BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G25780.1
Length=2409
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg489563 jgi|Araly1|489563|fgenesh2_kg.6__2697__AT5G25780.1 3373 0.0
Ahg489433 jgi|Araly1|489433|fgenesh2_kg.6__2567__AT5G27640.2 3014 0.0
Ahg351685 jgi|Araly1|351685|fgenesh1_pg.C_scaffold_6002278 1616 0.0
> Ahg489563 jgi|Araly1|489563|fgenesh2_kg.6__2697__AT5G25780.1
Length=2255
Score = 3373 bits (1826), Expect = 0.0
Identities = 2122/2265 (94%), Gaps = 19/2265 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 33 ctctctctctctctctATCCTCAAAGCTTCTTCTTC--C-TCGATATCGATTGAG-AGAA 88
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || || || ||| | || |
Sbjct 2 CTCTCTCTCTCTCTCTTTCCTCAAATCTTCTTCTTCTTCTTC-AT-TC-TTTG-GCAG-A 56
Query 89 ACTTCGTTCT-AAGATTCGAAATCATGGCGGCGGTTGTTGATATTGATGTC-CTAACAGC 146
|| | ||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||||| | | | ||||
Sbjct 57 TTTTTGATCTAAAGTTTTGAAATCAT---GGAGGTCGTTGATATTGATG-CTCGAGCAGC 112
Query 147 TCAGTTAGGGATTAATTGGTCAGATGTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTCCTGGA-A 205
| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 113 TAAGTTAGGGATTAATTGGTCTCAGGTTAATTTTGATTCCATCCAACTTCCTCCTGGAGA 172
Query 206 ACGACTTTGGGATCGAAAGTGATGATGAAAG-TGTTTACCAAGATGACCAGTCAGAATTC 264
| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 173 A-GACTTTGGGATTGAGAGTGATGATG-AAGCTGTTTACCACGATGACCAGTCAGAATTC 230
Query 265 GACACTGGATTCGGTAACATTATCGTTGTCGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAG 324
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 GACACTGGATTCGGTAACATTATCGTGGTTGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAG 290
Query 325 TTTGAGAAACTAGAAGGTGTTGTTAAGAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATTAAGGAA 384
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 291 TTTGAGAAACTTGAAGGTGTTGTCAAGAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATCAAGGAA 350
Query 385 AATGGACTGTTGATGCCCGTTGATCCCGATACTAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATT 444
|||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 AATGGACTGTGGATGCCCGTTGATCCCGACACCAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATT 410
Query 445 GAGTTCAACACTCCTCAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTG 504
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 GAGTTCAATACTCCTCAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTG 470
Query 505 GACAAGTCTCACATATTTGCTGTTAATATGTTCGATGATTTCGATAGGTTGATGAATGTG 564
|||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 471 GACAAGTCTCACATCTTTGCTGTAAACATGTTCGATGATTTCGACAGGTTGATGAATGTG 530
Query 565 AAGGAGGAGTGGGAGCCTCCTCAAGAAAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAATTTGCAGAAG 624
||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 531 CGGGAGGAGTGGGAGCCTCCTCAGGCCAGGCCATATGTCCCTGGGGAAAATTTACAAAAG 590
Query 625 TGGCTTACTGATGACAAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTTTGGCCATGATACTGAA 684
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 591 TGGCTTACTGATGACAAAGCCCGGGACCAGCTAGTTATTCGTTCTGGCCCTGATACTGAA 650
Query 685 GTTTACTGGAATGATGCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTTCTTATTGG 744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 651 GTTTACTGGAATGATGCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTTATTGG 710
Query 745 ACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCAATAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAG 804
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 ACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAG 770
Query 805 GGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTTACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCA 864
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 GGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTCACACGTCTCATGCGTTATCAGCATTCT 830
Query 865 ATGGTCAAACTAGTTGATTTCTCGCCTGGTGAGAAATATCTTGTAACTTACCATAGCCAA 924
||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 831 ATGGTTAAACTAGTTGATTTCTCACCAGGTGAGAAATATCTGGTAACTTACCACAGCCAA 890
Query 925 GAACCAAGCAATCCGAGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGAACC 984
||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 891 GAACCAAGCAACCCGCGGGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTTTTTGATGTGAGAACT 950
Query 985 GGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGT 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 GGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGT 1010
Query 1045 GGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGCGGAAAAGATGATAAATAC 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1011 GGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAAATAC 1070
Query 1105 TTTGCCAAGCTGAGCAAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATA 1164
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 TTTGCCAAGCTTAGCAAAAACACTATCTCCGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATA 1130
Query 1165 GACAAGAAATCCATGAAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCCACTGATTCA 1224
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1131 GACAAGAAATCCATGAAGGTTGATAATGTTGTGGATATCTGCTGGTCTCCTACTGATTCC 1190
Query 1225 ATCCTTTCATTGTTTGTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCAGCCAAGGTTGCTCTA 1284
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1191 ATCCTTTCATTGTTTGTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCCAAGGTCGCTCTA 1250
Query 1285 GTCCAAATCCCGAGTAAGGTAGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGC 1344
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 GTCCAAATCCCGAGCAAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGC 1310
Query 1345 AAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAA 1404
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1311 AAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTCAAGGTTGATCGGTACACGAAA 1370
Query 1405 ACTAAGAAGAGTACATACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCA 1464
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 ACTAAGAAGAGCACATACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCC 1430
Query 1465 ATCGAGGTTCTTGAGCTGGATAACAAGAACGATAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCC 1524
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 ATCGAGGTTCTTGAGCTGGACAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCC 1490
Query 1525 AAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCATGGTGACCAGCCAAGACCGGATGTTAGTTTCTAC 1584
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||
Sbjct 1491 AAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGACGTCAGTTTCTAC 1550
Query 1585 TCGATGAAGACTGCACAAAACACTGGAAGAGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAA 1644
|| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TCAATGAAGACCACACAAAACACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAA 1610
Query 1645 CAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAA 1704
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1611 CAAGCTAATGCCCTCTTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATAATTCTTGCTGGGTTAAAA 1670
Query 1705 GGTTTCAATGGCCAGCTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCT 1764
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 GGTTTCAATGGCCAGCTTGAGTTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCT 1730
Query 1765 GAACACTTCATGGCCACAGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCTCA 1824
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
Sbjct 1731 GAACACTTCATGGCCACTGATATCGAATGGGACCCGACTGGAAGGTACGTAGCAACCGCG 1790
Query 1825 GTGACAACAGTCCACGAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAATGGGAATATG 1884
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||
Sbjct 1791 GTGACATCAGTCCACGAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAACGGGATTGTG 1850
Query 1885 GTTTACCGGATACTGAAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGGCATCA 1944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 1851 ATTTACCGGATACTGAAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCCTGGCGTCCAAGACCGCCATCA 1910
Query 1945 TTCTTGACTGCGGAGAAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAGGAATTACAGCAAGAGG 2004
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
Sbjct 1911 TTCTTGACTGCAGAGAAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAG 1970
Query 2005 TATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCGTTGCTATTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGG 2064
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 TATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGG 2030
Query 2065 AGGGCATTGAATGAAGAGTGGCAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAG 2124
| |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2031 AAGGCATTAAAGGAAGAATGGGAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGGCTCTGCATGAAGAG 2090
Query 2125 GAGAAACTCGTGAGGCAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAG 2184
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2091 GAGAAACTCGCGAGGCAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAG 2150
Query 2185 TATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTTACTGAGGAAATTGTTCAA 2244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2151 TATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAG 2210
Query 2245 GAGTTGATGTAAGTTTCTCGGTCTCTTTTGTTACCCTCTCTTAGT 2289
|||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2211 GAGTCGATGTAAGATACTCTGTCTCTTTTGTTGCCCTCTCTGAGT 2255
> Ahg489433 jgi|Araly1|489433|fgenesh2_kg.6__2567__AT5G27640.2
Length=2322
Score = 3014 bits (1632), Expect = 0.0
Identities = 1762/1827 (96%), Gaps = 0/1827 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 460 CAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTGGACAAGTCTCACATA 519
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 496 CAGGAAGCACAAAATGCTAAGGAAAAGTCGCATGGCTACAAGTTGGACAAGACTCACATC 555
Query 520 TTTGCTGTTAATATGTTCGATGATTTCGATAGGTTGATGAATGTGAAGGAGGAGTGGGAG 579
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 556 TTTGCTGTTAACATGTTTGATGATTTCGATAGGTTGATGAATGTGAGGGAGGAGTGGGAG 615
Query 580 CCTCCTCAAGAAAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAATTTGCAGAAGTGGCTTACTGATGAC 639
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 616 CCTCCTCAGGCCAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAATTTGCAGAAGTGGCTTACCGATGAA 675
Query 640 AAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTTTGGCCATGATACTGAAGTTTACTGGAATGAT 699
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 676 AAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTCAGGCCCTGATACTGAGGTTTACTGGAATGAT 735
Query 700 GCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTTCTTATTGGACAGAGAGTTATGTG 759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 GCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTTATTGGACAGAGAGTTATGTG 795
Query 760 CAGTGGTCTCCAATAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGG 819
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 CAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGG 855
Query 820 GGTGGTGCTGATACATTTACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCAATGGTCAAACTAGTT 879
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 856 GGTGGTGCTGATACATTCACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCTATGGTCAAACTAGTT 915
Query 880 GATTTCTCGCCTGGTGAGAAATATCTTGTAACTTACCATAGCCAAGAACCAAGCAATCCG 939
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 GATTTCTCGCCAGGTGAGAGATATCTTGTAACTTACCATAGCCAAGAACCAAGCAATCCG 975
Query 940 AGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGAACCGGGAGGATGATGAGA 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 976 AGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGAACCGGGAGGATGATGAGA 1035
Query 1000 GATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCC 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCC 1095
Query 1060 TCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGCGGAAAAGATGATAAATACTTTGCCAAGCTGAGC 1119
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1096 TCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAAATACTTTGCCAAGCTTAGC 1155
Query 1120 AAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATAGACAAGAAATCCATG 1179
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 AAAAACACCATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATAGACAAGAAATCCATG 1215
Query 1180 AAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCCACTGATTCAATCCTTTCATTGTTT 1239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1216 AAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCCACTGATTCTATCCTTTCATTGTTT 1275
Query 1240 GTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCAGCCAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGT 1299
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276 GTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCCAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGT 1335
Query 1300 AAGGTAGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAG 1359
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336 AAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAG 1395
Query 1360 AGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGTACA 1419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1396 AGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGCACA 1455
Query 1420 TACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCAATCGAGGTTCTTGAG 1479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1456 TACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCCATCGAGGTTCTTGAG 1515
Query 1480 CTGGATAACAAGAACGATAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTT 1539
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 CTGGATAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTCGCTTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTT 1575
Query 1540 GCTGTGATTCATGGTGACCAGCCAAGACCGGATGTTAGTTTCTACTCGATGAAGACTGCA 1599
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1576 GCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGATGTCAGTTTCTACTCGATGAAGACCGCA 1635
Query 1600 CAAAACACTGGAAGAGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTC 1659
||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1636 CAAAATACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACGTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTC 1695
Query 1660 TTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAG 1719
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696 TTCTGGTCGCCCACAGGAAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAG 1755
Query 1720 CTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCC 1779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1756 CTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCC 1815
Query 1780 ACAGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCTCAGTGACAACAGTCCAC 1839
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1816 ACGGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCGCAGTGACATCAGTCCAC 1875
Query 1840 GAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAATGGGAATATGGTTTACCGGATACTG 1899
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1876 GAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAACGGGAATTTGGTTTACCGGATACTG 1935
Query 1900 AAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGGCATCATTCTTGACTGCGGAG 1959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||
Sbjct 1936 AAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGCCATCATTCTTAACTGCAGAG 1995
Query 1960 AAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAGGAATTACAGCAAGAGGTATGAGGCAGAGGAT 2019
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1996 AAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAGTATGAGGCAGAGGAT 2055
Query 2020 CAGGACGTGTCGTTGCTATTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGGAGGGCATTGAATGAA 2079
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2056 CAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGAAGGGCATTGAAGGAA 2115
Query 2080 GAGTGGCAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGTGAGG 2139
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2116 GAATGGGAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGCGAGG 2175
Query 2140 CAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAGTATGAAGCCAAAGAA 2199
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2176 CAAAATCTTCGAGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAATATGAAGCCAAGGAA 2235
Query 2200 GTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTTACTGAGGAAATTGTTCAAGAGTTGATGTAAGTT 2259
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 2236 GTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAAGAGTCGATGTAAGTT 2295
Query 2260 TCTCGGTCTCTTTTGTTACCCTCTCTT 2286
|||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2296 TCTCGGTCTCTTTTGTTACCATCTCTT 2322
Score = 503 bits (272), Expect = 3e-141
Identities = 327/354 (92%), Gaps = 2/354 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 112 ATGGCGGCGGTTGTTGATATTGATGTCCTAACAGCTCAGTTAGGGATTAATTGGTCAGAT 171
||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||
Sbjct 73 ATGGCGGCGGTAGTTGATATTGATGCCCTATCGGCTCAATTAGGGGTTAATTGGTCTGAG 132
Query 172 GTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTCCTGGAAACGACTTTGGGATCGAAAGTGATGAT 231
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 133 GTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTTCTGGAAACAACTTTGGGATCGAGAGTGATGAT 192
Query 232 GAAAG-TGTTTACCAAGATGACCAGTCAGAATTCGACACTGGATTCGGTAACATTATCGT 290
| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 193 G-AAGCTGTATACCATGATGATCAGTCGGAATTCGACACTGGATTTGGTAACATTATCGT 251
Query 291 TGTCGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTGAGAAACTAGAAGGTGTTGTTAA 350
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 252 GGTTGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTGAGAAACTAGAAGGTGTTCTCAA 311
Query 351 GAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATTAAGGAAAATGGACTGTTGATGCCCGTTGATCC 410
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 312 GAAAATTTACAATCAGTTAGGTGTTATTAAGGAAAATGGACTGTGGATGCCCGTTGATCC 371
Query 411 CGATACTAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGTTCAACACTCCTCAGGA 464
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 372 CGATACGAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGTTCAATACTCCTCAGGA 425
> Ahg351685 jgi|Araly1|351685|fgenesh1_pg.C_scaffold_6002278
Length=3744
Score = 1616 bits (875), Expect = 0.0
Identities = 959/1001 (96%), Gaps = 0/1001 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1252 GGTGGTGGAAACCAACCAGCCAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGTAAGGTAGAGCTG 1311
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 919 GGTGGTGGAAACCAACCTGCTAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGCAAGGTGGAGCTG 978
Query 1312 AGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAG 1371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 AGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAG 1038
Query 1372 TATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGTACATACTCTGGATTT 1431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1039 TATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGCACATACTCTGGATTT 1098
Query 1432 GAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCAATCGAGGTTCTTGAGCTGGATAACAAG 1491
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 GAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCCATCGAGGTTCTTGAGCTGGATAACAAG 1158
Query 1492 AACGATAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCAT 1551
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 AACGACAAGATCATTGCTTTCGCTTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCAT 1218
Query 1552 GGTGACCAGCCAAGACCGGATGTTAGTTTCTACTCGATGAAGACTGCACAAAACACTGGA 1611
|||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1219 GGTGACCAACCAAGACCAGATGTCAGTTTCTACTCGATGAAGACCGCACAAAATACTGGA 1278
Query 1612 AGAGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCGCCC 1671
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279 AGGGTTTCAAAGCTCGCAACGTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCGCCC 1338
Query 1672 ACAGGCAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAGCTTGAATTTTTC 1731
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 ACAGGAAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAGCTTGAATTTTTC 1398
Query 1732 AACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCCACAGATATCGAA 1791
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1399 AACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCAACATCTGAACACTTCATGGCCACGGATATCGAA 1458
Query 1792 TGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCTCAGTGACAACAGTCCACGAGATGGAGAAT 1851
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 1459 TGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCGCAGTGACATCAGTTCACGAGATGGAGAAT 1518
Query 1852 GGGTTCACCATATGGTCTTTCAATGGGAATATGGTTTACCGGATACTGAAGGATCATTTC 1911
||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1519 GGGTTCACCATGTGGTCTTTCAACGGGAATTTGGTTTACCGGATACTGAAGGATCATTTC 1578
Query 1912 TTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGGCATCATTCTTGACTGCGGAGAAGGAAGAAGAG 1971
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 1579 TTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGCCATCATTCTTAACTGCAGAGAAGGAAGAAGAG 1638
Query 1972 ATAGCAAAGAACCTGAGGAATTACAGCAAGAGGTATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCG 2031
|||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1639 ATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAGTATGAGGCAGAGGATCAGGACGTATCG 1698
Query 2032 TTGCTATTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGGAGGGCATTGAATGAAGAGTGGCAGAAA 2091
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||
Sbjct 1699 TTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGGAGGGCATTGAAGGAAGAATGGGAGAAA 1758
Query 2092 TGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGTGAGGCAAAATCTTCGG 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 1759 TGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGCGAGAAAAAATCTTCGG 1818
Query 2152 GATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAGTATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAG 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1819 GATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAGTATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAG 1878
Query 2212 GATCTTATTGATGTTACTGAGGAAATTGTTCAAGAGTTGAT 2252
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 1879 GATCTTATTGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAAGAGTCGAT 1919
Score = 732 bits (396), Expect = 0.0
Identities = 427/442 (97%), Gaps = 1/442 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 742 TGGACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCAATAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAG 801
||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TGG-CAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAG 537
Query 802 CAGGGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTTACGCGTCTCATGCGTTATCAGCAT 861
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 CAGGGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTACTGATACATTCACGCGTCTCATGCGTTATCAGCAT 597
Query 862 TCAATGGTCAAACTAGTTGATTTCTCGCCTGGTGAGAAATATCTTGTAACTTACCATAGC 921
|| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 TCTATGGTCAAACTTGTTGATTTCTCGCCAGGTGAGAGATATCTTGTAACTTACCATAGC 657
Query 922 CAAGAACCAAGCAATCCGAGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGA 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 CAAGAACCAAGCAATCCGAGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGA 717
Query 982 ACCGGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCT 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 ACCGGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCT 777
Query 1042 GGTGGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGCGGAAAAGATGATAAA 1101
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 778 GGTGGTGTTGCTGGCGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAGA 837
Query 1102 TACTTTGCCAAGCTGAGCAAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTA 1161
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 TACTTTGCCAAGCTTAGCAAAAACACCATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTA 897
Query 1162 ATAGACAAGAAATCCATGAAGG 1183
|||||||||| |||||||||||
Sbjct 898 ATAGACAAGACATCCATGAAGG 919
Score = 137 bits (74), Expect = 3e-31
Identities = 82/86 (95%), Gaps = 0/86 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 654 GCTAGTCATTCGTTTTGGCCATGATACTGAAGTTTACTGGAATGATGCTAGGCAGAAGAA 713
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 351 GCTAGTCATTCGTTCTGGCCCTGATACTGAAGTTTACTGGAATGATGCAAGGCAGAAGAA 410
Query 714 GCCTGAACCTGTTCATAAGCGTTCTT 739
|||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 411 GCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTT 436
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 90769053835
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5