BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G49460.1
Length=2336
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg949437 jgi|Araly1|949437|scaffold_801324.1 3173 0.0
Ahg477973 jgi|Araly1|477973|fgenesh2_kg.3__674__AT3G06650.1 2266 0.0
> Ahg949437 jgi|Araly1|949437|scaffold_801324.1
Length=1870
Score = 3173 bits (1718), Expect = 0.0
Identities = 1820/1870 (97%), Gaps = 4/1870 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 221 CAGTTTTTTCTATCTGAGCTATGGCAACGGGACAGCTTTTTTCTCGTACCACACAAGCTT 280
||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4 CAG-TTTTTCTAT-TGAGCTATGGCAACGGGACAGCTTTTTTCTCGGACTACACAAGCTT 61
Query 281 TGTTCTACAACTATAAGCAGCTTCCTGTTCAACGAATGCTCGATTTCGACTTTCTCTGTG 340
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 62 TGTTCTATAACTATAAGCAGCTTCCTGTTCAACGAATGCTCGATTTCGACTTTCTTTGTG 121
Query 341 GACGTGAAACGCCTTCTGTTGCTGGAATCATAAATCCTGGTTCTGAAGGTTTTCAAAAGC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 GACGTGAAACGCCTTCTGTTGCTGGAATCATAAATCCTGGTTCTGAAGGTTTTCAAAAGC 181
Query 401 TCTTTTTCGGGCAGGAGGAAATCGCTATCCCTGTTCATGCCGCCATTGAGGCAGCTTGTG 460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 TCTTTTTCGGGCAGGAGGAAATCGCTATCCCTGTTCATGCCGCCATTGAGGCAGCTTGTG 241
Query 461 CTGCGCATCCAACAGCGGATGTATTCATCAACTTTGCATCTTTTAGGAGTGCTGCTGCTT 520
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 242 CTGCGCATCCAACCGCGGATGTATTCATCAACTTTGCATCTTTCAGGAGTGCTGCTGCTT 301
Query 521 CATCCATGGCTGCTTTGAAGCAGCCGACTATTAAAGTTGTGGCAATTATAGCTGAAGGTG 580
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 CGTCCATGGCTGCTTTGAAGCAGCCGACTATTAAAGTTGTGGCAATTATAGCTGAAGGTG 361
Query 581 TTCCAGAATCAGACACTAAGCAGCTGATTGCGTATGCTCGTGCAAACAATAAGGTTGTTA 640
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 TTCCAGAATCAGACACTAAGCAGCTGATTGCTTATGCTCGTGCAAACAATAAGGTTGTTA 421
Query 641 TTGGACCGGCTACTGTTGGAGGTATTCAAGCTGGAGCCTTTAAGATTGGTGATACTGCAG 700
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 422 TTGGACCGGCTACTGTTGGAGGTATTCAAGCTGGAGCCTTTAAGATTGGTGACACTGCAG 481
Query 701 GAACAATTGATAACATTATCCAGTGCAAGCTATACAGACCTGGATCTGTTGGTTTTGTCT 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 GAACAATTGATAACATTATCCAGTGCAAGCTATACAGACCTGGATCTGTTGGTTTTGTCT 541
Query 761 CCAAATCTGGTGGAATGTCTAATGAAATGTACAATACTGTTGCCCGTGTGACTGATGGGA 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 CCAAATCTGGTGGAATGTCTAATGAAATGTACAATACTGTTGCCCGTGTGACTGATGGGA 601
Query 821 TCTACGAAGGCATTGCTATTGGTGGAGACGTGTTCCCAGGATCGACTTTATCTGACCACA 880
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 602 TCTATGAAGGCATTGCCATTGGTGGAGACGTGTTCCCAGGATCCACTTTATCTGACCACA 661
Query 881 TCCTTCGGTTTAACAACATCCCACAGATAAAAATGATGGTTGTACTTGGAGAGCTTGGAG 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 TCCTTCGGTTTAACAACATCCCACAGATAAAAATGATGGTTGTACTTGGAGAGCTTGGAG 721
Query 941 GAAGAGATGAATACTCTCTTGTTGAAGCTTTGAAAGAGGGAAAAGTCAATAAACCTGTGG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 GAAGAGATGAATACTCTCTTGTTGAAGCTTTGAAAGAGGGAAAAGTCAATAAACCTGTGG 781
Query 1001 TTGCTTGGGTCAGTGGAACTTGTGCACGACTCTTCAAGTCTGAAGTACAGTTTGGTCATG 1060
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 TTGCTTGGGTCAGCGGAACTTGTGCACGGCTCTTCAAGTCTGAAGTACAGTTTGGTCATG 841
Query 1061 CAGGTGCCAAAAGTGGCGGCGAGATGGAGTCTGCACAAGCCAAGAATCAAGCTCTCATAG 1120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 842 CAGGTGCCAAAAGTGGCGGCGAGATGGAGTCTGCACAAGCCAAGAATCAAGCTCTCATGG 901
Query 1121 ATGCTGGAGCTATTGTTCCCACTTCATTTGAAGCTCTAGAATCTGCAATCAAAGAGACTT 1180
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 902 ATGCTGGAGCTATTGTTCCCACTTCATTTGAAGCCCTTGAAGCTGCAATCAAAGAGACTT 961
Query 1181 TTGAGAAACTGGTTGAAGAAGGAAAGGTCTCTCCTATCAAGGAAGTCATTCCTCCACAAA 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 TTGAGAAACTGGTTGAAGAAGGAAAGGTCTCTCCTATCAAGGAAGTCATTCCTCCACAAA 1021
Query 1241 TCCCTGAGGATCTCAATTCTGCAATTAAGAGTGGGAAAGTCCGGGCTCCTACTCACATCA 1300
|||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1022 TCCCCGAGGATCTCAATTCCGCAATTAAGAGCGGGAAAGTTCGGGCTCCTACTCACATAA 1081
Query 1301 TCTCCACCATATCTGATGACAGAGGGGAGGAACCATGCTATGCTGGTGTTCCAATGTCTT 1360
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 TCTCCACCATCTCTGATGACAGAGGGGAGGAACCATGCTATGCTGGTGTTCCAATGTCTT 1141
Query 1361 CCATCATCGAACAAGGCTATGGAGTGGGTGATGTCATTTCCCTTCTATGGTTCAAACGTA 1420
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1142 CCATCATCGAACAAGGCTATGGAGTGGGTGATGTTATTTCTCTTCTATGGTTCAAACGTA 1201
Query 1421 GTCTACCTCGTTACTGTACAAAATTCATTGAGATATGCATAATGCTGTGTGCTGATCACG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 GTCTACCTCGTTACTGTACAAAATTCATTGAGATATGCATAATGCTGTGTGCTGATCACG 1261
Query 1481 GTCCATGCGTCTCCGGCGCTCACAACACCATTGTAACAGCAAGAGCAGGCAAAGACCTCG 1540
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1262 GTCCATGCGTCTCTGGTGCTCACAACACCATTGTAACAGCAAGAGCAGGCAAAGACCTTG 1321
Query 1541 TCTCAAGTCTTGTCTCAGGTTTA-TTGACCATTGGTCCCCGATTTGGTGGTGCCATTGAT 1599
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 TCTCAAGTCTTGTCTCAGGTTTACTT-ACCATTGGTCCCCGATTTGGTGGTGCCATTGAT 1380
Query 1600 GACGCTGCTCGATACTTCAAAGACGCGTGTGACAGGAATCTCACACCTTATGAATTTGTT 1659
|||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1381 GACGCTGCTCGATATTTCAAGGACGCTTGTGACAGGAATCTCACACCTTATGAATTCGTC 1440
Query 1660 GAGGGAATGAAGAAAAAGGGAATCCGAGTCCCCGGGATTGGACACAGGATCAAGAGCAGA 1719
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GAGGGAATGAAGAAAAAAGGAATCCGAGTCCCCGGGATTGGACACAGGATCAAGAGCAGA 1500
Query 1720 GACAACAGAGACAAAAGAGTGGAGCTTCTTCAGAAATTTGCTCGGTCCAACTTCCCATCA 1779
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GACAACAGAGACAAAAGAGTGGAGCTGCTACAGAAATTTGCTCGGTCCAACTTCCCATCA 1560
Query 1780 GTGAAGTACATGGAGTACGCAGTGACAGTGGAGACATACACGCTCTCAAAGGCAAACAAC 1839
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1561 GTGAAGTACATGGAGTACGCAGTGACAGTGGAGACTTACACGCTCTCAAAAGCAAACAAC 1620
Query 1840 CTCGTACTCAACGTTGATGGAGCCATTGGATCTCTCTTCTTGGACCTTCTAGCTGGAAGT 1899
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 CTCGTACTCAACGTTGATGGAGCCATAGGATCTCTCTTCTTGGACCTTCTAGCTGGAAGT 1680
Query 1900 GGGATGTTCACTAAACAAGAGATTGACGAGATTGTTCAGATCGGTTATCTCAACGGTCTG 1959
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GGGATGTTCACTAAACAAGAGATCGACGAGATAGTTCAGATCGGTTATCTCAACGGTCTC 1740
Query 1960 TTTGTTCTTGCTCGCTCCATCGGTTTGATCGGGCACACGTTTGATCAGAAGAGATTGAAG 2019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 TTTGTTCTTGCTCGCTCCATCGGTTTGATCGGGCACACGTTTGATCAGAAGAGATTGAAG 1800
Query 2020 CAGCCACTGTATCGTCACCCATGGGAAGATGTGTTGTACACCAAGTAAAACTCATTTCAA 2079
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1801 CAGCCTCTGTATCGTCACCCATGGGAAGATGTGTTATACACCAAGTAAAACTCATCTCAA 1860
Query 2080 TCCTATTTTT 2089
||||||||||
Sbjct 1861 TCCTATTTTT 1870
> Ahg477973 jgi|Araly1|477973|fgenesh2_kg.3__674__AT3G06650.1
Length=2134
Score = 2266 bits (1227), Expect = 0.0
Identities = 1666/1881 (89%), Gaps = 17/1881 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 241 ATGGCAACGGGACAGCTTTTTTCTCGTACCACACAAGCTTTGTTCTACAACTATAAGCAG 300
||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 129 ATGGCTACGGGACAGCTATTTTCACGCAACACACAGGCGTTGTTCTACAATTATAAGCAG 188
Query 301 CTTCCTGTTCAACGAATGCTCGATTTCGACTTT-CTCTGTGGACGTGAAACGCCTTCTGT 359
||||| |||| || ||||| ||||| || ||| || ||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 189 CTTCCCATTCAGCGGATGCTTGATTTTGA-TTTCCTATGTGGGCGAGAAACTCCTTCTGT 247
Query 360 TGCTGGAATCATAAATCCTGGTTCTGAAGGTTTTCAAAAGCTCTTTTTCGGGCAGGAGGA 419
|||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| ||||| || ||||||||
Sbjct 248 TGCTGGTATCATTAACCCAGGTTCCGAGGGATTCCAAAAGCTATTTTTTGGTCAGGAGGA 307
Query 420 AATCGCTATCCCTGTTCATGCCGCCATTGAGGCAGCTTGTGCTGCGCATCCAACAGCGGA 479
||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 308 GATCGCCATCCCTGTCCATGCAGCCATTGAGGCAGCATGCGCTGCGCATCCCACAGCTGA 367
Query 480 TGTATTCATCAACTTTGCATCTTTTAGGAGTGCTGCTGCTTCATCCATGGCTGCTTTGAA 539
||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 TGTATTCATCAACTTCGCATCGTTTAGAAGTGCTGCTGCTTCATCCATGGCTGCTTTGAA 427
Query 540 GCAGCCGACTATTAAAGTTGTGGCAATTATAGCTGAAGGTGTTCCAGAATCAGACACTAA 599
|| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 428 GCTGCCAACTATTAAAGTAGTGGCCATAATAGCAGAAGGTGTTCCGGAGTCAGACACTAA 487
Query 600 GCAGCTGATTGCGTATGCTCGTGCAAACAATAAGGTTGTTATTGGACCGGCTACTGTTGG 659
|||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 488 GCAGTTGATTGCTTATGCTCGGGCTAACAATAAGGTTATTATTGGACCAGCTACTGTTGG 547
Query 660 AGGTATTCAAGCTGGAGCCTTTAAGATTGGTGATACTGCAGGAACAATTGATAACATTAT 719
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||
Sbjct 548 AGGCGTTCAAGCTGGAGCCTTTAAAATTGGTGATACTGCCGGAACAATTGACAATATCAT 607
Query 720 CCAGTGCAAGCTATACAGACCTGGATCTGTTGGTTTTGTCTCCAAATCTGGTGGAATGTC 779
|||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 608 CCAGTGCAAGTTGTACAGACCTGGATCTGTTGGCTTTGTCTCAAAATCTGGTGGCATGTC 667
Query 780 TAATGAAATGTACAATACTGTTGCCCGTGTGACTGATGGGATCTACGAAGGCATTGCTAT 839
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 668 TAATGAAATGTACAATACCATTGCCCGTGTGACAGATGGGATCTATGAAGGCATTGCTAT 727
Query 840 TGGTGGAGACGTGTTCCCAGGATCGACTTTATCTGACCACATCCTTCGGTTTAACAACAT 899
|||||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 728 TGGTGGGGATGTGTTCCCGGGCTCAACTTTATCTGACCATATCCTGCGGTTTAACAACAT 787
Query 900 CCCACAGATAAAAATGATGGTTGTACTTGGAGAGCTTGGAGGAAGAGATGAATACTCTCT 959
||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 788 CCCACAGATTAAGATGGTGGTTGTACTTGGAGAGCTTGGAGGAAGAGATGAGTATTCTCT 847
Query 960 TGTTGAAGCTTTGAAAGAGGGAAAAGTCAATAAACCTGTGGTTGCTTGGGTCAGTGGAAC 1019
|||||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||
Sbjct 848 AGTTGAAGCCATGAAACAGGGAAAAGTGACCAAACCAGTGGTTGCTTGGGTCAGCGGGAC 907
Query 1020 TTGTGCACGACTCTTCAAGTCTGAAGTACAGTTTGGTCATGCAGGTGCCAAAAGTGGCGG 1079
||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 908 TTGTGCACGTCTCTTCAAGTCCGAAGTGCAATTTGGTCATGCAGGGGCCAAAAGTGGTGG 967
Query 1080 CGAGATGGAGTCTGCACAAGCCAAGAATCAAGCTCTCATAGATGCTGGAGCTATTGTTCC 1139
|||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||| ||
Sbjct 968 AGAGATGGAGTCTGCACAAGCCAAGAATCAAGCGCTAAAAGACGCTGGAGCTACTGTACC 1027
Query 1140 CACTTCATTTGAAGCTCTAGAATCTGCAATCAAAGAGACTTTTGAGAAACTGGTTGAAGA 1199
||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 1028 CACTTCATTTGAAGCCCTAGAATCTGCAATCAAGGAAACTTTTGACAAATTGGTTGAAGA 1087
Query 1200 AGGAAAGGTCTCTCCTATCAAGGAAGTCATTCCTCCACAAATCCCTGAGGATCTCAATTC 1259
||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1088 GGGAAAGGTCTCTCCTATTAAGGAGGTCACTCCTCCACAAATCCCTGAAGATCTCAGCTC 1147
Query 1260 TGCAATTAAGAGTGGGAAAGTCCGGGCTCCTACTCACATCATCTCCACCATATCTGATGA 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1148 TGCAATTAAGAGTGGGAAAGTCCGGGCTCCTACCCACATCATCTCCACCATTTCTGATGA 1207
Query 1320 CAGAGGGGAGGAACCATGCTATGCTGGTGTTCCAATGTCTTCCATCATCGAACAAGGCTA 1379
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||
Sbjct 1208 CAGAGGGGAGGAACCATGCTATGCTGGTGTGCCAATGTCATCCATCATTGAACAGGGTTA 1267
Query 1380 TGGAGTGGGTGATGTCATTTCCCTTCTATGGTTCAAACGTAGTCTACCTCGTTACTGTAC 1439
||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1268 TGGCGTGGGAGATGTCATTTCTCTCCTATGGTTCAAACGTAGTCTTCCTCGTTATTGTAC 1327
Query 1440 AAAATTCATTGAGATATGCATAATGCTGTGTGCTGATCACGGTCCATGCGTCTCCGGCGC 1499
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1328 CAAATTCATTGAGATATGCATAATGTTGTGCGCTGACCACGGTCCATGCGTCTCTGGTGC 1387
Query 1500 TCACAACACCATTGTAACAGCAAGAGCAGGCAAAGACCTCGTCTCAAGTCTTGTCTCAGG 1559
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 TCACAACACCATCGTAACAGCAAGAGCAGGAAAAGACCTTGTCTCAAGTCTTGTCTCAGG 1447
Query 1560 TTTATTGACCATTGGTCCCCGATTTGGTGGTGCCATTGATGACGCTGCTCGATACTTCAA 1619
| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||
Sbjct 1448 TCTATTAACAATTGGTCCTAGATTTGGTGGTGCCATTGATGATGCAGCACGATACTTCAA 1507
Query 1620 AGACGCGTGTGACAGGAATCTCACACCTTATGAATTTGTTGAGGGAATGAAGAAAAAGGG 1679
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||
Sbjct 1508 GGACGCTTGTGACAGGAATCTCACACCTTATGAATTCGTGGAAGGCATGAAGAAGAAGGG 1567
Query 1680 AATCCGAGTCCCCGGGATTGGACACAGGATCAAGAGCAGAGACAACAGAGACAAAAGAGT 1739
|||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1568 AATCCGTGTCCCTGGCATTGGTCACAGGATAAAGAGCAGAGACAACAGAGACAAAAGAGT 1627
Query 1740 GGAGCTTCTTCAGAAATTTGCTCGGTCCAACTTCCCAT-CAGTGAAGTACATGGAGTACG 1798
|||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1628 GGAGCTGCTTCAGAAATTTGCACGGTCTAACTTCCC-TGCAGTTAAGTACATGGAATACG 1686
Query 1799 CAGTGACA-GTGGAGACATACACGCTCTC-AAAGGCAAACAACCTCGTACTCAACGTTGA 1856
| || || || ||||||||||| || || |||| ||| |||||||||| | || || ||
Sbjct 1687 CGGTC-CAAGTAGAGACATACACACTGTCTAAAGCCAA-CAACCTCGTAATGAATGTCGA 1744
Query 1857 TGGAGCCATTGGATCTCTCTTCTTGGACCTTCTAGCTGGAAGTGGGATGTTCACTAAACA 1916
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1745 TGGAGCCATTGGATCTCTCTTCTTAGACCTTCTCGCTGGAAGTGGGATGTTCACTAAGCA 1804
Query 1917 AGAGATTGACGAGATTGTTCAGATCGGTTATCTCAACGGTCTGTTTGTTCTTGCTCGCTC 1976
|||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||
Sbjct 1805 AGAGATAGACGAAATCGTTCAGATCGGTTATCTCAACGGCCTCTTTGTCCTCGCTCGATC 1864
Query 1977 CATCGGTTTGATCGGGCACACGTTTGATCAGAAGAGATTGAAGCAGCCACTGTATCGTCA 2036
||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1865 CATCGGTTTAATCGGGCACACATTCGATCAGAAGAGATTGAAGCAGCCACTGTACCGACA 1924
Query 2037 CCCATGGGAAGATGTGTTGTACACCAAGTAA--A-ACTCATT-T-CAATCCTATTTTTGT 2091
||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| | || | || | ||| |
Sbjct 1925 CCCGTGGGAAGATGTCTTGTACACCAAGTAATCATA-TCATTATTCACTTCT-TCTTTAT 1982
Query 2092 TATTAT-TCCAATTAA-TTAG 2110
|||| | ||| ||||| ||||
Sbjct 1983 TATTCTCTCCCATTAAGTTAG 2003
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 87988465950
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5