCGGATGAGTTTGGAGACAACAGGCCAGAGATTCAACGGAAAAAGAAAGATT 599
Query 608 TTTCCTTCACTGATATAGGGCCTTTGAAGAACAATGAACGTCAAGACTTAAACTGTGCAG 667
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 600 TTTCCTTCACTGATATAGGGCCTTTGAAGAACAATGAACGTCGAGACTTAAATTGTGCAG 659
Query 668 TGAAAGAATATCTTCTTCTAGCAGGTTATAGGCTTACGGCTATGACATTTTATGAGGAGG 727
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGAAAGAATATCTTCTTCTAGCAGGTTACAGGCTTACGGCTATGACATTTTATGAGGAGG 719
Query 728 TGACAGACCAGAACTTGGACGTTTGGCAGGACAGTCCAGCACACGTACCTGATGCCTTGC 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 720 TGACAGACCAGAACTTGGACGTTTGGCAGGACAGTCCAGCACATGTACCTGATGCCTTGC 779
Query 788 GCTATTATTACTATCAGTACCTCTCATCAACTTCAGAAGCAGCTGAGGAGAAAATAGCCA 847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GCTATTATTACTATCAGTACCTCTCATCAACTTCAGAAGCAGCTGAGGAGAAAATAGCCA 839
Query 848 TGCTTCAGGAGAATGAATCATTGAAAAAGGAGATTGAGAGGCTAAGCAAAGAAAAGGACG 907
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 840 TGCTTCAGGAGAATGAATCTTTGAAAAAGGAGATTGAGAGGCTAAACAAAGAAAAGGACG 899
Query 908 GACTACTTAAGAGCAAAGAAAATTTCGAAGAGCAAATAGGTGCTTTTAACAAGTCTACAG 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GACTACTTAAGAGCAAAGAAAATTTCGAAGAGCAAATCGGTGCTTTTAACAAGTCTACAG 959
Query 968 AATCACTTCAGAAGGATCTTCGGGACAGAGAAAAGCAGGTGCAAAGTTTGAAGCAATCCT 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 AATCACTTCAGAAGGATCTTCGGGACAGAGAAAAGCAGGTGCAAAGTTTGAAGCAATCCT 1019
Query 1028 CAGAGCATCAGAGGAGGAACCTCAATGACTGTAGGGCTGAGATCACTTCTCTTAAAATGC 1087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 CAGAGCATCAGAGGAGGAACCTCAATGACTGTAGGGCTGAGATCACTTCTCTTAAAATGC 1079
Query 1088 ATATTGAAGGGTCTCGCGCTGGTCAATATGTGTCACT-GAATGAAGGTGATCCTGTAAAA 1146
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 ATATTGAAGGGTCTCGTGCTGGTCAATATGTGTCA-TCGAATGAAGGTGATCCTGTAAAA 1138
Query 1147 TTACAATCCAAGGAAGTCGAGGAACAGATAAGCACTCTGTCAGAGGAAGTTGTAAATCCA 1206
||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1139 TTACAATCC-----A----AGGAACAGATCAGCACGCTGTCGGAGGAAGTTGTAAAACCA 1189
Query 1207 ACAGTGGAAAAGGATGGTGGTTTGATTTCTAAAGTTTCTATATCGGCTGAGAAAGGGCAC 1266
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1190 ACAGTGGAAAAGGATGGTGGTTTGATTTCTGAAGTTTCTATATTGGCTGAGAAAGGGCAC 1249
Query 1267 ATACAAACAGAAGACGATATGGTGGTGGAAGAGGTTAAGAATATTATTGCTGATCAAAGA 1326
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 ATACAAACAGAAGACGATCTGGTGGTGGAAGAGGTTAAGAATATTATTGCTGATCAAAGA 1309
Query 1327 GAGGTGGCAGGAGAGGCCGGCAATATATCTTA-TGCCAACAATGGTACGTTGGAGAACCA 1385
|||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1310 GAGGTGGCAGCAGAGGCCAGCAATATATC-TATTGCCAACAATGGTACTTTAGAAAACCA 1368
Query 1386 GAAAGAAGTCTCAAACTATTTGTTAAGTCCATCAAACGGTAATTTCTCACCCAGAGACCT 1445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 GAAAGAAGTCTCAAACTATTTGTTAAGTCCATCAAACGGCAATTTCTCACCCAGAGACCT 1428
Query 1446 TGGAAGCATCTTGAAAGTGGATCCTGGAATTGGTCGTGATTCTAACTCAAAATCAGACAA 1505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 AGGAAGCATCTTGAAAGTGGATCCTGGAATTGGTCGTGGTTCTAACTCAAAATCAGACAA 1488
Query 1506 TGCAAATGGTGAAGCTGCTTCTGAGGAAATGGGTTTAGGAACGATTCAGATACTTGCAGA 1565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 TGCAAATGGTGAAGCTGCTTCTGAGGAAATGGGTTTAGGAACGATTCAGATACTTGCAGA 1548
Query 1566 TGCTTTGCCGAATATTGTTCCATATGTTCTGATAAACCATCGAGAGGAACTCCTTCCCCT 1625
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 TGCTTTGCCGAAGATTGTTCCGTATGTTCTGATAAACCATCGAGAGGAACTCCTTCCCCT 1608
Query 1626 GATGATGTGTGCAATTGAGCGGCATCCAGTTAGCAGTACAAGAGATTCCTTGACTCATAC 1685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 GATGATGTGTGCAATTGAGCGGCATCCAGTTAGCAGTACAAGAGATTCCTTGACTCATAC 1668
Query 1686 ACTGTTCAACCTGATCAAACGTCCAGATGAACAGCAGAGGCGGATTATTATGGATGCATG 1745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669 ACTGTTCAACCTGATCAAACGTCCAGATGAACAGCAGAGGCGGATTATTATGGATGCATG 1728
Query 1746 TGTTAGCCTATCGAGGAATGTTGGGGAAATGAGAACAGAAACAGAATTGCTTCCGCAGTG 1805
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1729 TGTTAGCCTATCGCGGAATGTTGGGGAAATGAGAACAGAAACAGAATTGCTTCCACAGTG 1788
Query 1806 CTGGGAACAGATAAATCATACATATGAAGAACGCAGGCTGCTAGTTGCTCAATCATGTGG 1865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1789 CTGGGAACAGATAAATCATACATATGAAGAACGCAGGCTGCTAGTTGCTCAATCATGTGG 1848
Query 1866 GGAGCTTGCAGAATATGTCCGCCCTGAGATACGGGACTCTCTTATTTTGTCTATCGTACA 1925
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1849 GGAGCTTGCAGAATATGTCCGCCCTGAGATACGGGACTCTCTTATTTTATCTATCGTACA 1908
Query 1926 ACAACTCATAGAAGATTCTGCCACCGTTGTTCGAGAGGCTGCGGCTCATAATCTGGCATT 1985
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1909 ACAACTCATAGAAGATTCTGCCACCGTTGTTCGAGAGGCTGCCGCTCATAATCTGGCATT 1968
Query 1986 GCTGCTTCCACTATTTCCTAACACAGACAAATATTTCAAGGTAGAGGAGATGATGTTTCA 2045
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1969 GCTGCTTCCACTATTTCCGAACACAGACAAATATTTCAAGGTCGAGGAGATGATGTTTCA 2028
Query 2046 GCTGATATGCGATCCGTCTGGCCTGGTGGTTGAAACTACATTGAAAGAACTACTTCCTGC 2105
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 GCTGATATGTGATCCGTCTGGCCTGGTGGTTGAAACTACATTGAAAGAACTACTTCCTGC 2088
Query 2106 AGTGATAAAATGGGGTAACAGGCTGGATCATATCTTGAGAGGTCTTCTCTCTCACACTTT 2165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 AGTGATAAAATGGGGTAACAGGCTGGATCATATCTTGAGAGGTCTTCTCTCTCACACTTT 2148
Query 2166 GAGCTCAGCTCAGCACTGCCCACCTCTTTCTGGAGTTGAAGGGTCATTGGAGTCTCATCT 2225
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 GAGCTCTGCTCAGCACTGCCCACCTCTTTCTGGAGTTGAAGGGTCATTGGAGTCTCATCT 2208
Query 2226 ACGAGTCTTAGGTGAACGGGAGCGATGGAACATTGATGTCCTACTACGAATGCTCATGGA 2285
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 GCGGGTCTTAGGTGAACGGGAGCGATGGAACATTGATGTCCTACTACGAATGCTCATGGA 2268
Query 2286 GTTGCTTCCAGCTATACACCAGAAGGCAATGACAACATGTCCGTTTTCTTCCATCTCAAA 2345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2269 CTTGCTTCCAGCTATACACCAGAAGGCAATGACAACATGTCCTTTTTCTTCCATCTCAAA 2328
Query 2346 GTCAGAGGAATCTGCATTCTCTGTTTCCTTGCTTGAGATCTATGCCGAGGGACGTTCTGA 2405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2329 GTCAGAGGAATCTGCATTCTCTGTTTCCTTGCTTGAGATCTATGCCGAGGGACGTTCTGA 2388
Query 2406 GTGGCCTATGTTTGAGTGGATGCATGTTGATTGCTTTGCTAACTTGTTGCAACTGGCATG 2465
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2389 GTGGCCTATGTTTGAATGGATGCATGTTGATTGCTTTGCTAACTTGTTGCAACTGGCATG 2448
Query 2466 CATGTTGCCCCAGAAGGAAGACCATTTGAGAAATCGGATAACAAAGTTTCTCTTGGCTGT 2525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 CATGTTGCCCCAGAAGGAAGACCATTTGAGAAATCGGATAACAAAGTTTCTCTTGGCTGT 2508
Query 2526 ATCTGAACGTTTTGGAAGTTCCTACCTAACTCACATTGAGTTACCTGTATTTTTGGTGGC 2585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2509 ATCTGAACGTTTTGGAAGTTCCTACCTAACTCACATTGAGTTACCTGTATTCTTGGTGGC 2568
Query 2586 CGCTGGAGATGATGAGGCTGATCTTCGATTCTTACCTTCTGCAATCCATCCAAGAATAAA 2645
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2569 CGCTGGAGATGATGAGGCTGATCTTCGATTCTTACCTTCTGCAATCCATCCAAGGATAAA 2628
Query 2646 AGGCCTGAAACCAAGAACTGCTGTAGCCAATAGACTTGCCACTCTTTGTATTCTACCGCT 2705
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2629 AGGCCTGAAACCAAGAACTGCTGTAGCCAATAGACTTGCCACGCTTTGTATTCTACCGCT 2688
Query 2706 TCTGCTGGCAGGAGTTCTTGGTGCGCCAAGTAAACGCGAAGAATTAACTATCTTCTTACG 2765
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2689 TCTGTTGGCAGGAGTTCTTGGTGCACCAAGTAAACGCGAAGAATTAACTATCCTCTTACG 2748
Query 2766 ACAACTTTTAGTTGAGAGCAAAACCAAGGAAAACCAGTCATCGAAGCACAACAACGAGGT 2825
|||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||
Sbjct 2749 ACAACTCTTAGTGGAGAGCAAAACAAAGGAAAACCAGTCAGCGAAGCACAATAATGAGGT 2808
Query 2826 TTTGGATGCAGTTCGCTTCCTTTGCACATTTGAGGTACACCATAACATGATATTCGGCAT 2885
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2809 TTTGGATGCAGTTCGCTTCCTTTGCACATTTGAGGAACACCATAACATGATATTCGGAAT 2868
Query 2886 TTTGTGGGAAATGGTCGTTGATTCCACTGCAGAACTCAAAATCAACGCTGCTAAGTTGTT 2945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2869 TTTGTGGGAAATGGTCGTTGATTCCACTGCAGAACTCAAAATCAACGCTGCTAAGTTGTT 2928
Query 2946 GAAGACCATCGTTCCATATATCGACGCAAAAGTTGCTTCCGCCAATGTTTTACCAGCCTT 3005
||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2929 GAAGACCATTGTTCCATATATCGATGCAAAGGTTGCTTCTGCCAATGTTTTACCAGCCTT 2988
Query 3006 GATCACTCTTGGCTCGGACCAGAACCTGAATGTGAAGTACGCAAGCATAGATGCATTTGG 3065
|||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||
Sbjct 2989 GATCACTCTTGGTTCAGACCAGAACCTGAATGTAAAATATGCAAGCATAGATGCATTTGG 3048
Query 3066 ATCTGTAGCACAGCATTTCAAAGTCGACATGATTGTTGATAAAATCCTAGTCCAGATGGA 3125
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3049 ATCTGTAGCACAGCATTTCAAAATCGACATGATTGTTGATAAAATCCTAGTCCAGATGGA 3108
Query 3126 TGCTTTTATGGAAGATGGATCTCATGAGGCTATAATCGCAGTCATTCGTGCACTCTTAGT 3185
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TGCTTTTTTGGAAGATGGATCTCATGAGGCTATAATCGCAGTCATTCGTGCACTCTTAGT 3168
Query 3186 TGCTATTCCTCACACGACAGAACGGCTTCGAGATTATCTTTTGTCCAAGATTTTACAACT 3245
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3169 TGCTATTCCTCACACTACAGAACGGCTTCGAGATTATCTTTTGTCCAAGATTTTACAACT 3228
Query 3246 TTCAGCAAGTCCAAGCTCTTCAACAGACGTAAATCGTCGTCGAGAAAGAGCTAACGCATT 3305
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 TTCAGCAAGTCCAAGCACTTCAACAGATGTAAATCGTCGGCGAGAAAGAGCTAACGCATT 3288
Query 3306 CTGTGAAGCCATTCGTGCACTCGATGCAACTGATTTGTCTCAAACAAGTGTCAAAGAATA 3365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3289 CTGTGAAGCCATTCGTGCACTCGATGCAACTGATTTGTCTCAAACAAGTGTCAAAGAATA 3348
Query 3366 CCTCCTTCCAGCGATTCAAAACCTACTGAAAGATCCAGATGCGCTAGATCCAGCTCACAA 3425
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3349 TCTCCTTCCAGCGATTCAAAACCTACTGAAAGATCCAGATGCGCTAGATCCAGCTCACAA 3408
Query 3426 GGAAGCGTTAGAGATCATAATGAAGGAGAGATCAGGTGGGACATTTGAAGCAATTAGTAA 3485
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3409 GGAAGCGTTAGAGATCATAATGAAGGAGAGATCAGGTGGGACATTTGAAGCAATCAGTAA 3468
Query 3486 AGCTATGGGTGCTCACTTGGGGATTGCATCATCCGTCACGAGCTTGTTTGGAGAAGGAGG 3545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3469 AGCTATGGGTGCTCACTTGGGGATTGCATCATCCGTCACAAGCTTGTTTGGAGAAGGAGG 3528
Query 3546 CTTGTTGGGGAAGAAAGAAGCAACGGAAAGCAC-G-G----CACC-TGGATCACCGACAG 3598
|||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | |||||||||||
Sbjct 3529 CTTGTTGGGGAAGAAAGAAGCAACAGAAAGCACTGCGGTTGCACCGTC-ATCACCGACAG 3587
Query 3599 GTCAGGGACCCGAGTCACCAAAGGTTGTGGCTGCAGCAAGTGAAGACACGAGATTCAGAC 3658
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3588 TTCAGGGACCTGAGTCCCCAAAGGTTGTGGCTGCAGCGACTGAAGACACGAGATTCAGAC 3647
Query 3659 GTATCATGAGAGGCAACTTCACTGAGATGCTAAGGAGTAAAGCCAAGACCCAAGATGAGA 3718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3648 GTATCATGAGAGGCAACTTCACTGAGATGCTAAGGAGTAAAGCCAAGAACCAAGATGAGA 3707
Query 3719 CACAGCCACAAAATCACTAAATATAGACCAGGTTTTTA-TTCATTTAATACATCTACTGC 3777
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 3708 CACAGCCACAAAATCACTAAATATAAACCAGGTTTTTAATTCATTTAATACTTCTACTGC 3767
Query 3778 ATATATTCTAAATACACAGA-AA-TAAAATCATGTtcttttgttatttggcttgctttat 3835
||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 3768 ATATATTCTTAATACACAGAGAAATAAAATCATGTTCTTTTGTTATTTAGCCTGCTTTAT 3827
Query 3836 ttttatctctcttttagctattttgttttt 3865
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3828 TTTTATCTCTCTTTTAGCTATTTTGTTTTT 3857
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 146255253039
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5