BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G26570.1
Length=3794
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg489476 jgi|Araly1|489476|fgenesh2_kg.6__2610__AT5G26570.1 6008 0.0
> Ahg489476 jgi|Araly1|489476|fgenesh2_kg.6__2610__AT5G26570.1
Length=3670
Score = 6008 bits (3253), Expect = 0.0
Identities = 3541/3681 (96%), Gaps = 16/3681 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGAGCATTGGCAGCCATTGTTGCAGCTCTCCTTTCACCTTCATCACTAGAAACTCA 60
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 1 ATGGAGAGCATTGGCGGCCATTGTTGCAGCTCTCCTTTCACCTTCATCAGTAGAAA--C- 57
Query 61 TCATCATCACTTCCTAGACTCGTTAACATCACTCACAGAGTTAATCTCAGCCACCAATCT 120
|||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 TCATCATCACTTCCCAAACTCGTTAACTTCACTCGTAGAGTTAATCTCAGCCACCAATCT 117
Query 121 CACCGACTCAGAAACTCCAATTCTCGTCTCACTTGCACTGCTACTTCTTCTTCCACCATT 180
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 CACCGACTCAGAAACTCCTCTTCTCGTCTCACTTGCACTGCTACTTCTTCTTCCACCATA 177
Query 181 GAGGAACAACGGAAGAAGAAAGATGGGTCAGGAACGAAAGTGAGGTTGAATGTGAGGTTA 240
|||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 178 GAGGAACAACTGAAGAAGAAAGATGGGTCTGGTACGAAAGTGAAGTTGAATGTGAGGTTA 237
Query 241 GATCATCAAGTTAATTTTGGTGACCATGTGGCTATGTTTGGATCAGCTAAAGAGATTGGT 300
||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 GATTATCAAGTTAAGTTTGGTGAACATGTGGCTATGTTTGGATCAGCTAAAGAGATTGGT 297
Query 301 TCATGGAAAAAGAAATCGCCTTTGAATTGGAGTGAGAATGGATGGGTTTGTGAGTTGGAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 TCATGGAAAAAGAAATCGCCTTTGAATTGGACTGAGAATGGATGGGTTTGTGAGTTGGAA 357
Query 361 CTTGACGGTGGTCAGGTTTTGGAGTATAAGTTTGTCATTGTTAAGAATGATGGTTCACTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 358 CTTGACGGTGGTCAGGTTTTGGAGTATAAGTTTGTCATTGTTAAGGATGATGGTTCACTT 417
Query 421 TCATGGGAATCTGGTGATAATCGTGTCCTTAAGGTTCCAAATTCTGGGAATTTTTCTGTT 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 418 TCATGGGAATCTGGTGATAATCGTGTCCTTAAGGTTCCTAATTCTGGGAATTTCTCTGTT 477
Query 481 GTTTGTCATTGGGATGCTACTAGAGAAACCCTTGATTTGCCTCAGGAGGTTGGTAATGAT 540
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 478 GTTTGTCATTGGGATGCTACAAGAGAAACCCTTGATTTGCCTCAGGAGGTTGATAATGAT 537
Query 541 GATGATGTTGGTGATGGTGGGCATGAGAGGGATAATCATGATGTTGGTGATGATAGAGTA 600
|| | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 538 GA--A----GGTGGTGGTGGGGACGAGAGGGATAATCATGATGTTGGTGATGAGAGAGTA 591
Query 601 GTGGGAAGTGAAAATGGTGCGCAGCTTCAGAAGAGTACATTGGGTGGGCAATGGCAAGGT 660
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 GTGGGGAGTGAAAATGGTGCGCAGCTTCAGAAGAGTACATTGGGTGGGCAATGGCAAGGT 651
Query 661 AAAGATGCGTCCTTTATGCGTTCTAATGATCATGGTAACAGAGAAGTTGGTAGAAATTGG 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 652 AAAGATGCGTCCTTTATGCGTTCTAATGATCATGGTAATAGAGAAGTTGGTAGAAATTGG 711
Query 721 GATACTAGTGGTCTTGAAGGCACAGCTCTTAAGATGGTTGAGGGTGATCGCAACTCTAAG 780
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 712 GATACTAGTGGTCTTGAAGGCCCAGCTCTTAAGATGGTTGAAGGTGATCGTAACTCTAAG 771
Query 781 AACTGGTGGAGAAAGCTTGAAATGGTACGCGAGGTTATAGTTGGGAGTGTTGAGAGGGAG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 772 AACTGGTGGAGAAAGCTTGAAATGGTACGCGAGGTTATAGTTGGGAGTGTTGAGAGGGAG 831
Query 841 GAACGATTGAAGGCGCTCATATACTCTGCAATTTATTTGAAGTGGATAAACACAGGTCAG 900
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 GAACGATTGAAGGCGCTCATATACTCTGCGATTTATTTGAAGTGGATAAACACAGGTCAA 891
Query 901 ATTCCTTGTTTTGAAGATGGAGGGCATCACCGTCCAAACAGGCATGCCGAGATTTCCAGA 960
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 892 ATTCCTTGCTTTGAAGATGGAGGGCACCACCGTCCAAACCGGCATGCTGAGATTTCCAGA 951
Query 961 CTTATATTCCGTGAGTTGGAGCACATTTGCAGTAAGAAAGATGCTACTCCAGAGGAAGTG 1020
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 952 CTTATATTTCGTGAGTTGGAGCACATTTGCAGTAAGAAAGATGCTACGGCAGAGGAAGTG 1011
Query 1021 CTTGTTGCTCGGAAAATCCATCCGTGTTTACCTTCTTTCAAAGCAGAGTTTACTGCAGCT 1080
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 CTTGTTGCTCGGAAAATCCATCCTTGTTTACCTTCTTTCAAAGCAGAGTTTACTGCAGCT 1071
Query 1081 GTCCCTCTAACTCGGATTAGGGACATAGCCCATCGCAATGATATTCCTCATGATCTCAAG 1140
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 GTCCCTCTAACTCGAATTAGGGACATAGCCCATCGCAATGATATTCCTCATGATCTCAAG 1131
Query 1141 CAAGAAATCAAGCATACGATACAAAATAAGCTTCACCGGAATGCTGGTCCAGAAGATCTA 1200
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1132 CAAGAAATCAAGCATACCATACAAAATAAGCTTCACCGGAATGCGGGTCCAGAAGATCTA 1191
Query 1201 ATTGCAACAGAAGCAATGCTTCAACGAATTACCGAGACCCCAGGAAAATATAGTGGAGAC 1260
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1192 ATTGCAACAGAAGCAATGCTTCAAAGAATTACTGAGACCCCAGGAAAATACAGTGGAGAC 1251
Query 1261 TTTGTGGAGCAGTTTAAAATATTCCATAATGAGCTTAAAGATTTCTTTAATGCTGGAAGT 1320
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 TTCGTGGAGCAATTTAAAATATTCCATAATGAGCTTAAAGATTTCTTTAATGCTGGAAGC 1311
Query 1321 CTCACTGAACAGCTTGATTCTATGAAAATTTCTATGGATGATAGAGGTCTTTCTGCGCTC 1380
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 CTCACTGAACAACTTGATTCTATGAAAATTTCCATGGACGATAGAGGTCTTTCTGCGCTC 1371
Query 1381 AATTTGTTTTTTGAATGTAAAAAGCGCCTTGACACATCAGGAGAATCAAGCAATGTTTTG 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 AATTTGTTTTTTGAATGTAAAAAGCGCCTTGACGCATCAGGAGAATCAAGCAATGTTTTG 1431
Query 1441 GAGTTGATTAAAACCATGCATTCTCTAGCTTCTTTAAGAGAAACAATTATAAAGGAACTT 1500
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1432 GAGTTGATTAAAACCATGCATTCTCTGGCTTCTCTAAGAGAAACAATTATAAAAGAACTT 1491
Query 1501 AATAGCGGCTTGCGAAATGATGCTCCTGATACTGCCATTGCAATGCGCCAGAAGTGGCGC 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 AATAGCGGCTTGCGAAATGATGCTCCTGATACTGCCATTGCAATGCGCCAGAAGTGGCGC 1551
Query 1561 CTTTGTGAGATCGGCCTCGAGGACTACTTTTTTGTTCTACTAAGCAGATTCCTCAATGCT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 CTTTGTGAGATCGGCCTCGAGGACTACTTTTTTGTTCTACTAAGCAGATTCCTCAATGCT 1611
Query 1621 CTTGAAACTATGGGAGGAGCTGATCAACTGGCAAAAGATGTGGGATCAAGAAACGTTGCC 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 1612 CTTGAAACTATGGGAGGAGCTGATCAACTGGCAAAAGATGTGGGATCAAGAAATGTTTCC 1671
Query 1681 TCATGGAATGATCCACTAGATGCTTTGGTGTTGGGTGTTCACCAAGTAGGTCTATCTGGT 1740
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672 TCATGGAATGATCCACTCGATGCTCTGGTGTTGGGTGTTCACCAAGTAGGTCTATCTGGT 1731
Query 1741 TGGAAGCAAGAAGAATGTTTAGCCATTGGAAATGAACTCCTTGCTTGGCGAGAAAGGGAC 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1732 TGGAAGCAAGAAGAATGTTTAGCCATTGGAAATGAACTCCTTGCTTGGCGAGAGAGAGAC 1791
Query 1801 CTACTTGAAAAAGAAGGGGAAGAGGATGGAAAAACAATTTGGGCCATGAGGCTGAAAGCA 1860
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1792 CTACTTGAAAAAGAAGGGGAAGAGGATGGAAAAACAATTTGGGCTATGAGGCTGAAAGCA 1851
Query 1861 ACTCTTGATCGAGCACGCAGATTAACAGCAGAATATTCTGATTTGCTTCTTCAAATATTT 1920
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1852 ACTCTTGATCGAGCACGCAGATTAACAGCAGAATATTCTGATTTACTTCTTCAAATATTT 1911
Query 1921 CCTCCTAATGTGGAGATTTTAGGAAAAGCTCTAGGAATTCCAGAGAATAGTGTCAAGACC 1980
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 CCTCCTAATGTGGAGATTTTAGGAAAAGCTCTAGGAATCCCAGAGAATAGTGTCAAGACT 1971
Query 1981 TATACAGAAGCAGAGATTCGTGCTGGAATTATTTTCCAGATCTCAAAGCTCTGCACTGTT 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972 TATACAGAAGCAGAGATTCGTGCTGGAATTATTTTCCAGATCTCAAAGCTCTGCACTGTT 2031
Query 2041 CTTCTAAAAGCTGTAAGAAATTCACTTGGTTCTGAGGGCTGGGATGTCGTTGTACCTGGA 2100
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 CTTCTAAAAGCTGTAAGAAGTTCACTTGGTTCTGAGGGCTGGGATGTCGTTGTACCTGGA 2091
Query 2101 TCGACGTCTGGGACATTAGTTCAGGTTGAGAGCATTGTTCCGGGATCATTGCCAGCAACT 2160
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||
Sbjct 2092 TCGACTTCTGGGACATTAGTTCAGGTTGAGAGCATTGTACCGGGATCTTTACCATCAACT 2151
Query 2161 TCTGGTGGTCCTATTATTCTCTTGGTCAATAAAGCTGATGGCGATGAAGAGGTAAGTGCT 2220
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 GGTGGTGGTCCTATTATTCTCTTGGTCAACAAAGCTGACGGCGATGAAGAGGTAAGTGCT 2211
Query 2221 GCTAATGGGAACATAGCTGGAGTCATGCTTCTGCAGGAGCTGCCTCACTTGTCTCACCTT 2280
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 GCTAATGGGAACATAGCCGGAGTCATGCTTCTGCAGGAACTGCCTCACTTGTCTCACCTT 2271
Query 2281 GGCGTTAGAGCGCGGCAGGAGAAAATTGTCTTTGTGACATGTGATGATGATGACAAGGTT 2340
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 GGCGTTAGAGCGCGGCAGGAGAAAATTGTCTTTGTGACATGTGATGATGATGACAAGGTC 2331
Query 2341 GCTGATATACGACGACTTGTGGGAAAATTTGTGAGGTTGGAAGCATCTCCAAGTCATGTG 2400
||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2332 GCTGATATACGGCGACTTGTGGGAAAGTTCGTGAGGTTGGAAGCATCTCCAAGCCATGTG 2391
Query 2401 AATCTGATACTTTCAACTGAGGGTAGGAGTCGCACTTCCAAATCCAGTGCGACCaaaaaa 2460
||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2392 AATCTTATACTTTCAACTGAGGGTAAGAGTCGTACTCCCAAATCTAGTGCGAACAAAAAA 2451
Query 2461 aCGGATAAGAACAGCTTATCTAAGaaaaaaaCAGATAAGAAGAGCTTATCTATCGATGAT 2520
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 ACGGATAAGAACAGCTTATCTAAGAAAAAAACGGATAAGAAGAGCTTATCTATCGATGAT 2511
Query 2521 GAAGAATCAAAGCCTGGTTCCTCATCTTCCAATAGCCTCCTTTACTCTTCCAAGGATATC 2580
|||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 GAAGAATCAAAGACTGGTTCTTCATCTTCCAGTAGCCTCCTTTACTCTTCCAAGGATATC 2571
Query 2581 CCTAGTGGAGGAATCATAGCACTTGCTGATGCAGATGTACCAACTTCTGGTTCAAAATCT 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 CCTAGTGGAGGAATCATAGCACTTGCTGATGCAGATGTACCAACTTCTGGTTCAAAATCT 2631
Query 2641 GCTGCATGTGGTCTTCTTGCATCTTTAGCAGAAGCCTCTAGTAAAGTGCACAGCGAACAC 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2632 GCTGCATGTGGTCTTCTTGCATCTTTAGCAGAAGCCTCTAGTAAAGTGCACAGCGAACAC 2691
Query 2701 GGAGTTCCGGCATCATTTAAGGTTCCAACTGGAGTTGTCATACCTTTTGGATCGATGGAA 2760
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2692 GGAGTTCCAGCATCATTTAAGGTTCCAACTGGAGTTGTCATACCTTTTGGATCGATGGAA 2751
Query 2761 TTAGCTTTAAAGCAAAATAATTCGGAAGAAAAGTTTGCGTCTTTGCTAGAAAAACTAGAA 2820
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 2752 TTAGCTTTAAAGCAAAGTAATTCGGAAGAAAAGTTTGCGTTTTTGCTAGAAAAGCTAGAA 2811
Query 2821 ACCGCCAGACCTGAGGGTGGTGAGCTAGACGACATATGTGACCAGATCCATGAAGTGATG 2880
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 ACCGCCAGACCTGAGGGCGGTGAGCTAGACGACATATGTGACCAGATCCATGAAGTGATG 2871
Query 2881 AAAACGTTGCAAGTGCCTAAAGAAACAATCAACAGCATAAGCAAAGCGTTTCTCAAAGAT 2940
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2872 AAAACGCTGCAAGTGCCTGAAGAAACAATCAACAGCATAAGCAAAGCGTTTCCCAAAGAT 2931
Query 2941 GCTCGTCTCATTGTTCGTTCAAGTGCTAACGTCGAGGACTTAGCCGGAATGTCAGCTGCA 3000
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 GCTCGTCTCATTGTGCGTTCAAGTGCTAACGTGGAGGACTTAGCCGGAATGTCAGCTGCA 2991
Query 3001 GGACTCTATGAATCAATCCCTAACGTGAGTCCCTCGGATCCTTTGGTGTTTTCAGA-TTC 3059
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2992 GGACTCTATGAATCAATCCCCAACGTGAGTCCCTCAGATCCTTTGGTGTTTTC-GAATTC 3050
Query 3060 GGTTTGCCAAGTTTGGGCTTCTCTCTACACAAGAAGAGCTGTTCTAAGCCGTAGAGCTGC 3119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051 GGTTTGCCAAGTTTGGGCTTCTCTCTACACAAGAAGAGCTGTTCTAAGCCGTAGAGCTGC 3110
Query 3120 TGGTGTCTCTCAAAGAGAAGCTTCAATGGCTGTTCTCGTTCAAGAAATGCTTTCGCCGGA 3179
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3111 TGGTGTCTCTCAAAGAGAAGCTTCAATGGCAGTTCTCGTTCAAGAAATGCTTTCGCCGGA 3170
Query 3180 CTTATCATTCGTTCTGCACACAGTGAGTCCAGCTGATCCGGACAGTAACCTTGTGGAAGC 3239
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3171 CTTATCATTTGTTTTGCACACAGTGAGTCCAGCTGATCCGGACAGTAACCTCGTGGAAGC 3230
Query 3240 CGAGATCGCTCCTGGTTTAGGTGAGACTTTAGCTTCAGGAACAAGAGGAACACCATGGAG 3299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3231 CGAGATCGCTCCTGGTTTAGGTGAGACTTTAGCTTCAGGGACAAGAGGAACACCATGGAG 3290
Query 3300 ACTCGCTTCGGGTAAGCTCGACGGGATTGTACAAACCTTAGCTTTCGCAAACTTCAGCGA 3359
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3291 ACTCGCTTCGGGTAAGCTCGATGGGATTGTACAAACCTTAGCTTTTGCAAACTTCAGCGA 3350
Query 3360 AGAGCTTCTTGTGTCAGGAACAGGTCCTGCTGATGGAAAATACGTTCGGTTGACCGTGGA 3419
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3351 AGAGCTTCTTGTGTCAGGAACAGGTCCCGCTGATGGTAAATATGTTCGGTTGACCGTCGA 3410
Query 3420 CTATAGCAAAAAACGTTTAACTGTTGACTCGGTGTTTAGACAGCAGCTCGGTCAGAGACT 3479
||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 CTATAGCAAGAAACGGTTAACCGTTGACTCGGTGTTTAGACAGCAGCTCGGTCAGAGACT 3470
Query 3480 CGGTTCGGTTGGTTTCTTCTTGGAAAGAAACTTTGGCTGTGCTCAAGACGTTGAAGGTTG 3539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3471 CGGTTCGGTTGGTTTCTTCTTGGAAAGAAACTTTGGCTGTGCTCAAGACGTGGAAGGTTG 3530
Query 3540 TTTGGTTGGTGAAGATGTTTACATTGTTCAGTCAAGGCCACAACCTCTGTAGAATCTTTT 3599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3531 TTTGGTTGGTGAAGATGTTTACATTGTTCAGTCAAGGCCACAACCTCTGTAGAATCTTTT 3590
Query 3600 AT---CTATAAAGCGAATAATACAAAAAATG-CTAGAAATAAAATCTGCATTTGCCTCGT 3655
|| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3591 ATTTTCTATAAAGCGAATAATACAAAAAATGTC-AGAAATAAAATCTGCATTTGCTTCAT 3649
Query 3656 TACCATATGTGAAGTTATGTT 3676
|||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 TACCATATGTGAAGTTATGTT 3670
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 143362877491
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5