BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G23880.1
Length=2473
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg489246 jgi|Araly1|489246|fgenesh2_kg.6__2380__AT5G23880.1 4034 0.0
Ahg941911 jgi|Araly1|941911|scaffold_602455.1 1177 0.0
> Ahg489246 jgi|Araly1|489246|fgenesh2_kg.6__2380__AT5G23880.1
Length=2443
Score = 4034 bits (2184), Expect = 0.0
Identities = 2364/2450 (96%), Gaps = 16/2450 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GTTCATCGGAGAAATTTTAGGGTTTATATCGGCGAACGGAAAAGATGGGTACTTCGGTGC 62
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1 GTTCATCGGAGAAATTTTAGGGTTTATATCGCCGAACGGAAAAAATGGGTACTTCGGTGC 60
Query 63 AAGTGACTCCTCTCTGCGGAGTTTACAACGAGAATCCTCTCTCCTACTTAGTCTCCATTG 122
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAGTTACTCCTCTCTGCGGAGTTTACAACGAGAATCCTCTTTCCTACTTAGTCTCCATTG 120
Query 123 ATGGTTTCAACTTCCTCATCGACTGTGGTTGGAACGATCTCTTCGACACATCGCTCCTCG 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||
Sbjct 121 ATGGTTTCAACTTCCTCATCGACTGTGGTTGGAACGATCTCTTTGATACATCCCTCCTCG 180
Query 183 AACCTCTCTCCAGGGTTGCTTCTACTATAGATGCAGTTTTGCTTTCTCATCCAGATACAC 242
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 181 AACCTCTCTCCAGGGTTGCTTCTAGTATAGATGCAGTTTTGCTTTCTCATCCAGATACGC 240
Query 243 TTCA-CATTGGTGCTCTTCCTTATGCTATGAAGCAGCTTGGACTCTCCGCTCCTGTTTAT 301
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 241 TTCATC-TTGGTGCTCTTCCTTATGCTATGAAGCAGCTTGGACTCTCTGCTCCTGTTTAT 299
Query 302 GCTACTGAGCCTGTTCATAGATTAGGTCTCCTTACAATGTATGATCAGTTTTTGTCCAGG 361
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 300 GCTACTGAGCCTGTTCATAGATTAGGTCTTCTTACAATGTATGATCAGTTTTTATCCAGA 359
Query 362 AAGCAAGTATCCGACTTTGATCTGTTTACACTGGATGACATAGATTCTGCTTTCCAGAAT 421
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 360 AAGCAAGTATCCGACTTTGATTTGTTTACACTGGATGACATTGATTCTGCTTTCCAGAAT 419
Query 422 GTGATCAGATTGACTTACTCTCAAAATTACCATCTTTCTGGAAAGGGAGAGGGTATTGTA 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GTGATCAGATTGACTTACTCTCAAAATTACCATCTTTCTGGAAAGGGAGAGGGTATTGTA 479
Query 482 ATTGCTCCTCATGTTGCTGGACACATGCTGGGAGGTAGCATCTGGAGGATAACAAAGGAT 541
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 ATTGCTCCTCATGTTGCTGGACATATGCTGGGAGGTAGCATCTGGAGGATAACAAAGGAT 539
Query 542 GGGGAGGATGTTATATATGCTGTTGACTACAATCATCGGAAAGAAAGGCATTTGAATGGA 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 540 GGGGAGGATGTTATATATGCTGTTGACTACAATCATCGGAAAGAAAGGCATTTAAATGGA 599
Query 602 ACTGTTTTACAGTCTTTTGTTCGGCCTGCTGTTCTGATAACCGATGCATATCATGCTCTT 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ACTGTTTTACAGTCTTTTGTTCGGCCTGCTGTTCTGATAACCGATGCATATCATGCTCTT 659
Query 662 TATACCAATCAAACCGCAAGACAGCAAAGGGACAAAGAATTTCTAGATACCATTTCAAAA 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TATACCAATCAAACCGCAAGACAGCAAAGGGACAAAGAATTTCTAGATACCATTTCAAAA 719
Query 722 CATCTTGAAGTTGGAGGAAATGTTCTATTGCCAGTAGACACTGCGGGTCGTGTCCTGGAA 781
|||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 720 CATCTTGAAGTTGGGGGAAATGTTCTATTACCCGTGGATACTGCGGGTCGAGTCCTGGAA 779
Query 782 CTTCTCTTGATACTTGAACAGCATTGGTCACAAAGAGGTTTCAGCTTTCCCATTTATTTT 841
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 780 CTTCTCTTGATACTTGAACAGCATTGGTCACAAAGAGGTTTCAGCTTTCCCATTTACTTT 839
Query 842 CTCACGTACGTGTCATCTAGCACAATTGACTATGTTAAGAGTTTCCTCGAGTGGATGAGT 901
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CTCACATACGTGTCATCTAGCACAATTGACTATGTTAAGAGTTTCCTCGAGTGGATGAGT 899
Query 902 GACTCCATTTCAAAGTCCTTTGAGACTTCACGTGATAATGCCTTTCTATTGAGGCATGTC 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GACTCCATTTCAAAGTCCTTTGAGACTTCACGTGATAATGCCTTTCTATTGAGGCATGTC 959
Query 962 ACTCTGTTGATAAACAAGACTGATCTGGATAATGCTCCACCTGGTCCAAAGGTTGTTCTT 1021
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ACTCTCTTGATAAACAAGACTGATCTGGATAATGCTCCACCTGGTCCAAAGGTTGTTCTT 1019
Query 1022 GCTTCCATGGCTAGTCTCGAAGCCGGTTTTGCTCGAGAGATATTCGTGGAGTGGGCAAAT 1081
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GCTTCCATGGCCAGTCTCGAAGCAGGTTTTGCTCGTGAGATATTCGTGGAGTGGGCAAAT 1079
Query 1082 GATCCCAGAAATTTAGTCCTCTTTACTGAAACAGGCCAGTTTGGCACTTTAGCTCGTATG 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1080 GATCCCAGAAATTTAGTCCTCTTTACTGAAACAGGGCAGTTTGGCACTTTAGCTCGCATG 1139
Query 1142 CTTCAGTCAGCCCCACCTCCAAAATTTGTTAAAGTCACCATGTCTAAGAGGGTTCCTTTG 1201
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1140 CTTCAGTCAGCCCCACCTCCCAAATTTGTTAAAGTCACCATGTCTAAGAGGGTCCCTTTG 1199
Query 1202 GCTGGGGAAGAGTTAATTGCATATGAGGAAGAGCAAAACAGACTGAAAAGGGAAGAAGCT 1261
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GCTGGGGAAGAGTTGATTGCATATGAAGAAGAGCAAAACAGACTGAAAAGGGAAGAAGCT 1259
Query 1262 TTGCGAGCTAGCCTCGTTAAAGAGGAGGAAACAAAAGCTTCCCATGGATCCGATGATAAT 1321
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TTGCGAGCTAGCCTCGTCAAAGAGGAGGAAACAAAAGCTTCCCATGGATCCGATGATAAT 1319
Query 1322 TCAAGTGAACCTATGATCATAGATACCAAGACTACTCACGATGTTATTGGTTCTCACGGG 1381
||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1320 TCAAGTGAACCTATGGTCATAGATACGAAGACTACTCACGATGTTGTTGGTTCTCACGGG 1379
Query 1382 CCTGCATATAAAGATATATTGATTGATGGATTTGTTCCCCCATCCAGCAGCGTAGCTCCA 1441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CCTGCATATAAAGATATATTGATTGATGGATTTGTTCCCCCATCCAGCAGCGTAGCTCCA 1439
Query 1442 ATGTTCCCATATTATGATAACACATCTGAATGGGACGACTTTGGGGAGATTATTAATCCA 1501
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1440 ATGTTCCCATTTTATGATAACACATCTGAATGGGACGACTTTGGGGAGATTATAAATCCA 1499
Query 1502 GATGACTATGTGATCAAGGATGAAGACATGGACCGAGGAGCAATGCATAACGGAGGTGAT 1561
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 GATGACTACGTGATCAAGGATGAAGACATGGACCGAGGAGCAATGCATAACGGAGGTGAT 1559
Query 1562 GTGGACGGAAGGCTTGATGAGGCAACTGCTAGTCTCATGCTTGATACAAGACCTTCGAAA 1621
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 GTGGACGGGAGGCTTGATGAGGCAACTGCTAGTCTCATGCTTGATACAAGACCTTCGAAA 1619
Query 1622 GTCATGTCCAATGAGCTCATTGTGACTGTTAGTTGTTCACTTGTTAAAATGGACTATGAA 1681
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GTCATTTCCAATGAGCTCATTGTGACTGTTAGTTGTTCACTTGTTAAAATGGACTATGAA 1679
Query 1682 GGTCGGTCAGATGGCCGCTCAATCAAGTCAATGATTGCGCATGTTTCTCCT-TTAAAACT 1740
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1680 GGTCGGTCAGATGGCCGCTCAATCAAGTCTATGATTGCGCATGTTTCTCCTCTTAAA-CT 1738
Query 1741 TGTTTTGGTGCACGCGATAGCTGAGGCTACAGAGCATTTGAAGCAACACTGCTTGAACAA 1800
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 TGTTTTGGTACACGCAATAGCTGAGGCTACAGAGCATTTGAAGCAACACTGCTTGAACAA 1798
Query 1801 CATCTGTCCACACGTGTATGCTCCTCAAATAGAGGAAACGGTCGATGTGACTTCTGATTT 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1799 CATCTGTCCACACGTGTATGCTCCTCAAATAGAGGAAACTGTGGATGTGACTTCTGATTT 1858
Query 1861 ATGTGCTTACAAGGTCCAACTTTCTGAAAAGCTGATGAGCAATGTGATCTTCAAGAAGCT 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 ATGTGCTTACAAGGTCCAACTTTCTGAAAAGCTGATGAGCAATGTGATCTTCAAGAAGCT 1918
Query 1921 GGGAGATTCAGAAGTAGCTTGGGTGGATTCCGAAGTAGGGAAGACAGAGAGGGACATGAG 1980
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1919 GGGAGATTCAGAAGTAGCTTGGGTGGATTCTGAAGTAGGGAAGACAGAGAGCGACATGAG 1978
Query 1981 GTCTCTACTACCGATGCCAGGTGCTGCTTCGCCACACAAACCTGTTCTAGTAGGTGATCT 2040
||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 ATCTCTACTACCAATGCCAGGCGCAGCTTCTCCACACAAACCTGTTCTAGTAGGTGATCT 2038
Query 2041 GAAAATCGCAGACTTCAAGCAGTTTCTGTCGAGCAAGGGTGTTCAGGTAGAATTTGCAGG 2100
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GAAAATTGCAGACTTCAAGCAGTTTCTGTCAAGCAAGGGTGTTCAGGTAGAATTTGCAGG 2098
Query 2101 TGGAGGAGCTTTACGTTGTGGTGAATATGTCACTCTACGAAAGGTTGGACCGACGGGTCA 2160
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2099 TGGAGGAGCTTTACGTTGTGGAGAATATGTCACTCTACGAAAGGTTGGCCCGACTGGTCA 2158
Query 2161 AAAGGGAGGAGCATCGGGTCCACAGCAAATTCTGATAGAAGGACCGTTGTGTGAAGACTA 2220
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 AAAGGGGGGAGCATCAGGTCCACAGCAAATTCTGATAGAAGGACCGTTGTGTGAAGACTA 2218
Query 2221 TTACAAAATCAGGGATTATCTCTATTCTCAGTTCTACCTCCTCTGAGCAT--GATATAGa 2278
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2219 TTATAAAATCAGGGATTATCTCTATTCTCAGTTCTACCTCCTCTGAGCATATGATATAGA 2278
Query 2279 aaaaaaaTGAAGCTTCTTCTCATTTT--CTCAACATTTTTCAACCACTCAACATGTAATC 2336
|||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 AAAAAAC-GAAGCTTCTTCTCATTTTTTCTCAACACTTTTCAACCACTCAACATGTAATC 2337
Query 2337 TCGTATAGTTTATTGCCTTGCTTATAACCCTCAAATCTTATAGATTAATGTGTTAAAAAT 2396
|||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 TCGTATAGTT-ATTGCCTTGCTTTTAACCC-CAA-TCTTATAGATTAATGTGTTAAAAAA 2394
Query 2397 GGCAATAGCTTTTTGTAA-CTTTTTTGTACTT--GTCATCTTAGTAGAAG 2443
|||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 2395 GGCAATAGATGTTTGTAATCTTTTTTGT-CTTTTGTCATCTTAGTAGAAG 2443
> Ahg941911 jgi|Araly1|941911|scaffold_602455.1
Length=1676
Score = 1177 bits (637), Expect = 0.0
Identities = 684/706 (97%), Gaps = 6/706 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 249 TTGGTGCTCTTCCTTATGCTATGAAGCAGCTTGGACTCTCCGCTCCTGTTTATGCTACTG 308
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTGGTGCTTTTCCTTATGCTATGAAGCAGCTTGGACTCTCTGCTCCTGTTTATGCTACTG 60
Query 309 AGCCTGTTCATAGATTAGGTCTCCTTACAATGTATGATCAGTTTTTGTCCAGGAAGCAAG 368
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 61 AGCCTGTTCATAGATTAGGTCTCCTTACAATGTATGATCAGTTTTTATCCAGAAAGCAAG 120
Query 369 TATCCGACTTTGATCTGTTTACACTGGATGACATAGATTCTGCTTTCCAGAATGTGATCA 428
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TATCCGACTTTGATTTGTTTACACTGGATGACATTGATTCTGCTTTCCAGAATGTGATCA 180
Query 429 GATTGACTTACTCTCAAAATTACCATCTTTCTGGAAAGGGAGAGGGTATTGTAATTGCTC 488
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 181 GATTGACTTACTCTCAAAATTACCATCTTTCT-----GGGAGA-GGTATTGTAATTGCTC 234
Query 489 CTCATGTTGCTGGACACATGCTGGGAGGTAGCATCTGGAGGATAACAAAGGATGGGGAGG 548
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 CTCATGTTGCTGGACATATGCTGGGAGGTAGCATCTGGAGGATAACAAAGGATGGGGAGG 294
Query 549 ATGTTATATATGCTGTTGACTACAATCATCGGAAAGAAAGGCATTTGAATGGAACTGTTT 608
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 295 ATGTTATATATGCTGTTGACTACAATCATCGGAAAGAAAGGCATTTAAATGGAACTGTTT 354
Query 609 TACAGTCTTTTGTTCGGCCTGCTGTTCTGATAACCGATGCATATCATGCTCTTTATACCA 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 TACAGTCTTTTGTTCGGCCTGCTGTTCTGATAACCGATGCATATCATGCTCTTTATACCA 414
Query 669 ATCAAACCGCAAGACAGCAAAGGGACAAAGAATTTCTAGATACCATTTCAAAACATCTTG 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 ATCAAACCGCAAGACAGCAAAGGGACAAAGAATTTCTAGATACCATTTCAAAACATCTTG 474
Query 729 AAGTTGGAGGAAATGTTCTATTGCCAGTAGACACTGCGGGTCGTGTCCTGGAACTTCTCT 788
||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 475 AAGTTGGGGGAAATGTTCTATTACCCGTGGATACTGCGGGTCGAGTCCTGGAACTTCTCT 534
Query 789 TGATACTTGAACAGCATTGGTCACAAAGAGGTTTCAGCTTTCCCATTTATTTTCTCACGT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 535 TGATACTTGAACAGCATTGGTCACAAAGAGGTTTCAGCTTTCCCATTTACTTTCTCACAT 594
Query 849 ACGTGTCATCTAGCACAATTGACTATGTTAAGAGTTTCCTCGAGTGGATGAGTGACTCCA 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 ACGTGTCATCTAGCACAATTGACTATGTTAAGAGTTTCCTCGAGTGGATGAGTGACTCCA 654
Query 909 TTTCAAAGTCCTTTGAGACTTCACGTGATAATGCCTTTCTATTGAG 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TTTCAAAGTCCTTTGAGACTTCACGTGATAATGCCTTTCTATTGAG 700
Score = 1009 bits (546), Expect = 0.0
Identities = 588/609 (97%), Gaps = 0/609 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1034 AGTCTCGAAGCCGGTTTTGCTCGAGAGATATTCGTGGAGTGGGCAAATGATCCCAGAAAT 1093
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 699 AGTCTCGAAGCAGGTTTTGCTCGGGAGATATTCGTGGAGTGGGCAAATGATCCCAGAAAT 758
Query 1094 TTAGTCCTCTTTACTGAAACAGGCCAGTTTGGCACTTTAGCTCGTATGCTTCAGTCAGCC 1153
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 759 TTAGTCCTCTTTACTGAAACAGGGCAGTTTGGCACTTTAGCTCGCATGCTTCAGTCAGCC 818
Query 1154 CCACCTCCAAAATTTGTTAAAGTCACCATGTCTAAGAGGGTTCCTTTGGCTGGGGAAGAG 1213
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 CCACCTCCCAAATTTGTTAAAGTCACCATGTCAAAGAGGGTTCCTTTGGCTGGGGAAGAG 878
Query 1214 TTAATTGCATATGAGGAAGAGCAAAACAGACTGAAAAGGGAAGAAGCTTTGCGAGCTAGC 1273
|| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 TTGATTGCGTATGAAGAAGAGCAAAACAGACTGAAAAGGGAAGAAGCTTTGCGAGCTAGC 938
Query 1274 CTCGTTAAAGAGGAGGAAACAAAAGCTTCCCATGGATCCGATGATAATTCAAGTGAACCT 1333
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 939 CTCGTCAAAGAGGTGGAAACAAAAGCTTCCCATGGATCCGATGATAATTCAAGTGAACCT 998
Query 1334 ATGATCATAGATACCAAGACTACTCACGATGTTATTGGTTCTCACGGGCCTGCATATAAA 1393
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 999 ATGGTCATAGATACCAAGACTACTCACGATGTTGTTGGTTCTCACGGGCCTGCATATAAA 1058
Query 1394 GATATATTGATTGATGGATTTGTTCCCCCATCCAGCAGCGTAGCTCCAATGTTCCCATAT 1453
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1059 GATATATTGATTGATGGATTTGTTCCCCCATCTAGCAGCGTAGCTCCAATGTTCCCATTT 1118
Query 1454 TATGATAACACATCTGAATGGGACGACTTTGGGGAGATTATTAATCCAGATGACTATGTG 1513
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||
Sbjct 1119 TATGACAACACATCTGAATGGGACGACTTTGGGGAGGTTATCAATCCAGATGATTACGTG 1178
Query 1514 ATCAAGGATGAAGACATGGACCGAGGAGCAATGCATAACGGAGGTGATGTGGACGGAAGG 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 ATCAAGGATGAAGACATGGACCGAGGAGCAATGCATAACGGAGGTGATGTGGACGGAAGG 1238
Query 1574 CTTGATGAGGCAACTGCTAGTCTCATGCTTGATACAAGACCTTCGAAAGTCATGTCCAAT 1633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1239 CTTGATGAGGCAACTGCTAGTCTCATGCTTGATACAAGACCTTCGAAAGTCATTTCCAAT 1298
Query 1634 GAGCTCATT 1642
|||||||||
Sbjct 1299 GAGCTCATT 1307
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 93206829515
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5