BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G26710.1
Length=2513
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg489491 jgi|Araly1|489491|fgenesh2_kg.6__2625__AT5G26710.1 3635 0.0
Ahg473931 jgi|Araly1|473931|fgenesh2_kg.1__3885__AT5G26710.1 2708 0.0
Ahg489492 jgi|Araly1|489492|fgenesh2_kg.6__2626__AT5G26700.1 117 4e-25
> Ahg489491 jgi|Araly1|489491|fgenesh2_kg.6__2625__AT5G26710.1
Length=2339
Score = 3635 bits (1968), Expect = 0.0
Identities = 2232/2357 (95%), Gaps = 28/2357 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 150 TAGATCCAAAGATGGATGGGATGAAGCTTTCGTTCCCACCGGAAAGTCCACCACTTTCAG 209
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TAGATCCAAAGATGGATGGGATAAAGCTCTCGTTCCCACCGGAAAGTCCACCACTTTCAG 60
Query 210 TCATCGTTGCTCTTTCTCTCTCAGCTTCTCCGGTGACGATTGATTCTTCCGCCGCTGCAA 269
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 61 TCATCGTTGCTCTTTCTCTCTCAGCTTCTCCGGTCACTATTGATTCTTCCGCCTCTGTAA 120
Query 270 CAACCGTCCCTTCTTTTGTCTTCTCCGACGGGAGGAAATTGAATGGAGCCACCGTTCTTC 329
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 121 CCACCGTCCCTTCTTTTGTCTTCTCCGACGGGAGGAAATTGAGTGGAGCCACTGTTCTTC 180
Query 330 TTCGCTATGTTGGTCGATCAGCGAAAAAGCTTCCTGATTTCTATGGCAACAATGCTTTTG 389
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 181 TTCGCTATGTTGGTCGATCAGCGAATACGCTTCCTGATTTCTATGGCAACAGTGCTTTTG 240
Query 390 ATTCTTCTCAGATTGATGAGTGGGTAGATTACGCATCTGTCTTCTCTTCTGGTTCAGAGT 449
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATTCTTCTCAGATTGATGAGTGGGTAGATTTCGCTTCTGTATTCTCTTCTGGTTCAGAGT 300
Query 450 TTGAGAATGCTTGTGGTCGTGTTGATAAGTATCTCGAGAGTAGCACGTTTCTTGTTGGCC 509
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 301 TTGAGAATGCTTGTGGTCGTGTTGATAAGCATCTCGAGAGTCGTACGTTTCTTGTTGGCC 360
Query 510 ATTCTCTTTCCATTGCTGATGTCGCTATTTGGTCAGCTCTTGCTGGAACTGGTCAAAGAT 569
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 361 ATTCTCTTTCCATTGCTGATGTTGCTATTTGGTCAGCTCTTGCTGGAACTGGCCAAAGAT 420
Query 570 GGGAAAGTTTGAGGAAATCTAAAAAGTATCAGAGTCTT-GTTAGATGGTTCAATTCGATA 628
|||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GGGAAAGTTTGAGGAAGTCGAAAAAGTATCAGAGT-TTAGTTAGATGGTTCAATTCGATA 479
Query 629 TTAGACGAGTACAGTGAGGTGCTTAACAAGGTTCTAGCAACTTATGTTAAGAAAGGATCA 688
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||
Sbjct 480 TTAGACGAGTACAGTGAGCTGCTTAACAAAGTTCTAGCAACATATGTGAAGAAAAGCTCT 539
Query 689 GGGAAGCCTGTTGCTGCACCTAAGTCTAAAGATAGCCAACAAGCTGTGAAAGGAGATGGT 748
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 540 GGGAAGCCTGTTGCTGCACCTAAGTCTAAAGACAGCCAACAAGCTTTGAAAGGAGATGCT 599
Query 749 CAGGATAAAGGTAAGCCTGAAGTGGACTTGCCGGAAGCGGAGATTGGAAAGGTTAAACTC 808
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||
Sbjct 600 CAGGATAAAGGCAAACCTGAAGTGGACTTGCCGGAAGCAGAAATTGGAAAGGTTCGACTC 659
Query 809 CGGTTTGCTCCAGAGCCAAGTGGTTATCTTCACATAGGACATGCTAAGGCTGCGTTGCTG 868
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CGGTTTGCTCCAGAGCCAAGTGGTTATCTTCACATTGGACATGCTAAGGCTGCGTTGCTG 719
Query 869 AACAAGTATTTCGCTGAGCGTTACCAAGGGGAAGTGATTGTGCGTTTTGATGATACTAAC 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AACAAGTATTTCGCTGAGCGTTACCAAGGGGAAGTGATTGTGCGTTTTGATGATACTAAC 779
Query 929 CCTGCTAAAGAAAGCAATGAGTTTGTGGATAATCTTGTGAAGGATATTGGGACCTTGGGG 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 CCTGCTAAAGAAAGCAATGAGTTTGTGGATAATCTTGTGAAGGATATTGGGACCTTGGGG 839
Query 989 ATCAAGTATGAGAAAGTGACATACACTTCGGACTATTTTCCTGAATTGATGGATATGGCG 1048
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 840 ATCAAGTATGAGAAAGTGACTTACACTTCGGACTATTTTCCTGAGTTGATGGAAATGGCG 899
Query 1049 GAAAAACTGATGCGTGAGGGTAAGGCATATGTTGATGACACACCGAGGGAGCAGATGCAG 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GAAAAACTGATGCGTGAGGGTAAGGCATATGTTGATGACACACCGAGGGAGCAGATGCAG 959
Query 1109 AAAGAGAGGATGGATGGGATTGATTCGAAATGTAGGAATCATAGCGTCGAGGAGAATTTG 1168
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 960 AAAGAGAGGATGGATGGGATTGATTCGAAATGTAGGAATCATAGTGTCGATGAGAATTTG 1019
Query 1169 AAGCTATGGAAGGAAATGATTGCAGGAAGTGAGAGAGGATTACAGTGCTGTGTTCGTGGG 1228
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1020 AAGCTATGGAAGGAAATGATTGCGGGAAGTGAGAGAGGATTACAGTGCTGCGTTCGTGGG 1079
Query 1229 AAATTCAACATGCAAGATCCCAACAAAGCCATGCGTGACCCGGTTTATTACCGATGCAAT 1288
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1080 AAATTCAACATGCAAGATCCCAACAAAGCCATGCGTGACCCGGTTTATTATCGATGCAAC 1139
Query 1289 CCTATGTCTCACCACCGTATCGGGGATAAGTATAAGATATATCCAACATATGACTTTGCT 1348
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 CCTATGTCTCACCACCGTATCGGAGATAAGTATAAGATATATCCAACATATGACTTTGCT 1199
Query 1349 TGCCCGTTTGTTGATTCCCTTGAAGGTATAACGCATGCTCTTCGGTCTAGTGAGTATCAT 1408
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TGCCCGTTTGTTGATTCCCTTGAAGGTATAACGCATGCCCTTCGGTCTAGTGAGTATCAT 1259
Query 1409 GACCGAAATGCTCAGTACTTTAAAGTTCTGGAGGATATGGGACTGCGACAGGTTCAGCTT 1468
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1260 GACCGGAATGCTCAGTACTTTAAAGTTCTGGAGGACATGGGATTACGACAGGTTCAGCTT 1319
Query 1469 TACGAATTCAGCCGGTTAAACCTAGTTTTTACACTTCTCAGTAAGCGCAAGCTTCTCTGG 1528
||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 TACGAATTCAGCCGGCTAAATCTGGTTTTCACACTTCTCAGTAAGCGCAAGCTTCTCTGG 1379
Query 1529 TTTGTCCAAACTGGATTGGTTGACGGGTGGGATGATCCACGTTTCCCGACAGTCCAAGGA 1588
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TTTGTCCAGACTGGATTGGTTGACGGGTGGGATGATCCACGCTTCCCGACAGTCCAAGGA 1439
Query 1589 ATTGTTCGTAGAGGTTTGAAAATCGAGGCTCTGATTCAATTCATTCTCGAGCAGGGGGCT 1648
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1440 ATTGTTCGTAGAGGTTTGAAAATCGAGGCTCTGATTCAGTTCATTCTCGAGCAGGGAGCT 1499
Query 1649 TCGAAGAATCTAAATTTGATGGAATGGGACAAACTTTGGTCTATAAATAAGAGAATAATT 1708
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1500 TCGAAGAATCTAAATTTGATGGAATGGGACAAACTTTGGTCTATTAATAAGAGAATAATT 1559
Query 1709 GATCCTGTGTGCCCTAGACACACTGCTGTGGTTGCAGAACGTCGTGTACTATTTACCTTA 1768
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 GATCCTGTGTGCCCTAGACACACGGCTGTGATTGCAGAGCGTCGTGTACTATTTACCTTA 1619
Query 1769 ACGGATGGTCCTGATGAGCCGTTTGTTCGCATGATACCAAAGCACAAGAAATTCGAAGGT 1828
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 ACAGATGGTCCTGATGAGCCGTTTGTTCGCCTGATACCAAAGCACAAGAAATTCGAAGGT 1679
Query 1829 GCTGGAGAAAAGGCGACCACTTTCACTAAGAGCATTTGGCTCGAGGAAGCTGATGCGAGT 1888
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GCAGGAGAAAAGGCGACCACTTTCACCAAGAGCATTTGGATCGAGGAAGCTGATGCGAGT 1739
Query 1889 GCCATATCCGTTGGTGAGGAAGTAACTTTGATGGATTGGGGAAATGCTATCGTAAAGGAA 1948
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1740 GCAATATCCGTTGGTGAGGAAGTAACTTTGATGGATTGGGGAAATGCCATAGTAAAGGAA 1799
Query 1949 ATCACAAAGGACGAGGAGGGTCGTGTCACTGCCTTATCTGGTGT-CTTGAATCTCCAAGG 2007
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1800 ATCACAAAGGACAAGGAGGGTCGTGTCACTGCATTATCTGGCGTTCT-GAATCTCCAAGG 1858
Query 2008 TTCTGTAAAGACTACAAAGCTGAAGCTGACATGGCTTCCTGATACTAATGAATTGGTCAA 2067
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1859 TTCTGTAAAGACTACAAAGCTAAAGCTCACATGGCTTCCCGATACCAATGAATTGGTCAA 1918
Query 2068 TCTCACATTAACAGAGTTTGATTATCTAATCACCAAGAAGAAGCTGGAAGATGATGATGA 2127
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 TCTCACATTAACTGAGTTTGATTATTTAATCACCAAGAAGAAGCTGGAAGATGATGATGA 1978
Query 2128 AGTTGCTGATTTTGTGAATCCTAACACAAAGAAGGAAACATTGGCACTTGGTGATTCGAA 2187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1979 AGTTGCTGATTTTGTGAATCCTAACACAAAGAAGGAAACTTTGGCACTTGGTGATTCTAA 2038
Query 2188 TATGAGGAATCTGAAATGTGGAGATGTGATTCAGCTTGAGAGGAAAGGCTATTTCAGATG 2247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TATGAGGAATCTGAAATGTGGAGATGTGATTCAGCTTGAGAGGAAAGGCTATTTCAGATG 2098
Query 2248 TGATGTGCCTTTTGTCAAATCTTCAAAGCCCATTGTCTTATTCTCCATTCCAGATGGAAG 2307
|||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2099 TGATGTTCCATTTGTCAAATCTTCAAAGCCCATCGTCTTATTCTCGATTCCAGATGGAAG 2158
Query 2308 AGCCGCTAAGTGATCAATGAACTATTTTTGAGTTTCCCATTTTATGAACATTGTGTTGAG 2367
||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2159 AGCGGCTAAGTGATGAATGAACTATTTTTGTGTTTCCCATTTTATGAAAATTGTGTTGAG 2218
Query 2368 AAATTTGCTCTTTAGGTTTTAAAACAATGAAAA-CAAAGCT-TTTTATCAGTTCTTT--- 2422
|| ||| || | ||||||||| || |||| |||||||||||||||
Sbjct 2219 AA-TTTA------AG-----A---CAATGAAAAACAGAGCTCTTTTATCAGTTCTTTGCT 2263
Query 2423 -AGTTT--CATCTCATAATAGTTTTAAAGTTGCAAACTTTATATTGATTCATTCTTCTTT 2479
| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2264 TAATTTTTCATCTCATAATAGTTT-AAAGTTGCAAACTTTATCTTGATTCATTCTTCTTT 2322
Query 2480 GCTTAGTGTTTACAATA 2496
|||||||||||||||||
Sbjct 2323 GCTTAGTGTTTACAATA 2339
> Ahg473931 jgi|Araly1|473931|fgenesh2_kg.1__3885__AT5G26710.1
Length=1775
Score = 2708 bits (1466), Expect = 0.0
Identities = 1676/1779 (94%), Gaps = 8/1779 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 554 GGAACTGGTCAAAGATGGGAAAGTTTGAGGAAATCTAAAAAGTATCAGAGTCTT-GTTAG 612
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1 GGAACTGGCCAAAGATGGGAAAGTTTGAGGAAATCGAAAAAGTATCAGAGT-TTGGTTAG 59
Query 613 ATGGTTCAATTCGATATTAGACGAGTACAGTGAGGTGCTTAACAAGGTTCTAGCAACTTA 672
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 60 ATGGTTCAATTCGATATTAGACGAGTACAGCGAGCTGCTTAACAAGGTTCTATCAACATA 119
Query 673 TGTTAAGAAAGGATCAGGGAAGCCTGTTGCTGCACCTAAGTCTAAAGATAGCCAACAAGC 732
||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||||||||
Sbjct 120 TGTGAAGAAAGGCTCAGGGAAGCCTGTGGCTCCACCCAAGTCTAAAGACAACCAACAAGC 179
Query 733 TGTGAAAGGAGATGGTCAGGATAAAGGTAAGCCTGAAGTGGACTTGCCGGAAGCGGAGAT 792
| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 180 TACGAAAGCAGATGCACAGGATAAAGGCAAATCTGAAGTGGACTTGCCGGAAGCAGAAAT 239
Query 793 TGGAAAGGTTAAACTCCGGTTTGCTCCAGAGCCAAGTGGTTATCTTCACATAGGACATGC 852
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 240 TGGAAAGGTTCGACTTCGGTTTGCTCCAGAGCCAAGTGGTTATCTTCACATTGGACATGC 299
Query 853 TAAGGCTGCGTTGCTGAACAAGTATTTCGCTGAGCGTTACCAAGGGGAAGTGATTGTGCG 912
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CAAGGCTGCGTTACTGAACAAGTATTTTGCTGAGCGTTACCAAGGGGAAGTGATTGTGCG 359
Query 913 TTTTGATGATACTAACCCTGCTAAAGAAAGCAATGAGTTTGTGGATAATCTTGTGAAGGA 972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||
Sbjct 360 TTTTGATGATACTAACCCTGCTAAAGAAAGCAATGAGTTTGTGGATAATCTCGTTAAAGA 419
Query 973 TATTGGGACCTTGGGGATCAAGTATGAGAAAGTGACATACACTTCGGACTATTTTCCTGA 1032
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 420 TATTGGGACTTTGGGGATCAAGTATGAGAAAGTGACATACACTTCAGACTACTTTCCTGA 479
Query 1033 ATTGATGGATATGGCGGAAAAACTGATGCGTGAGGGTAAGGCATATGTTGATGACACACC 1092
| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 480 ACTGATGCAAATGGCGGAAAAACTGATGCGTGAGGGCAAGGCATATGTTGACGACACTCC 539
Query 1093 GAGGGAGCAGATGCAGAAAGAGAGGATGGATGGGATTGATTCGAAATGTAGGAATCATAG 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 540 AAGGGAGCAGATGCAGAAAGAGAGGATGGATGGGATTGATTCAAAATGTAGGAATCATAG 599
Query 1153 CGTCGAGGAGAATTTGAAGCTATGGAAGGAAATGATTGCAGGAAGTGAGAGAGGATTACA 1212
||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TGTCGATGAGAATTTGAAGCTATGGCAGGAAATGATTGCGGGAAGTGAGAGAGGATTACA 659
Query 1213 GTGCTGTGTTCGTGGGAAATTCAACATGCAAGATCCCAACAAAGCCATGCGTGACCCGGT 1272
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 660 GTGCTGTGTTCGCGGGAAATTCAACATGCAAGATCCCAACAAAGCCATGCGCGACCCTGT 719
Query 1273 TTATTACCGATGCAATCCTATGTCTCACCACCGTATCGGGGATAAGTATAAGATATATCC 1332
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TTATTATCGATGTAATCCTATGTCTCACCACCGTATCGGAGATAAGTATAAGATATATCC 779
Query 1333 AACATATGACTTTGCTTGCCCGTTTGTTGATTCCCTTGAAGGTATAACGCATGCTCTTCG 1392
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 780 AACATATGACTCTGCTTGCCCGTTTGTTGATTCCCTTGAAGGTATAACGCATGCCCTTCG 839
Query 1393 GTCTAGTGAGTATCATGACCGAAATGCTCAGTACTTTAAAGTTCTGGAGGATATGGGACT 1452
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 840 GTCTAGTGAGTATCATGACCGGAATGCTCAATACTTTAAAGTTCTGGAGGACATGGGAAT 899
Query 1453 GCGACAGGTTCAGCTTTACGAATTCAGCCGGTTAAACCTAGTTTTTACACTTCTCAGTAA 1512
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GCGACAGGTTCAGCTTTATGAATTCAGCCGGTTAAATCTGGTTTTTACACTTCTCAGTAA 959
Query 1513 GCGCAAGCTTCTCTGGTTTGTCCAAACTGGATTGGTTGACGGGTGGGATGATCCACGTTT 1572
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 960 ACGCAAGCTTCTCTGGTTTGTCCAGACTGGATTGGTTGACGGGTGGGATGATCCACGCTT 1019
Query 1573 CCCGACAGTCCAAGGAATTGTTCGTAGAGGTTTGAAAATCGAGGCTCTGATTCAATTCAT 1632
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1020 CCCGACAGTCCAAGGAATTGTTCGTAGAGGTTTGAAAATCGAGGCTCTTATTCAGTTCAT 1079
Query 1633 TCTCGAGCAGGGGGCTTCGAAGAATCTAAATTTGATGGAATGGGACAAACTTTGGTCTAT 1692
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TCTCGAGCAGGGAGCTTCGAAGAATCTAAATTTGATGGAATGGGACAAACTTTGGTCTAT 1139
Query 1693 AAATAAGAGAATAATTGATCCTGTGTGCCCTAGACACACTGCTGTGGTTGCAGAACGTCG 1752
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||
Sbjct 1140 TAATAAGAGAATAATTGATCCTGTGTGCCCTAGACACACGGCTGTGATTGCAGAGCGTCG 1199
Query 1753 TGTACTATTTACCTTAACGGATGGTCCTGATGAGCCGTTTGTTCGCATGATACCAAAGCA 1812
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1200 TGTACTATTTACCTTAACAGATGGTCCTGATGAGCCGTTTGTTCGCCTGATACCAAAGCA 1259
Query 1813 CAAGAAATTCGAAGGTGCTGGAGAAAAGGCGACCACTTTCACTAAGAGCATTTGGCTCGA 1872
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 1260 CAAGAAATTCGAAGGTGCTGGAGAAAAAGCGACCACTTTCACCAAGAGCATTTGGATCGA 1319
Query 1873 GGAAGCTGATGCGAGTGCCATATCCGTTGGTGAGGAAGTAACTTTGATGGATTGGGGAAA 1932
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GGAAGCTGATGCGAGTGCCATATCCGTTGATGAGGAAGTAACTTTGATGGATTGGGGAAA 1379
Query 1933 TGCTATCGTAAAGGAAATCACAAAGGACGAGGAGGGTCGTGTCACTGCCTTATCTGG--T 1990
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1380 TGCCATAGTAAAGGAAATCACAAAGGACGAGGAGGGTCGTGTCACTGCGTTATCTGGCAT 1439
Query 1991 GTCTTGAATCTCCAAGGTTCTGTAAAGACTACAAAGCTGAAGCTGACATGGCTTCCTGAT 2050
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1440 -TC-TGAATCTCCAAGGATCTGTAAAGACTACAAAGCTGAAGCTCACATGGCTTCCTGAC 1497
Query 2051 ACTAATGAATTGGTCAATCTCACATTAACAGAGTTTGATTATCTAATCACCAAGAAGAAG 2110
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1498 ACCAATGAATTGGTCAATCTCACATTAACTGAGTTTGATTATTTAATCACCAAGAAGAAG 1557
Query 2111 CTGGAAGATGATGATGAAGTTGCTGATTTTGTGAATCCTAACACAAAGAAGGAAACATTG 2170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 CTGGAAGATGATGATGAAGTTGCTGATTTTGTGAATCCTAACACAAAGAAGGAAACATTG 1617
Query 2171 GCACTTGGTGATTCGAATATGAGGAATCTGAAATGTGGAGATGTGATTCAGCTTGAGAGG 2230
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 GCACTTGGTGATTCGAATATGCGGAATCTGAAATGTGGAGATGTGATTCAGCTTGAGAGG 1677
Query 2231 AAAGGCTATTTCAGATGTGATGTGCCTTTTGTCAAATCTTCAAAGCCCATTGTCTTATTC 2290
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1678 AAAGGCTATTTCAGATGTGATGTTCCTTTTGTCAAATCTTCAAAGTCCATTGTTTTATTC 1737
Query 2291 TCCATTCCAGATGGAAGAGCCGCT-AAGTGATCAATGAA 2328
|| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||
Sbjct 1738 TCTATTCCAGATGGAAGAGCT-CTTAAGTGATGAATGAA 1775
> Ahg489492 jgi|Araly1|489492|fgenesh2_kg.6__2626__AT5G26700.1
Length=786
Score = 117 bits (63), Expect = 4e-25
Identities = 69/72 (96%), Gaps = 0/72 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 2442 TTTAAAGTTGCAAACTTTATATTGATTCATTCTTCTTTGCTTAGTGTTTACAATATAAAC 2501
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 786 TTTAAAGTTGCAAACTTTATCTTGATTCATTCTTCTTTGCTTAGTGTTTACAATAGAGAC 727
Query 2502 AAAAACAAACTC 2513
||||||||||||
Sbjct 726 AAAAACAAACTC 715
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 94730439315
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5