BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G47480.1
Length=4345
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg494224 jgi|Araly1|494224|fgenesh2_kg.8__40__AT5G47480.1 6261 0.0
Ahg494223 jgi|Araly1|494223|fgenesh2_kg.8__39__AT5G47490.1 2558 0.0
Ahg948161 jgi|Araly1|948161|scaffold_800048.1 1581 0.0
> Ahg494224 jgi|Araly1|494224|fgenesh2_kg.8__40__AT5G47480.1
Length=4379
Score = 6261 bits (3390), Expect = 0.0
Identities = 4090/4414 (93%), Gaps = 104/4414 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTTCGACTGCTGATTTCCTCCTGGATGATCAAACGGACGAGGATTTCTTCGACAAA 60
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCGACTGCTGATTTCCTCCTGGAGGATCAAACGGACGAGGATTTCTTCGACAAA 60
Query 61 CTTGTTGATGATTCCTATACTCCTACCGCTTCATCCTCTGCCAAGGAGCTGAAATTCGAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 61 CTTGTTGATGATTCCTATACTCCTACCGCTTCATCCTCTGCTAAGGAGCTGAAATTCGAC 120
Query 121 GACGGTAGTGATTCCGATGACGCCAAAGCTTTTGCTAATCTCTCCGTCGTTGACGATGTT 180
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GACGGTAGTGATTCCGATGACGCCAGAGCTTTTGCTAATCTCTCCGTCGTTGACGATGTT 180
Query 181 TTGGGTGATGGAGATGTCGCATTGAATGAAGCAGGTTTGGGGAACGATGTTGCAAACGAG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTGGGTGATGGAGATGTCGCATTGAATGAAGCAGGTTTTGGGAACGATGTTGCAAACGAG 240
Query 241 GGTACAAGTGGTTCGGTGGGAAAAGAAGAGCCTTCTTCATCTATTGCTCCGGAAGCTGTT 300
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 241 GGTACTAGTGGTTCGGTGGGAAAAGAAGAGCCTTCTTCATCTATTGCTCCGGAAGCTCTT 300
Query 301 CAATTTGTCAACAGTGATGCAAATAGGTTAAGGGATG-T--TGATGTGGTGCGATCGGAG 357
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| |
Sbjct 301 CAATTTGTCAACAGTGATGCAAATAAGTTAAGGGATGATGATGATGTGGTGAGATCGGGG 360
Query 358 GTGGATGATATGGCACTAACTGAAACAGG-AAAAGAGAGTAATATAGTCGATGGATCTGG 416
|||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTGGATGATATGCCACTAACTGAAAC-GGCAAAAGAAAGTAATATAGTCGATGGATCTGG 419
Query 417 GAGTCCTGGGGTTAAGGAGGTTGACTGGGGCTCGTTTTATGCAGATTCATCTGTAAATGA 476
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 420 GAGTCCTGGGGTTAAGGAGGTTGGTTGGGGCTCCTTTTATGCCGATTCATCTGTAAATGA 479
Query 477 CGGTGGTGGGTTTGGTTCATACTCTGATTTCTTCACTGAGTTGGATGCAACTGCAGGAAA 536
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 480 CGGTCGTGGGTTTGGTTCATACTCTGATTTCTTCACTGAGTTGGATGGAACTGCAGGGGA 539
Query 537 TGTACAGGGACAGGCGGAGGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAGCCAATGATAC 596
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 540 TTTACAGGGACAGGCCGAGGTAGCTGTGGCCACTGGAGGCAACTTAGTAGCCAATG---C 596
Query 597 AATTAACACAAGTGTTGGTTTAGATAATTCGGCAGGCTTTGAGCAACACCAGGGTCAAGT 656
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 597 -----A-ACAAGTGTTGGTTTAGATAATTCGGCAGGGTTTGAGCAACACCATGGTCAAGT 650
Query 657 GCAACACGATTCTGGAAGCGGGCAGTATGTGGATAACAGTCAATCTTGGGAAAATCTCTA 716
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 GCAACACGATTCTGGAAGCGGGCAGTATGTGGATAATAGTCAATCTTGGGAAAATCTCTA 710
Query 717 TCCTGGATGGAAATATGATGCAAGTACTGGTCAATGGTATCAAGTTGATGGTCAGGATGC 776
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 711 TCCTGGGTGGAAATATGATGCAAGTACTGGTCAATGGTATCAAGTTGATGGTCATGATGC 770
Query 777 AACCGTTAATTCACAGGAGAGCTATATTAACTCAACAGGTAACTGGGAAAGCGTTGCTGC 836
|| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 AAGCGTGAATTCACAGGAGAGCTATACAAACTCAACAAGTAACTGGGAAAGCGTTGCTGC 830
Query 837 TGATAACTCGGATGTTGCTTATCTGAAACAGAGTACAACATCTGCAATGGCTGGCACAGC 896
||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 831 TGATATCTCAGATGTTGCTTATCTGAAGCAGAGTACAACATCTGCAGCGGCCGGCACAGC 890
Query 897 TGAGAGTGTGTCTACATGGAACCAGGTTTCACAAGTGGGCAATGGATATCCAGAACACAT 956
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 891 CGAGAGTGTGTCTACTTGGAACCAGGTTTCACAAGTGGGGAATGGATATCCAGAACACAT 950
Query 957 GGTATTTGACGCCCAGTATCCTGGATGGTACTATGACACAATTGCTCAAGAATGGCGCTC 1016
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 951 GGTCTTTGACGCTCAGTATCCTGGATGGTACTATGATACAATTGCTCAAGAGTGGCGCTC 1010
Query 1017 TCTGGACAGCTACAACCAGGCTTCCCAAACAACTGTAACTGGTCAAGCTCATGATCAGCA 1076
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 TCTGGACAGCTACAACCAGGCTTCTCAAACAACTGTAACTGGTCAAGCTCATGATCAGCA 1070
Query 1077 AGTTCAGAACGGTCATGCTCGTACAACTACGTATCACAATAATAGCCAGAGTAGTGTGTA 1136
||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 1071 AGTTCAGAATGGTCATGCTCATACAGCTACGTATCACAGTAATAGCCAGAGTAGTATGTA 1130
Query 1137 TGATGTTAACAACAAAAACCAGACATTCAAAGCGCAAGACTTTGCTATTCAGGGCCAACA 1196
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||
Sbjct 1131 TGATGTTAACGACAAAAACCAGAGTTTCAAAGCGCAAGAATATGCTATGCAGAGCCAACA 1190
Query 1197 CGGAAGTTGGGACGAATCTTACTATGCCAACAATCAGCAGGCTGGAAACACTTGGCAACC 1256
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 1191 CGGAAGTTGGGACCAATCTTACTATGCCAACAATCAGCAGGCTGCAAACACTTGGCAATC 1250
Query 1257 AGTAAATGTAGGTAAGGCTGAGCCTGCGGTAACTTCTGATTCATTATCACGCTTCGGAGG 1316
||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1251 AGTAAATGTAGGTCAGGCTGAGCCTGCTATAAATTCTAATTCATTATCAAGCTTCAGAGG 1310
Query 1317 AAACCAGCAAGTAAATAATTTGTACAGTACAGAATCTGTGGCTGAACAGTTTAAGCCAAA 1376
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 AAACCAGCATGTAAATAATTTGTACAGTACAGAACCTGTGGCTGAACAGTTTAAGCCAAA 1370
Query 1377 TACGATTGGAGCCCAGAGCTTTATCCCTCAGCATATGAATGTGGCTAGTGCCACACAAAA 1436
| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 1371 TGCGATTGGAGCGCAGAGCTTCATCCCGCAGCATATGAATGTGGCTAGTGTCACACAGAA 1430
Query 1437 TGGACCATTGAGTTTCTCAAACGATTTGTATAATAGACAGCAATCGGTAGATCATGCTCA 1496
||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 1431 TGGACCATTGAGTTTCTCAAACGGTGTCTATAATAGACAGCAATCTGTAGATGATGCTCA 1490
Query 1497 AAAGTCTTTTCAGAACAATCAGCTTTTCTCCCCAAGTGTGGGAAGATCATCTGATAGG-C 1555
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |
Sbjct 1491 TCAGTCTTTTCAGAACAATCAGCTTTTCTCCCCAAGTGCGGGAAGATCATCTGAT-GGTC 1549
Query 1556 GTCCACCACACGCACTAGTCAGTTTTGGATTTGGTGGGAAGCTCATTGTTATGAAGGATA 1615
|||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1550 GTCCACCACATGCGCTTGTCAGTTTTGGATTTGGTGGGAAGCTCATTCTTATGAAGGAT- 1608
Query 1616 AT-AATGGTTCTCTGCAGAATACATCATTTGGGAGTCAGGGGATTGGGGGAAGCTCCATC 1674
|| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1609 ATAAATGGTTCTCTGCAGAATTCATCATTTGGAAGTCAGGGAATTGGGGGAAGCTCCGCC 1668
Query 1675 ACTGTCTTAAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCCTCTTATTCCAGTCCCGGGGAA 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1669 TCTGTCTTAAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCCTCTTATTCCAGTCAAGGGGAA 1728
Query 1735 GACTCTTTGAGCTACTTTCGTTGTCTGCATCAACAATCTCTTCCAGGCCCTTTGGTAGGG 1794
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1729 GACTCTTTGAGCTACTTTCGTTGCCTGCATCAACAATCTCTTCCAGGTCCTTTGGTAGGA 1788
Query 1795 GGAAATGTTGGAAGTAAAGAGTTGCATAAGTGGATTGATGAGAGACTCTTGCATTGTGAA 1854
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 1789 GGAAATGTTGGAAGTAAAGAGTTGCACAAGTGGATTGATGAGAGAATTTTGAATTGTGAA 1848
Query 1855 TCTTCCAACATGGATTTTTCAAGAGGGAAACTCTTAAAGATGCTTCTTTCTTTGCTCAGA 1914
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||
Sbjct 1849 TCTTCCTATATGGATTTTTCAAGAGGGAAACTCTTAAAGATGCTTCTTTGTTTACTCCGA 1908
Query 1915 ATATCTTGTCAGTATTATGGGAAACTCCGATCTCCTTTTGGCT-CTGATGCATCGCAAAA 1973
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 1909 ATATCTTGTCAGTATTATGGGAAACTCCGTTCTCCTTTTGG-TACTGATGCATCGCAAAA 1967
Query 1974 GGAAACGGA-TACTCCAGAAGCAGCAGTTGCTAAACTTTTTGCATTTGCCAAGAAAGATG 2032
||||||||| | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1968 GGAAACGGACT-CTGCTGAAGCAGCAGTCGCTAAGCTTTTTGCATTTGCAAAGAAAGATG 2026
Query 2033 GCATCCAAAATGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGCTTGCAGCATTTACCACCTGAATCGC 2092
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2027 GCTTACAAAATGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGCTTGCAGCATTTACCACCTGAATCAC 2086
Query 2093 AAATGCAAGTAACTGCTTCAGAGGTTCAGAATCTTCTGGCTTCTGGTAGAAAAATGGAGG 2152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 AAATGCAAGTAACTGCTTCAGAGGTTCAGAATCTTCTGGCTTCTGGTAGAAAAATGGAGG 2146
Query 2153 CTCTACAATGTGCGCAAGAAGGCCATTTATGGGGACCGGCACTTGTCATCGCGGCTCAAC 2212
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||
Sbjct 2147 CTCTACAATGTGCACAAGAAGGCCATTTATGGGGAATAGCGCTTGTTATCGCGGCACAAC 2206
Query 2213 TTGGGGATCAGTTCTATGTAGACACTGTGAAACAAATGGCCCTTCGCCAGCTGATACCCG 2272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2207 TTGGGGATCAGTTCTATGTAGACACTGTGAAACAAATGGCCCTTCGCCAGCTGATACCAG 2266
Query 2273 GGTCACCTTTACGGACATTGTGCCTACTCGTTGCGGGACAACCAGCTGAAGTGTGTCCCA 2332
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2267 GGTCACCTTTACGGACATTGTGCCTACTGGTTGCAGGACAACCAGCTGAAGTGTGTCCCG 2326
Query 2333 CTGGAAGTAGTAGTAGCATGCTTGACAATTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATAACTGCTA 2392
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2327 CTGGAAGTAGTAG---CATGCTTGACAATTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATAACTGCTA 2383
Query 2393 ACAGAACCACAGATGACGACCTTGTGATTATTCATCTTGGAGATAGCATGTGGAAAGAAA 2452
|||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 2384 ACAGAACCACAGATGATGAGCTTGTGATTACTCATCTTGGAGATCGCATGTGGAAAGATA 2443
Query 2453 GAGGG-GAGATAATTGCGGCGCATATTTGCTATTTAATCGCAGACAAGAACTTTGATCCA 2511
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2444 G-GGGCGAGATAATTGCGGCGCATATTTGCTATTTAATCGCGGACAAGAACTTTGATCCA 2502
Query 2512 TACTCAGAAAGCGCCAGACTCTGCCTTGTCGGAGCGGACCATTGGAAATGTCCTCGAACA 2571
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 TACTCAGAAAGCGCCAGACTCTGCCTTGTCGGAGCAGACCATTGGAAATGTCCTCGAACA 2562
Query 2572 TACGCAAGTCCAGATGCTATACAGAGAACAGAGTTATATGAATACTCTAAGACGCTGGGA 2631
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563 TACGCAAGTCCAGAGGCTATACAGAGGACAGAGTTATATGAATACTCTAAGACGCTGGGA 2622
Query 2632 AACTCTCAGTATATCCTGTTACCGTTTCAACCATATAAAATCATATATGCTCATATGCTG 2691
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2623 AATTCTCAGTATATCCTGTTACCGTTTCAACCATATAAAATCATATATGCCCATATGCTG 2682
Query 2692 GCTGAAGTTGGTAAACTTTCTACTGCACAAAAGTACTGTCAAGCAGTAATAAGATGCCTC 2751
|||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 2683 GCTGAAGTTGGTAAACTTTCGACTGCGCTGAAGTACTGTCAAGCAGTATTAAAATGCCTC 2742
Query 2752 AAGACTAG-CCGATCATCTGAAGTAGAAATGTGGAAGCAGTTTGCTTCATCTCTTGAAGA 2810
||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2743 AAGAC-AGGCCGATCACCAGAAGTGGAAATGTGGAAACAGTTTGTTTCATCTCTTGAAGA 2801
Query 2811 GAGAATCCGTAGCCATCAAGAGGGTGGG-A-A-T-----T-TGGCCCCAGCAAAACTTGT 2861
||||||||||| ||| ||| |||| ||| | | | | |||||||||||||||||||
Sbjct 2802 GAGAATCCGTATCCACCAACAGGGCGGGTATACTGCGAATATGGCCCCAGCAAAACTTGT 2861
Query 2862 TGGAAAG--C-TG--CT-----GA-ACT-C----T-T--TGT-G--GGGG--ATGCCACC 2897
||||||| | || || || ||| | | | ||| | |||| ||||||||
Sbjct 2862 TGGAAAGTTCCTGAACTTTATTGATACTACAGCATCTCGTGTTGTTGGGGGGATGCCACC 2921
Query 2898 ACCTGCACCACATTCAACAACTGGAAACCCGCAGGTAAATGAGTATCAACATCAACAGCA 2957
||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2922 ACCTGCACCACATTCAACAACCGGAAACCTGCCGGTAAATGACTATCAACATCAACAGCA 2981
Query 2958 GGAAGCGGCTAAGTTATCATATAGTCAATCCGCTAATACAATGTCATCATTGATGCCACC 3017
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 GGAAGCAGCTAAGTTATCATATAGTCAATCGGCTAATACAATGTCATCATTGATGCCACC 3041
Query 3018 TGCTTC---AATTGAACCCGTACATGAGTGGGGTGGGAACGGGAGGACAATGGCAGCACA 3074
|||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3042 TGCTTCTTCAATTGAACCCGTGCGTGAGTTGGGTGGGAACGGGAGGACAATGGCAGCACA 3101
Query 3075 TTCTAGAAGTGTATCAGAGCCAGATTTCAGTAGGACGCCAATACAGGATCAGACTGACTC 3134
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3102 TTCTAGAAGTGTATCAGAACCAGATTTCGGTAGGACGCCAATACAGGATCAGACTGACTC 3161
Query 3135 CTCAAAAGACAAAGCTCCTGATGGGGTGACACAGGTGAAATCAACTCGGAAG-GTGCCAA 3193
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||
Sbjct 3162 CTCAAAAGACAAAGCTGCTGATGGGGTGACACAGGTGAAAGCAACTCGTA-GTGTGCCAA 3220
Query 3194 GTTCTCGGTTTAGCCGCTTTGGTATTGGCATATTGAAGAACACTGTAGGGAAGGTCTTCC 3253
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||| |
Sbjct 3221 GTTCTCGGTTTAGCCGCTTTGGTATTGGAATACTGAAGA-----G--GG-----TCTTAC 3268
Query 3254 CATCTCGATCATCTAATGAGGCAAAACTGGGTAATGAGAATCAATTCTACTATGACGATA 3313
||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3269 CATCTCGTTCATCTAAAGAGGCAAAACTGGGTGACGAGAATCAATTCTACTATGACGATA 3328
Query 3314 ACCTAAAGAGATGGGTGGAAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAGGAAGCTGCACTACCTC 3373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3329 ATCTAAAGAGATGGGTGGAAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAGGAAGCTGCACTACCTC 3388
Query 3374 CTCCTCCAACGTCAGTCCCATTCCGAAGCAACTCATTGGGTCATGAAAACAAGTCTGAGA 3433
|||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
Sbjct 3389 CTCCTCCAACGTTAGGCGCATTCCGAAGCAACTCATTGGGTTATGAAAACAAATCTGACA 3448
Query 3434 TAAAGAACGAGATGTCTCCATCTAGTGGGAGCTGGAGTAGTGGCAGCCCAACTCCGTCAG 3493
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3449 TGAAGAACGAGATGTCTCCATCTAGTGGGAGCTGGAGTAGTGGCAGCCCAACTCCGTCAG 3508
Query 3494 AGAATTCTCCGGGAATCCCACCAGTCTCACAGGGCTCAAACCAATTCTCAGCTCGTGGAC 3553
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3509 AGAATTCTTCGGGAATCCCACCAGTATCACAGGGCTCAAACCAATTCTCAGCTCGTGGAC 3568
Query 3554 GTATGGGTGTGCGTGCAAGGTACGTTGACACCTATAATCAAGGC--T-----C-C-TCGA 3604
||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | | ||||
Sbjct 3569 GTATGGGTGTGCGTGCAAGATACGTTGACACCTTTAATCAAGGCCGTGGAAACTCCTCGA 3628
Query 3605 GCATGTATCAGTCACCTCCCGTGCAATCTTCTAAACCACCGATTCCTGCGAAAGCAAAAT 3664
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3629 GCATGTATCAGTCACCTCCCGTACAATCTGCTAAACCACCGATTCCTGCAAAAGCAAAAT 3688
Query 3665 TCTTTGTCCCAGCAGCACCGGCATCGTTTGCAAACGACCAGGTAATGGAATCGGTTAGTG 3724
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3689 TCTTCGTCCCAGCAGCACCGGCATCGTTTGCAAACGACCAGGTAATGGAATCGGTTAGTG 3748
Query 3725 CTGAAACCAGACAAGAGAACTCAGGAGATGAAGCAG-TAGTAGGCTCTGCAGGCGCTCCA 3783
|||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3749 ATGAAACCAGACAGGAGAACTCAGCAGATGAAG-AGGTAGTAGGGTCTGCAGGCGCTCCA 3807
Query 3784 GGACCAAGCCAGGCTTCATTCCAGTCCCCGACACCATCTCCAATTGCAATGCAGAGATTT 3843
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3808 GGACCAAGCCAGTCTTCATTCCAGTCCCCGACACCATCTCCAATGGCAATGCAGAGATTT 3867
Query 3844 CCAAGTGTAGACAACATCAGAAGAAGTGGATCAGGAACAAGCCTTAATGGTGATCTTCCT 3903
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3868 CCAAGTCTAGACAACATCAAAAGAAGTGGATCAGGAATAAGCCTTAATGGTGATCTTCCT 3927
Query 3904 CAGTCAGTATCAAGAAGAACAGCTTCATGGAGCGGAAGCGTCAACAGCTCGTCGTTTATG 3963
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3928 CCGTCAGGATCAAGAAGAACAGCTTCATGGAGCGGAAGCGTCAACAGCTCGTCGTTTATG 3987
Query 3964 TCTCCAACGAGTGCATCAACATTCAGACCAAGCCCACTGAACAGTAGCAGTAGCAGCTTA 4023
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3988 TCTCCAACGAGTGCATCAACATTCAAACCAAGCCCACTGAACAGTAGCAGTAGCAGCTTA 4047
Query 4024 GGAGAGGAGCTTCAGGAAGTTGAACTGTAAGTTGAAAAATCTGTAATATCACAA-AAGaa 4082
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 4048 GGAGAGGAGCTTCAGGAAGTGGAACTGTAAGTTGAAAAATCTGTAATATCACAACAACAA 4107
Query 4083 -aa-aaaaaGTTTTGCTCACTGTCACAACA------GGTTAGATCGATCAATCAATCAAA 4134
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4108 CAACAAAAAGTTTTGCTCACTGTCACAACAACAACAGGTTAGATCGATCAATCAATCAAA 4167
Query 4135 TGTTAATCCATGAGTTACCCCAAAATTACATGAAGCACTTTCTCTGCTTCTGTCAATGAC 4194
||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 4168 TGTGAATCCATGAGTTACCC-AAAATTACATAAAACACTTACTCTGCTTCTGTCAACGAC 4226
Query 4195 AGGGGGCAAATATGTATTATGCCGTTTGTA-ttttttttt-tATTTTCTTACTAAATATA 4252
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||
Sbjct 4227 -GGGGGCAAATATGTATTATGCCGTTTGTAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTAAATATA 4285
Query 4253 AATTCATTAAATTT-CTTTGTTAACAGACTTGAGGAATTACACAATAATACACATTAATA 4311
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4286 AATTCATTAATTTTTCTTTGTTAACAGACTTGAGGAATTACACAATAATGCACATTAATA 4345
Query 4312 TTTCGTTCATGAGTGGTAATGAAATTTGTTCACC 4345
||||||| ||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 4346 TTTCGTTTATGAGTGATAATCAAATTTGTTCACC 4379
> Ahg494223 jgi|Araly1|494223|fgenesh2_kg.8__39__AT5G47490.1
Length=4368
Score = 2558 bits (1385), Expect = 0.0
Identities = 2057/2373 (87%), Gaps = 79/2373 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTTCGACTGCTGATTTCCTCCTGGATGATCAAACGGACGAGGATTTCTTCGACAAA 60
||||||||| || || | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCGGCTTCTCAATTCCTGCTGGAGGATCAAACGGATGAGGATTTCTTCGACAAG 60
Query 61 CTTGTTGATGATTCCTATACT--C--C-TA-C-C--GCTTCATCCTCTGCCAAGGAGCTG 111
|||||||||||| | ||| || | | | | | ||||||||||||| | ||||||
Sbjct 61 CTTGTTGATGATGCTTATTCTCCCGGCGAAGCTCAGGCTTCATCCTCTGTGACGGAGCTC 120
Query 112 AAATTCGATGACGGTAGTGATTCCGATGACGCCAAAGCTTTTGCTAATCTCTCCGTCGTT 171
|| || || |||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||| | |||
Sbjct 121 AAGTTTGACGACGAAAGTGACTCCGATGATTCCAGAGCTTTTTCCAATCTCTCCATTGTT 180
Query 172 GACGATGTTTTGGGTGATGGAGATGTCGCATTGAATGAAGCAGGTTTGGGGAACGATGTT 231
| ||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 181 AAAGATCCTTTGGGTGAAGTAGATGGCACATTGAATGAAGCAGCTTTGGGGAACGATGTT 240
Query 232 GCAAACGAGGGTACAAGTGGTTCGGTGGGAAAAGAAGAGCCTTCTTCATCTATTGCTCCG 291
| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||
Sbjct 241 ----------G--CAAGTGGTTCGGTGGGAAAAGACGAGCCTTC-T--TCTATTGCTCCG 285
Query 292 GAAGCTGTTCAATTTGTCAACAGTGATGCAAATAGG--TTAAGGGATGTTGATGTGGTGC 349
||| ||||||||||| || | |||||||| || ||| |||| || | ||||| ||
Sbjct 286 GAACCTGTTCAATTTCTCCATAGTGATGC-AA-AGGAATTAA--GA-GATGATGAAATGA 340
Query 350 GATCGGAGGTGGATGATATGGCACTAACTGAAACAGGAAAAGAGA-GTAATATAGTCGAT 408
|||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| | | | || || |
Sbjct 341 GATCAGAGGTAGCTGATATGCCACTATCTGAAACAGCAAAAGA-ATGCACCATGGT-TAA 398
Query 409 GGA-TCTGGGAGTCCTGGGGTTAAGGAGGTTGACTGGGGCTCGTTTT-ATGCAGATTCAT 466
|| | |||| |||||||||||||||| | || ||||| || |||| ||||||||| ||
Sbjct 399 CGACCCCGGGATTCCTGGGGTTAAGGAGCTAGATTGGGGTTC-TTTTGATGCAGATTTAT 457
Query 467 CTGTAAATGACGGTGGTGGGTTTGGTTCATACTCTGATTTCTTCACTGAGTTGGATGCAA 526
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 458 CTGTAAATGACGGTCGTGGGTTTGGTTCATGCTCTGATTTCTTCACTGAGTTGGATGAAA 517
Query 527 CTGCAGGAAATGTACAGGGACAGGCGGAGGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAG 586
||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CTGCAGGAAATTTACAGGGAAAGGCGGATGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAG 577
Query 587 CCAATGATACAATTAACACAAGTGTTGGTTTAGATAATTCGGCAGGCTTTGAGCAACACC 646
||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 578 CCAATCATACAAATAACACAAGTGTTGGTTTTGATAATTCGGCAGGGTTTGAGCAACACC 637
Query 647 AGGGTCAAGTGCAACACGATTCTGGAAGCGGGCAGTATGTGGATAACAGTCAATCTTGGG 706
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 638 AGGGTCAAGTGCACCACGATTCTGCAAGCGGGCAGTACGTGGATAACAGTCAGTCTTGGG 697
Query 707 AAAATCTCTATCCTGGATGGAAATATGATGCAAGTACTGGTCAATGGTATCAAGTTGATG 766
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 698 AAAATCTCTATCCTGGATGGAAATATGATGCAAGTACTGGCCAGTGGTATCAAGTTGATG 757
Query 767 GTCAGGATGCAACCGTTAATTCACAGGAGAGCTAT-ATTAACTCAACAG-GTAACTGGGA 824
|||| ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||
Sbjct 758 GTCATGATGCAAGCATGAATTCACAGGAGAGCTATGA-AAACTCAAC-GAGTAACTGGGA 815
Query 825 AAGCGTTGCTGCTGATAACTCGGATGTTGCTTATCTGAAACAGAGTACAACATCTGCAAT 884
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |
Sbjct 816 AAACGTTGCTGCTAATAACTCGGATGTTGCTTATCAGAGACAGAGTACAGCATCTGCAGT 875
Query 885 GGCTGGCACAGCTGAGAGTGTGTCTACATGGAACCAGGTTTCACAAGTGGGCAATGGATA 944
||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||
Sbjct 876 GGCTGGCACAGTTGAGAATGTGTCTACTTGGAACCAGGCTTCACAAGTGAGCAATGGGTA 935
Query 945 TCCAGAACACATGGTATTTGACGCCCAGTATCCTGGATGGTACTATGACACAATTGCTCA 1004
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 TCCAGAACACATGGTCTTTGACTCCCAGTATCCGGGATGGTACTATGACACAATTGCTCA 995
Query 1005 AGAATGGCGCTCTCTGGACAGCTACAACCAGGCTTCCCAAACAACTGTAACTGGTCAAGC 1064
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||
Sbjct 996 AGAATGGCGCTCTCTTGACAGCTACAACCAGGCTTTTC--A-AAC---AACTGGTCAAGC 1049
Query 1065 TCATGATCAGCAAGTTCAGAACGGTC-ATGCTCGTACAACTACGTATCACAATAATAGCC 1123
| ||||||||||||||||||| || | || ||| |||| ||| ||| | | |||||||
Sbjct 1050 TAATGATCAGCAAGTTCAGAATGG-CAATTCTCTTACAGCTATGTA-C-C-ATAATAGAG 1105
Query 1124 AGAGTAGTGTGTATGATGTTAACAACAAAAACCAGACATTCA-AAGCGCAAGAC-TTTGC 1181
|||||| ||| |||||||| || | ||||| |||| | ||| || ||||| | ||||
Sbjct 1106 AGAGTAATGTACATGATGTTTACGATAAAAATCAGATACTCAGAA-CGCAA-TCATTTGA 1163
Query 1182 TATTCAGGGCCAACACGGAAGTTGGGA-CGAATCTTACTATGCCAACAATCAGCAGGCTG 1240
||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1164 TATCCAGAGCCAACATGGAAGTTGGGATC-AATCGTACTATGACAACAATCAGCAGGCTA 1222
Query 1241 GAAACACTTGGCAACCAGTAAATGTAGGTAAGGCTGAGCCTGCGGTAACTTCTGATTCAT 1300
||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||| ||| ||||
Sbjct 1223 CAAACATTTGGCAACCAGAAAATGCAGGTAAGGCTGAGGCGGCTGTAACTCCTGCCTCAT 1282
Query 1301 TATCACGCTTCGGAGGAAACCAGCAAGTAAATAATTTGTACAGTACAGAATC-TGTGGCT 1359
||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||
Sbjct 1283 TATCAAACTTCGCAGGAAACCAGCAAGTAAATAATCTGTACAGTACAGGA-CATGTGGCT 1341
Query 1360 GAACAGTTTAAGCCAAAT-ACGATTGGAGCCCAGAGCTTTATCCCTCAGCATATGAATGT 1418
||||||||||||||| || | || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1342 GAACAGTTTAAGCCATATGA-GAGTGGTGTTCAGAGCTTCATCCCTCAGCATATGAATGT 1400
Query 1419 GGCTAGTGCCACACAAAATGGA-CCATTGAGTTTCTCAAACGATTTGTATAATAGACAGC 1477
|||||||| ||| || |||||| | | |||||||||| |||||||| |||| |||||||
Sbjct 1401 GGCTAGTGTCACGCAGAATGGAGCTA-TGAGTTTCTCGAACGATTTTTATAGTAGACAGG 1459
Query 1478 AATCGGTAGATCATGCTCAAAAGTCTTTTCAGAACAATCAGCTTTTCTCCCCAAGTGTGG 1537
|||| |||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |
Sbjct 1460 AATCTGTAGATGATGCTCCACAGTCATTTCAGAGCAATCAGCTTGTCTCCTCAAGTGCAG 1519
Query 1538 GAAGATCATCTGATAGGCGTCCACCACACGCACTAGTCAGTTTTGGATTTGGTGGG-AAG 1596
|||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||
Sbjct 1520 GAAGATCATCTGATGGGCGGCCACCACATGCACTTGTCAATTTTGGATTTGG-GGGAAAG 1578
Query 1597 CTCATTGTTATGAAGGATAATAATGGTTCTCTGCAGAATACATCATTTGGGAGTCAG--G 1654
|||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |
Sbjct 1579 CTCATTCTTATGAAGGATGATAATGGTTCTCTCCAGAATTCATCATTTGGAAGTCAGAAG 1638
Query 1655 GG-ATTGGGGGAAGCTCCATCACTGTCTTAAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCC 1713
|| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1639 GGAACTGGGGGAAGCTCCATCTCTGTCTTAAACTTGGCAGAAGTTATTTCTGGGAGTGCC 1698
Query 1714 TCTTATTCCAGTCCCGGGGAAGACTCTTTGAGCTACTTTC-GTTGTCTGCATCAACAATC 1772
|||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 1699 TCTTATTCAAGTCTCGGGGAAAACTCTTTGAGTTAC-TTCAGTTGTCTGGATCAACAATC 1757
Query 1773 TCTTCCAGG-CCCTTTGGTAGGGGGAAATGTTGGAAGTAAAGAGTTGCATAAGTGGATTG 1831
||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||
Sbjct 1758 TCTTCCAGGACCC-TTGGTTGGAGGAAATGTTGGAAGTAAAGACTTACATAAGTGGCTTG 1816
Query 1832 ATGAGAGACTCTTGCATTGTGAATCTTCCAACATGGATTTTTCAAGAGGGAAACTCTTAA 1891
|||||| | | ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1817 ATGAGAAAATTTTGAATTGTGAATCTTCCTATATGGAATTTTCAAGAGGGAAACTTTTAA 1876
Query 1892 AGATGCTTCTTTCTTTGCTCAGAATATCTTGTCAGTATTATGGGAAACTCCGATCTCCTT 1951
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1877 AGATGCTTCTTTCTTTGCTCAGAATATCTTGTCAGTATTATGGGAAACTCCGTTCTCCTT 1936
Query 1952 TTGGCT-CTGATGCATCGCAAAAGGAAACGGA-TACTCCAGAAGCAGCAGTTGCTAAACT 2009
|||| | ||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1937 TTGG-TACTGATGCATCGCAAAAGGAAATGGACT-CTGCTGAAGCAGCAGTCGCTAAGCT 1994
Query 2010 TTTTGCATTTGCCAAGAAAGATGGCATCCAAAATGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGCTT 2069
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1995 TTTTGCATTTGCCAAGAAAGATGGCGTACAAAATGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGTTT 2054
Query 2070 GCAGCATTTACCACCTGAATCGCAAATGCAAGTAACTGCTTCAGAGGTTCAGAATCTTCT 2129
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2055 ACAGCATTTACCACCGGAATCACAAATGCAAGTAACTGCTTCAGAGGTGCAGAATCTTCT 2114
Query 2130 GGCTTCTGGTAGAAAAATGGAGGCTCTACAATGTGCGCAAGAAGGCCATTTATGGGGACC 2189
||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2115 GGCTTCTGGCAGGAAGATGGAGGCTCTCCAATGTGCACAAGAAGGTCATTTATGGGGACC 2174
Query 2190 GGCACTTGTCATCGCGGCTCAACTTGGGGATCAGTTCTATGTAGACACTGTGAAACAAAT 2249
|| ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||
Sbjct 2175 AGCGCTTGTTATCGCAGCACAACTTGGGCAGCAGTTTTATATTGACACTGTGAAACAAAT 2234
Query 2250 GGCCCTTCGCCAGCTGATACCCGGGTCACCTTTACGGACATTGTGCCTACTCGTTGC-GG 2308
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||
Sbjct 2235 GGCCCTTCGCCAGCTGGTACCCGGGTCACCTTTACGGACACTGTGCCTGCTAGTTGCAGG 2294
Query 2309 GACAACCAGCTGAAGTGTGTCCCACTGGAAGTA 2341
| |||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 2295 G-CAACCAGCTGAAGTGTTTTCCACTGGAAGTA 2326
Score = 773 bits (418), Expect = 0.0
Identities = 768/928 (83%), Gaps = 59/928 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 2884 TGGGGG-ATGCCACCACCTGCACCACATTCAA-CAACTGGAAACCCGCAGGTAAATGAGT 2941
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||
Sbjct 2961 TGGGGGCATGCCACCACCTGCACCACATTCAACCAA-AGGAAACCTACAGGGAAATGAGT 3019
Query 2942 ATCAACATCAACAGCAGGAAGCGGCTAAGTTATCATATAGTCAATCCGCTAATACAATGT 3001
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 3020 ATCAACATCAACAGCAGGAAGCCACTAAGTTAGCATATAGTCAATCGGTTAATACAATGT 3079
Query 3002 CATCATTGATGCCACCTGCTTCAATTGAACCCGTACATGAGTGGGGTGGGAACGGGAGGA 3061
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3080 CATCATTGATGCCACCTGCTTCAATGGAACCCATACATGAGTCGGGTGGGAGTGGGAGGA 3139
Query 3062 CAATGGCAGCACATTCTAGAAGTGTATCAGAGCCAGATTTCAGTAGGACGCCAATACAGG 3121
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3140 GAATGGCAGTACATACTAGAAGTGTATCAGAGCCAGATTTCGGTAGGACGCCAATACAGG 3199
Query 3122 ATCA-GACTGACTCCTCAAAAGACAAA-GCTCCTGATGGGGTGACACAGGTGAAATCAAC 3179
|| | | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||| |
Sbjct 3200 AT-ATGGCTGACTCCTCAAAAGA-AAAGGCAGTTGATGGGGTGACAAAGTTGAAATCATC 3257
Query 3180 TCGGA-AGGTGCCAAGTTCTCGGTTTAGCCGCTTTGGTATTGGCATATTGAAGAACACTG 3238
| ||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||| || |||| ||||| ||||||
Sbjct 3258 TGGGACA-GTGGCAAGTTCGCGGTTAAGTCGCTTTGGTTTTAGCATGCTGAAGGACACTG 3316
Query 3239 TAGGGAAGGTCTTCCCATCTCGATCATCTAATGAGGCAAAACTGGG-TAATGAGAATCAA 3297
|||||| |||||| || ||| ||||| || ||||||||| |||| | || |||||
Sbjct 3317 TAGGGAGGGTCTT---ATATCGGTCATCCAAAGAGGCAAAATTGGGCGCA-GAAAATCAG 3372
Query 3298 TTCTACTATGACGATAACCTAAAGAGATGGGTGGAAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAG 3357
||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3373 TTCTACTATGATGACAAACTAAAGAGATGGGTGGAAAGAGGTGTGGAACCCCCAGCTGAG 3432
Query 3358 GAAGCTGCACTACCTCCTCCTCCAACG-TCAGTCCCATTCCGAAGCAACTCATTGGGTCA 3416
||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||| |||||||||| ||||| |
Sbjct 3433 GAAGCTGCACTGCCTCCTCCTCCAACAAT-AGGCGCATTCCAAAGCAACTCACTGGGTTA 3491
Query 3417 TGAAAACAAGTCTGAGATAAAGAACGAGATGTCTCCATCTAGTGGGAGCTGGAGTAGTGG 3476
||||||||| || | | | || | | ||||| || |||| ||
Sbjct 3492 TGAAAACAA-TC------------C-A--T--CT--A---A-TGGGAACTCGAGTTCCGG 3527
Query 3477 CAGCCCAACTCCGTCAGAGAATTCTCCGGGAATCCCACCAGTCTCACAGGGCTCAAACCA 3536
| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || || || ||
Sbjct 3528 CGGCCCAACTCCATCAGAGAATTCTTCAGGAATCCCACCAATCTCACACGGTTCGAATCA 3587
Query 3537 ATTCTCAGCTCGTGGACGTATGGGTGTGCGTGCAAGGTACGTTGACACCTATAATCAAGG 3596
||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 3588 ATTCTCAGCTCGTGGGCGTACGGGTGTGCGGGCAAGATACGTTGACACCTATAATTTAGG 3647
Query 3597 C--TC----CT--C-GAGCATGTATCAGTCACCTCCCGTGCAATCTTCTAAACCACCGAT 3647
| | || | || |||||||||||||||| |||| ||| || | |||||||| ||
Sbjct 3648 CCGTGGAAACTGTCAGACCATGTATCAGTCACCTTCCGTACAAACTGCAAAACCACCAAT 3707
Query 3648 TCCTGCGAAAGCAAAATTCTTTGT-CCCAGCAGCACCGGCATCGTTTGCAAACGACCAGG 3706
|| || |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3708 CCCGGCAAAAGCAAAGTTCTTTGTTCCC-GCAGCACCTGCATCGTTTTCAAACGACCAGG 3766
Query 3707 TAATGGAATCGGTTAG-TGCTGAAACCAGACAAGAG-A-ACTCAGG-AGATGAAGCAGTA 3762
||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||| | | | || |||||||| ||
Sbjct 3767 CAATGGAACCGGCT-GCTGCTGAAACCAGACAGGAGGAGATTTTGGCAGATGAAG---TA 3822
Query 3763 GTAGGCTCTGCAGGCGCTCCAGGACCAA 3790
|||| |||| |||| |||||| |||||
Sbjct 3823 GTAGCCTCTTCAGGGGCTCCACCACCAA 3850
Score = 665 bits (360), Expect = 0.0
Identities = 455/501 (91%), Gaps = 6/501 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2341 AGTAGTAGCATGCTTGACAATTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATAACTGCTAACAGAACC 2400
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2386 AGTAGTAGCATGCTTGACAGTTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATAACTGCGAACAGAACC 2445
Query 2401 ACAGATGACGACCTTGTGATTATTCATCTTGGAGATAGCATGTGGAAAGAAAGAGGG-GA 2459
|||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 2446 ACAGATGATGAGCTTGTAATTACTCATCTTGGAGATTGCATGTGGAAAGAAAG-GGGCGA 2504
Query 2460 GATAATTGCGGCGCATATTTGCTATTTAATCGCAGACAAGAACTTTGATCCATACTCAGA 2519
||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 GATAATTGCAGCTCATATTTGCTATTTAATTGCGGACAAGAACTTTGATCCATACTCAGA 2564
Query 2520 AAGC-GCCAGACTCTGCCTTGTCGGAGCGGACCATTGGAAATGTCCTCGAACATACGCAA 2578
| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 2565 TA-CTGCCAGACTCTGCCTTGTTGGAGCGGATCACTGGAAATATCCTCGAACATATGCAA 2623
Query 2579 GTCCAGATGCTATACAGAGAACAGAGTTATATGAATACTCTAAGACGCTGGGAAACTCTC 2638
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2624 GTCCAGAGGCTATACAGAGAACAGAGTTATATGAATACTCTAAGACTCTGGGAAACTCTC 2683
Query 2639 AGTATATCCTGTTACCGTTTCAACCATATAAAATCATATATGCTCATATGCTGGCTGAAG 2698
||| || |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2684 AGTTTACCCTGCTACCGTTTCAACCATATAAAGTCATGTATGCCCATATGCTGGCTGAAG 2743
Query 2699 TTGGTAAACTTTCTACTGCACAAAAGTACTGTCAAGCAGTAATAAGATGCCTCAAGACTA 2758
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
Sbjct 2744 TTGGTAAACTTTCGACTGCACTGAAGTACTGTCAAGCAGTATTAAAATGCCTCAAGAC-A 2802
Query 2759 G-CCGATCATCTGAAGTAGAAATGTGGAAGCAGTTTGCTTCATCTCTTGAAGAGAGAATC 2817
| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2803 GGCCGATCACCAGAAGTGGAAATGTGGAAACAGTTTGTTTCATCTCTTGAAGAGAGAATC 2862
Query 2818 CGTAGCCATCAAGAGGGTGGG 2838
|| | ||| ||| |||| |||
Sbjct 2863 CGCATCCACCAACAGGGCGGG 2883
Score = 182 bits (98), Expect = 3e-44
Identities = 187/229 (82%), Gaps = 10/229 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 3832 ATGCAGAGATTTCCAAGTGTAGACAACAT-CAGAAGAAGTGGATCAGGAACAAGCCTTAA 3890
|||||||||| ||||||| | || ||||| || ||||| ||||| || | ||| | ||
Sbjct 3856 ATGCAGAGATATCCAAGTATGGATAACATCCA-AAGAAATGGATTGGGGATTAGCGTCAA 3914
Query 3891 TGGTGATCTTCCTCAG--T-CAG-TATCAAGAAGAACAGCTTCATGGAGCGGAAGCGTCA 3946
||| |||| || |||| | | | | || ||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 3915 TGGGGATCATCATCAGCCTCCTGCT-TCCAGAAGAACAGCTTCATGGAGCGGAAACTTCA 3973
Query 3947 ACAGCTCGTCGTTTATGTCTCCAACGAGTGCATCAACATTCAGACCAAGCCCACTGAACA 4006
||| | | ||||||| | |||| || ||| ||||||| |||| ||||| || ||| ||||
Sbjct 3974 ACA-C-C-TCGTTTACGCCTCCGACCAGTCCATCAACCTTCAAACCAATCCTACTCAACA 4030
Query 4007 GTAGCAGTAGCAGCTTAGGAGAGGAGCTTCAGGAAGTTGAACTGTAAGT 4055
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 4031 GTAGCAGCAGCAGCTTAGGAGAGGAGCTTCAGGAAGTGGAACTCTAAGT 4079
> Ahg948161 jgi|Araly1|948161|scaffold_800048.1
Length=2950
Score = 1581 bits (856), Expect = 0.0
Identities = 1080/1182 (91%), Gaps = 40/1182 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1729 GGGGAAGACTCTTTGAGCTACTTTCGTTGTCTGCATCAACAATCTCTTCCAGGCCCTTTG 1788
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1551 GGGGAAGACTCTTTGAGCTACTTTCGTTGCCTGCATCAACAATCTCTTCCAGGTCCTTTG 1610
Query 1789 GTAGGGGGAAATGTTGGAAGTAAAGAGTTGCATAAGTGGATTGATGAGAGACTCTTGCAT 1848
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||
Sbjct 1611 GTAGGAGGAAATGTTGGAAGTAAAGAGTTGCATAAGTGGATTGATGAGAGAATTTTGAAT 1670
Query 1849 TGTGAATCTTCCAACATGGATTTTTCAAGAGGGAAACTCTTAAAGATGCTTCTTTCTTTG 1908
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 TGTGAATCTTCCTATATGGATTTTTCAAGAGGGAAACTCTTAAAGATGCTTCTTTCTTTA 1730
Query 1909 CTCAGAATATCTTGTCAGTATTATGGGAAACTCCGATCTCCTTTTGGCT-CTGATGCATC 1967
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 1731 CTCAGAATATCTTATCAGTATTATGGGAAACTCCGTTCTCCTTTTGG-TACTGATGCATC 1789
Query 1968 GCAAAAGGAAACGGA-TACTCCAGAAGCAGCAGTTGCTAAACTTTTTGCATTTGCCAAGA 2026
|||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1790 ACAAAAGGAAACGGACT-CTGCTGAAGCAGCAGTCGCTAAGCTTTTTGCATTTGCCAAGA 1848
Query 2027 AAGATGGCATCCAAAATGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGCTTGCAGCATTTACCACCTG 2086
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1849 AAGATGGCGTACAAAATGGTTATGCTCCTATTAGCCAATGCTTGCAGTATTTACCACCTG 1908
Query 2087 AATCGCAAATGCAAGTAACTGCTTCAGAGGTTCAGAATCTTCTGGCTTCTGGTAGAAAAA 2146
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909 AATCACAAATGCAAGTAACTGCTTCAGAGGTTCAGAATCTTCTGGCTTCTGGTAGAAAAA 1968
Query 2147 TGGAGGCTCTACAATGTGCGCAAGAAGGCCATTTATGGGGACCGGCACTTGTCATCGCGG 2206
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||
Sbjct 1969 TGGAGGCTCTACAATGTGCACAAGATGGCCATTTATGGGGACCAGCGCTTGTTATCGCGG 2028
Query 2207 CTCAACTTGGGGATCAGTTCTATGTAGACACTGTGAAACAAATGGCCCTTCGCCAGCTGA 2266
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 CACAACTTGGGGATCAGTTCTATGTTGACACTGTGAAACAAATGGCCCTTCGCCAGCTGA 2088
Query 2267 TACCCGGGTCACCTTTACGGACATTGTGCCTACTCGTTGCGGGACAACCAGCTGAAGTGT 2326
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2089 TACCAGGGTCACCTTTACGGACATTGTGCCTACTGGTTGCAGGACAACCAGCTGAAGTGT 2148
Query 2327 GTCCCACTGGAAGTAGTAGTAGCATGCTTGACAATTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATAA 2386
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 GTCCCGCTGGAAGTAGTAG---CATGCTTGACAATTGGGAAGAGAATTTGGGTATAATAA 2205
Query 2387 CTGCTAACAGAACCACAGATGACGACCTTGTGATTATTCATCTTGGAGATAGCATGTGGA 2446
|||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2206 CTGCTAACAGAACCACGGATGATGAGCTTGTGATTACTCATCTTGGAGATCGCATGTGGA 2265
Query 2447 AAGAAAGAGGG-GAGATAATTGCGGCGCATATTTGCTATTTAATCGCAGACAAGAACTTT 2505
|||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2266 AAGATAG-GGGCGAGATAATTGCGGCGCATATTTGCTATTTAATCGCGGACAAGAACTTT 2324
Query 2506 GATCCATACTCAGAAAGCGCCAGACTCTGCCTTGTCGGAGCGGACCATTGGAAATGTCCT 2565
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2325 GATCCATACTCAGAATGCGCCAGACTCTGCCTTGTCAGAGCTGACCATTGGAAATGTCCT 2384
Query 2566 CGAACATACGCAAGTCCAGATGCTATACAG--A-----G-A-----A-----CAGAGTTA 2607
|||||||||||||||||||| ||||||||| | | | | ||||||||
Sbjct 2385 CGAACATACGCAAGTCCAGAGGCTATACAGTTATCTTTGCATGGGCAGAGGACAGAGTTA 2444
Query 2608 TATGAATACTCTAAGACGCTGGGAAACTCTCAGTATATCCTGTTACCGTTTCAACCATAT 2667
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2445 TATGAATACTCTAAGACACTGGGAAATTCTCAGTATATCCTGTTACCGTTTCAACCATAT 2504
Query 2668 AAAATCATATATGCTCATATGCTGGCTGAAGTTGGTAA-ACTTTCTACTGCACAAAAGTA 2726
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||
Sbjct 2505 AAAATCATATATGCCCATATGCTGGCCGAAGTTGGTAATA-TTTCGACTGCACAGAAGTA 2563
Query 2727 CTGTCAAGCAGTAATAAGATGCCTCAAGACTAG-CCGATCATCTGAAGTAGAAATGTGGA 2785
||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| | ||||| | ||||||||
Sbjct 2564 CTGTCAAGCAGTATTAAAATGCCTCAAGAC-AGGCCGATCACCAGAAGTGGGAATGTGGA 2622
Query 2786 AGCAGTTTGCTTCATCTCTTGAAGAGAGAATCCGTAGCCATCAAGAGGGTGGG-A-A-T- 2841
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| | | |
Sbjct 2623 AACAGTTTGTTTCATCTCTTGAAGAGAGAATCCGTATCCACCAACAGGGCGGGTATACTG 2682
Query 2842 ----TT-GGCCCCAGCAAAACTTGTTGGAAAGCTGCTGAACT 2878
|| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 2683 CGAATTTGGCCCCAGCAAAACTTGTTGGAAAGTTCCTGAACT 2724
Score = 1118 bits (605), Expect = 0.0
Identities = 763/837 (91%), Gaps = 20/837 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 793 GAGAGCTATATTAACTCAACAGGTAACTGGGAAAGCGTTGCTGCTGATAACTCGGATGTT 852
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 GAGAGCTATATAAACTCAACAAGTAACTGGGAAAGCGTTGCTGCTGATAACTCGGATGTT 788
Query 853 GCTTATCTGAAACAGAGTACAACATCTGCAATGGCTGGCACAGCTGAGAGTGTGTCTACA 912
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 789 GCTTATCTGAAACAGAGTACAACATCTGCAGCGGCTGGCACAGTTGAGAGTGTGTCTACT 848
Query 913 TGGAACCAGGTTTCACAAGTGGGCAATGGATATCCAGAACACATGGTATTTGACGCCCAG 972
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||
Sbjct 849 TGGAATCAGGTTTCACAAGTGAGCAATGGATATCCAGAACACATGATCTTTGACGCTCAG 908
Query 973 TATCCTGGATGGTACTATGACACAATTGCTCAAGAATGGCGCTCTCTGGACAGCTACAAC 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct 909 TATCCTGGATGGTACTATGACACAATTGCTCAAGAGTGTCGCTCTCTAGACAGCTACAAC 968
Query 1033 CAGGCTTCCCAAACAACTGTAACTGGTCAAGCTCATGATCAGCAAGTTCAGAACGGTCAT 1092
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 969 CAGGCTTCTCAAACAACTCTAACTGGTCAAGCTCATGATAAGCAAGTTCAGAATGGTCA- 1027
Query 1093 GCTCGTACAACTACGTATCACAATAATAGCCAGAGTAGTGTGTATGATGTTAACAACAAA 1152
| | || || | ||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1028 --T-G-----CT-CG--T---AAT-A-A-CCAGAGTAGTATGTATGATGTTAACGACAAA 1070
Query 1153 AACCAGACATTCAAAGCGCAAGACTTTGCTATTCAGGGCCAACACGGAAGTTGGGACGAA 1212
|||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1071 AACCAGACTTTCAAAGCGCAAGAATATGCTATTCAGAGCCAACACGGAAGTTGGGACCAG 1130
Query 1213 TCTTACTATGCCAACAATCAGCAGGCTGGAAACACTTGGCAACCAGTAAATGTAGGTAAG 1272
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1131 TCTTACTATGCCAACAATCAGCAGGCTGCAAACACTTGGCAATCAGTAAATGTAGGTCAG 1190
Query 1273 GCTGAGCCTGCGGTAACTTCTGATTCATTATCACGCTTCGGAGGAAACCAGCAAGTAAAT 1332
||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 GCTGAGCCTGCTATAAATTCGGATTCATTATCAAGCTTTGGAGGAAACCAGCAAGTAAAT 1250
Query 1333 AATTTGTACAGTACAGAATCTGTGGCTGAACAGTTTAAGCCAAATACGATTGGAGCCCAG 1392
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 1251 AATTTGTACAGTACAGAACCTGTGACTGAACAGTTTAAGCCAAATGCGATTGGAGCGCAG 1310
Query 1393 AGCTTTATCCCTCAGCATATGAATGTGGCTAGTGCCACACAAAATGGACCATTGAGTTTC 1452
||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1311 AGCTTCATCCCACAGCATATGAATCTGGCTAGTGTCACACAGAATGGACCTTTGAGTTTC 1370
Query 1453 TCAAACGATTTGTATAATAGACAGCAATCGGTAGATCATGCTCAAAAGTCTTTTCAGAAC 1512
||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1371 TCAAACGATGTCTATAATAGACAGCAATCTGTAGATGATGCTCATCAGTCTTTTCAGAAC 1430
Query 1513 AATCAGCTTTTCTCCCCAAGTGTGGGAAGATCATCTGATAGG-CGTCCACCACACGCACT 1571
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||
Sbjct 1431 AATCAGCTTTTCTCCCCAAGTGCGGGAAGATCATCTGAT-GGTCGTCCACCACATGCACT 1489
Query 1572 AGTCAGTTTTGGATTTGGTGGGAAGCTCATTGTTATGAAGGATAATAATGGTTCTCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 TGTCAGTTTTGGATTTGGTGGGAAGCTCATTGTTATGAAGGATAATAATGGTTCTCT 1546
Score = 1002 bits (542), Expect = 0.0
Identities = 680/740 (92%), Gaps = 35/740 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTTCGACTGCTGATTTCCTCCTGGATGATCAAACGGACGAGGATTTCTTCGACAAA 60
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21 ATGGCTTCGACTGCTGATTTCCTCCTGGAGGATCAAACGGACGAGGATTTCTTCGACAAA 80
Query 61 CTTGTTGATGATTCCTATACTCCTACCGCTTCATCCTCTGCCAAGGAGCTGAAATTCGAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 81 CTTGTTGATGATTCCTATACTCCTACCGCTTCATCCTCTGCTAAGGAGCTCAAATTCGAT 140
Query 121 GACGGTAGTGATTCCGATGACGCCAAAGCTTTTGCTAATCTCTCCGTCGTTGACGATGTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 GACGGTAGTGATTCCGATGACGCCAAAGCTTTTGCGAATCTCTCCGTCGTTGACGATGTT 200
Query 181 TTGGGTGATGGAGATGTCGCATTGAATGAAGCAGGTTTGGGGAACGATGTTGCAAACGAG 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || |
Sbjct 201 GTGGGTGATGGAGATGTCGCATTGAATGAAGCA--------G---G-T-TT--------G 239
Query 241 GGTACAAGTGGTTCGGTGGGAAAAGAAGAGCCTTCTTCATCTATTGCTCCGGAAGCTGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 240 GGTACAAGTGGTTCGGTGGGAAAAGAAGAGCCTTCTTCATCTATTGCTCCGGAAGCTCTT 299
Query 301 CAATTTGTCAACAGTGATGCAAATAGGTTAAGGGATG-T--TGATGTGGTGCGATCGGAG 357
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| |
Sbjct 300 CAATTTGTCAACAGTGATGCAAATAAGTTAAGGGATGATGATGATGTGGTGAGATCGGGG 359
Query 358 GTGGATGATATGGCACTAACTGAAACAGG-AAAAGAGAGTAATATAGTCGATGGATCTGG 416
|||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GTGGATGATATGCCACTAACTGAAAC-GGCAAAAGAAAGTAATATAGTCGATGGATCTGG 418
Query 417 GAGTCCTGGGGTTAAGGAGGTTGACTGGGGCTCGTTTTATGCAGATTCATCTGTAAATGA 476
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 419 GAGTCCTGGGGTTAAGGAGGTTGGTTGGGGCTCCTTTTATGCCGATTCATCTGTAAATGA 478
Query 477 CGGTGGTGGGTTTGGTTCATACTCTGATTTCTTCACTGAGTTGGATGCAACTGCAGGAAA 536
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 479 CGGTCGTGGGTTTGGTTCATACTCTGATTTCTTCACTGAGTTGGATGGAACTGCAGGGGA 538
Query 537 TGTACAGGGACAGGCGGAGGTAGCTGTGGCCACTGGAGGAAACTTAGTAGCCAATGATAC 596
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 539 TTTACAGGGACAGGCCGAGGTAGCTGTGGCCACTGGAGGCAACTTAGTAGCCAATG---C 595
Query 597 AATTAACACAAGTGTTGGTTTAGATAATTCGGCAGGCTTTGAGCAACACCAGGGTCAAGT 656
|| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 AA----CA-A-GTGTTGGTTTAGATAATTCGGCAGGGTTTGAGCAACACCAGGGTCAAGT 649
Query 657 GCAACACGATTCTGGAAGCGGGCAGTATGTGGATAACAGTCAATCTTGGGAAAATCTCTA 716
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 650 GCAACACGATTCTGGAAGCGGGCAGTATGTGGATAATAGTCAATCTTGGGAATATCTCTA 709
Query 717 TCCTGGATGGAAATATGATG 736
||||||||||||||||||||
Sbjct 710 TCCTGGATGGAAATATGATG 729
Score = 76.8 bits (41), Expect = 1e-12
Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2885 GGGGGATGCCACCACCTGCACCACATTCAACAACTGGAAACCCGCAG 2931
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 2755 GGGGGATGCCACCACCTGCACCACATTCAACAACCGGAAACCTGCAG 2801
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 164332600214
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5