BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G49030.1
Length=3600
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg494966 jgi|Araly1|494966|fgenesh2_kg.8__782__AT5G49030.1 5445 0.0
> Ahg494966 jgi|Araly1|494966|fgenesh2_kg.8__782__AT5G49030.1
Length=3740
Score = 5445 bits (2948), Expect = 0.0
Identities = 3287/3448 (95%), Gaps = 33/3448 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 AGTTCTGAGGTTTGGTTTTAGTTTCAACTTTTCAGTTAT-C-CACACACATA-CACACAT 61
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||
Sbjct 3 AGTTCTGAGGTTTGGTTCTAGTTTCAAC-TTTCAGTTATCCACACACACATATTACATAT 61
Query 62 --AC---G-CTTCCCTGAATTTGGTGACGTTAG------T-CTTC-TTCCTTCCTTCTCA 107
|| | ||||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||
Sbjct 62 ACACAAAGCCTTCCCTGAGTTTGGCGACGTTAGTCTTCTTCCTTCTTTCCTTCCTTCTCA 121
Query 108 CTCTTTGTTTCG-C-----CGTGAAAATGAGCTCTGATAGATAGAAGCGACAGAGAGAAA 161
||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 122 ATCTTTGTTTCGCCGATAGCGTGGAAATGAGCTCTGAGAGATAGAAGCGTTAGAGAGAAA 181
Query 162 CTTGAAGCAGATGTCGTCTTTCTTCAAATCCTTCGCGGGAAATCCCAGGGAAGCTGCTGC 221
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 182 ATTGAAGAAGATGTCTTCTTTCTTCAAATCCTTTGCGGGTAATCCCAGGGAAGCTGCTGC 241
Query 222 AATGGCGATGGTTCAATCTTCATCTTACAGAGTTTTGTCAGGTAAAAGTTGTTCAAATTT 281
|||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 242 AATGGCGATGGTTCAATCCTCATCTTACAGAGTATTGTCAGGTAGAAGTTGTTCAAATTT 301
Query 282 AAGGAGAAACACGCCGTTGGATTCTTTTCTTGCCAAGGGAAGGTCTTCC-GTCAAGGCTT 340
|||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 302 AAGGAGGAATACGCCGTTGGATTCATTTCTTGCCAAGGGAAGGTC-TCCTGTCAAGGCTT 360
Query 341 TTTCATTCTTATATGTCTCACGGTTTTCAACTGAACCAAACAATGAGTTTGGTCATTCAT 400
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTTCATTCTTATATGTCTCAGGGTATTCAACTGAGCCAAACAATGAGTTTGGTCATTCAT 420
Query 401 CAAAACGAAGGTCTCGTGGGCCTGTTATGGCAGCCAAGAAAGCATCTGAAGGGGAAAAGC 460
|||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 421 CAAAGCGAAGGTCTCGTGGGCCTGTTATGGCGGCAAAGAAAGCATCCGAAGGGGAAAAGC 480
Query 461 AAGAAGATGGAAAGTACAAGCAAACGGTTGATTTGCCAAAGACTGGTTTTGGTATGAGAG 520
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 481 AAGAAGATGGGAAGTACAAGCAAACGGTTGATTTGCCAAAGACAGGTTTTGGTATGAGAG 540
Query 521 CGAATTCTTTGACAAGGGAACCTGAACTCCAGAAGTTGTGGGAAGAGAACCAGGTCTTCA 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 541 CGAATTCTTTGACAAGGGAACCTGAACTCCAGAAGTTGTGGGACGAGAACCAGGTCTTCA 600
Query 581 AGAGAGTTTCTGATAATAACAATGGAGGGAGTTTCATTCTTCATGATGGTCCTCCTTATG 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AGAGAGTTTCTGATAATAACAATGGAGGGAGTTTCATTCTTCATGATGGTCCTCCTTATG 660
Query 641 CCAATGGTGATCTGCATATGGGTCATGCTCTTAACAAGATACTGAAGGATATCATTAATC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CCAATGGTGATCTGCATATGGGTCATGCTCTTAACAAGATACTGAAGGATATCATTAATC 720
Query 701 GCTATAAGCTGCTCCAAAACTATAAAGTTCAGTACGTTCCTGGGTGGGATTGCCATGGCC 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GCTATAAGCTGCTCCAAAACTATAAAGTTCAGTACGTTCCTGGGTGGGATTGCCATGGCC 780
Query 761 TTCCAATTGAGTTGAAAGTTCTGCAGTCCCTGGATCAGGAAGTAAGAAAGGAACTTACAC 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TTCCAATTGAGTTGAAAGTTCTGCAGTCCCTGGATCAGGAAGTAAGAAAGGAACTTACAC 840
Query 821 CATTAAAATTAAGGGCAAAGGCGGCGAAATTTGCAAAAGCAACAGTCAAAACACAAATGG 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CATTAAAATTAAGGGCAAAGGCGGCGAAATTTGCAAAAGCAACAGTCAAAACACAAATGG 900
Query 881 AATCATTTAAGCGATTTGGAGTATGGGCAGACTGGAACAATCCTTATCTAACTCTTGATC 940
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AATCATTTAAGCGGTTTGGTGTATGGGCAGACTGGAACAATCCTTATCTAACTCTTGATC 960
Query 941 CGGAATATGAAGCAGCTCAGATTGAAGTATTTGGCCAGATGGCCTTGAAAGGGTACATTT 1000
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 961 CGGAATATGAAGCAGCCCAGATTGAAGTATTTGGCCAGATGGCCTTGAAAGGGTACATCT 1020
Query 1001 ATAGAGGTAGGAAACCAGTTCACTGGAGCCCTTCATCTCGGACTGCTCTTGCAGAAGCTG 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ATAGAGGTAGGAAACCAGTTCACTGGAGCCCTTCATCTCGGACTGCTCTTGCAGAAGCTG 1080
Query 1061 AACTAGAGTATCCGGAGGGTCATATTTCCAAAAGCATATATGCTATTTTTAAATTGGTTG 1120
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1081 AATTAGAGTATCCGGAGGGTCATATTTCCAAAAGCATATATGCTATTTTCAAAGTGGTTG 1140
Query 1121 GTGGAGCGAAAACAAGCCTTTTAGATGAGTTTATCCCTAATATATACTTGGCAGTATGGA 1180
| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1141 GCGGAGCGAAAACAAGCCTTTTAGATGAGTTTGTCCCTAATATATGCTTGGCAGTATGGA 1200
Query 1181 CAACTACACCTTGGACTATGCCAGCCAATGCTGCTGTCGCGGTGAATGCAAAGCTTCAGT 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 CAACTACACCTTGGACTATGCCAGCCAATGCTGCTGTCGCGGTGAATGCAAAGCTTCAGT 1260
Query 1241 ACTCTGTTGTGGAAGTGCAGTCATTCTCAGAAGATGAATCAACAGTGACAAGCAATAAAA 1300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||
Sbjct 1261 ACTCTGTTGTGGAAGTGCAGTCATTCTCAGAAGATGAATCTGCTGTGACAGGCAATAAAA 1320
Query 1301 AGAAAATTCCCGGGAAGGTTCTAAAGAATCAACAAAAGCTTTTCGTGATTGTAGCGACCG 1360
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 AGAAAATGCCTGGGAAGGTTCTAAAGAATCAACAAAAGCTTTTCGTGATTGTAGCGACCG 1380
Query 1361 ACCTTGTGCCAGCATTAGAAGCGAAATGGGGTGTGAAGCTTAGCATAAGTAAAACATTCC 1420
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1381 ACCTTGTGCCAGCATTAGAAGCGAAATGGGGTGTCAAGCTTATCATAAGTAAAACATTCC 1440
Query 1421 TTGGTTCAGATCTTGAAAACTGCAGGTACACTCATCCCATTGACAACAGAGACTGTCCAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1441 TTGGTTCAGATCTTGAAAACTGCAGGTACACACATCCAATTGACAACAGGGACTGTCCAG 1500
Query 1481 TCGTTATAGGGGGTGATTACATAACTACAGAATCTGGAACAGGGTTGGTCCACACTGCCC 1540
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 TCGTTATAGGGGGTGATTACATAACTACGGAATCTGGAACAGGGTTGGTCCACACTGCCC 1560
Query 1541 CTGGTCATGGTCAGGAGGATTATGCAACTGGCCTGAAGTACGGGCTGCCTCTTGTCTCTC 1600
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1561 CTGGTCATGGTCAGGAGGATTATGCAACCGGCCTGAAGTATGGGCTGCCTCTTATCTCTC 1620
Query 1601 CGGTGGATGATGAAGGAAAGTTCACTGAAGAAGCTGGACAG-TTTAGAGGGCTCTCTGTC 1659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 1621 CGGTGGATGATGAAGGAAAGTTCACTGAAGAAGCTGGA-AGGTTTAGAGGGCTCTCCGTC 1679
Query 1660 CTTGGAGAAGGGAATACCGCTGTTGTCAGTTACCTGGATGAAAATATGTCTCTGGTCATG 1719
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 CTTGGAGAAGGGAATAGTGCTGTTGTCAGTTACCTGGATGAAAATATGTCTCTGGTCATG 1739
Query 1720 GAAGAATCTTATGCTCATAAATACCCATATGATTGGCGAACTAAGAAACCGACGATATTT 1779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1740 GAAGAATCTTATGCTCATAAATACCCATATGATTGGCGAACTAAGAAACCTACGATATTT 1799
Query 1780 AGAGCGACTGAGCAGTGGTTTGCATCGGTTGAAGGGTTTCGCACAGCCACAATGGATGCA 1839
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1800 AGAGCGACTGAGCAGTGGTTTGCATCAGTTGAAGGGTTTCGCACGGCCACAATGGATGCA 1859
Query 1840 ATCAACAATGTAAAATGGGTACCACATCAGGCAGTAAACAGAATATCTGCCATGACTTCC 1899
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 ATCAACAATGTAAAATGGGTACCAGATCAGGCGGTAAACAGAATATCTGCCATGACTTCC 1919
Query 1900 AGTCGATCTGATTGGTGCATCTCAAGACAAAGGACATGGGGTGTCCCTATTCCTGCTTTT 1959
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1920 AGTCGATCTGATTGGTGCATCTCGAGACAAAGGACATGGGGGGTCCCTATTCCTGCCTTT 1979
Query 1960 TATCATGTTAAGACAAAAGAACCACTCATGAATGAAGAGACAATCAACCATGTTAAATCT 2019
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1980 TATCATGTTAAGACAAAAGAACCCCTCATGAATGAAGAGACAATTAACCATGTTAAATCT 2039
Query 2020 ATAATTTCCCAAAAGGGTAGTGATGCGTGGTGGTATATGTCAGTGGAAGACCTACTTCCT 2079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 GTAATTTCCCAAAAGGGTAGTGATGCGTGGTGGTATATGTCAGTGGAAGACCTACTTCCT 2099
Query 2080 GAGAAATATCGTGATAAAGCAGCTGATTATGAAAAGGGGACTGATACGATGGACGTCTGG 2139
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2100 GAGAAATATCGTGATAAAGCAGCTGATTATGAAAAAGGGACTGATACAATGGACGTCTGG 2159
Query 2140 TTTGACTCAGGATCTTCTTGGGCTGGTGTATTAGGGAAACGCGAAGGTCTTAGTTTCCCT 2199
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2160 TTCGACTCAGGATCTTCTTGGGCTGGTGTATTGGGGAAACGTGAGGGTCTTAGTTTCCCT 2219
Query 2200 GCAGACGTGTATCTAGAAGGTACAGATCAGCATCGTGGATGGTTCCAAAGTTCTTTGTTA 2259
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2220 GCAGACGTGTATCTAGAGGGTACAGATCAGCATCGTGGATGGTTCCAGAGTTCTTTGTTA 2279
Query 2260 ACAAGCATCGCAACGCAAGGAAAAGCCCCCTATTCTGCTGTTATAACACATGGATTTGTA 2319
|||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 ACAAGCATCGCAACACAAGGAAAAGCTCCATATTCTGCTGTTATAACACATGGATTTGTA 2339
Query 2320 TTGGATGAGAAGGGTATGAAAATGAGCAAGTCTCTAGGTAACGTAGTGGACCCACGTTTG 2379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2340 TTGGATGAGAAGGGTATGAAAATGAGCAAGTCTCTAGGTAATGTAGTGGACCCACGTTTG 2399
Query 2380 GTCATTGAAGGAGGGAAAAATTCAAAGGACGCACCTGCTTACGGAGCTGATGTTATGCGT 2439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2400 GTCATTGAAGGAGGGAAAAATTCAAAGGACGCACCTGCTTATGGAGCTGATGTTATGCGT 2459
Query 2440 CTTTGGGTTTCTAGTGTAGATTACACAGGGGATGTACTAATAGGTCCCCAGATTCTTCGT 2499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2460 CTTTGGGTTTCTAGTGTAGATTACACAGGGGATGTACTGATAGGTCCTCAGATTCTTCGG 2519
Query 2500 CAAATGTCTGATATATATAGGAAGTTAAGGGGAACGTTAAGATACCTCTTGGGAAATCTT 2559
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2520 CAAATGTCTGATATATATAGGAAGTTGAGGGGAACGTTAAGATATCTCTTGGGCAATCTT 2579
Query 2560 CATGATTGGAGAGTTGATAATGCTGTTCCATACCAGGATTTACCTATCATTGATCAGCAT 2619
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 CATGATTGGAGAGTTGATAATGATGTTCCATACGAGGATTTACCTATCATTGATCAGCAT 2639
Query 2620 GCTCTCTTTCAGCTTGAGAATGTTGTAAAGAATATACAAGAATGTTACGAGAACTACCAG 2679
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 GCTCTCTTTCAGCTTGAGAATGTTGTAAAGAACATACACGAATGTTACGAGAACTACCAG 2699
Query 2680 TTCTTTAAAATATTCCAGATCATACAACGATTCACAATTGTTGATCTGTCAAATTTCTAC 2739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 TTCTTTAAAATATTCCAGATCATACAACGATTCACAATTGTTGATCTGTCAAATTTCTAC 2759
Query 2740 TTCGATATAGCTAAAGATAGACTGTATACTGGGGGTACTTCAAGTTTTACCAGAAGAAGC 2799
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2760 TTCGATATTGCTAAAGATAGACTGTATACTGGGGGCACTTCAAGTTTTACCCGAAGAAGC 2819
Query 2800 TGTCAAACAGTTCTTTCAACACATCTTTTATCCATATTGAGAGTGATTGCTCCAATCGTA 2859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2820 TGTCAAACAGTTCTTTCAACACATCTTTTATCCATATTGAGAGTGATTGCTCCGATAGTA 2879
Query 2860 CCTCACCTAGCGGAAGATGTCTGGCAGAATCTTCCATTTGAGTACAGAAATGAAGATGGC 2919
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 CCTCACCTAGCAGAAGATGTCTGGCAGAATCTTCCATTTGAGTACAGAAATGAAGATGGC 2939
Query 2920 TCTGCAGCAGAATTTGTCTTCGAACTTAAATGGCCTACTTTGAATGAACAATGGCTTTCA 2979
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||
Sbjct 2940 TCTGCAGCAAAATTCGTCTTCGAACTTAAATGGCCTACAGTGAACGAACAATGGCTCTCA 2999
Query 2980 TTTCCTGCTGAAGATGTTCTCTTCTGGCAAAGGCTTCTCGAGTTGAGGACTGAGG-TGAA 3038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||
Sbjct 3000 TTTCCTGCTGAAGATGTTCTCTTCTGGCAAAGGCTTCTCC-G--G-GGACCGAGGGTGAA 3055
Query 3039 CAAAGTGCTGGAGCTAGCACGTAATGAGAAAATGATTGGTTCCAGTTTAGAAGCAAAGGT 3098
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 CAAAGTGCTGGAGCTCGCACGTAATGATAAAATGATTGGTTCCAGTTTAGAAGCAAAGGT 3115
Query 3099 GTATTTGCATACTGCAGATGCAGGCATGGCTGCAAAATTACTAGAGATGAGTGAAGCAAA 3158
|||| || | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 GTATCTGTACACTGCAGATGCAGGAATGGCTACAAAATTACTAGAGATGAGTGAAGCAAA 3175
Query 3159 GAACGAGGCTGACACTCTGCAACGCATATTCATAACATCACAAGTTGAAGTATTGTCTTC 3218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3176 GAACGAGGCTGACACTCTGCAACGCATATTCATAACATCACAAGTTGAAGTATTGCCTTC 3235
Query 3219 AATGGAGAAGGAGATGATAAGCAGTGTGCAACACACAGGAGAGTATGTGGAGGGAGAGAA 3278
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3236 AATGGAGAAGGAGATGGTAAGCAGTGTGCAACACACAGGAGAGTATGTAGAGGGAGATAA 3295
Query 3279 CAAAGTGTGGATTGGGGTGTCACGAGCCGAGGGGTCTAAGTGTGAGAGGTGCTGGAATTA 3338
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3296 GAAAGTGTGGATTGGTGTGTCACGAGCTGAGGGGTCCAAGTGTGAGAGGTGCTGGAATTA 3355
Query 3339 CTCGGGCCAGGTCGGATCATTTTCTGACCATCCTACTCTCTGTGGACGCTGCTTCAGTGT 3398
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3356 CTCGGGCCAGGTCGGGTCATTTTCCAACCATCCTACTCTCTGTGGACGCTGCTTCAATGT 3415
Query 3399 CATTGTTGCTAATCCACCTGAGCCTGCA 3426
||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3416 CATTGTTGCTAATCCGCCTGAGCCAGCA 3443
Score = 375 bits (203), Expect = 9e-103
Identities = 244/264 (92%), Gaps = 2/264 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3200 AAGTTGAAGTATTGTCTTCAATGGAGAAGGAGATGATAAGCAGTGTGCAACACACAGGAG 3259
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3478 AAGTTGAAGTATTGCCTTCAATGGAGAAGGAGATGGTAAGCAGTGTGCAACACACAGGAG 3537
Query 3260 AGTATGTGGAGGGAGAGAACAAAGTGTGGATTGGGGTGTCACGAGCCGAGGGGTCTAAGT 3319
||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 3538 AGTATGTAGAGGGAGATAAGAAAGTGTGGATTGGTGTGTCACGAGCTGAGGGGTCCAAGT 3597
Query 3320 GTGAGAGGTGCTGGAATTACTCGGGCCAGGTCGGATCATTTTCTGACCATCCTACTCTCT 3379
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3598 GTGAGAGGTGCTGGAATTACTCGGGCCAGGTCGGGTCATTTTCCAACCATCCTACTCTCT 3657
Query 3380 GTGGACGCTGCTTCAGTGTCATTGTTGCTAATCCACCTGAGCCTGCAGTTGCAGC-TGTG 3438
||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||
Sbjct 3658 GTGGACGCTGCTTCAATGTCATTGTAGCTAATCCGCCTGAGCCAGCAGTTGCAGCCT-TG 3716
Query 3439 AACAGCTTAGCCTAAAATTTGCTC 3462
| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 3717 ATCAGCTCAGCCTGAAATTTGCTC 3740
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 135979708329
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5