BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G41360.1
Length=2694
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg947584 jgi|Araly1|947584|scaffold_703813.1 3759 0.0
Ahg891524 jgi|Araly1|891524|Al_scaffold_0007_3510 3306 0.0
> Ahg947584 jgi|Araly1|947584|scaffold_703813.1
Length=2347
Score = 3759 bits (2035), Expect = 0.0
Identities = 2239/2337 (96%), Gaps = 15/2337 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 218 AAAAGAAGAAAATCAATATGGGAAACGATGAAAGAAAACGACCTACAAAGAAGATGAAGT 277
|||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||
Sbjct 4 AAAAAAAGAAGATCAATATGGGAAACGGTGAAAGAGGACGACCGACGAAGAAGATGAAGT 63
Query 278 ACGGTGGGAAGGATGATCAAAAGATGAAGAACATACAAAACGTTGAAGATTACTATGATG 337
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 64 ACGGTGGGAAGGATGATCAAAAGATGAAGAACATCCAAAACGCTGAAGATTACTATGATG 123
Query 338 ATGCTGATGAGGATTCTCGTGATGGTGAAGGAGAGGAGAAGAGGAGAGATTTTACTGATT 397
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 124 ATGCTGATGAGGATTCTCGTGATGGTGCAGGAGAGGAGAAGAAGAGAGATTTTACTGAAT 183
Query 398 TGGAGTTGAAGCCGGATCATGGAAATAGGCCTTTGTGGGCTTGTGCTGATGGAAAGATTT 457
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 184 TGGAGTTGAAGCCAGATCATGGCAATAGGCCTTTGTGGGCTTGTGCTGATGGAAGGATTT 243
Query 458 TCTTGGAGACATTTTCTCCTCTCTATAAACAAGCTTATGACTTTCTTATCGCCATTGCTG 517
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 244 TCTTGGAGACGTTTTCTCCTCTCTATAAACAAGCTTATGATTTTCTTATCGCCATTGCTG 303
Query 518 AACCCGTTTGCAGGCCTGAGTCAATGCACGAGTATAATTTAACCCCACACTCGTTGTATG 577
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 AACCCGTTTGCAGGCCTGAGTCAATGCACGAGTATAGTTTAACCCCACACTCGTTGTATG 363
Query 578 CTGCTGTTTCCGTTGGTCTTGAGACAGAAACTATCATCTCTGTTTTGAATAAGCTATCTA 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 364 CTGCTGTTTCCGTTGGTCTTGAGACAGAAACTATCATCTCTGTTTTGAATAAGCTGTCTA 423
Query 638 AGACCAAGCTACCCGGGGAGATCATTGATTTCATCCATGCTTCTACTGCTAATTATGGGA 697
|||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 AGACTAAGCTACCCAATGAGATCATTGATTTTATCCATGCTTCTACTGCTAATTATGGGA 483
Query 698 AAGTGAAGTTGGTATTGAAGAAAAATCGGTATTTTATTGAATCACCATTCCCGGAGGTGT 757
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
Sbjct 484 AAGTGAAGCTGGTATTGAAGAAGAATCGGTATTTTATTGAATCCCCATTCACGGAGGTAT 543
Query 758 TGAAAAGGCTTCTCAGTGATGATGTC-ATAAATCGAGCAAGA-TTTACTTCTGAGCCATA 815
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||
Sbjct 544 TGAAAAGGCTTCTCAGTGATGAT-ACTATAAATCGAGCTAGACTTT-CTTCTGAGCCATA 601
Query 816 TTATGGTGGTGATGGATTTACGATCGGCAAAACAAGTGGTGAACTTGAAGCAGGACCTGG 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 TTATGGTGGTGATGGATTTACGATCGGCAAAACAAGTGGTGAACTTGAAGCAGGACCTGG 661
Query 876 GGAGTTGTTGAATGAAGCAGAATTGGCAGCAGCAGCAGAAGAGAAAGAAACTCACTCATT 935
|||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 662 GGAGCTGTTGAATGAAGCAGAATTGGCAGCAGCTTCGGAAGAGAAAGAAACTCATTCATT 721
Query 936 TGAGATAGACCCTGCACTGGTGGAGAATGTTAAGCAGCGTTGCTTGCCAAATGCCTTGAA 995
|||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 722 TGAGGTAGACCCTGCACAGGTGGAGAATGTGAAGCAGCGTTGCTTACCAAATGCCTTGAA 781
Query 996 TTACCCTATGTTAGAGGAATATGACTTCAGGAACGATAATGTTAATCCTGATCTTGACAT 1055
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 TTACCCTATGTTAGAGGAATATGACTTCAGGAACGACAATGTTAATCCTGATCTTGACAT 841
Query 1056 GGAACTGAAGCCCCATGCACAACCAAGGCCATACCAGGAAAAAAGTTTGAGCAAAATGTT 1115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 GGAACTGAAGCCCCATGCACAACCAAGGCCATACCAGGAAAAAAGTTTGAGCAAAATGTT 901
Query 1116 TGGAAACGGACGAGCAAGATCTGGGATTATAGTGTTACCTTGTGGAGCTGGTAAATCTCT 1175
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 902 TGGAAACGGACGAGCAAGATCTGGGATTATAGTGTTGCCTTGTGGTGCTGGTAAATCTCT 961
Query 1176 AGTTGGTGTTTCTGCAGCGGCTCGTATAAAGAAGAGTTGTCTTTGTTTGGCAACGAATGC 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AGTTGGTGTTTCTGCAGCGGCTCGTATAAAGAAGAGTTGTCTTTGTTTGGCAACGAATGC 1021
Query 1236 TGTCTCGGTGGATCAATGGGCCTACCAATTTAAGTTGTGGTCTACTATAAAAGATGACCA 1295
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1022 TGTCTCGGTGGATCAATGGGCCTACCAATTTAAGTTGTGGTCTACTATAAGAGATGACCA 1081
Query 1296 AATATGCCGTTTCACTTCTGATAGTAAAGAACGATTCCGTGGAAATGCTGGTGTTGTTGT 1355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 AATATGCCGTTTCACTTCTGATAGTAAAGAACGATTCCGTGGAAATGCTGGTGTTGTTGT 1141
Query 1356 GACAACCTATAATATGATTGCCTTTGGTGGTAAACGATCTGAAGAAGCAGAGAAGATTAT 1415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 GACAACCTATAATATGATTGCCTTTGGTGGTAAACGATCTGAAGAAGCAGAGAAGATTAT 1201
Query 1416 AGAAGAAATGAGAAACAGAGAGTGGGGGTTGCTGCTTATGGACGAGGTGCATGTGGTTCC 1475
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 AGAAGAAATGAGAAACAGAGAGTGGGGGTTACTGCTTATGGACGAGGTGCATGTGGTTCC 1261
Query 1476 AGCCCATATGTTTAGGAAAGTTATCAGTATTACAAAATCTCACTGCAAGCTAGGACTTAC 1535
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1262 AGCTCATATGTTTAGGAAAGTTATCAGTATCACAAAATCTCACTGCAAGCTGGGACTTAC 1321
Query 1536 AGCCACCCTTGTGAGAGAAGACGAAAAAATTACAGATTTAAACTTCCTCATTGGCCCGAA 1595
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 AGCCACCCTTGTGAGAGAAGACGAAAAGATTACAGATTTGAACTTCCTCATTGGCCCGAA 1381
Query 1596 ACTCTATGAAGCCAATTGGCTAGATTTAGTTAAAGGAGGCTTTATTGCAAATGTTCAGTG 1655
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1382 ACTATATGAAGCCAATTGGCTAGATTTAGTTAAAGGAGGCTTTATTGCAAATGTTCAATG 1441
Query 1656 TGCTGAAGTATGGTGTCCCATGACCAAAGAGTTTTTTGCAGAATATCTGAAGAAAGAGAA 1715
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 TGCTGAAGTATGGTGTCCTATGACCAAAGAGTTTTTTGCAGAATATCTGAAGAAAGAGAA 1501
Query 1716 CTCGaaaaaaaaaCAGGCGCTTTATGTCATGAACCCTAACAAGTTCAGAGCCTGTGAATT 1775
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 CTCCAAGAAAAAACAGGCGCTTTATGTCATGAACCCTAACAAGTTCAGAGCCTGTGAATT 1561
Query 1776 TTTGATACGTTTCCATGAACAACAACGTGGGGATAAAATCATCGTCTTTGCAGACAATCT 1835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 TTTGATACGTTTCCATGAACAACAACGTGGGGATAAAATCATCGTCTTTGCAGACAATCT 1621
Query 1836 TTTTGCACTTACAGAGTATGCAATGAAACTCCGGAAACCGATGATTTACGGTGCAACCAG 1895
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1622 TTTTGCACTTACAGAGTATGCAATGAAACTCCGGAAACCGATGATTTATGGTGCAACCAG 1681
Query 1896 CCATATCGAACGAACAAAAATTCTCGAGGCGTTTAAAACCAGTAAA-ACCGTGAACACTG 1954
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1682 CCATATCGAACGAACCAAAATTCTCGAGGCATTTAAAACCAGTAAAGA-CGTGAACACTG 1740
Query 1955 TATTCCTGTCAAAGGTTGGTGATAACTCCATAGATATCCCTGAAGCGAATGTGATCATCC 2014
| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1741 TCTTCTTGTCAAAGGTTGGTGATAACTCTATAGATATCCCTGAAGCGAATGTGATTATCC 1800
Query 2015 AGATTTCGTCACATGCTGGTTCTAGACGTCAAGAGGCTCAACGTTTGGGTCGTATCCTTA 2074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 AGATTTCGTCACATGCTGGTTCTAGACGTCAAGAGGCTCAACGTTTGGGTCGTATCCTTA 1860
Query 2075 GGGCTAAGGGTAAACTTGAAGATAGAATGGCTGGTGGAAAAGAAGAGTACAATGCATTCT 2134
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 GGGCTAAGGGTAAACTTGAAGACAGAATGGCCGGTGGAAAAGAAGAGTACAATGCATTCT 1920
Query 2135 TCTACTCGCTTGTTTCTACCGATACACAGGAAATGTATTATTCAACGAAAAGACAGCAGT 2194
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 TCTACTCACTTGTTTCTACTGATACACAGGAAATGTATTATTCAACGAAAAGACAGCAGT 1980
Query 2195 TTTTGATCGACCAAGGTTATAGCTTCAAGGTAATAACAAGCCTCCCACCTCCGGACGCGG 2254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 TTTTGATCGACCAAGGTTATAGCTTCAAGGTAATAACAAGCCTCCCACCTCCGGACGCGG 2040
Query 2255 GTTCAAGCTTGGGCTACCACAGTCAAGAAGAACAGTTGTCTCTTCTCGGAAAGGTGTTGA 2314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GTTCAAGCTTGGGCTACCACAGTCAAGAAGAACAGTTGTCTCTTCTCGGAAAGGTGTTGA 2100
Query 2315 ATGCTGGAGACGATATGGTTGGTTTAGAACAACTTGAAGAAGACACAGATGGAAAGGCTC 2374
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 2101 ATGCTGGAGACGATTTGGTTGGTTTAGAGCAACTCGAAGAAGACACAGACGGAATGGCTC 2160
Query 2375 TA-AAGA--CGCGACGAAGCATGGGATCGATGAGTGCAATGTCCGGTGCAAATGGAAGGG 2431
|| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2161 TACAAAAGGCGCGACGAAGCATGGGATCGATGAGTGCAATGTCCGGTGCAAAGGGAAGGG 2220
Query 2432 TCTACATGGAATACAACTCAGGTCGTCAAAAATCTGGT-AACCAA-TCCAAGAAACCTAA 2489
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| | | |||||||||||
Sbjct 2221 TCTACATGGAATACAACTCAGGCCGTCACAAATCCGGTCAAC-AGGTA-AAGAAACCTAA 2278
Query 2490 AGACCCAACCAAACGACAC-AATATCTTCAAAAAACGTTATGTTTGAGACAAGAGAA 2545
|||||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2279 AGACCCAACCCAACGACACCAA-ATGTTCAGAAAACGTTATGGGTGAGACAAGAGAA 2334
> Ahg891524 jgi|Araly1|891524|Al_scaffold_0007_3510
Length=2340
Score = 3306 bits (1790), Expect = 0.0
Identities = 2152/2323 (93%), Gaps = 39/2323 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 246 TGAAAGA-AAACGA-CCTACAAAGAAGATGAAGTACGGTGGGAAGGATGATCAAAAGATG 303
||||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 24 TGAAAGAGGAA-GACCCAAC-AAGAAGATCAAGTATGGTGGCAAGGATGATCAAAAGATG 81
Query 304 AAGAACATACAAAACGTTGAAGATTACTAT------GATGAT---G-----C-TGA---T 345
|||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | | ||| |
Sbjct 82 AAGAACATCCAAAACGCTGAAGATTACTATGACGAAGATGATGAAGATTCTCGTGATGGT 141
Query 346 G-A-GGA-T-TCTCG-TG-ATGGTGAAGGAGAGGAGAAGAGGAGAGATTTTACTGATTTG 399
| | | | ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||
Sbjct 142 GAACTTACTCTCTCGCTGTATGGTGAAGGAGAAGAGAAGAAGAGGGATTTTACTAAACTG 201
Query 400 GAGTTGAAGCCGGATCATG-GAAATAGGCCTTTGTGGGCTTGTGCTGATGGAAAGATTTT 458
||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 202 GAGTTGAAGCCAGATCATGTG-AACAGGCCTTTGTGGGCTTGTGCTGATGGAAGGATTTT 260
Query 459 CTTGGAGACATTTTCTCCTCTCTATAAACAAGCTTATGACTTTCTTATCGCCATTGCTGA 518
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 261 CTTGGAGACTTTTTCTCCTCTTTATAAACAAGCTTATGATTTTCTTATCGCCATTGCTGA 320
Query 519 ACCCGTTTGCAGGCCTGAGTCAATGCACGAGTATAATTTAACCCCACACTCGTTGTATGC 578
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 ACCTGTTTGCAGGCCTGAGTCAATGCACGAGTATAATTTAACCCCACACTCGTTGTATGC 380
Query 579 TGCTGTTTCCGTTGGTCTTGAGACAGAAACTATCATCTCTGTTTTGAATAAGCTATCTAA 638
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||
Sbjct 381 TGCTGTTTCCGTTGGTCTTGAGACAGAAACTATCATTTCTGTTTTGAATAAACTGTCTAA 440
Query 639 GACCAAGCTACCCGGGGAGATCATTGATTTCATCCATGCTTCTACTGCTAATTATGGGAA 698
||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 GACTAAGCTACCCAAGGAGATGATTGAGTTCATCCATGCTTCTACTGCTAATTATGGGAA 500
Query 699 AGTGAAGTTGGTATTGAAGAAAAATCGGTATTTTATTGAATCACCATTCCCGGAGGTGTT 758
||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 501 AGTGAAGCTCGTTTTGAAGAAGAATCGGTATTTTATTGAATCCCCATTCCCAGAGGTATT 560
Query 759 GAAAAGGCTTCTCAGTGATGATGTCATAAATCGAGCAAGATTTACTTCTGAGCCATATTA 818
|||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 561 GAAAAGGCTTCTCAGTGACGATGTTATTAACCGAGCTAGATTTTCTTCTGAGCCATATTA 620
Query 819 TGGTGGTGATGGATTTACGATCGGCAAAACAAGTGGTGAACTTGAAGCAGGACCTGGGGA 878
||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 621 TGGCGGTGATGGATTCACGATCGGCAAAACAAGCGGTGAACTTGAAGCAGGACCCGGGGA 680
Query 879 GTTGTTGAATGAAGCAGAATTGGCAGCAGCAGCAGAAGAGAAAGAAACTCACTCATTTGA 938
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681 GCTGTTGAATGGAGCAGAATTGGCAGCAGCAGCAGAAGAGAAAGAAACTCACTCATTTGA 740
Query 939 GATAGACCCTGCACTGGTGGAGAATGTTAAGCAGCGTTGCTTGCCAAATGCCTTGAATTA 998
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 741 GATAGACCCTGCACAGGTGGAGAATGTGAAGCAGCGTTGCTTACCAAATGCCTTGAATTA 800
Query 999 CCCTATGTTAGAGGAATATGACTTCAGGAACGATAATGTTAATCCTGATCTTGACATGGA 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 801 CCCTATGTTAGAGGAATATGACTTCAGGAACGACAATGTTAATCCCGATCTTGACATGGA 860
Query 1059 ACTGAAGCCCCATGCACAACCAAGGCCATACCAGGAAAAAAGTTTGAGCAAAATGTTTGG 1118
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 ACTGAAGCCCCATGCACAACCGAGGCCATACCAGGAAAAAAGTTTGAGCAAAATGTTTGG 920
Query 1119 AAACGGACGAGCAAGATCTGGGATTATAGTGTTACCTTGTGGAGCTGGTAAATCTCTAGT 1178
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 921 GAACGGACGAGCAAGATCTGGGATTATAGTGTTGCCTTGTGGTGCTGGTAAATCTCTAGT 980
Query 1179 TGGTGTTTCTGCAGCGGCTCGTATAAAGAAGAGTTGTCTTTGTTTGGCAACGAATGCTGT 1238
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 981 TGGTGTTTCGGCAGCGGCTCGTATAAAGAAGAGTTGTCTTTGTTTGGCGACGAATGCTGT 1040
Query 1239 CTCGGTGGATCAATGGGCCTACCAATTTAAGTTGTGGTCTACTATAAAAGATGACCAAAT 1298
|||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1041 CTCGGTGGATCAGTGGGCCTTCCAGTTCAAGTTGTGGTCTACTATAAGAGATGACCAAAT 1100
Query 1299 ATGCCGTTTCACTTCTGATAGTAAAGAACGATTCCGTGGAAATGCTGGTGTTGTTGTGAC 1358
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 ATGCCGTTTCACTTCTGATAGCAAAGAACGATTCCGTGGAAATGCTGGTGTTGTTGTGAC 1160
Query 1359 AACCTATAATATGATTGCCTTTGGTGGTAAACGATCTGAAGAAGCAGAGAAGATTATAGA 1418
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 1161 AACCTATAATATGGTTGCCTTTAGTGGTAAACGATCTGAGGAATCAGAGAAGATTATAGA 1220
Query 1419 AGAAATGAGAAACAGAGAGTGGGGGTTGCTGCTTATGGACGAGGTGCATGTGGTTCCAGC 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1221 AGAAATGAGAAACAGAGAGTGGGGGTTGCTGCTCATGGACGAGGTGCATGTGGTCCCGGC 1280
Query 1479 CCATATGTTTAGGAAAGTTATCAGTATTACAAAATCTCACTGCAAGCTAGGACTTACAGC 1538
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1281 CCATATGTTTAGGAAAGTTATCAGTATCACAAAATCTCACTGCAAGCTAGGACTGACAGC 1340
Query 1539 CACCCTTGTGAGAGAAGACGAAAAAATTACAGATTTAAACTTCCTCATTGGCCCGAAACT 1598
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 CACCCTTGTGAGAGAAGACGAAAGGATTACAGATTTGAACTTCCTCATTGGCCCGAAACT 1400
Query 1599 CTATGAAGCCAATTGGCTAGATTTAGTTAAAGGAGGCTTTATTGCAAATGTTCAGTGTGC 1658
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 ATATGAAGCCAATTGGCTAGATTTAGTTAAAGGAGGCTTTATTGCAAATGTTCAGTGTGC 1460
Query 1659 TGAAGTATGGTGTCCCATGACCAAAGAGTTTTTTGCAGAATATCTGAAGAAAGAGAACTC 1718
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1461 TGAAGTATGGTGTCCTATGACTAAAGAGTTTTTTGCAGAATATCTGAAGAAAGAAAACTC 1520
Query 1719 GaaaaaaaaaCAGGCGCTTTATGTCATGAACCCTAACAAGTTCAGAGCCTGTGAATTTTT 1778
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1521 CAAGAAAAAACAGGCACTTTATGTCATGAACCCTAACAAGTTCAGAGCCTGTGAGTTTCT 1580
Query 1779 GATACGTTTCCATGAACAACAACGTGGGGATAAAATCATCGTCTTTGCAGACAATCTTTT 1838
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 GATTCGTTTCCATGAACAACAACGTGGGGATAAAATCATTGTCTTTGCAGACAATCTTTT 1640
Query 1839 TGCACTTACAGAGTATGCAATGAAACTCCGGAAACCGATGATTTACGGTGCAACCAGCCA 1898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1641 TGCACTTACAGAGTATGCAATGAAACTCCGGAAACCGATGATTTATGGTGCAACCAGCCA 1700
Query 1899 TATCGAACGAACAAAAATTCTCGAGGCGTTTAAAACCAGTAAA-ACCGTGAACACTGTAT 1957
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |
Sbjct 1701 TATCGAACGAACCAAAATTCTCGAGGCATTTAAAACCAGTAAAGAC-GTGAACACTGTCT 1759
Query 1958 TCCTGTCAAAGGTTGGTGATAACTCCATAGATATCCCTGAAGCGAATGTGATCATCCAGA 2017
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1760 TCCTGTCAAAGGTTGGTGATAACTCTATAGATATCCCTGAAGCGAATGTGATTATCCAGA 1819
Query 2018 TTTCGTCACATGCTGGTTCTAGACGTCAAGAGGCTCAACGTTTGGGTCGTATCCTTAGGG 2077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1820 TTTCGTCACATGCTGGTTCTAGACGTCAAGAGGCTCAGCGTTTGGGTCGTATTCTTAGGG 1879
Query 2078 CTAAGGGTAAACTTGAAGATAGAATGGCTGGTGGAAAAGAAGAGTACAATGCATTCTTCT 2137
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1880 CTAAGGGTAAACTTGAAGACAGAATGGCCGGTGGAAAAGAAGAGTACAATGCATTCTTCT 1939
Query 2138 ACTCGCTTGTTTCTACCGATACACAGGAAATGTATTATTCAACGAAAAGACAGCAGTTTT 2197
|||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1940 ACTCACTTGTTTCGACAGATACACAGGAAATGTATTATTCAACGAAAAGACAACAGTTCC 1999
Query 2198 TGATCGACCAAGGTTATAGCTTCAAGGTAATAACAAGCCTCCCACCTCCGGACGCGGGTT 2257
|||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2000 TGATTGACCAAGGTTACAGCTTTAAGGTTATAACAAGCCTCCCACCTCCGGACGCGGGTT 2059
Query 2258 CAAGCTTGGGCTACCACAGTCAAGAAGAACAGTTGTCTCTTCTCGGAAAGGTGTTGAATG 2317
|||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 CAAGCTTGAGCTACCACAGTCAAGAAGAACAATTATCTCTTCTCGGAAAGGTGTTGAATG 2119
Query 2318 CTGGAGACGATATGGTTGGTTTAGAACAACTTGAAGAAGACACAGATGGAAAGGCTCTA- 2376
||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||
Sbjct 2120 CTGGAGACGATTTGGTCGGTTTAGAGCAACTCGAAGAAGACACAGACGGAATGGCTTTAC 2179
Query 2377 AAGACGCGA--CGAAGCATGGGATCGATGAG-TGCAATGTCCGGTGCAAATGGAAGGGTC 2433
|| | |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||
Sbjct 2180 AAAAGGCGAGACGAAGCATGGGATCGATGAGCTT-AATGTCTGGTGCAAAAGGAATGGTC 2238
Query 2434 TACATGGAATACAACTCAGGTCGTCAAAAATCTGGT-AACCAATCCAAGAAACCTAAAGA 2492
|||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 2239 TACATGGAATACAACTCAGGCCGTCACAAATCCGGTCAAC-AATTCAAGAAACCTAAAGA 2297
Query 2493 CCCAACCAAACGACACAATATCTTCAAAAAACGTTATGTTTGA 2535
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||
Sbjct 2298 CCCAACCAAACGACACAATCTCTTCAAAAAACGTTACGTGTGA 2340
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 101624773660
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5