BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G28667.1
Length=1026
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg474030 jgi|Araly1|474030|fgenesh2_kg.1__3984__AT5G28667.1 1358 0.0
Ahg497217 jgi|Araly1|497217|fgenesh2_kg.61__1__AT5G28667.1 1308 0.0
Ahg494740 jgi|Araly1|494740|fgenesh2_kg.8__556__AT5G28667.1 1254 0.0
Ahg493747 jgi|Araly1|493747|fgenesh2_kg.7__3180__AT5G28667.1 763 0.0
Ahg949069 jgi|Araly1|949069|scaffold_800956.1 510 7e-144
> Ahg474030 jgi|Araly1|474030|fgenesh2_kg.1__3984__AT5G28667.1
Length=976
Score = 1358 bits (735), Expect = 0.0
Identities = 897/976 (92%), Gaps = 8/976 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 GAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCAATATGTGACATAATGGAAACAAGTTATGGATTAC 69
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1 GAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCATTATGTGACATAATGGAAACACGTTATGGATTAC 60
Query 70 AACCTACATTGAATGTTAGCATTGAAGAGTGTGTTGCCATGTTTTTACGGATATGTGGAT 129
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AACCTACATTGAATGTTAGCATTGAAGAGAGTGTTGCCATGTTTTTACGGATATGTGGAC 120
Query 130 ACAATGAAGGTCAAAGAGATGTTGGGTTGCGATTTTTTGAAGGCCTTAGAGTGACAAAGT 189
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||
Sbjct 121 ACAATGAAGTTCAAAGAGATGTTGGGTTACGATTTTTTGAAGTCCTTAGAGCGACAGAGT 180
Query 190 TACTTGCTTGTGATTGTATCAAGACGCCAACAACACAAGAACTACGTCGAATTCATGAAA 249
||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 181 TACTTGCTTGTGATTATATCAAGACTCCAACAAGACAAGAACTACGTCGAATTCCTGAAA 240
Query 250 AAGTACAAATGGATCGAAGATATTGGTCATATTTTAGTG-ATTTGTTGGAGCTATAGATG 308
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AACTACAAATGGATCGAAGATATTGGCCATATTTCAGTGGATTTGTTGGAGCTATAGATG 300
Query 309 GAGTTCATGTGTGT-T-AAGGTGAAGCCTAAACTACAAGGAATGTATTGGAATTGACACG 366
|||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 301 GAGTTCATGTATGTATTAAGGTGAAGCCTGAACTACAAGGAATGTATTGGAATCGACACG 360
Query 367 ATAGAACATCATTTAATATCATGGCCGTATGTGATATAAATATGTTGTTTTCATATGTTT 426
|||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 361 ATAGAACATCGTTTAATATCATGGCAATATGCGATATAAATATGTTGTTTACATATGTTT 420
Query 427 GAAATAGAGCACATGGATCGTGTCACGATACAGTAGTTCTAACGATGGTACAAGATAATG 486
| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 421 GGAATGGAGCACCTGGATCGTGTCACGATACAGCAGTTCTAACGATGGCACAAGATAATG 480
Query 487 ATTATGAATTTCCTTTGCCTCCTAGACACAAGTATTATGTAGTTGATTTTGGGTATCCAA 546
||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 481 ATTCTGAATTTCCTTTGCCTCCAAGAGACAAGTATTATGTAGTTGATTCTGGGTATCCAA 540
Query 547 ATAAACAAGGCTTTTTGGCACCTTATAGATCTTCGCGGAACAGAGTTGTTAAGTATCACA 606
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 541 ATAAACAAGGCTTTTTGGCACCTTATAGGTCTTCGCGGAACGGAGTTGTTAGGTATCACA 600
Query 607 TGTCACAGTTCTACAATGTTCCTTCTCTTAGGAATAAACAAGAGTTGTTTAATCGATGTC 666
| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 601 TATCACAATTCTACAATGGTCCTCCTCCTAGGAATAAACAGGAGTTGTTTAATCGATGTC 660
Query 667 ATGCATGAAAAA-T-CA---ATTGAAAGGACAATTGGAGTTTGAAAGAAAAAATGGAGGA 721
|||||| | | | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 661 ATGCATCTCTACGTTCTGTTATTGAGAGGACATTTGGAGTTTGGAAGAAAAAATGGAGGA 720
Query 722 TTCTTTGTGAATTTCCCAGATATGATATTGATGTTCAAAAAAGAGTGGTAACAATTACAA 781
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 721 TTCTTTGTGAATTTCCCAGATATGATATTGATGTTCAAAAAAGAGTGGTAACGGCTACAA 780
Query 782 TGGGACTATATAATTTTATCAGGATTTCGAATTATTTTGACGAGAATTTTGATGAAGGAA 841
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||
Sbjct 781 TGGGACTACATAATTTTATCAGAATTTCGAATTATTTTGATGAGGATTTTGTTGAAGTAA 840
Query 842 TGAGAAATACAAATATCAACAACGTAAATTCTGAGAATGATCTAGATGACATGGAGAGAG 901
|| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 841 TGGGAGATACAAATATCAACAACATAAATTCTGAGAATGATCTTGATGACATGGAGAGAG 900
Query 902 GTGGTATACCTGATGAAAATTATATGGCAAATATAAGAAAAAATATTGTTGATATGTTAT 961
|| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 901 GTAGTAAACCTGACGGAAATTATATGGCAAATATAAGAGAAAATATTGCTGATATGTTAT 960
Query 962 GGGCAACTCAAAATAC 977
|||||| |||||||||
Sbjct 961 GGGCAAATCAAAATAC 976
> Ahg497217 jgi|Araly1|497217|fgenesh2_kg.61__1__AT5G28667.1
Length=976
Score = 1308 bits (708), Expect = 0.0
Identities = 891/979 (91%), Gaps = 14/979 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 GAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCAATATGTGACATAATGGAAACAAGTTATGGATTAC 69
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Sbjct 1 GAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCATTATGTGACAAAATGGAAACAAGTTATGGATTAC 60
Query 70 AACCTACATTGAATGTTAGCATTGAAGAGTGTGTTGCCATGTTTTTACGGATATGTGGAT 129
|||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AACCTACATTGATTGTTAGCATTGAAGAGAGTGTCGCCATGTTTTTACGGATATGTGGAC 120
Query 130 ACAATGAAGGTCAAAGAGATGTTGGGTTGCGATTTTTTGAAGGCCTTAGAGTGACAAAGT 189
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 121 ACAATGAAGTTCAAAGAGATGTTGGGTTACGATTTTTTGAAGTCCTTAGAGCAACAAAGT 180
Query 190 TACTTGCTTGTGATTGTATCAAGACGCCAACAACACAAGAACTACGTCGAATTCATGAAA 249
||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 181 TACTTACTTGTGATTATATCAAGACTCCAACAAGACAAGAACTACGTCGAATTCCTGAAA 240
Query 250 AAGTACAAATGGATCGAAGATATTGGTCATATTTTAGTG-ATTTGTTGGAGCTATAGATG 308
|| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AACTGCAAATGGATCGAAGATATTGGCCATATTTTAGTGGATTTGTTGGAGCTATAGATG 300
Query 309 GAGTTCATGT--GTGTTAAGGTGAAGCCTAAACTACAAGGAATGTATTGGAATTGACACG 366
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 301 GAGTTCATGTATGTGTTAAGGTGAAGCCTGAACTACAAGGAATGTATTGGAATCGACACG 360
Query 367 ATAGAACATCATTTAATATCATGGCCGTATGTGATATAAATATGTTGTTTTCATATGTTT 426
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 361 ATAGAACATCGTTTAATATCATGGCAATATGTGATATAAATATGTTGTTTACATATGTTT 420
Query 427 GAAATAGAGCACATGGATCGTGTCACGATACAGTAGTTCTAACGATGGTACAAGATAATG 486
| || |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 421 GGAACGGAGCACCTGGATCATGTCACGATACAGCAGTTCTAACGATGGCACAAGATAATG 480
Query 487 ATTATGAATTTCCTTTGCCTCCT-AGACACAAGTATTATGTAGTTGATTTTGGGTATCCA 545
||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 481 ATTATGAATTTCCTTTGCCTC-TGAGAGACAAGTATTATGTAGTTGATTCTGGGTATCCA 539
Query 546 AATAAACAAGGCTTTTTGGCACCTTATAGATCTTCGCGGAACAGAGTTGTTAAGTATCAC 605
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||
Sbjct 540 AATAAACAAAGCTTTTTGGCACCTTATAGATCTTCGCGGAACGGGGTTGTTATGTATCAC 599
Query 606 ATGTCACAGTTCTACAATGTTCCTTCTCTTAGGAATAAACAAGAGTTGTTTAATCGATGT 665
||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ATGTCACAGTTCTACAATGGTCCTCCTCCAAGAAATAAACAAGAGTTGTTTAATCGATGC 659
Query 666 CATGCATGAAAAA-T-CA---ATTGAAAGGACAATTGGAGTTTGAAAGAAAAAATGGAGG 720
||||||| | | | |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 660 CATGCATCTCTACGTTCTGTTATTGAAAGAACATTTGGAGTTTGGAAGAAAAAATGGAGG 719
Query 721 ATTCTTTGTGAATTTCCCAGATATGATATTGATGTTCAAAAAAGAGTGGTAACAATTACA 780
||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 720 ATTCTAAGTGATTTTCCCAGATATGATATTGATGTTAAAAAAAGAGTGGTAATGGCTACA 779
Query 781 ATGGGACTATATAATTTTATCAGGATTTCGAATTATTTTGACGA-GAATTTTGATGAAG- 838
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct 780 ATGGGACTACATAATTTTATCAGAATTTCGAATTATTTTGACGAAGA-TTTTGTTGAAGT 838
Query 839 GAATGAGAAATACAAATATCAACAACGTAAATTCTGAGAATGATCTAGATGACATGGAGA 898
|| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 GA-TGGGAGATACAAATATCAACAACGTAAATTCTGAGAATGATCTAGATGACATGGAGA 897
Query 899 GAGGTGGTATACCTGATGAAAATTATATGGCAAATATAAGAAAAAATATTGTTGATATGT 958
| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 898 GTGATGGTATACCTGATGGAAATCATATGGCAAATATAAGAGAAAATATTGCAGATATGT 957
Query 959 TATGGGCAACTCAAAATAC 977
||||||||| |||||||||
Sbjct 958 TATGGGCAAATCAAAATAC 976
> Ahg494740 jgi|Araly1|494740|fgenesh2_kg.8__556__AT5G28667.1
Length=954
Score = 1254 bits (679), Expect = 0.0
Identities = 880/974 (90%), Gaps = 26/974 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 GAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCAATATGTGACATAATGGAAACAAGTTATGGATTAC 69
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCATTATGTGACAAAATGGAAACAAGTTATGGATTAC 60
Query 70 AACCTACATTGAATGTTAGCATTGAAGAGTGTGTTGCCATGTTTTTACGGATATGTGGAT 129
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Sbjct 61 AACCTACATTGAATGTTAGCATTGAAGAGAGTGTCGCCATGTTTTTACGTATATGTGGAC 120
Query 130 ACAATGAAGGTCAAAGAGATGTTGGGTTGCGATTTTTTGAAGGCCTTAGAGTGACAAAGT 189
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 121 ACAATGAAGTTCAAAGAGATGTTGGGTTACGATTTTTTGAAGTCCTTAGAGCAACAAAGT 180
Query 190 TACTTGCTTGTGATTGTATCAAGACGCCAACAACACAAGAACTACGTCGAATTCATGAAA 249
||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 181 TACTTACTTGTGATTATATCAAGACTCCAACAAGACAAGAACTACGTCGAATTCCTGAAA 240
Query 250 AAGTACAAATGGATCGAAGATATTGGTCATATTTTAGTG-ATTTGTTGGAGCTATAGATG 308
|| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AACTGCAAATGGATCGAAGATATTGGCCATATTTTAGTGGATTTGTTGGAGCTATAGATG 300
Query 309 GAGTTCATGT--GTGTTAAGGTGAAGCCTA-AACTACAAGGAATGTATTGGAATTGACAC 365
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 301 GAGTTCATGTATGTGTTAAGGTGAAGCCTGGAACTACAAGGAATGTATTGGAATCGACAC 360
Query 366 GATAGAACATCATTTAATATCATGGCCGTATGTGATATAAATATGTTGTTTTCATATGTT 425
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 361 GATAGAACATCGTTTAATATCATGGCAATATGTGATATAAATATGTTGTTTACATATGTT 420
Query 426 TGAAATAGAGCACATGGATCGTGTCACGATACAGTAGTTCTAACGATGGTACAAGATAAT 485
|| || |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 421 TGGAACGGAGCACCTGGATCATGTCACGATACAGCAGTTCTAACGATGGCACAAGATAAT 480
Query 486 GATTATGAATTTCCTTTGCCTCCTAGACACAAGTATTATGTAGTTGATTTTGGGTATCCA 545
|||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 481 GATTCTGAATTTCCTTTGCCTCCGAGAGACAAGTATTATGTAGTTGATTCTGGGTATCCA 540
Query 546 AATAAACAAGGCTTTTTGGCACCTTATAGATCTTCGCGGAACAGAGTTGTTAAGTATCAC 605
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||
Sbjct 541 AATAAACAAGGCTTTTTGGCACCTTATAGATCTTCGCGGAACGGGGTTGTTAGGTATCAC 600
Query 606 ATGTCACAGTTCTACAATGTTCCTTCTCTTAGGAATAAACAAGAGTTGTTTAATCGATGT 665
||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ATGTCACAGTTCTACAATGGTCCTCCTCCAAGAAATAAACAAGAGTTGTTTAATCGATGC 660
Query 666 CATGCATGAAAAATCAATTGAAAGGACAATTGGAGTTTGAAAGAAAAAATGGAGGATTCT 725
||||||| | || || | |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CATGCAT-A-----CA-TT----------T-GGAGTTTGGAAGAAAAAATGGAGGATTCT 702
Query 726 TTGTGAATTTCCCAGATATGATATTGATGTTCAAAAAAGAGTGGTAACAATTACAATGGG 785
|||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |
Sbjct 703 AAGTGATTTTCCCAGATATGATATTGATGTTAAAAAAAAAGTGGTAATGGCTACAATGAG 762
Query 786 ACTATATAATTTTATCAGGATTTCGAATTATTTTGACGA-GAATTTTGATGAAG-GAATG 843
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||
Sbjct 763 ACTACATAATTTTATCAGAATTTCGAATTATTTTGACGAAGA-TTTTGTTGAAGTGA-TG 820
Query 844 AGAAATACAAATATCAACAACGTAAATTCTGAGAATGATCTAGATGACATGGAGAGAGGT 903
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 821 GGAGATACAAATATCAACAACGTAAATTCTGAGAATGATCTAGATGACATGGAGAGTGGT 880
Query 904 GGTATACCTGATGAAAATTATATGGCAAATATAAGAAAAAATATTGTTGATATGTTATGG 963
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 881 GGTATACCTGATGGAAATCATATGGCAAATATAAGAGAAAATATTGCAGATATGTTATGG 940
Query 964 GCAACTCAAAATAC 977
|||| |||||||||
Sbjct 941 GCAAATCAAAATAC 954
> Ahg493747 jgi|Araly1|493747|fgenesh2_kg.7__3180__AT5G28667.1
Length=956
Score = 763 bits (413), Expect = 0.0
Identities = 576/652 (88%), Gaps = 22/652 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 347 AATGTATTGGAATTGACACGATAGAACATCATTTAATATCATGGCCGTATGTGATATAAA 406
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 306 AATGTATTGGAATCGACACGATAGAACATCGTTTAATATCATGGTAATATGTGATATAAA 365
Query 407 TATGTTGTTTTCATATGTTTGAAATAGAGCACATGGATCGTGTCACGATACAGTAGTTCT 466
|||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 366 TATGTTGTTTACATATGTTTGGAATGGAGCACCTGGATCGTGTCACGATACAGCAGTTCT 425
Query 467 AACGATGGTACAAGATAATGATTATGAATTTCCTTTGCCTCC--TAGAC-AC------AA 517
||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || ||
Sbjct 426 AACTATGGCACAAGATAATGATTCTGAATTTTCTTTGCCTCCAAGAGACAACTATTATAA 485
Query 518 GTATTATGTAGTTGATTTTGGGTATCCAAATAAACAAGGCTTTTTGGCACCTTATAGATC 577
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486 CTATTATGTAGTTGATTCTGGGTATCCAAATAAACAAGGCTTTTTGGCACCTTATAGATT 545
Query 578 TTCGCGGAACAGAGTTGTTAAGTATCACATGTCACAGTTCTACAATGTTCCTTCTCTTAG 637
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||
Sbjct 546 TTCGCGGAACGGAGTTGTTAAGTATCACATGTCACAGTTCTACAATGGTCCTCCTCCTAG 605
Query 638 GAATAAACAAGAGTTGTTTAATCGATGTCATGCA--TGAAAAATC---AATTGAAAGGAC 692
||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||
Sbjct 606 GAATAAACAGGAGTTGTTTAATCGATGTCATGCATCTCTACGTTCTGTTATTGAGAGGAC 665
Query 693 AATTGGAGTTTGAAAGAAAAAATGGAGGATTCTTTGTGAATTTCCCAGATATGATATTGA 752
| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 666 ATTTGGAGTTTGGAAGAAAAAATGGAGCATTCTTTGTGAA-TTCCCAGATATGATATTGA 724
Query 753 TGTTCAAAAAAGAGTGGTAACAATTACAATGGGACTATATAATTTTATCAGGATTTCGAA 812
||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 725 TGTTCAATAAAGAGTGGTAACGGCTACAATTGGACTACATAATTTTATCAGAATTTCGAA 784
Query 813 TTATTTTGACGAGAATTTTGATGAAGGAATGAGAAATACAAATATCAACAACGTAAATTC 872
||||||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 785 TTATTTTGATGAGGATTTTGTTGAAGTAATGGGAGATAAAAATATCAACAACGTAAATTC 844
Query 873 TGAGAATGATCTAGATGACATGGAGAGAGGT-G--G-TA-TA--CCTGATGAAAATTATA 925
|||||||||||| |||||||||||||||||| | | || || ||||| | |||| |||
Sbjct 845 TGAGAATGATCTTGATGACATGGAGAGAGGTAGTAGGTAGTATACCTGACGGAAATCATA 904
Query 926 TGGCAAATATAAGAAAAAATATTGTTGATATGTTATGGGCAACTCAAAATAC 977
|||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 905 TGGCAAATATAAGAGAAAATATTGCTGATATGTTATGGGCAAATCAAAATAC 956
Score = 311 bits (168), Expect = 7e-84
Identities = 267/313 (85%), Gaps = 14/313 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 GAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCAATATGTGACATAATGGAAACAAGTTATGGATTAC 69
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1 GAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCATTATGTGACATAATGGAAACACGTTATGGATTAC 60
Query 70 AACCTACATTGAATGTTAGCATTGAAGAGTGTGTTGCCATGTTTTTACGGATATGTGGAT 129
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AACCTACATTGAATGTTCGCATTGAAGAGAGTGTTGTCATGTTTTTACGGATATGTGGAC 120
Query 130 ACAATGAAGGTCAAAGAGATGTTGGGTTGCGATTTTTT-GAAGGCCTTAGA--GTGACAA 186
||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || | | |||| |
Sbjct 121 ACAATGAAGTTCAAAGAGATGTTGGGTTACGATTTGGACGAACGCAAGAAACAGTGA-AT 179
Query 187 AGTTACTTGCTTGTGATTGTA-TCAAGACGCCAACA-ACACAAGAACTACGTCGAATTCA 244
| | || || ||| || | | || || |||| | |||||||||||||| |||||
Sbjct 180 CGGAAATTT-TT-TGAA-GTCCTTA-GA-GC-AACAGA-ACAAGAACTACGTCAAATTCC 232
Query 245 TGAAAAAGTACAAATGGATCGAAGATATTGGTCATATTTTAGTG-ATTTGTTGGAGCTAT 303
||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 233 TGAAAAACTACAAATGGATAGAAGATATTGGCCATATTTCAGTGTATTTGTTGGAGCTAT 292
Query 304 AGATGGAGTTCAT 316
||||| |||||||
Sbjct 293 AGATGAAGTTCAT 305
> Ahg949069 jgi|Araly1|949069|scaffold_800956.1
Length=1823
Score = 510 bits (276), Expect = 7e-144
Identities = 377/423 (89%), Gaps = 18/423 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 161 ATTTTTTGAAGGCCTTAGAGTGACAAAGTTACTTGCTTGTGATTGTATCAAGACGCCAAC 220
||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1212 ATTTTTTGAAGTCCTTAGAGCGACAGAGTTACTTGCTTGTGATTATATCAAGACTCCAAC 1271
Query 221 AACACAAGAACTACGTCGAATTCATGAAAAAGTACAAATGGATCGAAGATATTGGTCATA 280
|| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 1272 AAGACAAGAACTACGTCGAATTCCTAAAAAACTACAAAGGGATCGAAGATATTGGCCATA 1331
Query 281 TTTTAGT-GATTTGTTGGAGCTATAGATGGAGTTCATG--TGTGTTAAGGTGAAGCCTAA 337
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 1332 TTTCAGTGGATTTGTTGGAGCTATAGATGGAGTTCATGTATGTGTTAAGGTGAAGCCTGA 1391
Query 338 ACTACAAGGAATGTATTGGAATTGACACGATAGAACATCATTTAATATCATGGCCGTATG 397
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1392 ACTACAAGGAATGTATTGGAATCGACACGATAGAACATCGTTTAATATCATGGCAATATG 1451
Query 398 TGATATAAATATGTTGTTTTCATATGTTTGAAATAGAGCACATGGATCGTGTCACGATAC 457
||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1452 TGATATAAATATGTTGTTTACATATGTTTGGAATGGAGCACCTGGATCGTGTCACGATAC 1511
Query 458 AGTAGTTCTAACGATGGTACAAGATAATGATTATGAATTTCCTTTGCCTCCTAGACACAA 517
|| |||||||||||||| ||||||| | || || ||| || ||| | ||
Sbjct 1512 AGCAGTTCTAACGATGGCACAAGATC-T--TT-TG-----CCT---CCA---AGAGATAA 1556
Query 518 GTATTATGTAGTTGATTTTGGGTATCCAAATAAACAAGGCTTTTTGGCACCTTATAGATC 577
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 GTATTATGTAGTTGATTCTGGGTATCCAAATAAACAAGGCTTTTTGGCACCTTATAGATC 1616
Query 578 TTC 580
|||
Sbjct 1617 TTC 1619
Score = 244 bits (132), Expect = 7e-64
Identities = 169/187 (90%), Gaps = 2/187 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 805 ATTTCGAATTATTTTGACGAGAATTTTGATGAAGGAATGAGAAATACAAATATCAACAAC 864
||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1621 ATTTCGAATTATTTTGATGAGGATTTTGTTGAAGTAATGGGAGATACAAATATCAACAAC 1680
Query 865 GTAAATTCTGAGAATGATCTAGATGACATGGAGAGAGGTGGTATACCTGATGAAAATTAT 924
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||
Sbjct 1681 GTAAATTCTGAGAATGATCTTGATGACATGGAGAGAGGTAGTATACCTGACGGAAATCAT 1740
Query 925 ATGGCAAATATAAGAAAAAATATTGTTGATATGTTATGGGCAACTCAAAATACACTTTTC 984
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
Sbjct 1741 ATGGCAAATATAAGAGAAAATATTGCTGATATGTTATGGGCAAATCAAAATAC--TTTCC 1798
Query 985 GTTAAAT 991
||||||
Sbjct 1799 ATTAAAT 1805
Score = 239 bits (129), Expect = 3e-62
Identities = 152/163 (93%), Gaps = 2/163 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 GTTAC-A-GAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCAATATGTGACATAATGGAAACAAGTTA 61
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Sbjct 1020 GTTACTACGAATGTCTCTTGATTGTTTTAGATCATTATGTGACGTAATGGAAATACGTTA 1079
Query 62 TGGATTACAACCTACATTGAATGTTAGCATTGAAGAGTGTGTTGCCATGTTTTTACGGAT 121
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Sbjct 1080 TGGATTACAACCTACATTGAATGTTAGCATTGAAAAGAGTGTTGCCATGTTTTTACGGAT 1139
Query 122 ATGTGGATACAATGAAGGTCAAAGAGATGTTGGGTTGCGATTT 164
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Sbjct 1140 ATGTGGACACAATGAAGTTCAAAGAGATGTTGGGTTACGATTT 1182
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
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Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5