BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G19610.1
Length=4128
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488855 jgi|Araly1|488855|fgenesh2_kg.6__1989__AT5G19610.1 6523 0.0
> Ahg488855 jgi|Araly1|488855|fgenesh2_kg.6__1989__AT5G19610.1
Length=4131
Score = 6523 bits (3532), Expect = 0.0
Identities = 3938/4137 (95%), Gaps = 15/4137 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATCGTATCGCCGTAAGAGCAAAGCGGAAAGAGCTAGGGATATCATGCATGCTTAAC 60
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATCGTATCGCGGTGAGAGCAAAGCGGAAAGAGCTAGGGATATCATGCATGCTTAAC 60
Query 61 ACGGAGGTTGGTGCAGTCCTTGCCGTCATTCGTAGACCCCTTTCAGAAAGTTACCTTTCT 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 ACGGAGGTTGGTGCAGTCCTTGCCGTCATTCGTAGACCCCTTTCGGAAAGTTACCTTTCT 120
Query 121 CCCCAAGAAACAGACCACTGTGATTCATCAGTCCAACAATCTCTCAAATCTCTTAGAGCT 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 121 CCCCAAGAAACAGACCACTGTGATTCATCAGTCCAACAATCTCTAAAATCTCTTAGAGCC 180
Query 181 CTTATTTTCAATCCTCAACAAGATTGGCGCACCATAGATCCTTCGGTTTATCTTTCTCCT 240
||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 181 CTTATCTTCAATCCTCAACAAGATTGGCGCACTATCGATCCTTCGGTTTACCTCTCTCCT 240
Query 241 TTCCTCGAAGTTATTCAAAGCGATGAGATTCCGGCTAGCGCCACAGCTGTCGCTCTTTCC 300
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 241 TTCCTCGAAGTTATTCAAAGCGATGAGATCCCGGCTAGCGCCACAGCTGTCGCCCTTTCC 300
Query 301 TCCATCTTAAAGATCCTTAAAATCGAGATCTTCGATGAGAAAACACCTGGTGCAAAAGAT 360
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TCCATCTTGAAGATCCTTAAAATCGAGATTTTCGATGAGAAAACACCTGGTGCAAAAGAT 360
Query 361 GCTATGAATTCTATTGTCTCCGGGATTACTAGTTGTCGTTTGGAGAAAACAGATTTGGTG 420
||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 361 GCTATGAATTCAATTGTTTCGGGGATTACTAGTTGTCGTTTGGAGAAAACAGATTTGTTG 420
Query 421 TCTGAAGATGCTGTAATGATGAGGATTCTTCAAGTTTTAACCGGAATCATGAAACATCCA 480
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCCGAAGATGCTGTGATGATGAGGATTCTTCAAGTTTTAATCGGAATCATGAAACATCCA 480
Query 481 TCCTCTGAGTTATTAGAAGATCAAGCGGTTTGCACAATAGTCAATACATGTTTCCAAGTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||
Sbjct 481 TCCTCTGAGTTATTAGAAGATCAAGCGGTTTGCACTATCGTCAACACATGTTTCCAAGTG 540
Query 541 GTGCAACAATCTACCGGTAGAGGAGATTTGCTGCAACGAAATGGAAGATACACAATGCAT 600
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 541 GTGCAACAATCTACCGGTAGAGGAGATTTGTTGCAACGAAATGGAAGATACGCAATGCAC 600
Query 601 GAGCTGATTCAGATCATTTTCTCCAGATTACCTGATTTTGAGGTCAGAGGAGACGAAGGT 660
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 601 GAACTGATTCAGATCATTTTCTCTAGATTACCTGATTTTGAAGTCAGAGGAGACGATGGT 660
Query 661 GGTGAGGATTCAGAATCTGATACTGACGAAATCGACATGAGCGGCGGATATGGAATCCGA 720
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GGTGAGGAATCAGAATCTGATACTGACGAAATAGACATGAGCGGCGGATATGGAATCCGA 720
Query 721 TGTTGCATCGACATTTTTCATTTCTTATGTTCGTTGCTCAATGTTGTTGAAGTTGTTGAG 780
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 721 TGTTGTATCGACATTTTTCATTTCTTATGTTCGTTGCTCAATGTTGTTGAGGTTGTTGAG 780
Query 781 AACTTAGAAGGGACAAACGTTCACACTGCAGACGAAGATGTGCAGATTTTTGCTTTAGTT 840
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 781 AACTCGGAAGGGACAAGTGTTCACACTGCAGACGAAGATGTGCAGATTTTTGCTTTGGTT 840
Query 841 TTAATAAATAGCGCCATTGAGTTAAGCGGTGATGCGATCGGGCAACACCCTAAGCTTCTT 900
||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TTAATCAATAGCGCGATTGAGTTAAGTGGTGATGCGATCGGGCAACACCCTAAGCTTCTT 900
Query 901 CGGATGGTTCAGGACGATCTATTTCACCATTTAATCCATTATGGAGCTTCTTCAAGCCCT 960
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CGGATGGTTCAAGACGATCTATTTCACCATTTAATCCATTATGGAGCTTCTTCAAGCCCG 960
Query 961 CTTGTGCTATCAATGATCTGTAGTTGTATACTCAATATATATCACTTCCTCCGCAAGTTC 1020
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTTGTTCTATCGATGATCTCTAGTTGTATACTCAATATATATCACTTCCTCCGCAAGTTC 1020
Query 1021 ATGAGGCTACAACTCGAAGCTTTCTTCTCCTTCGTGTTGTTGAGAGTTACAGCTTTCACA 1080
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1021 ATGAGGCTACAGCTCGAAGCTTTCTTCTCCTTTGTGTTGTTGAGAGTTACAGCTTTTACA 1080
Query 1081 GGCTTCCTTCCGTTACAAGAAGTTGCTCTTGAAGGGCTAATCAACTTTTGTCGACAACCT 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GGCTTCCTTCCGTTACAAGAAGTTGCTCTTGAAGGGCTAATCAACTTTTGTCGACAACCC 1140
Query 1141 GCTTTCATAGTCGAAGCTTATGTAAACTACGACTGTGATCCGATGTGTAGAAATATATTT 1200
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 1141 GCTTTCATAGTCGAAGCCTATGTGAACTACGACTGTGATCCAATGTGTAGGAATAT-TTT 1199
Query 1201 -GAAGAGACCGGAAAAGTTCTATGCAGACATACATTCCCTACCTCTGGTCCTTTAACCTC 1259
|||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 CGAAGAGACCGGAAAAGTTCTGTGTAGGCATACCTTCCCTACCTCTGGTCCTTTAACCTC 1259
Query 1260 TATACAAATCCAAGCCTTTGAAGGTCTTGTGATCTTGATTCACAACATCGCCGACAATAT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1260 TATACAAATCCAAGCCTTTGAAGGTCTTGTGATCTTGATTCACAACATCGCTGACAATAT 1319
Query 1320 GGATAGAGAGGAAGATGAGGGTAATGAAGAAGATGATAATAACTCCAATGTGATTAAGCC 1379
||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1320 GGATAGAGAGGAAGAAGAGGGTGCTGAAGAAGATG---ATAACTCCAATGCGATTAAGCC 1376
Query 1380 AAGCCCTGTTGAGATTCATGAGTACATACCCTTTTGGATAGATAAGCCAAAAGAGGATTT 1439
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 AAGCCCCGTTGAGATTCACGAGTACATACCCTTTTGGATAGATAAGCCAAAAGAGGATTT 1436
Query 1440 TGAGACGTGGGTAGATCATATAAGAGTAAGGAAAGCTCAGAAGAGAAAGCTAGCGATCGC 1499
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1437 TGAGACGTGGGTAGATCATATAAGAGTGAGGAAAGCTCAGAAGAGGAAGCTAGCGATCGC 1496
Query 1500 TGCAAATCATTTCAACAGAGATGAGAAAAAGGGTTTGGAGTATTTGAAGTATAACTACTT 1559
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497 TGCAAATCATTTCAATAGAGATGAGAAAAAGGGTTTGGAGTATTTGAAGTATAACTACTT 1556
Query 1560 AGTCTCAGATCCTCTTGATCCAATGGCATTAGCTTCATTTTTCAGATTCACACCGGGTTT 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1557 AGTCTCAGATCCTCTTGATCCAATGGCATTAGCTTCATTTTTCAGATTTACACCGGGTTT 1616
Query 1620 GGATAAGACAATGATTGGAGATTACCTTGGAGATCCTGATGAATTACATCTCAGTGTTCT 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1617 GGATAAGACAATGATTGGAGATTACCTTGGAGATCCTGATGAGTTACATCTCAGTGTTCT 1676
Query 1680 TAGAAGCTTTACACATACATTTGAGTTCACTGGTATGAATCTTGATACCGCATTGAGGAC 1739
|| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 TAAAAGCTTTACACATACGTTTGAGTTCACGGGTATGAATCTTGATACCGCATTGAGGAC 1736
Query 1740 ATTTCTTGAGTCATTTCGGTTACCGGGAGAGTCTCAAAAGATCGAACGTATGATTGAAGC 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 ATTTCTTGAGTCATTTCGGTTACCGGGAGAGTCGCAAAAGATCGAACGTATGATTGAAGC 1796
Query 1800 CTTCTCTGAGAGATTCTATGATCAACAATCATCTGATATTTTTGCAAGCAAAGATACTGT 1859
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797 TTTCTCTGAAAGATTCTATGATCAACAATCATCTGATATTTTTGCAAGCAAAGATACTGT 1856
Query 1860 TCACATTTTGTGTTACTCGCTTATAATGCTCAACACGGATCAACATAACCCTCAAGTTAG 1919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1857 TCACATTTTGTGTTACTCGCTTATAATGCTCAACACGGATCAACATAACCCTCAGGTTAG 1916
Query 1920 GAGGAAAATGACAGAAGATGAGTTTATCCGCAACAACAGGGCAATTAACGCGGGAAATGA 1979
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 GAAGAAAATGACAGAAGATGAGTTTATCCGCAACAACCGAGCAATTAACGCGGGAAATGA 1976
Query 1980 CCTTCCAAAGGAATACCTCTCTGAGCTTTTTCAGTCCATTGCAACAAATGCATTCGCTTT 2039
|||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 CCTTCCAAAGGAATACCTATCCGAGCTTTTTCAATCCATTGCAACAAATGCATTCGCTTT 2036
Query 2040 ATCGACACATTCCGGTCCGGTGGAAATGAATCCAAACAGATGGATTGAGCTAATGAACAG 2099
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2037 ATCGACACATTCAGGTCCTGTGGAAATGAATCCAAATAGATGGATTGAGCTGATGAACAG 2096
Query 2100 AACAAAGACTACACAACCTTTTAGTTTATGTCAGTTTGATCGTAGAATAGGAAGGGATAT 2159
||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2097 AACAAAGACGACACAACCTTTTAGTCTCTGCCAGTTCGATCGGCGAATAGGAAGGGATAT 2156
Query 2160 GTTTGCAACCATTGCAGGTCCATCAATAGCAGCAGTTTCTGCATTCTTTGAGCATTCAGA 2219
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 GTTTGCAACCATTGCAGGTCCATCAATAGCCGCTGTTTCTGCATTCTTTGAGCATTCAGA 2216
Query 2220 TGATGATGAAGTGCTTCATGAATGTGTTGATGCTATGATCTCTATAGCAAGAGTTGCTCA 2279
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 TGATGATGAAGTGCTTCATGAATGTGTGGATGCTATGATCTCTATAGCAAGAGTTGCTCA 2276
Query 2280 GTATGGCCTTGAAGACATTCTTGATGAGCTCATTGCTTCCTTTTGTAAATTCACAACGTT 2339
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 ATATGGCCTTGAAGACATTCTTGACGAGCTCATAGCTTCCTTTTGTAAATTCACAACGTT 2336
Query 2340 GTTAAACCCTTACACTACACCTGAAGAGACTTTGTTTGCATTTAGTCACGATATGAAACC 2399
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337 GTTAAACCCTTACACTACACCCGAAGAGACTTTGTTCGCATTTAGTCACGATATGAAACC 2396
Query 2400 GCGAATGGCTACTCTCGCGGTTTTCACGCTCGCTAAC-ACATTTGGTGATTCTATCAGAG 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct 2397 GCGAATGGCTACTCTCGCGGTTTTCACGCTCGCTAACAAC-TTTGGTGATTCTATTAGAG 2455
Query 2459 GAGGGTGGAGGAACATTGTGGATTGCCTCTTGAAACTTAGGAAGCTTCAGCTTCTTCCAC 2518
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2456 GAGGGTGGAGGAACATTGTGGATTGTCTCTTGAAACTTAGAAAGCTTCAGCTTCTTCCAC 2515
Query 2519 AGTCTGTTATTGAGTTTGAGAT---AAATGA--AGAA-AATGGCGGATCAGAATCCGACA 2572
|||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 AGTCTGTTATTGAGTTTGAGATAACAAATGAGGAAAATAATGGCGGATCAGAATCCGACA 2575
Query 2573 TGAACAATGTTTCGAGCCAGGACACAAAATTTAACCGACGACAAGGTTCTAGTCTAATGG 2632
|||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 2576 TGAACATTGTTTCAAACCAAGACACAAAATTTAACCGACGACAGGGTTCTAGTTTAATGG 2635
Query 2633 GTCGGTTTTCACACTTCTTGGCATTAGACAACGTGGAAGAATCTGTAGCTCTTGGAATGA 2692
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||
Sbjct 2636 GTCGGTTTTCACACTTCTTGGCATTAGACAGCGTGGAAGAGTCTCTGGCTCTTGGAATGA 2695
Query 2693 GTGAGTTTGAACAAAACCTTAAAGTCATAAAACAATGCAGGATCGGTCAAATATTCAGCA 2752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2696 GTGAGTTTGAACAAAACCTTAAAGTCATAAAACAATGCAGGATTGGTCAAATATTCAGCA 2755
Query 2753 AAAGCTCAGTGTTGCCGGATGTTGCGGTGTTGAATCTTGGTCGGTCTTTAATCTATGCAG 2812
| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2756 AGAGCTCGGTGTTACCGGATGTTGCGGTGTTGAATCTAGGCCGGTCTTTAATCTATGCAG 2815
Query 2813 CTGCTGGGAAAGGACAGAAGTTTAGTACAGCTATCGAAGAAGAAGAGACGGTTAAGTTTT 2872
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2816 CTGCTGGGAAAGGACAGAAGTTTAGTACAGCGATAGAAGAAGAAGAGACGGTCAAGTTCT 2875
Query 2873 GTTGGGATTTGATCATAACCATTGCATTATCTAACGTCCACCGGTTCAACATGTTTTGGC 2932
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2876 GCTGGGATTTGATCATAACCATTGCGTTATCTAACGTCCATCGGTTCAACATGTTCTGGC 2935
Query 2933 CAAGTTACCATGAATATCTACTCAACGTTGCAAACTTTCCGCTCTTTTCACCCATTCCGT 2992
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2936 CAAGTTACCATGAATATCTACTCAATGTTGCAAACTTTCCGCTCTTTTCACCCATTCCGT 2995
Query 2993 TTGTCGAAAAAGGGCTCCCGGGTTTATTTAGGGTATGCATCAAGATTCTTGCTTCTAACC 3052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2996 TTGTCGAAAAAGGGCTCCCGGGTTTATTTAGGGTATGCATCAAGATTCTTGCTTCTAACC 3055
Query 3053 TTCAAGACCATCTACCAGAGGAGTTGATTTTTAGGTCCTTGACAATAATGTGGAAGATAG 3112
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3056 TTCAAGACCATCTACCAGAGGAGCTGATTTTTAGGTCCTTAACTATAATGTGGAAGATAG 3115
Query 3113 ACAAAGAAATCATTGAAACATGTTATGACACAATAACAGAGTTTGTCAGCAAGATCATTA 3172
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 ATAAAGAAATCATCGAAACATGTTATGACACAATAACAGAGTTTGTCAGCAAGATCATTA 3175
Query 3173 TAGACTACTCTGCGAATCTGCATACCAATATAGGGTGGAAAAGTGTTTTACAACTACTTT 3232
|| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3176 CAGTGTACTCTGCAAATCTGCATACCAATATTGGGTGGAAAAGCGTTTTACAACTACTTT 3235
Query 3233 CTTTATGTGGAAGACATCCAGAGACCAAAGAGCAAGCGGTGGATGCTCTCATCGGTTTAA 3292
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3236 CTTTATGTGGAAGGCATCCAGAGACCAAAGAGCAAGCTGTGGATGCTCTCATCGGTTTAA 3295
Query 3293 TGTC-ATTTAACGCATCGCATCTATCGCAGTCAAGCTACGCTTATTGCATCGATTGCGCC 3351
|||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3296 TGTCGATA-AACGCATCGCATCTCTCGCAGTCAAGCTACGCTTATTGCATCGATTGCGCC 3354
Query 3352 TTCAGTTTTGTTGCTTTAAGAAATAGCTCTGTTGAGAAGAACTTGAAAATATTGGATCTC 3411
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3355 TTCAGTTTTGTTGCTCTAAGAAATAGCTCTGTTGAGAAGAACTTGAAAATATTGGATCTC 3414
Query 3412 ATGGCAGATTCAGTGACAATGTTGGTAAAATGGTACAAAACTGCCTCTACTGATACCGCG 3471
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 3415 ATGGCAGATTCAGTGACAATGCTAGTAAAATGGTACAAAACGGCCTCGACTGATACCGCG 3474
Query 3472 AATAGCTATAGCCCGGCAAGCAACACAAGCAGTTCATCATCCATGGAAGAAAACAACTTG 3531
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 3475 AATAGCTACAGCCCGGCAAGCAACACAAGCAGTTCATCTTCCATGGAAGAAAACAGCTTG 3534
Query 3532 AGAGGGGTTAACTTTGTTCATCATCTTTTCCTCAAACTCTCCGAGGCTTTTCGAAAAACG 3591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3535 AGAGGGGTTAACTTTGTTCATCATCTTTTCCTCAAACTCTCAGAGGCTTTTCGAAAAACG 3594
Query 3592 ACCCTTGCACGCCGAGAAGAGATAAGGAACAGAGCAGTGACGTCTCTAGAGAAAAGTTTC 3651
|| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||
Sbjct 3595 ACACTTGCACGACGAGAAGAAATAAGGAACAGAGCAGTGACGTCTTTGGAGAAAAGCTTC 3654
Query 3652 ACCATGGGTCATGAAGATCTTGGATTCACACCTTCTGGTTGTATATACTGCATAGACCAT 3711
||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3655 ACCATGGGTCATGAAGACCTTGGATTCACGCCATCGGGTTGTATATACTGCATCGACCAT 3714
Query 3712 GTCATATTCCCAACAATCGATGACTTGCATGAGAAGCTTCTCGACTATTCAAGGCGCGAA 3771
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3715 GTCATATTCCCAACAATTGATGACTTGCATGAGAAGCTTCTAGACTATTCAAGGCGCGAA 3774
Query 3772 AACGCGGAAAGAGAGATGAGAAGCATGGAGGGGACGTTGAAGATAGCTATGAAAGTGCTC 3831
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3775 AACGCGGAAAGAGAGATGAGAAGCATGGAGGGGACATTGAAGATAGCTATGAAAATGCTC 3834
Query 3832 ATGAACGTTTTCTTGGTTTACTTGGAACAAATTGTAGAAAGTGCTGAGTTTAGAACTTTT 3891
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3835 ATGAACGTTTTCTTGGTTTACTTGCAACAGATTGTAGAAAGTGCTGAGTTTAGAACTTTT 3894
Query 3892 TGGTTAGGAGTGTTGAGGAGAATGGATACGTGTATGAAGGCGGATTTGGGAGAGTATGGA 3951
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3895 TGGTTAGGAGTGTTGCGGAGAATGGATACGTGTATGAAGGCGGATTTGGGAGAGTATGGA 3954
Query 3952 GATAACAAACTTCAAGAGGTTGTCCCTGAACTTTTGACCACCATGATTGGTACCATGAAG 4011
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3955 GATAATAAACTTCAAGAGGTTGTGCCTGAACTTTTGACCACCATGATTGGTACCATGAAG 4014
Query 4012 GAGAAAGAGATTTTGGTGCAGAAGGAAGACGATGACCTTTGGGAGATTACGTATATTCAG 4071
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4015 GAGAAAAAGATTTTGGTGCAGAAGGAAGACGATGACCTTTGGGAGATTACTTATATTCAG 4074
Query 4072 ATTCAATGGATTGCTCCAGCGCTCAAGGATGAGTTATTTCCCGATGAAGAGATTTAG 4128
|||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4075 ATTCAATGGATTGCCCCATCCCTCAAGGATGAGTTATTTCCTGATGAAGAGATTTAG 4131
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 156074106873
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5