BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G20610.1
Length=3783
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg488965 jgi|Araly1|488965|fgenesh2_kg.6__2099__AT5G20610.1 3110 0.0
> Ahg488965 jgi|Araly1|488965|fgenesh2_kg.6__2099__AT5G20610.1
Length=3697
Score = 3110 bits (1684), Expect = 0.0
Identities = 1904/2011 (95%), Gaps = 11/2011 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 CCTCCACCATTTTTATCTTATTCCAAGCTTCCACAGAGACGACTTTTCTTTAGTCGCCCT 63
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1 CCTCCACCATTTTTCTCTTCTTCCAAGCTTCGACGGAGACGACTTTTCTTTAGTCGCCAT 60
Query 64 TTCACGCC-GATTTCT-GGTTCCAGGATGAGTAAAGTTAACAGTGAGGAATCTTCTAGTA 121
||||| || || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 61 TTCACTCCGGA-TTCTCAG-TACAGGATGAGTAAAGTTAACAGTGAGGAATCTTCGAGTA 118
Query 122 GCCAAAAATTGTTGAAGGAGGTTGAGAAAATAAGCGAAGCTCTGTATGTGAACAAGAATC 181
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 GCCAAAAATTGTTGAAGGAGGTTGAGACAATAGGCGAAGCTCTGTATGTGAACAAGAATC 178
Query 182 CTAGGGGTTCAGTTGCTGGTTCTAATAAGACTCCAACGAAACCATTGAGTCGTAGCAACT 241
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||
Sbjct 179 CTAGGGGTTCGGTTGCTGGTCCTAATAAGACTCCAACAAAACCTTTGAGTCGAAGCAACT 238
Query 242 TGGCTGAG-C-C-TAAGGAGAAGAAATCGTTTTGGAATTGGCCTCTCAGAGCTATTAATC 298
|||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 239 TGGCTGAGCCTCATAAGGAGAAGAAATCGTTTTGGAATTGGCCTCTCAGAGCCATTAATC 298
Query 299 ATGTCAGAAACCGCCGATTCAATTGTTGTTTCTCTGCTCAAGTCCATTCCATCGAAGGAT 358
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 299 ATGTCAGAAACCGCCGATTCAATTGTTGTTTCTCTGCTCAAGTCCATTCCATTGAAGGGT 358
Query 359 TACCACCGATATTCCAGGATCTTTCTCTCACTGTGCACTGGAAACGTCGTGATGAATCTT 418
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 TACCCCCGATATTCCAGGATCTTTCTCTCACTGTGCACTGGAAACGTCGTGATGAATCTT 418
Query 419 TAAGCACTCGTCCTGCAAAAGTTTCTAATGGAAGAGCTGAATTTAAGGACAAGCTGACAC 478
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 419 TAAGCACTCGTCCTGCAAAAGTTTCCAATGGAAGAGCTGAATTTAAGGATAAGCTGACAC 478
Query 479 ATACATGCTCGGTCTACGGAAGCAGAAGTGGACCGCATCACTCAGCTAAGTATGAAGCTA 538
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 ATACATGCTCGGTATACGGAAGCAGAAGTGGACCACATCACTCAGCTAAGTATGAAGCTA 538
Query 539 AGCATTTCTTGCTGTATGTCT-CTCTGGTTGGATCTCCTGAGATTGATTTGGGAAAACAT 597
||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 539 AGCATTTCTTGTTGTATGT-TGCTCAGGTTGGATCTCCTGAGATTGATCTAGGAAAACAT 597
Query 598 CGAATGGATCTCACTAAATTGCTTCCTCTCACACTTGAGGAGTTGCAGGATGAGAAAAGC 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 CGAATGGATCTCACTAAATTGCTTCCTCTCACACTTGAGGAGTTGCAGGATGAGAAAAGC 657
Query 658 TCTGGTAAGTGGTCAACGACATTTCAGTTGTCTGGAAAGGCTAATGGTGCTACTTTAAGC 717
|| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TCGGGTAAGTGGTCAACAACATTTCAGTTGACTGGAAAGGCTAATGGTGCTACTTTAAGC 717
Query 718 ATGAGTTTTGGGTACACTGTTGTTGGTGATACTCGTAATCCTGCTTCATCTGGTAGCACT 777
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 718 ATGAGTTTTGGGTACACTGTTGTTGGGGATACTCGTAATCCTGCTTCATCAGGTAGCACT 777
Query 778 CAGAATTTCCGCAGTTCGTCAAATGTAAAACAAACTAGTAATAACACAGGGTTGACAAGA 837
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 CAGAATTTCCGCAGTTCTTCAAGTGTAAAACAAACTAGTAATAACACAGGGTTGACAAGA 837
Query 838 GCTATCAGTGCAAAGTCTAGTCTAGGGAATGGAAAGTCCGC-GTCTCGGCGTTATGATCA 896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||
Sbjct 838 ACTATCAGTGCAAAGTCTAGTCTAGGGAATGGAAAGTCCACAG-CTCGGCGTTATGATCA 896
Query 897 TAGTATTGTCAACAGAGAATCACATCCTTTGTCCCAGAATATGGAGGAAATTAAAGACCT 956
|||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 897 CAGTATTGTTAACAAAGAATCGCATCCTTCGTCCCAGAATATGGAGGAAATTAAAGATCT 956
Query 957 TCATGAAATTTTGCCTGCTGTACAATCTGACCTGGGTAGTTCTGTAAACACTTTGTATCA 1016
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 TCATGAAATTTTGCCCGCTGCACAATCTGACCTGGGTAGTTCTGTAAACACTTTGTATCA 1016
Query 1017 AAAATTTGATGAGGAGAAGGTGGATCCTGCAAATGAGTCTCAGTTCGAATTTGACGTTGT 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 AAAATTTGATGAGGAGAAGGTGGATCCTGCAAATGAGTCTCAGTTCGAATTTGACGTTGT 1076
Query 1077 CACTAAACACATTGAACCTGTTGAGTCGATATCTCATGAAAAAGAAGATGCAAATGCACT 1136
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CACTAAATACATTGAACCTGTTGAGTCAATATCTCATGAAAAAGAAGATGCAAATGCACT 1136
Query 1137 TCAAAGCGAGTTGGTAACTGGGAATGAAACTGTTGTTCCTTTTGAGGAAATaaaaaaaGC 1196
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1137 TCAAAGCGAGTTGGGGACTGGGAATGAAACTGTTGTTCCTTTTGAGGAAATAAAAAACGC 1196
Query 1197 TGGTGAAGTTCCTACTGCTGGAAGTGACGAAGTTGGTGCAGAAAATTTCCCTTTAGAAGA 1256
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1197 TGGCGAAGTTCCTACTGCTGGAAGTGATGAAGTTGGTACAGAAAATTTTCCTTCAGAAGA 1256
Query 1257 GCCCTTGGTAAACGGTAATGAAACTGATGTTCCTTTTGAACTATTAAAGAAAGCTGGTGA 1316
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 1257 GCCCTTGGTAAACGGCAATGAAACTGATGTTCCTTTTGAAGTATTGAAGAAAGCTGGTGA 1316
Query 1317 AGTTCCTACTGCTGGAAGGGACGAAGTTGGTACAGAAATTTTGCCTCCAGAAGAGCCCTT 1376
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1317 AGTTCCTACGGCTGGAAGGGACGAAGTTGGTACAGAAATTTTGCCTTCAGAAGAGCCCTC 1376
Query 1377 GGTAAATGGGAATGAAACTGATGTTCCTTTTGAGGAATTAATGATTACTGGCGAAGCTAG 1436
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||
Sbjct 1377 GGTAAATGGGAATGAAACTGATGTTCCTTTTGAGGAATTAATGATTGTTAGTGAAGCTAC 1436
Query 1437 TATTGCTAGAAGTGAGGAAGCTGTTGAGATTGTTACAGAAGAGTTGGCTCCAGAAGAGGG 1496
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1437 TATTGATAGAAGTGAGGAAGCTGTTGAGATTGGTACAGAAAAGTTGGCTCCAGAAGAGGG 1496
Query 1497 AAACAAAATTTCTCCGAAGAACGAGGAAAGTGTTGTTCCTAAAGATGCTGAAGAGGTAAT 1556
|||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 1497 GAACAAAGTTTCTCCAAAGGACGAGGAAAGTGTTGTTCCTCAAGATGCAGAAGAGGTAAT 1556
Query 1557 GAACGGTGAGAAAGACTTGAAAGAAATGATAATGAAAGATCTTGAATCAGCTTTGAAAAG 1616
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 GAACGGTGAGAGAGACTTGAAAGAAATGATAATGAAAGATCTTGAATCAGCTTTGAAAAG 1616
Query 1617 TGTAGAAATGTTGGAAGCTACTGCGTCAGAAGACGAGGAAGATCGAAAAAAGCATGGAGA 1676
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 1617 TGTAGAAATGTTGGAAACAACTGCGTCAGAAGACGAGGAAGATCGAGAAAACCATGGAGA 1676
Query 1677 CAAAGATAAATATTTTATAACACCAATGAAGGAAACAGTGCCATCATGTTCGAGAGATGT 1736
| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 CGAAGATAAATGTTTTATAACACCAATGAAGGAAGCAGCACCATCATGTTCGAGAGATGT 1736
Query 1737 GGCTGAATCTGTGGCATGTGAGTTCTTAGACATGCTAGGTATTGAACACAGCCCTTTTGG 1796
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 GGCTGAATCTGTGGCAAGTGAGTTCTTAGACATGCTAGGTATTGAACACAGCCCTTTTGG 1796
Query 1797 TCTAAGTTCTGAGAGTGAACCTGAATCCCCAAGGGAGCGCCTGTTAAGAGAGTTTGAAAT 1856
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1797 TCTAAGTTCTGAGAGTGAACCTGAGTCCCCAAGGGAGCGCTTGTTAAGAGAGTTTGAAAT 1856
Query 1857 GGAAACTCTAGCGGCAGGTTCTTTGTTTGACTTTAGTATTGAAGGTGATGATCCCCAATT 1916
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1857 GGAAACCCTAGCGGCAGGTTCTTTGTTTGACTTTAGTATTGAAGGTGATGATCCCCAAAT 1916
Query 1917 GGAATGTGATGAAAACTTTCCGAACGAGTATGAGTCGGATTTTGAAGAAGGTTTTGATCT 1976
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1917 GGAATGTGATGAAAACTTTTCTAACGAGTATGAGTCGGATTTTGAAGAAGATTTCGATCT 1976
Query 1977 GGCATCCCTTGTTCATGACATAGAAGAAGAG 2007
||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1977 GGCATCCCTCGTTCATGATATAGAAGAAGAG 2007
Score = 2728 bits (1477), Expect = 0.0
Identities = 1642/1718 (96%), Gaps = 25/1718 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2058 AGAAG-GCTTGGAAACAGAATCTCTGATGCGTGAGTGGGGTATGAATGAAAACACATTTC 2116
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2001 AGAAGAGCTTGGAAACAGAATCT-TGATGCGTGAGTGGGGTATGAATGAAAACACATTTC 2059
Query 2117 AAAACTCTCCGCCTCACAATGGTCGTGATGCGTTTCATCCAGCTGATTTTCCAGTGAAGG 2176
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 AAAACTCTCCGCCTCACAATGGTCGTGATGCATTTCATCCAGCTGATTTTCCAGTGAAGG 2119
Query 2177 AGCCATTTGATTTGCCTCCTCTTGGAGATGGCTTGGGTCCAGTTGTGCAGACAAAGAATG 2236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2120 AGCCATTTGATTTGCCTCCTCTTGGAGATGGCTTGGGTCCAGTTGTGCAGACAAAGAATG 2179
Query 2237 GAGGGTTCTTGCGATCAATGAATCCCTTACTGTTCAGGAACTCTAAAGCTGGAGGCAGCT 2296
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2180 GAGGGTTCTTGCGGTCAATGAATCCCTTACTGTTCAGGAACTCTAAAGCTGGAGGCAGCT 2239
Query 2297 TGATCATGCAAGTGTCAACTCCAGTGGTGGTGCCTGCTGAGATGGGCTCTGGTATCATGG 2356
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2240 TGATCATGCAAGTGTCAAATCCAGTGGTGGTGCCTGCTGAGATGGGCTCTGGTATCATGG 2299
Query 2357 AGATACTTCAAAAACTAGCCACTGCTGGAATTGAGAAGCTCTCGATGCAGGCAAATAAAG 2416
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2300 AGATACTTCAGAAACTAGCCACTGCTGGAATTGAGAAGCTCTCGATGCAGGCAAATAAAG 2359
Query 2417 TAATGCCTTTGGACGATATAACAGGGAAAACCATGGAAGAGGTGTTGTGGGAAACTTCAC 2476
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2360 TAATGCCTTTGGATGATGTAACAGGGAAAACCATGGAAGAGGTGTTGTGGGAAACTTCAC 2419
Query 2477 CTACAATTGACATTGGGGACAGGGATCATGTATCAGAGCGTGAATCTGGTGATGCATCTG 2536
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||
Sbjct 2420 CTACAATTGACGGTGGGGACAGGGATCATGTATCAGTGCATGAATCTGATGATGCAGCTG 2479
Query 2537 GTTTTGTGAGGGGAGGTGAAAGACGAACATCATTTGCAGCTAAGCCAAAAAAGTTTGGTT 2596
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2480 GTTTTGTGAGGGGAGCTGAAAGACGAACATCATTTGCAGCTAAGCCAAAAAAGTTTGGTT 2539
Query 2597 CAAGCTCTGGTAACAATAACTTTGACTCGGAGTATGTATCACTTGAAGATCTTGCTCCTT 2656
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2540 CAAGCTCTGGTAACAATACCTTTGACTCGGAGTATGTATCACTTGAAGATCTTGCTCCTT 2599
Query 2657 TGGCTATGGATCAGATTGAAGCACTTTCTTTGGAAGGATTGAGAATACAATCAGGAATGT 2716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2600 TGGCTATGGATCAGATTGAAGCACTTTCTTTGGAAGGATTGAGAATACAATCAGGAATGT 2659
Query 2717 CAGATGAGGATGCACCCTCGGACATCACTGCACAATCTATTGGAGATATCTCAGCCTTTC 2776
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2660 CAGATGAGGATGCACCCTCGGACATCACTGCACAATCTATTGGAGATATCTCAGCCTTCC 2719
Query 2777 AAGGGAAAAGCGGGTGCGTTGGTCTAGAAGGTGCTGCCGGTTTACAACTTCTGGACATAA 2836
| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2720 AGGGGAAAAGCGGGTGTGTTGGTCTAGAAGGTGCCGCCGGGTTACAACTTCTGGACATAA 2779
Query 2837 AAGATGATGGGGACGATGATGATGATG--G-TTTAATGGGACTCTCCTTGACTCTTGATG 2893
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2780 AAGATGATGGGGACGATGATGATGATGATGGTTTAATGGGACTCTCCTTGACGCTTGATG 2839
Query 2894 AGTGGATGAAGTTAGATTCAGGGGACATTGGCGATGAAGACGAAATAAATGAGCGAACTT 2953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2840 AGTGGATGAAGTTAGATTCAGGGGACATTGGCGATGAAGACGAAATAAATGAGCGAACTT 2899
Query 2954 CAAAAATTCTGGCTGCCCATCATGCAAACCCACTAAACTTTATCCGTaaaggatcaaaag 3013
|||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2900 CAAAAATTTTGGCTGCCCATCATGCGAACCCGCTAAACTTTATCCGTAAAGGATCAAAAG 2959
Query 3014 gggagaaaagaaagggaaaaaaaggaaggaaaTGCGGTTTACTGGGTAATACCTTCACCG 3073
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2960 GGGAGAAAAGAAAGGGAAAAAAAGGAAGGAAATGTGGTTTACTGGGGAATACCTTCACCG 3019
Query 3074 TAGCACTAATGGTGCAACTTCGAGATCCACTAAGGAACTACGAACCAGTAGGAGCTCCTA 3133
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3020 TAGCACTAATGGTGCAACTTCGAGATCCTCTAAGGAACTACGAGCCAGTAGGAGCTCCTA 3079
Query 3134 TGCTTTCTCTTATCCAAGTTGAGAGATTGTTCGTCCCTCCAAAGCCCAAAATCTACAGCA 3193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3080 TGCTTTCTCTTATCCAAGTTGAGAGATTGTTCGTCCCTCCAAAGCCCAAAATCTACAGCA 3139
Query 3194 CAGTTTCAGAGCTGAAGAAAACCGATGAAGAGGAGGAAGCGGACGCGAGTGATGCAAAGA 3253
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||
Sbjct 3140 CAGTTTCAGAGCTGAGGAAAACCGATGAAGAGGAGAAAGCTGAGGTGAGTGATGCAAAGA 3199
Query 3254 AAGAAGAGAAACCCATGGAGGAACAAGGAATACCTCAGTACAAAATCACAGAGGTACATC 3313
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3200 AAGAAGAGAAACCCATGGAGGAACAAGGAATCCCTCAGTACAAAATCTCAGAGGTACATC 3259
Query 3314 TTACCGGTATGAAGAGCGAGACAGATAAGAAGCCATGGGGAATCACGACTCAGCAGCAGC 3373
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3260 TTACCGGTATGAAGAGCGAGACCGATAAGAAACCATGGGGAATCACGACTCAGCAGCAGC 3319
Query 3374 AGGTGCAGTCTGGTTCAAGGTGGTTGATGGCTAACGGAATGGGAAAAGGGAACAACAAGC 3433
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3320 AGGTGCAATCTGGTTCAAGATGGTTGATGGCTAACGGAATGGGGAAAGGGAACAACAAGC 3379
Query 3434 TTCCTCTTATGAAACCAAAATTGGGTTCGGCAAAGCCTGGTGACAAGTTGTGGAGTGTCT 3493
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3380 TTCCTCTTATGAAACCAAAATTGGGTTTGACAAAGCCTGGTGATAAGTTGTGGAGTGTCT 3439
Query 3494 CTGGTTCTGGGTCTAAATGGAAAGAGCTTGGGAAAATGGGAAAGTCGAACACACACATTC 3553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 3440 CTGGTTCTGGGTCTAAATGGAAAGAGCTTGGGAAAATGGGAAAGTTGAACACACACGTTC 3499
Query 3554 GAAATCCGAATGTAATAATGCCAAAATGAAACTGAAGCAGTAGCATGTGTCTGCTCTGTA 3613
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3500 GAAATCCGAATGTGATAATGCCAAAATGAAACTGAAGAAGTAGCATGTGTCTGCTCTATA 3559
Query 3614 TTTTTGATGCTAAGTAAAGTTAATGTTATGTGGTGTGGTGGATTGTGTGTAGATTCACTT 3673
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||
Sbjct 3560 TTTTTGATGCTAAGTAAAGTTAATGTTATGTGGTG------A--G-----A--TTCACTT 3604
Query 3674 CAAATGTTGCATGTGGTTTATATTGTGTTTGCAGTTTTAGGTTTTGCGGATCAAACTAAT 3733
|||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 3605 CAAATGGTGCATGTGTTTTATATTGTGT----AGTTT-AGGTTTTGCGTATCAAACTAAT 3659
Query 3734 CGCTGTTTGTGGTACAGTTAAGAGATCAATGGAACAAA 3771
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3660 CGCTGTTTGTGGTACAGTTAAAAGATCAATGGAACAAA 3697
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 142944244188
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5