BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G18525.1
Length=5193
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg893776 jgi|Araly1|893776|Al_scaffold_0006_1772 4172 0.0
Ahg893775 jgi|Araly1|893775|Al_scaffold_0006_1771 1360 0.0
> Ahg893776 jgi|Araly1|893776|Al_scaffold_0006_1772
Length=2742
Score = 4172 bits (2259), Expect = 0.0
Identities = 2530/2661 (95%), Gaps = 18/2661 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 85 ATGAGAGGTGAAG-ATAGTGACCTTTGCTTCGATTGTCTCGATCAACGTATCAACTCTGA 143
||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGGTGAAGCA-AGTGACCTTTGCTTCGATTGCCTCGATCAACGTATCAACTCTGA 59
Query 144 CTTCTCCGATCAGATCGTCTTCTCTTACGGTGTCTCCGATTCGCCGCTACCTTTTGGATC 203
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 CTTCTCCGACCAGATCGTCTTCGCTTACGGTGTCTCCGATTCGCCGCTACCTTTTGGATC 119
Query 204 CTCCGCCGTCGTTAAGGTTTCTGATTCTAGCGAGGAATTTTCTGCTTCTTGTTCTTCTTG 263
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 120 TTCCGCCGTCGTTAAGGTTTCTGACTCTAGCGAGGAATTTTCTGCTTC---TTCTTCTTG 176
Query 264 TGAATCCACTTCTTCTCAGTTCATTTTGGAGTATCTCCGGAAGGACGAACATGGCTGCTT 323
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 177 TGAATCCACTTCGTCTCAGTTCATTTTGGAGTATCTCCGGAAAGAAGAACATGGTTGCTT 236
Query 324 AGCTAAATACGTCGACAAATTTGTTGTTAAGG-ATCGAGAGGGT---AATTCAAACGATG 379
|||||| |||||||| | || ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 237 AGCTAACTACGTCGATAGATGTGTTGTT-GGGAATCGAGAGGGTGGGAATTCAAACGATG 295
Query 380 CTGTTGAATCTGATGAGTGTTTGGATTGTTCAACCAGTGGCTCTCAAGCTACTG-A-A-G 436
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || || | | |
Sbjct 296 CTGTTGAATCTGATGAGTATTTGGATTGTTCATCCAGTGGCTCTCAGGTTATTGAAGATG 355
Query 437 ATGATGACACAGAGAATATTACTTGTGGAAGTGTTACTTGCGAGCATTCAGGTAGTTTTT 496
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 356 ATGATGACACAGAGAACATTACTTGTGGAAGTGTTACTTGCAAGCATTCAGGTAGTTTTT 415
Query 497 CATGTTGGAGAACTGTAGCTGCACTTTTACCAATCGCTCAGATTAGAAAATGTTCTGCAT 556
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 416 CATGTTGGAGAACTATAGCTGCACTTTTACCAATTGCTCAGATTAGCAAATGTTCTGCAT 475
Query 557 CTGAACTTCAAAAGCTTGCTTCTAGTTTCCATTATGAGTGTCCAGAAGATCAAATTTTAG 616
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 CTGAACTTCAAAAGCTTTCTTTTAGTTTCCTTTATGATTGTCCAGAAGATCAAATTTTAG 535
Query 617 CCTCTTTACATCGCCTGATTGATGGAAAGTCATCTGGACAAGCAACCCATAGTTTCCTTT 676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 536 CCTCTTTACATCGCCTGATTGATGGAAAGTCATCTGGGCAAGCAACCCATAGTTTCC--T 593
Query 677 GTCTTCTTCTTGGGTTACCGTTGTTAGAGGAAAAAAGCAAGCTTCGATGTCTCAGGCATC 736
|| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||
Sbjct 594 -TCGTCTTCTTGGGTTACCGTTGTCAGAGGAGAAAAGAAAGCTTCAATGTTTTAGGCATC 652
Query 737 CAAATCTATCACCGGTCCTAGGACTTCTGACATCATCTGATTGTTTGGTCTCAGTGCTCC 796
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 653 CAAATCTATCACCGGTCTTAGGACTTCTGACATCATCTGATTGTTTGGTCTCTGTGCTCC 712
Query 797 CCAAAGCCCCTTATACATTGGAAAATATTC-TCTACTACAGCCCCAGTGCTATAAAGTCA 855
|||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 713 CCAAAGCCCCGTATACATTGGAAAATATTCTTC-ACTACAGCCCCTGTGCTATAAAGTCA 771
Query 856 GAATGGCATAGAAATTTTATAATATATCAGCTATTGTCTGCGTTAGCTCACTTGCATGGG 915
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 772 GAATGGCATAGGAATTTTATGATATATCAGCTATTGTCTGGGTTAGCTCACTTGCATGGG 831
Query 916 TTGAAGGTTTCACATGGGGACATTCGTCCGTCAAACATATTGTTGTCTGATTCATTATGG 975
|||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 TTGAGGGTTTCGCATGGGAACATTTGTCCGTCAAGCATATTGTTGTCTGATTCATTATGG 891
Query 976 AGTTGGTTAACGATCTATAGCAAACCTGATTTAGGTTCTGTAGATGCCAATTCATCTGCT 1035
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
Sbjct 892 AGTTGGTTAAAGATCTATAGCAAGCCTGATTTAGGTTCTGGAGATGCCGATTCATCTGTT 951
Query 1036 TCAAGAAGAAGGTGGTGTGTTGAGGGTTGTTATTCTTATGGCCTTTATGCTGATCTTAAA 1095
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 952 TCAAGAAGAAGGTGGTGTGTTGAGGATTGTTATTCGTATGGCCTTTATGCTGATCTTAAA 1011
Query 1096 ATTTCTTCACATTTGGACTGGCAGACTCACTTTGATAAATGGTGGAAGGGAGAGCTAAGC 1155
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 ATTTCTTCACATTTGGACTGGCAGACTCACTTGGATAAATGGTGGAAGGGAGAGCTAAGC 1071
Query 1156 AATTTTGAATATTTACTCGTCTTAAACAAACTAGCAGGTCGAAGGTGGGGGGACCACACA 1215
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 AATTTTGAGTATTTACTCGTCTTAAACAAACTAGCAGGTCGAAGGTGGGGGGACCACACA 1131
Query 1216 TTTCATCCGGTAATGCCATGGGTCATAGATTTCAGCAAAAAACCTGAAAATGATAGTGAT 1275
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 TTTCATCCGGTAATGCCATGGGTCATAGATTTCAGCAAGAAACCTGAAAATGATAGTGAC 1191
Query 1276 TCAGGATGGCGTGATTTAAGAAAAAGCAAATGGAGATTGGCAAAAGGAGATGAACAATTA 1335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1192 TCAGGATGGCGTGATTTAAGAAAAAGCAAATGGAGATTGGCAAAAGGAGATGAACAACTA 1251
Query 1336 GATTTTACCTACTCAACATTTGAATTTCCGCATCATGTATCAGATGAATGTCTTTCTGAG 1395
||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1252 GATTTCACCTATTCGACATTTGAATTTCCGCATCATGTTTCAGATGAATGTCTGTCTGAG 1311
Query 1396 CTGGCTGTTTGCAGCTACAAAGCAAGAAGACTGCCACTGAGTGTCCTGCGAAAGGCAGTT 1455
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 CTGGCTGTTTGCAGCTACAAAGCAAGGAGACTGCCACTGAGTGTCCTGCGAAAGGCAGTT 1371
Query 1456 CGGTCGGTGTATGAGCCTAATGAATATCCCTCTGACATGCAAAGGCTTTATGATTGGACC 1515
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 AGGTCGGTGTATGAACCTAATGAGTATCCCTCTGACATGCAAAGGCTTTATGATTGGACC 1431
Query 1516 CCTGACGAGTGCATCCCTGAGTTTTACTGTGATCCCCGCATCTTTTGCTCCCTTCATCCT 1575
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432 CCTGACGAGTGCATCCCTGAGTTTTACTGCGATCCCCGCATCTTTTGCTCCCTTCATCCT 1491
Query 1576 AGTATGTCTGATTTGGCTGTACCTCCATGGGCAAGCAGCCCCGATGAGTTCATTAGATTG 1635
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1492 AGTATGTCTGATTTGGCTGTACCTCCATGGGCAAACAGCCCCGAGGAGTTCATTAGATTG 1551
Query 1636 CATCGAGATGCTCTGGAAAGCCCCCATGTTTCATCTCTAATACATCACTGGATTGATATT 1695
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 CATCGAGATGCCCTGGAAAGCCCTCATGTTTCAACTCTAATACATCACTGGATTGATATT 1611
Query 1696 ACTTTTGGTTACAAAATGTCAGGACATGCTGCTATTACTGCGAAGAATGTTATGTTGTCT 1755
| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1612 ATTTTTGGTTACAAAATGTCAGGAGAGGCTGCTATTACTGCAAAGAATGTGATGTTGTCT 1671
Query 1756 TCATCTGAACCCACAGTACCGAGGTCAGTTGGACGTCGCCAACTCTTTTTTCGGCCTCAT 1815
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1672 TCATCTGAGCCCACAGTACCGAGGTCAGTTGGACGCCGTCAACTCTTTTTCCGGCCTCAT 1731
Query 1816 CCGGTGCGCCTTGGTTTCTCCCGAGAGAAGGAACAAAGTAGAAATGAACTAGAAATGCAT 1875
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1732 CCGGTGCGCCTTGGTTTCTCCCGCGAGAAGGAACAAAGTAGAAATGAACTAGAGATGCAT 1791
Query 1876 ACATTCCATGGCTTTGGTGTGGACAACAAGAGGTCCGTCATTCTCCTAGCTGATGAGTAT 1935
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1792 ACATTTCATGGCTTTGGTGTGGACAACAAGAGGTCCGTCATTCTCCAAGCTGATGAGTAT 1851
Query 1936 CTGGAAGAAACTGAAGAGGCATCTGCATTTTCTGATCATGCAACACATCTATGTCCAAAG 1995
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1852 CTGGAAGAAACTGAAGAGGCATCTGCATTTTCTGATCATGCAGCACATCTAAGTCCAAAG 1911
Query 1996 TATCACCTTCGTGAAAACCTGGTTGAGTCTCCTTTGCATGTATCTTACAGTGAAAACACT 2055
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1912 TATCACCTTCATGAAAACCTGGTTGAGTCTCCTTTGCATGTATCTTACAGCGAAAACACT 1971
Query 2056 AAGAAAGTAAATACTAGTCTCCCTGGAACTTCAAAAAACAAAGGTTTATCATCAAGGATA 2115
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972 AAAAAAGTAAATACTAGTCTCCCTGGAACTTCAAAAAACAAAGGTTTATCATCAAGGATA 2031
Query 2116 AGTTTGAATTATCTTTTAGAGCATATGGAGGTGAGAGATGAAGCATCGACTGAACTTCAG 2175
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2032 AGTTTGAATTATCTTTTGGAGCATATGGAGGTGAGAGACGAGGCATCGACTGAACTTCAG 2091
Query 2176 GAGTTGTTACAATGGCGGCAAGATTTCTGCACAGGAAACATTTCCAAGGACATTGCTGGG 2235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct 2092 GAGTTGTTACAATGGCGGCAAGATTTCTGCACAGGAAACTTTTCCAAGGACATTGCAGGG 2151
Query 2236 GATATTTTTTCTATTGGCTGTGTCCTGGCAGAACTTTATTTGATGAAGCCGCTATTCAAC 2295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 GATATTTTTTCTATTGGCTGTGTCCTGGCAGAACTTTATTTGATGAAGCCGCTATTCAAC 2211
Query 2296 TCAGTGTCTTTGGCTACTTATTTAGAAGGTGGTGACTTACCTGAACTGATCAAAGAACTT 2355
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 2212 TCAGTGTCTTTGGCTAATTATTTAGAAGGTGGTGACTTACCTGAATTGATCAAGGAACTT 2271
Query 2356 CCTCCTCCTACTCAGGTAATTGTCGAAGCATGTATTGAACAAGATTGGAGAAGGAGGCCC 2415
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 CCTCCTCCTACTCAGGTACTTGTCGAAGCATGTGTTGAACAAGATTGGAGAAGGAGGCCC 2331
Query 2416 TCAGCAAAGAGTCTTTTGGACTCTCCGTATTTCTCAGCTACAGTGAGGTCAGCTCACTTG 2475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 TCAGCAAAGAGTCTTTTGGACTCTCCGTATTTCTCAGCTACAGTGAGGTCAGCTCACTTG 2391
Query 2476 TTTGCTGCTCCACTTCAACTTTTGGCCAAAGGTCAAACACGCTTGTGTTATGCAGCAAGT 2535
|||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2392 TTTGCTGCTCCACTGCACCTTTTGGCTAAAGGTCAAACACGCTTGTGTTATGCTGCAAGT 2451
Query 2536 TTTGCCAAACAGGGAGTCTTGAAAGTAATGGGAACATTTGTGGCAGAGATGTGTGCTGTG 2595
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 TTTGCCAAACAGGGAGTCCTGAAAGCAATGGGAACATTTGTGGCAGAGATGTGTGCTGTG 2511
Query 2596 TACTGTTTGCCACTGGTCACCACACCTTTATCTGAGGACGAGTGTGAATTGGCTTATGTA 2655
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 TACTGTTTGCCACTGGTCACAACACCTTTATCTGACGACGAGTGTGAATTGGCTTATGTA 2571
Query 2656 CTTCTCAAGGAATTTACAAAATCTTTGACACCAATGGCTGTGCAGAGACTTGTCTTGCCT 2715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 2572 CTTCTCAAGGAATTTACAAAATCTTTGACACCAATGGCTGTGCAGAGACTTATCTTACCT 2631
Query 2716 TCTATCCAGAAGATCTTACTG 2736
|||||||||||||||||||||
Sbjct 2632 TCTATCCAGAAGATCTTACTG 2652
> Ahg893775 jgi|Araly1|893775|Al_scaffold_0006_1771
Length=1527
Score = 1360 bits (736), Expect = 0.0
Identities = 809/845 (96%), Gaps = 2/845 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3262 ATGCAGAAAAATCTAGAGTTGCGGGTCCTTCAGTTTGCTGCAACTTCCCTGATGTCAATT 3321
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1 ATGCAGAAAAATCTGGAGTTGCGGGTCCTTCAGTTTGCTGCAACTTCCTTGATGTCAATT 60
Query 3322 TGCCAGCGGATTGGACAAGAAATGACTGCATTGCATGTTCTTCCGCAGTTGAAGGAGCTT 3381
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TGCGAGCGGATTGGACAAGAGATGACTGCATTGCATGTTCTTCCGCAGTTGAAGGAGCTT 120
Query 3382 TTTGATGAGTTTGCTTTCTCTGAGAAAAGTACAGATGCATCTGACTCTTTAAGCTGGAAG 3441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTTGATGAGTTTGCTTTCTCTGAGAAAAGTACAGATGCATCTGACTCTTTAAGCTGGAAG 180
Query 3442 ATTAGGACTGCCGAACAAAAATTTCATCCAGAATCTCCAATCAAAAGCCGTATGGATCTT 3501
|| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 181 ATCAGGACTGCCGAACAAAACTTCCATCCAGAATCTCCAATCAAAAACCGTATGGATCTT 240
Query 3502 GTGTTGCTCCTCTATCCTTCTTTCGCCTCACTTCTTGGTATGGAGAAATTACGCCAGGGT 3561
|||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 241 GTGTTGCTTCTCTATCCTTCTTTTGCGTCACTTCTTGGTATGGAGAAATTACGTCAGAAT 300
Query 3562 TGTCCAACCTGGCTACTCCTTGAGCAGTATCTGCTAAAGCATCATAACTGGAAGTGGGAA 3621
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGTCCAACCTGGCTACTCCTTGAGCAATATCTGCTAAAGCATCATAACTGGAAGTGGGAA 360
Query 3622 TACACCGGACGATCTTCTCGATACAATATGGAAGCAAGGCCTGTATTAAAACA-GGGCCC 3680
||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 361 TACACAGGTCGATCTTCTAGATACAGTATGGAAGCAAGGCCTGTGTTAAA-CAAGGGCCC 419
Query 3681 TGCATCTAAGCACACTCCTAAGGTGTTGCTTAATGGATCTGGACGGTCGGTTCCCCAGTC 3740
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TGCATCTAAGCACACTCCTAAGATGTTGCTCAATGGATCTGGACGGTCGGTTCCCCAGTT 479
Query 3741 GCAGGGGTTAAGAAATTCCAATCACTTAAAACTTCATATACATGTCCCAGTTGAAGGACA 3800
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GCAGGGGTTAAGAAATTCCAATCACTTAAAACCTCATATACATGTCCCAGTTGAAGGACA 539
Query 3801 AGAAGCAGTTCTAAACCCTTTGGTGCATGAACCCTGGTCATGGTTTCCTAGTCCAGTAAC 3860
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 540 AGAAGCAGTCCTAAACCCTTTGGTGCATGAACCCTGGTCATGGTTTCCTAGTCCAGTAGC 599
Query 3861 TTGTTGGGATGGGCTTGACATTGGGCGTTTTGGAAACCCCAAAGATGAGAATCGATGGAA 3920
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 600 TTGTTGGGATGGGATTGACATTGGGCGTTTTGGAAACCCCAAAGATGAGCATCGATTGAA 659
Query 3921 AATTAGAGCATCTGTTTTGTCTTCTGCGCGGGCCCATCATGGAGCTCTAAGATCTTTAGT 3980
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AATTAGAGCATCTGTTTTGTCTTCTGTGCGTGCCTATCATGGAGCTCTAAGATCTTTAGT 719
Query 3981 GGTTTCTGAAGATGAGTGTACAGTTTTCACTTCAGGAATTGATCCAGGGTTTAAGGGAAG 4040
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GGTTTCTGAAGATGAGTGTACAGTTTTCGCTTCAGGAATTGATCCAGGGTTTAAGGGAAG 779
Query 4041 TGTTCAGAAGTGGGAACTAGCAAGCTTAAGTTGTGTATCTAGTTATCATGCCCATGAAGA 4100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 780 TGTTCAGAAGTGGGAACTAGCAAGCTTAAGTTGTGTATCTAGTTATCATGCACATGAAGA 839
Query 4101 GGTTG 4105
|||||
Sbjct 840 GGTTG 844
Score = 952 bits (515), Expect = 0.0
Identities = 553/571 (97%), Gaps = 3/571 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4437 AGGAGAAGCTATTGAATCTGGATTCACTTCTCTCGTATCTGCTCTTTGTTCAGGAGGGTC 4496
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 AGGAGAACCTATTGAATCTGGATTCACTTCTCTCGTATCTGCTCTTTGTTCAGGAGGGTC 1016
Query 4497 TCAAACAAAACATGGAGACGGAGCTTCAGTATCACCTTCTTGGATTGCAGCTGGTTTTAG 4556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 TCAAACAAAACATGGAGACGGAGCTTCAGTATCACCTTCTTGGATTGCAGCTGGTTTTAG 1076
Query 4557 TTCTGGCCAGTGTAGGCTATTTGACTTGAGGGAAAATGGTTTTATTTCCTCCTGGAGAGC 4616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1077 TTCTGGCCAGTGTAGGCTATTTGACTTGAGGGAAAATGGTTTTATGTCCTCCTGGAGAGC 1136
Query 4617 TCACGACGGATACGTGACAAAGTTAGTGGCACCTGAGAGTCATTTACTTGTTTCCAGCTC 4676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 TCACGACGGATACGTGACAAAGTTAGTGGCACCTGAGAGCCATTTACTTGTTTCCAGCTC 1196
Query 4677 TCTTGACAAAACTTTACGGATCTGGGACTTAAGGAAGAGCTGGACACCACAGCCTTTTGT 4736
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 TCTTGACAAAACTTTACGGATCTGGGACTTGAGGAAGAGCTGGACACCACAGCCTTTTGT 1256
Query 4737 TGTCAAAGGACACAATGACGGTGTTTCCGGTTTCTCCATCTGGGGCAAGGACGTTATCTC 4796
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 TGTCAAAGGACACAATGACGGTGTTTCCGATTTCTCCATCTGGGGCAAGGACGTTATCTC 1316
Query 4797 CATCTCAAGAAACAACATCGGGATTTTCTCACTGGCAAAGTCTCAAGATGAGGAGGAGCA 4856
||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||
Sbjct 1317 TATCTCAAGAAATAACATCGGGATTTTCTCACTGTCAAATTTTCAAGACGAGGAGGAGCA 1376
Query 4857 AC---AGCAGCAGCGGATTATACCACAGAAACTGTATATGGCAGAGAAGGGAGGAAGAGT 4913
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 ACGGCAGCAGCAGCGGATTATACCACAGAAACTGTATATGGCAGAGAAGGGAGGAAGAGT 1436
Query 4914 AAAGTCGGATTTATCGACCATTTGTGTTTTACCATTTTCGAGATTGTTCATCGTTGGAGC 4973
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 CAAGTCGGATTTATCAACCATTTGTGTTTTACCATTCTCGAGATTGTTCATCGTTGGAGC 1496
Query 4974 ACATGATGGTCACTTGAGAATCTGTTGTTGA 5004
|||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1497 ACATGATGGTTACTTGAGAATCTGTTGTTGA 1527
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 196605422118
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5