BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G40480.1
Length=5987
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg493939 jgi|Araly1|493939|fgenesh2_kg.7__3372__AT5G40480.1 9149 0.0
Ahg474789 jgi|Araly1|474789|fgenesh2_kg.1__4743__AT5G40480.1 7635 0.0
Ahg947699 jgi|Araly1|947699|scaffold_703928.1 84.2 1e-14
> Ahg493939 jgi|Araly1|493939|fgenesh2_kg.7__3372__AT5G40480.1
Length=5845
Score = 9149 bits (4954), Expect = 0.0
Identities = 5561/5851 (95%), Gaps = 54/5851 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 83 CTACTTCTTCAATTTACTCTCATTCGTTTGCGTTGATGTAGCAAAAC-AA-A-AAC--CA 137
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | ||| |
Sbjct 27 CTACTTCTTCAATTCACTCTCCTTCGTCTGCGTTGATGTAGCAAAACAAAGAGAACAAAA 86
Query 138 AAATGGTTCC-CGTCTCGTTCTGCTTCTTCTTTCTCCTTCTCTTGCTCTCTGCTGGAGAG 196
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||
Sbjct 87 AAATGG-TCCGTGTCTCGTTCTGCTTCTTCTTTCTCCTTCTCCTGCTATCGGCTGGAGAA 145
Query 197 AGTTCATCGCAATTAGTTTCTGGTCCACACATCACCGATGTTAACATACTCTTACCTCCC 256
| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 ATTTCATCGCAATTAGGTTCTGGTCCACACATTACCGATGTTAACATACTCTTACCTCCG 205
Query 257 AAGATGAAGAATCCGGTTGAGTATCGCCTTCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCA 316
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 AAGATGAAGAACCCAGTTGAGTATCGCCTTCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCG 265
Query 317 TGGGATCATCATGATATTCTATCAGTCACACCTGAGTTTAATTCGAGCAGTCATTGTTCG 376
|||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 266 TGGGATCATCATGACATTCTCTCAGTTACACCTGAGTTTAATTCGAGCAGTCATTGCTCG 325
Query 377 ACCAGCGCGCGTCTCAGATCGATTTCTCCGTATAGTGGTAGAAAGGAGACTGCAGTTTAT 436
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 326 ACCAGCGCGCGTCTCAGATCGATTTCTCCGTATAGTGGTAGAAAAGAGACTGCAGTTTAT 385
Query 437 GCCACTGATATACAGACTGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTCTTTATTGACAACTTCTCA 496
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 386 GCCACTGATATACAGACCGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTGTTTATTGACAACTTCTCA 445
Query 497 CGGATTCAGATTTTTCATAATTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGTCTTTCCATGCTTAGA 556
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 446 CGGATTCAGATTTTTCATAATTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGACTTTGAATGCTTAGA 505
Query 557 GTCCGCGCTTTTGATAATGAAGATAACGAGTTCTCCTCACTGGTGGGTCTACAATTCATT 616
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506 GTCCGCGCTTTTGATAATGAAGAGAACGAGTTCTCCTCACTGGTGGGTCTACAATTCATG 565
Query 617 TGGAAGCTAATGCCTGAGAGTGGTGGATCAACACATCATCTTGCTCATGTGCCTTTGAAG 676
|||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 566 TGGAAGCTGATGCCTGAAAGTGGTGGATCAACGCATCACCTTGCTCATGTGCCTTTGAAG 625
Query 677 GAATCTCCGTTGACTGACTGTGGAGGACTGTGTGGCTACTTAGATATCCAGAAAAAGCTT 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 626 GAATCTCCGTTGACTGACTGTGGAGGACTGTGTGGCTACTTGGATATCCAGAAAAAGCTT 685
Query 737 GAAGATAGTGGTGTATTTGCAGATTTGTTTGTTGTGAAGGGAACTAAAATTGGACATGAG 796
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 686 GAAGATAGTGGTGTATTTGCAGATTTGTTTGTCGTGAAGGGAACCAAAATTGGACATGAG 745
Query 797 AAGGTTTCAGTTCATCTGCTTGAGGCTCCTCTGACCCATATAGCTGATGAAATTGTATTA 856
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||
Sbjct 746 AAGGTTTCAGTGCATCTGCTTGAGGCTCCTCTGACCCATATAGCCGATGAAATAGTACTA 805
Query 857 ACGGTTGCAGAAGCCATGTCTCTTGAACCTCGCTCACCTGTCTATGTCCTGATGGGAGCT 916
|| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 806 ACTGTGGCAGAGGCCATGTCTCTTGAACCTCGTTCACCAGTCTATGTCCTGATGGGAGCT 865
Query 917 TCTTTTGGTTACACGTTAAAGGTCATGCGTGGAAATGTTCCTCAAGCCGTGGATCTACCA 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 866 TCTTTTGGTTACACGTTAAAGGTCATGCGTGGAAATGTTCCTCAAGCCGTGCATCTACCA 925
Query 977 TCACCACATCATAGATGGTCTGTGTTAAACTCTTCTGTTGCTCAAGTGGATTCTTTGATA 1036
|||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 926 TCACCACATCATAGATGGTCTGTGTTGAACACTTCTGTTGCTCAAGTGGATTCTTTGATA 985
Query 1037 GGTCTGACTAAAGCGTTAAGCTTGGGGGTAACAACAGTTGTTGTTGAGGATACCCGGGTC 1096
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 986 GGTCTGACTAAAGCGTTAAGCTTAGGGGTAACAACAGTTGTTGTTGAGGACACCCGGGTC 1045
Query 1097 GCTGGCCACATTCAAGGATCATCTATTAATGTTGTCACTCCAGATACTCTTATCTTGTAC 1156
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1046 GCTGGCCACATTCAAGGATCATCTATTAATGTTGTCACTCCAGATACTATTATCTTGTAC 1105
Query 1157 ATATCACCTTGGTCAATGTCAGGGGATCTTATTACAGAATCCAAACCTTTTCCATCATCT 1216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1106 ATATCACCTTGGTCAATGTCAGGGGATCTTATTACAGAATCGAAACCTTTTCCATCATCG 1165
Query 1217 ATGCATTGGTATGTGGTGTCTGGTCGTCAATATCTAATTCAAATGAAGATTTTCTCTGGA 1276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 ATGCATTGGTATGTGGTGTCTGGTCGTCAATATCTAATTCAAATGAAGATTTTCTCTGGA 1225
Query 1277 AGACCTGATGCACATGAAATCTATATAACTGAGACGGATGACATAAAACTGTATGGAAAA 1336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 AGACCTGATGCACATGAAATCTATATAACTGAGACGGATGACATAAAACTGTATGGAAAA 1285
Query 1337 GATTCAGATTATTGGAAAATCGTCTCACTGCCAGATGAACTTTCCTCTGAATATGGTCAG 1396
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286 GATTCAGAGTATTGGAAAATCTTCTCACTGCCAGATGAACTTTCCTCTGAATATGGTCAG 1345
Query 1397 CGAAATTCTAGAATTTTGAACGCAATCTCACCAGGATTAGGAGAGCTGACAT--CTACAT 1454
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||
Sbjct 1346 CAAAATTCTAGAATTTTGAACGCAATGTCACCAGGATTAGGAGAGCT-A-ATGGCTACAT 1403
Query 1455 TGACTTACTTCAGTGGGCATCAAGAGTCAAAAGAGGTTCTCAAGGTTGTCCAAGAAATTA 1514
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1404 TGACTTACTTCAGTGGGCATCAGGAATCAAAAGAGGTTCTCAAAGTTGTCCAAGAAATTA 1463
Query 1515 GGGTTTGTGAAAAAGTGCAGTTCACATTGAACAGTGAAGATGACACACCTAAGGTTCTAC 1574
||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1464 TGGTTTGTGAGAAAGTGCAGTTCACATTGAACAGTAAAGATGACACACCTAAGATTCTAC 1523
Query 1575 TCCCATGGACCCCTGCTGTTTATCAGGAGATGGAGCTAATTGTGACAGGAGGTTGTGCAA 1634
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1524 TCCCTTGGACCCCTGCTGTTTATCAGGAGATGGAGCTAACTGTGACAGGAGGTTGTGCAA 1583
Query 1635 AAGCATCGAGTGACTACAAGTGGTTTACTTCAGATATAAGCATTTTGTCGGTGTCAGCTT 1694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 AAGCATCGAGTGACTACAAGTGGTTTACTTCAGATATGAGCATTTTGTCGGTGTCAGCTT 1643
Query 1695 ATGGAATTATCCAGGCAAAGAGGCCCGGTATAGCCACTGTGAAGGTGGTGTCGACTTTCG 1754
|||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1644 ATGGAATTGTCCAGGCAAAGAGGCCTGGAATAGCCACTGTGAAGGTGGTGTCTACTTTCG 1703
Query 1755 ATTCACAAAATTTTGATGAGGTTATTGTTGAAGTTTCCATTCCATCCTCTATGGTTATGT 1814
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 ATTCACAAAATTTTGATGAGGTTATCGTTGAAGTTTCCATTCCATCCTCTATGGTTATGT 1763
Query 1815 TGCAAAACTTCCCAGTAGAGACAGTTGTTGGATCACACCTGAAAGCTGCTGTCACAATGA 1874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764 TGCAAAACTTCCCAGTAGAGACAGTTGTTGGATCACACCTGAAAGCTGCTGTCACAATGA 1823
Query 1875 AGGCTTTAAATGGTGCAACGTTCTCTAGATGTGATGCTTTTAATTCATTGATAAAGTGGA 1934
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824 AGGCTTTAAATGGTGCCTTGTTCTCTAGATGTGATGCATTTAATTCATTGATAAAGTGGA 1883
Query 1935 AGACGGGGAGTGAGTCTTTTGTTATTGTTAATGCAACATCTGAGATGATGATGTTGGACG 1994
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1884 AGACAGGGAGTGACTCTTTTGTTATTGTTAATGCAACATCTGAGATAATGATGTTGGACG 1943
Query 1995 AACTAAGAAGCATGGACTCCAGCCCTCCTTGTTCACGGGCTTCTATATAT-ACTGCATCT 2053
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||
Sbjct 1944 AACTAAGAACCATGGACTCCAGCCCTCCTTGTTCACGGGCTTCTATAT-TGACTTCATCT 2002
Query 2054 ACTGGCCGCACAGTATTACAAGCAACTCTGGCAAAAGAGTTCCATTATTTTGATAAGTCT 2113
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003 CCTGGCCGAACAGTACTACAAGCAACTCTGGCAAAAGAGTTCCATTATTTTGATAAGTCT 2062
Query 2114 TTGAGTGAATCAATAGATTTGAAAGCAACTTTAACTATCGGGGCCTATCTGCCACTTTCT 2173
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063 TTGAGTGAATCAATTGATTTGAAAGCAACTTTAAGTATCGGGGCCTATCTGCCACTTTCT 2122
Query 2174 GTCAGACAAGATAGTGACGGGAATCATCATGGTGGATATTGGTTTGATAAGGCACAAGAG 2233
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2123 GTCAGACAAGATAGTGACGGGAATCATCATGGTGGATATTGGTTTGATAAGGCACAGGAA 2182
Query 2234 GAAACTGATTTTGGTGTTAGTAAGCTATATCTTGTACCTGGTACATATGTTGACGTTATG 2293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2183 GAAACTGATTTTGGTGTTAGTAAGCTATATCTTGTACCTGGGACATATGTTGACGTTATG 2242
Query 2294 CTTCTGGGTGGACCTGAAAGGTGGGATGACAATGTTGAGTTCACCGAGACTGTGAAGACA 2353
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2243 CTTCTGGGGGGACCTGAAAGGTGGGATGACAATGTTGAGTTCACCGAGACTGTGAAGACA 2302
Query 2354 TT-ATATGAAGATGAGGAGGATCTTACAAGCAGAGTTAACGTCCATCATGAGGTTGACCG 2412
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 2303 TTGA-ATGAAGATGAGGAGGATCTTACAAGCAGAGTTAACGTGCATCATGAGTTTGACCG 2361
Query 2413 CCGTGCTAACATGTATAGAATTTCATGCCAGAAGCTTGGCTCCTATAAACTGGTCTTCTT 2472
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2362 CCATGCTAACATGTATAGAATTTCGTGCCAGAAGCTTGGCTCCTATAAACTGGTCTTCTT 2421
Query 2473 GCGTGGGAATCTGCTGGGTATAGACCATCCTGTACCTGCAGTTGCAGAAGCTTTATTGTC 2532
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2422 GCGTGGGAATTTGGTGGGTATGGACCATCCTGTACCTGCAGTTGCAGAAGCTTTATTGTC 2481
Query 2533 TGTTCATTGCAGCTTACCATCCTCTGTTGTGCTCATTGTTGATGAACCTGTTAACAAGCT 2592
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2482 TGTTCATTGCAGCTTCCCATCCTCTGTTGTGCTCATTGTTGATGAACCTGTTAACAAGCT 2541
Query 2593 TGATGTGATTAGAGCTGCTAGTCAAGCTGACAGGGCACCAGGACGACTTCGTGTAACTCC 2652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2542 TGATGTGATTAGAGCTGCTAGTCAAGCTGACAGGGCACCAGGACGACTTCGTGTAACTCC 2601
Query 2653 TGTGACTGTGGCAAATGGGCAAATAATTCGTGTGGCTGCTGTTGGTATTAGCGAGTTTGG 2712
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2602 TGTGACTGTGGCAAATGGGCAGATAATTCGTGTGGCTGCTGTTGGTATTAGCGAGTTTGG 2661
Query 2713 AGAAGCTTTTTCAAACTCCTCAACTCTTTCTCTCAGGTGGGAATTGACCAGTTGCAACAA 2772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2662 AGAAGCTTTTTCAAACTCCTCAACTCTTTCTCTCAGGTGGGAACTGACCAGTTGCAACAA 2721
Query 2773 TTTGGCATACTGGGACGATGATTATAACTCAAAAATGACAAAGTCTGGCTGGGAGAGATT 2832
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2722 TTTGGCATACTGGGACGATAATTATAACTCAAAAATGACAAAGTCTAGCTGGGAGAGATT 2781
Query 2833 TCTGGCTCTACGCAATGAATCAGGATTGTGCACTGTTCGAGCCACCGTTTCTGGTATTGA 2892
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2782 TCTGGCTCTTCGCAACGAATCAGGATTGTGCACTGTCCGAGCTACCGTTTCTGGTATTGA 2841
Query 2893 TTATTCTTTCAAAAGCCAATACTCAACTCTGCTTCCACAAGGTTCTGAAAGTACTCTCAC 2952
|||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2842 TTATTC----A--------TACTCAACTCCGCTTCCACAAGGTTCTCAAAGTACTCTCAC 2889
Query 2953 TGATGCTGTACGCTTACAGTTGGTTTCCACACTAAGAGTCACACCAGAGTTCAACCTGGT 3012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2890 TGATGCTGTACGCTTACAGTTGGTTTCCACACTAAGAGTCACACCAGAGTTCAACCTGGT 2949
Query 3013 CTTTTTCAATCCTAATGCCAAGGTAAACTTGTCAATGACTGGAGGGAGCTGTTTGTGGGA 3072
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2950 CTTTTTCAATCCGAATGCCAAGGTAAATTTGTCAATGACTGGAGGGAGCTGTTTGTGGGA 3009
Query 3073 AGCAGTTGTGAATAATTCTCGTGTAGCAGAAGTTATTCGACCCCCATCTGGCCTGCAATG 3132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3010 AGCAGTTGTGAATAATTCTCGTGTAGCAGAAGTTATTCGACCCCCATCTGGCCTGCAATG 3069
Query 3133 CTCGCAAATGATGCTATCTCCAAAAGGGTTGGGGACTACAATCGTGACAGTATACGACAT 3192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3070 CTCGCAAATGATGCTATCTCCAAAAGGGTTGGGGACTACACTCGTGACAGTATACGACAT 3129
Query 3193 TGGAGTTTCTCCTCCACTTTCAGCTCTTGCGTTGATAAAAGTTGCAGATGTGGACTGGAT 3252
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3130 TGGGGTTTCTCCTCCACTTTCTGCTCTTGCGTTGATTAAAGTTGCAGATGTGGACTGGAT 3189
Query 3253 AAAGATTGCATCTGGGGATGAGATAAGTATAATGGAAGGAAGTACACACTCCATTGATCT 3312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3190 AAAGATTGCATCTGGGGATGAGATAAGTATAATGGAAGGAAGTACACACTCCATTGATCT 3249
Query 3313 CTTGACTGGCATTGACGATGGAATGACCTTTGATTCTTCCCAGTACTCACTTATGGACAT 3372
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3250 CTTGACTGGCATTGACGATGGGATGACCTTTGATTCTTCCCAGTACCCACTTATGGACAT 3309
Query 3373 TATGGTGCATATTGAGGATGATCTCGTGGAGCATGTCACTGTTGATGAGGATTCACTTTC 3432
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3310 TATGGTGCATATTGAGGATGATCTCGTAGAGCATGTCACTGTTGATGATAATTCACTTTC 3369
Query 3433 TGTTGGTGAACACGTGGCAACTTCCTCTTTTAAAATTGCTGCTAGACGACTGGGAATCAC 3492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3370 TGTTGGTGAACACGTGGCAACTTCCTCTTTTAAAATTGCTGCTAGACGACTGGGAATCAC 3429
Query 3493 AACCCTATATGTCAGCGCAAGACAACAATCAGGAGGTAAAGTGCTAAGCCAAACTATTAA 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||
Sbjct 3430 AACCCTATATGTCAGCGCAAGACAACAATCAGGAGATAAAATACTTAGCCAAACTATTAA 3489
Query 3553 AGTCGAAGTTTATTCCCCACCAAGACTTCACCCACAAGGAATATTTCTTGTTCCTGGTGC 3612
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3490 AGTCGAAGTTTATTCCCCTCCAAGACTTCACCCACAAGGAATATTTCTTGTTCCCGGTGC 3549
Query 3613 TTCCTATGTGCTCACTATTGAAGGAGGCCCGACCATGAATGTTTCTGTTGACTACACCAC 3672
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3550 TTCTTATGTGCTCACTATTGAAGGAGGCCCGACCATGAATGTTTCTGTTGACTACACCAC 3609
Query 3673 TGTGGATAACGAAGTTGCAAAGATCGAAAAATCAGGACGCCTATATGCAACATCTCCCGG 3732
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 3610 TGTGGATAACGAAGTTGCAAAGATTGAAAAATCAGGACGCCTATACGCAACATCACCAGG 3669
Query 3733 CAACACGACAATCTATGCAACAATTTACGGGAGTGAAGGTGCTGTAATTTGTCAGGCAAT 3792
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 3670 CAACACGACAATCTATGCAACGATTTACGGGAGTGAAGGTACTGTAGTTTGTCAGGCAAT 3729
Query 3793 TGGAAATGCCGAAGTAGGACTTCCTGCTACTGCAATGCTGGTAGCTCAAAGTGACACTGT 3852
||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3730 TGGCAATGCTGAAGTAGGACTTCCTGCTGCTGCGATGCTGGTAGCTCAAAGTGACACTAT 3789
Query 3853 GGCCGTTGGCCATGAAATGCCTGTATCCCCATCATTTCCTGAGGGTGACCTTTTATCTTT 3912
||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 3790 GGCCGTTGGTCATGAAATGCCTATGTCCCCATCATTTCCTGAGGGAGACCTTTTGTCATT 3849
Query 3913 TTATGAGCTCTGCAGCGCTTACAAATGGACTATTGAAGATGAAAAGGTGTTAATTTTCAT 3972
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 3850 TTATGAGCTCTGCAGCGCATACAAGTGGACTATTGAAGATGAGAAGGTGTTAATTTTCCT 3909
Query 3973 TGCATCATCCA-TCAATGTGGAAGAGAATGCTGGCTTTGTTAATGTCGTCCAAGGAAGAT 4031
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3910 TGCATCATCCACT-AATGTGGAAGAGAATGCTGGCTTTGTCAATGTCGTCCAAGGAAGAT 3968
Query 4032 CAGCTGGCAAAACCAGAGTTACAATTGCCTTCTCATGTGATTTCGTGTCTCCTGGCTTGT 4091
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3969 CAGCTGGCAAAACCAGAGTCACAATTGCCTTCTCATGTGATTTCGTGTCTCCTGGCTTGT 4028
Query 4092 ACTCTGAATCTAGAACATATGAAGCGTCAATGATTTTATCTGTTGTGCCTGATCTCCCTC 4151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4029 ACTCTGAATCTAGAACATATGAAGCGTCAATGATTTTATCTGTTGTGCCTGATCTCCCTC 4088
Query 4152 TTTCGCTTGGGGCTCCTATGACTTGGGTTCTTCCGCCTTTTTATACATCATCTGGTCTAT 4211
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4089 TTTCGCTTGGCGCTCCTATGACTTGGGTTCTTCCGCCTTTTTATACATCATCTGGTCTAT 4148
Query 4212 TACCTTCATCT-TCAGAGCCACAGAAGCATAGAGATGGACAAAGTCACAGAGGCAATATA 4270
||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4149 TACCTTCATCTCT-AGAGCCACAGAAGCATAGGGATGGCCAAAGTCACAGAGGCAATATA 4207
Query 4271 GTCTACTCCATATTGAAAGACTGCAGCTCTCGGGCTGATTTTGAACGAGATACCATATCA 4330
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4208 GTCTATTCCATATTGAAAGACTGTAGCTCTCGGGCTGATTTTGAACGAGATACCATATCA 4267
Query 4331 ATTAATGGCGGGAGTGTCAAAACAACTGATAGCAACAATGTTGCATGTATTCAAGCCAAA 4390
|| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4268 ATAAATGGCGGAAGTGTCAAAACAACAGATAGCAACAATGTTGCATGTATTCAAGCCAAA 4327
Query 4391 GACCGCACAAGTGGAAGGATTGAGATTGCTGCTTGCGTGAGAGTTGCAGAGGTTGCTCAA 4450
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4328 GACCGCACAAGTGGAAGGATTGAGATTGCTGCTTGTGTGAGGGTTGCAGAGGTTGCTCAA 4387
Query 4451 ATAAGAATGAAGAGTGAGGGGATCCCTTTCCACGTGATAGATCTTGCTGTTGGCGGTGAA 4510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4388 ATAAGAATGAAGAGTGAGGGGATCCCTTTCCACGTGATAGATCTTGCTGTTGGCGGTGAA 4447
Query 4511 CTTGAACTTCCAATAAATTACTATGACACTTTAGGAATCCCTTTTCTCGAAGCACATGGT 4570
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4448 CTTGAACTTCCAATCAATTACTATGACACTTTAGGAATCCCTTTTCTCGAAGCACATGGT 4507
Query 4571 GTTACTACATACAATGTCGAAACCAATCATCGTGATGTTGTATTTATTAAGACTGTCAAT 4630
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4508 GTTATTACATATAATGTCGAAACCAATCATCGTGATGTTGTATCTATTAAGACTGTCAAT 4567
Query 4631 GACCAACCAAGTGCCTACATTAAGGGAATAAAACATGGCAAAGCTCTCATTCGGGTTTCC 4690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4568 GACCAACCAAGTGCCTACATTAAGGGAATAAAACATGGCAAAGCTCTCATTCGGGTTTCC 4627
Query 4691 ATTGGTGATAATCTCAGGAAATCAGATTACGTTCTGGTTTCAGTTGGGGCGCATATCTTT 4750
||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4628 ATTGGCGGCAATCTCAGGAAATCAGACTATGTTCTGGTTTCAGTTGGGGCGCATATCTTT 4687
Query 4751 CCTCAAAACCCGGTCATTCACACTGGAAATTTGTTAAATTTCAGCATAACAGGGGCTGAT 4810
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 4688 CCTCAAAACCCGGTCATTCACACTGGAAATGTGTTAAATTTCAGCATAGCAGGGTCTGAT 4747
Query 4811 AATGAAGTCACTGGTCAATGGTTTACATCAAACAGAAGTGTCATATCCGTCAATGTGGCA 4870
|||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 4748 CATGAAGTCTCTGGGCAATGGGTTACATCAAACAGAAGTGTCCTATCCGTAAATGTGGCA 4807
Query 4871 TCTGGCCAAGCTAAAGCGATCAGCCAAGGCTCAACTCACGTTACATTTAAAGGTCATGGT 4930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||
Sbjct 4808 TCTGGCCAAGCTAAAGCGATCAGCCAAGGCTCAACTCAC---A--------G-TCATGGT 4855
Query 4931 TTGAAACTGCAAACAAAAGTCACAGTGCTATTTGGAAACACCATATATGTCGACTCTCCA 4990
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 4856 TTGAAACTGCAAACAAAAGTCACAGTGCTATTTGGAAACACCATTTACGTCGACTCTCCA 4915
Query 4991 GGAGAAACACTGACAAATGTCCACGTCCCTGCAGAAGGATATAAGTTTCCAGTGAAATTC 5050
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4916 AGTGAAACACTGACAAATGTCCACGTCCCTGCAGAAGGATATAAATTTCCAGTGAAATTC 4975
Query 5051 AGGGAGAACAAGTTTGCAGTCACTGAACATGGAAACAAGGCCACGTTTAACTGCCAAGTA 5110
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4976 AGGGAGAACAAGTTTGCAGTCTCTGAATATGGAAACAAGGCCACGTTTAACTGCCAAGTA 5035
Query 5111 GACCCTCCGTTTATAGGATACACAAAGCCATGGATGGATCTCGATACGGGCAACACTTAT 5170
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 5036 GACCCTCCGTTTATAGGATACGCAAAGCCATGGATGGATCTCGTTACGGGCAACATTTAT 5095
Query 5171 TGTCTTTTCTTCCCATACTCACCAGAGCATCTTGTTCACTCCATGTCTATAACAAAAGAC 5230
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5096 TGTCTTTTCTTCCCATACTCACCAGAGCATCTGGTTCGCTCCATGTCTATAACAAAAGAC 5155
Query 5231 ATGAAACCTCATGTGTCATTCTCCGTTGATGCTTCACTTAAAGAAGCTCGACGTGTTTCG 5290
||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 5156 ATGAAACCTCATGTGTCCTTCTCTGTTAATGCTTCACTTAAAGAAGCTCGTCATGTTTCG 5215
Query 5291 GGATCTGCATCTGCACTTCTTATAGGAGGGTTTTCTGTAACAGGGCCAGATAAGCTGAAT 5350
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5216 GGATCTGCATCTGCACTTCTTATTGGAGGGTTTTCTGTAACAGGGCCAAATAAGCTGAAT 5275
Query 5351 ATAAACCCGGATTCAAACACGACCATCATTTCATTAGTGGGGAACACCGATGTTCAAATT 5410
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5276 ATAAACCCGGATTCAAACACGACCATTATTTCAATAGTGGGGAACACCGATGTTCAAATT 5335
Query 5411 CACTGCCGCAACAAAGGTAGGTTATCAATCAGCTTGATTAAAAGAGACGATTTTGGTATC 5470
|||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 5336 CACTGCCGCAGCAAAGGTAGGTTATCGATCAACTTGATCAAAAGGGAAGATTTTGGTATC 5395
Query 5471 GCAGGGCATGCACAATACAAGGTAAATGTGTTAAGATCAGAGCAATTCACAGATAGAATC 5530
||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5396 GCAGGACTTGCACTATACAAGGTGAATGTGTTAAGATCAGAGCAATTCACAGATATAATC 5455
Query 5531 ATCATCACTCTACC-TGCTACTGGCCAAATTGTAGAAATCGATGTCTGCTATGACACAGG 5589
||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||
Sbjct 5456 CGCATCACTCTCCCCT-CTACTGGCCAAAGTGTAGAAATTGATGTCTCCTATGACACGGG 5514
Query 5590 AGAGTCACTAGTAGCTTCGTCTAAAGATGGTTACTCTGTTTTGTTGAAGATACTATGGGG 5649
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 5515 CGAGTCCCTAGTAGCTTCGTCTAAAGATGGATACTCTGTTTTGTTCAAGATACTATGGTG 5574
Query 5650 CGTTTTGGTGTTGGTTGTATCAGTGATCATCTTGATGAAAGTGATAGATCGACAAGTGCC 5709
|||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 5575 CGTTTTGGTGTTGGCTATATCAGTGATCATCTTGATGAAAGTGATAGATAGACAAGGGCC 5634
Query 5710 -------C-A-CAGGAGCTACTGGAACGGCAACATACAGTGGAAATGCAGCACAGGGAAC 5760
| | ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct 5635 AATTGGTCCAACAGGAGCTACTAGAACTGCAACAAACAATGGAACTGCAGCACCGGGAAC 5694
Query 5761 ACCAGAAAGAAGAAGCGGCACAGTTATATACCATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACC 5820
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5695 ACCAGAAAGAAGAAGCGGTGCAGTTATATACCATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACC 5754
Query 5821 ATTTATGGAGTATGTGAAGAGAACAGTGGATGAAACTCCCTACTACAGAAGAGAAGGAAG 5880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5755 GTTTATGGAGTATGTGAAGAGAACAGTGGATGAAACTCCCTATTACAGAAGAGAAGGAAG 5814
Query 5881 AAGAAGGTTTAATCCTCAAAACACTATGTAG 5911
|||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5815 AAGAAGGTTTAATCCTCAAAACACAATGTAG 5845
> Ahg474789 jgi|Araly1|474789|fgenesh2_kg.1__4743__AT5G40480.1
Length=5229
Score = 7635 bits (4134), Expect = 0.0
Identities = 4606/4836 (95%), Gaps = 23/4836 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 83 CTACTTCTTCAATTTACTCTCATTCGTTTGCGTTGATGTAGCAAAACAAA-AAC--CAAA 139
||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1 CTACTTCTTCAATCTACTCTCCTTTGTTTGCGTTGATGTAGCAAAACAAAGAACAAAAAA 60
Query 140 ATGGTTCCCGTCTCGTTCTGCTTCTTCTTTCTCCTTCTCTTGCTCTCTGCTGGAGAGAGT 199
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |
Sbjct 61 ATGGTTCGTTTCTCGTTCTGCTTCTTCTTTCTCCTTCTCTTGCTATCGGCTGGAGAAATT 120
Query 200 TCATCGCAATTAGTTTCTGGTCCACACATCACCGATGTTAACATACTCTTACCTCCCAAG 259
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 121 TCATCGCAATTAGGTTCTGGTCCACACATTACCGATGTTAACATACTCTTACCTCCGAAG 180
Query 260 ATGAAGAATCCGGTTGAGTATCGCCTTCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCATGG 319
|||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ATGAAGAACCCAGTTGATTATCGCCTTCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCATGG 240
Query 320 GATCATCATGATATTCTATCAGTCACACCTGAGTTTAATTCGAGCAGTCATTGTTCGACC 379
||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| || |||
Sbjct 241 GATCATCATGACATTCTCTCAGTTATACCTGAGTTTAATTCGAGCAGTCGTTGCTCAACC 300
Query 380 AGCGCGCGTCTCAGATCGATTTCTCCGTATAGTGGTAGAAAGGAGACTGCAGTTTATGCC 439
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 301 AGCGCGCGTCTGAGATCGATTTCTCCGTATAGTGGTAGAAAGGAGACTGCAGTTTATGGC 360
Query 440 ACTGATATACAGACTGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTCTTTATTGACAACTTCTCACGG 499
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ACTGATATACAGACCGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTGTTTATTGACAACTTCTCACGG 420
Query 500 ATTCAGATTTTTCATAATTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGTCTTTCCATGCTTAGAGTC 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 421 ATTCAGATTTTTCATAATTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGACTTTCCTTGCTTAGAGTC 480
Query 560 CGCGCTTTTGATAATGAAGATAACGAGTTCTCCTCACTGGTGGGTCTACAATTCATTTGG 619
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 481 CGCGCTTTTGATAATGAAGAAAACGAATTCTCCTCACTGGTGGGTCTACAATTCATGTGG 540
Query 620 AAGCTAATGCCTGAGAGTGGTGGATCAACACATCATCTTGCTCATGTGCCTTTGAAGGAA 679
||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AAGCTGATGCCTGAAAGTGGTGGATCAACGCATCACCTTGCTCATGTGCCTTTGAAGGAA 600
Query 680 TCTCCGTTGACTGACTGTGGAGGACTGTGTGGCTACTTAGATATCCAGAAAAAGCTTGAA 739
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 601 TCTCCGTTGACTGACTGTGGAGGACTGTGTGGCTACTTGGATATCCAGAAAAAGCTTGCA 660
Query 740 GATAGTGGTGTATTTGCAGATTTGTTTGTTGTGAAGGGAACTAAAATTGGACATGAGAAG 799
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 661 GATAGTGGTGTATTTGCAGATTTGTTTGTCGTGAAGGGAACCAAAATTGGACATGAGAAG 720
Query 800 GTTTCAGTTCATCTGCTTGAGGCTCCTCTGACCCATATAGCTGATGAAATTGTATTAACG 859
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||
Sbjct 721 GTTTCAGTACATCTGCTTGAGGATCCTCTGACCCATATATCCGATGAAATAGTACTAACT 780
Query 860 GTTGCAGAAGCCATGTCTCTTGAACCTCGCTCACCTGTCTATGTCCTGATGGGAGCTTCT 919
|| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GTGGCAGAGGCCATGTCTCTTGAACCTCGTTCACCAGTCTATGTCCTGATGGGAGCTTCT 840
Query 920 TTTGGTTACACGTTAAAGGTCATGCGTGGAAATGTTCCTCAAGCCGTGGATCTACCATCA 979
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 841 TTTGGTTACACGTTAAAGGTCATGCGTGAAAATGTTCCTCAAGCCGTGCATCTACCATCA 900
Query 980 CCACATCATAGATGGTCTGTGTTAAACTCTTCTGTTGCTCAAGTGGATTCTTTGATAGGT 1039
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CCACATCATAGATGGTCTGTGTTGAACACTTCTGTTGCTCAAGTGGATTCTTTGATAGGT 960
Query 1040 CTGACTAAAGCGTTAAGCTTGGGGGTAACAACAGTTGTTGTTGAGGATACCCGGGTCGCT 1099
|||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CTGACTAAAGGGTTAAGCTTGGGGTTAACAACTGTTGTTGTTGAGGATACCCGGGTCGCT 1020
Query 1100 GGCCACATTCAAGGATCATCTATTAATGTTGTCACTCCAGATACTCTTATCTTGTACATA 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GGCCACATTCAAGGATCATCTATTAATGTTGTCACTCCAGATACTCTTATCTTGTACATA 1080
Query 1160 TCACCTTGGTCAATGTCAGGGGATCTTATTACAGAATCCAAACCTTTTCCATCATCTATG 1219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TCACCTTGGTCAATGTCAGGGGATCTTATTACAGAATCGAAACCTTTTCCATCATCTATG 1140
Query 1220 CATTGGTATGTGGTGTCTGGTCGTCAATATCTAATTCAAATGAAGATTTTCTCTGGAAGA 1279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 CATTGGTATGTGGTGTCTGGTCGTCAATATCTAATTCAAATGAAGATTTTCTCTGGAAGA 1200
Query 1280 CCTGATGCACATGAAATCTATATAACTGAGACGGATGACATAAAACTGTATGGAAAAGAT 1339
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 CCTGATGCACATGAAATCTATATAACTGAGACGGATGACATAAAACTGTATGGAAAAGAA 1260
Query 1340 TCAGATTATTGGAAAATCGTCTCACTGCCAGATGAACTTTCCTCTGAATATGGTCAGCGA 1399
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1261 TCAGATTATTGGAAAATCTTCTCACTGCCAGATGAACTTTCCTCTGAATATGGTCAGCAA 1320
Query 1400 AATTCTAGAATTTTGAACGCAATCTCACCAGGATTAGGAGAGCTGACATCTACATTGACT 1459
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 1321 AATTCTAGAATTTTGAACGCAATGTCACCAGGGTTAGGAGAGCTAACAGCTACATTGACC 1380
Query 1460 TACTTCAGTGGGCATCAAGAGTCAAAAGAGGTTCTCAAGGTTGTCCAAGAAATTAGGGTT 1519
||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1381 TACTTCAGTGGGCATCAGGAATCAAAAGAAGTTCTCAAAATTGTCCAAGAAATTATGGTT 1440
Query 1520 TGTGAAAAAGTGCAGTTCACATTGAACAGTGAAGATGACACACCTAAGGTTCTACTCCCA 1579
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1441 TGTGAGAAAGTGCAGTTCACATTGAACAGTAAAGATGACACACCTAAGATTCTACTCCCT 1500
Query 1580 TGGACCCCTGCTGTTTATCAGGAGATGGAGCTAATTGTGACAGGAGGTTGTGCAAAAGCA 1639
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 TGGACCCCTGCTGTTTATCAGGAGATGGAGCTAATTGTTACAGGAGGTTGTGCAAAAGCA 1560
Query 1640 TCGAGTGACTACAAGTGGTTTACTTCAGATATAAGCATTTTGTCGGTGTCAGCTTATGGA 1699
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1561 TCGAGTGACTACAAGTGGTTTACTTCAGATATGAGCATTTTTTCGGTGTCAGCTTATGGA 1620
Query 1700 ATTATCCAGGCAAAGAGGCCCGGTATAGCCACTGTGAAGGTGGTGTCGACTTTCGATTCA 1759
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1621 ATTATCCAGGCAAAGAGGCCTGGAATAGCCACTGTGAAGGTGGTGTCAACTTTTGATTCA 1680
Query 1760 CAAAATTTTGATGAGGTTATTGTTGAAGTTTCCATTCCATCCTCTATGGTTATGTTGCAA 1819
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 CAAAATTTTGATGAGGTTATCGTTGAAGTTTCCATTCCATCCTCTATGGTTATGTTGCAA 1740
Query 1820 AACTTCCCAGTAGAGACAGTTGTTGGATCACACCTGAAAGCTGCTGTCACAATGAAGGCT 1879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 AACTTCCCAGTAGAGACAGTTGTTGGATCACACCTGAAAGCTGCTGTCACAATGAAGGCT 1800
Query 1880 TTAAATGGTGCAACGTTCTCTAGATGTGATGCTTTTAATTCATTGATAAAGTGGAAGACG 1939
| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 TCAAATGGTGCCTCTTTCTCTAGATGTGATGCTTTTAATTCATTGATAAAGTGGAAGACG 1860
Query 1940 GGGAGTGAGTCTTTTGTTATTGTTAATGCAACATCTGAGATGATGATGTTGGACGAACTA 1999
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 GGGAGTGACTCTTTTGTTATTGTTAATGCGACATCTGAGATGATGATGTTGGACGAACTA 1920
Query 2000 AGAAGCATGGACTCCAGCCCTCCTTGTTCACGGGCTTCTATATATACTGCATCTACTGGC 2059
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1921 AGAAGCATGGACTCCAGCCCTCCTTGTTCGCAGGCTTCTATATATACTTCATCTCCTGGC 1980
Query 2060 CGCACAGTATTACAAGCAACTCTGGCAAAAGAGTTCCATTATTTTGATAAGTCTTTGAGT 2119
||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1981 CGCACAGTACTCCAAGCAACTTTGGCAAAAGAGTTCCATTATTTTGATAAGTCGTTGAGT 2040
Query 2120 GAATCAATAGATTTGAAAGCAACTTTAACTATCGGGGCCTATCTGCCACTTTCTGTCAGA 2179
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GAATCAATAGATTTGAAAGCAACTTTAAGTATCGGGGCCTATCTGCCACTTTCTGTCAGA 2100
Query 2180 CAAGATAGTGACGGGAATCATCATGGTGGATATTGGTTTGATAAGGCACAAGAGGAAACT 2239
|||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2101 CAAGATAGCGACGGGAATCATCACGGTGGATATTTGTTTGATAAGGCACAAGAAGAAACT 2160
Query 2240 GATTTTGGTGTTAGTAAGCTATATCTTGTACCTGGTACATATGTTGACGTTATGCTTCTG 2299
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 GATTTTGGTGTTAGTAAGCTATATCTTGTACCTGGGACATATGTTGACGTTATGCTTCTG 2220
Query 2300 GGTGGACCTGAAAGGTGGGATGACAATGTTGAGTTCACCGAGACTGTGAAGACATTATAT 2359
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2221 GGGGGACCTGAAAGGTGGGATGACAATGTTGAGTTCACCGAGACTGTGAAGACATTGTAT 2280
Query 2360 GAAGATGAGGAGGATCTTACAAGCAGAGTTAACGTCCATCATGAGGTTGACCGCCGTGCT 2419
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 2281 GAAGATGAGGAGGATCTTACAAGCAGAGTTAACGTGCATCATGAGTTTGACCGCCATGCT 2340
Query 2420 AACATGTATAGAATTTCATGCCAGAAGCTTGGCTCCTATAAACTGGTCTTCTTGCGTGGG 2479
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 AACATATATAGAATTTCGTGCCAGAAGCTTGGCTCCTATAAACTGGTCTTCTTGCGTGGG 2400
Query 2480 AATCTGCTGGGTATAGACCATCCTGTACCTGCAGTTGCAGAAGCTTTATTGTCTGTTCAT 2539
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 TATCTGGTGGGTATGGACCATCCTGTACCTGCAGTTGCAGAAGCTTTATTGTCTGTTCAT 2460
Query 2540 TGCAGCTTACCATCCTCTGTTGTGCTCATTGTTGATGAACCTGTTAACAAGCTTGATGTG 2599
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 TGCAGCTTCCCATCCTCTGTTGTGCTCATTGTTGATGAACCTGTTAACAAGCTTGATGTG 2520
Query 2600 ATTAGAGCTGCTAGTCAAGCTGACAGGGCACCAGGACGACTTCGTGTAACTCCTGTGACT 2659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 ATTAGAGCTGCTAGTCAAGCTGACAGGGCACCAGGACGACTTCGTGTAACTCCTGTGACT 2580
Query 2660 GTGGCAAATGGGCAAATAATTCGTGTGGCTGCTGTTGGTATTAGCGAGTTTGGAGAAGCT 2719
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 GTGGCAAATGGGCAGATAATTCGTGTGGCTGCTGTTGGTATTAGCGAGTTTGGAGAAGCT 2640
Query 2720 TTTTCAAACTCCTCAACTCTTTCTCTCAGGTGGGAATTGACCAGTTGCAACAATTTGGCA 2779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 TTTTCAAACTCCTCAACTCTTTCTCTCAGGTGGGAACTGACCAGTTGCAACAATTTGGCA 2700
Query 2780 TACTGGGACGATGATTATAACTCAAAAATGACAAAGTCTGGCTGGGAGAGATTTCTGGCT 2839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 2701 TACTGGGACGATGATTATAACTCAAAAATGACAAAGTCTAGCCGGGAGAGATTTCTGGCT 2760
Query 2840 CTACGCAATGAATCAGGATTGTGCACTGTTCGAGCCACCGTTTCTGGTATTGATTATTCT 2899
|| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 CTTCGCAACGAATCAGGATTGTGCACTGTCCGAGCCACCGTTTCTGGTATTGATTATTC- 2819
Query 2900 TTCAAAAGCCAATACTCAACTCTGCTTCCACAAGGTTCTGAAAGTACTCTCACTGATGCT 2959
| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 ---A--------TACTCAACTCCGCTTCCACAAGGTTCTCAAAGTACTCTCACTGATGCT 2868
Query 2960 GTACGCTTACAGTTGGTTTCCACACTAAGAGTCACACCAGAGTTCAACCTGGTCTTTTTC 3019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2869 GTACGCTTACAGTTGGTTTCCACACTAAGAGTCACACCAGAGTTCAACCTGGTCTTTTTC 2928
Query 3020 AATCCTAATGCCAAGGTAAACTTGTCAATGACTGGAGGGAGCTGTTTGTGGGAAGCAGTT 3079
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2929 AATCCTAATGCCAAGGTAAATTTGTCAATGACTGGAGGGAGCTGTTTGTGGGAAGCAGTT 2988
Query 3080 GTGAATAATTCTCGTGTAGCAGAAGTTATTCGACCCCCATCTGGCCTGCAATGCTCGCAA 3139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2989 GTGAATAATTCTCGTGTAGCAGAAGTTATTCGACCCCCATCTGGCCTGCAATGCTCGCAA 3048
Query 3140 ATGATGCTATCTCCAAAAGGGTTGGGGACTACAATCGTGACAGTATACGACATTGGAGTT 3199
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3049 ATGATGCTATCTCCAAAAGGGTTGGGGACTACACTCGTGACAGTATACGACATTGGGGTT 3108
Query 3200 TCTCCTCCACTTTCAGCTCTTGCGTTGATAAAAGTTGCAGATGTGGACTGGATAAAGATT 3259
||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TCTTCTCCACTTTCAGCACTTGCGTTGATTAAAGTTGCAGATGTGGACTGGATAAAGATT 3168
Query 3260 GCATCTGGGGATGAGATAAGTATAATGGAAGGAAGTACACACTCCATTGATCTCTTGACT 3319
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3169 GCATCTGGGGATGAGACAAGTATAATGGAAGGAAGTTCACACTCCATTGATCTCTTGACT 3228
Query 3320 GGCATTGACGATGGAATGACCTTTGATTCTTCCCAGTACTCACTTATGGACATTATGGTG 3379
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 GGCATTGACGATGGGATGACCTTTGATTCTTCCCAGTACCCACTTATGGACATTATGGTG 3288
Query 3380 CATATTGAGGATGATCTCGTGGAGCATGTCACTGTTGATGAGGATTCACTTTCTGTTGGT 3439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||
Sbjct 3289 CATATTGAGGATGATCTCGTGGAGCATGTCACTGTTGATGATAATTCACTTTCGGTCGGT 3348
Query 3440 GAACACGTGGCAACTTCCTCTTTTAAAATTGCTGCTAGACGACTGGGAATCACAACCCTA 3499
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3349 GAACACGTGGGAACTTCCTCTTTTAAAATTGCTGCTAGACGACTGGGAATCACAACCCTA 3408
Query 3500 TATGTCAGCGCAAGACAACAATCAGGAGGTAAAGTGCTAAGCCAAACTATTAAAGTCGAA 3559
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3409 TATGTCAGCGCAAGACAACAATCAGGAGATAAAGTACTAAGCCAGACTATTAAAGTCGAA 3468
Query 3560 GTTTATTCCCCACCAAGACTTCACCCACAAGGAATATTTCTTGTTCCTGGTGCTTCCTAT 3619
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3469 GTTTATTCCCCTCCAAGACTTCACCCACAAGGAATATTTCTTGTTCCCGGTGCTTCTTAT 3528
Query 3620 GTGCTCACTATTGAAGGAGGCCCGACCATGAATGTTTCTGTTGACTACACCACTGTGGAT 3679
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3529 GTGCTCACTGTTGTAGGAGGCCCGACCATGAATGTTTCTGTTGACTACACCACTGTGGAT 3588
Query 3680 AACGAAGTTGCAAAGATCGAAAAATCAGGACGCCTATATGCAACATCTCCCGGCAACACG 3739
| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3589 AGCGAAGTGGCAAAGGTTGAAAAATCAGGACGCCTATACGCAACATCACCCGGCAACACG 3648
Query 3740 ACAATCTATGCAACAATTTACGGGAGTGAAGGTGCTGTAATTTGTCAGGCAATTGGAAAT 3799
|||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3649 ACAATCTATGCAACGATTTACGGGAGTGAAGGTACTGTAATTTGTCAGGCAATTGGCAAT 3708
Query 3800 GCCGAAGTAGGACTTCCTGCTACTGCAATGCTGGTAGCTCAAAGTGACACTGTGGCCGTT 3859
|| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3709 GCTGAAGTAGGACTTCCTGCTGCTGCGATGCTGGTAGCTCAAAGTGACACTGTGGCCGTT 3768
Query 3860 GGCCATGAAATGCCTGTATCCCCATCATTTCCTGAGGGTGACCTTTTATCTTTTTATGAG 3919
|| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3769 GGTCATGAAATGCCTACGTCCCCATTATTTCCTGAGGGAGACCTTTTGTCTTTTTATGAG 3828
Query 3920 CTCTGCAGCGCTTACAAATGGACTATTGAAGATGAAAAGGTGTTAATTTTCATTGCATCA 3979
|||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3829 CTCTGCAGTGCATACAAGTGGACTATTGAAGATGAGAAGGTGTTAATTTTCATTGCATCA 3888
Query 3980 TCCATCAATGTGGAAGAGAATGCTG--G-CTTTGTTAATGTCGTCCAAGGAAGATCAGCT 4036
||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3889 TCCATCAATGTGGAAGAGAATGCTGCTGGCTTTATCAATGTCGTCCAAGGAAGATCAGCT 3948
Query 4037 GGCAAAACCAGAGTTACAATTGCCTTCTCATGTGATTTCGTGTCTCCTGGCTTGTACTCT 4096
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3949 GGCAAAACCAGAATCACAATTGCCTTCTCATGTGATTTCGTGTCTCCTGGCTTGTACTCT 4008
Query 4097 GAATCTAGAACATATGAAGCGTCAATGATTTTATCTGTTGTGCCTGATCTCCCTCTTTCG 4156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4009 GAATCTAGAACATATGAAGCGTCAATGATTTTATCTGTTGTGCCTGATCTCCCTCTTTCG 4068
Query 4157 CTTGGGGCTCCTATGACTTGGGTTCTTCCGCCTTTTTATACATCATCTGGTCTATTACCT 4216
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4069 CTTGGCGCTCCTATGACTTGGGTTCTTCCGCCTTTTTATACATCATCTGGTCTATTACCT 4128
Query 4217 TCATCT-TCAGAGCCACAGAAGCATAGAGATGGACAAAGTCACAGAGGCAATATAGTCTA 4275
|||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4129 TCATCTCT-AGAGCCACAGAAGCATAGGGATGGCCAAAGTCACAGAGGCAATAGAGTCTA 4187
Query 4276 CTCCATATTGAAAGACTGCAGCTCTCGGGCTGATTTTGAACGAGATACCATATCAATTAA 4335
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4188 TTCCATATTGAAAGACTGTAGCTCTCCGGCTGATTTTGAACGAGATACCATATCAATTAA 4247
Query 4336 TGGCGGGAGTGTCAAAACAACTGATAGCAACAATGTTGCATGTATTCAAGCCAAAGACCG 4395
||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4248 TGGTGGAAGTGTCAAAACAACAGATAGCAACAATGTTGCATGTATTCAAGCCAAAGACCG 4307
Query 4396 CACAAGTGGAAGGATTGAGATTGCTGCTTGCGTGAGAGTTGCAGAGGTTGCTCAAATAAG 4455
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4308 CACAAGTGGAAGGATTGAGATTGCTGCTTGTGTGAGGGTTGCAGAGGTTGCTCAAATAAG 4367
Query 4456 AATGAAGAGTGAGGGGATCCCTTTCCACGTGATAGATCTTGCTGTTGGCGGTGAACTTGA 4515
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4368 AATGAAGAGTGAGGGGATCCCGTTCCACGTGATAGATCTTGCTGTCGGCGGTGAACTTGA 4427
Query 4516 ACTTCCAATAAATTACTATGACACTTTAGGAATCCCTTTTCTCGAAGCACATGGTGTTAC 4575
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4428 ACTTCCAATAAATTACTATGACACTTTAGGAATCCCTTTTCTCGAAGCACATGGTGTTAT 4487
Query 4576 TACATACAATGTCGAAACCAATCATCGTGATGTTGTATTTATTAAGACTGTCAATGACCA 4635
|||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||
Sbjct 4488 TACATACAATGTTGAAACTAATCATCGGGATGTTGTGTATGTTAAGACTGTCAATGACCA 4547
Query 4636 ACCAAGTGCCTACATTAAGGGAATAAAACATGGCAAAGCTCTCATTCGGGTTTCCATTGG 4695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4548 ACCAAGTGCCTACATTAAGGGAATAAAACATGGCAAAGCTCTCATTCGGGTTTCCATTGG 4607
Query 4696 TG--ATAA-TCTCAGGAAATCAGATTACGTTCTGGTTTCAGTTGGGGCGCATATCTTTCC 4752
| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4608 CGGCAAAAATCTCAGGAAATCAGACTACGTTCTGGTTTCAGTTGGGGCTCATATCTTTCC 4667
Query 4753 TCAAAACCCGGTCATTCACACTGGAAATTTGTTAAATTTCAGCATAACAGGGGCTGATAA 4812
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 4668 TCAAAACCCAGTCATTCACACTGGAAATTTGTTAAATTTCAGCATAGCAGGGGCTGATCA 4727
Query 4813 TGAAGTCACTGGTCAATGGTTTACATCAAACAGAAGTGTCATATCCGTCAATGTGGCATC 4872
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4728 TGAAGTCTCTGGTCAATGGGTTACATCAAACAGAAGTGTCCTATCCGTCAATGTGGCATC 4787
Query 4873 TGGCCAAGCTAAAGCGATCAGCCAAGGCTCAACTCA 4908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4788 TGGCCAAGCTAAAGCGATCAGCCAAGGCTCAACTCA 4823
Score = 377 bits (204), Expect = 4e-103
Identities = 316/366 (86%), Gaps = 23/366 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 5547 CTACTGGCCAAATTGTAGAAATCGATGTCTGC-TATGACACAGGAGAGTCACTAGTAGCT 5605
|||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| || || ||||| |||||||||
Sbjct 4886 CTACAGGCCAAAGTGTAGAAATTGATGTCT-CATATGAGACGGGCGAGTCCCTAGTAGCT 4944
Query 5606 TCGTCTAAAGATGGTTACTCTGTTTTGTTGAAGATACTATGGGGCGTTTTGGTGTTGGTT 5665
|||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |
Sbjct 4945 TCGTCTAAAGATGGATACTCTTTTTTGTTCAAGATACTATGGTGCGTTTTGGTGTGGGCT 5004
Query 5666 GTATCAGTGATCATCTTGATGAAAGTGATAGATCGACAAGTGCCCACAGGAGCTACTGGA 5725
|||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||| ||
Sbjct 5005 ATATCAGGGATCATCTCGATGAAAGTGATAG---G----GT-----------CTA---GA 5043
Query 5726 ACGGCAACATACAGTGGAAATGCAGCACAGGGAACACCAGAAAGAAGAAGCGGCACAGTT 5785
| |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5044 ATTGCAACAAACAGTGGAACTGCAGGACCGGGAACACCAGAAAGAAGAAGCGGTGCAGTA 5103
Query 5786 ATATACCATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACCATTTATGGAGTATGTGAAGAGAACA 5845
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5104 ATATACCATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACCGTTTATGGAGTATGTGAAGAGAACA 5163
Query 5846 GTGGATGAAACTCCCTACTACAGAAGAGAAGGAAGAAGAAGGTTTAATCCTCAAAACACT 5905
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5164 GTGGATGAAACTCCCTATTACAGAAGAGAAGGAAGAAGAAGGTTTAATCCTCAAAACACT 5223
Query 5906 ATGTAG 5911
||||||
Sbjct 5224 ATGTAG 5229
> Ahg947699 jgi|Araly1|947699|scaffold_703928.1
Length=200
Score = 84.2 bits (45), Expect = 1e-14
Identities = 53/57 (93%), Gaps = 0/57 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2907 GCCAATACTCAACTCTGCTTCCACAAGGTTCTGAAAGTACTCTCACTGATGCTGTAC 2963
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||
Sbjct 89 GCCACTACTCAACTCTGCTTCCACAAGGTTCTGAAAATACTCTCACCGATGATGTAC 145
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 226823135080
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5