BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT5G35190.1

Length=987
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg916456 jgi|Araly1|916456|Al_scaffold_0008_1207                    645    0.0   
  Ahg323992 jgi|Araly1|323992|fgenesh1_pm.C_scaffold_5001536           499    1e-140
  Ahg940106 jgi|Araly1|940106|scaffold_600650.1                        481    5e-135
  Ahg355525 jgi|Araly1|355525|fgenesh1_pg.C_scaffold_7002698           435    4e-121
  Ahg912232 jgi|Araly1|912232|Al_scaffold_0001_2486                    370    1e-101
  Ahg931786 jgi|Araly1|931786|scaffold_304243.1                        313    2e-84 
  Ahg347221 jgi|Araly1|347221|fgenesh1_pg.C_scaffold_5000613           244    7e-64 
  Ahg938381 jgi|Araly1|938381|scaffold_502572.1                        233    2e-60 
  Ahg347223 jgi|Araly1|347223|fgenesh1_pg.C_scaffold_5000615           220    1e-56 
  Ahg327089 jgi|Araly1|327089|fgenesh1_pm.C_scaffold_6002309          67.6    2e-10 


> Ahg916456 jgi|Araly1|916456|Al_scaffold_0008_1207
Length=789

 Score =  645 bits (349),  Expect = 0.0
 Identities = 561/664 (84%), Gaps = 12/664 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  20   TGGTTTATGTCGTGGTCTTAAGTGCCATTGCAGCTACAGTGACAGCATACCCTTACTCAT  79
            ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct  20   TGGTTTATGTCGTGGTCCTAAGTGCCATTGCAGCTACAGTGACATCGTACCCTTACTCAT  79

Query  80   C-CCATCAAACACCACAATACAATTCTCC-AGTCCACAAACACGAATCATCTTATTCACC  137
            | || |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||| | ||| ||||
Sbjct  80   CTCC-TCAAACACCACAATACAATTCTCCAAG-CCATGAACACAAATCACCATATCCACC  137

Query  138  TAAAAAGTATTCCCCATACTACTCGGCATCACCACTACCTCCACTACAATATAGAAGACA  197
            |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||
Sbjct  138  TAAAAAGTATTCCCCATACTACTCAGCATCACCACCACCTTCACCACAATATCGAAGACA  197

Query  198  AGGCCCTAAGTACACGCCACATCCAAAACCGTATCTTTTCAACTCTCCACCACCACCTTA  257
            |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||  || ||||| || || ||
Sbjct  198  AGGCCCTAAGTACACGCCACATCCAACACCATATCTCTACAGTTCCCCACCTCCTCCATA  257

Query  258  TTACTCTCCTTCTCCAAAGGAA-GACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACT  316
             |||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| || || |||| ||
Sbjct  258  CTACTCTCCTTCTCCAAAG-ATTGAGTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTTTACAGCT  316

Query  317  CTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAAG-TAGACTACAAATCTCCTCCACCA  375
            | ||||| || || || ||||| |||||||| |||| | || ||||| || || ||||| 
Sbjct  317  CCCCACCTCCTCCATACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTGAGTACAAGTCCCCACCACCG  375

Query  376  CCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGAATAC  435
            || |||||||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct  376  CCGTACGTCTACAGCTCCCCACCTCCTCCATACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGAGTAC  435

Query  436  AAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCTTTCT  495
            ||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||| || || || ||||||| ||||
Sbjct  436  AAGTCCCCACCACCGCCGTACGTCTACAGCTCTCCACCTCCTCCATACTACTCTCCTTCT  495

Query  496  CCTAAAG-TAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACC  554
            || |||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || ||
Sbjct  496  CC-AAAGGTGGAGTACAAGTCCCCACCACCGCCGTACGTTTACAGCTCCCCACCTCCTCC  554

Query  555  TTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCACCACCATACGTCTACAA  614
             || |||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||| |||||||||||
Sbjct  555  ATACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGAGTACAAGTCCCCACCACCACCGTACGTCTACAA  614

Query  615  CTCTCCATCACCACCATATTACTCTCCTTCTCCTAAAGTAGACT-ACAAGTCTCCACCAC  673
            ||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||| |||| ||||| ||||
Sbjct  615  CTCCCCACCTCCTCCATACTACTCTCCTTCCCCTAAGGTC-ACTTACAAATCTCCCCCAC  673

Query  674  CACC  677
            ||||
Sbjct  674  CACC  677


> Ahg323992 jgi|Araly1|323992|fgenesh1_pm.C_scaffold_5001536
Length=1107

 Score =  499 bits (270),  Expect = 1e-140
 Identities = 450/537 (84%), Gaps = 12/537 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  225  ACCGTATCTTTTCAACTCTCCACCACCACCTTA-TTACTCTCCTTCTCCAAAGGAAGACT  283
            ||||||| ||| ||  || ||||| |||||  |  ||||| || |||||  | | ||| |
Sbjct  168  ACCGTATGTTTACAGTTCGCCACCCCCACC-AACCTACTCACCCTCTCC--A-GTAGAAT  223

Query  284  ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTT  343
            |||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct  224  ACAAGTCTCCTCCACCACCGTACGTATACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCCCCTT  283

Query  344  CTCCTAAA-GTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCA  402
            | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||
Sbjct  284  CGCC-AAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGTTCCCCACCACCA  342

Query  403  CCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTAC  462
            || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct  343  CCATACTACTCGCCTTCCCCTAAGGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTCTAC  402

Query  463  AACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCTTTCTCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACCA  522
            |  |||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct  403  AGTTCTCCACCACCACCATACTACTCGCCTTCCCCTAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCA  462

Query  523  CCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGAC  582
            ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||
Sbjct  463  CCACCGTACGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATATTATTCACCTTCCCCTAAGGTATAC  522

Query  583  TACAAGTTTTCACCACCACCA-TA-C-GTCTACAACTCTCCATCACCACCATATTACTCT  639
            || || | | ||||||||||  || | |||||||  |||||| ||||||| || ||||||
Sbjct  523  TATAAATCTCCACCACCACCGCTAGCCGTCTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTACTCT  582

Query  640  CCTTCTCCTAAAGTAG-ACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACC  698
            ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||
Sbjct  583  CCTTCACCTAAAGT-GTACTATAAGTCTCCACCACCACCATATGTGTACAGCTCTCCACC  641

Query  699  ACCACCTTATTTCTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTATAAATCTCCTCCACCACCATA  755
            |||||| || | ||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||
Sbjct  642  ACCACCATACTACTCACCTTCTCCTAAGGTATACTACAAGTCTCCACCACCACCATA  698


 Score =  279 bits (151),  Expect = 2e-74
 Identities = 281/342 (82%), Gaps = 16/342 (5%)
 Strand=Plus/Plus

Query  495  TCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATAC-GTCTACAACTCTCCACCACCAC  553
            ||||||||| || ||| || |||| |||| ||||| | |||||||  |||||||||||||
Sbjct  63   TCCTAAAGTTGAATACGAGACTCCTCCACTACCAT-CAGTCTACAGTTCTCCACCACCAC  121

Query  554  CTTATTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCACCACCATACGTCTAC  612
            ||||||| || || ||||| ||| || |||||||||| | | |||||||| || || |||
Sbjct  122  CTTATTATTCACCGTCTCCTAAA-GTTGACTACAAGTCTCCTCCACCACCGTATGTTTAC  180

Query  613  AACTCTCCATCACCACCATA-TTACTCTCCTTCTCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACC  671
            |  || ||| | |||||| |  ||||| || |||||   |||||| ||||||||||| ||
Sbjct  181  AGTTCGCCACCCCCACCA-ACCTACTCACCCTCTCC---AGTAGAATACAAGTCTCCTCC  236

Query  672  ACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTTCTCTCCTTCTCCAAAGGTAGA  731
            |||||| ||||| ||||  |||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||
Sbjct  237  ACCACCGTACGTATACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCCCCTTCGCCAAAGGTAGA  296

Query  732  CTATAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCACCTCCACCATACTATTC  791
            ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||
Sbjct  297  CTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGTTCCCCACCACC---ACCATACTACTC  353

Query  792  TCCTTCTCCAGAAG-TCAG-CTACAAGTCTCCACCACCTCCA  831
             ||||| ||  ||| | || |||||||||||| ||||| |||
Sbjct  354  GCCTTCCCCT-AAGGT-AGACTACAAGTCTCCTCCACCACCA  393


 Score =  248 bits (134),  Expect = 5e-65
 Identities = 425/557 (76%), Gaps = 54/557 (10%)
 Strand=Plus/Plus

Query  241   TCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGAAGACTACAAGTCTCCACCACCA  300
             |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||| | |||| || ||||||||||||
Sbjct  481   TCTCCACCACCACCATATTATTCACCTTCCCCTAAGGTATACTATAAATCTCCACCACCA  540

Query  301   CC-ATA--TGTCTACAACTCTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAAGTAG-A  356
             ||  ||   |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |
Sbjct  541   CCGCTAGCCGTCTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTACTCTCCTTCACCTAAAGT-GTA  599

Query  357   CTACAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCC  416
             ||| || ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct  600   CTATAAGTCTCCACCACCACCATATGTGTACAGCTCTCCACCACCACCATACTACTCACC  659

Query  417   TTCTCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTAC-AACTCTCCACCAC  475
             |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||  || || | ||  
Sbjct  660   TTCTCCTAAGGTATACTACAAGTCTCCACCACCACCATA---CTACTCAC-CTTCGCC-T  714

Query  476   CACCT-TATTAC---TCTCTTTCTCCTAAAGTA-GACTACAAG-TCTCCACCACCACCAT  529
              |  | ||||||   ||||   | || |  ||| | |||| || ||||||||||||||||
Sbjct  715   AAGGTGTATTACAAGTCTCCACCACC-ACCGTATGTCTAC-AGCTCTCCACCACCACCAT  772

Query  530   ACGT-CTACAAC-TCTCC--------AC--C--A---CCACC-T--TATTACTCTCCTTC  569
             || | || || | || ||        ||  |  |   ||||| |  || ||||| |||||
Sbjct  773   AC-TACT-CACCTTCGCCTAAGGTGTACTACAAATCTCCACCATCATACTACTCACCTTC  830

Query  570   TCCAAAGGTAG-ACTACAAGTTTTCACCACCA--C-CA--TACGTCTACAACTCTCCATC  623
             ||| ||||| | ||||||| | | ||||| ||  | ||  || || |    | | ||| |
Sbjct  831   TCCTAAGGT-GTACTACAAATCTCCACCA-CATCCTCATGTATGTGTTTGTC-CACCACC  887

Query  624   ACCACCATATTACTCTCCTTCTCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGT  683
              || |||| ||| ||||| || ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  888   TCCTCCATGTTATTCTCCATCCCCTAAGGTTGTGTACAAGTCTCCTCCACCACCATACGT  947

Query  684   CTACAACTCTCCACCACCACCTTA-TTTCTCTCCTTCTCCAAAGGTAG-ACTATAAATCT  741
             ||| |  |||||||||||||| || | | || || || ||||| || | |||||||||||
Sbjct  948   CTATAGTTCTCCACCACCACCATACTAT-TCACCATCCCCAAAAGT-GTACTATAAATCT  1005

Query  742   CCTCCACCACCATATGT  758
             |||||||||||||||||
Sbjct  1006  CCTCCACCACCATATGT  1022


> Ahg940106 jgi|Araly1|940106|scaffold_600650.1
Length=814

 Score =  481 bits (260),  Expect = 5e-135
 Identities = 426/505 (84%), Gaps = 16/505 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  191  GAAGAC-AAGGCCCTAAGTACACGCCACATCCAAAACCGTATCTTTTCAACTCTCCACCA  249
            ||| || || ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||  || ||||||
Sbjct  162  GAACACAAAAGCCCTAAGTATGCGCCACATCCAAAACCATATGTTTACAGTTCCCCACCA  221

Query  250  CCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGAAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTC  309
            ||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct  222  CCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTC  281

Query  310  TACAACTCTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAATCTCC  368
            |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||| ||  | |
Sbjct  282  TACAGCTCCCCACCCCCACCGTATTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTTACTAC-AA-GT-C  337

Query  369  TCCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGT  428
            |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||
Sbjct  338  TCCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCATCTCCAAAGGT  397

Query  429  AGAATACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTC  488
              | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||
Sbjct  398  TTACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTC  457

Query  489  TCTTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCAC  547
            || |||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct  458  TCCTTCTCC-AAAGGTTTATTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCAC  516

Query  548  CACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCACCACCATACG  607
            | ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct  517  CTCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTACTACAAGTCTCCACCACCACCATACG  576

Query  608  TCTACAACTCTCCATCACCACCATATTACTCTCCTTCTCCTAA--AGTA-GACTACAAGT  664
            |||| | ||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||  | || | ||||| | 
Sbjct  577  TCTATAGCTCCCCACCCCCACCGTATTACTCTCCATCTCC-AACCA-TACGTCTACA-G-  632

Query  665  CTCCACCACCACCATACGTCTACAA  689
            |||| ||||||||||| || |||||
Sbjct  633  CTCC-CCACCACCATATGTTTACAA  656


 Score =  442 bits (239),  Expect = 2e-123
 Identities = 394/468 (84%), Gaps = 13/468 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  300  ACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAA-GTAGACT  358
            ||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||  |||
Sbjct  197  ACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTTACT  255

Query  359  ACAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTT  418
            |||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct  256  ACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTATTACTCTCCTT  315

Query  419  CTCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCAC  478
            ||||||||||  | |||||||||   ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||
Sbjct  316  CTCCAAAGGTTTACTACAAGTCT---CCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC  372

Query  479  CTTATTACTCTCTTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTAC  537
            | || |||||||  ||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  373  CGTACTACTCTCCATCTCC-AAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC  431

Query  538  AACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCA  597
            | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||
Sbjct  432  AGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTATTACAAGTCTCCACCA  491

Query  598  CCACCATACGTCTACAACTCTCCATCACCACCATATTACTCTCCTTCTCCTAAA-GTAGA  656
            |||||||||||||||| ||| ||| | ||||| || |||||||||||||| ||| ||  |
Sbjct  492  CCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTTA  550

Query  657  CTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTTCTCTCC  716
            |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||| ||||||
Sbjct  551  CTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTATAGCTCCCCACCCCCACCGTATTACTCTCC  610

Query  717  TTCTCCAAAGGTA-GACTATAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACA  763
             |||||||   || | ||| |   |||| |||||||||||||| ||||
Sbjct  611  ATCTCCAACCATACGTCTACAG--CTCC-CCACCACCATATGTTTACA  655


 Score =  418 bits (226),  Expect = 4e-116
 Identities = 363/429 (85%), Gaps = 10/429 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  375  ACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGAATA  434
            |||||| || ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||
Sbjct  197  ACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTACTA  256

Query  435  CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCTTTC  494
            |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||
Sbjct  257  CAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTATTACTCTCCTTC  316

Query  495  TCCTAAA-GTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCAC  553
            ||| ||| ||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||
Sbjct  317  TCC-AAAGGTTTACTACAAGTCT---CCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCAC  372

Query  554  CTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCACCACCATACGTCTACA  613
            | || |||||||| |||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||
Sbjct  373  CGTACTACTCTCCATCTCCAAAGGTTTACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACA  432

Query  614  ACTCTCCATCACCACCATATTACTCTCCTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAGTCTCCACCA  672
             ||| ||| | ||||| || |||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||
Sbjct  433  GCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTTATTACAAGTCTCCACCA  491

Query  673  CCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTTCTCTCCTTCTCCAAAGGTAGAC  732
            |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||  ||
Sbjct  492  CCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTAC  551

Query  733  TATAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCACCTCCACCATACTATTCT  792
            || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| || || |||
Sbjct  552  TACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTATAGCTCCCCACC-CC-C-ACCGTATTACTCT  608

Query  793  CCTTCTCCA  801
            || ||||||
Sbjct  609  CCATCTCCA  617


 Score =  355 bits (192),  Expect = 3e-97
 Identities = 318/378 (84%), Gaps = 11/378 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  240  CTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGAAGACTACAAGTCTCCACCACC  299
            ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||   |||||
Sbjct  287  CTCCCCACCCCCACCGTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTTACTACAAGTCT---CCACC  343

Query  300  ACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAA-GTAGACT  358
            |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| ||  |||
Sbjct  344  ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCATCTCC-AAAGGTTTACT  402

Query  359  ACAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTT  418
            |||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct  403  ACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT  462

Query  419  CTCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCAC  478
            ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||
Sbjct  463  CTCCAAAGGTTTATTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCAC  522

Query  479  CTTATTACTCTCTTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTAC  537
            | || ||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  523  CGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTTACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTAT  581

Query  538  AACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTA-GACTACAAGTTTTCACC  596
            | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||   || | ||||| | |  | ||
Sbjct  582  AGCTCCCCACCCCCACCGTATTACTCTCCATCTCCAACCATACGTCTACA-GCTC-C-CC  638

Query  597  ACCACCATACGTCTACAA  614
            ||||||||| || |||||
Sbjct  639  ACCACCATATGTTTACAA  656


> Ahg355525 jgi|Araly1|355525|fgenesh1_pg.C_scaffold_7002698
Length=405

 Score =  435 bits (235),  Expect = 4e-121
 Identities = 315/354 (89%), Gaps = 4/354 (1%)
 Strand=Plus/Minus

Query  403  CCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTAC  462
            |||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  352  CCTTATTATTCGCCTTTTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTAC  293

Query  463  AACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCTTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAGTCTCCACC  521
            |  ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||
Sbjct  292  AGTTCTCCACCACCTCCTTATTATTCTCCTTCTCC-AAATGTTGACTACAAGTCTCCACC  234

Query  522  ACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGA  581
            |||||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct  233  ACCACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCTCTTTATTACTCTCCTTCTCCGAAGGTTGA  174

Query  582  CTACAAGTTTTCACCACCACCATACGTCTACAACT-CTCCATCACCACCATATTACTCTC  640
            |||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| || ||||||||||
Sbjct  173  CTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA-CTTCCCCACCACCTCCTTATTACTCTC  115

Query  641  CTTCTCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCAC  700
            |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct  114  CTTCTCCTAAGGTAGACTACAAGGCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCAC  55

Query  701  CACCTTATTTCTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTATAAATCTCCTCCACCACCAT  754
            | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct  54   CTCCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCAT  1


 Score =  418 bits (226),  Expect = 4e-116
 Identities = 311/352 (88%), Gaps = 6/352 (2%)
 Strand=Plus/Minus

Query  331  TATTACTCCCCTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAA  389
            ||||| || |||| ||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| 
Sbjct  349  TATTATTCGCCTTTTCC-AAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAG  291

Query  390  CTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCACC  449
             ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct  290  TTCTCCACCACCTCCTTATTATTCTCCTTCTCCAAATGTTGACTACAAGTCTCCACCACC  231

Query  450  ACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCTTTCTCCTAAAGTAGACTA  509
            |||||| || |||| ||| |||||||| | ||||||||||| |||||| || || |||||
Sbjct  230  ACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCTCTTTATTACTCTCCTTCTCCGAAGGTTGACTA  171

Query  510  CAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACT-CTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTT  568
            ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  170  CAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA-CTTCCCCACCACCTCCTTATTACTCTCCTT  112

Query  569  CTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCATCACCAC  628
            |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |
Sbjct  111  CTCCTAAGGTAGACTACAAGGCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCACCTC  52

Query  629  CATATTACTCTCCTTCTCCTAAAG-TAGACTACAAGTCTCCACCACCACCAT  679
            | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  51   CTTATTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCAT  1


 Score =  385 bits (208),  Expect = 4e-106
 Identities = 311/359 (87%), Gaps = 13/359 (4%)
 Strand=Plus/Minus

Query  478  CCTTATTACTC-TCTTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCT  535
            |||||||| ||  |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  CCTTATTATTCGCCTTT-TCC-AAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCT  295

Query  536  ACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCAC  595
            |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||
Sbjct  294  ACAGTTCTCCACCACCTCCTTATTATTCTCCTTCTCCAAATGTTGACTACAAGTCTCCAC  235

Query  596  CACCACCATACGTCTACAACTCTCCATCACCACCATATTACTCTCCTTCTCCTAAAGTAG  655
            ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||| || || |
Sbjct  234  CACCACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCTCTTTATTACTCTCCTTCTCCGAAGGTTG  175

Query  656  ACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACT-CTCCACCACCACCTTATTTCTCT  714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||
Sbjct  174  ACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA-CTTCCCCACCACCTCCTTATTACTCT  116

Query  715  CCTTCTCCAAAGGTAGACTATAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCA  774
            |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  115  CCTTCTCCTAAGGTAGACTACAAGGCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCA  56

Query  775  CCTCCACCATACTATTCTCCTTCTCCAGAAG-TC-AGCTACAAGTCTCCACCACCTCCA  831
            |||||   ||  || |||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||| |||
Sbjct  55   CCTCCTT-AT--TACTCTCCTTCTCCA-AAGGTTGA-CTACAAGTCTCCACCACCACCA  2


 Score =  279 bits (151),  Expect = 2e-74
 Identities = 241/283 (85%), Gaps = 11/283 (4%)
 Strand=Plus/Minus

Query  553  CCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCACCACCATACGTCTAC  612
            |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct  352  CCTTATTATTCGCCTTTTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTAC  293

Query  613  AACTCTCCATCACCACCATATTACTCTCCTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAGTCTCCACC  671
            |  |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||
Sbjct  292  AGTTCTCCACCACCTCCTTATTATTCTCCTTCTCC-AAATGTTGACTACAAGTCTCCACC  234

Query  672  ACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTTCTCTCCTTCTCCAAAGGTAGA  731
            |||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||
Sbjct  233  ACCACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCTCTTTATTACTCTCCTTCTCCGAAGGTTGA  174

Query  732  CTATAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGCT-CCCCACCACCTCCACCATACTATT  790
            ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||   ||  || |
Sbjct  173  CTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACA-CTTCCCCACCACCTCCTT-AT--TACT  118

Query  791  CTCCTTCTCCAGAAG-TCAG-CTACAAGTCTCCACCACCTCCA  831
            ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||||| |||
Sbjct  117  CTCCTTCTCCT-AAGGT-AGACTACAAGGCTCCACCACCACCA  77


 Score =  196 bits (106),  Expect = 2e-49
 Identities = 174/205 (85%), Gaps = 11/205 (5%)
 Strand=Plus/Minus

Query  631  TATTACTCTCCTTCTCCTAAA-GTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAA  689
            ||||| || |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  349  TATTATTCGCCTTTTCC-AAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAG  291

Query  690  CTCTCCACCACCACCTTATT-TCTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTATAAATCTCCTCCAC  748
             ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||
Sbjct  290  TTCTCCACCACCTCCTTATTAT-TCTCCTTCTCCAAATGTTGACTACAAGTCTCCACCAC  232

Query  749  CACCATATGTCTACAGCTCCCCACCACCTCCACCATACTATTCTCCTTCTCCAGAAG-TC  807
            ||||||| || |||||||||||||||||||    ||  || ||||||||||| |||| | 
Sbjct  231  CACCATACGTTTACAGCTCCCCACCACCTCTTT-AT--TACTCTCCTTCTCC-GAAGGTT  176

Query  808  -AGCTACAAGTCTCCACCACCTCCA  831
             | |||||||||||||||||| |||
Sbjct  175  GA-CTACAAGTCTCCACCACCACCA  152


> Ahg912232 jgi|Araly1|912232|Al_scaffold_0001_2486
Length=732

 Score =  370 bits (200),  Expect = 1e-101
 Identities = 369/449 (82%), Gaps = 18/449 (4%)
 Strand=Plus/Plus

Query  242  CTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGAAGACTACAAGTCTCCACCACCAC  301
            ||||||||||||| || ||||| || || || ||||  |||||||| ||||||||| |||
Sbjct  275  CTCCACCACCACCATACTACTCACCATCCCCTAAGGTTGACTACAAATCTCCACCAACAC  334

Query  302  CATATGTCTACA--ACT-CTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAA-GTAGAC  357
            ||||||||||||   || |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| || || 
Sbjct  335  CATATGTCTACAGTTCTCCTCCCCCACCACCATATTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTGAG  393

Query  358  TACAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCA--C-CTTATTACTCT  414
            ||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||  | | || ||||||
Sbjct  394  TACAAATCTCCTCGACCAGCATATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCCACGTACTACTCT  453

Query  415  CCTTCTCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCA  474
            |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  CCTTCTCCAAAGGTTGAATACAAATCTCCACCACCTCCATATGTCTACAACTCTCCACCA  513

Query  475  CCACCTT-ATTACTCTCTTTCTCCTAAAG-TAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACG  532
            |||||   || | ||||  ||||| |||| | || ||||| ||||| || |||||||| |
Sbjct  514  CCACCGGCAT-ATTCTCCATCTCC-AAAGGTTGAGTACAAATCTCCTCCTCCACCATATG  571

Query  533  TCTACAACTCTCCACCACCACCTT-ATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTT  591
            |||||| ||||||||| |||||   || | ||||| ||||||||||| || ||||| | |
Sbjct  572  TCTACAGCTCTCCACCTCCACCGGCAT-ATTCTCCATCTCCAAAGGTTGAGTACAAATCT  630

Query  592  TCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCATCACCACCAT-ATTACTCTCCTTCTCCTAA  650
             | || |||||||| || |||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||
Sbjct  631  CCTCCCCCACCATATGTTTACAGCTCTCCACCACCACCATCAT-ACTCCCCTTCTCCAAA  689

Query  651  AG-TAGACTACAAGTCTCCACCACCACCA  678
            |  | || ||||| ||||| || || |||
Sbjct  690  AACT-GAATACAAATCTCCTCCTCCCCCA  717


 Score =  252 bits (136),  Expect = 4e-66
 Identities = 245/296 (83%), Gaps = 13/296 (4%)
 Strand=Plus/Plus

Query  241  TCTCCACCACCA--C-CTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGAAGACTACAAGTCTCCACCA  297
            ||||||||||||  | | || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||
Sbjct  427  TCTCCACCACCACCCACGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGAATACAAATCTCCACCA  486

Query  298  CCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCGT-ATTACTCCCCTTCTCCTAAAG-TAG  355
            || ||||||||||||||||||||||||||||||  || | || || ||||| |||| | |
Sbjct  487  CCTCCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCGGCAT-ATTCTCCATCTCC-AAAGGTTG  544

Query  356  ACTACAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTT-ATTACTCT  414
            | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||   || | |||
Sbjct  545  AGTACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTCTACAGCTCTCCACCTCCACCGGCAT-ATTCT  603

Query  415  CCTTCTCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCA  474
            || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct  604  CCATCTCCAAAGGTTGAGTACAAATCTCCTCCCCCACCATATGTTTACAGCTCTCCACCA  663

Query  475  CCACCTT-ATTACTCTCTTTCTCCTAAAG-TAGACTACAAGTCTCCACCACCACCA  528
            ||||| | || |||| | |||||| |||  | || ||||| ||||| || || |||
Sbjct  664  CCACCATCAT-ACTCCCCTTCTCCAAAAACT-GAATACAAATCTCCTCCTCCCCCA  717


> Ahg931786 jgi|Araly1|931786|scaffold_304243.1
Length=472

 Score =  313 bits (169),  Expect = 2e-84
 Identities = 237/270 (88%), Gaps = 4/270 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  197  AAGGCCCTAAGTACACGCCACATCCAAAACCGTATCTTTTCAACTCTCCACCACCACCTT  256
            |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||| |
Sbjct  169  AAGGCCCTAAATACGCGCCACATCCAAAACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCAT  228

Query  257  ATTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGAAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAAC  315
            | ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  229  ACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGC  287

Query  316  TCTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAAG-TAGACTACAAATCTCCTCCACC  374
            || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||| || || |||||
Sbjct  288  TCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACC  346

Query  375  ACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGAATA  434
            |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||
Sbjct  347  ACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTA  406

Query  435  CAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAA  464
            |||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct  407  CAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAA  436


 Score =  283 bits (153),  Expect = 1e-75
 Identities = 213/242 (88%), Gaps = 4/242 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  375  ACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTAC-TCTCCTTCTCCAAAGGTAGAAT  433
            |||||| || |||| ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||| || |
Sbjct  197  ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT  255

Query  434  ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCTTT  493
            |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||| ||
Sbjct  256  ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCCCCACCGTACTACTCTCCTT  315

Query  494  CTCCTAAAG-TAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCA  552
            |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||
Sbjct  316  CTCC-AAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCCCCA  374

Query  553  CCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCACCACCATACGTCTAC  612
            || || |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||
Sbjct  375  CCGTACTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGACTACAAGTCCCCACCACCACCATACGTCTAC  434

Query  613  AA  614
            ||
Sbjct  435  AA  436


 Score =  148 bits (80),  Expect = 6e-35
 Identities = 135/160 (84%), Gaps = 9/160 (6%)
 Strand=Plus/Plus

Query  675  ACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTTC-TCTCCTTCTCCAAAGGTAGACT  733
            |||||| || |||| ||||||||| ||||| || | | || |||||||||||||| ||||
Sbjct  197  ACCATATGTTTACAGCTCTCCACCCCCACCATACTACTTC-CCTTCTCCAAAGGTTGACT  255

Query  734  ATAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCACCTCCACCATACTATTCTC  793
            | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||
Sbjct  256  ACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACC-CC-C-ACCGTACTACTCTC  312

Query  794  CTTCTCCAGAAG-TC-AGCTACAAGTCTCCACCACCTCCA  831
            |||||||| ||| |  | ||||||||| |||||||| |||
Sbjct  313  CTTCTCCA-AAGGTTGA-CTACAAGTCCCCACCACCACCA  350


> Ahg347221 jgi|Araly1|347221|fgenesh1_pg.C_scaffold_5000613
Length=834

 Score =  244 bits (132),  Expect = 7e-64
 Identities = 298/375 (79%), Gaps = 23/375 (6%)
 Strand=Plus/Plus

Query  470  CACCACCACCTTATTACTCT--CTTTCTCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACC  527
            |||||||||| |||| || |  |  | |||||||||||| ||||| ||||| |||| | |
Sbjct  92   CACCACCACCATATT-CTGTACCACT-TCCTAAAGTAGAATACAAATCTCCTCCACTAAC  149

Query  528  ATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTAGACTACA  586
            | | || ||||  |||||||||||||| |||||||||||  | || ||| || ||||| |
Sbjct  150  AGATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCAGCGCCTAAA-GTTGACTATA  208

Query  587  AGTTTTCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCATCACCA---CCATATTACTCTCCTT  643
            | | | | ||||||||||| || ||||  || ||| |||||   |||||||||||||| |
Sbjct  209  AATCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCACCACCACCACCGCCATATTACTCTCCAT  268

Query  644  CTCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCA-  702
            | ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| 
Sbjct  269  CCCCTAAGGTCGAATACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTATAATTCCCCACCACCAC  328

Query  703  C--CTTA-TTTCTCTCCTTCTCC-AAAGGTAGACTATAAATCTCCTCCACCACCATATGT  758
            |  | || | | || || ||||| ||| || || || || ||||||||||||||||||||
Sbjct  329  CAACATACTAT-TCACCATCTCCTAAA-GTTGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGT  386

Query  759  CTACAGCTCCCCACCACCTCCACCATACTATTCTCCTTCTCCAGAAG-TCAG-CTACAAG  816
            ||||||||||||||||||   ||||||||| || || |||||| ||| | || |||||||
Sbjct  387  CTACAGCTCCCCACCACC---ACCATACTACTCCCCATCTCCA-AAGGT-AGACTACAAG  441

Query  817  TCTCCACCACCTCCA  831
            ||||| ||||| |||
Sbjct  442  TCTCCTCCACCACCA  456


 Score =  159 bits (86),  Expect = 3e-38
 Identities = 173/214 (81%), Gaps = 10/214 (5%)
 Strand=Plus/Plus

Query  623  CACCACCATATTACTCT-CCTTC-TCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATA  680
            |||||||||||| || | ||  | |||||||||||| ||||| ||||| |||| | || |
Sbjct  95   CACCACCATATT-CTGTACC-ACTTCCTAAAGTAGAATACAAATCTCCTCCACTAACAGA  152

Query  681  CGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTTCTCTCCTTCTCC-AAAGGTAGACTATAAAT  739
             || ||||  |||||||||||||| |||| ||||||  | || ||| || ||||||||||
Sbjct  153  TGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCAGCGCCTAAA-GTTGACTATAAAT  211

Query  740  CTCCTCCACCACCATATGTCTACAGCTCCCCACCACCTCCACCATACTATTCTCCTTCTC  799
            ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || |
Sbjct  212  CTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCACCACCACCACCGCCATATTACTCTCCATCCC  271

Query  800  CAGAAG-TC-AGCTACAAGTCTCCACCACCTCCA  831
            |  ||| || |  ||||||||||| ||||| |||
Sbjct  272  CT-AAGGTCGAA-TACAAGTCTCCTCCACCACCA  303


> Ahg938381 jgi|Araly1|938381|scaffold_502572.1
Length=424

 Score =  233 bits (126),  Expect = 2e-60
 Identities = 219/264 (83%), Gaps = 6/264 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  241  TCTCCACCACCACCT-TATTAC-TCTCCTTC-TCCAAAGGAAGACTACAAGTCTCCACCA  297
            ||||||||||||  | |||| | || ||  | ||| ||||  || |||||  |||| |||
Sbjct  132  TCTCCACCACCA-TTGTATT-CTTCACC-GCTTCCTAAGGTTGAATACAAAACTCCCCCA  188

Query  298  CCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAAGTAGAC  357
            | |||||||||| | |  ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| 
Sbjct  189  CTACCATATGTCGATAGTTCTCCACCACCCCCATACTACTCGCCTTCCCCTAAGGTAGAT  248

Query  358  TACAAATCTCCTCCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCT  417
            ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  TACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTATACAGCTCCCCACCACCACCTTATTACTCTCCT  308

Query  418  TCTCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCA  477
            ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||
Sbjct  309  TCTCCAAAGGTTGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAAATCTCCACCTCCA  368

Query  478  CCTTATTACTCTCTTTCTCCTAAA  501
            || |  || || | |||||| |||
Sbjct  369  CCATCGTATTCACCTTCTCCAAAA  392


 Score =  228 bits (123),  Expect = 7e-59
 Identities = 218/264 (83%), Gaps = 6/264 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  391  TCTCCACCACCACCT-TATTAC-TCTCCTTC-TCCAAAGGTAGAATACAAGTCTCCACCA  447
            ||||||||||||  | |||| | || ||  | ||| ||||| ||||||||  |||| |||
Sbjct  132  TCTCCACCACCA-TTGTATT-CTTCACC-GCTTCCTAAGGTTGAATACAAAACTCCCCCA  188

Query  448  CCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCTTTCTCCTAAAGTAGAC  507
            | |||||||||| | |  ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| 
Sbjct  189  CTACCATATGTCGATAGTTCTCCACCACCCCCATACTACTCGCCTTCCCCTAAGGTAGAT  248

Query  508  TACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCT  567
            ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  TACAAGTCTCCTCCACCACCATACGTATACAGCTCCCCACCACCACCTTATTACTCTCCT  308

Query  568  TCTCCAAAGGTAGACTACAAGTTTTCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCATCACCA  627
            ||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||||| | |||
Sbjct  309  TCTCCAAAGGTTGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAAATCTCCACCTCCA  368

Query  628  CCATATTACTCTCCTTCTCCTAAA  651
            ||||  || || |||||||| |||
Sbjct  369  CCATCGTATTCACCTTCTCCAAAA  392


 Score =  130 bits (70),  Expect = 2e-29
 Identities = 98/112 (88%), Gaps = 0/112 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  240  CTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGAAGACTACAAGTCTCCACCACC  299
            ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||
Sbjct  281  CTCCCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCCAAAGGTTGAGTACAAGTCTCCTCCACC  340

Query  300  ACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCGTATTACTCCCCTTCTCCTAAA  351
            ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  || || |||||||| |||
Sbjct  341  ACCATATGTTTACAAATCTCCACCTCCACCATCGTATTCACCTTCTCCAAAA  392


> Ahg347223 jgi|Araly1|347223|fgenesh1_pg.C_scaffold_5000615
Length=1038

 Score =  220 bits (119),  Expect = 1e-56
 Identities = 294/375 (78%), Gaps = 26/375 (7%)
 Strand=Plus/Plus

Query  470  CACCACCACCTTATTACTCT--CTTTCTCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACC  527
            |||||||||| |||| || |  |  | |||||| ||||| ||||| ||||| |||  |||
Sbjct  92   CACCACCACCATATT-CTGTACCACT-TCCTAAGGTAGAATACAAATCTCCTCCATTACC  149

Query  528  ATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTTATTACTCTCCTTCTCC-AAAGGTAGACTACA  586
            | | || ||||  |||||||||||||| |||||||||||  | || ||| || ||||| |
Sbjct  150  AGATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCAGCACCTAAA-GTTGACTATA  208

Query  587  AGTTTTCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCATCACCA---CCATATTACTCTCCTT  643
            | | | | |||||||| || || ||||  || ||| |||||   |||||||||||||| |
Sbjct  209  AATCTCCTCCACCACCCTATGTTTACAGTTCACCACCACCACCGCCATATTACTCTCCGT  268

Query  644  CTCCTAAAGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCA-  702
            | |||   || || ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||| 
Sbjct  269  CCCCT---GTCGAATACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTATAATTCCCCACCACCAC  325

Query  703  C--CTTA-TTTCTCTCCTTCTCC-AAAGGTAGACTATAAATCTCCTCCACCACCATATGT  758
            |  | || | | || || ||||| ||| || || || || ||||||||||||||||||||
Sbjct  326  CAACATACTAT-TCACCATCTCCTAAA-GTTGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGT  383

Query  759  CTACAGCTCCCCACCACCTCCACCATACTATTCTCCTTCTCCAGAAG-TCAG-CTACAAG  816
            ||||||||||||||||||   ||||||||| || || |||||| ||| | || |||||||
Sbjct  384  CTACAGCTCCCCACCACC---ACCATACTACTCCCCATCTCCA-AAGGT-AGACTACAAG  438

Query  817  TCTCCACCACCTCCA  831
            ||||| ||||| |||
Sbjct  439  TCTCCTCCACCACCA  453


> Ahg327089 jgi|Araly1|327089|fgenesh1_pm.C_scaffold_6002309
Length=888

 Score = 67.6 bits (36),  Expect = 2e-10
 Identities = 38/39 (97%), Gaps = 0/39 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  517  CCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT  555
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  CCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT  252


 Score = 67.6 bits (36),  Expect = 2e-10
 Identities = 38/39 (97%), Gaps = 0/39 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  667  CCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT  705
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  CCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT  252


 Score = 62.1 bits (33),  Expect = 8e-09
 Identities = 33/33 (100%), Gaps = 0/33 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  373  CCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT  405
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  CCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT  252



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 36674246154


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5