BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G19610.1 Length=4128 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg488855 jgi|Araly1|488855|fgenesh2_kg.6__1989__AT5G19610.1 6523 0.0 > Ahg488855 jgi|Araly1|488855|fgenesh2_kg.6__1989__AT5G19610.1 Length=4131 Score = 6523 bits (3532), Expect = 0.0 Identities = 3938/4137 (95%), Gaps = 15/4137 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGATCGTATCGCCGTAAGAGCAAAGCGGAAAGAGCTAGGGATATCATGCATGCTTAAC 60 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGATCGTATCGCGGTGAGAGCAAAGCGGAAAGAGCTAGGGATATCATGCATGCTTAAC 60 Query 61 ACGGAGGTTGGTGCAGTCCTTGCCGTCATTCGTAGACCCCTTTCAGAAAGTTACCTTTCT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 61 ACGGAGGTTGGTGCAGTCCTTGCCGTCATTCGTAGACCCCTTTCGGAAAGTTACCTTTCT 120 Query 121 CCCCAAGAAACAGACCACTGTGATTCATCAGTCCAACAATCTCTCAAATCTCTTAGAGCT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 121 CCCCAAGAAACAGACCACTGTGATTCATCAGTCCAACAATCTCTAAAATCTCTTAGAGCC 180 Query 181 CTTATTTTCAATCCTCAACAAGATTGGCGCACCATAGATCCTTCGGTTTATCTTTCTCCT 240 ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| Sbjct 181 CTTATCTTCAATCCTCAACAAGATTGGCGCACTATCGATCCTTCGGTTTACCTCTCTCCT 240 Query 241 TTCCTCGAAGTTATTCAAAGCGATGAGATTCCGGCTAGCGCCACAGCTGTCGCTCTTTCC 300 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 241 TTCCTCGAAGTTATTCAAAGCGATGAGATCCCGGCTAGCGCCACAGCTGTCGCCCTTTCC 300 Query 301 TCCATCTTAAAGATCCTTAAAATCGAGATCTTCGATGAGAAAACACCTGGTGCAAAAGAT 360 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TCCATCTTGAAGATCCTTAAAATCGAGATTTTCGATGAGAAAACACCTGGTGCAAAAGAT 360 Query 361 GCTATGAATTCTATTGTCTCCGGGATTACTAGTTGTCGTTTGGAGAAAACAGATTTGGTG 420 ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 361 GCTATGAATTCAATTGTTTCGGGGATTACTAGTTGTCGTTTGGAGAAAACAGATTTGTTG 420 Query 421 TCTGAAGATGCTGTAATGATGAGGATTCTTCAAGTTTTAACCGGAATCATGAAACATCCA 480 || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 421 TCCGAAGATGCTGTGATGATGAGGATTCTTCAAGTTTTAATCGGAATCATGAAACATCCA 480 Query 481 TCCTCTGAGTTATTAGAAGATCAAGCGGTTTGCACAATAGTCAATACATGTTTCCAAGTA 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| Sbjct 481 TCCTCTGAGTTATTAGAAGATCAAGCGGTTTGCACTATCGTCAACACATGTTTCCAAGTG 540 Query 541 GTGCAACAATCTACCGGTAGAGGAGATTTGCTGCAACGAAATGGAAGATACACAATGCAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 541 GTGCAACAATCTACCGGTAGAGGAGATTTGTTGCAACGAAATGGAAGATACGCAATGCAC 600 Query 601 GAGCTGATTCAGATCATTTTCTCCAGATTACCTGATTTTGAGGTCAGAGGAGACGAAGGT 660 || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 601 GAACTGATTCAGATCATTTTCTCTAGATTACCTGATTTTGAAGTCAGAGGAGACGATGGT 660 Query 661 GGTGAGGATTCAGAATCTGATACTGACGAAATCGACATGAGCGGCGGATATGGAATCCGA 720 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GGTGAGGAATCAGAATCTGATACTGACGAAATAGACATGAGCGGCGGATATGGAATCCGA 720 Query 721 TGTTGCATCGACATTTTTCATTTCTTATGTTCGTTGCTCAATGTTGTTGAAGTTGTTGAG 780 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 721 TGTTGTATCGACATTTTTCATTTCTTATGTTCGTTGCTCAATGTTGTTGAGGTTGTTGAG 780 Query 781 AACTTAGAAGGGACAAACGTTCACACTGCAGACGAAGATGTGCAGATTTTTGCTTTAGTT 840 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 781 AACTCGGAAGGGACAAGTGTTCACACTGCAGACGAAGATGTGCAGATTTTTGCTTTGGTT 840 Query 841 TTAATAAATAGCGCCATTGAGTTAAGCGGTGATGCGATCGGGCAACACCCTAAGCTTCTT 900 ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TTAATCAATAGCGCGATTGAGTTAAGTGGTGATGCGATCGGGCAACACCCTAAGCTTCTT 900 Query 901 CGGATGGTTCAGGACGATCTATTTCACCATTTAATCCATTATGGAGCTTCTTCAAGCCCT 960 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CGGATGGTTCAAGACGATCTATTTCACCATTTAATCCATTATGGAGCTTCTTCAAGCCCG 960 Query 961 CTTGTGCTATCAATGATCTGTAGTTGTATACTCAATATATATCACTTCCTCCGCAAGTTC 1020 ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 CTTGTTCTATCGATGATCTCTAGTTGTATACTCAATATATATCACTTCCTCCGCAAGTTC 1020 Query 1021 ATGAGGCTACAACTCGAAGCTTTCTTCTCCTTCGTGTTGTTGAGAGTTACAGCTTTCACA 1080 ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1021 ATGAGGCTACAGCTCGAAGCTTTCTTCTCCTTTGTGTTGTTGAGAGTTACAGCTTTTACA 1080 Query 1081 GGCTTCCTTCCGTTACAAGAAGTTGCTCTTGAAGGGCTAATCAACTTTTGTCGACAACCT 1140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GGCTTCCTTCCGTTACAAGAAGTTGCTCTTGAAGGGCTAATCAACTTTTGTCGACAACCC 1140 Query 1141 GCTTTCATAGTCGAAGCTTATGTAAACTACGACTGTGATCCGATGTGTAGAAATATATTT 1200 ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| Sbjct 1141 GCTTTCATAGTCGAAGCCTATGTGAACTACGACTGTGATCCAATGTGTAGGAATAT-TTT 1199 Query 1201 -GAAGAGACCGGAAAAGTTCTATGCAGACATACATTCCCTACCTCTGGTCCTTTAACCTC 1259 |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 CGAAGAGACCGGAAAAGTTCTGTGTAGGCATACCTTCCCTACCTCTGGTCCTTTAACCTC 1259 Query 1260 TATACAAATCCAAGCCTTTGAAGGTCTTGTGATCTTGATTCACAACATCGCCGACAATAT 1319 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1260 TATACAAATCCAAGCCTTTGAAGGTCTTGTGATCTTGATTCACAACATCGCTGACAATAT 1319 Query 1320 GGATAGAGAGGAAGATGAGGGTAATGAAGAAGATGATAATAACTCCAATGTGATTAAGCC 1379 ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct 1320 GGATAGAGAGGAAGAAGAGGGTGCTGAAGAAGATG---ATAACTCCAATGCGATTAAGCC 1376 Query 1380 AAGCCCTGTTGAGATTCATGAGTACATACCCTTTTGGATAGATAAGCCAAAAGAGGATTT 1439 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1377 AAGCCCCGTTGAGATTCACGAGTACATACCCTTTTGGATAGATAAGCCAAAAGAGGATTT 1436 Query 1440 TGAGACGTGGGTAGATCATATAAGAGTAAGGAAAGCTCAGAAGAGAAAGCTAGCGATCGC 1499 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1437 TGAGACGTGGGTAGATCATATAAGAGTGAGGAAAGCTCAGAAGAGGAAGCTAGCGATCGC 1496 Query 1500 TGCAAATCATTTCAACAGAGATGAGAAAAAGGGTTTGGAGTATTTGAAGTATAACTACTT 1559 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1497 TGCAAATCATTTCAATAGAGATGAGAAAAAGGGTTTGGAGTATTTGAAGTATAACTACTT 1556 Query 1560 AGTCTCAGATCCTCTTGATCCAATGGCATTAGCTTCATTTTTCAGATTCACACCGGGTTT 1619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1557 AGTCTCAGATCCTCTTGATCCAATGGCATTAGCTTCATTTTTCAGATTTACACCGGGTTT 1616 Query 1620 GGATAAGACAATGATTGGAGATTACCTTGGAGATCCTGATGAATTACATCTCAGTGTTCT 1679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1617 GGATAAGACAATGATTGGAGATTACCTTGGAGATCCTGATGAGTTACATCTCAGTGTTCT 1676 Query 1680 TAGAAGCTTTACACATACATTTGAGTTCACTGGTATGAATCTTGATACCGCATTGAGGAC 1739 || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1677 TAAAAGCTTTACACATACGTTTGAGTTCACGGGTATGAATCTTGATACCGCATTGAGGAC 1736 Query 1740 ATTTCTTGAGTCATTTCGGTTACCGGGAGAGTCTCAAAAGATCGAACGTATGATTGAAGC 1799 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1737 ATTTCTTGAGTCATTTCGGTTACCGGGAGAGTCGCAAAAGATCGAACGTATGATTGAAGC 1796 Query 1800 CTTCTCTGAGAGATTCTATGATCAACAATCATCTGATATTTTTGCAAGCAAAGATACTGT 1859 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1797 TTTCTCTGAAAGATTCTATGATCAACAATCATCTGATATTTTTGCAAGCAAAGATACTGT 1856 Query 1860 TCACATTTTGTGTTACTCGCTTATAATGCTCAACACGGATCAACATAACCCTCAAGTTAG 1919 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1857 TCACATTTTGTGTTACTCGCTTATAATGCTCAACACGGATCAACATAACCCTCAGGTTAG 1916 Query 1920 GAGGAAAATGACAGAAGATGAGTTTATCCGCAACAACAGGGCAATTAACGCGGGAAATGA 1979 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct 1917 GAAGAAAATGACAGAAGATGAGTTTATCCGCAACAACCGAGCAATTAACGCGGGAAATGA 1976 Query 1980 CCTTCCAAAGGAATACCTCTCTGAGCTTTTTCAGTCCATTGCAACAAATGCATTCGCTTT 2039 |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1977 CCTTCCAAAGGAATACCTATCCGAGCTTTTTCAATCCATTGCAACAAATGCATTCGCTTT 2036 Query 2040 ATCGACACATTCCGGTCCGGTGGAAATGAATCCAAACAGATGGATTGAGCTAATGAACAG 2099 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 2037 ATCGACACATTCAGGTCCTGTGGAAATGAATCCAAATAGATGGATTGAGCTGATGAACAG 2096 Query 2100 AACAAAGACTACACAACCTTTTAGTTTATGTCAGTTTGATCGTAGAATAGGAAGGGATAT 2159 ||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 2097 AACAAAGACGACACAACCTTTTAGTCTCTGCCAGTTCGATCGGCGAATAGGAAGGGATAT 2156 Query 2160 GTTTGCAACCATTGCAGGTCCATCAATAGCAGCAGTTTCTGCATTCTTTGAGCATTCAGA 2219 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2157 GTTTGCAACCATTGCAGGTCCATCAATAGCCGCTGTTTCTGCATTCTTTGAGCATTCAGA 2216 Query 2220 TGATGATGAAGTGCTTCATGAATGTGTTGATGCTATGATCTCTATAGCAAGAGTTGCTCA 2279 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2217 TGATGATGAAGTGCTTCATGAATGTGTGGATGCTATGATCTCTATAGCAAGAGTTGCTCA 2276 Query 2280 GTATGGCCTTGAAGACATTCTTGATGAGCTCATTGCTTCCTTTTGTAAATTCACAACGTT 2339 ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2277 ATATGGCCTTGAAGACATTCTTGACGAGCTCATAGCTTCCTTTTGTAAATTCACAACGTT 2336 Query 2340 GTTAAACCCTTACACTACACCTGAAGAGACTTTGTTTGCATTTAGTCACGATATGAAACC 2399 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2337 GTTAAACCCTTACACTACACCCGAAGAGACTTTGTTCGCATTTAGTCACGATATGAAACC 2396 Query 2400 GCGAATGGCTACTCTCGCGGTTTTCACGCTCGCTAAC-ACATTTGGTGATTCTATCAGAG 2458 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| Sbjct 2397 GCGAATGGCTACTCTCGCGGTTTTCACGCTCGCTAACAAC-TTTGGTGATTCTATTAGAG 2455 Query 2459 GAGGGTGGAGGAACATTGTGGATTGCCTCTTGAAACTTAGGAAGCTTCAGCTTCTTCCAC 2518 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2456 GAGGGTGGAGGAACATTGTGGATTGTCTCTTGAAACTTAGAAAGCTTCAGCTTCTTCCAC 2515 Query 2519 AGTCTGTTATTGAGTTTGAGAT---AAATGA--AGAA-AATGGCGGATCAGAATCCGACA 2572 |||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||| Sbjct 2516 AGTCTGTTATTGAGTTTGAGATAACAAATGAGGAAAATAATGGCGGATCAGAATCCGACA 2575 Query 2573 TGAACAATGTTTCGAGCCAGGACACAAAATTTAACCGACGACAAGGTTCTAGTCTAATGG 2632 |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct 2576 TGAACATTGTTTCAAACCAAGACACAAAATTTAACCGACGACAGGGTTCTAGTTTAATGG 2635 Query 2633 GTCGGTTTTCACACTTCTTGGCATTAGACAACGTGGAAGAATCTGTAGCTCTTGGAATGA 2692 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| Sbjct 2636 GTCGGTTTTCACACTTCTTGGCATTAGACAGCGTGGAAGAGTCTCTGGCTCTTGGAATGA 2695 Query 2693 GTGAGTTTGAACAAAACCTTAAAGTCATAAAACAATGCAGGATCGGTCAAATATTCAGCA 2752 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2696 GTGAGTTTGAACAAAACCTTAAAGTCATAAAACAATGCAGGATTGGTCAAATATTCAGCA 2755 Query 2753 AAAGCTCAGTGTTGCCGGATGTTGCGGTGTTGAATCTTGGTCGGTCTTTAATCTATGCAG 2812 | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 2756 AGAGCTCGGTGTTACCGGATGTTGCGGTGTTGAATCTAGGCCGGTCTTTAATCTATGCAG 2815 Query 2813 CTGCTGGGAAAGGACAGAAGTTTAGTACAGCTATCGAAGAAGAAGAGACGGTTAAGTTTT 2872 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 2816 CTGCTGGGAAAGGACAGAAGTTTAGTACAGCGATAGAAGAAGAAGAGACGGTCAAGTTCT 2875 Query 2873 GTTGGGATTTGATCATAACCATTGCATTATCTAACGTCCACCGGTTCAACATGTTTTGGC 2932 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 2876 GCTGGGATTTGATCATAACCATTGCGTTATCTAACGTCCATCGGTTCAACATGTTCTGGC 2935 Query 2933 CAAGTTACCATGAATATCTACTCAACGTTGCAAACTTTCCGCTCTTTTCACCCATTCCGT 2992 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2936 CAAGTTACCATGAATATCTACTCAATGTTGCAAACTTTCCGCTCTTTTCACCCATTCCGT 2995 Query 2993 TTGTCGAAAAAGGGCTCCCGGGTTTATTTAGGGTATGCATCAAGATTCTTGCTTCTAACC 3052 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2996 TTGTCGAAAAAGGGCTCCCGGGTTTATTTAGGGTATGCATCAAGATTCTTGCTTCTAACC 3055 Query 3053 TTCAAGACCATCTACCAGAGGAGTTGATTTTTAGGTCCTTGACAATAATGTGGAAGATAG 3112 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 3056 TTCAAGACCATCTACCAGAGGAGCTGATTTTTAGGTCCTTAACTATAATGTGGAAGATAG 3115 Query 3113 ACAAAGAAATCATTGAAACATGTTATGACACAATAACAGAGTTTGTCAGCAAGATCATTA 3172 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3116 ATAAAGAAATCATCGAAACATGTTATGACACAATAACAGAGTTTGTCAGCAAGATCATTA 3175 Query 3173 TAGACTACTCTGCGAATCTGCATACCAATATAGGGTGGAAAAGTGTTTTACAACTACTTT 3232 || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3176 CAGTGTACTCTGCAAATCTGCATACCAATATTGGGTGGAAAAGCGTTTTACAACTACTTT 3235 Query 3233 CTTTATGTGGAAGACATCCAGAGACCAAAGAGCAAGCGGTGGATGCTCTCATCGGTTTAA 3292 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3236 CTTTATGTGGAAGGCATCCAGAGACCAAAGAGCAAGCTGTGGATGCTCTCATCGGTTTAA 3295 Query 3293 TGTC-ATTTAACGCATCGCATCTATCGCAGTCAAGCTACGCTTATTGCATCGATTGCGCC 3351 |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3296 TGTCGATA-AACGCATCGCATCTCTCGCAGTCAAGCTACGCTTATTGCATCGATTGCGCC 3354 Query 3352 TTCAGTTTTGTTGCTTTAAGAAATAGCTCTGTTGAGAAGAACTTGAAAATATTGGATCTC 3411 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3355 TTCAGTTTTGTTGCTCTAAGAAATAGCTCTGTTGAGAAGAACTTGAAAATATTGGATCTC 3414 Query 3412 ATGGCAGATTCAGTGACAATGTTGGTAAAATGGTACAAAACTGCCTCTACTGATACCGCG 3471 ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 3415 ATGGCAGATTCAGTGACAATGCTAGTAAAATGGTACAAAACGGCCTCGACTGATACCGCG 3474 Query 3472 AATAGCTATAGCCCGGCAAGCAACACAAGCAGTTCATCATCCATGGAAGAAAACAACTTG 3531 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct 3475 AATAGCTACAGCCCGGCAAGCAACACAAGCAGTTCATCTTCCATGGAAGAAAACAGCTTG 3534 Query 3532 AGAGGGGTTAACTTTGTTCATCATCTTTTCCTCAAACTCTCCGAGGCTTTTCGAAAAACG 3591 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3535 AGAGGGGTTAACTTTGTTCATCATCTTTTCCTCAAACTCTCAGAGGCTTTTCGAAAAACG 3594 Query 3592 ACCCTTGCACGCCGAGAAGAGATAAGGAACAGAGCAGTGACGTCTCTAGAGAAAAGTTTC 3651 || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| Sbjct 3595 ACACTTGCACGACGAGAAGAAATAAGGAACAGAGCAGTGACGTCTTTGGAGAAAAGCTTC 3654 Query 3652 ACCATGGGTCATGAAGATCTTGGATTCACACCTTCTGGTTGTATATACTGCATAGACCAT 3711 ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3655 ACCATGGGTCATGAAGACCTTGGATTCACGCCATCGGGTTGTATATACTGCATCGACCAT 3714 Query 3712 GTCATATTCCCAACAATCGATGACTTGCATGAGAAGCTTCTCGACTATTCAAGGCGCGAA 3771 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3715 GTCATATTCCCAACAATTGATGACTTGCATGAGAAGCTTCTAGACTATTCAAGGCGCGAA 3774 Query 3772 AACGCGGAAAGAGAGATGAGAAGCATGGAGGGGACGTTGAAGATAGCTATGAAAGTGCTC 3831 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3775 AACGCGGAAAGAGAGATGAGAAGCATGGAGGGGACATTGAAGATAGCTATGAAAATGCTC 3834 Query 3832 ATGAACGTTTTCTTGGTTTACTTGGAACAAATTGTAGAAAGTGCTGAGTTTAGAACTTTT 3891 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3835 ATGAACGTTTTCTTGGTTTACTTGCAACAGATTGTAGAAAGTGCTGAGTTTAGAACTTTT 3894 Query 3892 TGGTTAGGAGTGTTGAGGAGAATGGATACGTGTATGAAGGCGGATTTGGGAGAGTATGGA 3951 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3895 TGGTTAGGAGTGTTGCGGAGAATGGATACGTGTATGAAGGCGGATTTGGGAGAGTATGGA 3954 Query 3952 GATAACAAACTTCAAGAGGTTGTCCCTGAACTTTTGACCACCATGATTGGTACCATGAAG 4011 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3955 GATAATAAACTTCAAGAGGTTGTGCCTGAACTTTTGACCACCATGATTGGTACCATGAAG 4014 Query 4012 GAGAAAGAGATTTTGGTGCAGAAGGAAGACGATGACCTTTGGGAGATTACGTATATTCAG 4071 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4015 GAGAAAAAGATTTTGGTGCAGAAGGAAGACGATGACCTTTGGGAGATTACTTATATTCAG 4074 Query 4072 ATTCAATGGATTGCTCCAGCGCTCAAGGATGAGTTATTTCCCGATGAAGAGATTTAG 4128 |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4075 ATTCAATGGATTGCCCCATCCCTCAAGGATGAGTTATTTCCTGATGAAGAGATTTAG 4131 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 156074106873 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5