BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G25780.1 Length=2409 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg489563 jgi|Araly1|489563|fgenesh2_kg.6__2697__AT5G25780.1 3373 0.0 Ahg489433 jgi|Araly1|489433|fgenesh2_kg.6__2567__AT5G27640.2 3014 0.0 Ahg351685 jgi|Araly1|351685|fgenesh1_pg.C_scaffold_6002278 1616 0.0 > Ahg489563 jgi|Araly1|489563|fgenesh2_kg.6__2697__AT5G25780.1 Length=2255 Score = 3373 bits (1826), Expect = 0.0 Identities = 2122/2265 (94%), Gaps = 19/2265 (1%) Strand=Plus/Plus Query 33 ctctctctctctctctATCCTCAAAGCTTCTTCTTC--C-TCGATATCGATTGAG-AGAA 88 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || || || ||| | || | Sbjct 2 CTCTCTCTCTCTCTCTTTCCTCAAATCTTCTTCTTCTTCTTC-AT-TC-TTTG-GCAG-A 56 Query 89 ACTTCGTTCT-AAGATTCGAAATCATGGCGGCGGTTGTTGATATTGATGTC-CTAACAGC 146 || | ||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||||| | | | |||| Sbjct 57 TTTTTGATCTAAAGTTTTGAAATCAT---GGAGGTCGTTGATATTGATG-CTCGAGCAGC 112 Query 147 TCAGTTAGGGATTAATTGGTCAGATGTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTCCTGGA-A 205 | ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 113 TAAGTTAGGGATTAATTGGTCTCAGGTTAATTTTGATTCCATCCAACTTCCTCCTGGAGA 172 Query 206 ACGACTTTGGGATCGAAAGTGATGATGAAAG-TGTTTACCAAGATGACCAGTCAGAATTC 264 | ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 173 A-GACTTTGGGATTGAGAGTGATGATG-AAGCTGTTTACCACGATGACCAGTCAGAATTC 230 Query 265 GACACTGGATTCGGTAACATTATCGTTGTCGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAG 324 |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 231 GACACTGGATTCGGTAACATTATCGTGGTTGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAG 290 Query 325 TTTGAGAAACTAGAAGGTGTTGTTAAGAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATTAAGGAA 384 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 291 TTTGAGAAACTTGAAGGTGTTGTCAAGAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATCAAGGAA 350 Query 385 AATGGACTGTTGATGCCCGTTGATCCCGATACTAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATT 444 |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 351 AATGGACTGTGGATGCCCGTTGATCCCGACACCAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATT 410 Query 445 GAGTTCAACACTCCTCAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTG 504 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 411 GAGTTCAATACTCCTCAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTG 470 Query 505 GACAAGTCTCACATATTTGCTGTTAATATGTTCGATGATTTCGATAGGTTGATGAATGTG 564 |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 471 GACAAGTCTCACATCTTTGCTGTAAACATGTTCGATGATTTCGACAGGTTGATGAATGTG 530 Query 565 AAGGAGGAGTGGGAGCCTCCTCAAGAAAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAATTTGCAGAAG 624 ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 531 CGGGAGGAGTGGGAGCCTCCTCAGGCCAGGCCATATGTCCCTGGGGAAAATTTACAAAAG 590 Query 625 TGGCTTACTGATGACAAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTTTGGCCATGATACTGAA 684 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 591 TGGCTTACTGATGACAAAGCCCGGGACCAGCTAGTTATTCGTTCTGGCCCTGATACTGAA 650 Query 685 GTTTACTGGAATGATGCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTTCTTATTGG 744 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 651 GTTTACTGGAATGATGCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTTATTGG 710 Query 745 ACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCAATAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAG 804 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 711 ACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAG 770 Query 805 GGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTTACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCA 864 |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 771 GGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTCACACGTCTCATGCGTTATCAGCATTCT 830 Query 865 ATGGTCAAACTAGTTGATTTCTCGCCTGGTGAGAAATATCTTGTAACTTACCATAGCCAA 924 ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 831 ATGGTTAAACTAGTTGATTTCTCACCAGGTGAGAAATATCTGGTAACTTACCACAGCCAA 890 Query 925 GAACCAAGCAATCCGAGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGAACC 984 ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 891 GAACCAAGCAACCCGCGGGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTTTTTGATGTGAGAACT 950 Query 985 GGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGT 1044 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 951 GGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGT 1010 Query 1045 GGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGCGGAAAAGATGATAAATAC 1104 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1011 GGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAAATAC 1070 Query 1105 TTTGCCAAGCTGAGCAAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATA 1164 ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1071 TTTGCCAAGCTTAGCAAAAACACTATCTCCGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATA 1130 Query 1165 GACAAGAAATCCATGAAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCCACTGATTCA 1224 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 1131 GACAAGAAATCCATGAAGGTTGATAATGTTGTGGATATCTGCTGGTCTCCTACTGATTCC 1190 Query 1225 ATCCTTTCATTGTTTGTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCAGCCAAGGTTGCTCTA 1284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 1191 ATCCTTTCATTGTTTGTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCCAAGGTCGCTCTA 1250 Query 1285 GTCCAAATCCCGAGTAAGGTAGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGC 1344 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1251 GTCCAAATCCCGAGCAAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGC 1310 Query 1345 AAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAA 1404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1311 AAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTCAAGGTTGATCGGTACACGAAA 1370 Query 1405 ACTAAGAAGAGTACATACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCA 1464 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1371 ACTAAGAAGAGCACATACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCC 1430 Query 1465 ATCGAGGTTCTTGAGCTGGATAACAAGAACGATAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCC 1524 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1431 ATCGAGGTTCTTGAGCTGGACAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCC 1490 Query 1525 AAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCATGGTGACCAGCCAAGACCGGATGTTAGTTTCTAC 1584 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| Sbjct 1491 AAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGACGTCAGTTTCTAC 1550 Query 1585 TCGATGAAGACTGCACAAAACACTGGAAGAGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAA 1644 || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1551 TCAATGAAGACCACACAAAACACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAA 1610 Query 1645 CAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAA 1704 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1611 CAAGCTAATGCCCTCTTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATAATTCTTGCTGGGTTAAAA 1670 Query 1705 GGTTTCAATGGCCAGCTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCT 1764 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1671 GGTTTCAATGGCCAGCTTGAGTTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCT 1730 Query 1765 GAACACTTCATGGCCACAGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCTCA 1824 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | Sbjct 1731 GAACACTTCATGGCCACTGATATCGAATGGGACCCGACTGGAAGGTACGTAGCAACCGCG 1790 Query 1825 GTGACAACAGTCCACGAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAATGGGAATATG 1884 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || Sbjct 1791 GTGACATCAGTCCACGAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAACGGGATTGTG 1850 Query 1885 GTTTACCGGATACTGAAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGGCATCA 1944 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct 1851 ATTTACCGGATACTGAAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCCTGGCGTCCAAGACCGCCATCA 1910 Query 1945 TTCTTGACTGCGGAGAAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAGGAATTACAGCAAGAGG 2004 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | Sbjct 1911 TTCTTGACTGCAGAGAAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAG 1970 Query 2005 TATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCGTTGCTATTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGG 2064 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1971 TATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGG 2030 Query 2065 AGGGCATTGAATGAAGAGTGGCAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAG 2124 | |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2031 AAGGCATTAAAGGAAGAATGGGAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGGCTCTGCATGAAGAG 2090 Query 2125 GAGAAACTCGTGAGGCAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAG 2184 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2091 GAGAAACTCGCGAGGCAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAG 2150 Query 2185 TATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTTACTGAGGAAATTGTTCAA 2244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 2151 TATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAG 2210 Query 2245 GAGTTGATGTAAGTTTCTCGGTCTCTTTTGTTACCCTCTCTTAGT 2289 |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 2211 GAGTCGATGTAAGATACTCTGTCTCTTTTGTTGCCCTCTCTGAGT 2255 > Ahg489433 jgi|Araly1|489433|fgenesh2_kg.6__2567__AT5G27640.2 Length=2322 Score = 3014 bits (1632), Expect = 0.0 Identities = 1762/1827 (96%), Gaps = 0/1827 (0%) Strand=Plus/Plus Query 460 CAGGAAGCACAAAACGCTAAGGAAAAGTCTCATGGCTACAAGTTGGACAAGTCTCACATA 519 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 496 CAGGAAGCACAAAATGCTAAGGAAAAGTCGCATGGCTACAAGTTGGACAAGACTCACATC 555 Query 520 TTTGCTGTTAATATGTTCGATGATTTCGATAGGTTGATGAATGTGAAGGAGGAGTGGGAG 579 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 556 TTTGCTGTTAACATGTTTGATGATTTCGATAGGTTGATGAATGTGAGGGAGGAGTGGGAG 615 Query 580 CCTCCTCAAGAAAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAATTTGCAGAAGTGGCTTACTGATGAC 639 |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 616 CCTCCTCAGGCCAGGCCCTATGTCCCTGGGGAAAATTTGCAGAAGTGGCTTACCGATGAA 675 Query 640 AAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTTTGGCCATGATACTGAAGTTTACTGGAATGAT 699 |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 676 AAAGCCCGGGACCAGCTAGTCATTCGTTCAGGCCCTGATACTGAGGTTTACTGGAATGAT 735 Query 700 GCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTTCTTATTGGACAGAGAGTTATGTG 759 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 736 GCTAGGCAGAAGAAGCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTTATTGGACAGAGAGTTATGTG 795 Query 760 CAGTGGTCTCCAATAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGG 819 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 796 CAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAGCAGGGGGCAGCTGTTTGG 855 Query 820 GGTGGTGCTGATACATTTACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCAATGGTCAAACTAGTT 879 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 856 GGTGGTGCTGATACATTCACGCGTCTCATGCGTTATCAGCATTCTATGGTCAAACTAGTT 915 Query 880 GATTTCTCGCCTGGTGAGAAATATCTTGTAACTTACCATAGCCAAGAACCAAGCAATCCG 939 ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 916 GATTTCTCGCCAGGTGAGAGATATCTTGTAACTTACCATAGCCAAGAACCAAGCAATCCG 975 Query 940 AGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGAACCGGGAGGATGATGAGA 999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 976 AGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGAACCGGGAGGATGATGAGA 1035 Query 1000 GATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCC 1059 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1036 GATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCTGGTGGTGTTGCTGGTGCC 1095 Query 1060 TCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGCGGAAAAGATGATAAATACTTTGCCAAGCTGAGC 1119 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1096 TCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAAATACTTTGCCAAGCTTAGC 1155 Query 1120 AAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATAGACAAGAAATCCATG 1179 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1156 AAAAACACCATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTAATAGACAAGAAATCCATG 1215 Query 1180 AAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCCACTGATTCAATCCTTTCATTGTTT 1239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1216 AAGGTTGATAATGTTGTGGATATTTGCTGGTCTCCCACTGATTCTATCCTTTCATTGTTT 1275 Query 1240 GTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCAGCCAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGT 1299 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1276 GTTCCTGAACAAGGTGGTGGAAACCAACCTGCCAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGT 1335 Query 1300 AAGGTAGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAG 1359 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1336 AAGGTGGAGCTGAGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAG 1395 Query 1360 AGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGTACA 1419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1396 AGTAGTGGAGAGTATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGCACA 1455 Query 1420 TACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCAATCGAGGTTCTTGAG 1479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1456 TACTCTGGATTTGAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCCATCGAGGTTCTTGAG 1515 Query 1480 CTGGATAACAAGAACGATAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTT 1539 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1516 CTGGATAACAAGAACGACAAGATCATTGCTTTCGCTTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTT 1575 Query 1540 GCTGTGATTCATGGTGACCAGCCAAGACCGGATGTTAGTTTCTACTCGATGAAGACTGCA 1599 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1576 GCTGTGATTCATGGTGACCAACCAAGACCAGATGTCAGTTTCTACTCGATGAAGACCGCA 1635 Query 1600 CAAAACACTGGAAGAGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTC 1659 ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1636 CAAAATACTGGAAGGGTTTCAAAGCTCGCAACGTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTC 1695 Query 1660 TTCTGGTCGCCCACAGGCAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAG 1719 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1696 TTCTGGTCGCCCACAGGAAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAG 1755 Query 1720 CTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCC 1779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1756 CTTGAATTTTTCAACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCC 1815 Query 1780 ACAGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCTCAGTGACAACAGTCCAC 1839 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 1816 ACGGATATCGAATGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCGCAGTGACATCAGTCCAC 1875 Query 1840 GAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAATGGGAATATGGTTTACCGGATACTG 1899 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1876 GAGATGGAGAATGGGTTCACCATATGGTCTTTCAACGGGAATTTGGTTTACCGGATACTG 1935 Query 1900 AAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGGCATCATTCTTGACTGCGGAG 1959 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| Sbjct 1936 AAGGATCATTTCTTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGCCATCATTCTTAACTGCAGAG 1995 Query 1960 AAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAGGAATTACAGCAAGAGGTATGAGGCAGAGGAT 2019 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1996 AAGGAAGAAGAGATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAGTATGAGGCAGAGGAT 2055 Query 2020 CAGGACGTGTCGTTGCTATTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGGAGGGCATTGAATGAA 2079 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 2056 CAGGACGTGTCGTTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGAAGGGCATTGAAGGAA 2115 Query 2080 GAGTGGCAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGTGAGG 2139 || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2116 GAATGGGAGAAATGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGCGAGG 2175 Query 2140 CAAAATCTTCGGGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAGTATGAAGCCAAAGAA 2199 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 2176 CAAAATCTTCGAGATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAATATGAAGCCAAGGAA 2235 Query 2200 GTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTTACTGAGGAAATTGTTCAAGAGTTGATGTAAGTT 2259 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| Sbjct 2236 GTTGAGTTTGAGGATCTTATTGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAAGAGTCGATGTAAGTT 2295 Query 2260 TCTCGGTCTCTTTTGTTACCCTCTCTT 2286 |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2296 TCTCGGTCTCTTTTGTTACCATCTCTT 2322 Score = 503 bits (272), Expect = 3e-141 Identities = 327/354 (92%), Gaps = 2/354 (1%) Strand=Plus/Plus Query 112 ATGGCGGCGGTTGTTGATATTGATGTCCTAACAGCTCAGTTAGGGATTAATTGGTCAGAT 171 ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| || Sbjct 73 ATGGCGGCGGTAGTTGATATTGATGCCCTATCGGCTCAATTAGGGGTTAATTGGTCTGAG 132 Query 172 GTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTCCTGGAAACGACTTTGGGATCGAAAGTGATGAT 231 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct 133 GTTAATCTCGATTCAATCCAACTTCCTTCTGGAAACAACTTTGGGATCGAGAGTGATGAT 192 Query 232 GAAAG-TGTTTACCAAGATGACCAGTCAGAATTCGACACTGGATTCGGTAACATTATCGT 290 | ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 193 G-AAGCTGTATACCATGATGATCAGTCGGAATTCGACACTGGATTTGGTAACATTATCGT 251 Query 291 TGTCGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTGAGAAACTAGAAGGTGTTGTTAA 350 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct 252 GGTTGATCACCTCCCTGTTGTTCCCAAGGAGAAGTTTGAGAAACTAGAAGGTGTTCTCAA 311 Query 351 GAAAATTTACAACCAGTTAGGTGTGATTAAGGAAAATGGACTGTTGATGCCCGTTGATCC 410 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 312 GAAAATTTACAATCAGTTAGGTGTTATTAAGGAAAATGGACTGTGGATGCCCGTTGATCC 371 Query 411 CGATACTAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGTTCAACACTCCTCAGGA 464 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 372 CGATACGAAGATGACATTGGGCTACTGTTTTATTGAGTTCAATACTCCTCAGGA 425 > Ahg351685 jgi|Araly1|351685|fgenesh1_pg.C_scaffold_6002278 Length=3744 Score = 1616 bits (875), Expect = 0.0 Identities = 959/1001 (96%), Gaps = 0/1001 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1252 GGTGGTGGAAACCAACCAGCCAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGTAAGGTAGAGCTG 1311 ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 919 GGTGGTGGAAACCAACCTGCTAAGGTTGCTCTAGTCCAAATCCCGAGCAAGGTGGAGCTG 978 Query 1312 AGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAG 1371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 979 AGGCAGAAGAATCTCTTCAGTGTGAGCGACTGCAAGATGTACTGGCAGAGTAGTGGAGAG 1038 Query 1372 TATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGTACATACTCTGGATTT 1431 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1039 TATCTTGCTGTTAAGGTTGATCGATACACAAAAACTAAGAAGAGCACATACTCTGGATTT 1098 Query 1432 GAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCAATCGAGGTTCTTGAGCTGGATAACAAG 1491 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1099 GAGCTTTTCCGTATCAAAGAAAGGGATATTCCCATCGAGGTTCTTGAGCTGGATAACAAG 1158 Query 1492 AACGATAAGATCATTGCTTTCGCGTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCAT 1551 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1159 AACGACAAGATCATTGCTTTCGCTTGGGAGCCCAAGGGTCACAGGTTTGCTGTGATTCAT 1218 Query 1552 GGTGACCAGCCAAGACCGGATGTTAGTTTCTACTCGATGAAGACTGCACAAAACACTGGA 1611 |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 1219 GGTGACCAACCAAGACCAGATGTCAGTTTCTACTCGATGAAGACCGCACAAAATACTGGA 1278 Query 1612 AGAGTTTCAAAGCTCGCAACTTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCGCCC 1671 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1279 AGGGTTTCAAAGCTCGCAACGTTGAAGGCCAAACAAGCCAATGCCCTCTTCTGGTCGCCC 1338 Query 1672 ACAGGCAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAGCTTGAATTTTTC 1731 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1339 ACAGGAAAGTACATCATTCTTGCTGGGTTAAAAGGTTTCAATGGCCAGCTTGAATTTTTC 1398 Query 1732 AACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCCACAGCTGAACACTTCATGGCCACAGATATCGAA 1791 |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1399 AACGTGGATGAGCTCGAGACAATGGCAACATCTGAACACTTCATGGCCACGGATATCGAA 1458 Query 1792 TGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCTCAGTGACAACAGTCCACGAGATGGAGAAT 1851 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 1459 TGGGACCCAACTGGAAGGTACGTTGCAACCGCAGTGACATCAGTTCACGAGATGGAGAAT 1518 Query 1852 GGGTTCACCATATGGTCTTTCAATGGGAATATGGTTTACCGGATACTGAAGGATCATTTC 1911 ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1519 GGGTTCACCATGTGGTCTTTCAACGGGAATTTGGTTTACCGGATACTGAAGGATCATTTC 1578 Query 1912 TTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGGCATCATTCTTGACTGCGGAGAAGGAAGAAGAG 1971 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 1579 TTCCAGTTGGCTTGGCGTCCAAGACCGCCATCATTCTTAACTGCAGAGAAGGAAGAAGAG 1638 Query 1972 ATAGCAAAGAACCTGAGGAATTACAGCAAGAGGTATGAGGCAGAGGATCAGGACGTGTCG 2031 |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1639 ATAGCAAAGAACCTGAAGAAGTACAGCAAGAAGTATGAGGCAGAGGATCAGGACGTATCG 1698 Query 2032 TTGCTATTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGGAGGGCATTGAATGAAGAGTGGCAGAAA 2091 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| Sbjct 1699 TTGCTGTTGAGTGAACAAGACAGAGAGAAGAGGAGGGCATTGAAGGAAGAATGGGAGAAA 1758 Query 2092 TGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGTGAGGCAAAATCTTCGG 2151 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 1759 TGGGTGATGCAGTGGAAGTCTCTGCATGAAGAGGAGAAACTCGCGAGAAAAAATCTTCGG 1818 Query 2152 GATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAGTATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAG 2211 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1819 GATGGTGAAGTTAGTGATGTGGAAGAAGATGAGTATGAAGCCAAAGAAGTTGAGTTTGAG 1878 Query 2212 GATCTTATTGATGTTACTGAGGAAATTGTTCAAGAGTTGAT 2252 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| Sbjct 1879 GATCTTATTGATGTCACTGAGGAAATCGTTCAAGAGTCGAT 1919 Score = 732 bits (396), Expect = 0.0 Identities = 427/442 (97%), Gaps = 1/442 (0%) Strand=Plus/Plus Query 742 TGGACAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCAATAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAG 801 ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 TGG-CAGAGAGTTATGTGCAGTGGTCTCCTTTAGGTACATACCTTGTGACACTTCACAAG 537 Query 802 CAGGGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTGCTGATACATTTACGCGTCTCATGCGTTATCAGCAT 861 |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 CAGGGGGCAGCTGTTTGGGGTGGTACTGATACATTCACGCGTCTCATGCGTTATCAGCAT 597 Query 862 TCAATGGTCAAACTAGTTGATTTCTCGCCTGGTGAGAAATATCTTGTAACTTACCATAGC 921 || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 598 TCTATGGTCAAACTTGTTGATTTCTCGCCAGGTGAGAGATATCTTGTAACTTACCATAGC 657 Query 922 CAAGAACCAAGCAATCCGAGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGA 981 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 CAAGAACCAAGCAATCCGAGAGATGCAAGTAAAGTAGAGATTAAGGTCTTTGATGTGAGA 717 Query 982 ACCGGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCT 1041 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 ACCGGGAGGATGATGAGAGATTTCAAGGGTAGTGCTGATGAGTTTTCAATTGGAGGACCT 777 Query 1042 GGTGGTGTTGCTGGTGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGCGGAAAAGATGATAAA 1101 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct 778 GGTGGTGTTGCTGGCGCCTCTTGGCCTGTTTTCAGATGGGCTGGTGGAAAAGATGATAGA 837 Query 1102 TACTTTGCCAAGCTGAGCAAAAACACTATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTA 1161 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 TACTTTGCCAAGCTTAGCAAAAACACCATCTCTGTCTATGAGACTGAGACTTTCAGCCTA 897 Query 1162 ATAGACAAGAAATCCATGAAGG 1183 |||||||||| ||||||||||| Sbjct 898 ATAGACAAGACATCCATGAAGG 919 Score = 137 bits (74), Expect = 3e-31 Identities = 82/86 (95%), Gaps = 0/86 (0%) Strand=Plus/Plus Query 654 GCTAGTCATTCGTTTTGGCCATGATACTGAAGTTTACTGGAATGATGCTAGGCAGAAGAA 713 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 351 GCTAGTCATTCGTTCTGGCCCTGATACTGAAGTTTACTGGAATGATGCAAGGCAGAAGAA 410 Query 714 GCCTGAACCTGTTCATAAGCGTTCTT 739 |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 411 GCCTGAACCTGTTCATAAGCGTCCTT 436 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 90769053835 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5