BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G35750.1 Length=3903 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg493633 jgi|Araly1|493633|fgenesh2_kg.7__3066__AT5G35750.1 5823 0.0 > Ahg493633 jgi|Araly1|493633|fgenesh2_kg.7__3066__AT5G35750.1 Length=3915 Score = 5823 bits (3153), Expect = 0.0 Identities = 3684/3936 (94%), Gaps = 54/3936 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTCTATAACTTGTGAGCTCTTGAATCTTACTTCAAAGAAAGCTAAGAAGTCGTCGAGC 60 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| Sbjct 1 ATGTCTATAACTTGTGAACTCTTGAATCTTACTTCAAAGAAGGC--A-AAGGAGTCGAGG 57 Query 61 AGTGACAAGAAATGGCTAAAGAAGCCTCTCTTCTTCCTGATTTTGTGTGGCTCTTTGGTA 120 |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 58 AGTGGCAAGAAGTGGCTAAAGAAGCCTCTCTTGTTCCTGATTTTGTGTGGCTCTTTGGTA 117 Query 121 ATTGTT-TTGGTTATGTTCTTACGGTTAGGTAGAAGTCAGAAGGAGGAGACAGATTCTTG 179 |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 118 ATTGTTCTT-GTTATGTTCTCATGGTTAGGTAGAAGTCAGAAGGAGGAGACATCTTCTTG 176 Query 180 TAATGGAGAAGAGAAAGTGTTGTATAGACATCAAAATGTCACAAGAAGTGAGATTCATGA 239 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 177 TAATGGAGAAGCTAAAGTGTTGTATAGACATCAAAACGTCACAAGAAGTGAGATTCATGA 236 Query 240 TTTGGTCTCTTTGTTCTCTGATTCAGATCAGGTAACATCCTTTGAATGTCA-TAAGGAAT 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| Sbjct 237 TTTGGTCTCTTTGTTCTCTGATTCAGATCAGGTATTATCCTTTGAATGT-AGTAAGGAAT 295 Query 299 CAAGCCCTGGAATGT-GGACAAACTATGGTATTACATGTTCCCTGAGTGTGCGTTCTGAT 357 |||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| || || Sbjct 296 CAAGACCTGGAATGTGGGA-AAATTATGGTATTACATGTTCCCTGAATATGCGGTCGGAG 354 Query 358 AAACAAGAGACTAGAGGGCTTCCCTGGAATC----T---T--GGCTTAGGACATTCTATC 408 ||||| ||||| ||| || |||||||||||| | | ||||||| |||||||||| Sbjct 355 AAACAGGAGACCAGATGGATTCCCTGGAATCTTAATCCATCAGGCTTAGCACATTCTATC 414 Query 409 TCATCAACATCTTGTATGTGTGGTAATCTTGAACCGATTTTACAGCAACCTGAAAACCTT 468 |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| Sbjct 415 TCATCAACTTCTTGTATATGTGATAATCTTGAAGCGAGTTTACAACAACCGGAAAA---- 470 Query 469 GAGGAAGAAAACCATGAAGAAGGGCTGGAGCAGGGTTTGTCATCGTATTTAAGAAATGCA 528 | |||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| Sbjct 471 -A-TCAGAAAACCTTGAGGAAGAGCTGGAGCAGAGTTTGTCAACTTGTTTAAGAAATGCA 528 Query 529 ---TGGTGGTGTCTAATCCTTGGTGTGTTAGTGTGCCATAAGATTTATGTATCTCATTCT 585 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 529 TGGTGGTGGTGTCTAATCCTTGGTGTATTAGTGTGCCATAAGATTTATGTATTTCATTCT 588 Query 586 AAAGCACGAGGTGAGAGGAAAGAGAAAGTACATCTGCAAGAGGCTTTAGCTCCAAAGAAG 645 ||||||| || | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| Sbjct 589 AAAGCACCAGCTAAGAGGAAAGAAAAAGTACATCTACAAGAGCCTTTAGCTCAAAAGAAG 648 Query 646 CAGCAACAACGTGCTCAGACTTCTTCTAGAGGGGCTGGAAGATGGAGGAAGAATATCCTT 705 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| Sbjct 649 CAGCAACAACGTGCTCAGACTTCTTCTAAAGGGGCTGGAAAATGGAGGAAGAACATCCTT 708 Query 706 CTCCTTGGTATTTTAGGAGGAGTTTCCTTCTCTGTTTGGTGGTTTTGGGACACTAATGAG 765 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct 709 CTCCTTGGAATTTTAGGAGGAGTTTCCTTCTCCGTTTGGTGGTTTTGGAACACCAATGAG 768 Query 766 GAGATCATAATGAAAAGGAGGGAGACTTTGGCAAACATGTGTGACGAACGAGCACGTGTT 825 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || Sbjct 769 GAGATCATAATGAAAAGGAGGGAGACTTTAGCTAACATGTGTGATGAACGAGCCCGCGTG 828 Query 826 TTACAAGATCAGTTCAATGTTAGCTTGAACCATGTTCATGCCTTGTCTATTCTTGTATCT 885 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 829 TTACAAGATCAGTTCAATGTTAGCTTGAACCATGTTCATGCCTTGTCTATTCTTGTATCT 888 Query 886 ACATTTCATCATGGTAAAATCCCATCTGCCATTGATCAGAGAACATTTGAAGAATATACT 945 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 889 ACATTTCATCATGGGAAAACCCCATCTGCCATTGATCAGAAAACATTTGAAGAATATACT 948 Query 946 GAGAGAACAAACTTTGAGAGGCCACTTACTAGTGGTGTAGCGTATGCTTTGAAAGTCCCA 1005 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 949 GAGAGAACAAACTTTGAGAGGCCACTTACAAGTGGTGTAGCGTATGCTTTGAAAGTTCCA 1008 Query 1006 CACTCAGAAAGAGAGAAATTTGAAAAGGAGCATGGATGGGCAATAAAGAAAATGGAAACT 1065 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1009 CACTCAGAAAGGGAGAAATTTGAAAAGGAGCATGGATGGACAATAAAGAAAATGGAAACT 1068 Query 1066 GAGGACCAGACAGTTGTACAAGATTGTGTTCCTGAAAACTTTGATCCCGCACCGATTCAA 1125 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| Sbjct 1069 GAGGACCAGACAGTCGTCCAAGATTGTGTTCCTGAAAATTTTGATCCAGCACCTATTCAA 1128 Query 1126 GACGAATACGCGCCAGTTATATTTGCTCAAGAAACTGTTTCCCATATTGTATCGGTCGAC 1185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1129 GCCGAATACGCGCCAGTTATATTTGCTCAAGAAACAGTTTCCCATATTGTATCGGTTGAC 1188 Query 1186 ATGATGTCTGGAGAAGAAGACCGTGAAAACATCTTACGGGCAAGGGCATCAGGAAAAGGA 1245 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1189 ATGATGTCTGGAGAAGAAGACCGTGAAAACATTTTGCGGGCAAGGGCATCAGGAAAAGGA 1248 Query 1246 GTGTTAACATCTCCATTTAAGCTTCTTAAGTCAAATCATCTTGGTGTTGTGTTGACCTTT 1305 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 1249 GTATTAACATCTCCATTTAAGCTTCTTAAGTCAAATCATCTTGGCATCGTGTTGACCTTT 1308 Query 1306 GCTGTCTATGACACGAGCCTACCGCCTGATGCTACAGAAGAACAGCGTGTTGAAGCAACT 1365 ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1309 GCTGTGTATGACACGAGCCTACCGCCCAATGCTACAGAAGAACAGCGTGTTGAAGCAACT 1368 Query 1366 ATTGGGTACCTTGGTGCATCATATGATATGCCATCGCTGGTGGAGAAACTTCTTCACCAA 1425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1369 ATTGGGTACCTTGGTGCATCATATGATATGCCATCGCTGGTGGAGAAACTTCTTCACCAA 1428 Query 1426 CTTGCCAGCAAACAGACAATTGCTGTGGATGTTTACGACACAACTAACACTTCAGGTCTA 1485 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1429 CTTGCCAGTAAACAGACGATTGCTGTGGATGTTTACGACACAACTAACACCTCAGGTCTA 1488 Query 1486 ATAAAAATGTATGGCTCAGAAATTGGGGATATAAGTGAGCAGCATATAAGTAGCCTTGAT 1545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1489 ATAAAAATGTATGGCTCAGAAATTGGGGATATAAGTGAGCAGCACATAAGTAGCCTTGAT 1548 Query 1546 TTTGGTGATCCATCAAGGAACCATGAGATGCATTGCAGGTTTAAGCATAAACTTCCCATT 1605 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1549 TTTGGTGATCCATCAAGGAATCATGAGATGCACTGCAGGTTTAAGCATAAACTTCCCATT 1608 Query 1606 CCCTGGACAGCGATAACACCGTCGATCTTAGTTCTGGTTATTACTTTTCTTGTTGGTTAT 1665 || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1609 CCTTGGACCGCGATAACAACGTCGATCTTAGTTCTGGTTATTACTTTTCTTGTTGGTTAT 1668 Query 1666 ATTTT-ATATGAAGCCATCAACCGAATTGCGACAGTTGAAGAGGATTGTCAGAAGATGAG 1724 ||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1669 ATTTTCA-ATGAAGCCATCAATCGAATTGCCACAGTTGAAGAGGACTGTCAGAAGATGAG 1727 Query 1725 GGAACTCAAAGCTCGTGCTGAGGCCGCTGACATTGCAAAGTCACAGTTCCTAGCAACTGT 1784 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1728 GGAACTCAAAGCTCGTGCTGAGGCCGCTGACGTTGCAAAGTCACAGTTCCTAGCAACTGT 1787 Query 1785 TTCTCATGAGATACGGACTCCGATGAATGGAGTTTTAGGAATGCTGAAAATGCTGATGGA 1844 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1788 TTCTCATGAGATACGGACTCCGATGAATGGAGTTTTAGGAATGCTGAAAATGCTGATGGA 1847 Query 1845 CACCGATCTTGATGCGAAGCAGATGGACTATGCGCAAACTGCTCATGGCAGTGGGAAGGA 1904 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1848 CACCGATCTTGATGCGAAGCAGATGGACTATGCACAAACTGCTCATGGCAGTGGGAAGGA 1907 Query 1905 TCTTACATCACTAATAAATGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAATCCGGAAGGCTCGA 1964 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1908 TCTTACATCCCTAATAAATGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAATCAGGAAGGCTCGA 1967 Query 1965 GCTTGAAAATGTGCCTTTTGATATGCGTTTTATTCTTGATAATGTTTCATCTCTCCTCTC 2024 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1968 GCTTGAAAATGTGCCTTTTGATATGCGCTTTATTCTGGATAATGTTTCATCTCTCCTCTC 2027 Query 2025 TGGCAAGGCAAATGAAAAAGGAATTGAGTTGGCCGTTTATGTTTCTAGTCAAGTTCCTGA 2084 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2028 TGGCAAAGCAAATGAAAAAGGAATTGAGTTGGCCGTTTATGTTTCTAGTCAAGTTCCTGA 2087 Query 2085 TGTTGTAGTCGGTGATCCGAGTCGGTTCCGGCAGATCATTACAAACCTGGTTGGAAACTC 2144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2088 TGTTGTAGTCGGTGATCCGAGTCGGTTCCGGCAGATAATTACAAACCTTGTTGGAAACTC 2147 Query 2145 AATCAAATTCACACAGGAAAGGGGACACATATTTATCTCAGTGCACCTTGCAGATGAGGT 2204 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2148 AATCAAGTTCACACAGGAAAGGGGACACATATTTATCTCAGTGCACCTTGCAGATGAGGT 2207 Query 2205 AAAGGAGCCTCTTACTATTGAAGACGCAGTGCTAAAACAGCGACTAGCTTTAGGATGCAG 2264 || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2208 AAGGGAGCCTCTTAATATTGAAGATGCAGTGCTAAAACAGAGACTAGCTTTAGGATGCAG 2267 Query 2265 CGAGTCCGGTGAGACAGTTAGCGGGTTTCCTGCGGTAAATGCATGGGGAAGCTGGAAGAA 2324 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2268 CGAGTCCGGTGAGACAGTTAGCGGGTTTCCTGCCGTAAATGCATGGGGAAGCTGGAAGAA 2327 Query 2325 TTTCAAGACATGTTACAG-TACTGAGAGTCAGAATTCTGATCAAATCAAATTGCTAGTTA 2383 |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2328 TTTCAAGACATGTTACAGCT-CTGAGAATCATAATTCTGATAAAATCAAATTGCTAGTTA 2386 Query 2384 CAGTGGAGGACACTGGAGTTGGCATACCTGTGGATGCACAAGGCCGAATCTTCACACCTT 2443 ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 2387 CAGTGGAGGACACAGGAGTGGGCATACCTGTGGATGCACAAGGCCGAATATTCACGCCTT 2446 Query 2444 TTATGCAAGCCGACAGTTCCACATCGCGGACTTATGGTGGAACTGGCATAGGTTTGAGTA 2503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 2447 TTATGCAAGCCGACAGTTCCACATCGCGGACTTATGGTGGGACTGGCATAGGTTTGAGCA 2506 Query 2504 TAAGCAAACGTTTGGTTGAACTCATGCAAGGAGAGATGGGGTTTGTGAGTGAGCCCGGGA 2563 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2507 TAAGCAAGCGTTTGGTTGAACTCATGCAAGGAGAGATGGGGTTTGTGAGTGAGCCCGGGA 2566 Query 2564 TAGGCAGTACTTTTTCATTTACTGGAGTTTTCGGGAAAGCAGAAACAAATACGTCGATTA 2623 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2567 TAGGCAGTACTTTTTCATTTACTGTAGTTTTCGGGAAAGCAGAAACAAATACGTCAATTA 2626 Query 2624 CTAAGCTGGAACGATTCGATCTAGCTATTCAGGAGTTTACAGGATTGAGAGCATTAGTTA 2683 ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2627 CTAAGTTGGAACGATTCGATCTAGCTCTTCAGGAGTTTAAAGGATTGAGAGCATTAGTTA 2686 Query 2684 TTGATAACAGAAACATTAGAGCAGAGGTCACCAGGTACGAACTTCGGAGACTGGGAATAT 2743 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| Sbjct 2687 TTGATAACAGAAACATTAGAGCAGAGGTGACCAGCTACCATCTTCAGAGACTGGGAATAT 2746 Query 2744 CTGCAGACATTGTTTCAAGTCTGAGAATGGCATGCACTTGTTGTATCAGCAAATTAGAAA 2803 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||| Sbjct 2747 CTGCAGACATTGTTTCAAGTCTTAGAATGGCATGCACCTCT-GT--CAGCAAATTAGAAA 2803 Query 2804 ATTTGGCTATGATTCTAATAGACAAAGACGCCTGGAACAAGGAAGAATTTTCAGTACTTG 2863 ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 2804 ATTTGGCTATGGTTCTAATCGACAAAGACGCCTGGAACAAGAAAGACTTTTCAGTACTTG 2863 Query 2864 ACGAGTTGTTTACCCGAAGCAAAGTAACCTTTACAAGAGTCCCAAAGATTTTTCTTTTGG 2923 |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2864 ACGAGTTGTTTACCCGTAGCAAAGTAACCTTTGCAAGAGTCCCAAAGATTATTCTTTTGG 2923 Query 2924 CAACTTCTGCAACTCTTACTGAGCGCAGTGAGATGAAGTCTACTGGTCTCATCGATGAGG 2983 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 2924 CAACCTCTGCAACTCTTACTGAGCGCAGTGAGATGAAGTCTTCTGGCCTCATCGATGAGG 2983 Query 2984 TGGTGATAAAGCCTCTTCGGATGAGTGTCTTAATATGTTGCTTGCAAGAAACCCTTGTCA 3043 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2984 TAGTAATAAAGCCTCTTCGGATGAGTGTCTTAATATGTTGCTTGCAAGAAACCCTTGTCA 3043 Query 3044 ATGGCAAGAAGAGGCAACCGAACAGACAGCGAAGAAATCTTGGACACTTGCTAAGAGAAA 3103 |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 3044 ATGGCAAGAAGAGGCAACCGGATAGAAAGCGAAGAAATCTTGGACACTTACTCAGAGAAA 3103 Query 3104 AACAGATTCTGGTTGTGGATGATAATCTTGTGAACAGACGAGTTGCAGAAGGTGCACTTA 3163 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3104 AACAGATTCTGGTTGTGGACGATAATCTTGTGAACAGACGAGTTGCCGAAGGTGCACTTA 3163 Query 3164 AGAAATATGGAGCTATTGTTACATGCGTTGAGAGTGGCAAAGCTGCATTGGCAATGCTTA 3223 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| Sbjct 3164 AGAAATATGGAGCTATTGTTACATGCGTTGAGAGTGGGAAGGCTGCATTGGAAATGCTTA 3223 Query 3224 AGCCGCCTCATAACTTCGATGCTTGCTTCATGGATCTCCAGATGCCTGAAATGGATGGAT 3283 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3224 AGCCGCCTCACAACTTCGATGCTTGCTTCATGGATCTCCAGATGCCTGAAATGGATGGAT 3283 Query 3284 TTGAAGCGACAAGGAGAGTCCGTGAGCTGGAGAGGGAAATCAATAAGAAAATAGCTTCTG 3343 ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3284 TTGAAGCAACGAGGAGAGTCCGTGATCTGGAGAGGGAAATCAATAAGAAAATAGCTTCTG 3343 Query 3344 GAGAAGTTTCAGCTGAAATGTTCTGTAAATTTAGTAGTTGGCACGTCCCGATATTAGCAA 3403 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3344 GAGAAGTTTCTGCTGAAATGTTCTGTAAATTTAGTAGTTGGCATGTCCCGATATTAGCAA 3403 Query 3404 TGACAGCAGATGTTATTCAGGCTACTCATGAAGAATGCATGAAATGTGGAATGGATGGTT 3463 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3404 TGACAGCTGATGTTATTCAGGCTACTCACGAAGAATGCATGAAATGTGGAATGGATGGTT 3463 Query 3464 ATGTATCAAAACCGTTTGAAGAGGAAGTGCTCTACACAGCGGTAGCAAGATTCTTTGAAC 3523 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3464 ATGTATCAAAACCGTTTGAAGAGGAAGTGCTTTACACAGCGGTAGCAAGATTCTTTGAAC 3523 Query 3524 CTTGTTAA-A-A--G---AAAAA-GCCATTTCCCTTGTAGGATTATA--TATCAACCCGA 3573 | |||||| | | | ||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 3524 CCTGTTAACAGAAAGCCTAAAAACGCCACTGCCCTTGTAGCATTATAGATATCAACCCGA 3583 Query 3574 GAGCTTTTTGACATCGGGTAGTATATCTTGAACATCCATGACCTGCAATTCAACTTGAGA 3633 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3584 GAGCTTTTTGATGTCGGGTAGTATATCTTGAACATCCATGACCTGCAATTCAACTTGAGA 3643 Query 3634 TCAAGGCAAGAACCAGTTCATTGTCAATTTTTCTTCACAGGTCTCTTTCAGCTT-AAGAC 3692 |||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| Sbjct 3644 TCAAGGAAAGAACCAGTCCATTATCCATTGTTCTTCACAGGTCTCGTTC-GCTTTAAGAC 3702 Query 3693 CTCGTCTGGTTGAGTGAGAAAAA---CTGCGAAAACCG-A-TCTTTCTCTTTGTATAGAC 3747 || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 3703 CTTGTCTGGTTGAGTGAGAAAAAAGACTGCGAAAACCGCAATCTTTCTCTTTGTATAGAC 3762 Query 3748 ACTTTGTCTTCATTGATCTCTGCCTGTGTGTATAGTAGATTCCTAGGGTATAGCTCCATT 3807 | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 3763 AGTTTGTCGTCTTTGATCTCTGCATGTGTGTATAGTAGATTTCTAGTGTATAGCTCCATT 3822 Query 3808 ATATTCATTTtatatatatataAACCCAAACTCTGTCCTCTTAACTATGAAACAGCTTGT 3867 ||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||| Sbjct 3823 ATATTCATTC-ATATATATA-AA-CCCAAATTCTCTCCTCTGAACTGTAAAACAGCTTGT 3879 Query 3868 ATATTGTGTAGTAATAGTAATGGCTCTTGATTACAT 3903 || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3880 ATGTTGTGTAGTAATAGTAATGGCTCTTGATTACAT 3915 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 147511152948 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5