BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G17680.1
Length=3885
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488633 jgi|Araly1|488633|fgenesh2_kg.6__1767__AT5G17680.1 6039 0.0
> Ahg488633 jgi|Araly1|488633|fgenesh2_kg.6__1767__AT5G17680.1
Length=3846
Score = 6039 bits (3270), Expect = 0.0
Identities = 3653/3839 (95%), Gaps = 21/3839 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 16 tctt-cttcttcttcttcttcttcAACAGTGTGGAAAACGGACGTTTTCGTGAGTTTTAG 74
|||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 9 TCTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGCCGTGTGGAAAACGGACGTTTTCGTTAGTTTTAG 68
Query 75 AGGAGAAGATGTGCGTAAAACATTCGTGAGCCATCTATTCTGCGAGTTTGATCGGATGGG 134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69 AGGAGAAGATGTGCGTAAAACATTCGTGAGCCATCTATTCTGCGAGTTTGATCGGATGGG 128
Query 135 GATTAAAGCTTTCAGAGACGATTTGGATCTACAGAGAGGAAAATCCATCTCCCCTGAGCT 194
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct 129 GATCAACGCTTTCAGAGACGATTTGGATCTACAGAGAGGAAAATCTATTTCCCCAGAGCT 188
Query 195 TATAGATGCGATCAAAGGCTCCAGATTTGCCATTGTTGTGGTCTCTAGGAACTACGCAGC 254
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 TATTGATGCGATCAAAGGCTCCAGATTCGCCATTGTCGTGGTCTCTAGGAACTACGCAGC 248
Query 255 TTCAAGCTGGTGCTTAGACGAGCTCTTGAAGATCATGGAATGT--A-ATA--A--AG--A 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |
Sbjct 249 TTCAAGCTGGTGCTTAGACGAGCTCTTGAAGATCATGGAATGTAAAGATACGATTAGTCA 308
Query 306 TACGAT-TGTACCCATTTTCTACGAGGTTGATCCTTCGGATGTGAGAAGACAGAGAGGAA 364
|| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 309 GACAATCT-TGCCCATTTTCTACGAGGTTGATCCTTCGGACGTGAGAAGACAGAGAGGAA 367
Query 365 GTTTCGGTGAAGATGTTGAGAGTCACAGTGACAAGGAGAAAGTG-GGGAAATGGAAAGAA 423
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||
Sbjct 368 GTTTCGGTGAAGATGTTGAGAGTCACAGTGACAAGGAGAAAGTGAGGG-AATGGAGAGAA 426
Query 424 GCTTTGAAGAAATTAGCTGCCATTTCTGGTGAAGATTCTCGGAATT---GGGATGACTCA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||
Sbjct 427 GCTTTGAAGAAATTAGCTGCCATTTCTGGTGAAGACTCACGAAATTGGAGGGATGAGTCA 486
Query 481 AAGCTGATTAAGAAGATTGTTAAAGACATTTCTGATAAATTGGTTTCTACTTCATGGGAT 540
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 487 AAGCTGATTAAGAAGATTGTTAGAGACATTTCTGATAAATTGGTTTCGACTTCAAGGGAT 546
Query 541 GATTCAAAAGGTTTGATTGGAATGAGTTCTCATATGGACTTTCTGCAGTCTATGATATCT 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 547 GATTCAAAAGGTTTGATTGGAATGAGTTCTCATATGGACTTTCTTCAGTCTATGATGTCT 606
Query 601 ATAGTGGACAAGGATGTTCGAATGTTGGGGATTTGGGGAATGGGTGGAGTTGGGAAAACT 660
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 607 ATAGAGGACAAGGATGTTCGAATGGTGGGGATTTGGGGAATGGGTGGAGTTGGGAAAACT 666
Query 661 ACGATTGCCAAATACTTATACAATCAACTCTCAGGTCAATTTCAAGTTCATTGCTTCATG 720
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 667 ACGATTGCTAAGTACTTATACAATCAACTCTCAGGTCGATTTCAAGCTCATTGCTTCATG 726
Query 721 GAGAATGTGAAGGAAGTCTGTAACAGATATGGAGTTAGGCGTTTACAAGTGGAGTTTTTA 780
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 727 GAGAATGTGAAAGAAGTCTGTAACAGATATGGAGTTAGGCGTTTACAAGGGGAGTTTTTA 786
Query 781 TGCAGAATGTTTCAAGAGAGAGACAAAGAAGCGTGGAGTTCGGTTTCTTGTTGCAATATA 840
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||
Sbjct 787 TGCAGAATGTTTCGAGAGAGAGATAAAGAAGCGTGGAGCTCGGTGTCTTGTTGCAGCATG 846
Query 841 ATAAAGGAAAGGTTCAGGCACAAAATGGTTTTCATTGTTCTTGACGATGTAGATAGATCT 900
||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 847 ATAAAGGAAAGGTTCAGGCACAAAAGGGTCTTGATTGTGCTCGACGATGTAGATAGATCT 906
Query 901 GAGCAACTGAATGAATTGGTGAAGGAGACTGGTTGGTTTGGTCCGGGAAGCAGAATCATC 960
|||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 907 GAGCAATTGAATGAATTGGTGAAGGAGATTGATTGGTTTGGTCCGGGAAGCAGAATTATC 966
Query 961 GTGACAACACGGGATAGACATTTGCTACTTTCCCATGGAATAAATTTGGTGTATAAAGTG 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 967 GTGACAACACGGGATAGACATTTGCTACTTTCTCATGGAATAGATTTGGTATATAAAGTG 1026
Query 1021 AAGTGTTTACCCAAAAAAGAAGCTCTCCAGCTCTTTTGTAATTATGCTTTCAGAGAAGAG 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1027 AAGTGTTTACCCAAAAAAGAAGCTCTCCAGCTCTTTTGTAACTATGCTTTCAGAGAGGAG 1086
Query 1081 ATTATACTTCCACATGGGTTTGAGGAGTTATCGGTTCAAGCTGTTAACTATGCTTCTGGT 1140
|||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1087 ATTAGAATTCCACATGGGTTTCAGGAGTTATCGGTTCAAGCTATTAACTATGCTTCTGGC 1146
Query 1141 CTTCCACTGGCTCTAAGAGTTTTAGGCTCCTTCCTTTATCGAAGAAGCCAAATTGAATGG 1200
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1147 CTTCCACTGGCTCTAAGAGTTTTGGGTTCCTTCCTTTATCGAAGAAGCCAAAGAGAATGG 1206
Query 1201 GAAAGTACTCTTGCTAGGCTTAAAACTTACCCTCATAGTGATATCATGGAAGTTTTGAGA 1260
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1207 GAAAGCACTCTTGCTAGGCTTAAAACTTACCCTCATAGTGATATCATGGAAGTTCTGAGA 1266
Query 1261 GTTAGCTACGACGGATTGGATGAGCAAGAGAAGGCTATTTTTCTCTATATATCATGTTTT 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 GTTAGCTACGACGGATTGGATGAGCAAGAGAAGGCTATTTTTCTCTATATATCATGTTTC 1326
Query 1321 TATAACATGAAGCAGGTTGATTATGTCAGAAAACTTCTGGATCTTTGTGGCTATGCTGCT 1380
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 1327 TATAACATGAAGCATGTTGATTATGTCACAAAACTTCTGGATATTTGTGGCTTTGCTGCT 1386
Query 1381 GAAATCGGAATAACGATACTTACCGAGAAGTCTTTGATAGTTGAATCAAATGGATGCGTA 1440
||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||
Sbjct 1387 GAAATTGGTATCACGATTCTTACCGAGAAGTCTTTGATATTTGTATCAAATGGAAACATA 1446
Query 1441 AAGATACATGATTTGCTTGAACAGATGGGTAGAGAGCTTGTTCGTCAACAAGCAGTTAAC 1500
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 AAGATGCATGATTTGCTTGAACAGATGGGTAGAGAGATTGTTCGTCAACAAGCAGTTAAC 1506
Query 1501 AACCCAGCCCAACGGTTACTAT-TATGGGATCCTGAAGACATATGTCATTTGCTGTCAGA 1559
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1507 AACCCAGCCCAACGGTTACT-TGTATGGGATCCTGAAGACATCTGTGATTTGCTGTCAGA 1565
Query 1560 AAATTCTGGAACACAACTTGTTGAAGGAATCTCTCTGAACCTCTCTGAAATTTCTGAGGT 1619
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566 AAATTCTGGAACACAACTTGTTGAAGGAATTTCTCTGAACCTCTCTGAAATTTCTGAGGT 1625
Query 1620 ATTTGCTAGTGATCGAGCGTTCGAGGGATTGTCTAATCTCAAACTTCTCAACTTCTATGA 1679
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1626 ATTTGCTAGTGATCGAGCTTTCGAGGGATTGTCTAATCTCAAGCTTCTTAACTTCTATGA 1685
Query 1680 TCTTTCGTTTGATGGAGAGACTAGAGTGCATCTACCTAATGGCCTCAGTTATCTCCCACG 1739
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1686 TCTTTCATTTGATGGAGAGACTAGAGTGCATCTACCTAATGGCCTTAGTTATCTCCCACG 1745
Query 1740 CAAGCTTCGTTATCTCCGTTGGGATGGATACCCTTTAAAGACTATGCCTTCAAGATTTTT 1799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746 CAAGCTTCGTTATCTCCGTTGGGATGGATACCCTTTAAAGACTATGCCTTCAAGATTTTG 1805
Query 1800 TCCTGAGTTTCTTGTTGAACTTTGTATGAGTAATAGCAATCTTGAAAAACTTTGGGATGG 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1806 TCCTGAGTTTCTTGTTGAACTTTGTATGAGTAATAGCGATCTTGAAAAACTTTGGGATGG 1865
Query 1860 GATCCAGCCTCTGAGGAACTTGAAGAAGATGGATCTTTCTCGCTGTAAATACCTTGTCGA 1919
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1866 GATCCAGCCTCTTAGGAACTTGAAGAAGATGGATCTTTCTCGCTGTAAATACCTTGTCGA 1925
Query 1920 AGTTCCAGACCTCTCAAAAGCCACAAATCTGGAGGAACTAAACCTTTCCTATTGCCAAAG 1979
| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926 AATTCCTGATCTCTCAAAAGCCACAAATCTGGAGGAACTAAACCTTTCCTATTGCCAAAG 1985
Query 1980 CTTGGTTGAGGTTACTCCATCTATCAAGAACCTAAAGGGACTTTCTTGCTTCTACTTGAC 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1986 CTTGGTTGAGGTTACTCCATCTATCAAGAACCTTAAGGGACTTTCTTGCTTCTACATGAC 2045
Query 2040 TAATTGCATCCAACTCAAGGACATTCCGATTGGAATAATTTTGAAGTCGCTTGAAACAGT 2099
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 2046 TAATTGCATCCAACTCAAGAACATTCCGATTGGAATAACTTTGAAGTCACTTGAAACAGT 2105
Query 2100 GGGAATGAGTGGATGCTCAAGCCTAAAGCATTTTCCAGAAATTTCTTGGAATACTAGAAG 2159
| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106 GCGAATGAGTGGATGCTCAAGTCTAATGCATTTTCCAGAAATTTCTTGGAATACTAGAAG 2165
Query 2160 ACTCTATCTGAGCAGTACAAAGATAGAGGAACTTCCATCATCAATCAGCCGTCTCTCTTG 2219
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2166 ACTCTATCTGAGCAGTACAAAGATAGAGGAACTGCCATCATCAATTAGTCGTCTCTCTTG 2225
Query 2220 TCTGGTTAAATTGGATATGTCAGATTGTCAGAGACTCAGGACTCTTCCAAGCTATCTAGG 2279
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2226 TCTGGTTGAATTGGATATGTCAGATTGCCAGAGACTCAGGACCCTTCCAAGCTATCTAAG 2285
Query 2280 GCACTTGGTCTCACTGAAATCCCTGAATTTGGACGGTTGCAGACGTCTTGAGAACCTCCC 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2286 GCACTTGGTCTCACTGAAATCCCTGAATTTGGACGGTTGCAAACGTCTTGAGAACCTCCC 2345
Query 2340 AGACACGTTACAGAATCTAACATCTCTTGAAACGCTTGAAGTGTCTGGTTGCCTTAATGT 2399
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2346 AGACACATTACAGAACCTAACATCTCTTGAAACGCTTGAAGTATCTGGTTGCCTTAATGT 2405
Query 2400 CAACGAGTTCCCTCGTGTTTCCACGAGTATAGAAGTTCTGCGTATATCTGAGACATCAAT 2459
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2406 CAACGAGTTCCCTCGTGTCGCCACGAATATAGAAGTTCTGCGTATATCTGAGACATCAAT 2465
Query 2460 TGAAGAAATTCCTGCAAGGATCTGTAATCTCTCTCAGCTTAGGTCCTTGGATATCTCAGA 2519
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2466 TGAAGAAATTCCTGCAAGGATCTGTAATCTCTCTCAGCTTAGGTCCTTGGATATTTCAGA 2525
Query 2520 AAACAAAAGACTTGCATCACTTCCGGTAAGCATTTCTGAGCTAAGATCACTTGAAAAGCT 2579
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2526 AAACAAAAGACTTAAATCACTTCCGTTAAGCATTTCTAAGCTAAGATCACTTGAAAAGCT 2585
Query 2580 CAAGCTTTCTGGATGTTCTGTACTCGAGAGTTTTCCACTAGAAATTTGTCAGACAATGAG 2639
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2586 CAAGCTTTCTGGATGTTCTGTACTCGAGAGTTTTCCACCAGAAATTTGTCAGACAATGAG 2645
Query 2640 CTGCTTGAGGTGGTTTGATTTAGATAGGACTAGCATTAAAGAACTACCTGAAAACATTGG 2699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2646 CTGCTTGAGGTGGTTTGATTTAGATAGGACTAGCATTAAAGAACTACCTGAAAACATTGG 2705
Query 2700 GAATTTAGTAGCTCTTGAGGTGCTTCAAGCCAGTAGAACAGTGATAAGGCGAGCACCATG 2759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2706 GAATTTAGTAGCTCTTGAGGTGCTTCAAGCCAGTAGAACAGTGATAAGGCGAGCACCACG 2765
Query 2760 GTCTATTGCACGACTTACCCGTCTTCAAGTTTTAGCGATTGGGAATAGTTTCTTTACTCC 2819
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2766 GTCTACTGCACAACTTACCCGTCTTCAAGTTTTAGCGATTGGGAATAGTTTCTATACTCT 2825
Query 2820 AGAAGGTTTGTTGCATTCTCTTTGTCCTCCCTTATCAAGGTTTGATGACTTGAGAGCTCT 2879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2826 AGAAGGTTTGTTGCATTCTCTTTGTCCTCCCTTATCAAGGTTTGATGACTTGAGAGCTCT 2885
Query 2880 GAGCCTAAGCAACATGAACATGACAGAGATTCCTAACAGTATTGGTAACTTATGGAATCT 2939
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 GAGCCTAAGCAACATGAACATGGTAGAGATCCCTAACAGTATTGGTAACTTATGGAATCT 2945
Query 2940 ACTAGAACTAGATTTGAGTGGGAACAATTTTGAATTCATCCCCGCAAGCATCAAACGGCT 2999
|||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2946 ACTAGAACTAGATTTGAGTGGGAACAGTTTCGAATTCATCCCCGCAAGCATCAAACGGCT 3005
Query 3000 CACCAGGTTGAACAGACTGAATTTAAACAATTGCCAGAGACTTCAAGCATTGCCCGATGA 3059
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3006 CACCAGGTTGAACAGACTGAATTTAAACAATTGTCAGAGACTTCAAGCATTGCCCGATGA 3065
Query 3060 GCTTCCACGAGGTCTCTTGTATATCTACATCCATAGCTGCACATCACTAGTGAGTATCTC 3119
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3066 GCTTCCACGAGGTCTCTTGTATATCTACATCCATAACTGCACATCCCTAGTGAGTATCTC 3125
Query 3120 AGGTTGCTTCAACCAATATTGTCTGCGAAAGCTTGTAGCTAGCAACTGTTACAAATTGGA 3179
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3126 AGGTTGCTTCAACCAATATTGTCTGCGCCAGTTTGTAGCTAGCAACTGTTACAAATTGGA 3185
Query 3180 TCAAGCAGCGCAGATTCTCATTCACCGTAACTTGAAGCTAGAGTCAGCAAAACCAGAACA 3239
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3186 TCAAGCAGCGCAGATTCTCATTCACCGTAACATGAAGCTAGAGTCAGCAAAACCAGAACA 3245
Query 3240 CTCTTATTTTCCTGGAAGTGACATACCCACTTGCTTCAATCACCAAGTCATGGGTCCTTC 3299
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3246 CTCTTATTTTCCTGGAAGTGACATACCCAGTTGCTTCAATCACCAAGTCATGGGTCCTTC 3305
Query 3300 GCTGAATATACAGTTACCTCAGAGTGAATCATCGTCTGACATTCTGGGATTTTCTGCCTG 3359
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3306 GCTGAGTATACAGTTACCTCAGAGTGAATCATCGTCTGACATTCTGGGATTTTCTGCCTG 3365
Query 3360 CATCATGATTGGAGTTGATGGACAGTACCCGATGAACAATCTGAAGATACACTGCTCTTG 3419
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3366 CATCATGATTGGAGTTGATGGACTGTACCCGATGAACAATCTGAAGATACACTGCTCTTG 3425
Query 3420 TATATTAAAAGATGCTGATGCTTGTGAGCTGGTTGTTATGGATGAGGTGTGGTATCCTGA 3479
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3426 TATTTTAAAAGATGCTGATGATTGTGAGCTGGTTGTTATGGATGAGGTGTGGTATCCTGA 3485
Query 3480 TCCAAAAGCTTTCACAAACATGTATTTTGGATCAGATCACCTTCTCTTATTCAGCAGAAC 3539
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3486 TCCAAAAGCTTTCACAAACATGTGTTTTGGAACAGATCACCTTCTCTTATTCAGCAGAAC 3545
Query 3540 CTGCACGTCCATGGAAGCTTACAGCGAAGCCCTGTTTGAATTCTCAGTCGAAAACACAGA 3599
||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3546 CTGCATGTCCATGGGAGCTTACAATGAAGCCTTGTTTGAATTCTCAATCGAAAACACAGA 3605
Query 3600 AGGAGATTCCTTTAGCCCGCTTGGAGAGGTTAAAAAATGTGCGGTACACCTTATATCACT 3659
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
Sbjct 3606 AGGAGATTCTTTTAGCCCGCTTGGAGAGGTTAAAAAATGTGCAGTGCACCTTATATCATT 3665
Query 3660 CAAAGACATGATGCAAGAGTTCTCTAATGACTCTGACAAAATTCAGAGTTCTGATTTGGA 3719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3666 TAAAGACATGATGCAAGAGTTCTCTAATGACTCTGACAAAATTCAGAATTCTGATTTGGA 3725
Query 3720 TCTTCCAAAGGCATTTGATGACGCAAGAATTTTGAAAAGAAGAGCATATGAAACTGAGTT 3779
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3726 TCTTTCAAAGGCATTTGATGACGCAAGACTTTTGAAAAGAAGAGCATATGAAACTGAGCT 3785
Query 3780 CTTGCATAAGGAACAACTAA-ATCCCAAGAGGATCAAGTTTCTTCCAGTTCCTTTGGCT 3837
|||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3786 CTTGCATAAGGAGCAACCAAGATCC-AAGAGGATCAAGTTTCTTCCAGTTCATTTGGCT 3843
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 146826116634
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5