BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G37830.1 Length=4351 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg891409 jgi|Araly1|891409|Al_scaffold_0007_3395 5984 0.0 > Ahg891409 jgi|Araly1|891409|Al_scaffold_0007_3395 Length=3798 Score = 5984 bits (3240), Expect = 0.0 Identities = 3613/3797 (95%), Gaps = 9/3797 (0%) Strand=Plus/Plus Query 104 ATGGGAACTGTAATCGAAGGAAAGCTAAGATTTTGTATAGATAGAGGAGGTACTTTCACT 163 ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| Sbjct 1 ATGGGAACTGTGATTGAAGAAAAGCTAAGATTTTGTATTGACAGAGGAGGAACTTTCACT 60 Query 164 GATGTATACGCTGAGATTCCAGGACATTCCGATGGTCATGTGTTGAAGCTTTTATCAGTT 223 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 61 GATGTGTACGCTGAGATTCCAGGACATTCCGATGGTCATGTTTTGAAGCTTTTATCAGTT 120 Query 224 GATCCATCGAATTACGACGATGCTCCGGTCGAAGGAATTCGGAGAATACTCGAGGAGTAT 283 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GATCCATCGAATTACGACGACGCTCCGGTCGAAGGAATTCGGAGAATACTCGAGGAGTAT 180 Query 284 ACAGGGAAGAAGATACCAAGAACGTCGAAGATACCAACTGATAAGATACAGTGGATTAGA 343 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 181 ACAGGGAAGAAGATACCAAGAACGTCTAAGATACCAACTGATAAGATTCAGTGGATTAGG 240 Query 344 ATGGGAACTACTGTGGCAACGAATGCTTTGTTAGAGAGGAAAGGTGAAAGAATAGCTTTG 403 ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || |||||| Sbjct 241 ATGGGGACTACTGTGGCAACCAACGCGTTGTTGGAGAGGAAAGGGGAACGGATCGCTTTG 300 Query 404 TGTGTAACTAAAGGGTTTAAAGATTTGTTGCAGATAGGTAATCAAGCTAGACCTGATATT 463 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 301 TGTGTTACTAAAGGGTTTAAAGATTTGTTGCAGATAGGTAATCAAGCTAGGCCTGATATT 360 Query 464 TTTGATCTTACTGTTGCGAAACCGTCGAATCTTTATGAGGAGGTTATAGAGGTTGATGAA 523 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| Sbjct 361 TTCGATCTTACTGTTGCGAAACCGTCGAATCTTTATGAGGATGTGATTGAGGTTGATGAA 420 Query 524 AGAGTTGTGCTTGCGTTGGAAgatgatgatgatgatgaAGGGTCGTTGATTAAAGGAGTG 583 ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | | ||||||||||||||| Sbjct 421 AGAGTTGTGCTTGGGTTGGATGGTGATGATGATGATG-ATAAT--TTGATTAAAGGAGTG 477 Query 584 TCTGGGGAGTTTCTTAGAGTTGTGAAGCCGTTTGATGGAGAAGGTTTGAAACCTTTGTTG 643 ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 478 TCTGGTGAGTTTGTTAGAGTTGTGAAACCGTTTGATGGAGATGGTTTGAAACCGTTGTTG 537 Query 644 AAGGGTTTGCTTGATAAAGGGATAAGTTGTTTGGCTGTTGTTTTGATGCATTCGTATACT 703 |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 AAGGGTTTGCTTGATAGAGGGATAAGTTGTTTGGCGGTTGTTTTGATGCATTCGTATACT 597 Query 704 TATCCGAAGCATGAGATGGATGTGGAGAAGTTGGCTTTAGAGATGGGTTTTAGACATGTT 763 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 598 TATCCGAAGCATGAGATTGCGGTGGAGAAGTTGGCTTTGGAGATGGGTTTTATACATGTT 657 Query 764 TCGTTGTCTTCTGCTTTGACACCCATGGTTCGGGCTGTTCCTCGGGGTTTAACAGCTACT 823 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 TCGTTGTCTTCTGCTTTGACTCCTATGGTTCGGGCTGTTCCTCGGGGTTTAACAGCTACT 717 Query 824 GTGGATGCGTATTTGACACCAGTGATTAAAGAGTACTTGTCGGGTTTTATTTCCAAATTT 883 |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| Sbjct 718 GTGGATGCTTATTTGACTCCGGTGATTAAAGAGTACTTATCGGGTTTCATTTCGAAGTTT 777 Query 884 GATGATGATCTTGGGAAAGTGAATGTTTTATTCATGCAATCTGATGGAGGTTTAGCACCA 943 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 GATGATGATCTTGGGAAAGTGAATGTTTTATTCATGCAATCTGATGGAGGTTTAGCACCA 837 Query 944 GAAAGTAGGTTTTCAGGGCATAAGGCTGTGTTATCAGGTCCAGCAGGAGGAGTTGTTGGT 1003 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 GAAAGTAGGTTTTCAGGGCATAAGGCTGTGTTGTCAGGTCCAGCAGGAGGAGTTGTTGGT 897 Query 1004 TACTCACAGACACTCTTTGGTCTTGAAACTGAAAAACCGCTGATTGGATTTGATATGGGT 1063 ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 898 TACTCGCAGACTCTCTTTGGTCTTGAAACTGAAAAACCGTTGATTGGATTTGATATGGGT 957 Query 1064 GGTACGTCAACGGATGTTAGCCGCTATGATGGAAGTTATGAGCAAGTTATAGAAACTCAG 1123 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 958 GGTACATCAACGGATGTTAGCCGCTATGATGGGAGTTATGAGCAAGTCATAGAAACACAG 1017 Query 1124 ATTGCTGGAACAATTATACAAGCGCCACAGCTTGACATAAATACCGTTGCTGCCGGTGGT 1183 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| Sbjct 1018 ATTGCTGGAACAATCATACAAGCGCCACAGCTTGACATAAACACTGTTGCTGCTGGTGGT 1077 Query 1184 GGGTCGAAACTAAAGTTTCAGTTTGGTGCTTTCCGAGTGGGACCTGATTCTGTGGGTGCT 1243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 GGGTCGAAACTAAAGTTTCAGTTTGGTGCTTTCCGGGTGGGACCTGATTCTGTGGGTGCT 1137 Query 1244 CACCCAGGTCCAGTTTGTTACCGGAAAGGAGGTGAGTTAGCAGTTACTGATGCGAATCTT 1303 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1138 CACCCAGGTCCAGTTTGTTACCGGAAAGGAGGGGAGTTATCAGTTACTGATGCGAATCTC 1197 Query 1304 GTTTTGGGGTTTGTTATTCCTGATTATTTTCCATCCATATTT-GGGCCCAATGAAGATCA 1362 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| Sbjct 1198 GTTTTGGGATTTGTTATTCCTGATTATTTTCCATCCAT-TTTCGGGCCTAATGAAGATCA 1256 Query 1363 GCCCTTAGATGTAGCAGCAACAAGAGAAGCATTTGAAAAGCTTGCAGGACAGATTAATAT 1422 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 1257 GCCTTTAGATGTAGCGGCAACAAGAGAAGCATTTGAAAAACTTGCAGGACAGATTAAT-T 1315 Query 1423 -ATATAGAAAGAGCCAGGATCCATCTGCAAAAGACATGTCTGTGGAGGAAATAGCAATGG 1481 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| Sbjct 1316 CATATAGAAAGAGCCAGGATCCGTCTGCAAAGGACATGACAGTGGAGGCAATAGCAATGG 1375 Query 1482 GTTTTGTGAGTGTTGCTAACGAGACAATGTGCCGTCCCATACGGCAACTGACAGAGATGA 1541 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1376 GGTTTGTGAGTGTTGCTAACGAGACAATGTGCCGTCCCATTCGGCAACTGACAGAGATGA 1435 Query 1542 AGGGTCATGAAACAAAGAATCATGCACTCGCATGCTTTGGAGGTGCTGGACCGCAACATG 1601 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1436 AGGGTCATGAAACAAAGAATCATGCACTCGCATGCTTTGGAGGTGCTGGACCGCAGCATG 1495 Query 1602 CTTGTGCAATAGCTAGGTCTTTGGGCATGAAAGAAGTTCTTGTTCACAGATACTGTGGAA 1661 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1496 CTTGTGCAATAGCCAGGTCTTTGGGCATGAAAGAAGTTCTTGTTCACAGATACTGTGGAA 1555 Query 1662 TTTTGAGTGCTTATGGAATGGGTTTGGCAGATGTCATTGAAGATGCTCAAGAGCCATATT 1721 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 1556 TTTTGAGTGCTTATGGAATGGGTTTGGCAGATGTTATAGAAGATGCTCAAGAGCCATATT 1615 Query 1722 CAGCTGTTTATGGCCCTGAATCTCTTTCAGAGGTCTTTAGAAGGGAAACGGTATTGCTGA 1781 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| Sbjct 1616 CAGCTGTTTATGGCCCTGAATCTCTTTCAGAGGCCTTTAGAAGGGAAGCTCTATTGCTGG 1675 Query 1782 GAGAAGTGAGAGAAAAGCTCCAGGAACAGGGGTTTGGTGATGGAAATATCTCCACTGAGA 1841 ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||| Sbjct 1676 GAGAAGTGAGAGAGAAGCTCCAGGAGCAGGGTTTTGATAATGGAAGTATCTCCACTGAGA 1735 Query 1842 CATATTTGAACTTAAGATATGATGGGACAGATACAGCTATCATGGTAAAGGGTaaaaaaa 1901 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1736 CATATTTGAATTTAAGATATGACGGGACAGATACAGCGATCATGGTAAAGGGTAAAAAAA 1795 Query 1902 CTGGAGATGGGTCGGCATTTGATTATGCTGCAGAGTTTCTCAAGCTTTTCGAGCAAGAGT 1961 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1796 CTGGAGATGGGTTGGCATTTGATTATGCTGCAGAGTTTCTCAAGCTTTTTGAGCAAGAGT 1855 Query 1962 ATGGATTTAAACTTCAAAACAGAAATCTTCTCATATGTGATGTTCGGGTTCGGGGAATTG 2021 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1856 ATGGATTTAAACTTCAAAACAGAAATATTCTAATATGTGATGTTCGGGTTCGGGGAATTG 1915 Query 2022 GAGTGACTAGTATACTAAAACCACGGGCAGTTGAAGCTGCCCCT-GTCACTCCTAAGGTT 2080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 1916 GAGTGACTAGTATACTAAAACCACGGGCAGTTGAAGCTGCCCCTGGT-ACTCCTAAGGTT 1974 Query 2081 GAAAGGCACTACAAGGTTTACTTTGAAGGCGGATGGCATGACACACCGTTGTTCAAGTTG 2140 |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1975 GAAAGGCACTACAAAGTTTACTTTCAAGGCGGATGGCATGACACACCGTTGTTCAAGTTG 2034 Query 2141 GAGAATTTAGGTTTTGGCCATGAGATTCTCGGCCCTGCGATCATCATGAACGGGAACAGT 2200 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 2035 GAGAATTTAGGTTTTGGCCATGAGATTCCCGGCCCTGCAATCATCATGAACGGGAATAGT 2094 Query 2201 ACAGTTATTGTAGAACCTCAGTGCAAAGCCATCATTACAAAGTATGGAAACATTAAAATT 2260 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| Sbjct 2095 ACAGTTATTGTAGAACCTCAGTGCAAAGCCATCATTACAAAATATGGGAACATCAAAATT 2154 Query 2261 GAGGTAGAGCCAGCAACGAGCAGTGTGAAGCTTGCAGAGAATGTTGCAGATGTTGTTCAG 2320 ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2155 GAGGTAGAGTCTGCAATGAGCAGTGTGAAGCTTGCAGAGAATGTTGCAGATGTTGTTCAA 2214 Query 2321 CTATCCATATTTAATCACAGATTCATGGGTATAGCTGAGCAAATGGGAAGAACCCTGCAA 2380 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2215 CTGTCCATATTTAATCACAGATTCATGGGTATAGCTGAGCAAATGGGAAGAACCCTGCAA 2274 Query 2381 CGTACTTCCATATCGACAAATATCAAAGAAAGATTGGATTTTTCATGCGCCTTGTTTAGT 2440 |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2275 CGTACTTCTATATCGACAAATATCAAGGAACGATTGGATTTTTCTTGCGCCTTGTTTAGT 2334 Query 2441 CCTGACGGTGGCTTAGTTGCTAATGCGCCACATGTTCCAGTTCATCTGGGTGCCATGTCC 2500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2335 CCTGACGGTGGCTTAGTTGCTAATGCGCCACATGTTCCAGTTCATCTGGGTGCCATGTCA 2394 Query 2501 AGTACAGTTCGCTGGCAGCTCAAACATTGGGGTGAAAATCTGAACGAAGGAGATGTTTTG 2560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2395 AGTACAGTTCGCTGGCAGCTCAAACATTGGGGTGAAAATCTGAACGAAGGAGATGTTTTG 2454 Query 2561 GTAACAAATCATCCTTGCGCCGGTGGTAGCCATTTGCCTGATATAACCGTTATCACACCT 2620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2455 GTAACAAATCATCCTTGCGCCGGTGGTAGCCATTTGCCTGATATAACCGTTATCACGCCT 2514 Query 2621 GTTTTTGACAAGGGAAAGCTTGTGTTCTTTGTGGCTAGTAGAGGTCACCACGCAGAAGTA 2680 ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2515 GTTTTTGACAATGCAAAGCTTGTGTTCTTCGTAGCTAGTAGAGGTCACCACGCAGAAGTT 2574 Query 2681 GGAGGCATAACTCCCGGAAGCATGCCTCCGTTCTCAAAGGCGATTTGGGAGGAAGGAGCT 2740 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 2575 GGAGGTATAACTCCCGGTAGCATGCCTCCGTTCTCAAAGGCGATTTGGGAAGAAGGTGCT 2634 Query 2741 GCGATAAAAGCATTTAAAGTTGTTGAAAAAGGTGTTTTTCAGGAAGAAGGAATTGTAAAA 2800 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2635 GCGATAAAAGCGTTTAAAGTTGTTGAAAAAGGTGTTTTTCAGGAAGAAGGAATTGTTAAA 2694 Query 2801 CTTCTTCAATTCCCTTCTTCTGATGAGACAACAACTAAGATTCCAGGAACCAGACGGATT 2860 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2695 CTTCTTCAATTCCCTTCTTCTGATGAGACAACAGCTAAGATTCCAGGAACCAGGCGGATT 2754 Query 2861 CAGGACAATCTCTCGGATCTCCAAGCTCAGATAGCTGCAAACCAAAGAGGAATTTCTCTA 2920 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2755 CAGGACAATCTCTCAGATCTTCAAGCTCAGATAGCTGCAAACCAAAGAGGAATTTCTCTA 2814 Query 2921 ATTAAAGAGCTGATTGAGCAATATGGCCTTGGAACTGTTCAGGCTTACATGAAATACGTT 2980 ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2815 ATTAAAGAGTTGATTGAGCAATATGGTCTTGGAACTGTTCAGGCTTACATGAAATATGTT 2874 Query 2981 CAGCTTAACGCCGAAGAAGCAGTGAGAGAAATGCTGAAGTCTGTAGCTAATAGAGTTTCC 3040 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct 2875 CAGCTTAACGCTGAAGAAGCAGTGAGAGAAATGCTGAAGTCTGTAGCTATTAGAGTCTCC 2934 Query 3041 TCGGAAACACCAAATTCCAGGGTTGGTAACTCCGTGACCATAGAAGAAGAGGATTACATG 3100 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2935 TCGGAAACACCAAATTCCAGGGTTGGTAATTCTGTGACCATAGAAGAAGAGGATTACATG 2994 Query 3101 GATGATGGATCCATAATTCACTTAAAACTCACAATTGATGCCGACAAAGGAGAAGCCTCC 3160 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct 2995 GATGATGGATCCGTCATTCACTTAAAACTCACAATTGATGCTGACAAAGGAGAAGCCTTC 3054 Query 3161 TTTGACTTTACAGGCACAAGCCCGGAAGTCTACGGTAACTGGAATGCCCCAGAAGCAGTT 3220 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3055 TTTGACTTTACAGGCACAAGCCCGGAAGTCTATGGTAACTGGAATGCCCCAGAAGCAGTT 3114 Query 3221 ACATCTGCAGCGGTTATTTACTGCCTCCGTTGTTTGGTTAATGTCGACATTCCGCTAAAC 3280 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3115 ACATCTGCAGCAGTTATTTACTGCCTCCGTTGTTTGGTTAATGTCGACATTCCGCTAAAC 3174 Query 3281 CAAGGCTGCTTAGCTCCGGTTGAGATCCGCATACCCGCTGGTTCATTCCTGTCTCCAAGC 3340 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3175 CAAGGCTGCTTAGCTCCGGTTGAGATCCGGATACCCGCTGGTTCATTCCTGTCTCCAAGC 3234 Query 3341 GAAAAAGCAGCTGTTGTTGGAGGCAACGTTCTAACATCCCAGAGAGTTACAGATGTTGTC 3400 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3235 GAAAAAGCAGCTGTTGTTGGAGGCAACGTTCTAACATCCCAGAGAGTTACAGATGTTGTT 3294 Query 3401 CTAACAGCATTCCAGGCTTGTGCTTGTTCCCAAGGATGCATGAACAATCTCACATTTGGA 3460 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3295 TTAACAGCTTTCCAGGCTTGTGCTTGTTCCCAAGGATGCATGAACAATCTCACATTTGGA 3354 Query 3461 GACGACACATTTGGGTACTACGAGACCATTGGTGGTGGATGCGGAGCCGGACCCACATGG 3520 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3355 GACGACACATTTGGGTACTACGAGACCATTGGTGGAGGATGCGGAGCCGGACCCACATGG 3414 Query 3521 AACGGGACAAGCGGAGTCCAATGCCATATGACTAACACGCGGATGACTGATCCCGAGATC 3580 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3415 GACGGTACAAGCGGAGTCCAATGCCATATGACTAACACGCGGATGACTGATCCCGAGATC 3474 Query 3581 TTTGAGCAAAGGTACCCGGTTCTGTTGCATAGATTTGGATTGAGAGAGAATAGTGGAGGC 3640 || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3475 TTCGAGCAAAGGTACCCGGTTCTGTTGCATAAATTTGGATTGAGAGAGAACAGTGGAGGT 3534 Query 3641 AATGGGTTGCATAAAGGAGGCGATGGATTGGTGAGAGAGATAGAGTTTAGAAAGCCTGTA 3700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3535 AATGGGTTGCATAAAGGAGGCGATGGATTGGTGAGAGAGATAGAGTTTAGAAAGCCAGTG 3594 Query 3701 GTGGTTAGCATCCTCTCAGAGAGAAGAGTTCACTCGCCACGTGGATTGAACGGTGGCCAA 3760 |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3595 GTGGTTAGTATCCTCTCAGAGAGACGAGTACACTCGCCACGTGGATTGAACGGTGGCCAA 3654 Query 3761 AATGGACTCCGTGGAGCAAACTATCTCATCACTAAAGACAAACGAAGAATCTATCTTGGA 3820 || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3655 AACGGAGTTCGTGGAGCAAACTATCTCATCACTAAAGACAAACGAAGAATCTATCTTGGA 3714 Query 3821 GGCAAGAATACGGTACACGTAGAAGCCGGTGAAATCTTACAGATTCTTACTCCAGGCGGT 3880 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3715 GGCAAGAATACAGTACATGTAGAAGCCGGTGAAATCCTACAGATTCTTACTCCAGGCGGT 3774 Query 3881 GGCGGATTCGGCTCCAA 3897 ||||||||||| ||||| Sbjct 3775 GGCGGATTCGGTTCCAA 3791 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 164560945652 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5