BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G35750.1
Length=3903
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg493633 jgi|Araly1|493633|fgenesh2_kg.7__3066__AT5G35750.1 5823 0.0
> Ahg493633 jgi|Araly1|493633|fgenesh2_kg.7__3066__AT5G35750.1
Length=3915
Score = 5823 bits (3153), Expect = 0.0
Identities = 3684/3936 (94%), Gaps = 54/3936 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCTATAACTTGTGAGCTCTTGAATCTTACTTCAAAGAAAGCTAAGAAGTCGTCGAGC 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||
Sbjct 1 ATGTCTATAACTTGTGAACTCTTGAATCTTACTTCAAAGAAGGC--A-AAGGAGTCGAGG 57
Query 61 AGTGACAAGAAATGGCTAAAGAAGCCTCTCTTCTTCCTGATTTTGTGTGGCTCTTTGGTA 120
|||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 AGTGGCAAGAAGTGGCTAAAGAAGCCTCTCTTGTTCCTGATTTTGTGTGGCTCTTTGGTA 117
Query 121 ATTGTT-TTGGTTATGTTCTTACGGTTAGGTAGAAGTCAGAAGGAGGAGACAGATTCTTG 179
|||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 118 ATTGTTCTT-GTTATGTTCTCATGGTTAGGTAGAAGTCAGAAGGAGGAGACATCTTCTTG 176
Query 180 TAATGGAGAAGAGAAAGTGTTGTATAGACATCAAAATGTCACAAGAAGTGAGATTCATGA 239
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 TAATGGAGAAGCTAAAGTGTTGTATAGACATCAAAACGTCACAAGAAGTGAGATTCATGA 236
Query 240 TTTGGTCTCTTTGTTCTCTGATTCAGATCAGGTAACATCCTTTGAATGTCA-TAAGGAAT 298
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 237 TTTGGTCTCTTTGTTCTCTGATTCAGATCAGGTATTATCCTTTGAATGT-AGTAAGGAAT 295
Query 299 CAAGCCCTGGAATGT-GGACAAACTATGGTATTACATGTTCCCTGAGTGTGCGTTCTGAT 357
|||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| || ||
Sbjct 296 CAAGACCTGGAATGTGGGA-AAATTATGGTATTACATGTTCCCTGAATATGCGGTCGGAG 354
Query 358 AAACAAGAGACTAGAGGGCTTCCCTGGAATC----T---T--GGCTTAGGACATTCTATC 408
||||| ||||| ||| || |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||
Sbjct 355 AAACAGGAGACCAGATGGATTCCCTGGAATCTTAATCCATCAGGCTTAGCACATTCTATC 414
Query 409 TCATCAACATCTTGTATGTGTGGTAATCTTGAACCGATTTTACAGCAACCTGAAAACCTT 468
|||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||
Sbjct 415 TCATCAACTTCTTGTATATGTGATAATCTTGAAGCGAGTTTACAACAACCGGAAAA---- 470
Query 469 GAGGAAGAAAACCATGAAGAAGGGCTGGAGCAGGGTTTGTCATCGTATTTAAGAAATGCA 528
| |||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||
Sbjct 471 -A-TCAGAAAACCTTGAGGAAGAGCTGGAGCAGAGTTTGTCAACTTGTTTAAGAAATGCA 528
Query 529 ---TGGTGGTGTCTAATCCTTGGTGTGTTAGTGTGCCATAAGATTTATGTATCTCATTCT 585
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 529 TGGTGGTGGTGTCTAATCCTTGGTGTATTAGTGTGCCATAAGATTTATGTATTTCATTCT 588
Query 586 AAAGCACGAGGTGAGAGGAAAGAGAAAGTACATCTGCAAGAGGCTTTAGCTCCAAAGAAG 645
||||||| || | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 589 AAAGCACCAGCTAAGAGGAAAGAAAAAGTACATCTACAAGAGCCTTTAGCTCAAAAGAAG 648
Query 646 CAGCAACAACGTGCTCAGACTTCTTCTAGAGGGGCTGGAAGATGGAGGAAGAATATCCTT 705
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 649 CAGCAACAACGTGCTCAGACTTCTTCTAAAGGGGCTGGAAAATGGAGGAAGAACATCCTT 708
Query 706 CTCCTTGGTATTTTAGGAGGAGTTTCCTTCTCTGTTTGGTGGTTTTGGGACACTAATGAG 765
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 709 CTCCTTGGAATTTTAGGAGGAGTTTCCTTCTCCGTTTGGTGGTTTTGGAACACCAATGAG 768
Query 766 GAGATCATAATGAAAAGGAGGGAGACTTTGGCAAACATGTGTGACGAACGAGCACGTGTT 825
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 769 GAGATCATAATGAAAAGGAGGGAGACTTTAGCTAACATGTGTGATGAACGAGCCCGCGTG 828
Query 826 TTACAAGATCAGTTCAATGTTAGCTTGAACCATGTTCATGCCTTGTCTATTCTTGTATCT 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 TTACAAGATCAGTTCAATGTTAGCTTGAACCATGTTCATGCCTTGTCTATTCTTGTATCT 888
Query 886 ACATTTCATCATGGTAAAATCCCATCTGCCATTGATCAGAGAACATTTGAAGAATATACT 945
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACATTTCATCATGGGAAAACCCCATCTGCCATTGATCAGAAAACATTTGAAGAATATACT 948
Query 946 GAGAGAACAAACTTTGAGAGGCCACTTACTAGTGGTGTAGCGTATGCTTTGAAAGTCCCA 1005
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 949 GAGAGAACAAACTTTGAGAGGCCACTTACAAGTGGTGTAGCGTATGCTTTGAAAGTTCCA 1008
Query 1006 CACTCAGAAAGAGAGAAATTTGAAAAGGAGCATGGATGGGCAATAAAGAAAATGGAAACT 1065
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 CACTCAGAAAGGGAGAAATTTGAAAAGGAGCATGGATGGACAATAAAGAAAATGGAAACT 1068
Query 1066 GAGGACCAGACAGTTGTACAAGATTGTGTTCCTGAAAACTTTGATCCCGCACCGATTCAA 1125
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1069 GAGGACCAGACAGTCGTCCAAGATTGTGTTCCTGAAAATTTTGATCCAGCACCTATTCAA 1128
Query 1126 GACGAATACGCGCCAGTTATATTTGCTCAAGAAACTGTTTCCCATATTGTATCGGTCGAC 1185
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1129 GCCGAATACGCGCCAGTTATATTTGCTCAAGAAACAGTTTCCCATATTGTATCGGTTGAC 1188
Query 1186 ATGATGTCTGGAGAAGAAGACCGTGAAAACATCTTACGGGCAAGGGCATCAGGAAAAGGA 1245
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 ATGATGTCTGGAGAAGAAGACCGTGAAAACATTTTGCGGGCAAGGGCATCAGGAAAAGGA 1248
Query 1246 GTGTTAACATCTCCATTTAAGCTTCTTAAGTCAAATCATCTTGGTGTTGTGTTGACCTTT 1305
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1249 GTATTAACATCTCCATTTAAGCTTCTTAAGTCAAATCATCTTGGCATCGTGTTGACCTTT 1308
Query 1306 GCTGTCTATGACACGAGCCTACCGCCTGATGCTACAGAAGAACAGCGTGTTGAAGCAACT 1365
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 GCTGTGTATGACACGAGCCTACCGCCCAATGCTACAGAAGAACAGCGTGTTGAAGCAACT 1368
Query 1366 ATTGGGTACCTTGGTGCATCATATGATATGCCATCGCTGGTGGAGAAACTTCTTCACCAA 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 ATTGGGTACCTTGGTGCATCATATGATATGCCATCGCTGGTGGAGAAACTTCTTCACCAA 1428
Query 1426 CTTGCCAGCAAACAGACAATTGCTGTGGATGTTTACGACACAACTAACACTTCAGGTCTA 1485
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1429 CTTGCCAGTAAACAGACGATTGCTGTGGATGTTTACGACACAACTAACACCTCAGGTCTA 1488
Query 1486 ATAAAAATGTATGGCTCAGAAATTGGGGATATAAGTGAGCAGCATATAAGTAGCCTTGAT 1545
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1489 ATAAAAATGTATGGCTCAGAAATTGGGGATATAAGTGAGCAGCACATAAGTAGCCTTGAT 1548
Query 1546 TTTGGTGATCCATCAAGGAACCATGAGATGCATTGCAGGTTTAAGCATAAACTTCCCATT 1605
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 TTTGGTGATCCATCAAGGAATCATGAGATGCACTGCAGGTTTAAGCATAAACTTCCCATT 1608
Query 1606 CCCTGGACAGCGATAACACCGTCGATCTTAGTTCTGGTTATTACTTTTCTTGTTGGTTAT 1665
|| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 CCTTGGACCGCGATAACAACGTCGATCTTAGTTCTGGTTATTACTTTTCTTGTTGGTTAT 1668
Query 1666 ATTTT-ATATGAAGCCATCAACCGAATTGCGACAGTTGAAGAGGATTGTCAGAAGATGAG 1724
||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1669 ATTTTCA-ATGAAGCCATCAATCGAATTGCCACAGTTGAAGAGGACTGTCAGAAGATGAG 1727
Query 1725 GGAACTCAAAGCTCGTGCTGAGGCCGCTGACATTGCAAAGTCACAGTTCCTAGCAACTGT 1784
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728 GGAACTCAAAGCTCGTGCTGAGGCCGCTGACGTTGCAAAGTCACAGTTCCTAGCAACTGT 1787
Query 1785 TTCTCATGAGATACGGACTCCGATGAATGGAGTTTTAGGAATGCTGAAAATGCTGATGGA 1844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 TTCTCATGAGATACGGACTCCGATGAATGGAGTTTTAGGAATGCTGAAAATGCTGATGGA 1847
Query 1845 CACCGATCTTGATGCGAAGCAGATGGACTATGCGCAAACTGCTCATGGCAGTGGGAAGGA 1904
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 CACCGATCTTGATGCGAAGCAGATGGACTATGCACAAACTGCTCATGGCAGTGGGAAGGA 1907
Query 1905 TCTTACATCACTAATAAATGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAATCCGGAAGGCTCGA 1964
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1908 TCTTACATCCCTAATAAATGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAATCAGGAAGGCTCGA 1967
Query 1965 GCTTGAAAATGTGCCTTTTGATATGCGTTTTATTCTTGATAATGTTTCATCTCTCCTCTC 2024
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968 GCTTGAAAATGTGCCTTTTGATATGCGCTTTATTCTGGATAATGTTTCATCTCTCCTCTC 2027
Query 2025 TGGCAAGGCAAATGAAAAAGGAATTGAGTTGGCCGTTTATGTTTCTAGTCAAGTTCCTGA 2084
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028 TGGCAAAGCAAATGAAAAAGGAATTGAGTTGGCCGTTTATGTTTCTAGTCAAGTTCCTGA 2087
Query 2085 TGTTGTAGTCGGTGATCCGAGTCGGTTCCGGCAGATCATTACAAACCTGGTTGGAAACTC 2144
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2088 TGTTGTAGTCGGTGATCCGAGTCGGTTCCGGCAGATAATTACAAACCTTGTTGGAAACTC 2147
Query 2145 AATCAAATTCACACAGGAAAGGGGACACATATTTATCTCAGTGCACCTTGCAGATGAGGT 2204
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 AATCAAGTTCACACAGGAAAGGGGACACATATTTATCTCAGTGCACCTTGCAGATGAGGT 2207
Query 2205 AAAGGAGCCTCTTACTATTGAAGACGCAGTGCTAAAACAGCGACTAGCTTTAGGATGCAG 2264
|| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2208 AAGGGAGCCTCTTAATATTGAAGATGCAGTGCTAAAACAGAGACTAGCTTTAGGATGCAG 2267
Query 2265 CGAGTCCGGTGAGACAGTTAGCGGGTTTCCTGCGGTAAATGCATGGGGAAGCTGGAAGAA 2324
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268 CGAGTCCGGTGAGACAGTTAGCGGGTTTCCTGCCGTAAATGCATGGGGAAGCTGGAAGAA 2327
Query 2325 TTTCAAGACATGTTACAG-TACTGAGAGTCAGAATTCTGATCAAATCAAATTGCTAGTTA 2383
|||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2328 TTTCAAGACATGTTACAGCT-CTGAGAATCATAATTCTGATAAAATCAAATTGCTAGTTA 2386
Query 2384 CAGTGGAGGACACTGGAGTTGGCATACCTGTGGATGCACAAGGCCGAATCTTCACACCTT 2443
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2387 CAGTGGAGGACACAGGAGTGGGCATACCTGTGGATGCACAAGGCCGAATATTCACGCCTT 2446
Query 2444 TTATGCAAGCCGACAGTTCCACATCGCGGACTTATGGTGGAACTGGCATAGGTTTGAGTA 2503
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2447 TTATGCAAGCCGACAGTTCCACATCGCGGACTTATGGTGGGACTGGCATAGGTTTGAGCA 2506
Query 2504 TAAGCAAACGTTTGGTTGAACTCATGCAAGGAGAGATGGGGTTTGTGAGTGAGCCCGGGA 2563
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 TAAGCAAGCGTTTGGTTGAACTCATGCAAGGAGAGATGGGGTTTGTGAGTGAGCCCGGGA 2566
Query 2564 TAGGCAGTACTTTTTCATTTACTGGAGTTTTCGGGAAAGCAGAAACAAATACGTCGATTA 2623
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2567 TAGGCAGTACTTTTTCATTTACTGTAGTTTTCGGGAAAGCAGAAACAAATACGTCAATTA 2626
Query 2624 CTAAGCTGGAACGATTCGATCTAGCTATTCAGGAGTTTACAGGATTGAGAGCATTAGTTA 2683
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2627 CTAAGTTGGAACGATTCGATCTAGCTCTTCAGGAGTTTAAAGGATTGAGAGCATTAGTTA 2686
Query 2684 TTGATAACAGAAACATTAGAGCAGAGGTCACCAGGTACGAACTTCGGAGACTGGGAATAT 2743
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||||
Sbjct 2687 TTGATAACAGAAACATTAGAGCAGAGGTGACCAGCTACCATCTTCAGAGACTGGGAATAT 2746
Query 2744 CTGCAGACATTGTTTCAAGTCTGAGAATGGCATGCACTTGTTGTATCAGCAAATTAGAAA 2803
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||
Sbjct 2747 CTGCAGACATTGTTTCAAGTCTTAGAATGGCATGCACCTCT-GT--CAGCAAATTAGAAA 2803
Query 2804 ATTTGGCTATGATTCTAATAGACAAAGACGCCTGGAACAAGGAAGAATTTTCAGTACTTG 2863
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 2804 ATTTGGCTATGGTTCTAATCGACAAAGACGCCTGGAACAAGAAAGACTTTTCAGTACTTG 2863
Query 2864 ACGAGTTGTTTACCCGAAGCAAAGTAACCTTTACAAGAGTCCCAAAGATTTTTCTTTTGG 2923
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2864 ACGAGTTGTTTACCCGTAGCAAAGTAACCTTTGCAAGAGTCCCAAAGATTATTCTTTTGG 2923
Query 2924 CAACTTCTGCAACTCTTACTGAGCGCAGTGAGATGAAGTCTACTGGTCTCATCGATGAGG 2983
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 2924 CAACCTCTGCAACTCTTACTGAGCGCAGTGAGATGAAGTCTTCTGGCCTCATCGATGAGG 2983
Query 2984 TGGTGATAAAGCCTCTTCGGATGAGTGTCTTAATATGTTGCTTGCAAGAAACCCTTGTCA 3043
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2984 TAGTAATAAAGCCTCTTCGGATGAGTGTCTTAATATGTTGCTTGCAAGAAACCCTTGTCA 3043
Query 3044 ATGGCAAGAAGAGGCAACCGAACAGACAGCGAAGAAATCTTGGACACTTGCTAAGAGAAA 3103
|||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 3044 ATGGCAAGAAGAGGCAACCGGATAGAAAGCGAAGAAATCTTGGACACTTACTCAGAGAAA 3103
Query 3104 AACAGATTCTGGTTGTGGATGATAATCTTGTGAACAGACGAGTTGCAGAAGGTGCACTTA 3163
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3104 AACAGATTCTGGTTGTGGACGATAATCTTGTGAACAGACGAGTTGCCGAAGGTGCACTTA 3163
Query 3164 AGAAATATGGAGCTATTGTTACATGCGTTGAGAGTGGCAAAGCTGCATTGGCAATGCTTA 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||
Sbjct 3164 AGAAATATGGAGCTATTGTTACATGCGTTGAGAGTGGGAAGGCTGCATTGGAAATGCTTA 3223
Query 3224 AGCCGCCTCATAACTTCGATGCTTGCTTCATGGATCTCCAGATGCCTGAAATGGATGGAT 3283
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3224 AGCCGCCTCACAACTTCGATGCTTGCTTCATGGATCTCCAGATGCCTGAAATGGATGGAT 3283
Query 3284 TTGAAGCGACAAGGAGAGTCCGTGAGCTGGAGAGGGAAATCAATAAGAAAATAGCTTCTG 3343
||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3284 TTGAAGCAACGAGGAGAGTCCGTGATCTGGAGAGGGAAATCAATAAGAAAATAGCTTCTG 3343
Query 3344 GAGAAGTTTCAGCTGAAATGTTCTGTAAATTTAGTAGTTGGCACGTCCCGATATTAGCAA 3403
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3344 GAGAAGTTTCTGCTGAAATGTTCTGTAAATTTAGTAGTTGGCATGTCCCGATATTAGCAA 3403
Query 3404 TGACAGCAGATGTTATTCAGGCTACTCATGAAGAATGCATGAAATGTGGAATGGATGGTT 3463
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3404 TGACAGCTGATGTTATTCAGGCTACTCACGAAGAATGCATGAAATGTGGAATGGATGGTT 3463
Query 3464 ATGTATCAAAACCGTTTGAAGAGGAAGTGCTCTACACAGCGGTAGCAAGATTCTTTGAAC 3523
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 ATGTATCAAAACCGTTTGAAGAGGAAGTGCTTTACACAGCGGTAGCAAGATTCTTTGAAC 3523
Query 3524 CTTGTTAA-A-A--G---AAAAA-GCCATTTCCCTTGTAGGATTATA--TATCAACCCGA 3573
| |||||| | | | ||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 3524 CCTGTTAACAGAAAGCCTAAAAACGCCACTGCCCTTGTAGCATTATAGATATCAACCCGA 3583
Query 3574 GAGCTTTTTGACATCGGGTAGTATATCTTGAACATCCATGACCTGCAATTCAACTTGAGA 3633
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3584 GAGCTTTTTGATGTCGGGTAGTATATCTTGAACATCCATGACCTGCAATTCAACTTGAGA 3643
Query 3634 TCAAGGCAAGAACCAGTTCATTGTCAATTTTTCTTCACAGGTCTCTTTCAGCTT-AAGAC 3692
|||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||
Sbjct 3644 TCAAGGAAAGAACCAGTCCATTATCCATTGTTCTTCACAGGTCTCGTTC-GCTTTAAGAC 3702
Query 3693 CTCGTCTGGTTGAGTGAGAAAAA---CTGCGAAAACCG-A-TCTTTCTCTTTGTATAGAC 3747
|| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 3703 CTTGTCTGGTTGAGTGAGAAAAAAGACTGCGAAAACCGCAATCTTTCTCTTTGTATAGAC 3762
Query 3748 ACTTTGTCTTCATTGATCTCTGCCTGTGTGTATAGTAGATTCCTAGGGTATAGCTCCATT 3807
| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 3763 AGTTTGTCGTCTTTGATCTCTGCATGTGTGTATAGTAGATTTCTAGTGTATAGCTCCATT 3822
Query 3808 ATATTCATTTtatatatatataAACCCAAACTCTGTCCTCTTAACTATGAAACAGCTTGT 3867
||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||
Sbjct 3823 ATATTCATTC-ATATATATA-AA-CCCAAATTCTCTCCTCTGAACTGTAAAACAGCTTGT 3879
Query 3868 ATATTGTGTAGTAATAGTAATGGCTCTTGATTACAT 3903
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3880 ATGTTGTGTAGTAATAGTAATGGCTCTTGATTACAT 3915
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 147511152948
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5