BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G37830.1
Length=4351
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg891409 jgi|Araly1|891409|Al_scaffold_0007_3395 5984 0.0
> Ahg891409 jgi|Araly1|891409|Al_scaffold_0007_3395
Length=3798
Score = 5984 bits (3240), Expect = 0.0
Identities = 3613/3797 (95%), Gaps = 9/3797 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 104 ATGGGAACTGTAATCGAAGGAAAGCTAAGATTTTGTATAGATAGAGGAGGTACTTTCACT 163
||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||
Sbjct 1 ATGGGAACTGTGATTGAAGAAAAGCTAAGATTTTGTATTGACAGAGGAGGAACTTTCACT 60
Query 164 GATGTATACGCTGAGATTCCAGGACATTCCGATGGTCATGTGTTGAAGCTTTTATCAGTT 223
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 61 GATGTGTACGCTGAGATTCCAGGACATTCCGATGGTCATGTTTTGAAGCTTTTATCAGTT 120
Query 224 GATCCATCGAATTACGACGATGCTCCGGTCGAAGGAATTCGGAGAATACTCGAGGAGTAT 283
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GATCCATCGAATTACGACGACGCTCCGGTCGAAGGAATTCGGAGAATACTCGAGGAGTAT 180
Query 284 ACAGGGAAGAAGATACCAAGAACGTCGAAGATACCAACTGATAAGATACAGTGGATTAGA 343
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 181 ACAGGGAAGAAGATACCAAGAACGTCTAAGATACCAACTGATAAGATTCAGTGGATTAGG 240
Query 344 ATGGGAACTACTGTGGCAACGAATGCTTTGTTAGAGAGGAAAGGTGAAAGAATAGCTTTG 403
||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||
Sbjct 241 ATGGGGACTACTGTGGCAACCAACGCGTTGTTGGAGAGGAAAGGGGAACGGATCGCTTTG 300
Query 404 TGTGTAACTAAAGGGTTTAAAGATTTGTTGCAGATAGGTAATCAAGCTAGACCTGATATT 463
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 301 TGTGTTACTAAAGGGTTTAAAGATTTGTTGCAGATAGGTAATCAAGCTAGGCCTGATATT 360
Query 464 TTTGATCTTACTGTTGCGAAACCGTCGAATCTTTATGAGGAGGTTATAGAGGTTGATGAA 523
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 361 TTCGATCTTACTGTTGCGAAACCGTCGAATCTTTATGAGGATGTGATTGAGGTTGATGAA 420
Query 524 AGAGTTGTGCTTGCGTTGGAAgatgatgatgatgatgaAGGGTCGTTGATTAAAGGAGTG 583
||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct 421 AGAGTTGTGCTTGGGTTGGATGGTGATGATGATGATG-ATAAT--TTGATTAAAGGAGTG 477
Query 584 TCTGGGGAGTTTCTTAGAGTTGTGAAGCCGTTTGATGGAGAAGGTTTGAAACCTTTGTTG 643
||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 478 TCTGGTGAGTTTGTTAGAGTTGTGAAACCGTTTGATGGAGATGGTTTGAAACCGTTGTTG 537
Query 644 AAGGGTTTGCTTGATAAAGGGATAAGTTGTTTGGCTGTTGTTTTGATGCATTCGTATACT 703
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 AAGGGTTTGCTTGATAGAGGGATAAGTTGTTTGGCGGTTGTTTTGATGCATTCGTATACT 597
Query 704 TATCCGAAGCATGAGATGGATGTGGAGAAGTTGGCTTTAGAGATGGGTTTTAGACATGTT 763
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 598 TATCCGAAGCATGAGATTGCGGTGGAGAAGTTGGCTTTGGAGATGGGTTTTATACATGTT 657
Query 764 TCGTTGTCTTCTGCTTTGACACCCATGGTTCGGGCTGTTCCTCGGGGTTTAACAGCTACT 823
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TCGTTGTCTTCTGCTTTGACTCCTATGGTTCGGGCTGTTCCTCGGGGTTTAACAGCTACT 717
Query 824 GTGGATGCGTATTTGACACCAGTGATTAAAGAGTACTTGTCGGGTTTTATTTCCAAATTT 883
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||
Sbjct 718 GTGGATGCTTATTTGACTCCGGTGATTAAAGAGTACTTATCGGGTTTCATTTCGAAGTTT 777
Query 884 GATGATGATCTTGGGAAAGTGAATGTTTTATTCATGCAATCTGATGGAGGTTTAGCACCA 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 GATGATGATCTTGGGAAAGTGAATGTTTTATTCATGCAATCTGATGGAGGTTTAGCACCA 837
Query 944 GAAAGTAGGTTTTCAGGGCATAAGGCTGTGTTATCAGGTCCAGCAGGAGGAGTTGTTGGT 1003
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 GAAAGTAGGTTTTCAGGGCATAAGGCTGTGTTGTCAGGTCCAGCAGGAGGAGTTGTTGGT 897
Query 1004 TACTCACAGACACTCTTTGGTCTTGAAACTGAAAAACCGCTGATTGGATTTGATATGGGT 1063
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 898 TACTCGCAGACTCTCTTTGGTCTTGAAACTGAAAAACCGTTGATTGGATTTGATATGGGT 957
Query 1064 GGTACGTCAACGGATGTTAGCCGCTATGATGGAAGTTATGAGCAAGTTATAGAAACTCAG 1123
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 958 GGTACATCAACGGATGTTAGCCGCTATGATGGGAGTTATGAGCAAGTCATAGAAACACAG 1017
Query 1124 ATTGCTGGAACAATTATACAAGCGCCACAGCTTGACATAAATACCGTTGCTGCCGGTGGT 1183
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||
Sbjct 1018 ATTGCTGGAACAATCATACAAGCGCCACAGCTTGACATAAACACTGTTGCTGCTGGTGGT 1077
Query 1184 GGGTCGAAACTAAAGTTTCAGTTTGGTGCTTTCCGAGTGGGACCTGATTCTGTGGGTGCT 1243
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 GGGTCGAAACTAAAGTTTCAGTTTGGTGCTTTCCGGGTGGGACCTGATTCTGTGGGTGCT 1137
Query 1244 CACCCAGGTCCAGTTTGTTACCGGAAAGGAGGTGAGTTAGCAGTTACTGATGCGAATCTT 1303
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1138 CACCCAGGTCCAGTTTGTTACCGGAAAGGAGGGGAGTTATCAGTTACTGATGCGAATCTC 1197
Query 1304 GTTTTGGGGTTTGTTATTCCTGATTATTTTCCATCCATATTT-GGGCCCAATGAAGATCA 1362
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1198 GTTTTGGGATTTGTTATTCCTGATTATTTTCCATCCAT-TTTCGGGCCTAATGAAGATCA 1256
Query 1363 GCCCTTAGATGTAGCAGCAACAAGAGAAGCATTTGAAAAGCTTGCAGGACAGATTAATAT 1422
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 1257 GCCTTTAGATGTAGCGGCAACAAGAGAAGCATTTGAAAAACTTGCAGGACAGATTAAT-T 1315
Query 1423 -ATATAGAAAGAGCCAGGATCCATCTGCAAAAGACATGTCTGTGGAGGAAATAGCAATGG 1481
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||
Sbjct 1316 CATATAGAAAGAGCCAGGATCCGTCTGCAAAGGACATGACAGTGGAGGCAATAGCAATGG 1375
Query 1482 GTTTTGTGAGTGTTGCTAACGAGACAATGTGCCGTCCCATACGGCAACTGACAGAGATGA 1541
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1376 GGTTTGTGAGTGTTGCTAACGAGACAATGTGCCGTCCCATTCGGCAACTGACAGAGATGA 1435
Query 1542 AGGGTCATGAAACAAAGAATCATGCACTCGCATGCTTTGGAGGTGCTGGACCGCAACATG 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1436 AGGGTCATGAAACAAAGAATCATGCACTCGCATGCTTTGGAGGTGCTGGACCGCAGCATG 1495
Query 1602 CTTGTGCAATAGCTAGGTCTTTGGGCATGAAAGAAGTTCTTGTTCACAGATACTGTGGAA 1661
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 CTTGTGCAATAGCCAGGTCTTTGGGCATGAAAGAAGTTCTTGTTCACAGATACTGTGGAA 1555
Query 1662 TTTTGAGTGCTTATGGAATGGGTTTGGCAGATGTCATTGAAGATGCTCAAGAGCCATATT 1721
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 TTTTGAGTGCTTATGGAATGGGTTTGGCAGATGTTATAGAAGATGCTCAAGAGCCATATT 1615
Query 1722 CAGCTGTTTATGGCCCTGAATCTCTTTCAGAGGTCTTTAGAAGGGAAACGGTATTGCTGA 1781
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1616 CAGCTGTTTATGGCCCTGAATCTCTTTCAGAGGCCTTTAGAAGGGAAGCTCTATTGCTGG 1675
Query 1782 GAGAAGTGAGAGAAAAGCTCCAGGAACAGGGGTTTGGTGATGGAAATATCTCCACTGAGA 1841
||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1676 GAGAAGTGAGAGAGAAGCTCCAGGAGCAGGGTTTTGATAATGGAAGTATCTCCACTGAGA 1735
Query 1842 CATATTTGAACTTAAGATATGATGGGACAGATACAGCTATCATGGTAAAGGGTaaaaaaa 1901
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 CATATTTGAATTTAAGATATGACGGGACAGATACAGCGATCATGGTAAAGGGTAAAAAAA 1795
Query 1902 CTGGAGATGGGTCGGCATTTGATTATGCTGCAGAGTTTCTCAAGCTTTTCGAGCAAGAGT 1961
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1796 CTGGAGATGGGTTGGCATTTGATTATGCTGCAGAGTTTCTCAAGCTTTTTGAGCAAGAGT 1855
Query 1962 ATGGATTTAAACTTCAAAACAGAAATCTTCTCATATGTGATGTTCGGGTTCGGGGAATTG 2021
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 ATGGATTTAAACTTCAAAACAGAAATATTCTAATATGTGATGTTCGGGTTCGGGGAATTG 1915
Query 2022 GAGTGACTAGTATACTAAAACCACGGGCAGTTGAAGCTGCCCCT-GTCACTCCTAAGGTT 2080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1916 GAGTGACTAGTATACTAAAACCACGGGCAGTTGAAGCTGCCCCTGGT-ACTCCTAAGGTT 1974
Query 2081 GAAAGGCACTACAAGGTTTACTTTGAAGGCGGATGGCATGACACACCGTTGTTCAAGTTG 2140
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 GAAAGGCACTACAAAGTTTACTTTCAAGGCGGATGGCATGACACACCGTTGTTCAAGTTG 2034
Query 2141 GAGAATTTAGGTTTTGGCCATGAGATTCTCGGCCCTGCGATCATCATGAACGGGAACAGT 2200
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2035 GAGAATTTAGGTTTTGGCCATGAGATTCCCGGCCCTGCAATCATCATGAACGGGAATAGT 2094
Query 2201 ACAGTTATTGTAGAACCTCAGTGCAAAGCCATCATTACAAAGTATGGAAACATTAAAATT 2260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 2095 ACAGTTATTGTAGAACCTCAGTGCAAAGCCATCATTACAAAATATGGGAACATCAAAATT 2154
Query 2261 GAGGTAGAGCCAGCAACGAGCAGTGTGAAGCTTGCAGAGAATGTTGCAGATGTTGTTCAG 2320
||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 GAGGTAGAGTCTGCAATGAGCAGTGTGAAGCTTGCAGAGAATGTTGCAGATGTTGTTCAA 2214
Query 2321 CTATCCATATTTAATCACAGATTCATGGGTATAGCTGAGCAAATGGGAAGAACCCTGCAA 2380
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 CTGTCCATATTTAATCACAGATTCATGGGTATAGCTGAGCAAATGGGAAGAACCCTGCAA 2274
Query 2381 CGTACTTCCATATCGACAAATATCAAAGAAAGATTGGATTTTTCATGCGCCTTGTTTAGT 2440
|||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2275 CGTACTTCTATATCGACAAATATCAAGGAACGATTGGATTTTTCTTGCGCCTTGTTTAGT 2334
Query 2441 CCTGACGGTGGCTTAGTTGCTAATGCGCCACATGTTCCAGTTCATCTGGGTGCCATGTCC 2500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 CCTGACGGTGGCTTAGTTGCTAATGCGCCACATGTTCCAGTTCATCTGGGTGCCATGTCA 2394
Query 2501 AGTACAGTTCGCTGGCAGCTCAAACATTGGGGTGAAAATCTGAACGAAGGAGATGTTTTG 2560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 AGTACAGTTCGCTGGCAGCTCAAACATTGGGGTGAAAATCTGAACGAAGGAGATGTTTTG 2454
Query 2561 GTAACAAATCATCCTTGCGCCGGTGGTAGCCATTTGCCTGATATAACCGTTATCACACCT 2620
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2455 GTAACAAATCATCCTTGCGCCGGTGGTAGCCATTTGCCTGATATAACCGTTATCACGCCT 2514
Query 2621 GTTTTTGACAAGGGAAAGCTTGTGTTCTTTGTGGCTAGTAGAGGTCACCACGCAGAAGTA 2680
||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 GTTTTTGACAATGCAAAGCTTGTGTTCTTCGTAGCTAGTAGAGGTCACCACGCAGAAGTT 2574
Query 2681 GGAGGCATAACTCCCGGAAGCATGCCTCCGTTCTCAAAGGCGATTTGGGAGGAAGGAGCT 2740
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2575 GGAGGTATAACTCCCGGTAGCATGCCTCCGTTCTCAAAGGCGATTTGGGAAGAAGGTGCT 2634
Query 2741 GCGATAAAAGCATTTAAAGTTGTTGAAAAAGGTGTTTTTCAGGAAGAAGGAATTGTAAAA 2800
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2635 GCGATAAAAGCGTTTAAAGTTGTTGAAAAAGGTGTTTTTCAGGAAGAAGGAATTGTTAAA 2694
Query 2801 CTTCTTCAATTCCCTTCTTCTGATGAGACAACAACTAAGATTCCAGGAACCAGACGGATT 2860
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2695 CTTCTTCAATTCCCTTCTTCTGATGAGACAACAGCTAAGATTCCAGGAACCAGGCGGATT 2754
Query 2861 CAGGACAATCTCTCGGATCTCCAAGCTCAGATAGCTGCAAACCAAAGAGGAATTTCTCTA 2920
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 CAGGACAATCTCTCAGATCTTCAAGCTCAGATAGCTGCAAACCAAAGAGGAATTTCTCTA 2814
Query 2921 ATTAAAGAGCTGATTGAGCAATATGGCCTTGGAACTGTTCAGGCTTACATGAAATACGTT 2980
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2815 ATTAAAGAGTTGATTGAGCAATATGGTCTTGGAACTGTTCAGGCTTACATGAAATATGTT 2874
Query 2981 CAGCTTAACGCCGAAGAAGCAGTGAGAGAAATGCTGAAGTCTGTAGCTAATAGAGTTTCC 3040
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2875 CAGCTTAACGCTGAAGAAGCAGTGAGAGAAATGCTGAAGTCTGTAGCTATTAGAGTCTCC 2934
Query 3041 TCGGAAACACCAAATTCCAGGGTTGGTAACTCCGTGACCATAGAAGAAGAGGATTACATG 3100
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 TCGGAAACACCAAATTCCAGGGTTGGTAATTCTGTGACCATAGAAGAAGAGGATTACATG 2994
Query 3101 GATGATGGATCCATAATTCACTTAAAACTCACAATTGATGCCGACAAAGGAGAAGCCTCC 3160
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 2995 GATGATGGATCCGTCATTCACTTAAAACTCACAATTGATGCTGACAAAGGAGAAGCCTTC 3054
Query 3161 TTTGACTTTACAGGCACAAGCCCGGAAGTCTACGGTAACTGGAATGCCCCAGAAGCAGTT 3220
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3055 TTTGACTTTACAGGCACAAGCCCGGAAGTCTATGGTAACTGGAATGCCCCAGAAGCAGTT 3114
Query 3221 ACATCTGCAGCGGTTATTTACTGCCTCCGTTGTTTGGTTAATGTCGACATTCCGCTAAAC 3280
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 ACATCTGCAGCAGTTATTTACTGCCTCCGTTGTTTGGTTAATGTCGACATTCCGCTAAAC 3174
Query 3281 CAAGGCTGCTTAGCTCCGGTTGAGATCCGCATACCCGCTGGTTCATTCCTGTCTCCAAGC 3340
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 CAAGGCTGCTTAGCTCCGGTTGAGATCCGGATACCCGCTGGTTCATTCCTGTCTCCAAGC 3234
Query 3341 GAAAAAGCAGCTGTTGTTGGAGGCAACGTTCTAACATCCCAGAGAGTTACAGATGTTGTC 3400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3235 GAAAAAGCAGCTGTTGTTGGAGGCAACGTTCTAACATCCCAGAGAGTTACAGATGTTGTT 3294
Query 3401 CTAACAGCATTCCAGGCTTGTGCTTGTTCCCAAGGATGCATGAACAATCTCACATTTGGA 3460
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3295 TTAACAGCTTTCCAGGCTTGTGCTTGTTCCCAAGGATGCATGAACAATCTCACATTTGGA 3354
Query 3461 GACGACACATTTGGGTACTACGAGACCATTGGTGGTGGATGCGGAGCCGGACCCACATGG 3520
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3355 GACGACACATTTGGGTACTACGAGACCATTGGTGGAGGATGCGGAGCCGGACCCACATGG 3414
Query 3521 AACGGGACAAGCGGAGTCCAATGCCATATGACTAACACGCGGATGACTGATCCCGAGATC 3580
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3415 GACGGTACAAGCGGAGTCCAATGCCATATGACTAACACGCGGATGACTGATCCCGAGATC 3474
Query 3581 TTTGAGCAAAGGTACCCGGTTCTGTTGCATAGATTTGGATTGAGAGAGAATAGTGGAGGC 3640
|| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3475 TTCGAGCAAAGGTACCCGGTTCTGTTGCATAAATTTGGATTGAGAGAGAACAGTGGAGGT 3534
Query 3641 AATGGGTTGCATAAAGGAGGCGATGGATTGGTGAGAGAGATAGAGTTTAGAAAGCCTGTA 3700
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3535 AATGGGTTGCATAAAGGAGGCGATGGATTGGTGAGAGAGATAGAGTTTAGAAAGCCAGTG 3594
Query 3701 GTGGTTAGCATCCTCTCAGAGAGAAGAGTTCACTCGCCACGTGGATTGAACGGTGGCCAA 3760
|||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3595 GTGGTTAGTATCCTCTCAGAGAGACGAGTACACTCGCCACGTGGATTGAACGGTGGCCAA 3654
Query 3761 AATGGACTCCGTGGAGCAAACTATCTCATCACTAAAGACAAACGAAGAATCTATCTTGGA 3820
|| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3655 AACGGAGTTCGTGGAGCAAACTATCTCATCACTAAAGACAAACGAAGAATCTATCTTGGA 3714
Query 3821 GGCAAGAATACGGTACACGTAGAAGCCGGTGAAATCTTACAGATTCTTACTCCAGGCGGT 3880
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 GGCAAGAATACAGTACATGTAGAAGCCGGTGAAATCCTACAGATTCTTACTCCAGGCGGT 3774
Query 3881 GGCGGATTCGGCTCCAA 3897
||||||||||| |||||
Sbjct 3775 GGCGGATTCGGTTCCAA 3791
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 164560945652
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5