BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G18700.1
Length=4308
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488757 jgi|Araly1|488757|fgenesh2_kg.6__1891__AT5G18700.1 7033 0.0
> Ahg488757 jgi|Araly1|488757|fgenesh2_kg.6__1891__AT5G18700.1
Length=4311
Score = 7033 bits (3808), Expect = 0.0
Identities = 4147/4314 (96%), Gaps = 9/4314 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAATCAGTACCACATCTACGAAGCTATTGGACATGGCAAATGCTCGACTGTGTATAAA 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAATCAGTACCACATATACGAAGCTATTGGACATGGCAAATGCTCGACTGTGTATAAA 60
Query 61 GGAAGGAAGAAGAAGACGATCGAGTATTTTGCCTGCAAGAGTGTCGATAAGTCGCGGAAG 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 61 GGAAGGAAGAAGAAGACGATCGAGTATTTTGCCTGCAAGAGTGTGGACAAGTCGCGGAAG 120
Query 121 AACAAGGTTCTTCAAGAGGTCAGGATCCTTCACTCGCTAAATCATCCAAACGTACTCAAG 180
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGCAAGGTTCTTCAAGAGGTCAGGATCCTTCACTCGCTAAATCATCCAAACGTACTCAAG 180
Query 181 TTCTATGCTTGGTATGAAACTTCTGCTCACATGTGGTTAGTTCTGGAATATTGCGTTGGT 240
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTCTATGCGTGGTATGAAACTTCTGCTCACATGTGGTTAGTTCTGGAATATTGCGTTGGA 240
Query 241 GGTGATCTCAGGACATTATTGCAGCAGGACTGTAAACTGCCAGAAGAATCTATCTATGGT 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 241 GGTGATCTCAGGACATTATTGCAGCAGGACTGTAAACTGCCAGAAGAATCAATCTATGGT 300
Query 301 CTTGCTTATGATCTTGTCATAGCCCTGCAGTATTTACATTCGAAAGGAATTATATATTGT 360
|||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTTGCTTTTGATCTTGTTATAGCTCTGCAGTACTTACATTCAAAAGGAATTATATATTGT 360
Query 361 GATCTGAAACCATCAAACATCTTACTTGATGAAAATGGGCATATTAAGCTGTGTGATTTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GATCTGAAACCATCAAACATCTTACTTGATGAAAACGGGCATATTAAGCTGTGTGATTTT 420
Query 421 GGTTTGTCAAGGAAGCTGGATGATATTTCTAAATCTCCTTCCACGGGAAAACGTGGTACC 480
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GGATTGTCAAGGAAGCTGGATGATATTTCTAAATCTCCTTCCACGGGAAAACGTGGTACC 480
Query 481 CCGTATTATATGGCTCCAGAGCTATATGAAGATGGAGGGATCCATTCTTTTGCTTCTGAT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CCGTATTATATGGCTCCAGAGCTATATGAAGATGGAGGGATCCATTCTTTTGCTTCTGAT 540
Query 541 CTGTGGGCACTTGGTTGTGTACTATATGAATGTTACACAGGAAGACCTCCTTTTGTGGCA 600
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CTGTGGGCACTTGGTTGTGTATTATATGAATGTTACACAGGAAGACCTCCTTTTGTGGCA 600
Query 601 AGAGAGTTTACCCAGCTTGTGAAATCTATTCATTCAGATCCAACTCCTCCACTCCCTGGA 660
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AGAGAATTTACCCAGCTTGTGAAATCTATTCATTCAGATCCAACTCCTCCACTCCCTGGA 660
Query 661 AATGCTAGTCGTTCATTTGTCAATCTCATTGAGTCTCTTCTTATCAAAGACCCAGCTCAA 720
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AATGCAAGCCGTTCATTTGTCAATCTCATTGAGTCTCTTCTTATCAAAGACCCAGCTCAA 720
Query 721 AGAATACAATGGGCAGATCTCTGTGGTCATGCATTTTGGAAGAGTAAGATAAATTTAGTT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 721 AGAATACAATGGGCAGATCTCTGTGGTCATGCATTCTGGAAGAGTAAGATAAACTTAGTA 780
Query 781 CAGTTGCCTACTCAGCCTGCTTTTGATGATATGATTGGCATAAACACAAAGCCATGCCTT 840
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 781 CAGCTGCCTACTCAGCCTGCTTTTGATAATATGATTGGCATATACACAAAGCCATGCCTT 840
Query 841 TCCGAGCGTAATGGAGATAGACCAAATAAGACCCCTCCAAAGTACCGGGAGAAAGATCGA 900
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 841 TCCGAGCGAAATGGAGACAGACCAAATAAGACCCCTCCAAAGTATCGGGAGAAAGATCCA 900
Query 901 AAAGGGGGTTCAAAGCAAAATGAGAACTCCATTCAAGGTTCAAAAGGCCATGAGACGCCG 960
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AAAGGGGGTTCAAAGCAAAATGAGAACTCCGTTCAAGGTTCAAAAGGCCATGAGACGCCG 960
Query 961 ATAAAGGGCACCCCTGGTGGGTCTAAAGCTCAAGCAAAGCTTCCTAGTAGAGCAACTGAG 1020
|||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATAAAGGGTACGCCTGGTGGTTCTAAAGCTCAAACAAAGCTTCCTAGTAGAGCAACTGAG 1020
Query 1021 GAAAAGCATGGAGGTCGTCCTGCTGCTAACAGACAGGTGAATATTCTAAGATTGTCAAGG 1080
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1021 GAAAAGCATGGAGGTCGTCCTGGTGCTAACAGACAGATGAATATTCTGAGATTGTCAAGG 1080
Query 1081 ATAGCAAAGGCAAATCTTCAAAAGGAAAATGAGAAGGAAAACTATAGGAGACCCTTACCT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 ATAGCAAAGGCAAATCTTCAAAAGGAAAATGAGAAGGAAAACTATAGGAGACCCTTACCT 1140
Query 1141 AATAGCAACGAGAATTGTGCAGAAGTGAAGATCGACAACACTGATATGGAACTTGATTTT 1200
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1141 AATAGCAACGAGAATTGTGCAGAAGTGAAGATTGAGAACACTGACATGGAACTTGATTTT 1200
Query 1201 GATGAAAACAATGATGATGAGGGACCTGATGAATCAGAAGGAACCGAAAACACCTCTTGT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 GATGAAAACAATGATGATGAGGGACCTGATGAATCAGAAGGAACCGAAAACACCTCTTGT 1260
Query 1261 GCACAAGAAGAAAGAGTAATGAGCCATAATGAGAATCACAGAAGACAAAGAGTTGTAAGC 1320
||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1261 GCACAAGAAGAAAGAGTTGTGAGCCAAAATGAGAGTCACAGAAGACAAGGAGTTCTAAGC 1320
Query 1321 AGTAATGTGCCTGATGAGAACTCGTCTGCAAATGAAACACCAACCTTGGGTGAAGCAAGA 1380
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
Sbjct 1321 AGTAATGTGCCTGATGAGAACTCATCTGCAAATGAAACACCAATCTCGGGTGAAGCAAAA 1380
Query 1381 GATTGCCATGAAGATCAGTCAGAGCCAATGGACATGTCAGCTGCCCCACCTAGTGCTAGT 1440
|||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1381 GATTGCCATGAAGAGCAGTCAGAGCAAATGGACGTGTCAGCTGCGCCACCTAGTGCTAGT 1440
Query 1441 CCTCAACTTAAAACTCACCGAGGAAGAGAAACTTCTGGGGTTGCTGTTAATCATGACTCA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CCTCAACTTAAAACTCACCGAGGAAGAGAAATTTCTGGGGTTGCTGTTAATCATGACTCA 1500
Query 1501 TCTAAAGCACCTACTAGCCTCACTGACGTCTTTTGGCATATATCTGATCTTTCTGTTAGG 1560
|||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 TCTAAAACACCTACTAGCCTCAGTGACGTCCTTTGGCATATATCTGATCTTTCTGTTAGG 1560
Query 1561 CCTGTCATGCCCAGCAGAAAATCTGACAAAGAAGCTGTGCATTCTCTCTCATTCGAAACA 1620
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1561 CCTGTCATGCCCAGCAGAAAATCTGACAAAGAAGCTGTGCCTTCTCTCTTATTCGAAACA 1620
Query 1621 CCACAGCCCTCTGATTTTAGTAAGAAGGGAAAGCAAGAATTAGAACCGCTGAACAATAGG 1680
|||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1621 CCACAGCCTTCTGATTTTGGTAAGATGGGAAAGCAAGAATTAGAACCGCTTAACAATAGG 1680
Query 1681 ATCATAACAGTTCTAAGTGGGAGCAGTTCTGGACTGTCAGAGAAACAGAATTTGATCAGA 1740
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 ATCATAACAGTTCTAAGTGGGAGCAGTTCTGGCCTGTCAGAGAAACAGAATTTGATCAGA 1740
Query 1741 TACCTCGAGACATTGAGTACCAATGCTGATGCAGCCAACATCCTGACTAACGGACCAATA 1800
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1741 TACCTCGAGACATTGAGTAGCAATGCTGATGCAGCCAACATCCTGACCAACGGACCAATA 1800
Query 1801 ATGCTTGTGCTTGTTAAAGTTCTGAGATTATCCAAGACCCCAGCATTTCGTGTACAAATT 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 ATGCTTGTGCTTGTTAAAGTTCTGAGATTATCCAAGACCCCAGCATTTCGTGTACAAATT 1860
Query 1861 GCTTCACTAATTGGTTTGTTAATTCGGCATTCTACTTCAATCGAAGATGACTTGGCAAAT 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 GCTTCACTAATTGGTTTGTTAATTCGGCATTCTACTTCAATCGAAGATGACTTGGCAAAT 1920
Query 1921 TCTGGTATTTTAGACTCTCTTACTAATGGCCTCAGAGACAAGCATGAGAAAGTGAGAAGA 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1921 TCTGGTATTTTAGACTCTCTTACTAATGGCCTCAGAGACAAGCATGAAAAAGTGAGAAGA 1980
Query 1981 TTCTCTATGGCAGCTCTAGGTGAATTGCTATTCTACATCTCAACTCAAAATGAGCATAAG 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 TTCTCTATGGCAGCTCTAGGTGAATTGCTATTCTACATCTCAACTCAAAATGAGCATAAG 2040
Query 2041 GATTTCAAACCACCAGAATCCCCATCAAAAGAAACCCGGTCTGCATCGGGTTGGCAGGTT 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GATTTCAAACCACCAGAATCCCCATCAAAAGAAACCCGGTCTGCATCGGGTTGGCAGGTT 2100
Query 2101 TCAAATGCCTTGATCTCTCTTGTATCATCTGTCTTACGGAAGGGAGAAGATGACCTGACT 2160
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 TCGAATGCCTTGATCTCTCTTGTATCATCTGTCTTACGGAAGGGAGAAGATGACCTGACT 2160
Query 2161 CAGGTTTATGCGTTAAGGACAATAGAAAACATCTGCAGTCAAGGAGCTTACTGGGCCACC 2220
||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 CAGCTCTATGCGTTAAGGACGATAGAAAACATCTGCAGTCAAGGAGCTTACTGGGCCACC 2220
Query 2221 CGTTTCTCCAGCCAGGATTTGATTAGCAACCTCTGCTATATCTACAAGGCAACGGGGAAA 2280
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2221 CGTTTCTCCAGCCAAGATTTGATTAGCAACCTCTGCTATATCTACAGGGCAACTGGGAAA 2280
Query 2281 CAGGAGAGCATGAGGCAAACTGCTGGATCCTGTTTAGTCCGTCTTGCTCGCTTTAACCCT 2340
||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2281 CAGGAGAGCATGAGGCAGACGGCTGGATCATGTTTAGTCCGTCTTGCTCGCTTTAATCCT 2340
Query 2341 CCTTGCATTCAGACGGTCGTGGAAAAGCTTTCATTGAAGGAAATAGCTTCATCTTTTGTC 2400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||
Sbjct 2341 CCTTGCATTCAGACGGTCGTGGAAAAGCTTTCATTGAAAGAAATAGCTTCGTCATTTGTC 2400
Query 2401 AAAGGCAGCGCAAGAGAGCAGCAAGTCTGCTTAAATCTTCTGAACATGGCTATGATTGGA 2460
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 AAAGGCAGCGCACGAGAGCAGCAAGTCTGCTTAAATCTTCTGAACATGGCTATGATTGGA 2460
Query 2461 AGTCATACATTCACAAGCTTTGGAAGGCATCTCGTGACATTGACAGAGGAGAAGAACCTT 2520
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2461 AGTCATACATTCACAAGCTTTGGAAGGCATCTTGTGACATTGACAGAGGAGAAAAATCTT 2520
Query 2521 TTCCCTAGTTTACTCTCCATCATAGAGCAAGGAACAGAAGTTCTGAGGGGCAAAGCTCTT 2580
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2521 TTCCCTAGTTTGCTCTCCATCATAGAGCAAGGAACGGAAGTTCTGAGGGGGAAAGCTCTT 2580
Query 2581 CTCTTTGTTGCATTTCTCTGCAAAAACAGTAGGCGTTGGCTGACAAATTTCTTCTGCAAT 2640
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 CTCTTTGTTGCACTTCTCTGCAAAAACAGTAGGCGTTGGCTGACAAATTTCTTCTGCAAT 2640
Query 2641 GCAAGATTTCTTCCTGTGGTGGACAGATTAGCTAAAGAAAAAGACAGTTACCTGCAACAA 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2641 GCAAGATTTCTTCCTGTGGTGGACAGATTAGCTAAAGAAAAAGACAGTTACGTGCAACAA 2700
Query 2701 TGTCTTGAGGCATTTGTGAATGTAATCGCCTCCATAATACCGGGCATGCTGGATACAATA 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2701 TGTCTTGAGGCATTTGTGAATGTAATCGCCTCCATAATACCGGGCTTGCTGGATACAATA 2760
Query 2761 ACCAATGATATCCAACAACTGATGACAGGAAGACGCCATGGACCTGTCTCTCCCCTTAAT 2820
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 ACCAATGATATCCAACAACTGATGACAGGAAGACGCCATGGACCTGTCTCTCCCCTTAAC 2820
Query 2821 AGTCGAGCTCCTGTAAAGACTAATGCACACCTGTTCCCTGTGGTTCTTCACCTTCTGGGA 2880
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2821 AGTCGAGCTCCTTTAAAGACTAATGCACACCTGTTCCCTGTGGTTCTTCATCTTCTCGGA 2880
Query 2881 AGCTCTTCGTTTAAGAACAAGATGGTAACTCCACAAGTCCTAAGGCAGTTGGCAAATCTT 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2881 AGCTCTTCGTTTAAGAACAAGATGGTAACTCCACAAGTCGTAAGGCAGTTGGCAAATCTT 2940
Query 2941 ACAAAACTTGTGGAAGCATCGTTTCAGGGAAGAGATGACTTCCGTGTAACCCTTCTTCAA 3000
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2941 ACAAAACTTGTGGAAGCATCATTTCAGGGAAGAGATGACTTCCGTATAACCCTTCTTCAA 3000
Query 3001 GTTCTAGAGTGCATAACAGGAGATGCGCCTCTGGTTACACAAAATGGTGAGATTATTATC 3060
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3001 GTTCTAGAATGCATAGCAGGAGATGCGCCTCTGGTTACACAAAATGGTGAGATTATTATC 3060
Query 3061 CGTGAGATTCTCCCATCTCTGGCTGCAATTTACAATGGAAACAAAGACGGTGATGCTCGG 3120
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3061 CGTGAGATTCTCCCATCTCTGGCTGTAATTTACAATGGAAACAAAGACGGGGATGCTCGG 3120
Query 3121 TTTCTCTGTTTGAAAATCTGGTTCGATTCATTGACCATTCTCTTAACTGAGTGCACCGAA 3180
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3121 TTTCTCTGTTTGAAGATCTGGTTCGATTCAATGACCATTCTCTTAACTGAGTGCACTGAA 3180
Query 3181 ATCGAGCAACAAATATCGGAGGATTTGAAATCAATATCCAACTCTCATTTCCTCCCACTC 3240
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3181 ATCGAGCAACAAACATCTGAGGATTTGAAATCAATATCCAACTCTCATTTTCTCCCACTC 3240
Query 3241 TACCCTGCACTGATCCAAGACGAAGATCCAATCCCAGCTTACGCTCAAAAGCTCCTTGTC 3300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 TACCCTGCACTGATCCAAGACGAAGATCCAATCCCAGCTTACGCTCAAAAGCTCCTTGTC 3300
Query 3301 ATGCTCGTTGAGTTTGATTACATCAAAATCTCCAACTTATTGCGTCACAATACGGTTTCA 3360
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||
Sbjct 3301 ATGCTTGTTGAGTTTGATTACATCAAAATCTCCAACTTATTGCATCATAATACAGTTTCA 3360
Query 3361 CAATGCTTCGAGTTTCTTCTCGGAGACTTATCAAGCGCAAATGTGAACAATGTCAAGCTC 3420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3361 CAATGCTTCGAGTTTCTTCTCGGAGACTTATCAAGCGCAAATGTGAACAATGTCAAACTC 3420
Query 3421 TGTCTCGCCTTGGCTTCAGCTCCAGAGATGGAAAGTAAACTACTCTCTCAGCTCAAAGTA 3480
||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3421 TGTCTTGCCTTAGCTTCAGCTCCAGAGATGGAAACTAAACTACTCTCTCAGCTCAAAGTA 3480
Query 3481 GTGAGGAGAATCGGAAATCTGCTGGAATTCGTGAATGCCAAAGATATGGAAGATTTCCTA 3540
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3481 GTGAGGAGAATCGGAAATCTGTTGGAATTCGTGAATGCCAAAGACATGGAAGATTTCCTC 3540
Query 3541 GAACCCACTTTAAGTCTCTGCAGAGCTTTTCTGCTACGGTCACTTGGGAACAAGAAAGGT 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3541 GAACCCACTTTAAGTCTCTGCAGAGCTTTTCTGCTACGGTCACTTGGGAACAAGAAAGGT 3600
Query 3601 CTCAGTTCCAACTACACAAAAGAGCCAACGCTTTTATCAGAGGCATCTTTTACGTTCGAG 3660
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 3601 CTCAGCTCCAACTACACAAAAGAGCCAACGCTTTTATCAGAGACATCTTTTACATTCGAG 3660
Query 3661 GTTGATCCACAGGAATGCATAAGAGACATTGCAGATTTCGGTAGCAACATTGGCCTATTC 3720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3661 GTTGATCCACAGGAATGCATAAGAGACATTGCAGATTTCGGTAGCAACATTGGCCTGTTC 3720
Query 3721 TTGCACTTTGCAGGCTTAGACGATGACACAAGCATCGCAGTCGCAGATATTGCCTCTGAA 3780
|||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3721 TTGCACTTTGCAGGTTTAGATGACGACACAAGCATCGCAGTCGCAGATATTGCCTCTGAA 3780
Query 3781 TGTGTTGTGTTGCTACTCAAAGCGGCTTCGAGAGAAGCCACGACGGGATTCTTAACCAAT 3840
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3781 TGTGTTGTATTGCTACTCAAAGCGGCTTCGAGAGAAGCCACGACGGGATTCTTAACCAAT 3840
Query 3841 CTTCCTAAGATCACACCGATTCTGGACTCGTGGCGCAGGAGGAAGAGCACAGAGCTACAC 3900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3841 CTTCCTAAGATCACACCGATTCTGGACTCGTGGCGCAGGAGGAAGAGCACAGAGCTACAC 3900
Query 3901 TTGTTGGTTCTGAAGAGAGTCTTGCATTGTTTGGGTTATGCTTGCAAGCAGTATCTATCG 3960
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3901 TTGTTGGTTCTGAAGAGAGTCTTACATTGTTTGGGTTATGCTTGCAAGCAGTATCTATCG 3960
Query 3961 CAGGCGATGATTTTGTCGATATCGGGACACGATGTCTCAAAGATCAACGCAATTGTCTCT 4020
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||
Sbjct 3961 CAGGCGATGATTTTGTCGATATCAGGACACGATGTCTCGAAGATCAACACCATCGTCTCT 4020
Query 4021 GAGATGAAGAACTCAGACGCCGCTGGTCTTAACAGCATCGCTTCACTCGTTGCCATGGAG 4080
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || | |||||||| |||||
Sbjct 4021 GAGATGAAGAACTCAGACGTCGCTGGTCTTAATAGCGTTGCCACCCTCGTTGCTATGGAA 4080
Query 4081 TTGCAGAGATTACCTCGTTGAATTTGAAGTCATCTGAACAATG--G-ATTAACGACGACA 4137
||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | | |||||| | |||
Sbjct 4081 TTGCAGAGATTGCCTCGTTGAGTTTGAAGTTTTCTGAACAAAGCAGGATTAAC-A--ACA 4137
Query 4138 ATGACGCTGAGCTGTAGATTTTGAGTACATGCGAGGTAAAACAAACGCAAAAACATGTGA 4197
||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4138 ATGACGCTGAGCTGTAGATTTGGAGTACGTACGAGGTAAAACAAACGCAAAAACATGTGA 4197
Query 4198 CAAAGTGAAACCCAGAATCAAGATTTGTCTCTTCTTAATGTATATTTCTT-TCT--ATTG 4254
|||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 4198 CAAATTGAAACCCAGAATCGAGATTTGTCTCTTTTTAATGTATATTTCTTCTCTCCATTA 4257
Query 4255 CAATTTTTGTACCACTAATACAATCTACTTCCTTAATATTATCTTCTTTTAGAC 4308
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4258 CAAATTTTGTACCACTAGTACAATCTACTTCCTTAATATTATCTTCATTTAGAC 4311
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 162924470013
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5