BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G49430.1
Length=5034
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg494999 jgi|Araly1|494999|fgenesh2_kg.8__815__AT5G49430.1 8589 0.0
> Ahg494999 jgi|Araly1|494999|fgenesh2_kg.8__815__AT5G49430.1
Length=5037
Score = 8589 bits (4651), Expect = 0.0
Identities = 4911/5039 (97%), Gaps = 7/5039 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTCTTAGGAAAAATACTCCAAAAGGCGATTCAGTTTCACTACCTATGAAGCCTTTG 60
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGGCTCTTAGGAAAAATACTCCAAAAAGCGATTCAGTTTCACTCCCTATGAAGCCATTG 60
Query 61 AATTTCTCCAGAAAATTGCCAGGAAATGTGCAGATTCCAGACCCTGATATTGTTCAAAG- 119
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 61 AATTTCTCCAGAAAATTGCCAGGGAATGTGCAGATTCCAGACCCTGATATTGCTC-AAGT 119
Query 120 TGTTGCGCCTAACATTGATCTAGACCTCCGGGAAGTTTACTTTTTGATGCTCCACTTACT 179
|||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TGTTGCACCTAACATTGATTTAGACCTCCGTGAAGTTTACTTTTTGATGCTCCACTTACT 179
Query 180 TTCATCTGGGCCGTGCCAGAAAACTTATGCACTGTTGCGGCATGAACTTCTTGAACATGA 239
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTCATCTGGGCCATGCCAGAAAACTTATGCACTGTTGCGACATGAACTTCTTGAACATGA 239
Query 240 GCTTCTTCCTAGAAGATATCATGCTTGGTACTCGAGGAGTGGATTGCCTAGTGGGGATGA 299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 240 GCTTCTTCCTAGAAGATATCATGCTTGGTACTCGAGGAGTGGATTGTCTAGTGGGGATGA 299
Query 300 GAATGATGATGGCAATTCCTTTCCTTTGAACTATACTGAGTTGGCTAAGAGGTATTCTCA 359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 300 GAATGATGATGGCAATTCCTTTCCTTTGAACTATACTGAGTTGGCTAAAAGGTATTCTCA 359
Query 360 TGTaaaaaaaGATCACCTGGTGGAGCTTCTAAAGCAATTGGTCTTTGTTTCAAATAGGCC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 360 TGTAAAAAAAGATCACCTGGTGGAGCTTCTAAAGCAATTGGTCTTTGTTTCGAATAGGCC 419
Query 420 TAATCCCTCACGAGGGATCGGTGATGGAAATAAAATGATTGGAGCTGGGGTTCCAACACT 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 420 TAATCCCTCACGAGGGATCGGTGATGGAAATAAAATGATTGGAGCTGGTGTTCCAACACT 479
Query 480 TTTAGGCACTGGCTCGTTCTCCCTTTTGAGCTCTGACAAGGAAATAGTTGGAAGTGATCT 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TTTAGGCACTGGCTCGTTCTCCCTTTTGAGCTCTGACAAGGAAATAGTTGGAAGTGATCT 539
Query 540 CAAACCACCACCTATTGGCATGCGTTGGCCTCATATGCATGCTGATCAGGTTCGTGGTAT 599
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CAAATCACCACCTATTGGCATGCGTTGGCCTCATATGCATGCTGATCAGGTTCGTGGTAT 599
Query 600 TAGTTTGAGGGAAATTGGTGGTGGTTTTGCCAGACATCATCGTGCCCCATCAATTCGAGC 659
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 600 TAGTTTGAGGGAAATTGGTGGTGGTTTTGGCAGACATCATCGGGCCCCATCAATTCGTGC 659
Query 660 AGCATGTTACGTCATTGCAAAACCATCGTCAATGGTACAAAAGATGCAGAACATCAAGAG 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AGCATGTTACGTCATTGCAAAACCATCGTCAATGGTACAAAAGATGCAGAACATCAAGAG 719
Query 720 GCTACGTGGACACAGAAATGCTGTGTACTGTGCTATATTAGATCGCTCAGGAAGGTATGT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 720 GCTACGTGGACACAGAAATGCTGTGTACTGTGCTATATTAGATCGCTCAGGAAGGTACGT 779
Query 780 AATCACTGGTTCAGATGACCGCCTTGTAAAAGTATGGTCGATGGATACTGCATACTGCCT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATCACTGGTTCAGATGACCGCCTTGTAAAAGTATGGTCAATGGATACTGCATACTGCCT 839
Query 840 GGCCAGCTGTCGAGGGCATGAAGGTGACATAACTGATCTTGCTGTGAGTTCGAACAACAT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GGCCAGCTGTCGAGGGCATGAAGGTGACATAACTGATCTTGCTGTGAGTTCGAACAACAT 899
Query 900 TTTCATAGCATCCGCATCAAATGATTGTGTGATCCGCGTTTGGCGATTGCCAGATGGCTT 959
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TTTCATAGCATCCGCATCGAATGATTGTGTGATCCGCGTTTGGCGATTGCCAGATGGCTT 959
Query 960 ACCAGTTTCTGTTCTCCGTGGACATACTGGAGCTGTTACTGCTATTGCCTTTAGTCCCAG 1019
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 960 ACCAGTTTCTGTCCTCCGTGGACATACTGGAGCTGTTACTGCTATTGCATTTAGTCCCAG 1019
Query 1020 ACCTGGATCCCCGTACCAGCTTCTCTCATCGTCTGATGATGGTACATGTAGGATATGGGA 1079
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 ACCTGGATCCCCATACCAGCTTCTCTCATCGTCTGATGATGGTACATGTAGGATATGGGA 1079
Query 1080 TGCCCGGGGAGCCCAATTTGCTCCCCGGATATATGTCCCTAGGCCTCCTAGTCCTGATGG 1139
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TGCTCGGGGAGCCCAATTTGCTCCCCGGATATATGTCCCTAGGCCTCCTAGTCCTGATGG 1139
Query 1140 AAAGAACAGTGGCCCTTCTTCTAGTAATGCTCAGCAGAGTCACCAAATCTTTTGCTGTGC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AAAGAACAGTGGCCCTTCTTCTAGTAATGCTCAGCAGAGTCACCAAATCTTTTGCTGTGC 1199
Query 1200 ATTCAATGCTAGTGGATCTGTCTTTGTCACTGGCAGTTCTGACACTCTTGCTAGAGTATA 1259
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 ATTCAATGCTAATGGATCTGTCTTTGTCACTGGCAGTTCTGACACTCTTGCTAGAGTATA 1259
Query 1260 CTCGGTTTGGAGTGCTAATAAGACCAATACTGATGATCCAGAGCAGCCAAATCATGAGAT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CTCGGTTTGGAGTGCTAATAAGACCAATACTGATGATCCAGAGCAGCCAAATCATGAGAT 1319
Query 1320 GGATGTTCTGGCTGGACATGAGAATGATGTTAATTATGTTCAGTTCAGTGGTTGTGCTGC 1379
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GGATGTTCTAGCTGGACATGAGAATGATGTTAATTATGTTCAGTTCAGTGGTTGTGCTGC 1379
Query 1380 GGGGTCTAAATTTTCTGTAACTGACTACTCAAAAGACGAGAATGTTCCAAAATTTAAGAA 1439
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 GGGATCTAAATTTTCTGTAACTGACTACTCAAAAGACGAGAATGTTCCAAAATTTAAGAA 1439
Query 1440 TTCCTGGTTTTGTCATGATAACATAGTTACATGCTCTCGTGATGGTAGTGCAATCATTTG 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TTCCTGGTTTTGTCATGATAACATAGTTACATGCTCTCGTGATGGTAGTGCAATCATTTG 1499
Query 1500 GATCCCAAGATTACGGAGATCTCATGGAAAAAGCTGCCGATGGACACGAGCATATCATCT 1559
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 GATCCCAAGATTGCGGAGATCGCATGGAAAAAGCTGCCGATGGACACGAGCATATCATCT 1559
Query 1560 CAAGGTTCCACCTCCGCCCATGCCCCCTCAACCTCCTAGAGGGGGGCCACGTCAAAGGAT 1619
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1560 CAAGGTTCCACCTCCGCCCATGCCTCCTCAACCTCCTAGAGGTGGGCCACGTCAAAGGAT 1619
Query 1620 CCTACCTACACCCCGTGGGGTTAACATGATTGCTTGGAGTCTGGATAATCGTTTTGTCCT 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 CCTACCTACACCCCGTGGGGTTAACATGATTGCTTGGAGTCTGGATAATCGTTTTGTCCT 1679
Query 1680 TGCCGCTATTATGGATTGTAGAATATGCGTGTGGAATGCCTCTGATGGTAGCTTGGTACA 1739
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TGCCGCTATCATGGATTGTAGAATATGCGTGTGGAATGCCTCTGATGGTAGCTTGGTACA 1739
Query 1740 TTCTTTGACTGGTCATACAGCATCTACATATGTTATGGACGTCCATCCATTCAATCCTCG 1799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1740 TTCTTTGACTGGTCATACAGCATCTACATATGTTATGGACGTCCATCCTTTCAATCCTCG 1799
Query 1800 TATAGCTATGAGTGCTGGCTATGATGGAAAAACAATAGTGTGGGATATATGGGAAGGCAT 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 TATAGCTATGAGTGCTGGCTATGATGGAAAAACAATAGTGTGGGATATATGGGAAGGCAT 1859
Query 1860 ACCTATACAAATATACGACATTTCACACTACAAGTTGGTTGATGGGAAGTTTTCACCGGA 1919
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 ACCTATCCAAATATACGAGATTTCACACTACAAGTTGGTTGATGGGAAGTTTTCACCGGA 1919
Query 1920 TGGAACTTCAATTATACTTTCAGATGATGTGGGCCAATTGTACATATTAAGTACTGGCCA 1979
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1920 TGGAACATCAATTATACTTTCAGATGATGTGGGCCAATTGTACATATTAAGTACAGGCCA 1979
Query 1980 AGGGGATTCTCAAAAAGACGCTAAATATGATCAGTTCTTCCTGGGGGATTATCGTCCATT 2039
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1980 AGGGGATTCTCAAAAAGATGCTAAATATGATCAGTTCTTCCTGGGGGATTATCGGCCATT 2039
Query 2040 AATTCAGGACACATATGGTAATGTCCTTGACCAGGAATCTCAGCTTCAACCTTATCGCCG 2099
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2040 AATTCAGGACATATATGGTAATGTCCTTGACCAGGAATCTCAGCTTCAACCTTATCGTCG 2099
Query 2100 AAATATGGAGGATCCTCTTTGTGATTCAGGGATGATTCCATATGAAGAGCCATATCAGAC 2159
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 AAATATGGAGGATCCTCTTTGCGATTCAGGGATGATTCCATATGAAGAGCCATATCAGAC 2159
Query 2160 CACGTTTCAGAAACGGCGACTCGGCGCCTTAGGCAAAGAATGGCGACCATCTTCTTTGAA 2219
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 CACGTTTCAGAAACGACGACTCGGCGCCTTAGGCAAAGAATGGCGACCATCTTCTTTGAA 2219
Query 2220 GCTTGCTGTCGGGCCAGATATCACTTTAGATCGAGATTACCAAATGCCACCTCTGGCAGA 2279
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GCTTGCTGTCGGGCCAGATATCACTTTAGATCAAGATTACCAAATGCCACCTCTGGCAGA 2279
Query 2280 TCTAGACTTAGCCGAACCGTTGCCAGAGTTTATAGATGTAATGGAGTGGGAACCAGAAGT 2339
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TCTAGACTTAGCCGAACCGTTGCCAGAATTTATAGATGTAATGGAGTGGGAACCAGAAGT 2339
Query 2340 TGATATCTTAAGTGATGAAAACGACTCTGAATACAATGTGCCAGAGGAGTATTCGTCTGG 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 TGATATCTTAAGTGATGAAAACGACTCTGAATACAATGTGCCAGAGGAGTATTCGTCTGG 2399
Query 2400 AAAAGAGCAAGAATGTTTAAATTCTTCAACCTCTGGTGAGTCAGGTTCCAGTTCTGGTGA 2459
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2400 AAAAGAGCAAGAATGTTTAAATTCTTCAACCTCTGGTGAGTCAGGTTCCAGTTCCGGTGA 2459
Query 2460 AAGCTATGAGGATGATGATCATCAGAATAGCCTTAGAAGATCCAAAAGGAAAAAACATAA 2519
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2460 AAGCGATGAGGATGATGATCATCAGAATAGCCTTAGAAGATCCAAAAGGAAAAAAGATAA 2519
Query 2520 GAAAGAAGCTGGGATCATGACTTCTTCGGGTAGGCGTGTCAAAAAGAGGAACTTTGATGA 2579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 GAAAGAAGCTGGGATCATGACTTCTTCGGGTAGGCGCGTCAAAAAGAGGAACTTTGATGA 2579
Query 2580 GCTTGAGGGAGCTCCAAGCAACAAAAAACGTACCAGAAAATCTAGGAGTGGTCGTAAAGA 2639
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 GATTGAGGGAGCTCCAAGCAACAAAAAACGTACCAGGAAATCTAGGAGTGGTCGTAAAGA 2639
Query 2640 ATCGAAGAGGAAATCTTCAAAATCTAAATCGTCTAGACCTAGGCGAGCAGCTGCACGAAA 2699
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 ATCGAAAAGGAAATCTTCAAAATCTAAATCGTCCAGACCTAGGCGAGCAGCTGCACGAAA 2699
Query 2700 TGCTCTCTCTTGGTTTTCTAAGATTACAGGTACATCTAAAGATGCAGAAGAGGAGGAAGT 2759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2700 TGCTCTCTCTTGGTTTTCTAAGATTACAGGTACATCTAAAGATGCAGAAGAGGAAGAGGT 2759
Query 2760 CTCTGAATTGAGTGATTCATCAGAAAGTGAATCGACAACACAAGACTCAGGTACTGGGGA 2819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2760 CTCTGAATTGAGTGATTCATCAGAAAGTGAATCGACAACACAAGACTCAGGCACTGGGGA 2819
Query 2820 TAGTGAACTTGAAGTAGCTTTGTTAAATGGGCATGGGAAGCAATCGAAGGGGAAAACTAT 2879
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2820 TAGTGAACTTGAAGTAGCTTTGTTAAATGGGCATGGGAAGCAATCGAAGGGGAAAAATAT 2879
Query 2880 CCTCGTATGTGATTCTGATGATGGGGCTCAACAATGTGATATCAGAGAAACTCATACTGC 2939
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2880 CCTCGTATGTGATTCAGATGATGGGGCTCAACAATGTGATATCAGAGAAACTCATCCTAC 2939
Query 2940 TGAAAGGAGGAGATTGGTTCTTAGATTTCCTGTTAGGAATTCAGATAAGCTTACCTTACT 2999
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2940 TGAAAGGAGGAGATTGGTTCTTAGATTTCCTGTTAGGAATTCAGATAAGCTTACTTTACT 2999
Query 3000 GGAGAACCTACCTGGATCATCTTGTGATGTTCCAAGTCCAACTTTAGGGAACGGCTGTAC 3059
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3000 GGAGAACCTACCTGGATCATCTTCTGATGTTCCAACTCCAACTTTAGGGAACGGCTGTGC 3059
Query 3060 TGAAGACTCGAGGATTCCTGGGAACCAATTTGAAGGGCTAGATGTAAGTAAAGTCAAATG 3119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 TGAAGACTCGAGGATTCCTGGGAACCAATTTGAAGGGCTAGATGTAAGTAAAGTCAAATG 3119
Query 3120 GGGAATGGTTAAGGCTCGTACAACAAAGCGAATAAGAGGTGAAGCAATATCATCGCATGA 3179
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 GGGAATGGTTAAGGCTCGTACAACGAAGCGAATAAGAGGTGAAGCAATATCATCGCATGA 3179
Query 3180 ACTTATGGGCTCTGACCCGGAGGGAAAGGAAAATAATGTTAAGGAAGACT-CAAATCACC 3238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||
Sbjct 3180 ACTTATGGGCTCTGACCCGGAGGGAAAGGAAAATAATCTTAAGGAAGA-TGCAAATCACC 3238
Query 3239 GTGGAAATGGTGTTACAGCACCTAGTTGTTTGGAATTGAAAACAGATATAGATGACATGG 3298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3239 ATGGAAATGGTGTTACAGCACCTAGTTGTTTGGAATTGAAAACAGATATAGATGGCATGG 3298
Query 3299 CAGTTGACACTGACACGGTGATCTCTAATGGTTTGCCAAATGGTGGGAAGCGATATCCAG 3358
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3299 CAGTTGACACTGACACGGTGATCTCCAGTGGTTTGCCAAATGGTGGTAAGCGATATCCAG 3358
Query 3359 AACTGGATGGGTCACCAAGTCGAGTGGCTGATGACAAGGCCTCTAATAGTTCTCAAAATG 3418
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3359 AACTGGATGGGTCACCAAGTCGACTGGCTGATGACAGGGCCTCTAACGGTTCTCAAGATG 3418
Query 3419 TAACC---CACCGGCACGATCTAATAGATAGCCTTCCACCAATCTCAACGACATTGAAGA 3475
||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3419 TAACCGGTCACCGGCACAATCTAATTGATAGCCTTCCACCAATCTCAACGACATTGAGGA 3478
Query 3476 TACGCTCCAAGAGAGTTTCAAGGGCTCCGGATACATCTTTGAGGCAAGAAGGAAAATCCT 3535
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3479 TACGCTCCAAGAGAGTTTCAAGGGCTCCGGATACATCTTTGAGGCAAGAAGGAAAACCCT 3538
Query 3536 TATCAATAGATCAAGAGACTGGTGGCTCTGATGCATTAAATGATGGTTTTGAAGATGCTA 3595
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3539 TATCAATAGATCAAGAGACTGGTGGCTCTGATGCAATAAATGATGGTTTTGAAGACGCTA 3598
Query 3596 AATGTGATTTGACATTGGACTGTCAAAAGGATGGTGTGGTTGGGACAGAGATATCTCTGC 3655
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3599 AATGTGATTTGGCATTGGACTGTCAAAAGGATGGTGTGGTTGGGACAGAGATATCTCTGC 3658
Query 3656 GAAATGATTGTGTTCTGGAATTAAATCCTCAGATCTGTGATGCGCTCTCAATTGCTAATG 3715
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3659 GAAATGACTGTGTTCTGGAATTAAATCCTCAGATCAGTGATGCGCTCTCAATTGCTAATG 3718
Query 3716 ATGTTCCTGTGTCACACTCACATCCTAAACGGATGTTTGATTTTGTCTATAGACGAAAGT 3775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3719 ATGTTCCTGTGTCACACTCACATCCTAAACGGATGTTTGATTTTGTCTATAGACGAAAGT 3778
Query 3776 CACGGAAGCATAAGAACAACTTAGACAGGGATGCTGCTCTTACTAAAGAAGTCAGTCCAG 3835
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 3779 CACGGAAGCATAAGAACAACTTAGACAGGGATGCTGCTATTACTAAAGAAATCAGTCCAG 3838
Query 3836 GTTCTTGTAGTCAGGATCATGGTAGTGGCTCTAAGTCCCATGAAGGTGCCTCTAATGGGT 3895
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3839 GTTCTTGTAGTCAGGATCAGGGTAGTGGCTCTAAGTCCCATGAAGGTGCCTCTAATGGGT 3898
Query 3896 TCCATGGGACTGAGTTGAATGGATTAGAGAAGTCGGAAGGCAGTTTGACCCACATCCAAG 3955
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3899 TCCATGGGACTCAGTTGAATGGATTAGAGAAGTCGGAAGGCAGTTTGACACACATCCAAG 3958
Query 3956 ATAAAATAAGTGATTCACGTGGAAACCAAAACTCTCAGGAAGAATTGAGATCCGCTTCTG 4015
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3959 ATAAAATAAGTGATTCACGTGGAAACCAAAACTCTCAGGAAGAATTGAGATCTGCTTCTG 4018
Query 4016 GAGCAACACTTCGGTTGAGATCCACAAGAAATAGAAAGTCTACTTATCCCTTTAGTGAAA 4075
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 4019 GGGCAACACTTCGTTTGAGATCCACAAGAAATAGAAAGTCCACTTATCCTTTTAGTGAAA 4078
Query 4076 CTAAACCTATTGAAACAAAGAAGCCTCAGCAGTTAATAGAAAATGTATCCTGGTTGACAT 4135
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4079 CTAAACCTATTGAAACAAAGAAGCCGCAACAGTTAATAGAAAATGTATCCTGGTTGACAT 4138
Query 4136 TATCGATACATGAAGAGGGTTCTCGTTATATTCCACAAATGGGGGATGAAGTTGCGTATT 4195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4139 TATCGATACATGAAGAGGGTTCTCGTTATATTCCACAAATGGGGGATGAAGTTGCGTATT 4198
Query 4196 TGCGACAGGGGCATCAAGAATACTTAAACTTTAGCTCCCTGAGGGAAGTGGCTCCTTGGA 4255
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4199 TGCGACAGGGGCATCAAGAATACTTAAACTTTAGCTCCCTGAGGGAGGTGGCTCCTTGGA 4258
Query 4256 CATCAATAAAAGGAGGAAATATAAAGGCTGTAGAAATTTGTAAAGTGGAAAGTCTTGAAT 4315
| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4259 CTTCAATAAAAGGAGGAATTATAAAGGCTGTGGAAATTTGTAAAGTGGAAAGTCTTGAAT 4318
Query 4316 ATGCAACTCTGCCTGGTTCTGGGGATAGCTGCTGCAAAATGATACTTAAGGTCATCGATC 4375
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4319 ATGCAACTCTTCCTGGTTCTGGGGATAGCTGCTGCAAAATGATACTTAAGGTCATCGATC 4378
Query 4376 CAAACTCCGAAGTGTTCAACAAAGCTTTCAAACTTACGTTGCCTGAAGTGGTGACGTTTC 4435
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 4379 CAAACTCCGAAGTGTTCAACAAAGCTTTCAAACTTACGTTGCCTGAGGTGGTGACCTTTC 4438
Query 4436 CAGATTTTCTTGTGGAAAGAAGTCGGTATGAAGCAGCAATACAGAGGAACTGGACTTGCA 4495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4439 CAGATTTTCTTGTGGAAAGAAGTCGGTATGAAGCAGCAATACAGAGGAACTGGACTTGCA 4498
Query 4496 GGGACAAGTGTAAAGTTTGGTGGAGAGACGAAGGCGAAGAAGATGGTAGTTGGTGGGAAG 4555
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4499 GGGATAAGTGTAAGGTTTGGTGGAGAGACGAAGGCGAAGAAGATGGTAGTTGGTGGGAAG 4558
Query 4556 GACGGATTCTAGCTGTGAAACCCAAATCACCTGATTTTCCTGATAGTCCGTGGGAGAGGT 4615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4559 GACGGATTCTAGCTGTGAAACCCAAATCACCTGATTTTCCTGATAGTCCGTGGGAGAGGT 4618
Query 4616 ACACAGTTAAGTACAAGAGTGACCCTGCCGAGACACATCTTCACAGTCCCTGGGAGCTTT 4675
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4619 ACACTGTTAAGTACAAGAGTGACCCTGCCGAGACACATCTTCACAGTCCCTGGGAGCTTT 4678
Query 4676 TTGATGCAGATACCAAGTGGGAGCAGCCTCACATTGATGATGAGCAACGAAACCGTTTGC 4735
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4679 TTGATGCTGATACCAAGTGGGAGCCGCCTCACATTGATGATGAGCAACGAAACCGTTTGC 4738
Query 4736 TCTCGGCCTTAACAAAGTTAGAGACTTCAGACAAGAGAACCCAGGATTCTTTTGGCCTCC 4795
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4739 TCTCGGCCTTAACAAAGTTAGAGACTTCAGACAAAAGAACCCAGGATTCTTATGGCCTCC 4798
Query 4796 GAAAACTGAACCAGACCGTGGGAAATTCCAGCTACTCCAACAGGTTCCCAGTTCCTTTGT 4855
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4799 GAAAACTGAACCAGACCGTGGGAAACTCCAGCTACACCAACAGGTTCCCAGTTCCTTTGT 4858
Query 4856 CTCTTGAAGTAATCAGATCAAGGCTTGAGAACAACTATTACCGAAGTGTGGAAGCATTAC 4915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4859 CTCTTGAAGTAATCAGATCAAGGCTTGAGAACAACTATTACCGAAGTGTGGAAGCATTAA 4918
Query 4916 GACACGACGTATCAGTTATGTTGTCCAATGCAGAGACTTTCTTTGGTCGAAATAAAAGTG 4975
||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4919 GACACGACGTAGCAGTTATGTTGTCGAATGCAGAAACTTTCTTTGGTCGAAATAAAAGCG 4978
Query 4976 TAGCAGCCAAAATCTCAAATCTCTCTAACTGGTTCGACCGGACGCTACCTTCTTCGTAG 5034
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 4979 TAGCAGCCAAAATCTCAAATCTCTCTAACTGGTTCGACCGCATGCTACCTTCTTCGTAG 5037
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 190554268011
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5